FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2308, 1338 aa 1>>>pF1KE2308 1338 - 1338 aa - 1338 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.7771+/-0.000453; mu= -19.5808+/- 0.028 mean_var=647.8269+/-135.545, 0's: 0 Z-trim(125.4): 101 B-trim: 1676 in 1/60 Lambda= 0.050390 statistics sampled from 49046 (49198) to 49046 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.807), E-opt: 0.2 (0.577), width: 16 Scan time: 20.470 The best scores are: opt bits E(85289) NP_003740 (OMIM: 125853,600797) insulin receptor s (1338) 9245 688.2 1.1e-196 NP_005535 (OMIM: 125853,147545) insulin receptor s (1242) 1545 128.4 3.2e-28 XP_006724776 (OMIM: 300904) PREDICTED: insulin rec (1256) 716 68.1 4.5e-10 XP_005262277 (OMIM: 300904) PREDICTED: insulin rec (1256) 716 68.1 4.5e-10 NP_003595 (OMIM: 300904) insulin receptor substrat (1257) 716 68.1 4.5e-10 XP_011529363 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_003 PTSPRQLQPAPPLAPQGRPWTPGQPGGLVGCPGSGGSPMRRETSAGFQNGLNYIAIDVRE 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KE2 EPGLPPQPQPPPPPLPQPGDKSSWGRTRSLGGLISAVGVGSTGGGCGGPGPGALPPANTY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_003 EPGLPPQPQPPPPPLPQPGDKSSWGRTRSLGGLISAVGVGSTGGGCGGPGPGALPPANTY 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 pF1KE2 ASIDFLSHHLKEATIVKE :::::::::::::::::: NP_003 ASIDFLSHHLKEATIVKE 1330 >>NP_005535 (OMIM: 125853,147545) insulin receptor subst (1242 aa) initn: 1792 init1: 604 opt: 1545 Z-score: 627.6 bits: 128.4 E(85289): 3.2e-28 Smith-Waterman score: 2446; 41.0% identity (59.2% similar) in 1361 aa overlap (31-1287:13-1222) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MASPPRHGPPGPASGDGPNLNNNNNNNNHSVRKCGYLRKQKHGHKRFFVLRGPGAGGDEA ::: ::::: : ::::::::. : NP_005 MASPPESDGFSDVRKVGYLRKPKSMHKRFFVLRA-------A 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 TAGGGSAPQPPRLEYYESEKKWRSKAGAPKRVIALDCCLNINKRADAKHKYLIALYTKDE . .:: : ::::::.::::: :..:::: : :. :.:::::::.:.:.:.::::.:: NP_005 SEAGG----PARLEYYENEKKWRHKSSAPKRSIPLESCFNINKRADSKNKHLVALYTRDE 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 YFAVAAENEQEQEGWYRALTDLVSEGRAAAGDAPPAAAPAASCSASLPGALGGSAGAAGA .::.::..: ::..::.:: .: ..:: . :: :.. ..: :. : : :: NP_005 HFAIAADSEAEQDSWYQALLQL--HNRAKGHHDGAAALGAGGGGGSCSGSSG--LGEAGE 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 EDSYGLVAPATAAYREVWQVNLKPKGLGQSKNLTGVYRLCLSARTIGFVKLNCEQPSVTL . ::: : :. : ..::::: ::::::::.::: :.:::::...::.::::: : .:.: NP_005 DLSYGDVPPGPA-FKEVWQVILKPKGLGQTKNLIGIYRLCLTSKTISFVKLNSEAAAVVL 150 160 170 180 190 200 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 QLMNIRRCGHSDSFFFIEVGRSAVTGPGELWMQADDSVVAQNIHETILEAMKALKELFEF :::::::::::..::::::::::::::::.:::.::::::::.::::::::.:... :: NP_005 QLMNIRRCGHSENFFFIEVGRSAVTGPGEFWMQVDDSVVAQNMHETILEAMRAMSD--EF 210 220 230 240 250 260 310 320 330 340 350 pF1KE2 RPRSKSQSSGSSATHPISVPGARRHHHLVNLPPSQTGLVRRSRTDSLAATPPAA----KC ::::::::: :. ..::::: :.::: : ::::.::.:::::.:..:: ::. : NP_005 RPRSKSQSS-SNCSNPISVP--LRRHHLNNPPPSQVGLTRRSRTESITATSPASMVGGKP 270 280 290 300 310 320 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 SSCRVRTASEGDGGAAAGAAAAGARPVSVAGSPLSPGPVRAPLSRSHTLSGGCGGRGSKV .: :::..:.:.: . ::.:: :::.::. :. : : ::: . 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NP_005 PMSPKSVSAPQQIINP-----IRRHPQRVDPNGYMMMSPSGGCSPDIGGGPSSSSSSSNA 640 650 660 670 680 740 750 760 770 780 pF1KE2 -PEDSGYMRMWCGS------------KLSMEHADGKLLP-NGDYLNVSPSDAVTTGTPPD : ..: ..: .. : .: . ::::: .:::.:.:: .:..: : NP_005 VPSGTSYGKLWTNGVGGHHSHVLPHPKPPVESSGGKLLPCTGDYMNMSPVGDSNTSSPSD 690 700 710 720 730 740 790 800 810 820 830 pF1KE2 FFSAALHPGGEPLRGVPGCCYSSLPRSYKAPYTCG----GDSDQYVLMSSPVGRILEEER . . : .:. : :::::.: : : :.. .:. ::.: NP_005 CYYGPEDPQHKPV-----LSYYSLPRSFKHTQRPGEPEEGARHQHLRLSTSSGRLLYAAT 750 760 770 780 790 800 840 850 860 870 880 890 pF1KE2 LEPQATPGPSQAASAFGAG-------PTQP-PHPVVPSPVRPSGGRPEGFLGQRGRAVRP . ... : .....:.: :. : :: : .: : . . .: .:: NP_005 ADDSSS---STSSDSLGGGYCGARLEPSLPHPHHQVLQPHLPR--KVDTAAQTNSRLARP 810 820 830 840 850 900 910 920 930 pF1KE2 TRLSLEGLP---SLPSMHEY-----PL--PPEPKSPGEYINIDFG-EPGARLSPPAPPLL ::::: : : .:: .: :: ::::::::::.::.:: . .. :: :. 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