FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2309, 1257 aa 1>>>pF1KE2309 1257 - 1257 aa - 1257 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.3020+/-0.00106; mu= 3.7215+/- 0.064 mean_var=411.9786+/-84.255, 0's: 0 Z-trim(115.4): 94 B-trim: 167 in 1/53 Lambda= 0.063188 statistics sampled from 15865 (15955) to 15865 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.76), E-opt: 0.2 (0.49), width: 16 Scan time: 5.480 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS14544.1 IRS4 gene_id:8471|Hs108|chrX (1257) 8609 800.2 0 CCDS2463.1 IRS1 gene_id:3667|Hs108|chr2 (1242) 758 84.5 1.9e-15 CCDS9510.1 IRS2 gene_id:8660|Hs108|chr13 (1338) 716 80.7 2.8e-14 >>CCDS14544.1 IRS4 gene_id:8471|Hs108|chrX (1257 aa) initn: 8609 init1: 8609 opt: 8609 Z-score: 4259.0 bits: 800.2 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 8609; 100.0% identity (100.0% similar) in 1257 aa overlap (1-1257:1-1257) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MASCSFTRDQATRRLRGAAAAAAAALAAVVTTPLLSSGTPTALIGTGSSCPGAMWLSTAT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 MASCSFTRDQATRRLRGAAAAAAAALAAVVTTPLLSSGTPTALIGTGSSCPGAMWLSTAT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 GSRSDSESEEEDLPVGEEVCKRGYLRKQKHGHRRYFVLKLETADAPARLEYYENARKFRH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 GSRSDSESEEEDLPVGEEVCKRGYLRKQKHGHRRYFVLKLETADAPARLEYYENARKFRH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 SVRAAAAAAAAAASGAAIPPLIPPRRVITLYQCFSVSQRADARYRHLIALFTQDEYFAMV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 SVRAAAAAAAAAASGAAIPPLIPPRRVITLYQCFSVSQRADARYRHLIALFTQDEYFAMV 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 AENESEQESWYLLLSRLILESKRRRCGTLGAQPDGEPAALAAAAAAEPPFYKDVWQVIVK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 AENESEQESWYLLLSRLILESKRRRCGTLGAQPDGEPAALAAAAAAEPPFYKDVWQVIVK 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 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CCDS24 LVALYTRDEHFAIAADSEAEQDSWYQALLQLHNRAKGHHDGAAALGAGGGGGSCSGSSGL 90 100 110 120 130 140 230 240 250 260 270 pF1KE2 -AAAE-------PP--FYKDVWQVIVKPRGLGHRKELSGVFRLCLTDEEVVFVRLNTEVA :.: :: .:.:::::.::.:::. :.: :..:::::.. . ::.::.:.: CCDS24 GEAGEDLSYGDVPPGPAFKEVWQVILKPKGLGQTKNLIGIYRLCLTSKTISFVKLNSEAA 150 160 170 180 190 200 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 SVVVQLLSIRRCGHSEQYFFLEVGRSTVIGPGELWMQVDDCVVAQNMHELFLEKMRALCA .::.::..::::::::..::.:::::.: ::::.:::::: :::::::: .:: :::. . CCDS24 AVVLQLMNIRRCGHSENFFFIEVGRSAVTGPGEFWMQVDDSVVAQNMHETILEAMRAM-S 210 220 230 240 250 260 340 350 360 370 380 pF1KE2 DEYRARCRSYSISIGAHLLTLLSARRHLGLVPLEPGGWLRRSRFEQFC------------ ::.: : .: : : .. ... :.::. : : :::: :.. CCDS24 DEFRPRSKSQSSSNCSNPISVPLRRHHLNNPPPSQVGLTRRSRTESITATSPASMVGGKP 270 280 290 300 310 320 390 400 410 420 430 pF1KE2 ---HLRAIGDGEDEMLFTRRFVTPSEPVAHSRRGRLHLPRGRRSRRAVSVPASFFRRLAP ..:: .::: : .: . . ::. : .: : : : : : . : . : . : CCDS24 GSFRVRASSDGEGTM--SRPASVDGSPVSPST-NRTHAHRHRGSAR-LHPPLNHSRSI-P 330 340 350 360 370 440 450 460 470 480 490 pF1KE2 SPARPRHPAEAPNNGARLSSEVSGSGSGNFGEEGNPQGKEDQEGSGGDYM-PMNNWGSGN :: :. .: :: :.:.. :. :: .: . : . .: . CCDS24 MPASRCSPSA--------TSPVSLSSSSTSGH-----------GSTSDCLFPRRSSASVS 380 390 400 410 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 GRGSGGGQGSNGQGSSSHSSGGNQCSGEGQGSRGGQGSNGQGSGGNQCSRDGQGTAGGHG : : :: :. . .:: . .. . : : . . : .. : . ::.: CCDS24 GSPSDGGFISSDEYGSSPCDFRSSFRSVTPDS---LGHTPPARGEEELS--NYICMGGKG 420 430 440 450 460 470 560 570 580 590 600 610 pF1KE2 SGGGQRPGGGHG-SGGGQGPGDGHGSGGGKNSGGGKGSGSGKGSDGDGERGKSLKKRSYF . :.: . : ::.: :.: : .: . :. .....: :.. ..::.. CCDS24 PSTLTAPNGHYILSRGGNGHRCTPGTGLG-TSPALAGDEAASAADLDNR----FRKRTHS 480 490 500 510 520 620 630 640 650 660 pF1KE2 GKLTQSKQQQMPPPPPPP----------PPPPPAGGTGGKGKSGGRFRLYFCVDRGATKE . . . .: : : ::.::.:: . :. . : :. .: CCDS24 AGTSPTITHQKTPSQSSVASIEEYTEMMPAYPPGGGSGG--RLPGHRHSAFVPTRSYPEE 530 540 550 560 570 580 670 680 690 700 710 720 pF1KE2 CKEAKEVKDAEIPEGAARGPHRARAFDEDEDDPYVPMRPGVATPLVS----SSDYMPMAP : . : : :: . :: :.:: :::: :. : :.:::::.: CCDS24 GLEMH-------PLERRGGHHRPDSSTLHTDDGYMPMSPGVA-PVPSGRKGSGDYMPMSP 590 600 610 620 630 730 740 750 760 770 pF1KE2 QNVSASK------KRHSRSPFEDSRGYMMMFPRVSPPPAPSPPKAPDTNKEDDSKDNDSE ..::: . .:: . : ::::: : : .:. .:.... ... .. CCDS24 KSVSAPQQIINPIRRHPQR--VDPNGYMMMSP--SGGCSPDIGGGPSSSSSSSNAVPSGT 640 650 660 670 680 690 780 790 800 810 820 pF1KE2 SDYMFMAPGAGAI-------PKNPRNPQGGSSSKSWSSYFSL-P--NPFRSSP----LGQ : . . :.:. :: : . .::. ..:... : . ::: : CCDS24 SYGKLWTNGVGGHHSHVLPHPKPPVESSGGKLLPCTGDYMNMSPVGDSNTSSPSDCYYGP 700 710 720 730 740 750 830 840 850 860 870 pF1KE2 NDNSEYVPMLPGKFLGRGLDKEVSYNWDPKDAA-------SKPSGEGSFSKPGDGGSPSK .: .. :.: : :.. :... .:...: : ::. .. .: .: : CCDS24 ED-PQHKPVLSYYSLPRSF-KHTQRPGEPEEGARHQHLRLSTSSGRLLYAATADDSSSST 760 770 780 790 800 810 880 890 900 910 920 pF1KE2 PSDHEPPKNKAKRPNRLSFITKGYKIKPKPQKPTHE------QREADSSSDYVNMDFTKR :: :. : ...:. .: :. :..:.... . CCDS24 SSDS------------LGGGYCGARLEPSLPHPHHQVLQPHLPRKVDTAAQTNSRLARPT 820 830 840 850 930 940 950 960 970 980 pF1KE2 ESNTPAPSTQGLP-------DSWGIIAEPRQSAFSNYVNVEFGVPFPNPANDLSDLLRAI . . :... :: .. .. :. .. ..:::.::: .: : : CCDS24 RLSLGDPKASTLPRAREQQQQQQPLLHPPEPKSPGEYVNIEFG-------SDQSGYL--- 860 870 880 890 900 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE2 PRANPLSLDSARWPLPPLPLSATGSNAIEEEGDYIEVIFNSAMTPAMALADSAIRYDAET ..:... :. : . . . : .:: : .. . :. : . .: CCDS24 --SGPVAFHSS----PSVRCPSQLQPAPREEETGTEEYMKMDLGPGRRAAWQE-STGVEM 910 920 930 940 950 960 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KE2 GRIYVVDPFSEC-CMDISLSPSRCSEPPPVARLLQEEEQERRRPQSRSQSFFAAARAAVS ::. . : . : :: :. .. .. .: . . .: :.... CCDS24 GRLGPAPPGAASICRPTRAVPS--SRGDYMTMQMSCPRQSYVDTSPAAPVSYADMRTGIA 970 980 990 1000 1010 1020 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KE2 AFPTDSLERDLSPSSAPAVASAAEPTLALSQV-VAAASALAAAP-GIGAAAAAAGFDSAS : . :: : ... . :..: :: . . .:: :.: ..: : :. .: . . . CCDS24 AEEV-SLPRATMAAASSSSAASASPTGPQGAAELAAHSSLLGGPQGPGGMSAFTRVNLSP 1030 1040 1050 1060 1070 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KE2 ARWFQPVANAADAEAVRGAQDVAG-GSNPGAHNPSANLARGDNQA-GGAAAAAAAPEPPP : . . :: .. : .. .:.:.: . .. : . : ::....... : CCDS24 NRNQSAKVIRADPQGCRRRHSSETFSSTPSATRVGNTVPFGAGAAVGGGGGSSSSSEDVK 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1220 1230 1240 1250 pF1KE2 RSRRVPRPPEREDSDNDDDTHVRMDFARRDNQFDSPKRGR : CCDS24 RHSSASFENVWLRPGELGGAPKEPAKLCGAAGGLENGLNYIDLDLVKDFKQCPQECTPEP 1140 1150 1160 1170 1180 1190 >>CCDS9510.1 IRS2 gene_id:8660|Hs108|chr13 (1338 aa) initn: 1124 init1: 469 opt: 716 Z-score: 369.9 bits: 80.7 E(32554): 2.8e-14 Smith-Waterman score: 1136; 29.9% identity (52.1% similar) in 1308 aa overlap (79-1226:31-1212) 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 SCPGAMWLSTATGSRSDSESEEEDLPVGEEVCKRGYLRKQKHGHRRYFVLKLE------- : : ::::::::::.:.:::. CCDS95 MASPPRHGPPGPASGDGPNLNNNNNNNNHSVRKCGYLRKQKHGHKRFFVLRGPGAGGDEA 10 20 30 40 50 60 110 120 130 140 150 pF1KE2 -----TADAPARLEYYENARKFRHSVRAAAAAAAAAASGAAIPPLIPPRRVITLYQCFSV .: : ::::::. .:.: . .:: :.:::.: :... CCDS95 TAGGGSAPQPPRLEYYESEKKWR------------SKAGA-------PKRVIALDCCLNI 70 80 90 100 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 SQRADARYRHLIALFTQDEYFAMVAENESEQESWYLLLSRLILESKRRRCGTLGAQPDGE ..::::....::::.:.:::::..::::.:::.:: :. :. :. : .. : : . CCDS95 NKRADAKHKYLIALYTKDEYFAVAAENEQEQEGWYRALTDLVSEG---RAAAGDAPPAAA 110 120 130 140 150 220 230 240 250 pF1KE2 PAAL------------AAAAAAEPPF---------YKDVWQVIVKPRGLGHRKELSGVFR ::: :.::.:: . :..:::: .::.:::. :.:.::.: CCDS95 PAASCSASLPGALGGSAGAAGAEDSYGLVAPATAAYREVWQVNLKPKGLGQSKNLTGVYR 160 170 180 190 200 210 260 270 280 290 300 310 pF1KE2 LCLTDEEVVFVRLNTEVASVVVQLLSIRRCGHSEQYFFLEVGRSTVIGPGELWMQVDDCV :::. . . ::.:: : ::..::..:::::::...::.:::::.: ::::::::.:: : CCDS95 LCLSARTIGFVKLNCEQPSVTLQLMNIRRCGHSDSFFFIEVGRSAVTGPGELWMQADDSV 220 230 240 250 260 270 320 330 340 350 360 370 pF1KE2 VAQNMHELFLEKMRALCAD-EYRARCRSYSISIGA-HLLTLLSARRHLGLVPLEPG--GW ::::.:: .:: :.:: :.: : .: : . .: : ... .:::: :: : :. : CCDS95 VAQNIHETILEAMKALKELFEFRPRSKSQSSGSSATHPISVPGARRHHHLVNLPPSQTGL 280 290 300 310 320 330 380 390 400 410 420 430 pF1KE2 LRRSRFEQFCHLRAIGDGEDEMLFTRRFVTPSEPVAHSRRGRLHLPRGRRSRRAVSVPAS .:::: ... .:: :.:. :.. . :... :. CCDS95 VRRSRTDSLA------------------ATP--PAAKCSSCRVRTASEGDGGAAAGAAAA 340 350 360 370 440 450 460 470 480 pF1KE2 FFR--RLAPSPARPRHPAEAPNNGARLSSEVSGSGSGNFGEEGN--PQGKEDQEGSGGDY : .: :: : :..:: : .:: : :. : . : : :. : . CCDS95 GARPVSVAGSPLSP-GPVRAP---LSRSHTLSG-GCGGRGSKVALLPAGGALQH-SRSMS 380 390 400 410 420 430 490 500 510 520 530 pF1KE2 MPM-NNWGSGNGRGSGGGQGSNGQGSSSHSSGGNQ------CSGEGQ-GSRGGQGSNGQG ::. .. .... :: ......:.:: : . : :: : :. ...:. CCDS95 MPVAHSPPAATSPGSLSSSSGHGSGSYPPPPGPHPPLPHPLHHGPGQRPSSGSASASGSP 440 450 460 470 480 490 540 550 560 570 580 pF1KE2 SGGNQCSRDGQGTAGG-------HGSGG----GQRPGGGHGSGGGQGPGDGHGSGGGKNS : . : : :.. : : :. .. : . :.:::. : . .. CCDS95 SDPGFMSLDEYGSSPGDLRAFCSHRSNTPESIAETPPARDGGGGGEFYGYMTMDRPLSHC 500 510 520 530 540 550 590 600 610 620 630 640 pF1KE2 GGGKGSGSGKGSDGDGERGKSLKKRSYFGKLTQSKQQQMPPPPPPPPPPPPAGGTGGKGK : . :: ... : .:: :.::.: . : ..:. .: : . .: CCDS95 GRSYRRVSGDAAQ-DLDRG--LRKRTY-SLTTPARQRPVPQPSSASLDEYTLMRATFSG- 560 570 580 590 600 650 660 670 680 690 700 pF1KE2 SGGRFRLYFCVDRGATKECKEAKEVKDAEIPEGAAR---GPHRARAFDEDEDDPYVPMRP :.:: .: . :. . .: :: . : ::. . . :: :.:: : CCDS95 SAGR----LCPSCPAS-----SPKVAYHPYPEDYGDIEIGSHRSSSSNLGADDGYMPMTP 610 620 630 640 650 710 720 730 740 750 pF1KE2 GVA-----TPLVSSSDYMPMAPQNVSASKKRHSRSPFEDSRGYMMMFPRVSPP-PAPSP- :.: . :.:::::.: .::: :. .: . . . : ..: :::. CCDS95 GAALAGSGSGSCRSDDYMPMSPASVSAPKQ--ILQP-RAAAAAAAAVPSAGPAGPAPTSA 660 670 680 690 700 710 760 770 780 pF1KE2 -----P------KA--PDTNKEDDS-------------KDNDSE----SDYMFMAPGAGA : :: : .. .:: . :.. .::. ..:. .. CCDS95 AGRTFPASGGGYKASSPAESSPEDSGYMRMWCGSKLSMEHADGKLLPNGDYLNVSPSDAV 720 730 740 750 760 770 790 800 810 820 830 840 pF1KE2 IPKNPRN------PQGGSSSKSWSS--YFSLPNPFRSSPLGQNDNSEYVPMLPGKFLGRG .: . :: .. . : ::: ... .:...:: : .. .:: CCDS95 TTGTPPDFFSAALHPGGEPLRGVPGCCYSSLPRSYKAPYTCGGDSDQYVLM--SSPVGRI 780 790 800 810 820 830 850 860 870 880 890 pF1KE2 LDKEV---SYNWDPKDAASKPSGEGSFSKPGDG-GSPSKPSDHEPP-----KNKAKRPNR :..: . . :..::: : : . : :: .:: .: ...: ::.: CCDS95 LEEERLEPQATPGPSQAASA-FGAGPTQPPHPVVPSPVRPSGGRPEGFLGQRGRAVRPTR 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 pF1KE2 LSFITKGYKIKPKPQKPT-HEQR---EADSSSDYVNMDFTKRES--NTPAP-------ST ::. .: :. :. :: : : ..:.:.:: . . . ::: :. 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