FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB8524, 837 aa 1>>>pF1KB8524 837 - 837 aa - 837 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4800+/-0.000426; mu= 14.7334+/- 0.026 mean_var=88.1658+/-18.420, 0's: 0 Z-trim(111.3): 128 B-trim: 181 in 1/56 Lambda= 0.136592 statistics sampled from 19702 (19830) to 19702 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.584), E-opt: 0.2 (0.233), width: 16 Scan time: 12.820 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001005242 (OMIM: 602861,609040) plakophilin-2 i ( 837) 5440 1082.9 0 NP_004563 (OMIM: 602861,609040) plakophilin-2 isof ( 881) 2983 598.7 3.7e-170 NP_001005337 (OMIM: 601975,604536) plakophilin-1 i ( 726) 1219 251.1 1.4e-65 NP_001289958 (OMIM: 605561) plakophilin-3 isoform ( 812) 974 202.8 5.2e-51 NP_009114 (OMIM: 605561) plakophilin-3 isoform PKP ( 797) 971 202.2 7.7e-51 NP_001078938 (OMIM: 601045) catenin delta-1 isofor ( 832) 915 191.2 1.7e-47 NP_001193819 (OMIM: 601045) catenin delta-1 isofor ( 832) 915 191.2 1.7e-47 NP_001078937 (OMIM: 601045) catenin delta-1 isofor ( 832) 915 191.2 1.7e-47 NP_001078936 (OMIM: 601045) catenin delta-1 isofor ( 832) 915 191.2 1.7e-47 NP_001078934 (OMIM: 601045) catenin delta-1 isofor ( 840) 915 191.2 1.7e-47 NP_001078933 (OMIM: 601045) catenin delta-1 isofor ( 861) 915 191.2 1.7e-47 NP_001193817 (OMIM: 601045) catenin delta-1 isofor ( 879) 915 191.2 1.8e-47 NP_001193818 (OMIM: 601045) catenin delta-1 isofor ( 879) 915 191.2 1.8e-47 NP_001193820 (OMIM: 601045) catenin delta-1 isofor ( 879) 915 191.2 1.8e-47 NP_001193816 (OMIM: 601045) catenin delta-1 isofor ( 887) 915 191.2 1.8e-47 NP_001193815 (OMIM: 601045) catenin delta-1 isofor ( 908) 915 191.2 1.8e-47 NP_001078929 (OMIM: 601045) catenin delta-1 isofor ( 933) 915 191.2 1.9e-47 NP_001078931 (OMIM: 601045) catenin delta-1 isofor ( 933) 915 191.2 1.9e-47 NP_001078930 (OMIM: 601045) catenin delta-1 isofor ( 933) 915 191.2 1.9e-47 NP_001322 (OMIM: 601045) catenin delta-1 isoform 1 ( 941) 915 191.2 1.9e-47 NP_001078928 (OMIM: 601045) catenin delta-1 isofor ( 962) 915 191.2 1.9e-47 NP_001275644 (OMIM: 604275) catenin delta-2 isofor (1134) 889 186.1 7.7e-46 NP_001323 (OMIM: 604275) catenin delta-2 isoform 1 (1225) 889 186.1 8.3e-46 NP_001275646 (OMIM: 604275) catenin delta-2 isofor ( 792) 873 182.9 5e-45 NP_001275645 (OMIM: 604275) catenin delta-2 isofor ( 888) 873 182.9 5.5e-45 XP_016864563 (OMIM: 604275) PREDICTED: catenin del ( 979) 873 182.9 6e-45 XP_011528481 (OMIM: 602269) PREDICTED: armadillo r ( 993) 857 179.8 5.4e-44 XP_005248310 (OMIM: 604275) PREDICTED: catenin del (1159) 821 172.7 8.5e-42 XP_011512269 (OMIM: 604275) PREDICTED: catenin del (1159) 821 172.7 8.5e-42 XP_005248309 (OMIM: 604275) PREDICTED: catenin del (1236) 821 172.7 9e-42 XP_005248308 (OMIM: 604275) PREDICTED: catenin del (1250) 821 172.7 9.1e-42 XP_016864564 (OMIM: 604275) PREDICTED: catenin del ( 913) 805 169.5 6.1e-41 XP_016864565 (OMIM: 604275) PREDICTED: catenin del ( 913) 805 169.5 6.1e-41 XP_016864562 (OMIM: 604275) PREDICTED: catenin del ( 990) 805 169.5 6.6e-41 XP_016864561 (OMIM: 604275) PREDICTED: catenin del (1004) 805 169.5 6.7e-41 XP_011510324 (OMIM: 604276) PREDICTED: plakophilin (1044) 803 169.1 9.1e-41 XP_016860618 (OMIM: 604276) PREDICTED: plakophilin (1044) 803 169.1 9.1e-41 XP_011510323 (OMIM: 604276) PREDICTED: plakophilin (1048) 803 169.1 9.1e-41 XP_016860616 (OMIM: 604276) PREDICTED: plakophilin (1048) 803 169.1 9.1e-41 XP_011510322 (OMIM: 604276) PREDICTED: plakophilin (1133) 803 169.1 9.8e-41 XP_016860615 (OMIM: 604276) PREDICTED: plakophilin (1147) 803 169.2 9.9e-41 NP_001005476 (OMIM: 604276) plakophilin-4 isoform (1149) 803 169.2 9.9e-41 XP_011510319 (OMIM: 604276) PREDICTED: plakophilin (1190) 803 169.2 1e-40 XP_011510320 (OMIM: 604276) PREDICTED: plakophilin (1190) 803 169.2 1e-40 XP_011510318 (OMIM: 604276) PREDICTED: plakophilin (1192) 803 169.2 1e-40 NP_003619 (OMIM: 604276) plakophilin-4 isoform a [ (1192) 803 169.2 1e-40 XP_016860621 (OMIM: 604276) PREDICTED: plakophilin ( 791) 799 168.3 1.2e-40 XP_011510327 (OMIM: 604276) PREDICTED: plakophilin ( 850) 799 168.3 1.3e-40 XP_016860619 (OMIM: 604276) PREDICTED: plakophilin (1043) 796 167.8 2.4e-40 XP_016860617 (OMIM: 604276) PREDICTED: plakophilin (1047) 796 167.8 2.4e-40 >>NP_001005242 (OMIM: 602861,609040) plakophilin-2 isofo (837 aa) initn: 5440 init1: 5440 opt: 5440 Z-score: 5792.8 bits: 1082.9 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 5440; 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