FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2132, 863 aa 1>>>pF1KE2132 863 - 863 aa - 863 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7455+/-0.000463; mu= 10.3136+/- 0.029 mean_var=160.3402+/-32.700, 0's: 0 Z-trim(114.5): 26 B-trim: 0 in 0/54 Lambda= 0.101287 statistics sampled from 24405 (24431) to 24405 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.631), E-opt: 0.2 (0.286), width: 16 Scan time: 10.990 The best scores are: opt bits E(85289) NP_877423 (OMIM: 602638,609981) DNA replication li ( 863) 5601 831.4 0 NP_005905 (OMIM: 602638,609981) DNA replication li ( 863) 5601 831.4 0 XP_006724305 (OMIM: 602696) PREDICTED: DNA replica ( 732) 1087 171.8 1.1e-41 NP_006730 (OMIM: 602696) DNA replication licensing ( 734) 1087 171.8 1.1e-41 XP_016867706 (OMIM: 600592) PREDICTED: DNA replica ( 612) 1040 164.8 1.1e-39 XP_005250405 (OMIM: 600592) PREDICTED: DNA replica ( 612) 1040 164.8 1.1e-39 NP_005907 (OMIM: 600592) DNA replication licensing ( 719) 1040 164.9 1.2e-39 NP_877577 (OMIM: 600592) DNA replication licensing ( 543) 967 154.1 1.6e-36 NP_001265524 (OMIM: 600592) DNA replication licens ( 543) 967 154.1 1.6e-36 XP_016883595 (OMIM: 608187,612885) PREDICTED: DNA ( 776) 873 140.5 2.9e-32 NP_001268449 (OMIM: 608187,612885) DNA helicase MC ( 840) 873 140.5 3e-32 NP_115874 (OMIM: 608187,612885) DNA helicase MCM8 ( 840) 873 140.5 3e-32 NP_005906 (OMIM: 223100,601806) DNA replication li ( 821) 843 136.2 6.2e-31 XP_016883596 (OMIM: 608187,612885) PREDICTED: DNA ( 557) 768 125.1 9.2e-28 XP_011527689 (OMIM: 608187,612885) PREDICTED: DNA ( 581) 761 124.1 1.9e-27 NP_001257401 (OMIM: 602693) DNA replication licens ( 818) 756 123.4 4.2e-27 NP_002379 (OMIM: 602693) DNA replication licensing ( 853) 756 123.5 4.3e-27 NP_060166 (OMIM: 610098,616185) DNA helicase MCM9 (1143) 755 123.4 6e-27 NP_004517 (OMIM: 116945,616968) DNA replication li ( 904) 752 122.9 6.8e-27 NP_877954 (OMIM: 608187,612885) DNA helicase MCM8 ( 824) 727 119.2 7.9e-26 NP_001268450 (OMIM: 608187,612885) DNA helicase MC ( 880) 609 102.0 1.3e-20 XP_016883594 (OMIM: 608187,612885) PREDICTED: DNA ( 880) 609 102.0 1.3e-20 NP_001268451 (OMIM: 608187,612885) DNA helicase MC ( 793) 478 82.8 6.9e-15 NP_694987 (OMIM: 610098,616185) DNA helicase MCM9 ( 391) 333 61.4 9.5e-09 >>NP_877423 (OMIM: 602638,609981) DNA replication licens (863 aa) initn: 5601 init1: 5601 opt: 5601 Z-score: 4433.5 bits: 831.4 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 5601; 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