FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5325, 303 aa 1>>>pF1KE5325 303 - 303 aa - 303 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2845+/-0.000657; mu= 15.8457+/- 0.040 mean_var=73.6083+/-15.825, 0's: 0 Z-trim(105.0): 65 B-trim: 291 in 1/48 Lambda= 0.149490 statistics sampled from 13165 (13218) to 13165 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.467), E-opt: 0.2 (0.155), width: 16 Scan time: 4.550 The best scores are: opt bits E(85289) NP_076409 (OMIM: 604792) taste receptor type 2 mem ( 303) 1956 431.9 7.4e-121 NP_076411 (OMIM: 604790) taste receptor type 2 mem ( 317) 901 204.4 2.4e-52 NP_795370 (OMIM: 613962) taste receptor type 2 mem ( 309) 882 200.3 4e-51 NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 mem ( 309) 867 197.1 3.8e-50 NP_795369 (OMIM: 613961) taste receptor type 2 mem ( 299) 858 195.1 1.4e-49 NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2 ( 319) 850 193.4 4.9e-49 XP_003961040 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 839 191.0 2.4e-48 XP_006726600 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 839 191.0 2.4e-48 NP_795367 (OMIM: 613967) taste receptor type 2 mem ( 299) 839 191.0 2.4e-48 NP_795365 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 mem ( 309) 835 190.2 4.5e-48 NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 mem ( 299) 816 186.1 7.6e-47 NP_795366 (OMIM: 612669) taste receptor type 2 mem ( 309) 808 184.3 2.6e-46 NP_076408 (OMIM: 604793) taste receptor type 2 mem ( 318) 761 174.2 3e-43 NP_076406 (OMIM: 604795) taste receptor type 2 mem ( 312) 712 163.6 4.4e-40 NP_076407 (OMIM: 604794) taste receptor type 2 mem ( 309) 631 146.2 7.9e-35 NP_076410 (OMIM: 604791) taste receptor type 2 mem ( 307) 629 145.7 1.1e-34 NP_852094 (OMIM: 613966) taste receptor type 2 mem ( 314) 593 138.0 2.4e-32 NP_058639 (OMIM: 604868) taste receptor type 2 mem ( 316) 592 137.8 2.8e-32 NP_062545 (OMIM: 604796) taste receptor type 2 mem ( 299) 477 112.9 7.7e-25 NP_061853 (OMIM: 605062) taste receptor type 2 mem ( 299) 469 111.2 2.5e-24 NP_795364 (OMIM: 613965) taste receptor type 2 mem ( 307) 463 109.9 6.4e-24 NP_789787 (OMIM: 171200,607751) taste receptor typ ( 333) 437 104.4 3.3e-22 NP_795363 (OMIM: 613964) taste receptor type 2 mem ( 323) 417 100.0 6.4e-21 NP_803186 (OMIM: 613968) taste receptor type 2 mem ( 318) 400 96.4 8.1e-20 NP_058640 (OMIM: 604869) taste receptor type 2 mem ( 299) 368 89.4 9.2e-18 NP_058641 (OMIM: 103780,604867) taste receptor typ ( 291) 364 88.6 1.6e-17 >>NP_076409 (OMIM: 604792) taste receptor type 2 member (303 aa) initn: 1956 init1: 1956 opt: 1956 Z-score: 2290.7 bits: 431.9 E(85289): 7.4e-121 Smith-Waterman score: 1956; 100.0% identity (100.0% similar) in 303 aa overlap (1-303:1-303) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_076 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFSWIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAFL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_076 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFSWIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAFL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 YLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDWLDRYERNTTWNFSMSDFETFSVSVK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_076 YLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDWLDRYERNTTWNFSMSDFETFSVSVK 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 FTMTMFSLTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIVISFLLF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_076 FTMTMFSLTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIVISFLLF 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 YASFFLCVLISWISELYQNTVIYMLCETIGVFSPSSHSFLLILGNAKLRQAFLLVAAKVW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_076 YASFFLCVLISWISELYQNTVIYMLCETIGVFSPSSHSFLLILGNAKLRQAFLLVAAKVW 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 AKR ::: NP_076 AKR >>NP_076411 (OMIM: 604790) taste receptor type 2 member (317 aa) initn: 933 init1: 774 opt: 901 Z-score: 1060.8 bits: 204.4 E(85289): 2.4e-52 Smith-Waterman score: 901; 49.5% identity (74.9% similar) in 303 aa overlap (1-302:1-299) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW : ... ::::.:.:.:::::::.:.::.:.::::::. :..::::..: ::::::.:.: NP_076 MGGVIKSIFTFVLIVEFIIGNLGNSFIALVNCIDWVKGRKISSVDRILTALAISRISLVW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFSWIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAFL :. :: ... . :.:.. .:.. : : :::..:::: .. ::.::::.::. :: NP_076 LIFGSWCVSVFFPALFATEKMFRMLTNIWTVINHFSVWLATGLGTFYFLKIANFSNSIFL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 YLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDWLDRYERNTTWNFSMSDFETFSVSVK ::::::.::.:..:: : ::::::. ::.::. .. :.:: : . . :.: :: . 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NP_795 LHLKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNT- 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 KFTMTMFS-LTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIVISFL :.:... :.:::...::::::: :: :::.::::. :: .:: ::: .::. : ::: NP_795 --TVTILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LFYASFFLCVLIS-WISELYQNTVIYMLCETIGVFSPSSHSFLLILGNAKLRQAFLLVAA :. : .:: ...: : : .: ..:.::.:. ::.: :.:: :: ::.:.:: : NP_795 LLCAIYFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLW 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 KV--WAKR .: :.: NP_795 HVRYWVKGEKPSSS 300 >>NP_795369 (OMIM: 613961) taste receptor type 2 member (299 aa) initn: 839 init1: 253 opt: 858 Z-score: 1011.0 bits: 195.1 E(85289): 1.4e-49 Smith-Waterman score: 858; 45.2% identity (75.9% similar) in 290 aa overlap (8-295:8-293) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW : ..... :..::..::::.:.: ::::. :..::....: :..:::::.: NP_795 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFS-WIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAF .: :. .. :.. : .::. . : :.:::..:::. .::: :::::.::. 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NP_795 LTVTTLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLM 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 FYASFFLCVLIS-WISELYQNTVIYMLCETIGVFSPSSHSFLLILGNAKLRQAFLLVAAK ..: .:::.. : : . :. .. .::.:.... :: :::.::.:. ::.:.:: : NP_795 LFAIYFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQ 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 VWAKR NP_795 MTR >>NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2 memb (319 aa) initn: 797 init1: 255 opt: 850 Z-score: 1001.3 bits: 193.4 E(85289): 4.9e-49 Smith-Waterman score: 850; 47.2% identity (75.4% similar) in 309 aa overlap (1-302:1-302) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW : . :: ::...:.. :.:::..::::.:.: :.::.....: ::..: ::.::.::.: NP_001 MITFLPIIFSILIVVIFVIGNFANGFIALVNSIEWVKRQKISFVDQILTALAVSRVGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFS-WIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAF .:. :. : . : : . .:: .. : :.:::. :::: .:.::::.::.::. : NP_001 VLLLHWY-ATQLNPAFYS-VEVRITAYNVWAVTNHFSSWLATSLSMFYLLRIANFSNLIF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 LYLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDWLDRYERNTTWNFSMSDFETFSVSV : .: ::..:.:.:::: :.:: .:. ::: : .:: :.::.... . : NP_001 LRIKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMDETVWTKEYEGNVTWKIKLRSAMYHS--- 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 KFTMTMFS-LTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIVISFL ..:.::.. ..:.:...::::::: :: :::.::::. :: .:: :::: .::. : ::: NP_001 NMTLTMLANFVPLTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LFYASFFLCVLISW--ISELYQNTVIYMLCETIGVFS-PSSHSFLLILGNAKLRQAFLLV :. : .:: ..:: ...: .. : .:.:..: .:: ::.: :.::::: ::.: :: : NP_001 LLCAIYFLSMIISVCNFGRLEKQPV-FMFCQAI-IFSYPSTHPFILILGNKKLKQIFLSV 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 AAKV--WAKR .: :.: NP_001 LRHVRYWVKDRSLRLHRFTRGALCVF 300 310 >>XP_003961040 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste receptor (299 aa) initn: 828 init1: 245 opt: 839 Z-score: 988.9 bits: 191.0 E(85289): 2.4e-48 Smith-Waterman score: 839; 44.4% identity (73.9% similar) in 306 aa overlap (1-303:1-298) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW : . :: ::...... :.:::..::::.:.: .::.....: .:... ::.::.::.: XP_003 MITFLPIIFSILVVVTFVIGNFANGFIALVNSTEWVKRQKISFADQIVTALAVSRVGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFS-WIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAF .:..:. .. :.. .. :: .. : :..::. : :: .:::::::::.::. : XP_003 VLLLNWYSTVLNPAFY--SVELRTTAYNIWAVTGHFSNWPATSLSIFYLLKIANFSNLIF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 LYLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDWLDRYERNTTWNFSMSDFETFSVSV : :: ::..:::..::: :.:: .:. .::. : .:: : ::.... .: . 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XP_003 --TVTMLANLVPFTVTLISFLLLVCSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKVLQTVISFF 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LFYASFFLCVLIS-WISELYQNTVIYMLCETIGVFSPSSHSFLLILGNAKLRQAFLLVAA :. : .:. :.:: : . .: ..:.:..:: :.: :.:: :: ::.:..: : XP_003 LLRAIYFVSVIISVWSFKNLENKPVFMFCQAIGFSCSSAHPFILIWGNKKLKQTYLSV-- 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 KVWAKR .: : XP_003 -LWQMRY >>XP_006726600 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste receptor (299 aa) initn: 828 init1: 245 opt: 839 Z-score: 988.9 bits: 191.0 E(85289): 2.4e-48 Smith-Waterman score: 839; 44.4% identity (73.9% similar) in 306 aa overlap (1-303:1-298) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW : . :: ::...... :.:::..::::.:.: .::.....: .:... ::.::.::.: XP_006 MITFLPIIFSILVVVTFVIGNFANGFIALVNSTEWVKRQKISFADQIVTALAVSRVGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFS-WIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAF .:..:. .. :.. .. :: .. : :..::. : :: .:::::::::.::. : XP_006 VLLLNWYSTVLNPAFY--SVELRTTAYNIWAVTGHFSNWPATSLSIFYLLKIANFSNLIF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 LYLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDWLDRYERNTTWNFSMSDFETFSVSV : :: ::..:::..::: :.:: .:. .::. : .:: : ::.... .: . 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