FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9512, 532 aa 1>>>pF1KE9512 532 - 532 aa - 532 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5183+/-0.000455; mu= 13.4675+/- 0.028 mean_var=175.0341+/-40.782, 0's: 0 Z-trim(113.7): 510 B-trim: 1292 in 1/52 Lambda= 0.096942 statistics sampled from 22419 (23120) to 22419 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.63), E-opt: 0.2 (0.271), width: 16 Scan time: 9.480 The best scores are: opt bits E(85289) NP_036257 (OMIM: 118496) muscarinic acetylcholine ( 532) 3565 511.8 2e-144 NP_001307846 (OMIM: 118496) muscarinic acetylcholi ( 532) 3565 511.8 2e-144 XP_016855651 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45 XP_016855649 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45 XP_016855648 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45 XP_016855647 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45 XP_016855646 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45 XP_016855645 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45 NP_000731 (OMIM: 100100,118494) muscarinic acetylc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45 XP_016855650 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45 XP_011542347 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45 XP_011542346 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45 XP_011542345 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45 XP_016855643 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45 XP_005273089 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45 XP_011542348 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45 XP_016855642 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45 XP_016855641 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45 XP_016855652 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45 XP_011542349 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45 XP_016855644 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45 XP_011542343 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 1203 181.5 6.1e-45 XP_011543044 (OMIM: 118510) PREDICTED: muscarinic ( 460) 1093 166.0 2.2e-40 NP_000729 (OMIM: 118510) muscarinic acetylcholine ( 460) 1093 166.0 2.2e-40 NP_000732 (OMIM: 118495) muscarinic acetylcholine ( 479) 961 147.6 8.2e-35 NP_001006629 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 897 138.6 4e-32 NP_001006633 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 897 138.6 4e-32 NP_001006631 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 897 138.6 4e-32 XP_011514071 (OMIM: 118493) PREDICTED: muscarinic ( 466) 897 138.6 4e-32 NP_001006630 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 897 138.6 4e-32 NP_001006628 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 897 138.6 4e-32 NP_000730 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholine ( 466) 897 138.6 4e-32 NP_001006627 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 897 138.6 4e-32 NP_001006632 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 897 138.6 4e-32 NP_009163 (OMIM: 604525) histamine H3 receptor [Ho ( 445) 522 86.1 2.4e-16 XP_005260323 (OMIM: 604525) PREDICTED: histamine H ( 453) 522 86.1 2.4e-16 NP_001091683 (OMIM: 600167) histamine H1 receptor ( 487) 464 78.1 7e-14 NP_000852 (OMIM: 600167) histamine H1 receptor [Ho ( 487) 464 78.1 7e-14 XP_016861772 (OMIM: 600167) PREDICTED: histamine H ( 487) 464 78.1 7e-14 XP_011531954 (OMIM: 600167) PREDICTED: histamine H ( 487) 464 78.1 7e-14 NP_001091681 (OMIM: 600167) histamine H1 receptor ( 487) 464 78.1 7e-14 XP_011531955 (OMIM: 600167) PREDICTED: histamine H ( 487) 464 78.1 7e-14 NP_001091682 (OMIM: 600167) histamine H1 receptor ( 487) 464 78.1 7e-14 XP_016861773 (OMIM: 600167) PREDICTED: histamine H ( 487) 464 78.1 7e-14 NP_000015 (OMIM: 109690,600807,601665) beta-2 adre ( 413) 452 76.3 2e-13 NP_000854 (OMIM: 182131) 5-hydroxytryptamine recep ( 390) 444 75.2 4.2e-13 NP_000515 (OMIM: 109760,614674) 5-hydroxytryptamin ( 422) 436 74.1 9.6e-13 NP_000675 (OMIM: 109630,607276) beta-1 adrenergic ( 477) 430 73.3 1.9e-12 XP_011542714 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 308) 420 71.7 3.7e-12 XP_016868585 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 317) 420 71.7 3.8e-12 >>NP_036257 (OMIM: 118496) muscarinic acetylcholine rece (532 aa) initn: 3565 init1: 3565 opt: 3565 Z-score: 2713.7 bits: 511.8 E(85289): 2e-144 Smith-Waterman score: 3565; 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100.0% identity (100.0% similar) in 532 aa overlap (1-532:1-532) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MEGDSYHNATTVNGTPVNHQPLERHRLWEVITIAAVTAVVSLITIVGNVLVMISFKVNSQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 MEGDSYHNATTVNGTPVNHQPLERHRLWEVITIAAVTAVVSLITIVGNVLVMISFKVNSQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 LKTVNNYYLLSLACADLIIGIFSMNLYTTYILMGRWALGSLACDLWLALDYVASNASVMN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 LKTVNNYYLLSLACADLIIGIFSMNLYTTYILMGRWALGSLACDLWLALDYVASNASVMN 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 LLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTPKRAGIMIGLAWLISFILWAPAILCWQYLVGKRTVPL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 LLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTPKRAGIMIGLAWLISFILWAPAILCWQYLVGKRTVPL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE9 DECQIQFLSEPTITFGTAIAAFYIPVSVMTILYCRIYRETEKRTKDLADLQGSDSVTKAE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 DECQIQFLSEPTITFGTAIAAFYIPVSVMTILYCRIYRETEKRTKDLADLQGSDSVTKAE 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE9 KRKPAHRALFRSCLRCPRPTLAQRERNQASWSSSRRSTSTTGKPSQATGPSANWAKAEQL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 KRKPAHRALFRSCLRCPRPTLAQRERNQASWSSSRRSTSTTGKPSQATGPSANWAKAEQL 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE9 TTCSSYPSSEDEDKPATDPVLQVVYKSQGKESPGEEFSAEETEETFVKAETEKSDYDTPN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 TTCSSYPSSEDEDKPATDPVLQVVYKSQGKESPGEEFSAEETEETFVKAETEKSDYDTPN 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE9 YLLSPAAAHRPKSQKCVAYKFRLVVKADGNQETNNGCHKVKIMPCPFPVAKEPSTKGLNP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 YLLSPAAAHRPKSQKCVAYKFRLVVKADGNQETNNGCHKVKIMPCPFPVAKEPSTKGLNP 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE9 NPSHQMTKRKRVVLVKERKAAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVLVSTFCDKCVPVTLWHLG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 NPSHQMTKRKRVVLVKERKAAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVLVSTFCDKCVPVTLWHLG 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE9 YWLCYVNSTVNPICYALCNRTFRKTFKMLLLCRWKKKKVEEKLYWQGNSKLP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 YWLCYVNSTVNPICYALCNRTFRKTFKMLLLCRWKKKKVEEKLYWQGNSKLP 490 500 510 520 530 >>XP_016855651 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: muscarin (590 aa) initn: 1722 init1: 1153 opt: 1203 Z-score: 927.9 bits: 181.5 E(85289): 6.1e-45 Smith-Waterman score: 1748; 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XP_016 KETEKRTKELAGLQASG--TEAETENFVHPTGSSRSCSSYELQQQSMKRSNRRKYGRCHF 260 270 280 290 300 310 280 290 300 310 320 pF1KE9 WSSSRRSTSTTGKPSQATGPSANWAKAEQLTTCSSYPSSEDEDKPA-TDPVLQVVYKSQG : ... .. . .: . : .: . . .. . ::..:: . : . ..: : : XP_016 WFTTKSWKPSSEQMDQDHSSSDSWNNNDAAASLENSASSDEEDIGSETRAIYSIVLKLPG 320 330 340 350 360 370 330 340 350 360 370 380 pF1KE9 KES-------PG-EEFSAEETEETFVKAETEKSDYDTPNYLLSPAAAHRPKSQKCVAYKF . . :. ..... : : .: : .:.: . .. ... ::: . . .. 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NP_000 HSTILNSTKLPSSDNLQVPEEELGMVDLE-RKADKLQAQKSVDDGGSF-PKSFSKLPIQL 380 390 400 410 420 430 390 400 410 420 430 pF1KE9 RLVVKADGNQETNNGCHK-VKIMPCPFPVAKEPS-TKGLNPNPSHQMTKRKRVVLVKERK . .: . ....:.. : . .: : :: . .: . . :.:::::. ::::.: NP_000 ESAVDTAKTSDVNSSVGKSTATLPLSF---KEATLAKRFALKTRSQITKRKRMSLVKEKK 440 450 460 470 480 440 450 460 470 480 490 pF1KE9 AAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVLVSTFCDKCVPVTLWHLGYWLCYVNSTVNPICYALCN :::::::::::::::::::::::::.::::.:.: :.:.:::::::.::::::.:::::: NP_000 AAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVLVNTFCDSCIPKTFWNLGYWLCYINSTVNPVCYALCN 490 500 510 520 530 540 500 510 520 530 pF1KE9 RTFRKTFKMLLLCRWKKKKVEEKLYWQGNSKLP .::: ::::::::. ::: ... : : .: NP_000 KTFRTTFKMLLLCQCDKKKRRKQQYQQRQSVIFHKRAPEQAL 550 560 570 580 590 >>XP_016855650 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: muscarin (590 aa) initn: 1722 init1: 1153 opt: 1203 Z-score: 927.9 bits: 181.5 E(85289): 6.1e-45 Smith-Waterman score: 1748; 53.7% identity (76.3% similar) in 540 aa overlap (8-529:48-578) 10 20 30 pF1KE9 MEGDSYHNATTVNGTPVNHQPLERHRLWEVITIAAVT : .. .:: . .:: : .:.:. :: .: XP_016 SSWIHSPSDAGLPPGTVTHFGSYNVSRAAGNFSSPDGT--TDDPLGGHTVWQVVFIAFLT 20 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 90 pF1KE9 AVVSLITIVGNVLVMISFKVNSQLKTVNNYYLLSLACADLIIGIFSMNLYTTYILMGRWA ....:.::.::.::..:::::.::::::::.::::::::::::..::::.::::.:.::: XP_016 GILALVTIIGNILVIVSFKVNKQLKTVNNYFLLSLACADLIIGVISMNLFTTYIIMNRWA 80 90 100 110 120 130 100 110 120 130 140 150 pF1KE9 LGSLACDLWLALDYVASNASVMNLLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTPKRAGIMIGLAWLI ::.::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::.::::::.: XP_016 LGNLACDLWLAIDYVASNASVMNLLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTTKRAGVMIGLAWVI 140 150 160 170 180 190 160 170 180 190 200 210 pF1KE9 SFILWAPAILCWQYLVGKRTVPLDECQIQFLSEPTITFGTAIAAFYIPVSVMTILYCRIY ::.::::::: :::.::::::: :: :::::::::::::::::::.::..::::: ::: XP_016 SFVLWAPAILFWQYFVGKRTVPPGECFIQFLSEPTITFGTAIAAFYMPVTIMTILYWRIY 200 210 220 230 240 250 220 230 240 250 260 270 pF1KE9 RETEKRTKDLADLQGSDSVTKAEKRKPAH-RALFRSC--LRCPRPTLAQRERNQAS---- .:::::::.:: ::.: :.:: .. .: . ::: . . .. . .: . . 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