Result of FASTA (omim) for pFN21AE3764
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE3764, 630 aa
  1>>>pF1KE3764 630 - 630 aa - 630 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3755+/-0.000352; mu= 7.0281+/- 0.022
 mean_var=207.6378+/-44.656, 0's: 0 Z-trim(120.5): 121  B-trim: 0 in 0/55
 Lambda= 0.089006
 statistics sampled from 35770 (35907) to 35770 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.743), E-opt: 0.2 (0.421), width:  16
 Scan time: 11.180

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001123512 (OMIM: 600560) SHC-transforming prote ( 584) 1548 211.6 6.3e-54
NP_892113 (OMIM: 600560) SHC-transforming protein  ( 583) 1540 210.6 1.3e-53
NP_003020 (OMIM: 600560) SHC-transforming protein  ( 474) 1457 199.8 1.8e-50
NP_001123513 (OMIM: 600560) SHC-transforming prote ( 473) 1449 198.8 3.6e-50
NP_001189788 (OMIM: 600560) SHC-transforming prote ( 428) 1446 198.4 4.4e-50
XP_011508194 (OMIM: 600560) PREDICTED: SHC-transfo ( 593) 1435 197.1 1.5e-49
XP_011508195 (OMIM: 600560) PREDICTED: SHC-transfo ( 592) 1434 197.0 1.6e-49
XP_005245506 (OMIM: 600560) PREDICTED: SHC-transfo ( 598) 1351 186.3 2.7e-46
XP_005245508 (OMIM: 600560) PREDICTED: SHC-transfo ( 488) 1260 174.5 7.5e-43
XP_011508200 (OMIM: 600560) PREDICTED: SHC-transfo ( 432) 1213 168.5 4.5e-41
NP_036567 (OMIM: 605217) SHC-transforming protein  ( 582) 1196 166.4 2.5e-40
XP_011526195 (OMIM: 605217) PREDICTED: SHC-transfo ( 594) 1079 151.4 8.6e-36
XP_011526198 (OMIM: 605217) PREDICTED: SHC-transfo ( 437) 1013 142.8 2.4e-33
XP_016882056 (OMIM: 605217) PREDICTED: SHC-transfo ( 437) 1013 142.8 2.4e-33
NP_058544 (OMIM: 605263) SHC-transforming protein  ( 594) 1002 141.5 8.2e-33
XP_011517087 (OMIM: 605263) PREDICTED: SHC-transfo ( 598) 1002 141.5 8.2e-33
XP_011526197 (OMIM: 605217) PREDICTED: SHC-transfo ( 537)  860 123.2 2.3e-27
XP_011526196 (OMIM: 605217) PREDICTED: SHC-transfo ( 549)  860 123.2 2.4e-27
XP_011517088 (OMIM: 605263) PREDICTED: SHC-transfo ( 452)  803 115.8 3.3e-25
XP_011508199 (OMIM: 600560) PREDICTED: SHC-transfo ( 465)  803 115.8 3.3e-25
XP_016857570 (OMIM: 600560) PREDICTED: SHC-transfo ( 566)  804 116.0 3.5e-25
XP_011508196 (OMIM: 600560) PREDICTED: SHC-transfo ( 575)  803 115.9 3.9e-25
XP_016857572 (OMIM: 600560) PREDICTED: SHC-transfo ( 455)  801 115.6 3.9e-25
XP_016857571 (OMIM: 600560) PREDICTED: SHC-transfo ( 565)  801 115.7 4.6e-25
XP_016870299 (OMIM: 605263) PREDICTED: SHC-transfo ( 307)  712 104.0 8.1e-22
NP_001294960 (OMIM: 176942) tyrosine-protein kinas ( 453)  236 43.0  0.0027
XP_011541578 (OMIM: 176942) PREDICTED: tyrosine-pr ( 468)  236 43.0  0.0028
NP_001294957 (OMIM: 176942) tyrosine-protein kinas ( 647)  236 43.2  0.0035
XP_016864722 (OMIM: 176942) PREDICTED: tyrosine-pr ( 764)  236 43.2   0.004
XP_016864721 (OMIM: 176942) PREDICTED: tyrosine-pr ( 773)  236 43.2   0.004
XP_016864720 (OMIM: 176942) PREDICTED: tyrosine-pr ( 822)  236 43.2  0.0042
NP_005237 (OMIM: 176942) tyrosine-protein kinase F ( 822)  236 43.2  0.0042
XP_011541573 (OMIM: 176942) PREDICTED: tyrosine-pr ( 822)  236 43.2  0.0042
XP_016864719 (OMIM: 176942) PREDICTED: tyrosine-pr ( 822)  236 43.2  0.0042
XP_016864718 (OMIM: 176942) PREDICTED: tyrosine-pr ( 837)  236 43.3  0.0043
XP_011541571 (OMIM: 176942) PREDICTED: tyrosine-pr ( 837)  236 43.3  0.0043
XP_011541572 (OMIM: 176942) PREDICTED: tyrosine-pr ( 837)  236 43.3  0.0043
XP_011541569 (OMIM: 176942) PREDICTED: tyrosine-pr ( 837)  236 43.3  0.0043
XP_011541568 (OMIM: 176942) PREDICTED: tyrosine-pr ( 837)  236 43.3  0.0043


>>NP_001123512 (OMIM: 600560) SHC-transforming protein 1  (584 aa)
 initn: 1722 init1: 862 opt: 1548  Z-score: 1089.1  bits: 211.6 E(85289): 6.3e-54
Smith-Waterman score: 1638; 49.1% identity (69.9% similar) in 611 aa overlap (27-619:7-582)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MRERGQDSLAGLVLYVGLFGHPGMLHRAKYSRFRNESITSLDEGSSGGSVGNKGSPQPPH
                                 . ::. .::::..::.::.:: :.  .  :.:  
NP_001                     MDLLPPKPKYNPLRNESLSSLEEGASG-STPPEELPSPSA
                                   10        20         30         

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 PALAPHLPTEDATLPSQESPTPLCTLIPRMASMKLANPATLLSLKNFCLGTKEVPRLKLQ
        .:.: ::     ::...::: ::...:::....:::::          :.:  :    .
NP_001 SSLGPILP----PLPGDDSPTTLCSFFPRMSNLRLANPAGGRP------GSKGEPGRAAD
      40            50        60        70              80         

              130       140         150       160          170     
pF1KE3 ESRDPGSSGPSSPETSLSRSGTAPPPQQ--DLVGHRATALTPDSCPLPGPG---EPTLRS
       ...  :  : . :.     ::  :  :.   : :  .     ..  : :     . .. .
NP_001 DGE--GIVGAAMPD-----SGPLPLLQDMNKLSGGGGRRTRVEGGQLGGEEWTRHGSFVN
      90         100            110       120       130       140  

         180          190       200       210       220       230  
pF1KE3 RQDRHFLQ---HLLGMGMNYCVRYMGCVEVLQSMRSLDFGMRTQVTREAISRLCEAVPGA
       .  : .:.   ...: :..: ::::::::::::::.:::. :::::::::: .:::::::
NP_001 KPTRGWLHPNDKVMGPGVSYLVRYMGCVEVLQSMRALDFNTRTQVTREAISLVCEAVPGA
            150       160       170       180       190       200  

            240       250       260       270       280       290  
pF1KE3 NGAIKKRKPPVKFLSTVLGKSNLQFSGMNIKLTISTCSLTLMNLDNQQIIANHHMQSISF
       .:: ..:::  . ::..::.:::.:.:: : ::.:: ::.::  : .:::::::::::::
NP_001 KGATRRRKPCSRPLSSILGRSNLKFAGMPITLTVSTSSLNLMAADCKQIIANHHMQSISF
            210       220       230       240       250       260  

            300       310       320       330       340       350  
pF1KE3 ASGGDPDTTDYVAYVAKDPVNQRACHILECHNGMAQDVISTIGQAFELRFKQYLKNPSLN
       ::::::::..:::::::::::::::::::: .:.::::::::::::::::::::.::   
NP_001 ASGGDPDTAEYVAYVAKDPVNQRACHILECPEGLAQDVISTIGQAFELRFKQYLRNPPKL
            270       280       290       300       310       320  

            360         370          380       390       400       
pF1KE3 TSCESEEVHIDSHA--EERE---DHEYYNEIPGKQPPVGGVSDMRIKVQATEQMAYCPIQ
       .. ... . .:. :  ::.:   ::.:::..:::.::.::: :::..  :.   :  :  
NP_001 VTPHDRMAGFDGSAWDEEEEEPPDHQYYNDFPGKEPPLGGVVDMRLREGAAPGAAR-PTA
            330       340       350       360       370        380 

       410       420       430       440       450       460       
pF1KE3 CEKLCYLPGNSKCSSVYENCLEQSRAIGNVHPRGVQSQRDTSLLKHTCRVDLFDDPCYIN
              : :..  :     :  .. .:.  :. :..:        . : .::::: :.:
NP_001 -------P-NAQTPSHLGATLPVGQPVGG-DPE-VRKQMPPPPPCPAGR-ELFDDPSYVN
                     390       400         410       420        430

       470       480       490       500            510       520  
pF1KE3 TQALQSTPGSAGNQRSAQPLGSPWHCGKAPETV---QP--GATAQPASSHSLPHIKQQLW
       .: :...  ..:.   : :  .:   :.::. .   .:   :   :   .:.  . .:: 
NP_001 VQNLDKARQAVGG---AGP-PNPAINGSAPRDLFDMKPFEDALRVPPPPQSVS-MAEQLR
              440           450       460       470        480     

            530       540       550       560       570       580  
pF1KE3 SEECYHGKLSRKAAESLLVKDGDFLVRESATSPGQYVLSGLQGGQAKHLLLVDPEGKVRT
       .:  .::::::. ::.::  .::::::::.:.::::::.:::.:: :::::::::: :::
NP_001 GEPWFHGKLSRREAEALLQLNGDFLVRESTTTPGQYVLTGLQSGQPKHLLLVDPEGVVRT
         490       500       510       520       530       540     

            590       600       610       620       630
pF1KE3 KDHVFDNVGHLIRYHMDNSLPIISSGSEVSLKQPVRKDNNPALLHSNK
       ::: :..:.::: ::::: :::::.:::. :.:::..           
NP_001 KDHRFESVSHLISYHMDNHLPIISAGSELCLQQPVERKL         
         550       560       570       580             

>>NP_892113 (OMIM: 600560) SHC-transforming protein 1 is  (583 aa)
 initn: 1590 init1: 862 opt: 1540  Z-score: 1083.6  bits: 210.6 E(85289): 1.3e-53
Smith-Waterman score: 1635; 49.0% identity (69.6% similar) in 612 aa overlap (27-619:7-581)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MRERGQDSLAGLVLYVGLFGHPGMLHRAKYSRFRNESITSLDEGSSGGSVGNKGSPQPPH
                                 . ::. .::::..::.::.:: :.  .  :.:  
NP_892                     MDLLPPKPKYNPLRNESLSSLEEGASG-STPPEELPSPSA
                                   10        20         30         

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 PALAPHLPTEDATLPSQESPTPLCTLIPRMASMKLANPATLLSLKNFCLGTKEVPRLKLQ
        .:.: ::     ::...::: ::...:::....:::::          :.:  :    .
NP_892 SSLGPILP----PLPGDDSPTTLCSFFPRMSNLRLANPAGGRP------GSKGEPGRAAD
      40            50        60        70              80         

              130       140         150       160          170     
pF1KE3 ESRDPGSSGPSSPETSLSRSGTAPPPQQ--DLVGHRATALTPDSCPLPGPG---EPTLRS
       ...  :  : . :.     ::  :  :.   : :  .     ..  : :     . .. .
NP_892 DGE--GIVGAAMPD-----SGPLPLLQDMNKLSGGGGRRTRVEGGQLGGEEWTRHGSFVN
      90         100            110       120       130       140  

         180          190       200       210       220       230  
pF1KE3 RQDRHFLQ---HLLGMGMNYCVRYMGCVEVLQSMRSLDFGMRTQVTREAISRLCEAVPGA
       .  : .:.   ...: :..: ::::::::::::::.:::. :::::::::: .:::::::
NP_892 KPTRGWLHPNDKVMGPGVSYLVRYMGCVEVLQSMRALDFNTRTQVTREAISLVCEAVPGA
            150       160       170       180       190       200  

            240       250       260       270       280       290  
pF1KE3 NGAIKKRKPPVKFLSTVLGKSNLQFSGMNIKLTISTCSLTLMNLDNQQIIANHHMQSISF
       .:: ..:::  . ::..::.:::.:.:: : ::.:: ::.::  : .:::::::::::::
NP_892 KGATRRRKPCSRPLSSILGRSNLKFAGMPITLTVSTSSLNLMAADCKQIIANHHMQSISF
            210       220       230       240       250       260  

            300       310       320       330       340       350  
pF1KE3 ASGGDPDTTDYVAYVAKDPVNQRACHILECHNGMAQDVISTIGQAFELRFKQYLKNPSLN
       ::::::::..:::::::::::::::::::: .:.::::::::::::::::::::.::   
NP_892 ASGGDPDTAEYVAYVAKDPVNQRACHILECPEGLAQDVISTIGQAFELRFKQYLRNPPKL
            270       280       290       300       310       320  

            360         370          380       390       400       
pF1KE3 TSCESEEVHIDSHA--EERE---DHEYYNEIPGKQPPVGGVSDMRIKVQATEQMAYCPIQ
       .. ... . .:. :  ::.:   ::.:::..:::.::.::: :::..  :.   :  :  
NP_892 VTPHDRMAGFDGSAWDEEEEEPPDHQYYNDFPGKEPPLGGVVDMRLREGAAPGAAR-PTA
            330       340       350       360       370        380 

       410       420       430       440       450        460      
pF1KE3 CEKLCYLPGNSKCSSVYENCLEQSRAIGNVHPRGVQSQRDTSLLKHTCR-VDLFDDPCYI
              : :..  :     :  .. .:.  :. :..:         :   .::::: :.
NP_892 -------P-NAQTPSHLGATLPVGQPVGG-DPE-VRKQMPP---PPPCPGRELFDDPSYV
                     390       400         410          420        

        470       480       490       500            510       520 
pF1KE3 NTQALQSTPGSAGNQRSAQPLGSPWHCGKAPETV---QP--GATAQPASSHSLPHIKQQL
       :.: :...  ..:.   : :  .:   :.::. .   .:   :   :   .:.  . .::
NP_892 NVQNLDKARQAVGG---AGP-PNPAINGSAPRDLFDMKPFEDALRVPPPPQSVS-MAEQL
      430       440           450       460       470        480   

             530       540       550       560       570       580 
pF1KE3 WSEECYHGKLSRKAAESLLVKDGDFLVRESATSPGQYVLSGLQGGQAKHLLLVDPEGKVR
        .:  .::::::. ::.::  .::::::::.:.::::::.:::.:: :::::::::: ::
NP_892 RGEPWFHGKLSRREAEALLQLNGDFLVRESTTTPGQYVLTGLQSGQPKHLLLVDPEGVVR
           490       500       510       520       530       540   

             590       600       610       620       630
pF1KE3 TKDHVFDNVGHLIRYHMDNSLPIISSGSEVSLKQPVRKDNNPALLHSNK
       :::: :..:.::: ::::: :::::.:::. :.:::..           
NP_892 TKDHRFESVSHLISYHMDNHLPIISAGSELCLQQPVERKL         
           550       560       570       580            

>>NP_003020 (OMIM: 600560) SHC-transforming protein 1 is  (474 aa)
 initn: 1512 init1: 862 opt: 1457  Z-score: 1027.2  bits: 199.8 E(85289): 1.8e-50
Smith-Waterman score: 1472; 55.8% identity (75.3% similar) in 450 aa overlap (180-619:40-472)

     150       160       170       180       190       200         
pF1KE3 LVGHRATALTPDSCPLPGPGEPTLRSRQDRHFLQHLLGMGMNYCVRYMGCVEVLQSMRSL
                                     :  ....: :..: ::::::::::::::.:
NP_003 RRTRVEGGQLGGEEWTRHGSFVNKPTRGWLHPNDKVMGPGVSYLVRYMGCVEVLQSMRAL
      10        20        30        40        50        60         

     210       220       230       240       250       260         
pF1KE3 DFGMRTQVTREAISRLCEAVPGANGAIKKRKPPVKFLSTVLGKSNLQFSGMNIKLTISTC
       ::. :::::::::: .:::::::.:: ..:::  . ::..::.:::.:.:: : ::.:: 
NP_003 DFNTRTQVTREAISLVCEAVPGAKGATRRRKPCSRPLSSILGRSNLKFAGMPITLTVSTS
      70        80        90       100       110       120         

     270       280       290       300       310       320         
pF1KE3 SLTLMNLDNQQIIANHHMQSISFASGGDPDTTDYVAYVAKDPVNQRACHILECHNGMAQD
       ::.::  : .:::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::: .:.:::
NP_003 SLNLMAADCKQIIANHHMQSISFASGGDPDTAEYVAYVAKDPVNQRACHILECPEGLAQD
     130       140       150       160       170       180         

     330       340       350       360         370          380    
pF1KE3 VISTIGQAFELRFKQYLKNPSLNTSCESEEVHIDSHA--EERE---DHEYYNEIPGKQPP
       :::::::::::::::::.::   .. ... . .:. :  ::.:   ::.:::..:::.::
NP_003 VISTIGQAFELRFKQYLRNPPKLVTPHDRMAGFDGSAWDEEEEEPPDHQYYNDFPGKEPP
     190       200       210       220       230       240         

          390       400       410       420       430       440    
pF1KE3 VGGVSDMRIKVQATEQMAYCPIQCEKLCYLPGNSKCSSVYENCLEQSRAIGNVHPRGVQS
       .::: :::..  :.   :  :         : :..  :     :  .. .:.  :. :..
NP_003 LGGVVDMRLREGAAPGAAR-PTA-------P-NAQTPSHLGATLPVGQPVGG-DPE-VRK
     250       260        270               280       290          

          450       460       470       480       490       500    
pF1KE3 QRDTSLLKHTCRVDLFDDPCYINTQALQSTPGSAGNQRSAQPLGSPWHCGKAPETV---Q
       :        . : .::::: :.:.: :...  ..:.   : :  .:   :.::. .   .
NP_003 QMPPPPPCPAGR-ELFDDPSYVNVQNLDKARQAVGG---AGP-PNPAINGSAPRDLFDMK
      300       310        320       330           340       350   

               510       520       530       540       550         
pF1KE3 P--GATAQPASSHSLPHIKQQLWSEECYHGKLSRKAAESLLVKDGDFLVRESATSPGQYV
       :   :   :   .:.  . .:: .:  .::::::. ::.::  .::::::::.:.:::::
NP_003 PFEDALRVPPPPQSVS-MAEQLRGEPWFHGKLSRREAEALLQLNGDFLVRESTTTPGQYV
           360        370       380       390       400       410  

     560       570       580       590       600       610         
pF1KE3 LSGLQGGQAKHLLLVDPEGKVRTKDHVFDNVGHLIRYHMDNSLPIISSGSEVSLKQPVRK
       :.:::.:: :::::::::: :::::: :..:.::: ::::: :::::.:::. :.:::..
NP_003 LTGLQSGQPKHLLLVDPEGVVRTKDHRFESVSHLISYHMDNHLPIISAGSELCLQQPVER
            420       430       440       450       460       470  

     620       630
pF1KE3 DNNPALLHSNK
                  
NP_003 KL         
                  

>>NP_001123513 (OMIM: 600560) SHC-transforming protein 1  (473 aa)
 initn: 1380 init1: 862 opt: 1449  Z-score: 1021.6  bits: 198.8 E(85289): 3.6e-50
Smith-Waterman score: 1469; 55.7% identity (74.9% similar) in 451 aa overlap (180-619:40-471)

     150       160       170       180       190       200         
pF1KE3 LVGHRATALTPDSCPLPGPGEPTLRSRQDRHFLQHLLGMGMNYCVRYMGCVEVLQSMRSL
                                     :  ....: :..: ::::::::::::::.:
NP_001 RRTRVEGGQLGGEEWTRHGSFVNKPTRGWLHPNDKVMGPGVSYLVRYMGCVEVLQSMRAL
      10        20        30        40        50        60         

     210       220       230       240       250       260         
pF1KE3 DFGMRTQVTREAISRLCEAVPGANGAIKKRKPPVKFLSTVLGKSNLQFSGMNIKLTISTC
       ::. :::::::::: .:::::::.:: ..:::  . ::..::.:::.:.:: : ::.:: 
NP_001 DFNTRTQVTREAISLVCEAVPGAKGATRRRKPCSRPLSSILGRSNLKFAGMPITLTVSTS
      70        80        90       100       110       120         

     270       280       290       300       310       320         
pF1KE3 SLTLMNLDNQQIIANHHMQSISFASGGDPDTTDYVAYVAKDPVNQRACHILECHNGMAQD
       ::.::  : .:::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::: .:.:::
NP_001 SLNLMAADCKQIIANHHMQSISFASGGDPDTAEYVAYVAKDPVNQRACHILECPEGLAQD
     130       140       150       160       170       180         

     330       340       350       360         370          380    
pF1KE3 VISTIGQAFELRFKQYLKNPSLNTSCESEEVHIDSHA--EERE---DHEYYNEIPGKQPP
       :::::::::::::::::.::   .. ... . .:. :  ::.:   ::.:::..:::.::
NP_001 VISTIGQAFELRFKQYLRNPPKLVTPHDRMAGFDGSAWDEEEEEPPDHQYYNDFPGKEPP
     190       200       210       220       230       240         

          390       400       410       420       430       440    
pF1KE3 VGGVSDMRIKVQATEQMAYCPIQCEKLCYLPGNSKCSSVYENCLEQSRAIGNVHPRGVQS
       .::: :::..  :.   :  :         : :..  :     :  .. .:.  :. :..
NP_001 LGGVVDMRLREGAAPGAAR-PTA-------P-NAQTPSHLGATLPVGQPVGG-DPE-VRK
     250       260        270               280       290          

          450        460       470       480       490       500   
pF1KE3 QRDTSLLKHTCR-VDLFDDPCYINTQALQSTPGSAGNQRSAQPLGSPWHCGKAPETV---
       :         :   .::::: :.:.: :...  ..:.   : :  .:   :.::. .   
NP_001 QMPPP---PPCPGRELFDDPSYVNVQNLDKARQAVGG---AGP-PNPAINGSAPRDLFDM
      300          310       320       330           340       350 

                510       520       530       540       550        
pF1KE3 QP--GATAQPASSHSLPHIKQQLWSEECYHGKLSRKAAESLLVKDGDFLVRESATSPGQY
       .:   :   :   .:.  . .:: .:  .::::::. ::.::  .::::::::.:.::::
NP_001 KPFEDALRVPPPPQSVS-MAEQLRGEPWFHGKLSRREAEALLQLNGDFLVRESTTTPGQY
             360        370       380       390       400       410

      560       570       580       590       600       610        
pF1KE3 VLSGLQGGQAKHLLLVDPEGKVRTKDHVFDNVGHLIRYHMDNSLPIISSGSEVSLKQPVR
       ::.:::.:: :::::::::: :::::: :..:.::: ::::: :::::.:::. :.:::.
NP_001 VLTGLQSGQPKHLLLVDPEGVVRTKDHRFESVSHLISYHMDNHLPIISAGSELCLQQPVE
              420       430       440       450       460       470

      620       630
pF1KE3 KDNNPALLHSNK
       .           
NP_001 RKL         
                   

>>NP_001189788 (OMIM: 600560) SHC-transforming protein 1  (428 aa)
 initn: 1379 init1: 861 opt: 1446  Z-score: 1020.1  bits: 198.4 E(85289): 4.4e-50
Smith-Waterman score: 1466; 56.2% identity (75.1% similar) in 445 aa overlap (186-619:1-426)

         160       170       180       190       200       210     
pF1KE3 TALTPDSCPLPGPGEPTLRSRQDRHFLQHLLGMGMNYCVRYMGCVEVLQSMRSLDFGMRT
                                     .: :..: ::::::::::::::.:::. ::
NP_001                               MGPGVSYLVRYMGCVEVLQSMRALDFNTRT
                                             10        20        30

         220       230       240       250       260       270     
pF1KE3 QVTREAISRLCEAVPGANGAIKKRKPPVKFLSTVLGKSNLQFSGMNIKLTISTCSLTLMN
       :::::::: .:::::::.:: ..:::  . ::..::.:::.:.:: : ::.:: ::.:: 
NP_001 QVTREAISLVCEAVPGAKGATRRRKPCSRPLSSILGRSNLKFAGMPITLTVSTSSLNLMA
               40        50        60        70        80        90

         280       290       300       310       320       330     
pF1KE3 LDNQQIIANHHMQSISFASGGDPDTTDYVAYVAKDPVNQRACHILECHNGMAQDVISTIG
        : .:::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::: .:.:::::::::
NP_001 ADCKQIIANHHMQSISFASGGDPDTAEYVAYVAKDPVNQRACHILECPEGLAQDVISTIG
              100       110       120       130       140       150

         340       350       360         370          380       390
pF1KE3 QAFELRFKQYLKNPSLNTSCESEEVHIDSHA--EERE---DHEYYNEIPGKQPPVGGVSD
       :::::::::::.::   .. ... . .:. :  ::.:   ::.:::..:::.::.::: :
NP_001 QAFELRFKQYLRNPPKLVTPHDRMAGFDGSAWDEEEEEPPDHQYYNDFPGKEPPLGGVVD
              160       170       180       190       200       210

              400       410       420       430       440       450
pF1KE3 MRIKVQATEQMAYCPIQCEKLCYLPGNSKCSSVYENCLEQSRAIGNVHPRGVQSQRDTSL
       ::..  :.   :  :         : :..  :     :  .. .:.  :. :..:     
NP_001 MRLREGAAPGAAR-PTA-------P-NAQTPSHLGATLPVGQPVGG-DPE-VRKQMPPP-
              220                230       240        250          

               460       470       480       490       500         
pF1KE3 LKHTCR-VDLFDDPCYINTQALQSTPGSAGNQRSAQPLGSPWHCGKAPETV---QP--GA
           :   .::::: :.:.: :...  ..:.   : :  .:   :.::. .   .:   :
NP_001 --PPCPGRELFDDPSYVNVQNLDKARQAVGG---AGP-PNPAINGSAPRDLFDMKPFEDA
        260       270       280          290        300       310  

          510       520       530       540       550       560    
pF1KE3 TAQPASSHSLPHIKQQLWSEECYHGKLSRKAAESLLVKDGDFLVRESATSPGQYVLSGLQ
          :   .:.  . .:: .:  .::::::. ::.::  .::::::::.:.::::::.:::
NP_001 LRVPPPPQSVS-MAEQLRGEPWFHGKLSRREAEALLQLNGDFLVRESTTTPGQYVLTGLQ
            320        330       340       350       360       370 

          570       580       590       600       610       620    
pF1KE3 GGQAKHLLLVDPEGKVRTKDHVFDNVGHLIRYHMDNSLPIISSGSEVSLKQPVRKDNNPA
       .:: :::::::::: :::::: :..:.::: ::::: :::::.:::. :.:::..     
NP_001 SGQPKHLLLVDPEGVVRTKDHRFESVSHLISYHMDNHLPIISAGSELCLQQPVERKL   
             380       390       400       410       420           

          630
pF1KE3 LLHSNK

>>XP_011508194 (OMIM: 600560) PREDICTED: SHC-transformin  (593 aa)
 initn: 1711 init1: 851 opt: 1435  Z-score: 1010.6  bits: 197.1 E(85289): 1.5e-49
Smith-Waterman score: 1628; 48.5% identity (68.4% similar) in 620 aa overlap (27-619:7-591)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MRERGQDSLAGLVLYVGLFGHPGMLHRAKYSRFRNESITSLDEGSSGGSVGNKGSPQPPH
                                 . ::. .::::..::.::.:: :.  .  :.:  
XP_011                     MDLLPPKPKYNPLRNESLSSLEEGASG-STPPEELPSPSA
                                   10        20         30         

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 PALAPHLPTEDATLPSQESPTPLCTLIPRMASMKLANPATLLSLKNFCLGTKEVPRLKLQ
        .:.: ::     ::...::: ::...:::....:::::          :.:  :    .
XP_011 SSLGPILP----PLPGDDSPTTLCSFFPRMSNLRLANPAGGRP------GSKGEPGRAAD
      40            50        60        70              80         

              130       140         150       160          170     
pF1KE3 ESRDPGSSGPSSPETSLSRSGTAPPPQQ--DLVGHRATALTPDSCPLPGPG---EPTLRS
       ...  :  : . :.     ::  :  :.   : :  .     ..  : :     . .. .
XP_011 DGE--GIVGAAMPD-----SGPLPLLQDMNKLSGGGGRRTRVEGGQLGGEEWTRHGSFVN
      90         100            110       120       130       140  

         180          190       200       210       220       230  
pF1KE3 RQDRHFLQ---HLLGMGMNYCVRYMGCVEVLQSMRSLDFGMRTQVTREAISRLCEAVPGA
       .  : .:.   ...: :..: ::::::::::::::.:::. :::::::::: .:::::::
XP_011 KPTRGWLHPNDKVMGPGVSYLVRYMGCVEVLQSMRALDFNTRTQVTREAISLVCEAVPGA
            150       160       170       180       190       200  

            240       250       260       270       280       290  
pF1KE3 NGAIKKRKPPVKFLSTVLGKSNLQFSGMNIKLTISTCSLTLMNLDNQQIIANHHMQSISF
       .:: ..:::  . ::..::.:::.:.:: : ::.:: ::.::  : .:::::::::::::
XP_011 KGATRRRKPCSRPLSSILGRSNLKFAGMPITLTVSTSSLNLMAADCKQIIANHHMQSISF
            210       220       230       240       250       260  

            300       310       320       330       340        350 
pF1KE3 ASGGDPDTTDYVAYVAKDPVNQRACHILECHNGMAQDVISTIGQAFELRFKQYLKNP-SL
       ::::::::..:::::::::::::::::::: .:.::::::::::::::::::::.:: .:
XP_011 ASGGDPDTAEYVAYVAKDPVNQRACHILECPEGLAQDVISTIGQAFELRFKQYLRNPPKL
            270       280       290       300       310       320  

             360                    370       380       390        
pF1KE3 NTSCESEEVHI-------------DSHAEEREDHEYYNEIPGKQPPVGGVSDMRIKVQAT
        :  .:.   .             : . ::  ::.:::..:::.::.::: :::..  :.
XP_011 VTPHDSHSFTVLSLRMAGFDGSAWDEEEEEPPDHQYYNDFPGKEPPLGGVVDMRLREGAA
            330       340       350       360       370       380  

      400       410       420       430       440       450        
pF1KE3 EQMAYCPIQCEKLCYLPGNSKCSSVYENCLEQSRAIGNVHPRGVQSQRDTSLLKHTCRVD
          :  :         : :..  :     :  .. .:.  :. :..:        . : .
XP_011 PGAAR-PTA-------P-NAQTPSHLGATLPVGQPVGG-DPE-VRKQMPPPPPCPAGR-E
             390               400       410         420        430

      460       470       480       490       500            510   
pF1KE3 LFDDPCYINTQALQSTPGSAGNQRSAQPLGSPWHCGKAPETV---QP--GATAQPASSHS
       ::::: :.:.: :...  ..:.   : :  .:   :.::. .   .:   :   :   .:
XP_011 LFDDPSYVNVQNLDKARQAVGG---AGP-PNPAINGSAPRDLFDMKPFEDALRVPPPPQS
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           520       530       540       550       560       570   
pF1KE3 LPHIKQQLWSEECYHGKLSRKAAESLLVKDGDFLVRESATSPGQYVLSGLQGGQAKHLLL
       .  . .:: .:  .::::::. ::.::  .::::::::.:.::::::.:::.:: :::::
XP_011 VS-MAEQLRGEPWFHGKLSRREAEALLQLNGDFLVRESTTTPGQYVLTGLQSGQPKHLLL
         490       500       510       520       530       540     

           580       590       600       610       620       630
pF1KE3 VDPEGKVRTKDHVFDNVGHLIRYHMDNSLPIISSGSEVSLKQPVRKDNNPALLHSNK
       ::::: :::::: :..:.::: ::::: :::::.:::. :.:::..           
XP_011 VDPEGVVRTKDHRFESVSHLISYHMDNHLPIISAGSELCLQQPVERKL         
         550       560       570       580       590            

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 initn: 1718 init1: 851 opt: 1434  Z-score: 1009.9  bits: 197.0 E(85289): 1.6e-49
Smith-Waterman score: 1625; 48.5% identity (68.1% similar) in 621 aa overlap (27-619:7-590)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MRERGQDSLAGLVLYVGLFGHPGMLHRAKYSRFRNESITSLDEGSSGGSVGNKGSPQPPH
                                 . ::. .::::..::.::.:: :.  .  :.:  
XP_011                     MDLLPPKPKYNPLRNESLSSLEEGASG-STPPEELPSPSA
                                   10        20         30         

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 PALAPHLPTEDATLPSQESPTPLCTLIPRMASMKLANPATLLSLKNFCLGTKEVPRLKLQ
        .:.: ::     ::...::: ::...:::....:::::          :.:  :    .
XP_011 SSLGPILP----PLPGDDSPTTLCSFFPRMSNLRLANPAGGRP------GSKGEPGRAAD
      40            50        60        70              80         

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pF1KE3 ESRDPGSSGPSSPETSLSRSGTAPPPQQ--DLVGHRATALTPDSCPLPGPG---EPTLRS
       ...  :  : . :.     ::  :  :.   : :  .     ..  : :     . .. .
XP_011 DGE--GIVGAAMPD-----SGPLPLLQDMNKLSGGGGRRTRVEGGQLGGEEWTRHGSFVN
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pF1KE3 RQDRHFLQ---HLLGMGMNYCVRYMGCVEVLQSMRSLDFGMRTQVTREAISRLCEAVPGA
       .  : .:.   ...: :..: ::::::::::::::.:::. :::::::::: .:::::::
XP_011 KPTRGWLHPNDKVMGPGVSYLVRYMGCVEVLQSMRALDFNTRTQVTREAISLVCEAVPGA
            150       160       170       180       190       200  

            240       250       260       270       280       290  
pF1KE3 NGAIKKRKPPVKFLSTVLGKSNLQFSGMNIKLTISTCSLTLMNLDNQQIIANHHMQSISF
       .:: ..:::  . ::..::.:::.:.:: : ::.:: ::.::  : .:::::::::::::
XP_011 KGATRRRKPCSRPLSSILGRSNLKFAGMPITLTVSTSSLNLMAADCKQIIANHHMQSISF
            210       220       230       240       250       260  

            300       310       320       330       340        350 
pF1KE3 ASGGDPDTTDYVAYVAKDPVNQRACHILECHNGMAQDVISTIGQAFELRFKQYLKNP-SL
       ::::::::..:::::::::::::::::::: .:.::::::::::::::::::::.:: .:
XP_011 ASGGDPDTAEYVAYVAKDPVNQRACHILECPEGLAQDVISTIGQAFELRFKQYLRNPPKL
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pF1KE3 NTSCESEEVHI-------------DSHAEEREDHEYYNEIPGKQPPVGGVSDMRIKVQAT
        :  .:.   .             : . ::  ::.:::..:::.::.::: :::..  :.
XP_011 VTPHDSHSFTVLSLRMAGFDGSAWDEEEEEPPDHQYYNDFPGKEPPLGGVVDMRLREGAA
            330       340       350       360       370       380  

      400       410       420       430       440       450        
pF1KE3 EQMAYCPIQCEKLCYLPGNSKCSSVYENCLEQSRAIGNVHPRGVQSQRDTSLLKHTCR-V
          :  :         : :..  :     :  .. .:.  :. :..:         :   
XP_011 PGAAR-PTA-------P-NAQTPSHLGATLPVGQPVGG-DPE-VRKQMPP---PPPCPGR
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       460       470       480       490       500            510  
pF1KE3 DLFDDPCYINTQALQSTPGSAGNQRSAQPLGSPWHCGKAPETV---QP--GATAQPASSH
       .::::: :.:.: :...  ..:.   : :  .:   :.::. .   .:   :   :   .
XP_011 ELFDDPSYVNVQNLDKARQAVGG---AGP-PNPAINGSAPRDLFDMKPFEDALRVPPPPQ
      430       440       450           460       470       480    

            520       530       540       550       560       570  
pF1KE3 SLPHIKQQLWSEECYHGKLSRKAAESLLVKDGDFLVRESATSPGQYVLSGLQGGQAKHLL
       :.  . .:: .:  .::::::. ::.::  .::::::::.:.::::::.:::.:: ::::
XP_011 SVS-MAEQLRGEPWFHGKLSRREAEALLQLNGDFLVRESTTTPGQYVLTGLQSGQPKHLL
           490       500       510       520       530       540   

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pF1KE3 LVDPEGKVRTKDHVFDNVGHLIRYHMDNSLPIISSGSEVSLKQPVRKDNNPALLHSNK
       :::::: :::::: :..:.::: ::::: :::::.:::. :.:::..           
XP_011 LVDPEGVVRTKDHRFESVSHLISYHMDNHLPIISAGSELCLQQPVERKL         
           550       560       570       580       590           

>>XP_005245506 (OMIM: 600560) PREDICTED: SHC-transformin  (598 aa)
 initn: 1366 init1: 862 opt: 1351  Z-score: 952.3  bits: 186.3 E(85289): 2.7e-46
Smith-Waterman score: 1446; 47.6% identity (68.2% similar) in 573 aa overlap (27-580:7-542)

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pF1KE3 MRERGQDSLAGLVLYVGLFGHPGMLHRAKYSRFRNESITSLDEGSSGGSVGNKGSPQPPH
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XP_005                     MDLLPPKPKYNPLRNESLSSLEEGASG-STPPEELPSPSA
                                   10        20         30         

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 PALAPHLPTEDATLPSQESPTPLCTLIPRMASMKLANPATLLSLKNFCLGTKEVPRLKLQ
        .:.: ::     ::...::: ::...:::....:::::          :.:  :    .
XP_005 SSLGPILP----PLPGDDSPTTLCSFFPRMSNLRLANPAGGRP------GSKGEPGRAAD
      40            50        60        70              80         

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pF1KE3 ESRDPGSSGPSSPETSLSRSGTAPPPQQ--DLVGHRATALTPDSCPLPGPG---EPTLRS
       ...  :  : . :.     ::  :  :.   : :  .     ..  : :     . .. .
XP_005 DGE--GIVGAAMPD-----SGPLPLLQDMNKLSGGGGRRTRVEGGQLGGEEWTRHGSFVN
      90         100            110       120       130       140  

         180          190       200       210       220       230  
pF1KE3 RQDRHFLQ---HLLGMGMNYCVRYMGCVEVLQSMRSLDFGMRTQVTREAISRLCEAVPGA
       .  : .:.   ...: :..: ::::::::::::::.:::. :::::::::: .:::::::
XP_005 KPTRGWLHPNDKVMGPGVSYLVRYMGCVEVLQSMRALDFNTRTQVTREAISLVCEAVPGA
            150       160       170       180       190       200  

            240       250       260       270       280       290  
pF1KE3 NGAIKKRKPPVKFLSTVLGKSNLQFSGMNIKLTISTCSLTLMNLDNQQIIANHHMQSISF
       .:: ..:::  . ::..::.:::.:.:: : ::.:: ::.::  : .:::::::::::::
XP_005 KGATRRRKPCSRPLSSILGRSNLKFAGMPITLTVSTSSLNLMAADCKQIIANHHMQSISF
            210       220       230       240       250       260  

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pF1KE3 ASGGDPDTTDYVAYVAKDPVNQRACHILECHNGMAQDVISTIGQAFELRFKQYLKNPSLN
       ::::::::..:::::::::::::::::::: .:.::::::::::::::::::::.::   
XP_005 ASGGDPDTAEYVAYVAKDPVNQRACHILECPEGLAQDVISTIGQAFELRFKQYLRNPPKL
            270       280       290       300       310       320  

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pF1KE3 TSCESEEVHIDSHA--EERE---DHEYYNEIPGKQPPVGGVSDMRIKVQATEQMAYCPIQ
       .. ... . .:. :  ::.:   ::.:::..:::.::.::: :::..  :.   :  :  
XP_005 VTPHDRMAGFDGSAWDEEEEEPPDHQYYNDFPGKEPPLGGVVDMRLREGAAPGAAR-PTA
            330       340       350       360       370        380 

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pF1KE3 CEKLCYLPGNSKCSSVYENCLEQSRAIGNVHPRGVQSQRDTSLLKHTCR-VDLFDDPCYI
              : :..  :     :  .. .:.  :. :..:         :   .::::: :.
XP_005 -------P-NAQTPSHLGATLPVGQPVGG-DPE-VRKQMPPP---PPCPGRELFDDPSYV
                     390       400         410          420        

        470       480       490       500            510       520 
pF1KE3 NTQALQSTPGSAGNQRSAQPLGSPWHCGKAPETV---QP--GATAQPASSHSLPHIKQQL
       :.: :...  ..:.   : :  .:   :.::. .   .:   :   :   .:.  . .::
XP_005 NVQNLDKARQAVGG---AGP-PNPAINGSAPRDLFDMKPFEDALRVPPPPQSVS-MAEQL
      430       440           450       460       470        480   

             530       540       550       560       570       580 
pF1KE3 WSEECYHGKLSRKAAESLLVKDGDFLVRESATSPGQYVLSGLQGGQAKHLLLVDPEGKVR
        .:  .::::::. ::.::  .::::::::.:.::::::.:::.:: :::::::::: : 
XP_005 RGEPWFHGKLSRREAEALLQLNGDFLVRESTTTPGQYVLTGLQSGQPKHLLLVDPEGVVS
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pF1KE3 TKDHVFDNVGHLIRYHMDNSLPIISSGSEVSLKQPVRKDNNPALLHSNK      
                                                              
XP_005 VAEVWVRGGKKEGTVPYSVSLFLPSLLCRHSRWAAVYGPLLLFKVSGIFLQRLIP
           550       560       570       580       590        

>>XP_005245508 (OMIM: 600560) PREDICTED: SHC-transformin  (488 aa)
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Smith-Waterman score: 1280; 54.4% identity (73.5% similar) in 412 aa overlap (180-580:40-432)

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                                     :  ....: :..: ::::::::::::::.:
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pF1KE3 DFGMRTQVTREAISRLCEAVPGANGAIKKRKPPVKFLSTVLGKSNLQFSGMNIKLTISTC
       ::. :::::::::: .:::::::.:: ..:::  . ::..::.:::.:.:: : ::.:: 
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       ::.::  : .:::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::: .:.:::
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       :::::::::::::::::.::   .. ... . .:. :  ::.:   ::.:::..:::.::
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       .::: :::..  :.   :  :         : :..  :     :  .. .:.  :. :..
XP_005 LGGVVDMRLREGAAPGAAR-PTA-------P-NAQTPSHLGATLPVGQPVGG-DPE-VRK
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       :         :   .::::: :.:.: :...  ..:   .: :  .:   :.::. .   
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       .:   :   :   .:.  . .:: .:  .::::::. ::.::  .::::::::.:.::::
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       ::.:::.:: :::::::::: :                                      
XP_005 VLTGLQSGQPKHLLLVDPEGVVSVAEVWVRGGKKEGTVPYSVSLFLPSLLCRHSRWAAVY
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>>XP_011508200 (OMIM: 600560) PREDICTED: SHC-transformin  (432 aa)
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XP_011                               MGCVEVLQSMRALDFNTRTQVTREAISLVC
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       ::::::.:: ..:::  . ::..::.:::.:.:: : ::.:: ::.::  : .:::::::
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       ::::::::::::::..:::::::::::::::::::: .:.::::::::::::::::::::
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       :  :         : :..  :     :  .. .:.  :. :..:         :   .::
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       ::: :                                                       
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630 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sun Nov  6 07:07:56 2016 done: Sun Nov  6 07:07:57 2016
 Total Scan time: 11.180 Total Display time:  0.110

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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