FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB9741, 517 aa 1>>>pF1KB9741 517 - 517 aa - 517 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5371+/-0.000688; mu= 17.4470+/- 0.042 mean_var=75.6713+/-15.244, 0's: 0 Z-trim(110.6): 12 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.147438 statistics sampled from 11721 (11731) to 11721 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.725), E-opt: 0.2 (0.36), width: 16 Scan time: 3.180 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS13349.1 RBPJL gene_id:11317|Hs108|chr20 ( 517) 3532 760.5 0 CCDS63283.1 RBPJL gene_id:11317|Hs108|chr20 ( 516) 3513 756.5 1.6e-218 CCDS63284.1 RBPJL gene_id:11317|Hs108|chr20 ( 471) 2903 626.7 1.7e-179 CCDS3436.1 RBPJ gene_id:3516|Hs108|chr4 ( 485) 1381 303.0 5e-82 CCDS33969.1 RBPJ gene_id:3516|Hs108|chr4 ( 486) 1381 303.0 5e-82 CCDS43219.1 RBPJ gene_id:3516|Hs108|chr4 ( 487) 1381 303.0 5e-82 CCDS3437.1 RBPJ gene_id:3516|Hs108|chr4 ( 500) 1381 303.0 5.2e-82 >>CCDS13349.1 RBPJL gene_id:11317|Hs108|chr20 (517 aa) initn: 3532 init1: 3532 opt: 3532 Z-score: 4058.4 bits: 760.5 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 3532; 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