FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5325, 303 aa 1>>>pF1KE5325 303 - 303 aa - 303 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6324+/-0.00143; mu= 14.1412+/- 0.085 mean_var=77.1974+/-16.710, 0's: 0 Z-trim(99.1): 49 B-trim: 0 in 0/48 Lambda= 0.145973 statistics sampled from 5591 (5622) to 5591 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.491), E-opt: 0.2 (0.173), width: 16 Scan time: 2.110 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 ( 303) 1956 422.0 2.7e-118 CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 ( 317) 901 199.9 2.2e-51 CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 ( 309) 882 195.8 3.4e-50 CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 ( 309) 867 192.7 3e-49 CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 ( 299) 858 190.8 1.1e-48 CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 ( 319) 850 189.1 3.7e-48 CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 ( 309) 835 185.9 3.2e-47 CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 ( 299) 816 181.9 5e-46 CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 ( 309) 808 180.3 1.7e-45 CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 ( 318) 761 170.4 1.6e-42 CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 ( 312) 712 160.0 2e-39 CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 ( 309) 631 143.0 2.8e-34 CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 ( 307) 629 142.6 3.7e-34 CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 ( 314) 593 135.0 7.2e-32 CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 ( 316) 592 134.8 8.3e-32 CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs108|chr5 ( 299) 477 110.5 1.6e-24 CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs108|chr7 ( 338) 476 110.4 2e-24 CCDS5869.1 TAS2R5 gene_id:54429|Hs108|chr7 ( 299) 469 108.9 5e-24 CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs108|chr7 ( 307) 463 107.6 1.2e-23 CCDS34765.1 TAS2R38 gene_id:5726|Hs108|chr7 ( 333) 437 102.2 5.8e-22 CCDS43662.1 TAS2R40 gene_id:259286|Hs108|chr7 ( 323) 417 97.9 1.1e-20 CCDS5885.1 TAS2R60 gene_id:338398|Hs108|chr7 ( 318) 400 94.3 1.2e-19 CCDS5868.1 TAS2R4 gene_id:50832|Hs108|chr7 ( 299) 368 87.6 1.3e-17 CCDS5785.1 TAS2R16 gene_id:50833|Hs108|chr7 ( 291) 364 86.7 2.2e-17 >>CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 (303 aa) initn: 1956 init1: 1956 opt: 1956 Z-score: 2237.2 bits: 422.0 E(32554): 2.7e-118 Smith-Waterman score: 1956; 100.0% identity (100.0% similar) in 303 aa overlap (1-303:1-303) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFSWIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAFL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFSWIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAFL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 YLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDWLDRYERNTTWNFSMSDFETFSVSVK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 YLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDWLDRYERNTTWNFSMSDFETFSVSVK 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 FTMTMFSLTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIVISFLLF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 FTMTMFSLTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIVISFLLF 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 YASFFLCVLISWISELYQNTVIYMLCETIGVFSPSSHSFLLILGNAKLRQAFLLVAAKVW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 YASFFLCVLISWISELYQNTVIYMLCETIGVFSPSSHSFLLILGNAKLRQAFLLVAAKVW 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 AKR ::: CCDS86 AKR >>CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 (317 aa) initn: 933 init1: 774 opt: 901 Z-score: 1036.2 bits: 199.9 E(32554): 2.2e-51 Smith-Waterman score: 901; 49.5% identity (74.9% similar) in 303 aa overlap (1-302:1-299) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW : ... ::::.:.:.:::::::.:.::.:.::::::. :..::::..: ::::::.:.: CCDS86 MGGVIKSIFTFVLIVEFIIGNLGNSFIALVNCIDWVKGRKISSVDRILTALAISRISLVW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFSWIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAFL :. :: ... . :.:.. .:.. : : :::..:::: .. ::.::::.::. :: CCDS86 LIFGSWCVSVFFPALFATEKMFRMLTNIWTVINHFSVWLATGLGTFYFLKIANFSNSIFL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 YLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDWLDRYERNTTWNFSMSDFETFSVSVK ::::::.::.:..:: : ::::::. ::.::. .. :.:: : . . :.: :: . CCDS86 YLKWRVKKVVLVLLLVTSVFLFLNIALINIHINASINGYRRNKTCSSDSSNFTRFSSLIV 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 FTMTMFSLTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIVISFLLF .: :.: . :::... :::::::. :: .::: . : : ::.: . .: ::.:.:. CCDS86 LTSTVFIFIPFTLSLAMFLLLIFSMWKHRKKMQHTVKISGDASTKAHRG-VKSVITFFLL 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 pF1KE5 YASFFLCVLIS-WISELYQNTVIYMLCETIGVFSPSSHSFLLILGNAKLRQAFLLVAAKV :: : : .:: : :: ....: .: ...:. :: :: .::::: ::::: : : . CCDS86 YAIFSLSFFISVWTSERLEENLI-ILSQVMGMAYPSCHSCVLILGNKKLRQASLSVL--L 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 WAKR : . CCDS86 WLRYMFKDGEPSGHKEFRESS 300 310 >>CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 (309 aa) initn: 853 init1: 258 opt: 882 Z-score: 1014.7 bits: 195.8 E(32554): 3.4e-50 Smith-Waterman score: 882; 44.0% identity (76.7% similar) in 309 aa overlap (1-302:1-302) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW : : : .:...... ::.::..::::.::: : ::.....::.:... ::.::.::.: CCDS86 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIF---SWIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSP ::. :. .. . ....:...:: .: :.:::..:::: .::::::::..:: CCDS86 VILLHWYSTV----LNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 AFLYLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDWLDRYERNTTWNFSMSDFETFSV : .:: ....:.:.:.::.: :: .:.. . .:. : .. : :.::.... . .: CCDS86 IFHHLKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLS- 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 SVKFTMTMFS-LTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIVIS ..:..:.. : :::...:::::::.:: :::.::::. :: .:: ::.: .::. : : CCDS86 --NLTVAMLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTS 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 FLLFYASFFLCVLIS-WISELYQNTVIYMLCETIGVFSPSSHSFLLILGNAKLRQAFLLV ::.. : .:::..:: : .. . .. :::...:.. :: :::.:: :: :.:.:: : CCDS86 FLILLAIYFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSV 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 AAKV--WAKR .: ::: CCDS86 LWQVTCWAKGQNQSTP 300 >>CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 (309 aa) initn: 814 init1: 266 opt: 867 Z-score: 997.6 bits: 192.7 E(32554): 3e-49 Smith-Waterman score: 867; 46.9% identity (73.9% similar) in 307 aa overlap (1-302:1-302) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW : . :: ::...:.. :.:::..::::.:.: :.: .....: .:..: ::.::.::.: CCDS53 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFS-WIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAF ....:. : . : : .:: .. : : :::. :::: .:::::::::.::. : CCDS53 VLVLNWY-ATELNPAFNS-IEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 LYLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDWLDRYERNTTWNFSMSDFETFSVSV :.:: ::..:.:.:::: :.:: .:. :::. : .:: : ::.... . .: . CCDS53 LHLKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNT- 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 KFTMTMFS-LTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIVISFL :.:... :.:::...::::::: :: :::.::::. :: .:: ::: .::. : ::: CCDS53 --TVTILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LFYASFFLCVLIS-WISELYQNTVIYMLCETIGVFSPSSHSFLLILGNAKLRQAFLLVAA :. : .:: ...: : : .: ..:.::.:. ::.: :.:: :: ::.:.:: : CCDS53 LLCAIYFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLW 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 KV--WAKR .: :.: CCDS53 HVRYWVKGEKPSSS 300 >>CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 (299 aa) initn: 839 init1: 253 opt: 858 Z-score: 987.6 bits: 190.8 E(32554): 1.1e-48 Smith-Waterman score: 858; 45.2% identity (75.9% similar) in 290 aa overlap (8-295:8-293) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW : ..... :..::..::::.:.: ::::. :..::....: :..:::::.: CCDS86 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFS-WIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAF .: :. .. :.. : .::. . : :.:::..:::. .::: :::::.::. CCDS86 VMLFLWYATVFNSALY--GLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLIS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 LYLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDWLDRYERNTTWNFSMSDFETFSVSV :.:: :...:.:.:::: ::::. :: :.: . : .:: :.::.... . .. .: CCDS86 LHLKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRN--AIHLSS 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 KFTMTMFSLTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIVISFLL . :. .: :::...: ::::: :: :::.::.:. :: .:: :::: .::. : :::. 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CCDS86 LCAIFFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQ 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 VWAKR . CCDS86 IRC >>CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 (309 aa) initn: 742 init1: 241 opt: 808 Z-score: 930.5 bits: 180.3 E(32554): 1.7e-45 Smith-Waterman score: 808; 44.4% identity (72.9% similar) in 306 aa overlap (1-302:1-302) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW : . .: ::. :... :.:::..::::.:.: :. :.....: .:..: ::.::.::.: CCDS53 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFS-WIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAF .:..:. .. :.. .. .: .. : :..::. :::: .:::::::::.::. : CCDS53 VLLLNWYSTVFNPAFY--SVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 LYLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDWLDRYERNTTWNFSMSDFETFSVSV :.:: ::..:::..::: :.:: .:. :::. .:: : ::.... . . .: CCDS53 LHLKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRS--AVYLSD 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 KFTMTMFSLTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIVISFLL . :. .:.:::.... ::::: :: :::.::::. :: .:: :::: .::. :: ::: CCDS53 ATVTTLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 FYASFFLCVLIS-WISELYQNTVIYMLCETIGVFSPSSHSFLLILGNAKLRQAFLLVAAK . : .:: ..:: : .: ..:.:..: :: : :.:: :: ::.:.:: : . CCDS53 LCAVYFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQ 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 V--WAKR : :.: CCDS53 VRYWVKGEKPSSP 300 >>CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 (318 aa) initn: 673 init1: 420 opt: 761 Z-score: 876.8 bits: 170.4 E(32554): 1.6e-42 Smith-Waterman score: 761; 40.7% identity (72.8% similar) in 305 aa overlap (1-299:1-303) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW : . . . . .. ..:: .: :.:.:: :.::.:::.::...:.: .: :::::: :. CCDS86 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLILTSLAISRICLLC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFSWIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAFL ::.. :. . : ....: .::. : : ..::...:.:: .::.:..::..: : :: CCDS86 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLFL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 YLKWRVNKVILMILLGTLVF-LFLNLIQINMHIKDWL----DRYERNTTWNFSMSDFETF ..:::...:: :::: .:. .:..: . :. . . : ::. .. .: CCDS86 WMKWRIDRVISWILLGCVVLSVFISLPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVN--KTQ 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 SVSVKFTMTMFSLTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIVI .:.:. ... .: :: : ..::.:::.::..:...:::. : ::: :..:. ::: :: CCDS86 HASTKLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKAVI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 SFLLFYASFFLCVLISWISELYQNT-VIYMLCETIGVFSPSSHSFLLILGNAKLRQAFLL ::::.. ...: ::. : .. .: . .. :.:... ::::::.::::: :::.: : CCDS86 SFLLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASLK 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 VAAKVWAKR : :: CCDS86 VIWKVMSILKGRKFQQHKQI 300 310 303 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 23:47:54 2016 done: Mon Nov 7 23:47:54 2016 Total Scan time: 2.110 Total Display time: 0.020 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]