FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5383, 307 aa 1>>>pF1KE5383 307 - 307 aa - 307 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0184+/-0.00055; mu= 16.7897+/- 0.034 mean_var=61.7084+/-13.129, 0's: 0 Z-trim(105.8): 107 B-trim: 878 in 1/46 Lambda= 0.163268 statistics sampled from 13835 (13942) to 13835 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.478), E-opt: 0.2 (0.163), width: 16 Scan time: 5.660 The best scores are: opt bits E(85289) NP_076410 (OMIM: 604791) taste receptor type 2 mem ( 307) 1981 475.9 4.5e-134 NP_076408 (OMIM: 604793) taste receptor type 2 mem ( 318) 794 196.3 6.8e-50 NP_076406 (OMIM: 604795) taste receptor type 2 mem ( 312) 752 186.4 6.4e-47 NP_076407 (OMIM: 604794) taste receptor type 2 mem ( 309) 705 175.3 1.4e-43 NP_076411 (OMIM: 604790) taste receptor type 2 mem ( 317) 656 163.8 4.2e-40 NP_852094 (OMIM: 613966) taste receptor type 2 mem ( 314) 645 161.2 2.5e-39 NP_058639 (OMIM: 604868) taste receptor type 2 mem ( 316) 641 160.2 4.8e-39 NP_076409 (OMIM: 604792) taste receptor type 2 mem ( 303) 631 157.9 2.4e-38 NP_795366 (OMIM: 612669) taste receptor type 2 mem ( 309) 618 154.8 2e-37 NP_795365 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 mem ( 309) 610 152.9 7.4e-37 NP_795370 (OMIM: 613962) taste receptor type 2 mem ( 309) 601 150.8 3.2e-36 NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2 ( 319) 588 147.8 2.8e-35 NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 mem ( 309) 578 145.4 1.4e-34 NP_795367 (OMIM: 613967) taste receptor type 2 mem ( 299) 572 144.0 3.6e-34 XP_006726600 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 572 144.0 3.6e-34 XP_003961040 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 572 144.0 3.6e-34 NP_795369 (OMIM: 613961) taste receptor type 2 mem ( 299) 567 142.8 8.1e-34 NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 mem ( 299) 524 132.7 9.1e-31 NP_061853 (OMIM: 605062) taste receptor type 2 mem ( 299) 485 123.5 5.3e-28 NP_062545 (OMIM: 604796) taste receptor type 2 mem ( 299) 470 119.9 6.1e-27 NP_795363 (OMIM: 613964) taste receptor type 2 mem ( 323) 444 113.8 4.5e-25 NP_795364 (OMIM: 613965) taste receptor type 2 mem ( 307) 387 100.4 4.8e-21 NP_058640 (OMIM: 604869) taste receptor type 2 mem ( 299) 384 99.7 7.7e-21 NP_803186 (OMIM: 613968) taste receptor type 2 mem ( 318) 333 87.7 3.3e-17 NP_058641 (OMIM: 103780,604867) taste receptor typ ( 291) 293 78.2 2.1e-14 NP_789787 (OMIM: 171200,607751) taste receptor typ ( 333) 231 63.7 5.9e-10 NP_001295399 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 177 51.0 4.1e-06 NP_065110 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene rec ( 346) 177 51.0 4.1e-06 NP_001295400 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 177 51.0 4.1e-06 NP_001295397 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 177 51.0 4.1e-06 NP_001295398 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 177 51.0 4.1e-06 NP_001295405 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 177 51.0 4.1e-06 NP_001295394 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 177 51.0 4.1e-06 NP_001295396 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 177 51.0 4.1e-06 NP_997055 (OMIM: 608584,608595) neuropeptide S rec ( 371) 160 47.0 7e-05 NP_997056 (OMIM: 608584,608595) neuropeptide S rec ( 377) 160 47.0 7.1e-05 NP_001287864 (OMIM: 608584,608595) neuropeptide S ( 390) 160 47.0 7.3e-05 NP_940799 (OMIM: 601898) growth hormone secretagog ( 366) 141 42.5 0.0015 NP_001269115 (OMIM: 300201) cysteinyl leukotriene ( 337) 137 41.5 0.0028 NP_001269117 (OMIM: 300201) cysteinyl leukotriene ( 337) 137 41.5 0.0028 NP_006630 (OMIM: 300201) cysteinyl leukotriene rec ( 337) 137 41.5 0.0028 NP_001269116 (OMIM: 300201) cysteinyl leukotriene ( 337) 137 41.5 0.0028 NP_005192 (OMIM: 601834) C-C chemokine receptor ty ( 355) 136 41.3 0.0034 NP_001287862 (OMIM: 608584,608595) neuropeptide S ( 366) 132 40.4 0.0067 >>NP_076410 (OMIM: 604791) taste receptor type 2 member (307 aa) initn: 1981 init1: 1981 opt: 1981 Z-score: 2528.0 bits: 475.9 E(85289): 4.5e-134 Smith-Waterman score: 1981; 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NP_076 LLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASLKVI 250 260 270 280 290 300 300 pF1KE5 QQLKCCEKRKNLRVT .. NP_076 WKVMSILKGRKFQQHKQI 310 >>NP_076406 (OMIM: 604795) taste receptor type 2 member (312 aa) initn: 758 init1: 368 opt: 752 Z-score: 963.4 bits: 186.4 E(85289): 6.4e-47 Smith-Waterman score: 752; 41.2% identity (74.6% similar) in 311 aa overlap (1-302:1-307) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCIDCAKNK-LSTIGFILTGLAISRIFLIW : ..:.:.:.....: ..:. ::::: :::::: : . .: : .:: .:::::: :. NP_076 MPSAIEAIYIILIAGELTIGIWGNGFIVLVNCIDWLKRRDISLIDIILISLAISRICLLC 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 IIITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFL .: :::.... :. :... :. .. :...:.::.::.. :::::.:::::.:. .:. NP_076 VISLDGFFMLLFPGTYGNSVLVSIVNVVWTFANNSSLWFTSCLSIFYLLKIANISHPFFF 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 WLKSRTNMVLPFMIVFLLISSLLNFAYIAKILND------YKMKNDT--VWDLNMYKSEY ::: . : : :...:: : :... :. :: .:.... .: ... : NP_076 WLKLKINKV---MLAILLGSFLISLI-ISVPKNDDMWYHLFKVSHEENITWKFKVSKIPG 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 FIKQILLNLGVIFFFTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLIS .::. :::::. : : ::. ..:..:: ::..:.. ..::.:: .::::..:.:..: NP_076 TFKQLTLNLGVMVPFILCLISFFLLLFSLVRHTKQIRLHATGFRDPSTEAHMRAIKAVII 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 FIILFILYFIGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLRV :..:.:.:. . . : . ..::.::.: .:.:.: .::::::.:::::..: :.. NP_076 FLLLLIVYYPVFLVMTSSALIPQGKLVLMIGDIVTVIFPSSHSFILIMGNSKLREAFLKM 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 LQQLKCCEKRKNLRVT :. .:: .:. NP_076 LRFVKCFLRRRKPFVP 300 310 >>NP_076407 (OMIM: 604794) taste receptor type 2 member (309 aa) initn: 637 init1: 328 opt: 705 Z-score: 903.6 bits: 175.3 E(85289): 1.4e-43 Smith-Waterman score: 705; 38.4% identity (72.3% similar) in 307 aa overlap (1-297:1-307) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCID-CAKNKLSTIGFILTGLAISRIFLIW :. ...:::.....: ..:.::::.:.::: :: :.:.::. .:::.:.:.:: :: NP_076 MFSPADNIFIILITGEFILGILGNGYIALVNWIDWIKKKKISTVDYILTNLVIARICLIS 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 IIITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFL .....:.. ...:..:.... : ::...: .::..: :..:::::::. :. .:: NP_076 VMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQQIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYFLKIASSSHPLFL 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 WLKSRTNMVLPFMIVFLLISSLLNFAYIAKILN-DY------KMKNDTVWDLNMYKSEYF ::: . .::. .... . ::: : .:. :: : : . . ... : :: NP_076 WLKWKIDMVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCDYRFHAIAKHKRNITEMFHVSKIPYF 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 IKQILLNLGVIFFFTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLISF :.:: .: : .:::. ..:. :::::..:.. .:: :: .::.::.:.:.. :: NP_076 EPLTLFNLFAIVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGSRDPSTEVHVRAIKTMTSF 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 IILFILYFIGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLRVL :..:.::.:. . . . . :: . :: .. .:: :::.:::. :.::.:. .:.: NP_076 IFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEFGEIAAILYPLGHSLILIVLNNKLRQTFVRML 250 260 270 280 290 300 300 pF1KE5 --QQLKCCEKRKNLRVT ... : NP_076 TCRKIACMI >>NP_076411 (OMIM: 604790) taste receptor type 2 member (317 aa) initn: 577 init1: 293 opt: 656 Z-score: 841.0 bits: 163.8 E(85289): 4.2e-40 Smith-Waterman score: 656; 39.5% identity (72.0% similar) in 304 aa overlap (4-296:4-299) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCIDCAKN-KLSTIGFILTGLAISRIFLIW :...:: ::.. : ..: :::.::.:::::: .:. :.:.. :::.:::::: :.: NP_076 MGGVIKSIFTFVLIVEFIIGNLGNSFIALVNCIDWVKGRKISSVDRILTALAISRISLVW 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 IIITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFL .:. . ...: : ..:. ....... .:.. :. :.:.::.:. ::::::::::: ::: NP_076 LIFGSWCVSVFFPALFATEKMFRMLTNIWTVINHFSVWLATGLGTFYFLKIANFSNSIFL 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 WLKSRTNMVLPFMIVFLLISSLLNFAYIAKI-------LNDYKMKNDTVWDLNMYKSEYF .:: :.. :. .:.::..:.. : :: : .: :. .. : . . : NP_076 YLKWRVKKVV---LVLLLVTSVFLFLNIALINIHINASINGYRRNKTCSSDSSNFTR--F 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 IKQILLNLGVIFF--FTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLI . :.:. :..: ::::: ..::.:.:.: ..:: .: :..:.:: ...: .: NP_076 SSLIVLTSTVFIFIPFTLSLAMFLLLIFSMWKHRKKMQHTVKISGDASTKAH-RGVKSVI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 SFIILFILYFIGMAIEI-SCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASL .:..:. .. ... : . . ..:: :...... :: :: .:::::.::.:::: NP_076 TFFLLYAIFSLSFFISVWTSERLEEN--LIILSQVMGMAYPSCHSCVLILGNKKLRQASL 240 250 260 270 280 290 290 300 pF1KE5 RVLQQLKCCEKRKNLRVT :: :. NP_076 SVLLWLRYMFKDGEPSGHKEFRESS 300 310 >>NP_852094 (OMIM: 613966) taste receptor type 2 member (314 aa) initn: 622 init1: 309 opt: 645 Z-score: 827.1 bits: 161.2 E(85289): 2.5e-39 Smith-Waterman score: 645; 39.2% identity (68.5% similar) in 311 aa overlap (1-303:1-310) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCIDCAKN-KLSTIGFILTGLAISRIFLIW : .. ::......: ....::: ::::::: . :: :. . :::: :::: : . NP_852 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 IIITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFL .:. :.:. .. ..:.. : . . ..: . :. . :.:: ::::::.:::.: . .:: NP_852 VILFDSFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLFL 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 WLKSRTN-MVLPFMIV--FLLI-SSLLNFAYIAKILNDYKMKNDTVWDLNMYKSEY---F ::. : : :.. ..:. :::: .::. .: :: .: :.. :. :. : NP_852 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLLIFDSLVLEIFIDISLNIIDKSNLTLY-LDESKTLYDKLS 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 IKQILLNLGVIFFFTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLISF : . ::.: .. :.: : . .::..:: ::.:... . : :::.:::: .:::...:: NP_852 ILKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMKMVMSF 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 IILFILYFIGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLRVL ..:::..:... . : . :. . : : . .: ::::::::::::.:...:.: NP_852 LFLFIVHFFSLQVANWIFFMLWNNKCIKFVMLALNAFPSCHSFILILGNSKLQQTAVRLL 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 QQLKCCEKRKNLRVT .:. : : NP_852 WHLRNYTKTPNPLPL 300 310 >>NP_058639 (OMIM: 604868) taste receptor type 2 member (316 aa) initn: 634 init1: 316 opt: 641 Z-score: 822.0 bits: 160.2 E(85289): 4.8e-39 Smith-Waterman score: 641; 39.4% identity (70.0% similar) in 307 aa overlap (1-297:1-301) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCIDCAKNK-LSTIGFILTGLAISRIFLIW :. ..::.:... .. ..:.: : :: ::: . :.: .: ::.: ::. ::.:. 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NP_795 LHLKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDAT 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 LLNLGVIFFFTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLISFIILF . .:: . :::.:. ..:: :: .: ..:: . : .: .:..:.::....: :..: NP_795 VTTLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLC 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 ILYFIGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLRVLQQLK .::... : . : ::: ..:: . :: : :::: ::.::::. : ::.:.. NP_795 AVYFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVR 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 CCEKRKNLRVT NP_795 YWVKGEKPSSP 300 >>NP_795365 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 member (309 aa) initn: 473 init1: 286 opt: 610 Z-score: 782.7 bits: 152.9 E(85289): 7.4e-37 Smith-Waterman score: 610; 35.8% identity (67.9% similar) in 299 aa overlap (1-296:1-298) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCID-CAKNKLSTIGFILTGLAISRIFLIW :. . :: .:: :.: ..::::.::: :. ..:.: :::.::.::. :.: NP_795 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 IIITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFL ... . . ...: . : .. .:.. :. : :.::.:::::.::::::::.::: NP_795 VLLLNWYSTVLNPA-FNSVEVRTTAYNIWAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSNFIFL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 WLKSRTNMVLPFMIV--FLLISSLLNFAYIAKILNDYKMKNDTVWDLNMYKSEYFIKQIL :: :.. :. :.. .:... : . .:. ..... .: ... .. :: .. . NP_795 HLKRRVKSVILVMLLGPLLFLACHLFVINMNEIVRTKEFEGNMTWKIKLKSAMYFSNMTV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 LNLGVIFFFTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLISFIILFI .. . :::.:.. ..:: :: .: ..:: . : .: .:..:.::....:::..: NP_795 TMVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVISFLLLCA 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LYFIGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLRVLQQLKC .::... : . : ::: ..:: . :: : :::: ::.::::. : :. :.. NP_795 IYFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVFWQMRY 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 CEKRKNLRVT NP_795 WVKGEKTSSP 300 307 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 00:14:54 2016 done: Tue Nov 8 00:14:55 2016 Total Scan time: 5.660 Total Display time: -0.010 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]