Result of FASTA (ccds) for pFN21AE1245
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE1245, 477 aa
  1>>>pF1KE1245 477 - 477 aa - 477 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7045+/-0.000855; mu= 6.8840+/- 0.053
 mean_var=306.1524+/-71.232, 0's: 0 Z-trim(117.3): 205  B-trim: 1902 in 2/51
 Lambda= 0.073300
 statistics sampled from 17804 (18082) to 17804 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.815), E-opt: 0.2 (0.555), width:  16
 Scan time:  3.610

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10           ( 477) 3257 357.5 1.8e-98
CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5            ( 413)  973 115.9 8.3e-26
CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8            ( 408)  886 106.7 4.9e-23
CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6           ( 390)  690 85.9 8.2e-17
CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1            ( 377)  644 81.1 2.3e-15
CCDS5006.1 HTR1E gene_id:3354|Hs108|chr6           ( 365)  634 80.0 4.8e-15
CCDS33829.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3           ( 367)  604 76.8 4.3e-14
CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3           ( 366)  571 73.3 4.8e-13
CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5            ( 446)  570 73.3 5.9e-13
CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20         ( 572)  524 68.6   2e-11
CCDS2483.1 HTR2B gene_id:3357|Hs108|chr2           ( 481)  522 68.3 2.1e-11
CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5            ( 359)  509 66.7 4.5e-11
CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5           ( 397)  509 66.8 4.8e-11
CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5           ( 520)  506 66.6 7.1e-11


>>CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10                (477 aa)
 initn: 3257 init1: 3257 opt: 3257  Z-score: 1881.4  bits: 357.5 E(32554): 1.8e-98
Smith-Waterman score: 3257; 99.8% identity (99.8% similar) in 477 aa overlap (1-477:1-477)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MGAGVLVLGASEPGNLSSAAPLPDGAATAARLLVPASPPASLLPPASESPEPLSQQWTAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MGAGVLVLGASEPGNLSSAAPLPDGAATAARLLVPASPPASLLPPASESPEPLSQQWTAG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 MGLLMALIVLLIVAGNVLVIVAIAKTPRLQTLTNLFIMSLASADLVMGLLVVPFGATIVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MGLLMALIVLLIVAGNVLVIVAIAKTPRLQTLTNLFIMSLASADLVMGLLVVPFGATIVV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 WGRWEYGSFFCELWTSVDVLCVTASIETLCVIALDRYLAITSPFRYQSLLTRARARGLVC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 WGRWEYGSFFCELWTSVDVLCVTASIETLCVIALDRYLAITSPFRYQSLLTRARARGLVC
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 TVWAISALVSFLPILMHWWRAESDEARRCYNDPKCCDFVTNRAYAIASSVVSFYVPLCIM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TVWAISALVSFLPILMHWWRAESDEARRCYNDPKCCDFVTNRAYAIASSVVSFYVPLCIM
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 AFVYLRVFREAQKQVKKIDSCERRFLGGPARPPSPSPSPVPAPAPPPGPPRPAAAAATAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AFVYLRVFREAQKQVKKIDSCERRFLGGPARPPSPSPSPVPAPAPPPGPPRPAAAAATAP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 LANGRAGKRRPSRLVALREQKALKTLGIIMGVFTLCWLPFFLANVVKAFHRELVPDRLFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LANGRAGKRRPSRLVALREQKALKTLGIIMGVFTLCWLPFFLANVVKAFHRELVPDRLFV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 FFNWLGYANSAFNPIIYCRSPDFRKAFQRLLCCARRAARRRHATHGDRPRASGCLARPGP
       :::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FFNWLGYANSAFNPIIYCRSPDFRKAFQGLLCCARRAARRRHATHGDRPRASGCLARPGP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       
pF1KE1 PPSPGAASDDDDDDVVGATPPARLLEPWAGCNGGAAADSDSSLDEPCRPGFASESKV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PPSPGAASDDDDDDVVGATPPARLLEPWAGCNGGAAADSDSSLDEPCRPGFASESKV
              430       440       450       460       470       

>>CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5                 (413 aa)
 initn: 1327 init1: 957 opt: 973  Z-score: 576.8  bits: 115.9 E(32554): 8.3e-26
Smith-Waterman score: 1309; 54.1% identity (75.1% similar) in 390 aa overlap (35-413:4-365)

           10        20        30        40         50             
pF1KE1 VLVLGASEPGNLSSAAPLPDGAATAARLLVPASPPASLLPP-ASESPE-PLSQQ----WT
                                     :..  : :: : .:..:.  ..:.    :.
CCDS42                            MGQPGNGSAFLLAPNGSHAPDHDVTQERDEVWV
                                          10        20        30   

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE1 AGMGLLMALIVLLIVAGNVLVIVAIAKTPRLQTLTNLFIMSLASADLVMGLLVVPFGATI
       .:::..:.:::: :: ::::::.::::  ::::.:: :: ::: ::::::: ::::::. 
CCDS42 VGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAH
            40        50        60        70        80        90   

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE1 VVWGRWEYGSFFCELWTSVDVLCVTASIETLCVIALDRYLAITSPFRYQSLLTRARARGL
       ..   : .:.:.::.:::.::::::::::::::::.:::.::::::.::::::. .:: .
CCDS42 ILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVI
           100       110       120       130       140       150   

      180       190       200       210       220       230        
pF1KE1 VCTVWAISALVSFLPILMHWWRAESDEARRCYNDPKCCDFVTNRAYAIASSVVSFYVPLC
       .  :: .:.:.::::: :::.::  .::  :: .  :::: ::.:::::::.::::::: 
CCDS42 ILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYANETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLV
           160       170       180       190       200       210   

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE1 IMAFVYLRVFREAQKQVKKIDSCERRFLGGPARPPSPSPSPVPAPAPPPGPPRPAAAAAT
       ::.::: :::.::..:..:::. : ::          . : :                  
CCDS42 IMVFVYSRVFQEAKRQLQKIDKSEGRF-------HVQNLSQVEQ----------------
           220       230       240              250                

      300         310       320       330       340       350      
pF1KE1 APLANGRAGK--RRPSRLVALREQKALKTLGIIMGVFTLCWLPFFLANVVKAFHRELVPD
           .::.:.  :: :..  :.:.:::::::::::.:::::::::..:.:.... .:.  
CCDS42 ----DGRTGHGLRRSSKFC-LKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRK
                  260        270       280       290       300     

        360       370       380       390          400       410   
pF1KE1 RLFVFFNWLGYANSAFNPIIYCRSPDFRKAFQRLLCCAR---RAARRRHATHGDRPRASG
       ......::.::.::.:::.::::::::: :::.:::  :   .:    ....:.  . ::
CCDS42 EVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCLRRSSLKAYGNGYSSNGNTGEQSG
         310       320       330       340       350       360     

           420       430       440       450       460       470   
pF1KE1 CLARPGPPPSPGAASDDDDDDVVGATPPARLLEPWAGCNGGAAADSDSSLDEPCRPGFAS
                                                                   
CCDS42 YHVEQEKENKLLCEDLPGTEDFVGHQGTVPSDNIDSQGRNCSTNDSLL            
         370       380       390       400       410               

>>CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8                 (408 aa)
 initn: 839 init1: 625 opt: 886  Z-score: 527.1  bits: 106.7 E(32554): 4.9e-23
Smith-Waterman score: 1293; 52.4% identity (71.1% similar) in 422 aa overlap (10-424:2-394)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MGAGVLVLGASEPGNLSSAAPLPDGAATAARLLVPASPPASLLPPASESPEPLSQQWTAG
                :  : . :: :: ::  .     :.: .  .: :: .   :      : :.
CCDS60         MAPWPHENSSLAPWPDLPT-----LAPNTANTSGLPGV---P------WEAA
                       10             20        30                 

                70        80        90       100       110         
pF1KE1 M-GLLMALIVLLIVAGNVLVIVAIAKTPRLQTLTNLFIMSLASADLVMGLLVVPFGATIV
       . : :.:: ::  :.::.::::::: ::::::.::.:. :::.::::::::::: .::..
CCDS60 LAGALLALAVLATVGGNLLVIVAIAWTPRLQTMTNVFVTSLAAADLVMGLLVVPPAATLA
       40        50        60        70        80        90        

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE1 VWGRWEYGSFFCELWTSVDVLCVTASIETLCVIALDRYLAITSPFRYQSLLTRARARGLV
       . :.:  :.  ::::::::::::::::::::..:.:::::.:.:.:: .:.:.  ::  :
CCDS60 LTGHWPLGATGCELWTSVDVLCVTASIETLCALAVDRYLAVTNPLRYGALVTKRCARTAV
      100       110       120       130       140       150        

     180       190       200        210       220       230        
pF1KE1 CTVWAISALVSFLPILMHWWRAESD-EARRCYNDPKCCDFVTNRAYAIASSVVSFYVPLC
         ::..:: ::: ::. .:::. .: ::.::...:.:: :..:  :.. :: ::::.:: 
CCDS60 VLVWVVSAAVSFAPIMSQWWRVGADAEAQRCHSNPRCCAFASNMPYVLLSSSVSFYLPLL
      160       170       180       190       200       210        

      240       250       260       270        280       290       
pF1KE1 IMAFVYLRVFREAQKQVKKIDSCERRFLGGPAR-PPSPSPSPVPAPAPPPGPPRPAAAAA
       .: ::: :::  : .:.. . .   ::   : . ::.:: : .:::.   .::. . : .
CCDS60 VMLFVYARVFVVATRQLRLLRGELGRF--PPEESPPAPSRSLAPAPVGTCAPPEGVPACG
      220       230       240         250       260       270      

       300       310       320       330       340       350       
pF1KE1 TAPLANGRAGKRRPSRLVALREQKALKTLGIIMGVFTLCWLPFFLANVVKAFHRE-LVPD
                  :::.::. :::..:: :::.:::.:::::::::::::..:.    ::: 
CCDS60 -----------RRPARLLPLREHRALCTLGLIMGTFTLCWLPFFLANVLRALGGPSLVPG
                   280       290       300       310       320     

        360       370       380       390        400       410     
pF1KE1 RLFVFFNWLGYANSAFNPIIYCRSPDFRKAFQRLLC-CARRAARRRHATHGDRPR--ASG
         :. .::::::::::::.:::::::::.::.:::: :.::   .  :.   ::    ::
CCDS60 PAFLALNWLGYANSAFNPLIYCRSPDFRSAFRRLLCRCGRRLPPEPCAAA--RPALFPSG
         330       340       350       360       370         380   

           420       430       440       450       460       470   
pF1KE1 CLARPGPPPSPGAASDDDDDDVVGATPPARLLEPWAGCNGGAAADSDSSLDEPCRPGFAS
         :  . : .:                                                 
CCDS60 VPAARSSPAQPRLCQRLDGASWGVS                                   
           390       400                                           

>>CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6                (390 aa)
 initn: 588 init1: 352 opt: 690  Z-score: 415.3  bits: 85.9 E(32554): 8.2e-17
Smith-Waterman score: 690; 34.4% identity (62.6% similar) in 390 aa overlap (12-391:3-384)

               10        20         30        40        50         
pF1KE1 MGAGVLVLGASEPGNLSSAAPLPDGAAT-AARLLVPASPPASLLPPASESPEPLSQQWTA
                  :::  . : : : :. : . .  . ..:  .         . .:  : .
CCDS49          MEEPGA-QCAPPPPAGSETWVPQANLSSAPSQNCSAKDYIYQDSISLPWKV
                         10        20        30        40        50

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE1 GMGLLMALIVLLIVAGNVLVIVAIAKTPRLQTLTNLFIMSLASADLVMGLLVVPFGATIV
        . .:.:::.:  . .:..::... .: .:.: .: .: ::: .::....::.:...  .
CCDS49 LLVMLLALITLATTLSNAFVIATVYRTRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYT
               60        70        80        90       100       110

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE1 VWGRWEYGSFFCELWTSVDVLCVTASIETLCVIALDRYLAITSPFRYQSLLTRARARGLV
       : :::  :.  :..: : :. : ::::  ::::::::: :::.  .:..  :  ::  ..
CCDS49 VTGRWTLGQVVCDFWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDAVEYSAKRTPKRAAVMI
              120       130       140       150       160       170

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE1 CTVWAISALVSFLPILMHWWRAESDEARRCYNDPKCCDFVTNRAYAIASSVVSFYVPLCI
         ::..:  .:. :.. .  .:: .:. .:  .    : .    :.. :.: .:: :  .
CCDS49 ALVWVFSISISLPPFFWRQAKAE-EEVSECVVN---TDHIL---YTVYSTVGAFYFPTLL
              180       190        200             210       220   

     240       250         260       270        280        290     
pF1KE1 MAFVYLRVFREAQKQVKKI--DSCERRFLGGPARPPSP-SPSPVPA-PAPPPGPPRPAAA
       .  .: :.. ::.... :   .   .:.  .     :: : : : .  .  :  :  ...
CCDS49 LIALYGRIYVEARSRILKQTPNRTGKRLTRAQLITDSPGSTSSVTSINSRVPDVPSESGS
           230       240       250       260       270       280   

         300         310       320       330       340       350   
pF1KE1 AATAPLANGRAGKR--RPSRLVALREQKALKTLGIIMGVFTLCWLPFFLANVVKAFHREL
        . .  .. :..    . ..:.: ::.:: ::::::.:.: .::::::. ..:  . .. 
CCDS49 PVYVNQVKVRVSDALLEKKKLMAARERKATKTLGIILGAFIVCWLPFFIISLVMPICKDA
           290       300       310       320       330       340   

             360       370       380        390       400       410
pF1KE1 VPDRL--FVFFNWLGYANSAFNPIIYCRS-PDFRKAFQRLLCCARRAARRRHATHGDRPR
          .:  : ::.:::: :: .:::::  :  ::..::..:.                   
CCDS49 CWFHLAIFDFFTWLGYLNSLINPIIYTMSNEDFKQAFHKLIRFKCTS             
           350       360       370       380       390             

              420       430       440       450       460       470
pF1KE1 ASGCLARPGPPPSPGAASDDDDDDVVGATPPARLLEPWAGCNGGAAADSDSSLDEPCRPG

>>CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1                 (377 aa)
 initn: 528 init1: 313 opt: 644  Z-score: 389.2  bits: 81.1 E(32554): 2.3e-15
Smith-Waterman score: 644; 34.6% identity (66.0% similar) in 356 aa overlap (47-391:26-371)

         20        30        40        50         60        70     
pF1KE1 SSAAPLPDGAATAARLLVPASPPASLLPPASESPEPLS-QQWTAGMGLLMALIVLLIVAG
                                     ::. .: . :    ........:.:  : .
CCDS23      MSPLNQSAEGLPQEASNRSLNATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVITLATVLS
                    10        20        30        40        50     

          80        90       100       110       120       130     
pF1KE1 NVLVIVAIAKTPRLQTLTNLFIMSLASADLVMGLLVVPFGATIVVWGRWEYGSFFCELWT
       :..:...:  : .:.: .: .: :::..::....::.:.. . ..   :..:...:..: 
CCDS23 NAFVLTTILLTRKLHTPANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHTWNFGQILCDIWL
          60        70        80        90       100       110     

         140       150       160       170       180       190     
pF1KE1 SVDVLCVTASIETLCVIALDRYLAITSPFRYQSLLTRARARGLVCTVWAISALVSFLPIL
       : :. : ::::  ::::::::: :::. ..:..  : ..:  ..  :::::  .:. :..
CCDS23 SSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAISICISIPPLF
         120       130       140       150       160       170     

         200       210       220       230       240       250     
pF1KE1 MHWWRAESDEARRCYNDPKCCDFVTNRAYAIASSVVSFYVPLCIMAFVYLRVFREAQKQV
         : .:...:    ..:  :   ... .:.: :.  .::.:  .. ..: :..: :....
CCDS23 --WRQAKAQEE---MSD--CLVNTSQISYTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIYRAARNRI
           180            190       200       210       220        

         260        270       280        290            300        
pF1KE1 KKIDSCE-RRFLGGPARPPSPSPSPVPAPAP-PPGPPRPAAAA-----ATAPLANGRAGK
        .  :   .::  .     : . :     .    :  . :..      .   ::.. : .
CCDS23 LNPPSLYGKRFTTAHLITGSAGSSLCSLNSSLHEGHSHSAGSPLFFNHVKIKLADS-ALE
      230       240       250       260       270       280        

      310       320       330       340       350         360      
pF1KE1 RRPSRLVALREQKALKTLGIIMGVFTLCWLPFFLANVVKAFHRE--LVPDRLFVFFNWLG
       :.  :. : ::.:: : ::::.:.: .::::::....:  . :.   .   :: ::.:::
CCDS23 RK--RISAARERKATKILGIILGAFIICWLPFFVVSLVLPICRDSCWIHPALFDFFTWLG
         290       300       310       320       330       340     

        370        380       390       400       410       420     
pF1KE1 YANSAFNPIIYCR-SPDFRKAFQRLLCCARRAARRRHATHGDRPRASGCLARPGPPPSPG
       : :: .:::::   . .::.:::...                                  
CCDS23 YLNSLINPIIYTVFNEEFRQAFQKIVPFRKAS                            
         350       360       370                                   

>>CCDS5006.1 HTR1E gene_id:3354|Hs108|chr6                (365 aa)
 initn: 576 init1: 343 opt: 634  Z-score: 383.6  bits: 80.0 E(32554): 4.8e-15
Smith-Waterman score: 634; 34.3% identity (61.8% similar) in 353 aa overlap (58-393:20-361)

        30        40        50        60        70          80     
pF1KE1 TAARLLVPASPPASLLPPASESPEPLSQQWTAGMGLLMALIVL--LIVAGNVLVIVAIAK
                                     :  : . :.:.:.  : .  :. ::.::. 
CCDS50            MNITNCTTEASMAIRPKTITEKMLICMTLVVITTLTTLLNLAVIMAIGT
                          10        20        30        40         

          90       100       110       120       130       140     
pF1KE1 TPRLQTLTNLFIMSLASADLVMGLLVVPFGATIVVWGRWEYGSFFCELWTSVDVLCVTAS
       : .:.  .: .: ::: .::....::.:..   .:  ::. : :.::.: :::. : : :
CCDS50 TKKLHQPANYLICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFLCEVWLSVDMTCCTCS
      50        60        70        80        90       100         

         150       160       170       180       190       200     
pF1KE1 IETLCVIALDRYLAITSPFRYQSLLTRARARGLVCTVWAISALVSFLPILMHWWRAESDE
       :  ::::::::: :::. ..:    :  ::  .. :::.:: ..:. :..   ::..   
CCDS50 ILHLCVIALDRYWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPPLF---WRSH---
     110       120       130       140       150          160      

         210       220        230       240       250       260    
pF1KE1 ARRCYNDPKCCDFVTNRA-YAIASSVVSFYVPLCIMAFVYLRVFREAQKQVKKIDSCERR
        ::    :. : .  ... :.: :.. .::.:: .. ..: :... :..  .:  :   :
CCDS50 -RRLSPPPSQCTIQHDHVIYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAKSLYQKRGSS--R
            170       180       190       200       210         220

          270                  280       290       300         310 
pF1KE1 FLGGPARPPSPS-----------PSPVPAPAPPPGPPRPAAAAATAPLANG--RAGKRRP
        :.. .   . :            :   .  :     .  :.    :. :   . :.:. 
CCDS50 HLSNRSTDSQNSFASCKLTQTFCVSDFSTSDPTTEFEKFHASIRIPPFDNDLDHPGERQ-
              230       240       250       260       270          

             320       330       340       350       360       370 
pF1KE1 SRLVALREQKALKTLGIIMGVFTLCWLPFFLANVVKAFHRELVPDRLFVFFNWLGYANSA
        .. . ::.:: . ::.:.:.: : :::::. ... ..    : ...  :..::::.:: 
CCDS50 -QISSTRERKAARILGLILGAFILSWLPFFIKELIVGLSIYTVSSEVADFLTWLGYVNSL
      280       290       300       310       320       330        

              380       390       400       410       420       430
pF1KE1 FNPIIYCR-SPDFRKAFQRLLCCARRAARRRHATHGDRPRASGCLARPGPPPSPGAASDD
       .::..:   . ::. ::..:. :                                     
CCDS50 INPLLYTSFNEDFKLAFKKLIRCREHT                                 
      340       350       360                                      

>>CCDS33829.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3                (367 aa)
 initn: 476 init1: 160 opt: 604  Z-score: 366.5  bits: 76.8 E(32554): 4.3e-14
Smith-Waterman score: 604; 33.8% identity (62.8% similar) in 349 aa overlap (59-393:30-367)

       30        40        50        60        70        80        
pF1KE1 AARLLVPASPPASLLPPASESPEPLSQQWTAGMGLLMALIVLLIVAGNVLVIVAIAKTPR
                                     : ..: .  ..: :: :: :: .:. :   
CCDS33  MASLSQLSGHLNYTCGAENSTGASQARPHAYYALSYCALILAIVFGNGLVCMAVLKERA
                10        20        30        40        50         

       90       100       110        120       130       140       
pF1KE1 LQTLTNLFIMSLASADLVMGLLVVPFGATI-VVWGRWEYGSFFCELWTSVDVLCVTASIE
       ::: :: ...::: :::... ::.:. . . :. : :... . :......::.  :::: 
CCDS33 LQTTTNYLVVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVTGGVWNFSRICCDVFVTLDVMMCTASIL
      60        70        80        90       100       110         

       150       160       170          180       190       200    
pF1KE1 TLCVIALDRYLAITSPFRYQSLLTRARARG---LVCTVWAISALVSFLPILMHWWRAESD
       .::.:..::: :.. : .::    ..  :    .. .::...  ::  :.:. .      
CCDS33 NLCAISIDRYTAVVMPVHYQHGTGQSSCRRVALMITAVWVLAFAVSC-PLLFGF------
     120       130       140       150       160        170        

          210       220       230       240       250       260    
pF1KE1 EARRCYNDPKCCDFVTNRAYAIASSVVSFYVPLCIMAFVYLRVFREAQKQVKKIDSCERR
             .::  :. ..:  ..: :::::::.:. . ..:: :..   ... .:    .. 
CCDS33 ---NTTGDPTVCS-ISNPDFVIYSSVVSFYLPFGVTVLVYARIYVVLKQRRRKRILTRQN
               180        190       200       210       220        

          270       280       290          300        310          
pF1KE1 FLGGPARPPSPSPSPVPAPAPPPGPPRPAAAAATA---PLANGRAGK-RRPSR----LVA
          . .::  :. .  : ::        .    ::   :  . :.:. .:  .    :. 
CCDS33 SQCNSVRPGFPQQTLSPDPAHLELKRYYSICQDTALGGPGFQERGGELKREEKTRNSLMP
      230       240       250       260       270       280        

        320       330       340       350        360       370     
pF1KE1 LREQKALKTLGIIMGVFTLCWLPFFLANVVKAFHREL-VPDRLFVFFNWLGYANSAFNPI
       :::.:: . ..:..:.: .:::::::..:...  .   :  .:.   .::::.:::.::.
CCDS33 LREKKATQMVAIVLGAFIVCWLPFFLTHVLNTHCQTCHVSPELYSATTWLGYVNSALNPV
      290       300       310       320       330       340        

          380       390       400       410       420       430    
pF1KE1 IYCR-SPDFRKAFQRLLCCARRAARRRHATHGDRPRASGCLARPGPPPSPGAASDDDDDD
       ::   . .::::: ..: :                                         
CCDS33 IYTTFNIEFRKAFLKILSC                                         
      350       360                                                

>>CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3                (366 aa)
 initn: 589 init1: 289 opt: 571  Z-score: 347.6  bits: 73.3 E(32554): 4.8e-13
Smith-Waterman score: 571; 32.4% identity (61.9% similar) in 352 aa overlap (61-393:26-364)

               40        50        60        70        80        90
pF1KE1 RLLVPASPPASLLPPASESPEPLSQQWTAGMGLLMALIVLLIVAGNVLVIVAIAKTPRLQ
                                     ..: .. ..:. .. : :::.::  : .:.
CCDS29      MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPSKILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTRKLH
                    10        20        30        40        50     

              100       110       120       130       140       150
pF1KE1 TLTNLFIMSLASADLVMGLLVVPFGATIVVWGRWEYGSFFCELWTSVDVLCVTASIETLC
         .: .: ::: .:.....::.::. . .:   : .:.  :..: :::. : : ::  : 
CCDS29 HPANYLICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSILHLS
          60        70        80        90       100       110     

              160       170       180       190       200       210
pF1KE1 VIALDRYLAITSPFRYQSLLTRARARGLVCTVWAISALVSFLPILMHWWRAESDEARRCY
       .:::::: :::.  .:    :  .:  ..  :: ::...:. :..   :: ..  .:   
CCDS29 AIALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLF---WRHQGT-SR---
         120       130       140       150       160               

                 220       230       240       250            260  
pF1KE1 NDPKCC---DFVTNRAYAIASSVVSFYVPLCIMAFVYLRVFREAQ-----KQVKKIDSCE
        : .:    : ...  :   :.  .::.:: .. ..: ...: :.     .:...: . :
CCDS29 -DDECIIKHDHIVSTIY---STFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHKRQASRIAKEE
       170       180          190       200       210       220    

                270       280            290       300       310   
pF1KE1 ---RRFL-GGPARPPSPSPSPV-----PAPAPPPGPPRPAAAAATAPLANGRAGKRRPSR
          . .: .:     : : : :       :.      . .. .  . . . .. .:.  .
CCDS29 VNGQVLLESGEKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVRSLRSEFKHEKSWRRQ--K
          230       240       250       260       270       280    

           320       330       340        350       360       370  
pF1KE1 LVALREQKALKTLGIIMGVFTLCWLPFFLAN-VVKAFHRELVPDRLFVFFNWLGYANSAF
       . . ::.::  :::.:.:.:..::::::. . ::..  .  . ...  :. :::: :: .
CCDS29 ISGTRERKAATTLGLILGAFVICWLPFFVKELVVNVCDKCKISEEMSNFLAWLGYLNSLI
            290       300       310       320       330       340  

             380       390       400       410       420       430 
pF1KE1 NPIIYC-RSPDFRKAFQRLLCCARRAARRRHATHGDRPRASGCLARPGPPPSPGAASDDD
       ::.::   . ::.::::.:. :                                      
CCDS29 NPLIYTIFNEDFKKAFQKLVRCRC                                    
            350       360                                          

>>CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5                 (446 aa)
 initn: 781 init1: 269 opt: 570  Z-score: 346.1  bits: 73.3 E(32554): 5.9e-13
Smith-Waterman score: 777; 38.6% identity (64.1% similar) in 345 aa overlap (64-395:29-349)

            40        50        60        70        80        90   
pF1KE1 VPASPPASLLPPASESPEPLSQQWTAGMGLLMALIVLLIVAGNVLVIVAIAKTPRLQT-L
                                     ...:..:  . ::.:: .:. .  .:.. .
CCDS43   MRTLNTSAMDGTGLVVERDFSVRILTACFLSLLILSTLLGNTLVCAAVIRFRHLRSKV
                 10        20        30        40        50        

            100       110       120       130       140       150  
pF1KE1 TNLFIMSLASADLVMGLLVVPFGATIVVWGRWEYGSFFCELWTSVDVLCVTASIETLCVI
       ::.:..::: .::....::.:. :.  . : : .::: :..:.. :..: :::: .::::
CCDS43 TNFFVISLAVSDLLVAVLVMPWKAVAEIAGFWPFGSF-CNIWVAFDIMCSTASILNLCVI
       60        70        80        90        100       110       

            160       170       180       190       200            
pF1KE1 ALDRYLAITSPFRYQSLLTRARARGLVCTVWAISALVSFLPILMHWWRAE----SD-EAR
       ..::: ::.:::::.  .:   :  :. ..:..:.:.::.:. . : .:.    :: .: 
CCDS43 SVDRYWAISSPFRYERKMTPKAAFILISVAWTLSVLISFIPVQLSWHKAKPTSPSDGNAT
       120       130       140       150       160       170       

       210       220       230       240       250       260       
pF1KE1 RCYNDPKCCDFVTNRAYAIASSVVSFYVPLCIMAFVYLRVFREAQKQVKKIDSCERRFLG
          .    ::   .:.:::.:::.:::.:. ::  .: :..: ::::...: . ::  . 
CCDS43 SLAETIDNCDSSLSRTYAISSSVISFYIPVAIMIVTYTRIYRIAQKQIRRIAALERAAVH
       180       190       200       210       220       230       

       270        280       290       300       310       320      
pF1KE1 GPA-RPPSPSPSPVPAPAPPPGPPRPAAAAATAPLANGRAGKRRPSRLVALREQKALKTL
       .   .  . . .::    :  .                        ..   :: :.::::
CCDS43 AKNCQTTTGNGKPVECSQPESS-----------------------FKMSFKRETKVLKTL
       240       250                              260       270    

        330       340         350           360       370       380
pF1KE1 GIIMGVFTLCWLPFFLANVVKAF--HRELVP----DRLFVFFNWLGYANSAFNPIIYCRS
       ..:::::. ::::::. : .  :    :  :    .  :  : :.:.:::..:::::  .
CCDS43 SVIMGVFVCCWLPFFILNCILPFCGSGETQPFCIDSNTFDVFVWFGWANSSLNPIIYAFN
          280       290       300       310       320       330    

              390       400       410       420       430       440
pF1KE1 PDFRKAFQRLLCCARRAARRRHATHGDRPRASGCLARPGPPPSPGAASDDDDDDVVGATP
        ::::::. :: : :                                             
CCDS43 ADFRKAFSTLLGCYRLCPATNNAIETVSINNNGAAMFSSHHEPRGSISKECNLVYLIPHA
          340       350       360       370       380       390    

>>CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20              (572 aa)
 initn: 730 init1: 429 opt: 524  Z-score: 318.5  bits: 68.6 E(32554): 2e-11
Smith-Waterman score: 788; 34.9% identity (61.5% similar) in 455 aa overlap (2-441:53-475)

                                            10        20        30 
pF1KE1                              MGAGVLVLGASEPGNLSSAAPLPDGAATAAR
                                     :.::.  :..: .  :.. :   :.: :. 
CCDS13 SSAGGGGGSAGGAAPSEGPAVGGVPGGAGGGGGVVGAGSGEDNRSSAGEP---GSAGAGG
             30        40        50        60        70            

              40        50        60        70        80        90 
pF1KE1 LLVPASPPASLLPPASESPEPLSQQWTAGMGLLMALIVLLIVAGNVLVIVAIAKTPRLQT
        .  ..  ..:.         .: :  .:.:...: ..:. ::::.:::...: . .:::
CCDS13 DVNGTAAVGGLV---------VSAQ-GVGVGVFLAAFILMAVAGNLLVILSVACNRHLQT
      80        90                 100       110       120         

             100       110       120       130       140       150 
pF1KE1 LTNLFIMSLASADLVMGLLVVPFGATIVVWGRWEYGSFFCELWTSVDVLCVTASIETLCV
       .:: ::..:: :::...  :.::.::. : : : .:  ::..:..::::: :::: .::.
CCDS13 VTNYFIVNLAVADLLLSATVLPFSATMEVLGFWAFGRAFCDVWAAVDVLCCTASILSLCT
     130       140       150       160       170       180         

             160       170       180       190       200       210 
pF1KE1 IALDRYLAITSPFRYQSLLTRARARGLVCTVWAISALVSFLPILMHWWRAESDEARRCYN
       :..:::...   ..: ...:. .: ...  .:... .::  :.:   :.           
CCDS13 ISVDRYVGVRHSLKYPAIMTERKAAAILALLWVVALVVSVGPLLG--WKEPVPP------
     190       200       210       220       230         240       

             220       230       240       250       260       270 
pF1KE1 DPKCCDFVTNRAYAIASSVVSFYVPLCIMAFVYLRVFREAQKQVKKIDSCERRFLGGPAR
       : . : .. . .::. ::: :::.:. ... .: ::.  :.. ......  .:  :    
CCDS13 DERFCGITEEAGYAVFSSVCSFYLPMAVIVVMYCRVYVVARSTTRSLEAGVKRERG----
             250       260       270       280       290           

             280       290       300       310         320         
pF1KE1 PPSPSPSPVPAPAPPPGPPRPAAAAATAPLANGRAGKRRPS-RLVAL-REQKALKTLGII
           . : :       :    : .:     :.:.. .   : ::. . ::.:: :::.:.
CCDS13 ----KASEVVLRIHCRGAATGADGAHGMRSAKGHTFRSSLSVRLLKFSREKKAAKTLAIV
           300       310       320       330       340       350   

     330       340       350        360       370        380       
pF1KE1 MGVFTLCWLPFFLANVVKAFHRELVPDR-LFVFFNWLGYANSAFNPIIY-CRSPDFRKAF
       .:::.:::.:::..  . ..  .: :.. .:  . :::: ::  ::.:: : : .:..::
CCDS13 VGVFVLCWFPFFFVLPLGSLFPQLKPSEGVFKVIFWLGYFNSCVNPLIYPCSSREFKRAF
           360       370       380       390       400       410   

       390         400          410             420       430      
pF1KE1 QRLL-C-CARRAARR---RHATHGDRPRASG----CLARPG--PPPSPGAASDDDDDDVV
        ::: : : ::  ::   :   :  :  .::    :    :  :: .: : .   : :  
CCDS13 LRLLRCQCRRRRRRRPLWRVYGHHWRASTSGLRQDCAPSSGDAPPGAPLALTALPDPD--
           420       430       440       450       460       470   

        440       450       460       470                          
pF1KE1 GATPPARLLEPWAGCNGGAAADSDSSLDEPCRPGFASESKV                   
          ::                                                       
CCDS13 -PEPPGTPEMQAPVASRRKPPSAFREWRLLGPFRRPTTQLRAKVSSLSHKIRAGGAQRAE
              480       490       500       510       520       530




477 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sun Nov  6 07:58:35 2016 done: Sun Nov  6 07:58:36 2016
 Total Scan time:  3.610 Total Display time:  0.050

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com