FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2308, 1338 aa 1>>>pF1KE2308 1338 - 1338 aa - 1338 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.6362+/-0.00114; mu= -18.7241+/- 0.068 mean_var=541.9972+/-113.496, 0's: 0 Z-trim(117.4): 57 B-trim: 489 in 1/54 Lambda= 0.055090 statistics sampled from 18082 (18135) to 18082 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.797), E-opt: 0.2 (0.557), width: 16 Scan time: 6.310 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS9510.1 IRS2 gene_id:8660|Hs108|chr13 (1338) 9245 750.3 7.8e-216 CCDS2463.1 IRS1 gene_id:3667|Hs108|chr2 (1242) 1545 138.3 1.2e-31 CCDS14544.1 IRS4 gene_id:8471|Hs108|chrX (1257) 716 72.5 8.5e-12 >>CCDS9510.1 IRS2 gene_id:8660|Hs108|chr13 (1338 aa) initn: 9245 init1: 9245 opt: 9245 Z-score: 3988.4 bits: 750.3 E(32554): 7.8e-216 Smith-Waterman score: 9245; 100.0% identity (100.0% similar) in 1338 aa overlap (1-1338:1-1338) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MASPPRHGPPGPASGDGPNLNNNNNNNNHSVRKCGYLRKQKHGHKRFFVLRGPGAGGDEA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS95 MASPPRHGPPGPASGDGPNLNNNNNNNNHSVRKCGYLRKQKHGHKRFFVLRGPGAGGDEA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 TAGGGSAPQPPRLEYYESEKKWRSKAGAPKRVIALDCCLNINKRADAKHKYLIALYTKDE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS95 TAGGGSAPQPPRLEYYESEKKWRSKAGAPKRVIALDCCLNINKRADAKHKYLIALYTKDE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 YFAVAAENEQEQEGWYRALTDLVSEGRAAAGDAPPAAAPAASCSASLPGALGGSAGAAGA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS95 YFAVAAENEQEQEGWYRALTDLVSEGRAAAGDAPPAAAPAASCSASLPGALGGSAGAAGA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 EDSYGLVAPATAAYREVWQVNLKPKGLGQSKNLTGVYRLCLSARTIGFVKLNCEQPSVTL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS95 EDSYGLVAPATAAYREVWQVNLKPKGLGQSKNLTGVYRLCLSARTIGFVKLNCEQPSVTL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 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pF1KE2 TAGGGSAPQPPRLEYYESEKKWRSKAGAPKRVIALDCCLNINKRADAKHKYLIALYTKDE . .:: : ::::::.::::: :..:::: : :. :.:::::::.:.:.:.::::.:: CCDS24 SEAGG----PARLEYYENEKKWRHKSSAPKRSIPLESCFNINKRADSKNKHLVALYTRDE 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 YFAVAAENEQEQEGWYRALTDLVSEGRAAAGDAPPAAAPAASCSASLPGALGGSAGAAGA .::.::..: ::..::.:: .: ..:: . :: :.. ..: :. : : :: CCDS24 HFAIAADSEAEQDSWYQALLQL--HNRAKGHHDGAAALGAGGGGGSCSGSSG--LGEAGE 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 EDSYGLVAPATAAYREVWQVNLKPKGLGQSKNLTGVYRLCLSARTIGFVKLNCEQPSVTL . ::: : :. : ..::::: ::::::::.::: :.:::::...::.::::: : .:.: CCDS24 DLSYGDVPPGPA-FKEVWQVILKPKGLGQTKNLIGIYRLCLTSKTISFVKLNSEAAAVVL 150 160 170 180 190 200 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 QLMNIRRCGHSDSFFFIEVGRSAVTGPGELWMQADDSVVAQNIHETILEAMKALKELFEF :::::::::::..::::::::::::::::.:::.::::::::.::::::::.:... :: CCDS24 QLMNIRRCGHSENFFFIEVGRSAVTGPGEFWMQVDDSVVAQNMHETILEAMRAMSD--EF 210 220 230 240 250 260 310 320 330 340 350 pF1KE2 RPRSKSQSSGSSATHPISVPGARRHHHLVNLPPSQTGLVRRSRTDSLAATPPAA----KC ::::::::: :. ..::::: :.::: : ::::.::.:::::.:..:: ::. : CCDS24 RPRSKSQSS-SNCSNPISVP--LRRHHLNNPPPSQVGLTRRSRTESITATSPASMVGGKP 270 280 290 300 310 320 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 SSCRVRTASEGDGGAAAGAAAAGARPVSVAGSPLSPGPVRAPLSRSHTLSGGCGGRGSKV .: :::..:.:.: . ::.:: :::.::. :. : : ::: . CCDS24 GSFRVRASSDGEGTMS--------RPASVDGSPVSPSTNRTHAHR-H--------RGS-A 330 340 350 360 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 ALLPAGGALQHSRSMSMPVAHSPPAATSPGSLSSSS--GHGSGSYPPPPGPHPPLPHPLH : : :.::::. ::... :.:::: :::::: :::: : CCDS24 RLHPP---LNHSRSIPMPASRCSPSATSPVSLSSSSTSGHGSTS---------------- 370 380 390 400 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 HGPGQRPSSGSASASGSPSDPGFMSLDEYGSSPGDLRAFCSHRSNTPESIAETPPARDGG : .:::.:::::: ::.: ::::::: :.:. : :: ::.:...::::: CCDS24 --DCLFPRRSSASVSGSPSDGGFISSDEYGSSPCDFRS--SFRSVTPDSLGHTPPAR--- 410 420 430 440 450 540 550 560 pF1KE2 GGGEFYGYM--------TMDRP-----LSHCGRSYR-----------RVSGD---AAQDL : :. .:. :. : ::. : ..: ..:: .: :: CCDS24 GEEELSNYICMGGKGPSTLTAPNGHYILSRGGNGHRCTPGTGLGTSPALAGDEAASAADL 460 470 480 490 500 510 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 DRGLRKRTYSL-TTPA--RQRPVPQPSSASLDEYTLMRATF---SGSAGRLCPSCPASSP : .::::.: :.:. .:. : : ::..::: : .. .::.::: :. : CCDS24 DNRFRKRTHSAGTSPTITHQKTPSQSSVASIEEYTEMMPAYPPGGGSGGRL-PG-HRHSA 520 530 540 550 560 570 630 640 650 660 670 pF1KE2 KVAYHPYPEDYGDIEI-----GSHRSSSSNLGADDGYMPMTPGAALAGSGSGSCRSDDYM : . :::. ... : :: .::.: .:::::::.::.: . :: . : ::: CCDS24 FVPTRSYPEEGLEMHPLERRGGHHRPDSSTLHTDDGYMPMSPGVAPVPSGRKG--SGDYM 580 590 600 610 620 630 680 690 700 710 720 730 pF1KE2 PMSPASVSAPKQILQPRAAAAAAAAVPSAGPAGPAPTSAAGRTFPASGGGYKASSPAESS :::: :::::.::..: . : : : .: : ::: ..:: . .. CCDS24 PMSPKSVSAPQQIINP-----IRRHPQRVDPNGYMMMSPSGGCSPDIGGGPSSSSSSSNA 640 650 660 670 680 740 750 760 770 780 pF1KE2 -PEDSGYMRMWCGS------------KLSMEHADGKLLP-NGDYLNVSPSDAVTTGTPPD : ..: ..: .. : .: . ::::: .:::.:.:: .:..: : CCDS24 VPSGTSYGKLWTNGVGGHHSHVLPHPKPPVESSGGKLLPCTGDYMNMSPVGDSNTSSPSD 690 700 710 720 730 740 790 800 810 820 830 pF1KE2 FFSAALHPGGEPLRGVPGCCYSSLPRSYKAPYTCG----GDSDQYVLMSSPVGRILEEER . . : .:. : :::::.: : : :.. .:. ::.: CCDS24 CYYGPEDPQHKPV-----LSYYSLPRSFKHTQRPGEPEEGARHQHLRLSTSSGRLLYAAT 750 760 770 780 790 800 840 850 860 870 880 890 pF1KE2 LEPQATPGPSQAASAFGAG-------PTQP-PHPVVPSPVRPSGGRPEGFLGQRGRAVRP . ... : .....:.: :. : :: : .: : . . .: .:: CCDS24 ADDSSS---STSSDSLGGGYCGARLEPSLPHPHHQVLQPHLPR--KVDTAAQTNSRLARP 810 820 830 840 850 900 910 920 930 pF1KE2 TRLSLEGLP---SLPSMHEY-----PL--PPEPKSPGEYINIDFG-EPGARLSPPAPPLL ::::: : : .:: .: :: ::::::::::.::.:: . .. :: :. CCDS24 TRLSL-GDPKASTLPRAREQQQQQQPLLHPPEPKSPGEYVNIEFGSDQSGYLSGPV---- 860 870 880 890 900 910 940 950 960 970 980 990 pF1KE2 ASAASSSSLLSASSPASSLGSGTPGTSSDSRQRSPLSDYMNLDFSSPKSPKPGAPSGHPV : :: :. : :.: : . .... .::..:.. . .: . CCDS24 --AFHSSP--SVRCP-SQL---QP---APREEETGTEEYMKMDLGPGRRAAWQESTGVEM 920 930 940 950 960 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KE2 GSLDGLLSPEASSPYPPLPPRPSASPSS-SLQPPPPPPAPGELYRLPPASAVATAQGPGA : : : : :.: : ::. . ..: . : : : :. :.: CCDS24 GRL-GPAPPGAASICRPTRAVPSSRGDYMTMQ-----------MSCPRQSYVDTS--PAA 970 980 990 1000 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KE2 ASSLSSDTGDNGDYTEMAFGVAATP---PQPIAAPPKPEAARVASPTS--GVKRL----S : :..: :.:: :. : . .: ::::. :. .: : CCDS24 PVS----------YADMRTGIAAEEVSLPRATMAAASSSSAASASPTGPQGAAELAAHSS 1010 1020 1030 1040 1050 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KE2 LM---EQVSGVEAFLQASQPPDPHRGAKVIRADPQGGRRRHSSETFSSTTTVTPVSPSFA :. . .:. :: ... :. ...:::::::::: :::::::::::: ..: :. . CCDS24 LLGGPQGPGGMSAFTRVNLSPNRNQSAKVIRADPQGCRRRHSSETFSSTPSATRVGNTVP 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KE2 HNPKRHNSASVENVSLRKSSEGGVGVGPGGGDEPPTSPRQLQPAPPLAPQGRPWTPGQPG . .:..:: :::. . . . . . : .:: CCDS24 FG-------------------AGAAVGGGGGSSSSSEDVKRHSSASFE---NVWL--RPG 1120 1130 1140 1150 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KE2 GLVGCPGSGGSPMRRETSAG-FQNGLNYIAID-VREEPGLP----PQPQPPPPPLP-QP- : : : : . .:: ..:::::: .: :.. : :.::::::: : :: CCDS24 ELGGAPKE---PAKLCGAAGGLENGLNYIDLDLVKDFKQCPQECTPEPQPPPPPPPHQPL 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1280 1290 1300 1310 1320 1330 pF1KE2 --GDKSSWGRTRSLGGLISAVGVGSTGGGCGGPGPGALPPANTYASIDFLSHHLKEATIV :..:: :. CCDS24 GSGESSSTRRSSEDLSAYASISFQKQPEDRQ 1220 1230 1240 >>CCDS14544.1 IRS4 gene_id:8471|Hs108|chrX (1257 aa) initn: 1075 init1: 469 opt: 716 Z-score: 325.3 bits: 72.5 E(32554): 8.5e-12 Smith-Waterman score: 1150; 29.2% identity (52.4% similar) in 1337 aa overlap (31-1280:79-1232) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MASPPRHGPPGPASGDGPNLNNNNNNNNHSVRKCGYLRKQKHGHKRFFVLRGPGAGGDEA : : ::::::::::.:.:::. CCDS14 SCPGAMWLSTATGSRSDSESEEEDLPVGEEVCKRGYLRKQKHGHRRYFVLKLE------- 50 60 70 80 90 100 70 80 90 100 pF1KE2 TAGGGSAPQPPRLEYYESEKKWR------------SKAGA-------PKRVIALDCCLNI .: : ::::::. .:.: . .:: :.:::.: :... CCDS14 -----TADAPARLEYYENARKFRHSVRAAAAAAAAAASGAAIPPLIPPRRVITLYQCFSV 110 120 130 140 150 110 120 130 140 150 pF1KE2 NKRADAKHKYLIALYTKDEYFAVAAENEQEQEGWYRALTDLVSEG---RAAAGDAPPAAA ..::::....::::.:.:::::..::::.:::.:: :. :. :. : .. : : . CCDS14 SQRADARYRHLIALFTQDEYFAMVAENESEQESWYLLLSRLILESKRRRCGTLGAQPDGE 160 170 180 190 200 210 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 PAASCSASLPGALGGSAGAAGAEDSYGLVAPATAAYREVWQVNLKPKGLGQSKNLTGVYR ::: :.::.:: . :..:::: .::.:::. :.:.::.: CCDS14 PAAL------------AAAAAAEPPF---------YKDVWQVIVKPRGLGHRKELSGVFR 220 230 240 250 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 LCLSARTIGFVKLNCEQPSVTLQLMNIRRCGHSDSFFFIEVGRSAVTGPGELWMQADDSV :::. . . ::.:: : ::..::..:::::::...::.:::::.: ::::::::.:: : CCDS14 LCLTDEEVVFVRLNTEVASVVVQLLSIRRCGHSEQYFFLEVGRSTVIGPGELWMQVDDCV 260 270 280 290 300 310 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 VAQNIHETILEAMKALKELFEFRPRSKSQSSGSSATHPISVPGARRHHHLVNLPPSQTGL ::::.:: .:: :.:: :.: : .: : : ..: ... .:::: :: : :. : CCDS14 VAQNMHELFLEKMRALCAD-EYRARCRSYSI-SIGAHLLTLLSARRHLGLVPLEPG--GW 320 330 340 350 360 370 340 350 360 370 pF1KE2 VRRSRTDSLA------------------ATP--PAAKCSSCRVRTASEGDGGAAAGAAAA .:::: ... .:: :.:. :.. . :... :. CCDS14 LRRSRFEQFCHLRAIGDGEDEMLFTRRFVTPSEPVAHSRRGRLHLPRGRRSRRAVSVPAS 380 390 400 410 420 430 380 390 400 410 420 430 pF1KE2 GARPVSVAGSPLSP-GPVRAPLSR---SHTLSG-GCGGRGSKVALLPAGGALQHSRSMS- : .: :: : :..:: . : .:: : :. : . : : :.. . . CCDS14 FFR--RLAPSPARPRHPAEAPNNGARLSSEVSGSGSGNFGEEGN--PQGKEDQEGSGGDY 440 450 460 470 480 440 450 460 470 480 490 pF1KE2 MPVAHSPPAATSPGSLSSSSGHGSGSYPPPPGPHPPLPHPLHHGPGQRPSSGSASASGSP ::. .. .... :: ......:.:: : . : :: : :. ...:. CCDS14 MPM-NNWGSGNGRGSGGGQGSNGQGSSSHSSGGNQ------CSGEGQ-GSRGGQGSNGQG 490 500 510 520 530 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 SDPGFMSLDEYGSSPGDLRAFCSHRSNTPESIAETPPARDGGGGGEFYGYMTMDRPLSHC : . : : :.. : : :. .. : . :.:::. : . .. 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