FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9282, 1249 aa 1>>>pF1KE9282 1249 - 1249 aa - 1249 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4532+/-0.00107; mu= 16.7367+/- 0.064 mean_var=79.6858+/-16.110, 0's: 0 Z-trim(103.6): 30 B-trim: 144 in 1/49 Lambda= 0.143676 statistics sampled from 7465 (7480) to 7465 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.584), E-opt: 0.2 (0.23), width: 16 Scan time: 3.080 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS11631.1 BRIP1 gene_id:83990|Hs108|chr17 (1249) 8292 1729.3 0 CCDS13531.1 RTEL1 gene_id:51750|Hs108|chr20 (1219) 940 205.4 7.5e-52 CCDS63331.1 RTEL1 gene_id:51750|Hs108|chr20 (1300) 940 205.4 8e-52 CCDS13530.3 RTEL1 gene_id:51750|Hs108|chr20 (1243) 853 187.3 2e-46 CCDS74751.1 RTEL1 gene_id:51750|Hs108|chr20 ( 996) 838 184.2 1.4e-45 CCDS33049.1 ERCC2 gene_id:2068|Hs108|chr19 ( 760) 589 132.6 3.9e-30 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CCDS63 -KVCVLGSREQLCIHPEVKKQ-ESNHLQIHLCRKKVASRSCHFYNNVEEKSLEQELAS-- 140 150 160 170 180 330 340 350 360 370 380 pF1KE9 GMCKAWDIEELVSLGKKLKACPYYTARELIQDADIIFCPYNYLLDAQIRESMDLNLKEQV :::.::. :.: ..:::: .:.: :.::::: ::::::::. :.. ...:: : CCDS63 ---PILDIEDLVKSGSKHRVCPYYLSRNLKQQADIIFMPYNYLLDAKSRRAHNIDLKGTV 190 200 210 220 230 240 390 400 410 420 430 440 pF1KE9 VILDEAHNIEDCARESASYSVTEVQLRFARDELDSMVNNNIRKKDH-EPLRAVCCSLINW ::.:::::.: .::::...: .: . : .:...... . .. :: . CCDS63 VIFDEAHNVEKMCEESASFDLTPHDLASGLDVIDQVLEEQTKAAQQGEPHPEFSAD---- 250 260 270 280 290 300 450 460 470 480 490 500 pF1KE9 LEANAEYLVERDYESACKIWSGNEMLLTLHKMGITTATFPILQGHFSAVLQKEEKISPIY . .. . :. :. .:.: . .: .. .: : :.: . : .. CCDS63 ---SPSPGLNMELEDIAKL----KMILLRLEGAIDAVELP---GDDSGVTKPGSYIFELF 310 320 330 340 350 510 520 530 540 550 560 pF1KE9 GKEEAREVPVISASTQIMLKGLFMVLDYLFRQNSRFADD---YKIA--IQQTYSWT-NQI . :. . . .: .: .....: . . :.. :.: :: ..: .. CCDS63 A-----EAQITFQTKGCILDSLDQIIQHLAGRAGVFTNTAGLQKLADIIQIVFSVDPSEG 360 370 380 390 400 570 580 590 600 pF1KE9 DISDKNGLLVLPKNK---------KRSRQKTAV----------HVLNFWCLNPAVAFSD- . .. :: .: . : .:. :.. . .::..::..:. .. . CCDS63 SPGSPAGLGALQSYKVHIHPDAGHRRTAQRSDAWSTTAARKRGKVLSYWCFSPGHSMHEL 410 420 430 440 450 460 610 620 630 640 650 660 pF1KE9 INGKVQTIVLTSGTLSPMKSFSSELGVTFTIQLEANHIIKNSQVWVGTIGSGPKGRNLCA . :....::::::.:..::. :. . : . :: ::: . :.:::.. :: : .: . CCDS63 VRQGVRSLILTSGTLAPVSSFALEMQIPFPVCLENPHIIDKHQIWVGVVPRGPDGAQLSS 470 480 490 500 510 520 670 680 690 700 710 720 pF1KE9 TFQNTETFEFQDEVGALLLSVCQTVSQGILCFLPSYKLLEKLKERWLSTGLWHNLELVKT .:. . : . .: : .. ..: :.: :.::: ..:: : : . : ...: .: CCDS63 AFDRRFSEECLSSLGKALGNIARVVPYGLLIFFPSYPVMEKSLEFWRARDLARKMEALKP 530 540 550 560 570 580 730 740 750 760 770 780 pF1KE9 VIVEPQGGEKTNFDELLQVYYDAIKYKGEKDGALLVAVCRGKVSEGLDFSDDNARAVITI ..:::.. : .:.: ...:: . : . :: ..::::::.:::::::: :.:.::. CCDS63 LFVEPRS--KGSFSETISAYYARVAAPG-STGATFLAVCRGKASEGLDFSDTNGRGVIVT 590 600 610 620 630 640 790 800 810 820 830 pF1KE9 GIPFPNVKDLQVELKRQYNDHHSKLRG----LLPGRQWYEIQAYRALNQALGRCIRHRND :.:.: : .: :: :. :. . : .: :..::. :: ::.:::.:: ::::.: CCDS63 GLPYPPRMDPRVVLKMQFLDEMKGQGGAGGQFLSGQEWYRQQASRAVNQAIGRVIRHRQD 650 660 670 680 690 700 840 850 860 870 880 890 pF1KE9 WGALILVDDRFRNNPSRYISGLSKWVRQQIQHHSTFESALESLAEFSKKHQKVLNV---- .::..: : :: .: . : .::: ... ...: .....:.: . .... . CCDS63 YGAVFLCDHRFAFADAR--AQLPSWVRPHVRVYDNFGHVIRDVAQFFRVAERTMPAPAPR 710 720 730 740 750 760 900 910 920 930 940 pF1KE9 ----SIKDRTNIQDNES------TLEVTSLKYSTPPYLLEAASHLSPENFVEDEAKICVQ :.. . ... .: : .. :: .: :. : :: . :...::. CCDS63 ATAPSVRGEDAVSEAKSPGPFFSTRKAKSLDLHVPS--LKQRSSGSPAAG-DPESSLCVE 770 780 790 800 810 950 960 970 980 990 1000 pF1KE9 ELQCPKIITKNSPLPSSIISRKEKNDPVFLEEAGKAEKIVISRSTSPTFNKQTKRVSWSS : : . ... : CCDS63 YEQEP-VPARQRPRGLLAALEHSEQRAGSPGEEQAHSCSTLSLLSEKRPAEEPRGGRKKI 820 830 840 850 860 870 >>CCDS13530.3 RTEL1 gene_id:51750|Hs108|chr20 (1243 aa) initn: 1248 init1: 301 opt: 853 Z-score: 946.8 bits: 187.3 E(32554): 2e-46 Smith-Waterman score: 1115; 30.9% identity (60.3% similar) in 786 aa overlap (241-957:104-855) 220 230 240 250 260 270 pF1KE9 PGHCSRCCCSTKQGNSQESSNTIKKDHTGKSKIPKIYFGTRTHKQIAQITRELRRTAYSG . :::: ...:::.:..:. ::: :.: . CCDS13 ERAQGELFPDRALSSWGNAAAAAGDPIACYTDIPKIIYASRTHSQLTQVINELRNTSYRS 80 90 100 110 120 130 280 290 300 pF1KE9 -----------VP------------MTILSSRDHTCVHPEVVGNFNRNEKCMELLDGK-N .: . .:.::.. :.:::: . . :. ..: : CCDS13 RCRATLWVLETAPPRPTVLSPTRPKVCVLGSREQLCIHPEVKKQ-ESNHLQIHLCRKKVA 140 150 160 170 180 190 310 320 330 340 350 360 pF1KE9 GKSCYFYHGVHKISDQHTLQTFQGMCKAWDIEELVSLGKKLKACPYYTARELIQDADIIF ..::.::..:.. : .. : . :::.::. :.: ..:::: .:.: :.::::: CCDS13 SRSCHFYNNVEEKSLEQELAS-----PILDIEDLVKSGSKHRVCPYYLSRNLKQQADIIF 200 210 220 230 240 370 380 390 400 410 420 pF1KE9 CPYNYLLDAQIRESMDLNLKEQVVILDEAHNIEDCARESASYSVTEVQLRFARDELDSMV ::::::::. :.. ...:: :::.:::::.: .::::...: .: . : .:... CCDS13 MPYNYLLDAKSRRAHNIDLKGTVVIFDEAHNVEKMCEESASFDLTPHDLASGLDVIDQVL 250 260 270 280 290 300 430 440 450 460 470 480 pF1KE9 NNNIRKKDH-EPLRAVCCSLINWLEANAEYLVERDYESACKIWSGNEMLLTLHKMGITTA ... . .. :: . . .. . :. :. .:.: . .: .. CCDS13 EEQTKAAQQGEPHPEFSAD-------SPSPGLNMELEDIAKL----KMILLRLEGAIDAV 310 320 330 340 350 490 500 510 520 530 540 pF1KE9 TFPILQGHFSAVLQKEEKISPIYGKEEAREVPVISASTQIMLKGLFMVLDYLFRQNSRFA .: : :.: . : ... :. . . .: .: .....: . . :. CCDS13 ELP---GDDSGVTKPGSYIFELFA-----EAQITFQTKGCILDSLDQIIQHLAGRAGVFT 360 370 380 390 400 550 560 570 580 pF1KE9 DD---YKIA--IQQTYSWT-NQIDISDKNGLLVLPKNK---------KRSRQKTAV---- . :.: :: ..: .. . .. :: .: . : .:. :.. . CCDS13 NTAGLQKLADIIQIVFSVDPSEGSPGSPAGLGALQSYKVHIHPDAGHRRTAQRSDAWSTT 410 420 430 440 450 460 590 600 610 620 630 pF1KE9 ------HVLNFWCLNPAVAFSD-INGKVQTIVLTSGTLSPMKSFSSELGVTFTIQLEANH .::..::..:. .. . . :....::::::.:..::. :. . : . :: : CCDS13 AARKRGKVLSYWCFSPGHSMHELVRQGVRSLILTSGTLAPVSSFALEMQIPFPVCLENPH 470 480 490 500 510 520 640 650 660 670 680 690 pF1KE9 IIKNSQVWVGTIGSGPKGRNLCATFQNTETFEFQDEVGALLLSVCQTVSQGILCFLPSYK :: . :.:::.. :: : .: ..:. . : . .: : .. ..: :.: :.::: CCDS13 IIDKHQIWVGVVPRGPDGAQLSSAFDRRFSEECLSSLGKALGNIARVVPYGLLIFFPSYP 530 540 550 560 570 580 700 710 720 730 740 750 pF1KE9 LLEKLKERWLSTGLWHNLELVKTVIVEPQGGEKTNFDELLQVYYDAIKYKGEKDGALLVA ..:: : : . : ...: .: ..:::.. : .:.: ...:: . : . :: ..: CCDS13 VMEKSLEFWRARDLARKMEALKPLFVEPRS--KGSFSETISAYYARVAAPG-STGATFLA 590 600 610 620 630 640 760 770 780 790 800 810 pF1KE9 VCRGKVSEGLDFSDDNARAVITIGIPFPNVKDLQVELKRQYNDHHSKLRG----LLPGRQ :::::.:::::::: :.:.::. :.:.: : .: :: :. :. . : .: :.. CCDS13 VCRGKASEGLDFSDTNGRGVIVTGLPYPPRMDPRVVLKMQFLDEMKGQGGAGGQFLSGQE 650 660 670 680 690 700 820 830 840 850 860 870 pF1KE9 WYEIQAYRALNQALGRCIRHRNDWGALILVDDRFRNNPSRYISGLSKWVRQQIQHHSTFE ::. :: ::.:::.:: ::::.:.::..: : :: .: . : .::: ... ...: CCDS13 WYRQQASRAVNQAIGRVIRHRQDYGAVFLCDHRFAFADAR--AQLPSWVRPHVRVYDNFG 710 720 730 740 750 760 880 890 900 910 920 pF1KE9 SALESLAEFSKKHQKVLNV--------SIKDRTNIQDNES------TLEVTSLKYSTPPY .....:.: . .... . :.. . ... .: : .. :: .: CCDS13 HVIRDVAQFFRVAERTMPAPAPRATAPSVRGEDAVSEAKSPGPFFSTRKAKSLDLHVPS- 770 780 790 800 810 820 930 940 950 960 970 980 pF1KE9 LLEAASHLSPENFVEDEAKICVQELQCPKIITKNSPLPSSIISRKEKNDPVFLEEAGKAE :. : :: . :...::. : : . ... : CCDS13 -LKQRSSGSPAAG-DPESSLCVEYEQEP-VPARQRPRGLLAALEHSEQRAGSPGEEQAHS 830 840 850 860 870 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE9 KIVISRSTSPTFNKQTKRVSWSSFNSLGQYFTGKIPKATPELGSSENSASSPPRFKTEKM CCDS13 CSTLSLLSEKRPAEEPRGGRKKIRLVSHPEEPVAGAQTDRAKLFMVAVKQELSQANFATF 880 890 900 910 920 930 >>CCDS74751.1 RTEL1 gene_id:51750|Hs108|chr20 (996 aa) initn: 819 init1: 292 opt: 838 Z-score: 931.6 bits: 184.2 E(32554): 1.4e-45 Smith-Waterman score: 867; 30.2% identity (60.3% similar) in 635 aa overlap (368-957:2-608) 340 350 360 370 380 390 pF1KE9 EELVSLGKKLKACPYYTARELIQDADIIFCPYNYLLDAQIRESMDLNLKEQVVILDEAHN ::::::::. :.. ...:: :::.::::: CCDS74 MPYNYLLDAKSRRAHNIDLKGTVVIFDEAHN 10 20 30 400 410 420 430 440 450 pF1KE9 IEDCARESASYSVTEVQLRFARDELDSMVNNNIRKKDH-EPLRAVCCSLINWLEANAEYL .: .::::...: .: . : .:...... . .. :: .. . : CCDS74 VEKMCEESASFDLTPHDLASGLDVIDQVLEEQTKAAQQGEPHPEFSA------DSPSPGL 40 50 60 70 80 460 470 480 490 500 510 pF1KE9 VERDYESACKIWSGNEMLLTLHKMGITTATFPILQGHFSAVLQKEEKISPIYGKEEAREV . . :. :. .:.: . .: .. .: : :.: . : ... :. CCDS74 -NMELEDIAKL----KMILLRLEGAIDAVELP---GDDSGVTKPGSYIFELFA-----EA 90 100 110 120 130 520 530 540 550 560 570 pF1KE9 PVISASTQIMLKGLFMVLDYLFRQNSRFADD---YKIA--IQQTYSWT-NQIDISDKNGL . . .: .: .....: . . :.. :.: :: ..: .. . .. :: CCDS74 QITFQTKGCILDSLDQIIQHLAGRAGVFTNTAGLQKLADIIQIVFSVDPSEGSPGSPAGL 140 150 160 170 180 190 580 590 600 610 pF1KE9 LVLPKNK---------KRSRQKTAV----------HVLNFWCLNPAVAFSD-INGKVQTI .: . : .:. :.. . .::..::..:. .. . . :... CCDS74 GALQSYKVHIHPDAGHRRTAQRSDAWSTTAARKRGKVLSYWCFSPGHSMHELVRQGVRSL 200 210 220 230 240 250 620 630 640 650 660 670 pF1KE9 VLTSGTLSPMKSFSSELGVTFTIQLEANHIIKNSQVWVGTIGSGPKGRNLCATFQNTETF .::::::.:..::. :. . : . :: ::: . :.:::.. :: : .: ..:. . CCDS74 ILTSGTLAPVSSFALEMQIPFPVCLENPHIIDKHQIWVGVVPRGPDGAQLSSAFDRRFSE 260 270 280 290 300 310 680 690 700 710 720 730 pF1KE9 EFQDEVGALLLSVCQTVSQGILCFLPSYKLLEKLKERWLSTGLWHNLELVKTVIVEPQGG : . .: : .. ..: :.: :.::: ..:: : : . : ...: .: ..:::.. CCDS74 ECLSSLGKALGNIARVVPYGLLIFFPSYPVMEKSLEFWRARDLARKMEALKPLFVEPRS- 320 330 340 350 360 370 740 750 760 770 780 790 pF1KE9 EKTNFDELLQVYYDAIKYKGEKDGALLVAVCRGKVSEGLDFSDDNARAVITIGIPFPNVK : .:.: ...:: . : . :: ..::::::.:::::::: :.:.::. :.:.: CCDS74 -KGSFSETISAYYARVAAPG-STGATFLAVCRGKASEGLDFSDTNGRGVIVTGLPYPPRM 380 390 400 410 420 800 810 820 830 840 pF1KE9 DLQVELKRQYNDHHSKLRG----LLPGRQWYEIQAYRALNQALGRCIRHRNDWGALILVD : .: :: :. :. . : .: :..::. :: ::.:::.:: ::::.:.::..: : CCDS74 DPRVVLKMQFLDEMKGQGGAGGQFLSGQEWYRQQASRAVNQAIGRVIRHRQDYGAVFLCD 430 440 450 460 470 480 850 860 870 880 890 pF1KE9 DRFRNNPSRYISGLSKWVRQQIQHHSTFESALESLAEFSKKHQKVLNV--------SIKD :: .: . : .::: ... ...: .....:.: . .... . :.. CCDS74 HRFAFADAR--AQLPSWVRPHVRVYDNFGHVIRDVAQFFRVAERTMPAPAPRATAPSVRG 490 500 510 520 530 540 900 910 920 930 940 950 pF1KE9 RTNIQDNES------TLEVTSLKYSTPPYLLEAASHLSPENFVEDEAKICVQELQCPKII . ... .: : .. :: .: :. : :: . :...::. : : . CCDS74 EDAVSEAKSPGPFFSTRKAKSLDLHVPS--LKQRSSGSPAAG-DPESSLCVEYEQEP-VP 550 560 570 580 590 600 960 970 980 990 1000 1010 pF1KE9 TKNSPLPSSIISRKEKNDPVFLEEAGKAEKIVISRSTSPTFNKQTKRVSWSSFNSLGQYF ... : CCDS74 ARQRPRGLLAALEHSEQRAGSPGEEQAHSCSTLSLLSEKRPAEEPRGGRKKIRLVSHPEE 610 620 630 640 650 660 >>CCDS33049.1 ERCC2 gene_id:2068|Hs108|chr19 (760 aa) initn: 511 init1: 133 opt: 589 Z-score: 654.6 bits: 132.6 E(32554): 3.9e-30 Smith-Waterman score: 633; 26.3% identity (54.2% similar) in 672 aa overlap (242-868:66-701) 220 230 240 250 260 pF1KE9 GHCSRCCCSTKQGNSQESSNTIKKDHTGKSKIPKIYFGTRTHKQIAQITRELRRT----- .. :. . .:: .: .. .:::. CCDS33 GHGVLEMPSGTGKTVSLLALIMAYQRAYPLEVTKLIYCSRTVPEIEKVIEELRKLLNFYE 40 50 60 70 80 90 270 280 290 300 310 pF1KE9 AYSG--VPMT--ILSSRDHTCVHPEVVG-NFNRNE--KCMELLDG------KNGKS---C : .:. :::: . :.::::. :... :: : . .. : : CCDS33 KQEGEKLPFLGLALSSRKNLCIHPEVTPLRFGKDVDGKCHSLTASYVRAQYQHDTSLPHC 100 110 120 130 140 150 320 330 340 350 360 370 pF1KE9 YFYHGVHKISDQHTLQTFQGMCKAWDIEELVSLGKKLKACPYYTARELIQDADIIFCPYN ::. . . : . :. .....: .::.. :::. :: : :... :. CCDS33 RFYEEFDAHGREVPLPA--GI---YNLDDLKALGRRQGWCPYFLARYSILHANVVVYSYH 160 170 180 190 200 210 380 390 400 410 420 pF1KE9 YLLDAQIRESMDLNL-KEQVVILDEAHNIEDCARESASYSVTEVQLRFARDELDSMVNNN :::: .: . .. .: .. ::..::::::.. .: : ..:. : . .:... .. CCDS33 YLLDPKIADLVSKELARKAVVVFDEAHNIDNVCIDSMSVNLTRRTLDRCQGNLETLQKTV 220 230 240 250 260 270 430 440 450 460 470 480 pF1KE9 IRKK--DHEPLRAVCCSLINWL-EANAEYLVERDYESACKIWSGNEMLLTLHKMGITTAT .: : :.. :: :.. : ::.: : : . : . .:.: .: :: CCDS33 LRIKETDEQRLRDEYRRLVEGLREASAAR--ETDAHLANPVLP-DEVLQEAVPGSIRTAE 280 290 300 310 320 490 500 510 520 530 540 pF1KE9 FPILQGHFSAVLQKEEKISPIYGKEEAREVPVISASTQIMLKGLFMVLDYLFRQNSRFAD :: . :.. . : : . : :.. : .:.:: . . . :. :: CCDS33 ------HFLGFLRRLLE----YVKWRLRVQHVVQESPPAFLSGLAQRV-CIQRKPLRFCA 330 340 350 360 370 550 560 570 580 590 pF1KE9 DYKIAIQQTYSWTNQIDISD--------------KNGLLVLPKNKKRSRQKTAVHVLNFW . .. .: :. :.: .:. .. . : .:.: CCDS33 ERLRSLLHTLEITDLADFSPLTLLANFATLVSTYAKGFTIIIEPFDDRTPTIANPILHFS 380 390 400 410 420 430 600 610 620 630 640 pF1KE9 CLNPAVAFSDINGKVQTIVLTSGTLSPMKSFSSELG------VTFTIQLEANHIIKNSQV :.. ..:.. . . :....:::::::. . . : .:::. : .. .. CCDS33 CMDASLAIKPVFERFQSVIITSGTLSPLDIYPKILDFHPVTMATFTMTLA--RVCLCPMI 440 450 460 470 480 490 650 660 670 680 690 700 pF1KE9 WVGTIGSGPKGRNLCATFQNTETFEFQDEVGALLLSVCQTVSQGILCFLPSYKLLEKLKE :: : . . :.. : . . : ::: . .: .::. :. ::. .:. CCDS33 ----IGRGNDQVAISSKFETREDIAVIRNYGNLLLEMSAVVPDGIVAFFTSYQYMESTVA 500 510 520 530 540 550 710 720 730 740 750 760 pF1KE9 RWLSTGLWHNLELVKTVIVEPQGGEKTNFDELLQVYYDAIKYKGEKDGALLVAVCRGKVS : :. .:.. : ...: : : .:. :. : .: . .:. ::.:..: ::::: CCDS33 SWYEQGILENIQRNKLLFIETQDGAETSV--ALEKYQEACE-NGR--GAILLSVARGKVS 560 570 580 590 600 770 780 790 800 810 820 pF1KE9 EGLDFSDDNARAVITIGIPFPNVKDLQVELKRQYNDHHSKLRGLLPGRQWYEIQAYRALN ::.:: .:::: .:.:. ... .. . .: . ..: .. ..:.: CCDS33 EGIDFVHHYGRAVIMFGVPYVYTQSRILKARLEYLRDQFQIRE----NDFLTFDAMRHAA 610 620 630 640 650 660 830 840 850 860 870 880 pF1KE9 QALGRCIRHRNDWGALILVDDRFRNNPSRYISGLSKWVRQQIQHHSTFESALESLAEFSK : .:: :: ..:.: ....: :: . .: . : .:..... CCDS33 QCVGRAIRGKTDYGLMVFADKRFARGDKR--GKLPRWIQEHLTDANLNLTVDEGVQVAKY 670 680 690 700 710 890 900 910 920 930 940 pF1KE9 KHQKVLNVSIKDRTNIQDNESTLEVTSLKYSTPPYLLEAASHLSPENFVEDEAKICVQEL CCDS33 FLRQMAQPFHREDQLGLSLLSLEQLESEETLKRIEQIAQQL 720 730 740 750 760 >>CCDS8721.1 DDX11 gene_id:1663|Hs108|chr12 (856 aa) initn: 783 init1: 229 opt: 378 Z-score: 417.4 bits: 88.8 E(32554): 6.3e-17 Smith-Waterman score: 778; 23.9% identity (56.6% similar) in 922 aa overlap (10-887:8-851) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MSSMWSEYTIGGVKIYFPYKAYPSQLAMMNSILRGLNSKQHCLLESPTGSGKSLALLCSA .:.... ::. : : .: . : :.. . ..:::::.::::.:.:.: CCDS87 MANETQKVGAIHFPFPFTPYSIQEDFMAELYRVLEAGKIGIFESPTGTGKSLSLICGA 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 LAWQQSLSGKPADEGVSEKAEVQLSCCCACHSKDFTNNDMNQGTSRHFNYPSTPPSERNG :.: ... : .: :..: . .: .... ..: . . :. . . CCDS87 LSWLRDFEQKKREE------EARLLETGTGPLHDEKDESLCLSSSCEGAAGTPRPAGEPA 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 TSSTCQDSPEKTTLAAKLSAKKQASIYRDENDDFQVEKKRIRPLETTQQIRKRHCFGTEV . .. :. :. .:.:.. :.: .: ..:.. .....:... : CCDS87 WVTQFVQKKEERDLVDRLKAEQARRKQREER--LQQLQHRVQLKYAAKRLRQEE---EER 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 pF1KE9 HNLDAKVDSGKTVKLNSPLEKINSFSPQKPPGHCSRCCCSTKQGNSQESSNTIKKDHTG- .:: .. : . .. . :... : :. .. . .. .. . .:. CCDS87 ENL-LRL-SREMLETGPEAERLE----QLESGEEELVLAEYESDEEKKVASRVDEDEDDL 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 -KSKIPKIYFGTRTHKQIAQITRELRRTAYS-GVPMTILSSRDHTCVHPEV--VGNFNR- . .: :::. .:::.:.::...:.... .. : .. :.::.. ::. .: .:. . CCDS87 EEEHITKIYYCSRTHSQLAQFVHEVKKSPFGKDVRLVSLGSRQNLCVNEDVKSLGSVQLI 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 pF1KE9 NEKCMELLDGKNGK------------------SCYFYHGVHKISDQHTLQTFQGMCKAWD :..:... ... : .: ::. : .: : ... .. : CCDS87 NDRCVDMQRSRHEKKKGAEEEKPKRRRQEKQAACPFYN--H---EQMGLLRDEALAEVKD 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE9 IEELVSLGKKLKACPYYTARELIQDADIIFCPYNYLLDAQIRESMDLNLKEQVVILDEAH .:.:..:::. .::::: .: : :... ::..:: : :.. . :..::::.:::: CCDS87 MEQLLALGKEARACPYYGSRLAIPAAQLVVLPYQMLLHAATRQAAGIRLQDQVVIIDEAH 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE9 NIEDCARESASYSVTEVQLRFARDELDSMVN---NNIRKKDHEPLRAVCCSLINWLEANA :. : : :. :: :...: ..:. . .. :. :. . :.. . : CCDS87 NLIDTITGMHSVEVSGSQLCQAHSQLLQYVERYGKRLKAKNLMYLKQIL-YLLEKFVAVL 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 pF1KE9 EYLVERDYESACKIWSGNEMLLTLHKMGITTATFPILQGHFSAVLQKEEKISPIYGKEEA .... .. .:.: : :.. . . . : . . .: ..: : CCDS87 GGNIKQNPNTQSLSQTGTE-LKTINDFLFQSQIDNINLFKVQRYCEKSMISRKLFGFTE- 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 pF1KE9 REVPVISASTQIMLKGLFMVLDYLFRQNSRF----ADDYKIA-------IQQTYSWTNQI : :.:. : : :. . :. : .... ::. . . ... .. . CCDS87 RYGAVFSSREQPKLAGFQQFLQSLQPRTTEALAAPADESQASTLRPASPLMHIQGFLAAL 520 530 540 550 560 570 570 580 590 600 610 620 pF1KE9 DISDKNGLLVLPKNKKRSRQKTAVHVLNFWCLNPAVAFSDINGKVQTIVLTSGTLSPMKS ....: ..: .. . : :.: :.: ::::: :... . ...:...::..:... CCDS87 TTANQDGRVILSRQGSLS-QST----LKFLLLNPAVHFAQVVKECRAVVIAGGTMQPVSD 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 pF1KE9 FSSELGVTFTIQLEANHIIKNSQVWVGTIGSGPKGRNLCATFQNTETFEFQDEVGALLLS : ..: . . ::..... : :. :.. : : CCDS87 FRQQLLACAGV--EAERVVEFS----------------CGHVIPP------DNI--LPLV 630 640 650 660 690 700 710 720 730 740 pF1KE9 VCQTVSQGILCFLPSYKLLEKLKERWLSTGLWHNLELVKTVIVEPQGGEKTNFDELLQVY .:. .:. : : ...: :: . .. ::...... ...: .: CCDS87 ICSGISNQPLEFT--------FQKR----------ELPQMIFQEPKSAHQV--EQVLLAY 670 680 690 700 750 760 770 780 790 pF1KE9 YDAIKY----KGEKDGALLVAVCRGKVSEGLDFSDDNARAVITIGIPFPNVKDLQVELKR :. .:. ::::..: ::.:::..:::. .: :. .:.::::... ... : CCDS87 SRCIQACGQERGQVTGALLLSVVGGKMSEGINFSDNLGRCVVMVGMPFPNIRSAELQEKM 710 720 730 740 750 760 800 810 820 830 840 850 pF1KE9 QYNDHH-SKLRGLLP-GRQWYEIQAYRALNQALGRCIRHRNDWGALILVDDRFRNNPSRY : :. . : : :. : ..:.::..:: :::..:.....:.:.:. : CCDS87 AYLDQTLPRAPGQAPPGKALVENLCMKAVNQSIGRAIRHQKDFASVVLLDQRYARPP--V 770 780 790 800 810 820 860 870 880 890 900 910 pF1KE9 ISGLSKWVRQQIQHHSTFESALESLAEFSKKHQKVLNVSIKDRTNIQDNESTLEVTSLKY .. : :.: ... ..:: :. .. .: .. CCDS87 LAKLPAWIRARVEVKATFGPAIAAVQKFHREKSASS 830 840 850 920 930 940 950 960 970 pF1KE9 STPPYLLEAASHLSPENFVEDEAKICVQELQCPKIITKNSPLPSSIISRKEKNDPVFLEE >>CCDS41767.1 DDX11 gene_id:1663|Hs108|chr12 (906 aa) initn: 954 init1: 229 opt: 378 Z-score: 416.9 bits: 88.8 E(32554): 6.7e-17 Smith-Waterman score: 1000; 25.5% identity (59.5% similar) in 928 aa overlap (10-887:8-901) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MSSMWSEYTIGGVKIYFPYKAYPSQLAMMNSILRGLNSKQHCLLESPTGSGKSLALLCSA .:.... ::. : : .: . : :.. . ..:::::.::::.:.:.: CCDS41 MANETQKVGAIHFPFPFTPYSIQEDFMAELYRVLEAGKIGIFESPTGTGKSLSLICGA 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 LAWQQSLSGKPADEGVSEKAEVQLSCCCACHSKDFTNNDMNQGTSRHFNYPSTPPSERNG :.: ... : .: :..: . .: .... ..: . . :. . . CCDS41 LSWLRDFEQKKREE------EARLLETGTGPLHDEKDESLCLSSSCEGAAGTPRPAGEPA 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 TSSTCQDSPEKTTLAAKLSAKKQASIYRDENDDFQVEKKRIRPLETTQQIRKRHCFGTEV . .. :. :. .:.:.. :.: .: ..:.. .....:... : CCDS41 WVTQFVQKKEERDLVDRLKAEQARRKQREER--LQQLQHRVQLKYAAKRLRQEE---EER 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 pF1KE9 HNLDAKVDSGKTVKLNSPLEKINSFSPQKPPGHCSRCCCSTKQGNSQESSNTIKKDHTG- .:: .. : . .. . :... : :. .. . .. .. . .:. CCDS41 ENL-LRL-SREMLETGPEAERLE----QLESGEEELVLAEYESDEEKKVASRVDEDEDDL 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 -KSKIPKIYFGTRTHKQIAQITRELRRTAYS-GVPMTILSSRDHTCVHPEV--VGNFNR- . .: :::. .:::.:.::...:.... .. : .. :.::.. ::. .: .:. . CCDS41 EEEHITKIYYCSRTHSQLAQFVHEVKKSPFGKDVRLVSLGSRQNLCVNEDVKSLGSVQLI 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 pF1KE9 NEKCMELLDGKNGK------------------SCYFYHGVHKISDQHTLQTFQGMCKAWD :..:... ... : .: ::. : .: : ... .. : CCDS41 NDRCVDMQRSRHEKKKGAEEEKPKRRRQEKQAACPFYN--H---EQMGLLRDEALAEVKD 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE9 IEELVSLGKKLKACPYYTARELIQDADIIFCPYNYLLDAQIRESMDLNLKEQVVILDEAH .:.:..:::. .::::: .: : :... ::..:: : :.. . :..::::.:::: CCDS41 MEQLLALGKEARACPYYGSRLAIPAAQLVVLPYQMLLHAATRQAAGIRLQDQVVIIDEAH 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE9 NIEDCARESASYSVTEVQLRFARDELDSMVN---NNIRKKDHEPLRAVCCSLINWLEANA :. : : :. :: :...: ..:. . .. :. :. . :.. . : CCDS41 NLIDTITGMHSVEVSGSQLCQAHSQLLQYVERYGKRLKAKNLMYLKQIL-YLLEKFVAVL 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 pF1KE9 EYLVERDYESACKIWSGNEMLLTLHKMGITTATFPILQGHFSAVLQKEEKISPIYGKEEA .... .. .:.: : :.. . . . : . . .: ..: : CCDS41 GGNIKQNPNTQSLSQTGTE-LKTINDFLFQSQIDNINLFKVQRYCEKSMISRKLFGFTE- 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 pF1KE9 REVPVISASTQIMLKGLFMVLDYLFRQNSRF----ADDYKIA-------IQQTYSWTNQI : :.:. : : :. . :. : .... ::. . . ... .. . 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CCDS41 RPP--VLAKLPAWIRARVEVKATFGPAIAAVQKFHREKSASS 870 880 890 900 920 930 940 950 960 970 pF1KE9 VTSLKYSTPPYLLEAASHLSPENFVEDEAKICVQELQCPKIITKNSPLPSSIISRKEKND >>CCDS44856.1 DDX11 gene_id:1663|Hs108|chr12 (970 aa) initn: 772 init1: 229 opt: 378 Z-score: 416.5 bits: 88.8 E(32554): 7.1e-17 Smith-Waterman score: 855; 25.3% identity (58.8% similar) in 851 aa overlap (10-812:8-826) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MSSMWSEYTIGGVKIYFPYKAYPSQLAMMNSILRGLNSKQHCLLESPTGSGKSLALLCSA .:.... ::. : : .: . : :.. . ..:::::.::::.:.:.: CCDS44 MANETQKVGAIHFPFPFTPYSIQEDFMAELYRVLEAGKIGIFESPTGTGKSLSLICGA 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 LAWQQSLSGKPADEGVSEKAEVQLSCCCACHSKDFTNNDMNQGTSRHFNYPSTPPSERNG :.: ... : .: :..: . .: .... ..: . . :. . . CCDS44 LSWLRDFEQKKREE------EARLLETGTGPLHDEKDESLCLSSSCEGAAGTPRPAGEPA 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 TSSTCQDSPEKTTLAAKLSAKKQASIYRDENDDFQVEKKRIRPLETTQQIRKRHCFGTEV . .. :. :. .:.:.. :.: .: ..:.. .....:... : CCDS44 WVTQFVQKKEERDLVDRLKAEQARRKQREER--LQQLQHRVQLKYAAKRLRQEE---EER 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 pF1KE9 HNLDAKVDSGKTVKLNSPLEKINSFSPQKPPGHCSRCCCSTKQGNSQESSNTIKKDHTG- .:: .. : . .. . :... : :. .. . .. .. . .:. CCDS44 ENL-LRL-SREMLETGPEAERLE----QLESGEEELVLAEYESDEEKKVASRVDEDEDDL 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 -KSKIPKIYFGTRTHKQIAQITRELRRTAYS-GVPMTILSSRDHTCVHPEV--VGNFNR- . .: :::. .:::.:.::...:.... .. : .. :.::.. ::. .: .:. . 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CCDS44 QVLLAYSRCIQACGQERGQVTGALLLSVVGGKMSEGINFSDNLGRCVVMVGMPFPNIRSA 750 760 770 780 790 800 800 810 820 830 840 850 pF1KE9 QVELKRQYNDHHSKLRGLLPGRQWYEIQAYRALNQALGRCIRHRNDWGALILVDDRFRNN ... : : :. . : : CCDS44 ELQEKMAYLDQTLSPRPGTPREGSGGEPVHEGRQPVHRQGHQAPEGFCQRSAPGPAICPA 810 820 830 840 850 860 >>CCDS58224.1 DDX11 gene_id:1663|Hs108|chr12 (880 aa) initn: 917 init1: 229 opt: 339 Z-score: 373.5 bits: 80.8 E(32554): 1.8e-14 Smith-Waterman score: 961; 25.5% identity (59.4% similar) in 909 aa overlap (29-887:1-875) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MSSMWSEYTIGGVKIYFPYKAYPSQLAMMNSILRGLNSKQHCLLESPTGSGKSLALLCSA : . : :.. . ..:::::.::::.:.:.: CCDS58 MAELYRVLEAGKIGIFESPTGTGKSLSLICGA 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 LAWQQSLSGKPADEGVSEKAEVQLSCCCACHSKDFTNNDMNQGTSRHFNYPSTPPSERNG :.: ... : .: :..: . .: .... ..: . . :. . . CCDS58 LSWLRDFEQKKREE------EARLLETGTGPLHDEKDESLCLSSSCEGAAGTPRPAGEPA 40 50 60 70 80 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 TSSTCQDSPEKTTLAAKLSAKKQASIYRDENDDFQVEKKRIRPLETTQQIRKRHCFGTEV . .. :. :. .:.:.. :.: .: ..:.. .....:... : CCDS58 WVTQFVQKKEERDLVDRLKAEQARRKQREER--LQQLQHRVQLKYAAKRLRQEE---EER 90 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 pF1KE9 HNLDAKVDSGKTVKLNSPLEKINSFSPQKPPGHCSRCCCSTKQGNSQESSNTIKKDHTG- .:: .. : . .. . :... : :. .. . .. .. . .:. CCDS58 ENL-LRL-SREMLETGPEAERLE----QLESGEEELVLAEYESDEEKKVASRVDEDEDDL 150 160 170 180 190 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 -KSKIPKIYFGTRTHKQIAQITRELRRTAYS-GVPMTILSSRDHTCVHPEV--VGNFNR- . .: :::. .:::.:.::...:.... .. : .. :.::.. ::. .: .:. . 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