FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3460, 1354 aa 1>>>pF1KE3460 1354 - 1354 aa - 1354 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 17.6978+/-0.0018; mu= -34.4792+/- 0.105 mean_var=899.5629+/-196.451, 0's: 0 Z-trim(107.2): 558 B-trim: 0 in 0/53 Lambda= 0.042762 statistics sampled from 8931 (9442) to 8931 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.595), E-opt: 0.2 (0.29), width: 16 Scan time: 4.760 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS11870.2 ROCK1 gene_id:6093|Hs108|chr18 (1354) 8819 561.7 4.7e-159 CCDS42654.1 ROCK2 gene_id:9475|Hs108|chr2 (1388) 4178 275.4 7.4e-73 CCDS1558.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1 (1719) 1528 112.0 1.4e-23 CCDS9978.1 CDC42BPB gene_id:9578|Hs108|chr14 (1711) 1508 110.8 3.4e-23 CCDS1559.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1 (1638) 1497 110.1 5.2e-23 CCDS31601.1 CDC42BPG gene_id:55561|Hs108|chr11 (1551) 1407 104.5 2.3e-21 CCDS9192.1 CIT gene_id:11113|Hs108|chr12 (2027) 1394 103.8 5e-21 CCDS55891.1 CIT gene_id:11113|Hs108|chr12 (2069) 1372 102.5 1.3e-20 CCDS74400.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 ( 530) 1260 95.1 5.6e-19 CCDS46118.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 ( 624) 1260 95.1 6.3e-19 CCDS46117.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 ( 625) 1260 95.1 6.3e-19 CCDS12674.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 ( 629) 1181 90.3 1.9e-17 CCDS46119.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 ( 639) 1130 87.1 1.7e-16 >>CCDS11870.2 ROCK1 gene_id:6093|Hs108|chr18 (1354 aa) initn: 8819 init1: 8819 opt: 8819 Z-score: 2969.0 bits: 561.7 E(32554): 4.7e-159 Smith-Waterman score: 8819; 100.0% identity (100.0% similar) in 1354 aa overlap (1-1354:1-1354) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MSTGDSFETRFEKMDNLLRDPKSEVNSDCLLDGLDALVYDLDFPALRKNKNIDNFLSRYK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 MSTGDSFETRFEKMDNLLRDPKSEVNSDCLLDGLDALVYDLDFPALRKNKNIDNFLSRYK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 DTINKIRDLRMKAEDYEVVKVIGRGAFGEVQLVRHKSTRKVYAMKLLSKFEMIKRSDSAF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 DTINKIRDLRMKAEDYEVVKVIGRGAFGEVQLVRHKSTRKVYAMKLLSKFEMIKRSDSAF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 FWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNLMSNYDVPEKWARFYTA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 FWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNLMSNYDVPEKWARFYTA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 EVVLALDAIHSMGFIHRDVKPDNMLLDKSGHLKLADFGTCMKMNKEGMVRCDTAVGTPDY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 EVVLALDAIHSMGFIHRDVKPDNMLLDKSGHLKLADFGTCMKMNKEGMVRCDTAVGTPDY 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 ISPEVLKSQGGDGYYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLVGTYSKIMNHKNSLTFP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 ISPEVLKSQGGDGYYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLVGTYSKIMNHKNSLTFP 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 DDNDISKEAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIKRHLFFKNDQWAWETLRDTVAPVVPDLS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 DDNDISKEAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIKRHLFFKNDQWAWETLRDTVAPVVPDLS 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 SDIDTSNFDDLEEDKGEEETFPIPKAFVGNQLPFVGFTYYSNRRYLSSANPNDNRTSSNA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 SDIDTSNFDDLEEDKGEEETFPIPKAFVGNQLPFVGFTYYSNRRYLSSANPNDNRTSSNA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 DKSLQESLQKTIYKLEEQLHNEMQLKDEMEQKCRTSNIKLDKIMKELDEEGNQRRNLEST :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 DKSLQESLQKTIYKLEEQLHNEMQLKDEMEQKCRTSNIKLDKIMKELDEEGNQRRNLEST 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE3 VSQIEKEKMLLQHRINEYQRKAEQENEKRRNVENEVSTLKDQLEDLKKVSQNSQLANEKL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 VSQIEKEKMLLQHRINEYQRKAEQENEKRRNVENEVSTLKDQLEDLKKVSQNSQLANEKL 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE3 SQLQKQLEEANDLLRTESDTAVRLRKSHTEMSKSISQLESLNRELQERNRILENSKSQTD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 SQLQKQLEEANDLLRTESDTAVRLRKSHTEMSKSISQLESLNRELQERNRILENSKSQTD 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE3 KDYYQLQAILEAERRDRGHDSEMIGDLQARITSLQEEVKHLKHNLEKVEGERKEAQDMLN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 KDYYQLQAILEAERRDRGHDSEMIGDLQARITSLQEEVKHLKHNLEKVEGERKEAQDMLN 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KE3 HSEKEKNNLEIDLNYKLKSLQQRLEQEVNEHKVTKARLTDKHQSIEEAKSVAMCEMEKKL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 HSEKEKNNLEIDLNYKLKSLQQRLEQEVNEHKVTKARLTDKHQSIEEAKSVAMCEMEKKL 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KE3 KEEREAREKAENRVVQIEKQCSMLDVDLKQSQQKLEHLTGNKERMEDEVKNLTLQLEQES :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 KEEREAREKAENRVVQIEKQCSMLDVDLKQSQQKLEHLTGNKERMEDEVKNLTLQLEQES 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KE3 NKRLLLQNELKTQAFEADNLKGLEKQMKQEINTLLEAKRLLEFELAQLTKQYRGNEGQMR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 NKRLLLQNELKTQAFEADNLKGLEKQMKQEINTLLEAKRLLEFELAQLTKQYRGNEGQMR 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 pF1KE3 ELQDQLEAEQYFSTLYKTQVKELKEEIEEKNRENLKKIQELQNEKETLATQLDLAETKAE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 ELQDQLEAEQYFSTLYKTQVKELKEEIEEKNRENLKKIQELQNEKETLATQLDLAETKAE 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 pF1KE3 SEQLARGLLEEQYFELTQESKKAASRNRQEITDKDHTVSRLEEANSMLTKDIEILRRENE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 SEQLARGLLEEQYFELTQESKKAASRNRQEITDKDHTVSRLEEANSMLTKDIEILRRENE 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KE3 ELTEKMKKAEEEYKLEKEEEISNLKAAFEKNINTERTLKTQAVNKLAEIMNRKDFKIDRK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 ELTEKMKKAEEEYKLEKEEEISNLKAAFEKNINTERTLKTQAVNKLAEIMNRKDFKIDRK 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KE3 KANTQDLRKKEKENRKLQLELNQEREKFNQMVVKHQKELNDMQAQLVEECAHRNELQMQL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 KANTQDLRKKEKENRKLQLELNQEREKFNQMVVKHQKELNDMQAQLVEECAHRNELQMQL 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KE3 ASKESDIEQLRAKLLDLSDSTSVASFPSADETDGNLPESRIEGWLSVPNRGNIKRYGWKK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 ASKESDIEQLRAKLLDLSDSTSVASFPSADETDGNLPESRIEGWLSVPNRGNIKRYGWKK 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KE3 QYVVVSSKKILFYNDEQDKEQSNPSMVLDIDKLFHVRPVTQGDVYRAETEEIPKIFQILY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 QYVVVSSKKILFYNDEQDKEQSNPSMVLDIDKLFHVRPVTQGDVYRAETEEIPKIFQILY 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KE3 ANEGECRKDVEMEPVQQAEKTNFQNHKGHEFIPTLYHFPANCDACAKPLWHVFKPPPALE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 ANEGECRKDVEMEPVQQAEKTNFQNHKGHEFIPTLYHFPANCDACAKPLWHVFKPPPALE 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KE3 CRRCHVKCHRDHLDKKEDLICPCKVSYDVTSARDMLLLACSQDEQKKWVTHLVKKIPKNP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 CRRCHVKCHRDHLDKKEDLICPCKVSYDVTSARDMLLLACSQDEQKKWVTHLVKKIPKNP 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 pF1KE3 PSGFVRASPRTLSTRSTANQSFRKVVKNTSGKTS :::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 PSGFVRASPRTLSTRSTANQSFRKVVKNTSGKTS 1330 1340 1350 >>CCDS42654.1 ROCK2 gene_id:9475|Hs108|chr2 (1388 aa) initn: 5013 init1: 2349 opt: 4178 Z-score: 1421.5 bits: 275.4 E(32554): 7.4e-73 Smith-Waterman score: 5874; 65.8% identity (86.4% similar) in 1360 aa overlap (9-1344:25-1377) 10 20 30 40 pF1KE3 MSTGDSFETRFEKMDNLLRDPKSEVNSDCLLDGLDALVYDLDFP .: .:.. :.:::.: .: . :::::..:: ::::: CCDS42 MSRPPPTGKMPGAPETAPGDGAGASRQRKLEALIRDPRSPINVESLLDGLNSLVLDLDFP 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE3 ALRKNKNIDNFLSRYKDTINKIRDLRMKAEDYEVVKVIGRGAFGEVQLVRHKSTRKVYAM ::::::::::::.::. ..::: :.::::::.:::::::::::::::::::...::::: CCDS42 ALRKNKNIDNFLNRYEKIVKKIRGLQMKAEDYDVVKVIGRGAFGEVQLVRHKASQKVYAM 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 KLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 KLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNL 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 MSNYDVPEKWARFYTAEVVLALDAIHSMGFIHRDVKPDNMLLDKSGHLKLADFGTCMKMN :::::::::::.:::::::::::::::::.:::::::::::::: ::::::::::::::. CCDS42 MSNYDVPEKWAKFYTAEVVLALDAIHSMGLIHRDVKPDNMLLDKHGHLKLADFGTCMKMD 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 KEGMVRCDTAVGTPDYISPEVLKSQGGDGYYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLV . :::.:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 ETGMVHCDTAVGTPDYISPEVLKSQGGDGFYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLV 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 GTYSKIMNHKNSLTFPDDNDISKEAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIKRHLFFKNDQWA :::::::.::::: ::.: .:::.::::::::::::::::::::::::..: ::::::: CCDS42 GTYSKIMDHKNSLCFPEDAEISKHAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIRQHPFFKNDQWH 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 WETLRDTVAPVVPDLSSDIDTSNFDDLEEDKGEEETFPIPKAFVGNQLPFVGFTYYSNRR :...:.:.:::::.::::::.:::::.:.:::. ::::::::::::::::.::::: . CCDS42 WDNIRETAAPVVPELSSDIDSSNFDDIEDDKGDVETFPIPKAFVGNQLPFIGFTYYRENL 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 YLSSANPNDNRTSSNADKSLQES--LQKTIYKLEEQLHNEMQLKDEMEQKCRTSNIKLDK ::.. :. .:.: ... .:: .:: .: :::.: :::: :.:.::::.. : .:.: CCDS42 LLSDS-PSCRETDSIQSRKNEESQEIQKKLYTLEEHLSNEMQAKEELEQKCKSVNTRLEK 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KE3 IMKELDEEGNQRRNLESTVSQIEKEKMLLQHRINEYQRKAEQENEKRRNVENEVSTLKDQ :::.:: . :...::.. :.:.:: ::::. ::::::..: .:.::.::.:..:::: CCDS42 TAKELEEEITLRKSVESALRQLEREKALLQHKNAEYQRKADHEADKKRNLENDVNSLKDQ 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KE3 LEDLKKVSQNSQLANEKLSQLQKQLEEANDLLRTESDTAVRLRKSHTEMSKSISQLESLN :::::: .::::...::..:::.::.:.: :::::::::.::::...: ::.:.:::: : CCDS42 LEDLKKRNQNSQISTEKVNQLQRQLDETNALLRTESDTAARLRKTQAESSKQIQQLESNN 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 pF1KE3 RELQERNRILENSKSQTDKDYYQLQAILEAERRDRGHDSEMIGDLQARITSLQEEVKHLK :.::..: .::..: . .:.. .::. ::.::::: : ::.:.:::.:: .:.:..:. : CCDS42 RDLQDKNCLLETAKLKLEKEFINLQSALESERRDRTHGSEIINDLQGRICGLEEDLKNGK 600 610 620 630 640 650 650 660 670 680 690 700 pF1KE3 HNLEKVEGERKEAQDMLNHSEKEKNNLEIDLNYKLKSLQQRLEQEVNEHKVTKARLTDK- : ::: :... :. .. ::::.:.:::..:.:: .:: :::: :::.:::::.:: CCDS42 ILLAKVELEKRQLQERFTDLEKEKSNMEIDMTYQLKVIQQSLEQEEAEHKATKARLADKN 660 670 680 690 700 710 710 720 730 740 750 pF1KE3 --HQSIEEAKSVAMCEMEKKLKEEREAREKAENRVVQIEKQCSMLDVDLKQSQQKLEHLT ..::::::: :: :::::: ::: ..:.:: ... ::.::.:: ::::::::...: CCDS42 KIYESIEEAKSEAMKEMEKKLLEERTLKQKVENLLLEAEKRCSLLDCDLKQSQQKINELL 720 730 740 750 760 770 760 770 780 790 800 810 pF1KE3 GNKERMEDEVKNLTLQLEQESNKRLLLQNELKTQAFEADNLKGLEKQMKQEINTLLEAKR .:. ....:.::::..:::..:: : ::.:: :. ....:: :::.::: : :.: : CCDS42 KQKDVLNEDVRNLTLKIEQETQKRCLTQNDLKMQTQQVNTLKMSEKQLKQENNHLMEMKM 780 790 800 810 820 830 820 830 840 850 860 870 pF1KE3 LLEFELAQLTKQYRGNEGQMRELQDQLEAEQYFSTLYKTQVKELKEEIEEKNR---ENLK :: . :.: :. . .:::.::::::::::::::::::::.::::: :::.. : . CCDS42 NLEKQNAELRKERQDADGQMKELQDQLEAEQYFSTLYKTQVRELKEECEEKTKLGKELQQ 840 850 860 870 880 890 880 890 900 910 920 pF1KE3 KIQELQNEKETLATQLDLAETKAESEQLARGLLEEQYFELTQES-------KKAASRNRQ : ::::.:...::.::... :::.::::::.. :::: .: .:. :. .:..: CCDS42 KKQELQDERDSLAAQLEITLTKADSEQLARSIAEEQYSDLEKEKIMKELEIKEMMARHKQ 900 910 920 930 940 950 930 940 950 960 970 980 pF1KE3 EITDKDHTVSRLEEANSMLTKDIEILRRENEELTEKMKKAEEEYKLEKEEEISN--LKAA :.:.:: :.. :::.: ::.:. : :.:::..:.: ..:. . :.:::: .:: CCDS42 ELTEKDATIASLEETNRTLTSDVANLANEKEELNNKLKDVQEQLSRLKDEEISAAAIKAQ 960 970 980 990 1000 1010 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE3 FEKNINTERTLKTQAVNKLAEIMNRKDFKIDRKKANTQDLRKKEKENRKLQLELNQEREK :::.. ::::::::::::::::::::. :..: :.:.::::::::..::..:::: CCDS42 FEKQLLTERTLKTQAVNKLAEIMNRKE---PVKRGNDTDVRRKEKENRKLHMELKSEREK 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KE3 FNQMVVKHQKELNDMQAQLVEECAHRNELQMQLASKESDIEQLRAKLLDLS---DSTSVA ..:...:.:::::.::::..:: : :::: : ::.:::::::..: : ::.:.. CCDS42 LTQQMIKYQKELNEMQAQIAEESQIRIELQMTLDSKDSDIEQLRSQLQALHIGLDSSSIG 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KE3 SFPSADETDGNLPESRIEGWLSVPNRGNIKRYGWKKQYVVVSSKKILFYNDEQDKEQSNP : :. :.: ..::::.:::::.: :.: :..:: :.::.:::::::::..::::::::: CCDS42 SGPGDAEADDGFPESRLEGWLSLPVRNNTKKFGWVKKYVIVSSKKILFYDSEQDKEQSNP 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KE3 SMVLDIDKLFHVRPVTQGDVYRAETEEIPKIFQILYANEGECRKDVE--MEPVQQAEKTN :::::::::::::::: :::::...:::.::::::::::: .:. : .::: .::.: CCDS42 YMVLDIDKLFHVRPVTQTDVYRADAKEIPRIFQILYANEGESKKEQEFPVEPV--GEKSN 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1230 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KE3 FQNHKGHEFIPTLYHFPANCDACAKPLWHVFKPPPALECRRCHVKCHRDHLDKKEDLICP . ::::::::::::::.::.:: :::::.:::::::::::::.:::.::.::::..: : CCDS42 YICHKGHEFIPTLYHFPTNCEACMKPLWHMFKPPPALECRRCHIKCHKDHMDKKEEIIAP 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1290 1300 1310 1320 1330 1340 pF1KE3 CKVSYDVTSARDMLLLACSQDEQKKWVTHLVKKIPKNPPSG--FVRASPRTLSTRSTANQ ::: ::...:...:::: : .::.:::..:::::::.::. :.:.:::: : . :: CCDS42 CKVYYDISTAKNLLLLANSTEEQQKWVSRLVKKIPKKPPAPDPFARSSPRT-SMKIQQNQ 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1350 pF1KE3 SFRKVVKNTSGKTS :.:. CCDS42 SIRRPSRQLAPNKPS 1380 >>CCDS1558.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1 (1719 aa) initn: 1375 init1: 449 opt: 1528 Z-score: 536.6 bits: 112.0 E(32554): 1.4e-23 Smith-Waterman score: 1667; 30.9% identity (62.4% similar) in 1262 aa overlap (6-1206:2-1164) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MSTGDSFETRFEKMDNLLRDPKSEVNSDC-----LLDGLDALVYDLDFPALRKNKNIDNF : :.:........ : ...:..: ::: : : . . ::..::: .. CCDS15 MSGEVRLRQLEQFILDGPAQTNGQCFSVETLLDILICLYDECNNSPLRREKNILEY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 LSRYKDTINKIRDLRMKAEDYEVVKVIGRGAFGEVQLVRHKSTRKVYAMKLLSKFEMIKR : : .:....:.. ::.:..::::::::::: .:. :.. ::.:::.:.:.::.:: CCDS15 LEWAKPFTSKVKQMRLHREDFEILKVIGRGAFGEVAVVKLKNADKVFAMKILNKWEMLKR 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 SDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNLMSNYD--VPEK ...: : ::::... ... :.. : :::::: ::.::.:. ::::..:.:... .:: CCDS15 AETACFREERDVLVNGDNKWITTLHYAFQDDNNLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDRLPED 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 WARFYTAEVVLALDAIHSMGFIHRDVKPDNMLLDKSGHLKLADFGTCMKMNKEGMVRCDT :::: ::.:.:.:..:.. ..:::.::::.:.: .::..:::::.:.:. ..: :. .. CCDS15 MARFYLAEMVIAIDSVHQLHYVHRDIKPDNILMDMNGHIRLADFGSCLKLMEDGTVQSSV 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 AVGTPDYISPEVLKS-QGGDGYYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLVGTYSKIMN :::::::::::.:.. . : : :: ::::::.:: .:::: :.:::::.::: ::.:::: CCDS15 AVGTPDYISPEILQAMEDGKGRYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMN 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 HKNSLTFPDD-NDISKEAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIKRHLFFKNDQWAWETLRDT ::. . :: . .:.:..::.:: .. .:: :::.::.:..:.: ::.. . :...:. CCDS15 HKERFQFPAQVTDVSENAKDLIRRLICSREHRLGQNGIEDFKKHPFFSGID--WDNIRNC 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 VAPVVPDLSSDIDTSNFDDLEEDKGEEETFPIPK--AFVGNQLPFVGFTY-----YSNRR :: .:..:: :::::: .. . ::.: : :: :..:::::::: :.: CCDS15 EAPYIPEVSSPTDTSNFDVDDDCLKNSETMPPPTHTAFSGHHLPFVGFTYTSSCVLSDRS 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 YLS-SANPNDNRTSSNADKSLQESLQKTIYKLEEQLHNEMQLKDEMEQKCRTSNIKLDKI : .:.:.. . :....:...: : : ..: ..::. :: CCDS15 CLRVTAGPTSLDLDVNVQRTLDNNLATEAY--------ERRIK-RLEQE------KL--- 420 430 440 450 470 480 490 500 510 520 pF1KE3 MKELDEEGNQRRNLESTVSQIEKEKMLLQHRINEYQRKAEQENEKRRNVENEVSTLKDQL ::. :.:. ... .. ::. . : .. : ...::... CCDS15 --ELS------RKLQESTQTVQA----LQYSTVDGPLTASKDLE--------IKNLKEEI 460 470 480 490 530 540 550 560 570 580 pF1KE3 EDLKKVSQNSQLANEKLSQLQKQLEEANDLLRTESDTAVRLRKSHTEMSKSISQL-ESLN : :.: .: :.:..:::::: . : : : : : :.. .. :...: :.:: CCDS15 EKLRKQVTES-------SHLEQQLEEANAV-RQELDDAFRQIKAYEKQIKTLQQEREDLN 500 510 520 530 540 590 600 610 620 630 pF1KE3 REL-QERNRILENSKSQTD---KDYYQLQAILEA-ERRDRGHDSEMIGDLQARITSLQEE .:: : .:. ..:: : . .: ..: :: . : ... : .. . .:: CCDS15 KELVQASERLKNQSKELKDAHCQRKLAMQEFMEINERLTELHTQKQ--KLARHVRDKEEE 550 560 570 580 590 600 640 650 660 670 680 690 pF1KE3 VKHLKHNLEKVEGERKEAQDMLNHSEKEKNNLEIDLN-YKLKSLQQRLEQEVNEHKVTKA : . ..:::. :.: : ..:. :..::. . .. ..: .: .:: . CCDS15 VDLV---MQKVESLRQE----LRRTERAKKELEVHTEALAAEASKDRKLREQSEH--YSK 610 620 630 640 650 700 710 720 730 740 pF1KE3 RLTDKHQSIEEAK---SVAMCEMEKKLKEEREAREKAENRVVQIEKQCSMLD----VDLK .: .. ..... . : ..: .:.. .: . . :.. . :.. : . ..: CCDS15 QLENELEGLKQKQISYSPGVCSIEHQ-QEITKLKTDLEKKSIFYEEELSKREGIHANEIK 660 670 680 690 700 710 750 760 770 780 790 800 pF1KE3 QSQQKLEHLTGNKERMEDEVKNLTLQLEQESNKRLLLQNELKTQAFEADNLKGLEKQMKQ . ...:. :.. .. :. . :. . :...: ... . . ::.. ...:... CCDS15 NLKKELHDSEGQQLALNKEI--MILKDKLEKTRR---ESQSEREEFESE----FKQQYER 720 730 740 750 760 810 820 830 840 850 860 pF1KE3 EINTLLEAKRLLEFELAQLTKQYRGNEGQMRELQDQLE--AEQYFSTLY-KTQVKELKEE : : : .. : :: .:: :.. . ..:..... :.. :. . ..:. :. . CCDS15 EKVLLTEENKKLTSELDKLTTLYENLSIHNQQLEEEVKDLADKKESVAHWEAQITEIIQW 770 780 790 800 810 820 870 880 890 900 910 920 pF1KE3 I-EEKN-RENLKKI-QELQNEKETL-ATQLDLAETKA--ESEQLARGLLEEQYFELTQES . .::. : :. . ... .: :.: ..: : . ...:. : .:: : . CCDS15 VSDEKDARGYLQALASKMTEELEALRNSSLGTRATDMPWKMRRFAK-LDMSARLEL-QSA 830 840 850 860 870 880 930 940 950 960 970 pF1KE3 KKAASRNRQEITDKDHTVSRLEEANSMLTKDIEILRRENEELT---EKMKKAEEEYKLEK : : .: : .. ..... .: . .. ...: :: :.. : :: . :: CCDS15 LDAEIRAKQAIQEE---LNKVKASNIITECKLKDSEKKNLELLSEIEQLIKDTEELRSEK 890 900 910 920 930 940 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KE3 EEEISNLKAAFEKNINTERTLKTQAVNKLAEIMNRKDFKIDRKKANTQDLRKKEKENRKL : .. . .: .:: :.:.... : .. ... .: :::: . CCDS15 GIEHQDSQHSFLAFLNTP----TDALDQF-ETVDSTPLSV-----HTPTLRKKGCPG--- 950 960 970 980 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KE3 QLELNQEREKFNQMVVKHQKELNDMQAQLVEECAHRNELQMQLASK--ESDIEQLRAKLL . . .: : .:. :: . .: . . :.. : . .. . .. CCDS15 STGFPPKR-KTHQFFVK--------SFTTPTKCHQCTSLMVGLIRQGCSCEVCGFSCHIT 990 1000 1010 1020 1030 1040 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KE3 DLSDSTSVASFPSADETDGNL---PESRI----EGWLSVPNRGNIKRYGWKKQYVVVSSK .. . .. : ..: : : :.. : :: . .:. ...:. ::.. ..: . CCDS15 CVNKAPTTCPVPP-EQTKGPLGIDPQKGIGTAYEGHVRIPKPAGVKK-GWQRALAIVCDF 1050 1060 1070 1080 1090 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KE3 KILFYNDEQDKEQSNPSMVL----DI-DKLFHVRPVTQGDVYRAETEEIPKIFQI----L :...: : . . :.::.:. :. :. : : : .:: .: ..:: ::.. : CCDS15 KLFLY-DIAEGKASQPSVVISQVIDMRDEEFSVSSVLASDVIHASRKDIPCIFRVTASQL 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1200 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KE3 YANEGECRKDVEMEPVQQAEKTNFQNHKGHEFIPTLYHFPANCDACAKPLWHVFKPPPAL :....: CCDS15 SASNNKCSILMLADTENEKNKWVGVLSELHKILKKNKFRDRSVYVPKEAYDSTLPLIKTT 1160 1170 1180 1190 1200 1210 >>CCDS9978.1 CDC42BPB gene_id:9578|Hs108|chr14 (1711 aa) initn: 1269 init1: 454 opt: 1508 Z-score: 530.0 bits: 110.8 E(32554): 3.4e-23 Smith-Waterman score: 1676; 30.4% identity (62.7% similar) in 1264 aa overlap (6-1198:2-1178) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MSTGDSFETRFEKMDNLLRD-P---KSEVNSDCLLDGLDALVYDLDFPALRKNKNIDNFL : ..:..:...:: : : .: .. . ::: : : . . :::..: . .:: CCDS99 MSAKVRLKKLEQLLLDGPWRNESALSVETLLDVLVCLYTECSHSALRRDKYVAEFL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 SRYKDTINKIRDLRMKAEDYEVVKVIGRGAFGEVQLVRHKSTRKVYAMKLLSKFEMIKRS : . ....... ::.:..::::::::::: .:. :.:...::::.:.:.::.::. CCDS99 EWAKPFTQLVKEMQLHREDFEIIKVIGRGAFGEVAVVKMKNTERIYAMKILNKWEMLKRA 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 DSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNLMSNYD--VPEKW ..: : ::::... .. :.. : :::::. .::.::.:. ::::..:.:... .:: CCDS99 ETACFREERDVLVNGDCQWITALHYAFQDENHLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDKLPEDM 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 ARFYTAEVVLALDAIHSMGFIHRDVKPDNMLLDKSGHLKLADFGTCMKMNKEGMVRCDTA :::: .:.:::.:.::.. ..:::.::::.::: .::..:::::.:.::: .: :. ..: CCDS99 ARFYIGEMVLAIDSIHQLHYVHRDIKPDNVLLDVNGHIRLADFGSCLKMNDDGTVQSSVA 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 VGTPDYISPEVLKS-QGGDGYYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLVGTYSKIMNH ::::::::::.:.. . : : :: ::::::.:: .:::: :.:::::.::: ::.::::: CCDS99 VGTPDYISPEILQAMEDGMGKYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNH 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 KNSLTFPDD-NDISKEAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIKRHLFFKNDQWAWETLRDTV .. . ::. .:.:.:::.:: .. .:: :::.::.:..:.: ::.. ::..:. CCDS99 EERFQFPSHVTDVSEEAKDLIQRLICSRERRLGQNGIEDFKKHAFFEG--LNWENIRNLE 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 APVVPDLSSDIDTSNFDDLEEDKGEEETFPIPKA---FVGNQLPFVGFTY-----YSNRR :: .::.:: :::::: .. . : .: : . : : .:::.:::. .:.: CCDS99 APYIPDVSSPSDTSNFDVDDDVLRNTEILP-PGSHTGFSGLHLPFIGFTFTTESCFSDRG 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 YLSSANPNDNRTSS-NADKSLQESLQKTIYKLEEQLHNEMQLKDEMEQKCRTSNIKLDKI :.: ... :.. .....:..::: : :.... : : :. .: . :. .... CCDS99 SLKSIMQSNTLTKDEDVQRDLEHSLQMEAY--ERRIRRLEQEKLELSRKLQESTQTVQSL 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KE3 MKELDEEGNQRRNLESTVSQIEKEKMLLQHRINEYQRKAEQENEKRRNVENEVSTLKDQL .:..: . :. .:: :...:.. . : . :. .:..:. :. :... CCDS99 ------HGSSR---ALSNSNRDKEIKKLNEEIERLKNKIADSNRLERQLEDTVA-LRQER 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 pF1KE3 ED----LKKVSQNSQLANEKLSQLQKQLEEANDLLRTESDTAVRLRKSHTEMSKSISQLE :: :. . .. ... .. .:.::: ::.. :... : .:. .: . . ..... CCDS99 EDSTQRLRGLEKQHRVVRQEKEELHKQLVEASERLKSQ---AKELKDAHQQRKLALQEFS 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 pF1KE3 SLNRELQERNRILENSKSQTDKDYYQLQAILEAERRDRGHDSEMIGDLQARITSLQEEVK ::... : ..: .: :: ::. .. :. ..: CCDS99 ELNERMAEL-------RAQKQKVSRQL--------RDKEEEMEVA----------TQKVD 580 590 600 610 640 650 660 670 680 690 pF1KE3 HLKHNLEKVEGERKEAQDMLNHSEKEKNNLEIDLNYKLKSLQQRLEQEVNEHKVTK---- ........: ::: . .:. . : .. : : . ... ...:.:.. :: . CCDS99 AMRQEMRRAEKLRKELEAQLDDAVAEASK-ERKLREHSENFCKQMESELEALKVKQGGRG 620 630 640 650 660 670 700 710 720 730 740 pF1KE3 ARLTDKHQS-IEEAKSVAMCEMEKKL---KEE---REAREKAENRVVQIEKQCS-----M : : .::. : . :: :.:::. .:: ::: . : . :. : . : CCDS99 AGATLEHQQEISKIKS----ELEKKVLFYEEELVRREASHVLEVKNVKKEVHDSESHQLA 680 690 700 710 720 750 760 770 780 790 pF1KE3 LDVDLKQSQQKLEHLTGNKER---MEDEVKNLTLQLEQES------NKRLLLQNELKTQA :. .. . ..:::. ...:: ::. : .. . :.: ::.: .:: : . CCDS99 LQKEILMLKDKLEK--SKRERHNEMEEAVGTIKDKYERERAMLFDENKKLTAENE-KLCS 730 740 750 760 770 780 800 810 820 830 840 850 pF1KE3 FEADNLKGLEKQMKQEINTLLEAKRLLEFELAQLTKQYRGNEGQMRELQDQLEAEQYFST : .:.: . ..:...:.. : :. . ::... .. ..:. .:. :... CCDS99 F-VDKLTAQNRQLEDELQDLAAKKESVAHWEAQIAEI-------IQWVSDEKDARGYLQA 790 800 810 820 830 860 870 880 890 900 910 pF1KE3 LYKTQVKELKE----EIEEKNRENLKKIQELQNEKETLATQLDLAETKAESEQLARGLLE : . ...::. . .. . : :... : : ....:.: .. :.: :. :.. CCDS99 LASKMTEELEALRSSSLGSRTLDPLWKVRRSQ--KLDMSARLEL-QSALEAEIRAKQLVQ 840 850 860 870 880 890 920 930 940 950 960 970 pF1KE3 EQYFELTQESKKAASRNRQEITDKDHTVSRLEEANSMLTKDIEILRRENEELTEKMKKAE :. .. : : .... :. : : : ...:::. :: : CCDS99 EEL----RKVKDANLTLESKLKDS-------EAKNRELLEEMEILK----------KKME 900 910 920 930 980 990 1000 1010 1020 pF1KE3 EEYKLEKEEEISNLKAAFEKNINT-----ERTLKTQAVNKLAEIMNRKDFKIDRKKANTQ :... . .. ... .. . .:: . :..:..... . . . . . : .. CCDS99 EKFRADTGLKLPDFQDSIFEYFNTAPLAHDLTFRTSSASEQETQAPKPEASPSMSVAASE 940 950 960 970 980 990 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KE3 ---DLRKKEKENRKLQLELNQEREKFNQMVVKHQKELNDMQAQLVEECAHRNELQMQLAS :. . .. . : .: . :: ...... .:.: . :.. : CCDS99 QQEDMARPPQRPSAVPLPTTQALALAGPKPKAHQFSIKSFSSPT--QCSHCTSLMVGLIR 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KE3 K--ESDIEQLRAKLLDLSDSTSVASFPSAD-ETDGNLPESR-----IEGWLSVPNRGNIK . .. .. .. . . .: .: . . .. .: .: ..::. ..: CCDS99 QGYACEVCSFACHVSCKDGAPQVCPIPPEQSKRPLGVDVQRGIGTAYKGHVKVPKPTGVK 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KE3 RYGWKKQYVVVSSKKILFYNDEQDKEQSNP----SMVLDI-DKLFHVRPVTQGDVYRAET . ::.. :.:: . :...: : . ....: :.:::. : : : : .:: .: CCDS99 K-GWQRAYAVVCDCKLFLY-DLPEGKSTQPGVIASQVLDLRDDEFSVSSVLASDVIHATR 1120 1130 1140 1150 1160 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KE3 EEIPKIFQILYANEGECRKDVEMEPVQQAEKTNFQNHKGHEFIPTLYHFPANCDACAKPL ..:: ::.. CCDS99 RDIPCIFRVTASLLGAPSKTSSLLILTENENEKRKWVGILEGLQSILHKNRLRNQVVHVP 1170 1180 1190 1200 1210 1220 >>CCDS1559.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1 (1638 aa) initn: 1254 init1: 449 opt: 1497 Z-score: 526.6 bits: 110.1 E(32554): 5.2e-23 Smith-Waterman score: 1557; 30.8% identity (60.0% similar) in 1243 aa overlap (6-1206:2-1083) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MSTGDSFETRFEKMDNLLRDPKSEVNSDC-----LLDGLDALVYDLDFPALRKNKNIDNF : :.:........ : ...:..: ::: : : . . ::..::: .. CCDS15 MSGEVRLRQLEQFILDGPAQTNGQCFSVETLLDILICLYDECNNSPLRREKNILEY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 LSRYKDTINKIRDLRMKAEDYEVVKVIGRGAFGEVQLVRHKSTRKVYAMKLLSKFEMIKR : : .:....:.. ::.:..::::::::::: .:. :.. ::.:::.:.:.::.:: CCDS15 LEWAKPFTSKVKQMRLHREDFEILKVIGRGAFGEVAVVKLKNADKVFAMKILNKWEMLKR 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 SDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNLMSNYD--VPEK ...: : ::::... ... :.. : :::::: ::.::.:. ::::..:.:... .:: CCDS15 AETACFREERDVLVNGDNKWITTLHYAFQDDNNLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDRLPED 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 WARFYTAEVVLALDAIHSMGFIHRDVKPDNMLLDKSGHLKLADFGTCMKMNKEGMVRCDT :::: ::.:.:.:..:.. ..:::.::::.:.: .::..:::::.:.:. ..: :. .. CCDS15 MARFYLAEMVIAIDSVHQLHYVHRDIKPDNILMDMNGHIRLADFGSCLKLMEDGTVQSSV 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 AVGTPDYISPEVLKS-QGGDGYYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLVGTYSKIMN :::::::::::.:.. . : : :: ::::::.:: .:::: :.:::::.::: ::.:::: CCDS15 AVGTPDYISPEILQAMEDGKGRYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMN 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 HKNSLTFPDD-NDISKEAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIKRHLFFKNDQWAWETLRDT ::. . :: . .:.:..::.:: .. .:: :::.::.:..:.: ::.. .: ...:. CCDS15 HKERFQFPAQVTDVSENAKDLIRRLICSREHRLGQNGIEDFKKHPFFSGIDW--DNIRNC 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 VAPVVPDLSSDIDTSNFDDLEEDKGEEETFPIPK--AFVGNQLPFVGFTY-----YSNRR :: .:..:: :::::: .. . ::.: : :: :..:::::::: :.: CCDS15 EAPYIPEVSSPTDTSNFDVDDDCLKNSETMPPPTHTAFSGHHLPFVGFTYTSSCVLSDRS 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 YLS-SANPNDNRTSSNADKSLQESLQKTIYKLEEQLHNEMQLKDEMEQKCRTSNIKLDKI : .:.:.. . :....:...: : : ..: ..::. :: CCDS15 CLRVTAGPTSLDLDVNVQRTLDNNLATEAY--------ERRIK-RLEQE------KL--- 420 430 440 450 470 480 490 500 510 520 pF1KE3 MKELDEEGNQRRNLESTVSQIEKEKMLLQHRINEYQRKAEQENEKRRNVENEVSTLKDQL ::. :.:. ... .. ::. . : .. : ...::... CCDS15 --ELS------RKLQESTQTVQA----LQYSTVDGPLTASKDLE--------IKNLKEEI 460 470 480 490 530 540 550 560 570 580 pF1KE3 EDLKKVSQNSQLANEKLSQLQKQLEEANDLLRTESDTAVRLRKSHTEMSKSISQL-ESLN : :.: .: :.:..:::::: . : : : : : :.. .. :...: :.:: CCDS15 EKLRKQVTES-------SHLEQQLEEANAV-RQELDDAFRQIKAYEKQIKTLQQEREDLN 500 510 520 530 540 590 600 610 620 630 640 pF1KE3 R-ELQERNRILENSKSQTDKDYYQLQAILEAERRDRGHDSEMIGDLQARITSLQEEVKHL . :.. . : ::.. .. ..:. .. ..:. : :. . : . : . CCDS15 KLEVHTEALAAEASKDRKLRE--------QSEHYSKQLENELEG-LKQKQISYSPGVCSI 550 560 570 580 590 650 660 670 680 690 700 pF1KE3 KHNLEKVEGERKEAQDMLNHSEKEKNNLEIDLNYKLKSLQQRLEQEVNEHKVTKARLTDK .:. : . : :..:: . . :..: ..:: : : .: :. CCDS15 EHQQEIT---------------KLKTDLEKKSIFYEEELSKREGIHANEIKNLKKELHDS 600 610 620 630 640 710 720 730 740 750 760 pF1KE3 HQSIEEAKSVAMCEMEKKLKEEREAREKAENRVVQIEKQCSMLDVDLKQSQQKLEHLTGN :... : :. ..: : . :. ..::.. :.. .. CCDS15 -----------------------EGQQLALNKEIMILK--DKLEKTRRESQSEREEFESE 650 660 670 770 780 790 800 810 820 pF1KE3 -KERMEDEVKNLTLQLEQESNKRLLLQNELKTQAFEADNLKGLEKQMKQEINTLLEAKRL :...: : :: : ::.: .:: . .::. ..:...:.. : . :. CCDS15 FKQQYEREKVLLT-----EENKKL--TSELDKLTTLYENLSIHNQQLEEEVKDLADKKES 680 690 700 710 720 730 830 840 850 860 870 pF1KE3 LEFELAQLTKQYRGNEGQMRELQDQLEAEQYFSTLYKTQVKELKEEIEEKNRENL-KKIQ . ::.:. .. ..:. .:. :...: .... ::.: .: . CCDS15 VAHWEAQITEI-------IQWVSDEKDARGYLQAL----ASKMTEELEALRNSSLGTRAT 740 750 760 770 780 880 890 900 910 920 930 pF1KE3 ELQNEKETLATQLDLAETKAESEQLARGLLEEQYFELTQESKKAASRNRQEITDKDHTVS .. . . .: .::.. :: .:: : . : : .: : .. .. CCDS15 DMPWKMRRFA-KLDMS---------AR-------LEL-QSALDAEIRAKQAIQEE---LN 790 800 810 820 940 950 960 970 980 990 pF1KE3 RLEEANSMLTKDIEILRRENEELT---EKMKKAEEEYKLEKEEEISNLKAAFEKNINTER ... .: . .. ...: :: :.. : :: . :: : .. . .: .:: CCDS15 KVKASNIITECKLKDSEKKNLELLSEIEQLIKDTEELRSEKGIEHQDSQHSFLAFLNT-- 830 840 850 860 870 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KE3 TLKTQAVNKLAEIMNRKDFKIDRKKANTQDLRKKEKENRKLQLELNQEREKFNQMVVKHQ :.:.... : .. ... .: :::: . . . .: : .:. :: CCDS15 --PTDALDQF-ETVDSTPLSV-----HTPTLRKKGCPG---STGFPPKR-KTHQFFVK-- 880 890 900 910 920 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KE3 KELNDMQAQLVEECAHRNELQMQLASK--ESDIEQLRAKLLDLSDSTSVASFPSADETDG . .: . . :.. : . .. . .. .. . .. : ..: : CCDS15 ------SFTTPTKCHQCTSLMVGLIRQGCSCEVCGFSCHITCVNKAPTTCPVPP-EQTKG 930 940 950 960 970 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KE3 NL---PESRI----EGWLSVPNRGNIKRYGWKKQYVVVSSKKILFYNDEQDKEQSNPSMV : :.. : :: . .:. ...:. ::.. ..: . :...: : . . :.::.: CCDS15 PLGIDPQKGIGTAYEGHVRIPKPAGVKK-GWQRALAIVCDFKLFLY-DIAEGKASQPSVV 980 990 1000 1010 1020 1030 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KE3 L----DI-DKLFHVRPVTQGDVYRAETEEIPKIFQI----LYANEGECRKDVEMEPVQQA . :. :. : : : .:: .: ..:: ::.. : :....: CCDS15 ISQVIDMRDEEFSVSSVLASDVIHASRKDIPCIFRVTASQLSASNNKCSILMLADTENEK 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KE3 EKTNFQNHKGHEFIPTLYHFPANCDACAKPLWHVFKPPPALECRRCHVKCHRDHLDKKED CCDS15 NKWVGVLSELHKILKKNKFRDRSVYVPKEAYDSTLPLIKTTQAAAIIDHERIALGNEEGL 1100 1110 1120 1130 1140 1150 >>CCDS31601.1 CDC42BPG gene_id:55561|Hs108|chr11 (1551 aa) initn: 1170 init1: 480 opt: 1407 Z-score: 496.9 bits: 104.5 E(32554): 2.3e-21 Smith-Waterman score: 1497; 30.5% identity (58.6% similar) in 1210 aa overlap (8-1198:2-1030) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MSTGDSFETRFEKMDNLLRDPKSEVNS-DCLLDGLDALVYDLDFPALRKNKNIDNFLSRY : :.. ...: : . . : ::: : :: ..:. ::..... .::: CCDS31 MERRLRALEQLARGEAGGCPGLDGLLDLLLALHHELSSGPLRRERSVAQFLSWA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 KDTINKIRDLRMKAEDYEVVKVIGRGAFGEVQLVRHKSTRKVYAMKLLSKFEMIKRSDSA . ..:...::.. .:.:..::::::::::: .::...: ...:::.: :.::.::...: CCDS31 SPFVSKVKELRLQRDDFEILKVIGRGAFGEVTVVRQRDTGQIFAMKMLHKWEMLKRAETA 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 FFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNLMSNYD--VPEKWARF : ::::... ..: ::. : :::::..:::.::.:. ::::..:.: .. .: . :.: CCDS31 CFREERDVLVKGDSRWVTTLHYAFQDEEYLYLVMDYYAGGDLLTLLSRFEDRLPPELAQF 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 YTAEVVLALDAIHSMGFIHRDVKPDNMLLDKSGHLKLADFGTCMKMNKEGMVRCDTAVGT : ::.:::. ..:..:..::::::::.::: .::..:::::.:...: .::: ..:::: CCDS31 YLAEMVLAIHSLHQLGYVHRDVKPDNVLLDVNGHIRLADFGSCLRLNTNGMVDSSVAVGT 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 PDYISPEVLKS-QGGDGYYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLVGTYSKIMNHKNS :::::::.:.. . : :.:: .:::::.:: ::.: :.:::::.::: ::.:::::.. CCDS31 PDYISPEILQAMEEGKGHYGPQCDWWSLGVCAYELLFGETPFYAESLVETYGKIMNHEDH 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 LTFPDD-NDISKEAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIKRHLFFKNDQWAWETLRDTVAPV : :: : :. :..:: .: .: ::::.:..... : ::.. .: : : ...:: CCDS31 LQFPPDVPDVPASAQDLIRQLLCRQEERLGRGGLDDFRNHPFFEGVDW--ERLASSTAPY 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 VPDLSSDIDTSNFDDLEEDKGEEETFPIPK--AFVGNQLPFVGFTYYSNRRYLSSANPND .:.: . .:::::: .. .. :.: :. :: :..:::::::: :. : .:. CCDS31 IPELRGPMDTSNFDVDDDTLNHPGTLPPPSHGAFSGHHLPFVGFTYTSG-----SHSPE- 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 NRTSSNADKSLQESLQKTIYKLEEQLHNEMQLKDEMEQKCRTSNIKLDKIMKELDEEGNQ .::.: .:...:: .::. ...:.. .: . .. CCDS31 --SSSEAWAALERKLQC------------------LEQE----KVELSRKHQEALHAPTD 410 420 430 440 480 490 500 510 520 530 pF1KE3 RRNLESTVSQIEKEKMLLQHRINEYQRKAEQENEKRRNVENEVSTLKDQLEDLKKVSQNS .:.:: :..:: . :. :. :. : ...: . . . .:.: CCDS31 HRELE----QLRKEVQTLRDRLPEMLR-------------DKASLSQTDGPPAGSPGQDS 450 460 470 480 540 550 560 570 580 590 pF1KE3 QLANEKLSQLQKQLEEANDLLRTESDTAVRLRKSHTEMSKSISQLESLNRELQERNRILE .: .: :..:...: :. . :. .. :. .. .: : : ..::: .. CCDS31 DLRQE-LDRLHRELAEGR----------AGLQAQEQELCRAQGQQEELLQRLQEAQEREA 490 500 510 520 530 600 610 620 630 640 650 pF1KE3 NSKSQTDKDYYQLQAILEAERRDRGHDSEMIGDLQARITSLQEEVKHLKHNLEKVEGERK . ::: ::. :.: .:.:...::...: .:. . :. : . CCDS31 ATASQTRALSSQLEEARAAQR-----------ELEAQVSSLSRQVTQLQGQWEQRLEESS 540 550 560 570 580 660 670 680 690 700 710 pF1KE3 EAQDMLNHSEKEKNNLEIDLNYKLKSLQQRLEQEVNEHKVTKARLTDKHQSIEEAKSVAM .:. . :. .: :.. . . .:..:: . . .: . :. .: :. CCDS31 QAKTI--HTASETNGMGPP---EGGPQEAQLRKEVA---ALREQLEQAHSHRPSGKEEAL 590 600 610 620 630 720 730 740 750 760 pF1KE3 CEMEKKLKEEREAREKAENRVVQIEKQCSMLDVDLKQSQQKLEHLTGNKERMED----EV :.... ::: .. :.. :...: : :.. ..: :.... :. .. CCDS31 CQLQE------------ENRRLSREQE--RLEAELAQEQESKQRLEGERRETESNWEAQL 640 650 660 670 680 770 780 790 800 810 820 pF1KE3 KNLTLQLEQESNKRLLLQNELKTQAFEADNLKGLEKQM--KQEINTLLEAKRLLEFEL-A .. ...:. .: :: .: : ..:... : . .. .:.:: ..: : CCDS31 ADILSWVNDEKVSRGYLQALATKMAEELESLRNVGTQTLPARPLDHQWKARRLQKMEASA 690 700 710 720 730 740 830 840 850 860 870 880 pF1KE3 QLTKQYRGNEGQMRELQDQLEAEQYFSTLYKTQVKELKEEIEEKNRENLKKIQELQNEKE .: :::. :::: : ..: ...: . . ...:: ::. CCDS31 RL------------ELQSALEAEIR----AKQGLQERLTQVQEAQLQAERRLQE--AEKQ 750 760 770 780 890 900 910 920 930 940 pF1KE3 TLATQLDLAETKAESEQLARGLLEEQYFELTQESKKAASRNRQEITDKDHTVSRLEEANS . : : .:: . : . ::: .. :. :.. . ..:: . CCDS31 SQALQQELAMLREELR--ARGPVD------TKPSNSLIPFLSFRSSEKDSA--------- 790 800 810 820 950 960 970 980 990 1000 pF1KE3 MLTKDIEILRRENEELTEKMKKAEEEYKLEKEEEISNLKAAFEKNINTERTLKTQAVNKL :: : . : :.. .: . . : . :.:. :: CCDS31 ---KDPGI----SGEATRH--GGEPDLRPEGR-----------------RSLRMGAVFPR 830 840 850 860 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KE3 AEIMNRKDFKIDRKKANTQDLRKKEKENRKLQLELNQEREKFNQMVVKHQKELNDMQAQL : : . . : ... :: :.. . : .. . .: : . . CCDS31 APTANTASTEGLPAKPGSHTLRP-----RSFPSPTKCLRCTSLMLGLGRQGLGCDACGYF 870 880 890 900 910 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KE3 VEECAHRNELQMQLASKESDIEQLRAKLLDLSDSTSVASFPSADETDGNLPESRIEGWLS : : :. :: :... : :: . . ::.:: CCDS31 ---CHTTCAPQAPPCPVPPDL--LR---------TALGVHP---ETGTG---TAYEGFLS 920 930 940 950 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KE3 VPNRGNIKRYGWKKQYVVVSSKKILFYNDEQDKEQSNPS----MVLDI-DKLFHVRPVTQ :: ....: ::.. ....:....:.. : : . : :: .:::. : : . :: CCDS31 VPRPSGVRR-GWQRVFAALSDSRLLLF-DAPDLRLSPPSGALLQVLDLRDPQFSATPVLA 960 970 980 990 1000 1010 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KE3 GDVYRAETEEIPKIFQILYANEGECRKDVEMEPVQQAEKTNFQNHKGHEFIPTLYHFPAN .:: .:.....:.::.. CCDS31 SDVIHAQSRDLPRIFRVTTSQLAVPPTTCTVLLLAESEGERERWLQVLGELQRLLLDARP 1020 1030 1040 1050 1060 1070 >>CCDS9192.1 CIT gene_id:11113|Hs108|chr12 (2027 aa) initn: 1097 init1: 444 opt: 1394 Z-score: 491.0 bits: 103.8 E(32554): 5e-21 Smith-Waterman score: 1500; 29.1% identity (62.6% similar) in 1222 aa overlap (23-1159:44-1232) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MSTGDSFETRFEKMDNLLRDPKSEVNSDCLLDGLDALVYDLDFPALRKNKNI : .. . .::.: .: . . ::: : :.. CCDS91 AGAAEPIASRASRLNLFFQGKPPFMTQQQMSPLSREGILDALFVLFEECSQPALMKIKHV 20 30 40 50 60 70 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 DNFLSRYKDTINKIRDLRMKAEDYEVVKVIGRGAFGEVQLVRHKSTRKVYAMKLLSKFEM .::. .:.::: ....:. .:.:.:: ...: : :.:::.::.:.: .::::...: . CCDS91 SNFVRKYSDTIAELQELQPSAKDFEVRSLVGCGHFAEVQVVREKATGDIYAMKVMKKKAL 80 90 100 110 120 130 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 IKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNLMSNYD--V . . . .:: :::.:.. ..:::. :: ::::: .::.::::.:::::..:.. :. . CCDS91 LAQEQVSFFEEERNILSRSTSPWIPQLQYAFQDKNHLYLVMEYQPGGDLLSLLNRYEDQL 140 150 160 170 180 190 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 PEKWARFYTAEVVLALDAIHSMGFIHRDVKPDNMLLDKSGHLKLADFGTCMKMNKEGMVR :. .:: ::..::. ..: ::..:::.::.:.:.:..::.::.:::. :::.. :: CCDS91 DENLIQFYLAELILAVHSVHLMGYVHRDIKPENILVDRTGHIKLVDFGSAAKMNSNKMVN 200 210 220 230 240 250 240 250 260 270 280 pF1KE3 CDTAVGTPDYISPEVLKSQGGDGY--YGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLVGTYS .:::::..:::: ..::: :: .::::::::. :::. : .:: . . :.. CCDS91 AKLPIGTPDYMAPEVLTVMNGDGKGTYGLDCDWWSVGVIAYEMIYGRSPFAEGTSARTFN 260 270 280 290 300 310 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 KIMNHKNSLTFPDDNDISKEAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIKRHLFF-KNDQWAWET .::: . : :::: .:.. .:: ..: .. :: .: . : :: : : :.. CCDS91 NIMNFQRFLKFPDDPKVSSDFLDLIQSLLCGQKERLKFEG---LCCHPFFSKID---WNN 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 LRDTVAPVVPDLSSDIDTSNFDDLEEDKGEEETFPI---PKAFVGNQLPFVGFTYYSNRR .:.. : :: :.:: ::::::. :... . : :..: :..::::::.: . CCDS91 IRNSPPPFVPTLKSDDDTSNFDEPEKNSWVSSS-PCQLSPSGFSGEELPFVGFSYSKALG 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 pF1KE3 YLS------SANPNDNRTSSNA------DKSLQESLQKTIYKLEEQ---LH---NEMQL- :. :. . .::: .: ::.: : .:.:.. :: .:.. CCDS91 ILGRSESVVSGLDSPAKTSSMEKKLLIKSKELQDS-QDKCHKMEQEMTRLHRRVSEVEAV 430 440 450 460 470 480 450 460 470 480 490 pF1KE3 --KDEMEQKCRTSNIKL--DKIMKELDEEGNQRRNLEST---VSQIEKEKMLLQHRINEY . :.: : .. .: . . . : .. .:.::.. ::: . . . : : : : CCDS91 LSQKEVELKASETQRSLLEQDLATYITECSSLKRSLEQARMEVSQEDDKALQLLHDIREQ 490 500 510 520 530 540 500 510 520 530 540 pF1KE3 QRKAEQ--ENEKRRNVENEVSTLKDQLE-DL---KKVS-------QNSQLANE----KLS .:: .. :.: . .:: :. . .::: :: .. : ..:.:: : : . CCDS91 SRKLQEIKEQEYQAQVE-EMRLMMNQLEEDLVSARRRSDLYESELRESRLAAEEFKRKAT 550 560 570 580 590 600 550 560 570 580 590 pF1KE3 QLQKQLEEANDLLRTESDTAVRLRKSHTEMSKSISQL-ESLNRELQ---ERNRILENSKS . :..: .:.: . : ..:.: ..:.. .:..: :.:.. .. : ...:.: .. CCDS91 ECQHKLLKAKDQGKPEVGEYAKLEKINAEQQLKIQELQEKLEKAVKASTEATELLQNIRQ 610 620 630 640 650 660 600 610 620 630 640 650 pF1KE3 QTDKDYYQLQAILEAERRDRGHDSEMIG--DLQARITSLQEEVKHLKHNLEKVEGERKEA .. .:. . . : ..: .... .:. . : ..::. .:.. : . .: CCDS91 AKERAERELEKLQNREDSSEGIRKKLVEAEELEEKHREAQVSAQHLEVHLKQKEQHYEEK 670 680 690 700 710 720 660 670 680 690 700 710 pF1KE3 QDMLNHSEKEKNNLEIDLNYK--LKSLQQRLEQEVNEHKVTKARLTDKHQSIEEAKSVAM .:. :... :: : :....:: :.:..: :... ...... .: . . CCDS91 IKVLD------NQIKKDLADKETLENMMQRHEEEAHE----KGKILSEQKAMINAMDSKI 730 740 750 760 770 720 730 740 750 760 pF1KE3 CEMEKKLKEEREAREKAENRVV----QIEKQCSMLDVDLKQSQQKLEHLTGNKE----RM .:... : :: . : : . ... : :.. .:.:.. :: .:. : .. CCDS91 RSLEQRIVELSEANKLAANSSLFTQRNMKAQEEMIS-ELRQQKFYLETQAGKLEAQNRKL 780 790 800 810 820 830 770 780 790 800 810 820 pF1KE3 EDEVKNLTLQLEQESNKRLLLQNELKTQAFEADNLKGLEKQMKQEINTLLEAKRLLEFEL :....... : ....:. : :...:. ..: .. : :: .:.... : . . : .: CCDS91 EEQLEKISHQDHSDKNRLLELETRLREVSLEHEEQK-LE--LKRQLTELQLSLQERESQL 840 850 860 870 880 890 830 840 850 860 870 880 pF1KE3 AQLTKQYRGNEGQMRELQDQLEAEQYFSTLYKTQVKELKEEIEEKNRENLKKIQELQNEK . : . :.:.:. . .:: . . ..::..: . :.. . .. CCDS91 TALQAARAALESQLRQAKTELEETTAEAEEEIQALTAHRDEIQRK-FDALRNSCTVITDL 900 910 920 930 940 890 900 910 920 930 pF1KE3 ETLATQL--DLAETKAESEQLARGLLE-----EQYFELTQES---KKAASRNRQEITDKD : .:: : :: . .. :.. : : .. .: .: .. .. ....:.. CCDS91 EEQLNQLTEDNAELNNQNFYLSKQLDEASGANDEIVQLRSEVDHLRREITEREMQLTSQK 950 960 970 980 990 1000 940 950 960 970 980 990 pF1KE3 HTVSRLEEANSMLTKDIEILRRENEELTEKMKKAEEEYKLEKEEEISNLKA---AFEKNI .:. :. . .:: ... :. :.:: :: .. : .. .:. :... ... . CCDS91 QTMEALKTTCTMLEEQVMDLEALNDELLEKERQWEAWRSVLGDEK-SQFECRVRELQRML 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KE3 NTERTLKTQAVNKLAEIMNRKDFKIDRKKANTQDLRKKEKENRKLQLELNQEREKFNQMV .::. ...: ....: . .. . ..::. :.. :: .::. : . .:.:.. CCDS91 DTEKQSRARADQRITESRQVVELAVKEHKAEILALQQALKE-QKLKAE--SLSDKLNDLE 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KE3 VKHQK-ELN--DMQAQLVEECAHRNELQMQLASKESDIEQLRAKLLDLSDSTSVASFPSA :: :.: ..: .: : ...: . :. ..... . ... :... . : . : CCDS91 KKHAMLEMNARSLQQKLETERELKQRLLEEQAKLQQQMDLQKNHIFRLTQGLQEA-LDRA 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KE3 D--ETDGNLPESRIEGWLSVPNRGNIKRYGWKKQYVVVSSKKILFYNDEQDKEQSNPSMV : .:. . : ..:. . .. ..: : .: ..: : : . ..:. CCDS91 DLLKTERSDLEYQLENIQVLYSHEKVKMEGTISQ----QTKLIDFLQAKMDQPAKKKKGL 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KE3 LDIDKLFHVRPVTQGDVYRAETEEIPKIFQILYANEGECRKDVEMEPVQQAEKTNFQNHK CCDS91 FSRRKEDPALPTQVPLQYNELKLALEKEKARCAELEEALQKTRIELRSAREEAAHRKATD 1250 1260 1270 1280 1290 1300 >>CCDS55891.1 CIT gene_id:11113|Hs108|chr12 (2069 aa) initn: 1097 init1: 444 opt: 1372 Z-score: 483.5 bits: 102.5 E(32554): 1.3e-20 Smith-Waterman score: 1491; 28.2% identity (61.5% similar) in 1275 aa overlap (23-1227:44-1271) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MSTGDSFETRFEKMDNLLRDPKSEVNSDCLLDGLDALVYDLDFPALRKNKNI : .. . .::.: .: . . ::: : :.. CCDS55 AGAAEPIASRASRLNLFFQGKPPFMTQQQMSPLSREGILDALFVLFEECSQPALMKIKHV 20 30 40 50 60 70 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 DNFLSRYKDTINKIRDLRMKAEDYEVVKVIGRGAFGEVQLVRHKSTRKVYAMKLLSKFEM .::. .:.::: ....:. .:.:.:: ...: : :.:::.::.:.: .::::...: . CCDS55 SNFVRKYSDTIAELQELQPSAKDFEVRSLVGCGHFAEVQVVREKATGDIYAMKVMKKKAL 80 90 100 110 120 130 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 IKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNLMSNYD--V . . . .:: :::.:.. ..:::. :: ::::: .::.::::.:::::..:.. :. . CCDS55 LAQEQVSFFEEERNILSRSTSPWIPQLQYAFQDKNHLYLVMEYQPGGDLLSLLNRYEDQL 140 150 160 170 180 190 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 PEKWARFYTAEVVLALDAIHSMGFIHRDVKPDNMLLDKSGHLKLADFGTCMKMNKEGMVR :. .:: ::..::. ..: ::..:::.::.:.:.:..::.::.:::. :::.. :: CCDS55 DENLIQFYLAELILAVHSVHLMGYVHRDIKPENILVDRTGHIKLVDFGSAAKMNSNKMVN 200 210 220 230 240 250 240 250 260 270 280 pF1KE3 CDTAVGTPDYISPEVLKSQGGDGY--YGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLVGTYS .:::::..:::: ..::: :: .::::::::. :::. : .:: . . :.. CCDS55 AKLPIGTPDYMAPEVLTVMNGDGKGTYGLDCDWWSVGVIAYEMIYGRSPFAEGTSARTFN 260 270 280 290 300 310 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 KIMNHKNSLTFPDDNDISKEAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIKRHLFF-KNDQWAWET .::: . : :::: .:.. .:: ..: .. :: .: . : :: : : :.. CCDS55 NIMNFQRFLKFPDDPKVSSDFLDLIQSLLCGQKERLKFEG---LCCHPFFSKID---WNN 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 LRDTVAPVVPDLSSDIDTSNFDDLEEDKGEEETFPI---PKAFVGNQLPFVGFTYYSNRR .:.. : :: :.:: ::::::. :... . : :..: :..::::::.: . CCDS55 IRNSPPPFVPTLKSDDDTSNFDEPEKNSWVSSS-PCQLSPSGFSGEELPFVGFSYSKALG 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 pF1KE3 YLS------SANPNDNRTSSNA------DKSLQESLQKTIYKLEEQ---LH---NEMQL- :. :. . .::: .: ::.: : .:.:.. :: .:.. CCDS55 ILGRSESVVSGLDSPAKTSSMEKKLLIKSKELQDS-QDKCHKMEQEMTRLHRRVSEVEAV 430 440 450 460 470 480 450 460 470 480 490 pF1KE3 --KDEMEQKCRTSNIKL--DKIMKELDEEGNQRRNLEST---VSQIEKEKMLLQHRINEY . :.: : .. .: . . . : .. .:.::.. ::: . . . : : : : CCDS55 LSQKEVELKASETQRSLLEQDLATYITECSSLKRSLEQARMEVSQEDDKALQLLHDIREQ 490 500 510 520 530 540 500 510 520 530 540 pF1KE3 QRKAEQ--ENEKRRNVENEVSTLKDQLE-DL---KKVS-------QNSQLANE----KLS .:: .. :.: . .:: :. . .::: :: .. : ..:.:: : : . CCDS55 SRKLQEIKEQEYQAQVE-EMRLMMNQLEEDLVSARRRSDLYESELRESRLAAEEFKRKAT 550 560 570 580 590 600 550 560 570 580 590 pF1KE3 QLQKQLEEANDLLRTESDTAVRLRKSHTEMSKSISQL-ESLNRELQ---ERNRILENSKS . :..: .:.: . : ..:.: ..:.. .:..: :.:.. .. : ...:.: .. CCDS55 ECQHKLLKAKDQGKPEVGEYAKLEKINAEQQLKIQELQEKLEKAVKASTEATELLQNIRQ 610 620 630 640 650 660 600 610 620 630 640 650 pF1KE3 QTDKDYYQLQAILEAERRDRGHDSEMIGDLQARITSLQEEVKHLKHNLEKVEGERKEAQD .. .:. . . : ..: .... . . : ::...::.:. ..:. :.. :. : CCDS55 AKERAERELEKLQNREDSSEGIRKKLV-EAEERRHSLENKVKRLE-TMERRENRLKD--D 670 680 690 700 710 720 660 670 680 690 700 710 pF1KE3 MLNHSEKEKNNLEIDLNYKLKSLQQRLEQEVNEHKVTKARLTDKHQSIEEAKSVAMCEME . ..:.. .. . :. . : .: : .: ...: .:.: :: .: .. CCDS55 IQTKSQQIQQMADKILELEEK---HREAQVSAQH--LEVHLKQKEQHYEEKIKV----LD 730 740 750 760 770 720 730 740 750 760 770 pF1KE3 KKLKEEREAREKAENRVVQIEKQCSMLDVDLKQSQQKLEHLTGNKERMEDEVKNLTLQLE ...:.. .: :: . . :.. :.... .. . .. . .:... .:. . CCDS55 NQIKKDLADKETLENMMQRHEEEAHEKGKILSEQKAMINAMDSKIRSLEQRIVELSEANK 780 790 800 810 820 830 780 790 800 810 820 830 pF1KE3 QESNKRLLLQNELKTQAFEADNLKGLEKQMKQEINTLLEAKRLLEFELAQLTKQYRGNEG .:. :. : ..:.: ..:. . .. . . : .: :: .: ....: ..... CCDS55 LAANSSLFTQRNMKAQEEMISELRQQKFYLETQAGKLEAQNRKLEEQLEKISHQDHSDKN 840 850 860 870 880 890 840 850 860 870 880 890 pF1KE3 QMRELQDQLEAEQYFSTLYKTQVKELKEEIEEKNRENLKKIQELQNEKETLATQLDLAET .. ::. .:. . : ..:. :.. . .: ... :: . .: .:: :.: CCDS55 RLLELETRLREVSLEHEEQKLELKRQLTELQLSLQERESQLTALQAARAALESQLRQAKT 900 910 920 930 940 950 900 910 920 930 940 950 pF1KE3 KAESEQLARGLLEEQYFELTQESKKAASRNRQEITDKDHTVSRLEEANSMLTKDIEILRR . : : :.. ::. :: . . .:. . . .. ... ::: ..::.: : CCDS55 ELE-ETTAEA--EEEIQALTAH-RDEIQRKFDALRNSCTVITDLEEQLNQLTEDNAELNN 960 970 980 990 1000 960 970 980 990 1000 1010 pF1KE3 ENEELTEKMKKAE--EEYKLEKEEEISNLKAAFEKNINTERTLKTQAVNKLAEIMNRKDF .: :.... .: .. .. . :...:. . . . . : . :... : . . CCDS55 QNFYLSKQLDEASGANDEIVQLRSEVDHLRREITER-EMQLTSQKQTMEALKTTCTMLEE 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KE3 KIDRKKANTQDLRKKEKENRKLQLELNQEREKFNQMVVKHQKELNDMQAQLVEECAHRNE .. .: ...: .::.. . . :..:. .:. : . :. : : . : . .: CCDS55 QVMDLEALNDELLEKERQWEAWRSVLGDEKSQFECRVRELQRML-DTEKQSRARADQRIT 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KE3 LQMQLASKESDIEQLRAKLLDLSDSTSVASFPSADETDGNLPESRIEGWLSVPNRGNIKR . :.. : ... .:..: :... . .. . . .: . .. : . :. .. CCDS55 ESRQVV--ELAVKEHKAEILALQQALKEQKLKAESLSDKLNDLEKKHAMLEMNARSLQQK 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KE3 YGWKKQYVVVSSKKILFYNDEQDKEQSNPSMVLDIDKLFHVRPVTQG--------DVYRA ... ....: .:: : :.. .:..: :. .::: :. .. CCDS55 LETEREL----KQRLL---EEQAKLQQQ----MDLQKN-HIFRLTQGLQEALDRADLLKT 1190 1200 1210 1220 1230 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KE3 ETEEIP---KIFQILYANEGECRKDVEMEPV--QQAEKTNFQNHKGHEFIPTLYHFPANC : .. . .:.::..: :.:: . ::.. .: . : CCDS55 ERSDLEYQLENIQVLYSHE-----KVKMEGTISQQTKLIDFLQAKMDQPAKKKKGLFSRR 1240 1250 1260 1270 1280 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KE3 DACAKPLWHVFKPPPALECRRCHVKCHRDHLDKKEDLICPCKVSYDVTSARDMLLLACSQ CCDS55 KEDPALPTQVPLQYNELKLALEKEKARCAELEEALQKTRIELRSAREEAAHRKATDHPHP 1290 1300 1310 1320 1330 1340 >>CCDS74400.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 (530 aa) initn: 958 init1: 418 opt: 1260 Z-score: 454.2 bits: 95.1 E(32554): 5.6e-19 Smith-Waterman score: 1264; 38.4% identity (69.8% similar) in 536 aa overlap (6-527:2-523) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MSTGDSFETRFEKMDNLLRDPKSEVNSDCLLDGLDALVYDLDFPALRKNKNIDNFLSRYK : :.:......:. :: . .. . ::: : .. .: : ..: . .::. . CCDS74 MSAEVRLRRLQQLVLDP-GFLGLEPLLDLLLGVHQELGASELAQDKYVADFLQWAE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 DTINKIRDLRMKAEDYEVVKVIGRGAFGEVQLVRHKSTRKVYAMKLLSKFEMIKRSDSAF . .....:.. .:.:..::::::::.:: .:. :.: .:::::...:..:.::.. . CCDS74 PIVVRLKEVRLQRDDFEILKVIGRGAFSEVAVVKMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKRGEVSC 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE3 FWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNLMSNYD--VPEKWARFY : ::::... .. :..:: .::::. :::.::::. ::::..:.:.. .: . :::: CCDS74 FREERDVLVNGDRRWITQLHFAFQDENYLYLVMEYYVGGDLLTLLSKFGERIPAEMARFY 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 TAEVVLALDAIHSMGFIHRDVKPDNMLLDKSGHLKLADFGTCMKMNKEGMVRCDTAVGTP ::.:.:.:..: .:..:::.::::.:::. ::..:::::.:.:. .: :: .::::: CCDS74 LAEIVMAIDSVHRLGYVHRDIKPDNILLDRCGHIRLADFGSCLKLRADGTVRSLVAVGTP 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 DYISPEVLKSQGGD---GYYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLVGTYSKIMNHKN ::.:::.:.. :: : :: :::::..::: :::. :.::::::: . ::.::...:. CCDS74 DYLSPEILQAVGGGPGTGSYGPECDWWALGVFAYEMFYGQTPFYADSTAETYGKIVHYKE 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 SLTFPD-DNDISKEAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIKRH-LFFKNDQWAWETLRDTVA :..: :. . .::...: .: :.::::.:. ... : .:: : :. :::.: CCDS74 HLSLPLVDEGVPEEARDFIQRLLCPPETRLGRGGAGDFRTHPFFFGLD---WDGLRDSVP 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 PVVPDLSSDIDTSNFDDLEEDKGEEETFPIPK--AFVGNQLPFVGFTYYSNRRYLSSANP : .::. . :: ::: .:. ::. . : .: .:::::..: : .: : CCDS74 PFTPDFEGATDTCNFDLVEDGLTAMETLSDIREGAPLGVHLPFVGYSY-SCMALRDSEVP 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 NDNRTSSNADKSLQE-----SLQKTIYKLEEQLHNEMQLKDEMEQKCRTSNIKLDKIMKE . . .:.. :. ::. .. .: :. . . ... : .... CCDS74 GPTPMELEAEQLLEPHVQAPSLEPSVSPQDET--AEVAVPAAVPAAEAEAEVTLRELQEA 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KE3 LDEEGNQRRNLESTVSQIEKEKMLLQHRINEYQRKAEQENEKRRNVENEVSTLKDQLEDL :.:: :..: . :. ... . .. :.:: .: :..: .: :....: : CCDS74 LEEEVLTRQSLSREMEAIRTDNQNFASQL----REAEARN---RDLEAHVRQLQERMELL 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 pF1KE3 KKVSQNSQLANEKLSQLQKQLEEANDLLRTESDTAVRLRKSHTEMSKSISQLESLNRELQ . CCDS74 QAEGATGP 530 >>CCDS46118.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 (624 aa) initn: 958 init1: 418 opt: 1260 Z-score: 453.3 bits: 95.1 E(32554): 6.3e-19 Smith-Waterman score: 1264; 38.4% identity (69.8% similar) in 536 aa overlap (6-527:2-523) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MSTGDSFETRFEKMDNLLRDPKSEVNSDCLLDGLDALVYDLDFPALRKNKNIDNFLSRYK : :.:......:. :: . .. . ::: : .. .: : ..: . .::. . CCDS46 MSAEVRLRRLQQLVLDP-GFLGLEPLLDLLLGVHQELGASELAQDKYVADFLQWAE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 DTINKIRDLRMKAEDYEVVKVIGRGAFGEVQLVRHKSTRKVYAMKLLSKFEMIKRSDSAF . .....:.. .:.:..::::::::.:: .:. :.: .:::::...:..:.::.. . CCDS46 PIVVRLKEVRLQRDDFEILKVIGRGAFSEVAVVKMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKRGEVSC 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE3 FWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNLMSNYD--VPEKWARFY : ::::... .. :..:: .::::. :::.::::. ::::..:.:.. .: . :::: CCDS46 FREERDVLVNGDRRWITQLHFAFQDENYLYLVMEYYVGGDLLTLLSKFGERIPAEMARFY 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 TAEVVLALDAIHSMGFIHRDVKPDNMLLDKSGHLKLADFGTCMKMNKEGMVRCDTAVGTP ::.:.:.:..: .:..:::.::::.:::. ::..:::::.:.:. .: :: .::::: CCDS46 LAEIVMAIDSVHRLGYVHRDIKPDNILLDRCGHIRLADFGSCLKLRADGTVRSLVAVGTP 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 DYISPEVLKSQGGD---GYYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLVGTYSKIMNHKN ::.:::.:.. :: : :: :::::..::: :::. :.::::::: . ::.::...:. CCDS46 DYLSPEILQAVGGGPGTGSYGPECDWWALGVFAYEMFYGQTPFYADSTAETYGKIVHYKE 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 SLTFPD-DNDISKEAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIKRH-LFFKNDQWAWETLRDTVA :..: :. . .::...: .: :.::::.:. ... : .:: : :. :::.: CCDS46 HLSLPLVDEGVPEEARDFIQRLLCPPETRLGRGGAGDFRTHPFFFGLD---WDGLRDSVP 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 PVVPDLSSDIDTSNFDDLEEDKGEEETFPIPK--AFVGNQLPFVGFTYYSNRRYLSSANP : .::. . :: ::: .:. ::. . : .: .:::::..: : .: : CCDS46 PFTPDFEGATDTCNFDLVEDGLTAMETLSDIREGAPLGVHLPFVGYSY-SCMALRDSEVP 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 NDNRTSSNADKSLQE-----SLQKTIYKLEEQLHNEMQLKDEMEQKCRTSNIKLDKIMKE . . .:.. :. ::. .. .: :. . . ... : .... CCDS46 GPTPMELEAEQLLEPHVQAPSLEPSVSPQDET--AEVAVPAAVPAAEAEAEVTLRELQEA 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KE3 LDEEGNQRRNLESTVSQIEKEKMLLQHRINEYQRKAEQENEKRRNVENEVSTLKDQLEDL :.:: :..: . :. ... . .. :.:: .: :..: .: :....: : CCDS46 LEEEVLTRQSLSREMEAIRTDNQNFASQL----REAEARN---RDLEAHVRQLQERMELL 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 pF1KE3 KKVSQNSQLANEKLSQLQKQLEEANDLLRTESDTAVRLRKSHTEMSKSISQLESLNRELQ . CCDS46 QAEGATAVTGVPSPRATDPPSHLDGPPAVAVGQCPLVGPGPMHRRHLLLPARVPRPGLSE 530 540 550 560 570 580 1354 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 00:26:09 2016 done: Sun Nov 6 00:26:10 2016 Total Scan time: 4.760 Total Display time: 0.570 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]