FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2293, 206 aa 1>>>pF1KE2293 206 - 206 aa - 206 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8444+/-0.000716; mu= 16.6167+/- 0.043 mean_var=68.6189+/-13.702, 0's: 0 Z-trim(109.7): 36 B-trim: 66 in 1/50 Lambda= 0.154829 statistics sampled from 11027 (11063) to 11027 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.722), E-opt: 0.2 (0.34), width: 16 Scan time: 2.060 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS8194.1 FGF4 gene_id:2249|Hs108|chr11 ( 206) 1352 310.3 5.4e-85 CCDS8527.1 FGF6 gene_id:2251|Hs108|chr12 ( 208) 644 152.1 2.2e-37 CCDS34021.1 FGF5 gene_id:2250|Hs108|chr4 ( 268) 397 97.1 1.1e-20 CCDS34059.1 FGF2 gene_id:2247|Hs108|chr4 ( 288) 358 88.4 4.8e-18 CCDS5998.1 FGF20 gene_id:26281|Hs108|chr8 ( 211) 347 85.8 2.1e-17 CCDS9298.1 FGF9 gene_id:2254|Hs108|chr13 ( 208) 346 85.6 2.4e-17 CCDS75996.1 FGF16 gene_id:8823|Hs108|chrX ( 207) 329 81.8 3.4e-16 CCDS12037.1 FGF22 gene_id:27006|Hs108|chr19 ( 170) 320 79.7 1.2e-15 CCDS9501.1 FGF14 gene_id:2259|Hs108|chr13 ( 247) 303 76.0 2.1e-14 CCDS9500.1 FGF14 gene_id:2259|Hs108|chr13 ( 252) 303 76.0 2.2e-14 CCDS11105.1 FGF11 gene_id:2256|Hs108|chr17 ( 225) 293 73.8 9.4e-14 CCDS10131.1 FGF7 gene_id:2252|Hs108|chr15 ( 194) 286 72.1 2.5e-13 CCDS55512.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX ( 199) 283 71.5 4e-13 CCDS14664.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX ( 192) 280 70.8 6.2e-13 CCDS55511.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX ( 226) 280 70.9 7.1e-13 CCDS14665.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX ( 245) 280 70.9 7.5e-13 CCDS55513.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX ( 255) 280 70.9 7.7e-13 CCDS46983.1 FGF12 gene_id:2257|Hs108|chr3 ( 181) 278 70.3 8.1e-13 CCDS3301.1 FGF12 gene_id:2257|Hs108|chr3 ( 243) 278 70.4 1e-12 CCDS3950.1 FGF10 gene_id:2255|Hs108|chr5 ( 208) 270 68.6 3.1e-12 CCDS8195.1 FGF3 gene_id:2248|Hs108|chr11 ( 239) 261 66.6 1.4e-11 >>CCDS8194.1 FGF4 gene_id:2249|Hs108|chr11 (206 aa) initn: 1352 init1: 1352 opt: 1352 Z-score: 1639.3 bits: 310.3 E(32554): 5.4e-85 Smith-Waterman score: 1352; 100.0% identity (100.0% similar) in 206 aa overlap (1-206:1-206) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MSGPGTAAVALLPAVLLALLAPWAGRGGAAAPTAPNGTLEAELERRWESLVALSLARLPV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS81 MSGPGTAAVALLPAVLLALLAPWAGRGGAAAPTAPNGTLEAELERRWESLVALSLARLPV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 AAQPKEAAVQSGAGDYLLGIKRLRRLYCNVGIGFHLQALPDGRIGGAHADTRDSLLELSP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS81 AAQPKEAAVQSGAGDYLLGIKRLRRLYCNVGIGFHLQALPDGRIGGAHADTRDSLLELSP 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 VERGVVSIFGVASRFFVAMSSKGKLYGSPFFTDECTFKEILLPNNYNAYESYKYPGMFIA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS81 VERGVVSIFGVASRFFVAMSSKGKLYGSPFFTDECTFKEILLPNNYNAYESYKYPGMFIA 130 140 150 160 170 180 190 200 pF1KE2 LSKNGKTKKGNRVSPTMKVTHFLPRL :::::::::::::::::::::::::: CCDS81 LSKNGKTKKGNRVSPTMKVTHFLPRL 190 200 >>CCDS8527.1 FGF6 gene_id:2251|Hs108|chr12 (208 aa) initn: 621 init1: 621 opt: 644 Z-score: 784.6 bits: 152.1 E(32554): 2.2e-37 Smith-Waterman score: 647; 54.1% identity (72.9% similar) in 207 aa overlap (3-206:14-208) 10 20 30 40 pF1KE2 MSGPGTAAVALLPAVLLALLAPWAGRGGAAAPTAPNGTLEAE--LERR- : : .: :.:..:. : ..:. : :: . :. : CCDS85 MALGQKLFITMSRGAGRLQGTLWALVFLGILV------GMVVPS-PAGTRANNTLLDSRG 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 WESLVALSLARLPVAAQPKEAAVQSGAGDYLLGIKRLRRLYCNVGIGFHLQALPDGRIGG : .: :: .: .:.. . .:: ::.:::: ::::::::::::::.::::::.: CCDS85 WGTL--LSRSRAGLAGEIAGVNWESG---YLVGIKRQRRLYCNVGIGFHLQVLPDGRISG 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 AHADTRDSLLELSPVERGVVSIFGVASRFFVAMSSKGKLYGSPFFTDECTFKEILLPNNY .: .. ::::.: :::::::.::: : .::::.:::.::..: : .:: :.: :::::: CCDS85 THEENPYSLLEISTVERGVVSLFGVRSALFVAMNSKGRLYATPSFQEECKFRETLLPNNY 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 pF1KE2 NAYESYKYPGMFIALSKNGKTKKGNRVSPTMKVTHFLPRL ::::: : : .::::: :..:.:..::: : :::::::. CCDS85 NAYESDLYQGTYIALSKYGRVKRGSKVSPIMTVTHFLPRI 170 180 190 200 >>CCDS34021.1 FGF5 gene_id:2250|Hs108|chr4 (268 aa) initn: 417 init1: 305 opt: 397 Z-score: 484.9 bits: 97.1 E(32554): 1.1e-20 Smith-Waterman score: 397; 38.3% identity (64.3% similar) in 196 aa overlap (20-206:26-219) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MSGPGTAAVALLPAVLLALLAPWAGRGGAAAPTAPNGTLEAELERRWESLVALS ::: . : ::. : :. . . .. . : CCDS34 MSLSFLLLLFFSHLILSAWAHGEKRLAPKGQPGPAATDRNPRGS--SSRQSSSSAMSSSS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 LARLPVAAQPKEAA-VQSGAGDYLLGIKRLRRLYCNVGIGFHLQALPDGRIGGAHADTRD . :.:. .... ..... .. . .: ::: :::::::: :::...:.: . CCDS34 ASSSPAASLGSQGSGLEQSSFQWSPSGRRTGSLYCRVGIGFHLQIYPDGKVNGSHEANML 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 SLLELSPVERGVVSIFGVASRFFVAMSSKGKLYGSPFFTDECTFKEILLPNNYNAYESYK :.::. : .:.:.: :: : :.:::.::::..: :::.: :.: . :.::.: : CCDS34 SVLEIFAVSQGIVGIRGVFSNKFLAMSKKGKLHASAKFTDDCKFRERFQENSYNTYASAI 120 130 140 150 160 170 180 190 200 pF1KE2 Y----PG--MFIALSKNGKTKKGN--RVSPTMKVTHFLPRL . : ..::.: ::.:.: ::.: ::::::. CCDS34 HRTEKTGREWYVALNKRGKAKRGCSPRVKPQHISTHFLPRFKQSEQPELSFTVTVPEKKK 180 190 200 210 220 230 CCDS34 PPSPIKPKIPLSAPRKNTNSVKYRLKFRFG 240 250 260 >>CCDS34059.1 FGF2 gene_id:2247|Hs108|chr4 (288 aa) initn: 256 init1: 256 opt: 358 Z-score: 437.4 bits: 88.4 E(32554): 4.8e-18 Smith-Waterman score: 358; 38.6% identity (64.7% similar) in 184 aa overlap (25-204:107-283) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MSGPGTAAVALLPAVLLALLAPWAGRGGAAAPTAPNGTLEAELERRWE--SLVA ::: . . .:: .. :. : ...: CCDS34 SRLGDRGRGRALPGGRLGGRGRGRAPERVGGRGRGRGTAAPRAAPAARGSRPGPAGTMAA 80 90 100 110 120 130 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 LSLARLPVAAQPKEAAVQSGAGDYLLG-IKRLRRLYCNVGIGFHLQALPDGRIGGAHADT :.. :: : :... :.: . : .: .::::. : :: :. ::::. :.. . CCDS34 GSITTLP--ALPEDG----GSGAFPPGHFKDPKRLYCKNG-GFFLRIHPDGRVDGVREKS 140 150 160 170 180 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 RDSL-LELSPVERGVVSIFGVASRFFVAMSSKGKLYGSPFFTDECTFKEILLPNNYNAYE . :.:. ::::::: :: . ..::. :.: .: :::: : : : ::::.:. CCDS34 DPHIKLQLQAEERGVVSIKGVCANRYLAMKEDGRLLASKCVTDECFFFERLESNNYNTYR 190 200 210 220 230 240 180 190 200 pF1KE2 SYKYPGMFIALSKNGKTKKGNRVSPTMKVTHFLPRL : :: . ..::...:. : :....: .:. ::: CCDS34 SRKYTSWYVALKRTGQYKLGSKTGPGQKAILFLPMSAKS 250 260 270 280 >>CCDS5998.1 FGF20 gene_id:26281|Hs108|chr8 (211 aa) initn: 390 init1: 158 opt: 347 Z-score: 426.0 bits: 85.8 E(32554): 2.1e-17 Smith-Waterman score: 347; 41.7% identity (64.4% similar) in 163 aa overlap (57-205:33-193) 30 40 50 60 70 pF1KE2 GGAAAPTAPNGTLEAELERRWESLVALSLARLPVAAQPKEAAVQSGAGD-------YLLG : :. .. . :: .:. : .: : CCDS59 PLAEVGGFLGGLEGLGQQVGSHFLLPPAGERPPLLGERRSAAERSARGGPGAAQLAHLHG 10 20 30 40 50 60 80 90 100 110 120 130 pF1KE2 IKRLRRLYCNVGIGFHLQALPDGRIGGAHAD-TRDSLLELSPVERGVVSIFGVASRFFVA : : :.::: .: :::: :::: . :.. : . ..::. : :.::: :: : .... 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CCDS12 RSYPHLEGDVRWRRLFSSTH--FFLRVDPGGRVQGTRWRHGQDSILEIRSVHVGVVVIKA 40 50 60 70 80 140 150 160 170 180 pF1KE2 VASRFFVAMSSKGKLYGSPFFTDECTFKEILLPNNYNAYESYKY----PGMFIALSKNGK :.: :.:::. .:.:::: ..: .: :.: . :..:.: : .. ::.::.. : CCDS12 VSSGFYVAMNRRGRLYGSRLYTVDCRFRERIEENGHNTYASQRWRRRGQPMFLALDRRGG 90 100 110 120 130 140 190 200 pF1KE2 TKKGNRVSPTMKVTHFLPRL . :.:. .:::: : CCDS12 PRPGGRTRRYHLSAHFLPVLVS 150 160 170 >>CCDS9501.1 FGF14 gene_id:2259|Hs108|chr13 (247 aa) initn: 263 init1: 148 opt: 303 Z-score: 371.9 bits: 76.0 E(32554): 2.1e-14 Smith-Waterman score: 303; 42.6% identity (66.2% similar) in 136 aa overlap (77-205:68-199) 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 WESLVALSLARLPVAAQPKEAAVQSGAGDYLLGIKRLRRLYCNVGIGFHLQALPDGRIGG : :: . :::: :..:: ::: . : CCDS95 GLCNGNLVDIFSKVRIFGLKKRRLRRQDPQLKGI--VTRLYCRQ--GYYLQMHPDGALDG 40 50 60 70 80 90 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 AHADTRDS-LLELSPVERGVVSIFGVASRFFVAMSSKGKLYGSPFFTDECTFKEILLPNN .. :. .: :..: :: ::.: :: . ...::...: :: : .:: :: ::: .. : CCDS95 TKDDSTNSTLFNLIPVGLRVVAIQGVKTGLYIAMNGEGYLYPSELFTPECKFKESVFENY 100 110 120 130 140 150 170 180 190 200 pF1KE2 YNAYESYKY----PG--MFIALSKNGKTKKGNRVSPTMKVTHFLPRL : : :. : : :..:.:.:.. :::::. : ..::::. CCDS95 YVIYSSMLYRQQESGRAWFLGLNKEGQAMKGNRVKKTKPAAHFLPKPLEVAMYREPSLHD 160 170 180 190 200 210 CCDS95 VGETVPKPGVTPSKSTSASAIMNGGKPVNKSKTT 220 230 240 >>CCDS9500.1 FGF14 gene_id:2259|Hs108|chr13 (252 aa) initn: 263 init1: 148 opt: 303 Z-score: 371.8 bits: 76.0 E(32554): 2.2e-14 Smith-Waterman score: 303; 42.6% identity (66.2% similar) in 136 aa overlap (77-205:73-204) 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 WESLVALSLARLPVAAQPKEAAVQSGAGDYLLGIKRLRRLYCNVGIGFHLQALPDGRIGG : :: . :::: :..:: ::: . : CCDS95 LWNIFSKGTHMLQCLCGKSLKKNKNPTDPQLKGI--VTRLYCRQ--GYYLQMHPDGALDG 50 60 70 80 90 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 AHADTRDS-LLELSPVERGVVSIFGVASRFFVAMSSKGKLYGSPFFTDECTFKEILLPNN .. :. .: :..: :: ::.: :: . ...::...: :: : .:: :: ::: .. : CCDS95 TKDDSTNSTLFNLIPVGLRVVAIQGVKTGLYIAMNGEGYLYPSELFTPECKFKESVFENY 100 110 120 130 140 150 170 180 190 200 pF1KE2 YNAYESYKY----PG--MFIALSKNGKTKKGNRVSPTMKVTHFLPRL : : :. : : :..:.:.:.. :::::. : ..::::. CCDS95 YVIYSSMLYRQQESGRAWFLGLNKEGQAMKGNRVKKTKPAAHFLPKPLEVAMYREPSLHD 160 170 180 190 200 210 CCDS95 VGETVPKPGVTPSKSTSASAIMNGGKPVNKSKTT 220 230 240 250 206 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 04:35:18 2016 done: Sun Nov 6 04:35:18 2016 Total Scan time: 2.060 Total Display time: -0.010 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]