FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2132, 863 aa 1>>>pF1KE2132 863 - 863 aa - 863 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9165+/-0.00114; mu= 9.0427+/- 0.069 mean_var=140.6135+/-28.617, 0's: 0 Z-trim(106.9): 27 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.108159 statistics sampled from 9213 (9228) to 9213 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.632), E-opt: 0.2 (0.283), width: 16 Scan time: 3.390 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS6143.1 MCM4 gene_id:4173|Hs108|chr8 ( 863) 5601 886.4 0 CCDS13915.1 MCM5 gene_id:4174|Hs108|chr22 ( 734) 1087 182.0 3.4e-45 CCDS5683.1 MCM7 gene_id:4176|Hs108|chr7 ( 719) 1040 174.6 5.4e-43 CCDS5684.1 MCM7 gene_id:4176|Hs108|chr7 ( 543) 967 163.2 1.1e-39 CCDS13094.1 MCM8 gene_id:84515|Hs108|chr20 ( 840) 873 148.6 4.3e-35 CCDS2179.1 MCM6 gene_id:4175|Hs108|chr2 ( 821) 843 143.9 1.1e-33 CCDS75468.1 MCM3 gene_id:4172|Hs108|chr6 ( 818) 756 130.4 1.3e-29 CCDS4940.2 MCM3 gene_id:4172|Hs108|chr6 ( 853) 756 130.4 1.4e-29 CCDS56447.1 MCM9 gene_id:254394|Hs108|chr6 (1143) 755 130.3 2e-29 CCDS3043.1 MCM2 gene_id:4171|Hs108|chr3 ( 904) 752 129.7 2.2e-29 CCDS13095.1 MCM8 gene_id:84515|Hs108|chr20 ( 824) 727 125.8 3.1e-28 CCDS63227.1 MCM8 gene_id:84515|Hs108|chr20 ( 880) 609 107.4 1.1e-22 CCDS63226.1 MCM8 gene_id:84515|Hs108|chr20 ( 793) 478 87.0 1.5e-16 >>CCDS6143.1 MCM4 gene_id:4173|Hs108|chr8 (863 aa) initn: 5601 init1: 5601 opt: 5601 Z-score: 4730.4 bits: 886.4 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5601; 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CCDS13 FTFKYRDELKRHYNLGEYWIEVEMEDLASFDEDLADYLYKQPAEHLQLLEEAAKEVADEV 60 70 80 90 100 110 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 FFDRYPDSILEHQIQVRPFNALKTKNMRNLNPEDIDQLITISGMVIRTSQLIPEMQEAFF : . ..::: . . ...:.:. . ...:. : :..: .: . . . . CCDS13 TRPRPSGEEVLQDIQVMLKSDASPSSIRSLKSDMMSHLVKIPGIIIAASAVRAKATRISI 120 130 140 150 160 170 310 320 330 340 350 pF1KE2 QCQVCAHT-TRVEMDRGR--IAEPSVC-----GR--CHTTHSMALIHNRSLFSDKQMIKL ::. : .: : . : : : : : :: : . .. .. : : .:: CCDS13 QCRSCRNTLTNIAMRPGLEGYALPRKCNTDQAGRPKC-PLDPYFIMPDKCKCVDFQTLKL 180 190 200 210 220 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 QESPEDMPAGQTPHTVILFAHNDLVDKVQPGDRVNVTGIYRAVPIRVNPRVSNVKSVYKT :: :. .: :. :. . :. : ::: ::.::.. ::: . ... .. .. CCDS13 QELPDAVPHGEMPRHMQLYCDRYLCDKVVPGNRVTIMGIYSIKKF----GLTTSRGRDRV 230 240 250 260 270 280 420 430 440 450 460 pF1KE2 HIDVIHYRKTDAKRLHGL--DEEAEQKLF----SEKRVELLKELSRKPDIYERLASALAP . . ... :. :. : .. . : : .. : ...:. :..:: .....:: CCDS13 GVGI----RSSYIRVLGIQVDTDGSGRSFAGAVSPQEEEEFRRLAALPNVYEVISKSIAP 290 300 310 320 330 340 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 SIYEHEDIKKGILLQLFGGTRKDFSHTGRGKFRAEINILLCGDPGTSKSQLLQYVYNLVP ::. :.::.: ::::.:: . : . :..::.:. :::::.:::::..: . : CCDS13 SIFGGTDMKKAIACLLFGGSRKRLPD-GLTR-RGDINLLMLGDPGTAKSQLLKFVEKCSP 350 360 370 380 390 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 RGQYTSGKGSSAVGLTAYVMKDPETRQLVLQTGALVLSDNGICCIDEFDKMNESTRSVLH : :::::::::.:::: ::.:: .:..... ::.::.:.:. :::::::: :. : ..: CCDS13 IGVYTSGKGSSAAGLTASVMRDPSSRNFIMEGGAMVLADGGVVCIDEFDKMREDDRVAIH 400 410 420 430 440 450 590 600 610 620 630 640 pF1KE2 EVMEQQTLSIAKAGIICQLNARTSVLAAANPIESQWNPKKTTIENIQLPHTLLSRFDLIF :.:::::.::::::: ::.: ::::::: . ..:. : .::.. :.:::::.:: CCDS13 EAMEQQTISIAKAGITTTLNSRCSVLAAANSVFGRWDETKGE-DNIDFMPTILSRFDMIF 460 470 480 490 500 510 650 660 670 680 690 700 pF1KE2 LMLDPQDEAYDRRLAHHLVALYYQ--SEEQAEEELLDMAVLKDYIAYAHSTIMPRLSEEA .. : ..: : ::.:...:. . .. :: : .:.: :: .::: . :::: :: CCDS13 IVKDEHNEERDVMLAKHVITLHVSALTQTQAVEGEIDLAKLKKFIAYCRVKCGPRLSAEA 520 530 540 550 560 570 710 720 730 740 750 pF1KE2 SQALIEAYVDMR-------KIGSSRGMVSAYPRQLESLIRLAEAHAKVRLSNKVEAIDVE .. : . :. :: . .. :. . ::::...:.::: .:..:. . ::: CCDS13 AEKLKNRYIIMRSGARQHERDSDRRSSIPITVRQLEAIVRIAEALSKMKLQPFATEADVE 580 590 600 610 620 630 760 770 780 790 800 810 pF1KE2 EAKRLHREALKQSATDPRTGIVDISILTTGMSA-TSRKRKEELAEALKKLILSKGKTPAL :: :: . . ..: .: .:. . ::.. .: :.. :.: CCDS13 EALRLFQVSTLDAA---------LSGTLSGVEGFTSQEDQEMLSRIEKQLKRRFAIGSQV 640 650 660 670 680 820 830 840 850 860 pF1KE2 KYQQLFEDIRGQSDIAITKDMFEEALRALADDDFLTVTGKTVRLL CCDS13 SEHSIIKDFTKQKYPEHAIHKVLQLMLRRGEIQHRMQRKVLYRLK 690 700 710 720 730 >>CCDS5683.1 MCM7 gene_id:4176|Hs108|chr7 (719 aa) initn: 908 init1: 696 opt: 1040 Z-score: 885.3 bits: 174.6 E(32554): 5.4e-43 Smith-Waterman score: 1175; 34.2% identity (64.7% similar) in 720 aa overlap (158-826:5-700) 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 DLQSDGAAAEDIVASEQSLGQKLVIWGTDVNVAACKENFQRFLQRFI--DPLAKEEENVG . : ::. ..:::.: : :.:.. . : CCDS56 MALKDYALEKEKVKKFLQEFYQDDELGKKQFKYG 10 20 30 190 200 210 220 230 pF1KE2 IDITEPLYMQRLG---EINVIGE--PFL-NVNCEHIKSFDKNLYRQLISYPQEVIPTFDM .... . .... ... ..: : : . ::. . . : :. . . ::..: . CCDS56 NQLVRLAHREQVALYVDLDDVAEDDPELVDSICENARRYAK-LFADAV---QELLPQYKE 40 50 60 70 80 90 240 250 260 270 pF1KE2 --AVNEIFFDRY-------------PDSILEHQIQ-----VRPF-------NALKTKNMR .::. .: : : . : : .: : .. : . .: CCDS56 REVVNKDVLDVYIEHRLMMEQRSRDPGMVRSPQNQYPAELMRRFELYFQGPSSNKPRVIR 100 110 120 130 140 150 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 NLNPEDIDQLITISGMVIRTSQLIPEMQEAFFQCQVCAHTTRVEMDRGRIAEPSVCG--R .. ... .:.:. :.: :.:.. :.: : . :. :. : .. . .: . CCDS56 EVRADSVGKLVTVRGIVTRVSEVKPKMVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMCPSQE 160 170 180 190 200 210 340 350 360 370 380 pF1KE2 CHTTHS---MALIHNRSLFSDKQMIKLQESPEDMPAGQTPHTVILFAHNDLVDKVQPGDR :.:..: . : : : : .:.:: ...:.:. :... ...... . .::::. CCDS56 CQTNRSGGRLYLQTRGSRFIKFQEMKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQPGDH 220 230 240 250 260 270 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 VNVTGIYRAVPIRVNPRVSNVKSVYKTHID-VIHYRKTDAKRLHGLDE-EAEQKLFSEKR :.::::. .:: ... .. .. .. .:.:. ... : ... .: CCDS56 VSVTGIF--LPI--------LRTGFRQVVQGLLSETYLEAHRIVKMNKSEDDESGAGELT 280 290 300 310 320 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 VELLKELSRKPDIYERLASALAPSIYEHEDIKKGILLQLFGGTRKDFSHTGRGKFRAEIN : :...... :.::.::...:: :: :::.::..:: : ::. : : : :.:..:: CCDS56 REELRQIAEE-DFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGV--DQSPRGM-KIRGNIN 330 340 350 360 370 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 ILLCGDPGTSKSQLLQYVYNLVPRGQYTSGKGSSAVGLTAYVMKDPETRQLVLQTGALVL : : ::::..:::::.:. :.::.:::.:.:::.::::: :..: . .:.:. ::::: CCDS56 ICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVSGELTLEGGALVL 380 390 400 410 420 430 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 SDNGICCIDEFDKMNESTRSVLHEVMEQQTLSIAKAGIICQLNARTSVLAAANPIESQWN .:.:.::::::::: :. :...::::::::.:::::::. :::: :.:::::: ...: CCDS56 ADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYN 440 450 460 470 480 490 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 PKKTTIENIQLPHTLLSRFDLIFLMLDPQDEAYDRRLAHHLVALYYQSEEQAEE-ELLDM :... .::::: .:::::::..:. : :. : :::.:.. .. .:.. . : ::: CCDS56 PRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPSQFEPLDM 500 510 520 530 540 550 690 700 710 720 730 740 pF1KE2 AVLKDYIAYAHSTIMPRLSEEASQALIEAYVDMRKIG-SSRGMVSAYPRQLESLIRLAEA ... :::. . .: . : .. . :::.::. . .:. . . : : ...::. : CCDS56 KLMRRYIAMCREK-QPMVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATYTSARTLLAILRLSTA 560 570 580 590 600 610 750 760 770 780 790 pF1KE2 HAKVRLSNKVEAIDVEEAKRLH---REAL----KQSATDPRTGIVDISILTTGMSATSRK :..:. . :: ::.:: :: ...: :.: : . :. :..: .: CCDS56 LARLRMVDVVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPA--DV-IFATVRELVSGG 620 630 640 650 660 670 800 810 820 830 840 850 pF1KE2 RKEELAEALKKLILSKGKTPALKYQQLFEDIRGQSDIAITKDMFEEALRALADDDFLTVT :. ...:: .. . :.: ::: ..: ... CCDS56 RSVRFSEAEQRCV-SRGFTPA-QFQAALDEYEELNVWQVNASRTRITFV 680 690 700 710 >>CCDS5684.1 MCM7 gene_id:4176|Hs108|chr7 (543 aa) initn: 934 init1: 696 opt: 967 Z-score: 825.6 bits: 163.2 E(32554): 1.1e-39 Smith-Waterman score: 1079; 37.8% identity (68.6% similar) in 545 aa overlap (299-826:1-524) 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 KNMRNLNPEDIDQLITISGMVIRTSQLIPEMQEAFFQCQVCAHTTRVEMDRGRIAEPSVC : : . :. :. : .. . .: CCDS56 MVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMC 10 20 30 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 G--RCHTTHS---MALIHNRSLFSDKQMIKLQESPEDMPAGQTPHTVILFAHNDLVDKVQ .:.:..: . : : : : .:.:: ...:.:. :... ...... . .: CCDS56 PSQECQTNRSGGRLYLQTRGSRFIKFQEMKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQ 40 50 60 70 80 90 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 PGDRVNVTGIYRAVPIRVNPRVSNVKSVYKTHID-VIHYRKTDAKRLHGLDE-EAEQKLF :::.:.::::. .:: ... .. .. .. .:.:. ... : ... CCDS56 PGDHVSVTGIF--LPI--------LRTGFRQVVQGLLSETYLEAHRIVKMNKSEDDESGA 100 110 120 130 140 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 SEKRVELLKELSRKPDIYERLASALAPSIYEHEDIKKGILLQLFGGTRKDFSHTGRG-KF .: : :...... :.::.::...:: :: :::.::..:: : ::. ... :: :. CCDS56 GELTREELRQIAEE-DFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGV----DQSPRGMKI 150 160 170 180 190 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 RAEINILLCGDPGTSKSQLLQYVYNLVPRGQYTSGKGSSAVGLTAYVMKDPETRQLVLQT :..::: : ::::..:::::.:. :.::.:::.:.:::.::::: :..: . .:.:. CCDS56 RGNINICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVSGELTLEG 200 210 220 230 240 250 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 GALVLSDNGICCIDEFDKMNESTRSVLHEVMEQQTLSIAKAGIICQLNARTSVLAAANPI :::::.:.:.::::::::: :. :...::::::::.:::::::. :::: :.:::::: CCDS56 GALVLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPA 260 270 280 290 300 310 630 640 650 660 670 pF1KE2 ESQWNPKKTTIENIQLPHTLLSRFDLIFLMLDPQDEAYDRRLAHHLVALYYQSEEQAEE- ...::... .::::: .:::::::..:. : :. : :::.:.. .. .:.. . CCDS56 YGRYNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPSQF 320 330 340 350 360 370 680 690 700 710 720 730 pF1KE2 ELLDMAVLKDYIAYAHSTIMPRLSEEASQALIEAYVDMRKIG-SSRGMVSAYPRQLESLI : ::: ... :::. . .: . : .. . :::.::. . .:. . . : : ... CCDS56 EPLDMKLMRRYIAMCREK-QPMVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATYTSARTLLAIL 380 390 400 410 420 430 740 750 760 770 780 790 pF1KE2 RLAEAHAKVRLSNKVEAIDVEEAKRLH---REAL----KQSATDPRTGIVDISILTTGMS ::. : :..:. . :: ::.:: :: ...: :.: : .:. :..: CCDS56 RLSTALARLRMVDVVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRP--ADV-IFATVRE 440 450 460 470 480 490 800 810 820 830 840 850 pF1KE2 ATSRKRKEELAEALKKLILSKGKTPALKYQQLFEDIRGQSDIAITKDMFEEALRALADDD .: :. ...:: .. . :.: ::: ..: ... CCDS56 LVSGGRSVRFSEAEQRCV-SRGFTPA-QFQAALDEYEELNVWQVNASRTRITFV 500 510 520 530 540 860 pF1KE2 FLTVTGKTVRLL >>CCDS13094.1 MCM8 gene_id:84515|Hs108|chr20 (840 aa) initn: 883 init1: 380 opt: 873 Z-score: 743.5 bits: 148.6 E(32554): 4.3e-35 Smith-Waterman score: 1026; 29.0% identity (60.5% similar) in 751 aa overlap (164-863:97-837) 140 150 160 170 180 190 pF1KE2 AAAEDIVASEQSLGQKLVIWGTDVNVAACKENFQRFLQRFIDPLAKEE-ENVGIDITEPL . :..:. : :: :.: : : ... CCDS13 STLDRFIPYKGWKLYFSEVYSDSSPLIEKIQAFEKFFTRHIDLYDKDEIERKGSILVDFK 70 80 90 100 110 120 200 210 220 230 240 pF1KE2 YMQRLGEI-NVIGEPFLNVNCEHIKSFDKNLYRQLISYPQEVIPTFD-----MAVNEIFF . . ::. :.: : .. : . .:.: . .. : . .. . ..: . CCDS13 ELTEGGEVTNLI--P--DIATELRDAPEKTLACMGLAIHQVLTKDLERHAAELQAQEGLS 130 140 150 160 170 180 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 DRYPDSILEHQIQVRPFNALKTKNMRNLNPEDIDQLITISGMVIRTSQLIPEMQEAFFQC . . .:..: .: ...:. . . :.. : :.:.:.. : . : : CCDS13 NDGETMVNVPHIHARVYNYEPLTQLKNVRANYYGKYIALRGTVVRVSNIKPLCTKMAFLC 190 200 210 220 230 240 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 QVCAHTTRVEMDRGRIAEPSVCGR--CHTTHSMALIHNR-SLFSDKQMIKLQE--SPEDM .:.. . :. . :. : :. :: . .. : : ::.:: : .. CCDS13 AACGEIQSFPLPDGKYSLPTKCPVPVCRGRSFTALRSSPLTVTMDWQSIKIQELMSDDQR 250 260 270 280 290 300 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 PAGQTPHTVILFAHNDLVDKVQPGDRVNVTGIYRAVPIRVNPRVSNVKSVYKTHIDVIHY ::. :.:. .::::. ::: :..::: .. . . : .: : .. .:.. CCDS13 EAGRIPRTIECELVHDLVDSCVPGDTVTITGIVKVSNAEEGSRNKNDKCMFLLYIEANSI 310 320 330 340 350 360 430 440 450 460 470 pF1KE2 RKTDAKRLHGLDEEAEQKL---FSEKRVELLKELSRKPDIYERLASALAPSIYEHEDIKK .. ... .. .. .. . :: : . ..:.. . .... ....: : :. :: .: CCDS13 SNSKGQKTKSSEDGCKHGMLMEFSLKDLYAIQEIQAEENLFKLIVNSLCPVIFGHELVKA 370 380 390 400 410 420 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 GILLQLFGGTRKDFSHTGRGKFRAEINILLCGDPGTSKSQLLQYVYNLVPRGQYTSGKGS :. : ::::..: . .: .:.. .::. :::: .:::.:: . :..::: :. :. . CCDS13 GLALALFGGSQKYADDKNRIPIRGDPHILVVGDPGLGKSQMLQAACNVAPRGVYVCGNTT 430 440 450 460 470 480 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 SAVGLTAYVMKDPETRQLVLQTGALVLSDNGICCIDEFDKMNESTRSVLHEVMEQQTLSI .. :::. . :: . ...:..:::::.:.::: :::::::... ...: :.::::..:. CCDS13 TTSGLTVTLSKDSSSGDFALEAGALVLGDQGICGIDEFDKMGNQHQALL-EAMEQQSISL 490 500 510 520 530 540 600 610 620 630 640 650 pF1KE2 AKAGIICQLNARTSVLAAANPIESQWNPKKTTIENIQLPHTLLSRFDLIFLMLDPQDEAY ::::..:.: ::::..:::::. ...: ::. ::... .:::::::.:..:: .: . CCDS13 AKAGVVCSLPARTSIIAAANPVGGHYNKAKTVSENLKMGSALLSRFDLVFILLDTPNEHH 550 560 570 580 590 600 660 670 680 pF1KE2 DRRLAHHLVA--------------------------LYYQSEEQAEEEL----------L :. :..:..: : ::. :.: . CCDS13 DHLLSEHVIAIRAGKQRTISSATVARMNSQDSNTSVLEVVSEKPLSERLKVVPGETIDPI 610 620 630 640 650 660 690 700 710 720 730 740 pF1KE2 DMAVLKDYIAYAHSTIMPRLSEEASQALIEAYVDMRKIGSSRGMVSAYPRQLESLIRLAE .:. ::.::.. ..:::: ::...: . :...:: .. . :::::::::.: CCDS13 PHQLLRKYIGYARQYVYPRLSTEAARVLQDFYLELRKQSQRLNSSPITTRQLESLIRLTE 670 680 690 700 710 720 750 760 770 780 790 800 pF1KE2 AHAKVRLSNKVEAIDVEEAKRLHREALKQSATDPRTGIVDISILTTGMSATSRKRKEELA :.:...: ... :.:. .. . .. . .: . : .:. : . ..:. ... CCDS13 ARARLELREEATKEDAEDIVEIMKYSMLGTYSD-EFGNLDFERSQHGSGMSNRSTAKRFI 730 740 750 760 770 780 810 820 830 840 850 860 pF1KE2 EALKKLILSKGKTPALKYQQLFEDIRGQSDIAITKDMFEEALRALADDDFLTVTGKTVRL ::.. . . . ....:: ..: . .: .. ::. . .: :. .: : : CCDS13 SALNN-VAERTYNNIFQFHQL-RQIAKELNIQVAD--FENFIGSLNDQGYLLKKGPKVYQ 790 800 810 820 830 pF1KE2 L : CCDS13 LQTM 840 >>CCDS2179.1 MCM6 gene_id:4175|Hs108|chr2 (821 aa) initn: 782 init1: 592 opt: 843 Z-score: 718.3 bits: 143.9 E(32554): 1.1e-33 Smith-Waterman score: 1042; 32.5% identity (63.3% similar) in 667 aa overlap (141-764:6-651) 120 130 140 150 160 pF1KE2 PVRQRPDLGSAQKGLQVDLQSDGAAAEDIVASEQSLG-QKLVIWGTDVNVAACKENFQRF :.: . : :.: . : . :.. : : CCDS21 MDLAAAAEPGAGSQHLEV--RDEVAEKCQKLFLDF 10 20 30 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 LQRFIDPLAKEEENVGIDITEPLYMQRLGEINVIGEPFLNVNCEHIKSFDKNLYRQLISY :..: . . : : :.: :. . : :. ...:...: . CCDS21 LEEF-------QSSDG----EIKYLQLAEELIRPERNTLVVSFVDLEQFNQQLSTTIQEE 40 50 60 70 80 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 PQEVIPTFDMAVNEIFFDRYPDSILEHQIQVRPFNALKTKN-MRNLNPEDIDQLITISGM .: : . :.. . :: . : ... : :. : :.. .:.:. : : :::. CCDS21 FYRVYPYLCRALKTFVKDR-KEIPLAKDFYV-AFQDLPTRHKIRELTSSRIGLLTRISGQ 90 100 110 120 130 140 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 VIRTSQLIPEMQEAFFQCQVCAHTTRVEMDRGRIAEPSVCGR--CHTTHSMALIHNRSLF :.:: . ::. . : : : . : .. . ..:..: : . . . : :.: : CCDS21 VVRTHPVHPELVSGTFLCLDCQTVIRDVEQQFKYTQPNICRNPVCANRRRFLLDTNKSRF 150 160 170 180 190 200 350 360 370 380 390 pF1KE2 SDKQMIKLQESPEDMPAGQTPHTVILFAHNDLVDKVQPGDRVNVTGIYRAVP-------- : : ...::. ..: :. :... .. . . :...: ::. . :: .:: CCDS21 VDFQKVRIQETQAELPRGSIPRSLEVILRAEAVESAQAGDKCDFTGTLIVVPDVSKLSTP 210 220 230 240 250 260 400 410 420 430 pF1KE2 ---IRVNPRVSNVKSVYKTH---------IDVIHYR-------------KTDAKRLHGLD ..: :::.: . :.:. . . :: . .:.:. . CCDS21 GARAETNSRVSGVDG-YETEGIRGLRALGVRDLSYRLVFLACCVAPTNPRFGGKELRDEE 270 280 290 300 310 440 450 460 470 480 490 pF1KE2 EEAE--QKLFSEKRVELLKELSRKPDIYERLASALAPSIYEHEDIKKGILLQLFGGTRKD . :: .. .. :. : . :.:. ..:. : ..: :.:. ....:.:.::.::::. : CCDS21 QTAESIKNQMTVKEWEKVFEMSQDKNLYHNLCTSLFPTIHGNDEVKRGVLLMLFGGVPKT 320 330 340 350 360 370 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 FSHTGRG-KFRAEINILLCGDPGTSKSQLLQYVYNLVPRGQYTSGKGSSAVGLTAYVMKD ::.: ..:..::. . :::.:.:::.:..: .. ::. :::::.:::.:::: :..: CCDS21 ---TGEGTSLRGDINVCIVGDPSTAKSQFLKHVEEFSPRAVYTSGKASSAAGLTAAVVRD 380 390 400 410 420 430 560 570 580 590 600 610 pF1KE2 PETRQLVLQTGALVLSDNGICCIDEFDKMNESTRSVLHEVMEQQTLSIAKAGIICQLNAR :....:...:::.:.:::.:::::::::. . ..::.:::::.::.:::. :::: CCDS21 EESHEFVIEAGALMLADNGVCCIDEFDKMDVRDQVAIHEAMEQQTISITKAGVKATLNAR 440 450 460 470 480 490 620 630 640 650 660 670 pF1KE2 TSVLAAANPIESQWNPKKTTIENIQLPHTLLSRFDLIFLMLDPQDEAYDRRLAHHLVALY ::.::::::: .... .:. .::.: ..:::::.:...: .:. : .:...: :. CCDS21 TSILAAANPISGHYDRSKSLKQNINLSAPIMSRFDLFFILVDECNEVTDYAIARRIVDLH 500 510 520 530 540 550 680 690 700 710 720 pF1KE2 YQSEEQAEEELLDMAVLKDYIAYAHSTIMPRLSEEASQALIEAYVDMRK---IGSSRGMV . ::. .. . .. .. :. .:.. . :..:.:. . ..: : .:. : ... CCDS21 SRIEESIDR-VYSLDDIRRYLLFARQ-FKPKISKESEDFIVEQYKHLRQRDGSGVTKSSW 560 570 580 590 600 610 730 740 750 760 770 780 pF1KE2 SAYPRQLESLIRLAEAHAKVRLSNKVEAIDVEEAKRLHREALKQSATDPRTGIVDISILT :::::.:::.:: :... ..:. :.:: :: CCDS21 RITVRQLESMIRLSEAMARMHCCDEVQPKHVKEAFRLLNKSIIRVETPDVNLDQEEEIQM 620 630 640 650 660 670 790 800 810 820 830 840 pF1KE2 TGMSATSRKRKEELAEALKKLILSKGKTPALKYQQLFEDIRGQSDIAITKDMFEEALRAL CCDS21 EVDEGAGGINGHADSPAPVNGINGYNEDINQESAPKASLRLGFSEYCRISNLIVLHLRKV 680 690 700 710 720 730 >>CCDS75468.1 MCM3 gene_id:4172|Hs108|chr6 (818 aa) initn: 998 init1: 599 opt: 756 Z-score: 645.0 bits: 130.4 E(32554): 1.3e-29 Smith-Waterman score: 1004; 34.7% identity (61.8% similar) in 599 aa overlap (221-764:78-658) 200 210 220 230 240 250 pF1KE2 PLYMQRLGEINVIGEPFLNVNCEHIKSFDKNLYRQLISYPQEVIPTFDMAVNEIFFDRYP : ...:... :... : ... . .: CCDS75 AWRVPWCWTMWSCGRLREITWTSWTTRLLNNAFEELVAF-QRALKDFVASIDATYAKQYE 50 60 70 80 90 100 260 270 280 290 300 310 pF1KE2 DSILEHQIQVRPFNALKTKNMRNLNPEDIDQLITISGMVIRTSQLIPEMQEAFFQCQVCA : . .. . : . :.:. .. .. . :.: . : . :.. .. : . CCDS75 ----EFYVGLEGSFGSKHVSPRTLTSCFLSCVVCVEGIVTKCSLVRPKVVRSVHYCPATK 110 120 130 140 150 160 320 330 340 350 360 pF1KE2 HTT-RVEMDRGR-IAEPSVC---GRCHTTHSMALIHNRSLFSDKQMIKLQESPEDMPAGQ .: : : .: :: . . .. . .. :...:.: : .:: :: :::: CCDS75 KTIERRYSDLTTLVAFPSSSVYPTKDEENNPLETEYGLSVYKDHQTITIQEMPEKAPAGQ 170 180 190 200 210 220 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 TPHTVILFAHNDLVDKVQPGDRVNVTGIYRAVPIRVNPRVSNVKSVYKTHIDVIHYRKTD :..: .. .:::::..:::::.:.: :: .: . . .:.. . .: .. : : CCDS75 LPRSVDVILDDDLVDKAKPGDRVQVVGTYRCLPGKKGGYTSGTFRTVLIACNVKQMSK-D 230 240 250 260 270 280 430 440 450 460 470 480 pF1KE2 AKRLHGLDEEAEQKLFSEKRVELLKELSRKPDIYERLASALAPSIYEHEDIKKGILLQLF :. . .. :. : ::. .:. ::...::..:::::. :. .::.:: :. CCDS75 AQPSFSAEDIAKIKKFSK---------TRSKDIFDQLAKSLAPSIHGHDYVKKAILCLLL 290 300 310 320 330 490 500 510 520 530 540 pF1KE2 GGTRKDFSHTGRGKFRAEINILLCGDPGTSKSQLLQYVYNLVPRGQYTSGKGSSAVGLTA ::...:. . . ..:..::::: :::...:::::.:: .::. :.:.:::.::::: CCDS75 GGVERDLENGS--HIRGDINILLIGDPSVAKSQLLRYVLCTAPRAIPTTGRGSSGVGLTA 340 350 360 370 380 390 550 560 570 580 590 600 pF1KE2 YVMKDPETRQLVLQTGALVLSDNGICCIDEFDKMNESTRSVLHEVMEQQTLSIAKAGIIC : : :: . :..::.::.: :. ::::::::.. :...:::::: ..:::::: CCDS75 AVTTDQETGERRLEAGAMVLADRGVVCIDEFDKMSDMDRTAIHEVMEQGRVTIAKAGIHA 400 410 420 430 440 450 610 620 630 640 650 660 pF1KE2 QLNARTSVLAAANPIESQWNPKKTTIENIQLPHTLLSRFDLIFLMLDPQDEAYDRRLAHH .:::: ::::::::. .... :: .::: : .:::::::.:.::: .: ::... : CCDS75 RLNARCSVLAAANPVYGRYDQYKTPMENIGLQDSLLSRFDLLFIMLDQMDPEQDREISDH 460 470 480 490 500 510 670 pF1KE2 LVALY----------------------------YQSEEQAE------------------E .. .. ...:.: . : CCDS75 VLRMHRYRAPGEQDGDAMPLGSAVDILATDDPNFSQEDQQDTQIYEKHDNLLHGTKKKKE 520 530 540 550 560 570 680 690 700 710 720 730 pF1KE2 ELLDMAVLKDYIAYAHSTIMPRLSEEASQALIEAYVDMRKIGS-SRGMVSAYP---RQLE .... : .: :: :. : : :..:.. . : : .:. : : . . : : :: CCDS75 KMVSAAFMKKYIHVAK-IIKPVLTQESATYIAEEYSRLRSQDSMSSDTARTSPVTARTLE 580 590 600 610 620 740 750 760 770 780 790 pF1KE2 SLIRLAEAHAKVRLSNKVEAIDVEEAKRLHREALKQSATDPRTGIVDISILTTGMSATSR .::::: ::::.:.:. :. :.::: .: CCDS75 TLIRLATAHAKARMSKTVDLQDAEEAVELVQYAYFKKVLEKEKKRKKRSEDESETEDEEE 630 640 650 660 670 680 >>CCDS4940.2 MCM3 gene_id:4172|Hs108|chr6 (853 aa) initn: 998 init1: 599 opt: 756 Z-score: 644.7 bits: 130.4 E(32554): 1.4e-29 Smith-Waterman score: 1010; 32.5% identity (59.8% similar) in 723 aa overlap (103-764:3-693) 80 90 100 110 120 130 pF1KE2 PQMHSSAIPLDFDVSSPLTYGTPSSRVEGTPRSGV--RGTPVRQRPDLGSAQKGLQVDLQ ::: ::. . : ..:: . :.. CCDS49 MLPRSPPLPRGN-LWWREEFGSFRAGVE---- 10 20 140 150 160 170 180 pF1KE2 SDGAAAEDIVA-SEQSLGQKLVIWGTDVNVAACKENFQRFLQRFIDPLAKEEENVGIDIT :. .:. . : . :. .. ::.. .... ::. .::. :: CCDS49 SSWEPPRDFGGGSSLAAGMAGTVVLDDVELREAQRDYLDFLD--------DEEDQGI--- 30 40 50 60 70 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 EPLYMQRLGEINVIGEPFLNVNCEHIKSFDKNLYRQLISYPQEVIPTFDMAVNEIF--FD :.... :. .. : :: . .. ... .:.. : . .:. :.... .: CCDS49 ---YQSKVRELISDNQYRLIVNVNDLRRKNEKRANRLLNNAFEELVAFQRALKDFVASID 80 90 100 110 120 130 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 -RYPDSILEHQIQVRPFNALKTKNMRNLNPEDIDQLITISGMVIRTSQLIPEMQEAFFQC : . : . .. . : . :.:. .. .. . :.: . : . :.. .. : CCDS49 ATYAKQYEEFYVGLEGSFGSKHVSPRTLTSCFLSCVVCVEGIVTKCSLVRPKVVRSVHYC 140 150 160 170 180 190 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 QVCAHTT-RVEMDRGR-IAEPSVC---GRCHTTHSMALIHNRSLFSDKQMIKLQESPEDM . .: : : .: :: . . .. . .. :...:.: : .:: :: CCDS49 PATKKTIERRYSDLTTLVAFPSSSVYPTKDEENNPLETEYGLSVYKDHQTITIQEMPEKA 200 210 220 230 240 250 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 PAGQTPHTVILFAHNDLVDKVQPGDRVNVTGIYRAVPIRVNPRVSNVKSVYKTHIDVIHY :::: :..: .. .:::::..:::::.:.: :: .: . . .:.. . .: .. CCDS49 PAGQLPRSVDVILDDDLVDKAKPGDRVQVVGTYRCLPGKKGGYTSGTFRTVLIACNVKQM 260 270 280 290 300 310 430 440 450 460 470 480 pF1KE2 RKTDAKRLHGLDEEAEQKLFSEKRVELLKELSRKPDIYERLASALAPSIYEHEDIKKGIL : ::. . .. :. : ::. .:. ::...::..:::::. :. .::.:: CCDS49 SK-DAQPSFSAEDIAKIKKFSK---------TRSKDIFDQLAKSLAPSIHGHDYVKKAIL 320 330 340 350 360 490 500 510 520 530 540 pF1KE2 LQLFGGTRKDFSHTGRGKFRAEINILLCGDPGTSKSQLLQYVYNLVPRGQYTSGKGSSAV :.::...:. . .. .:..::::: :::...:::::.:: .::. :.:.:::.: CCDS49 CLLLGGVERDLENGSH--IRGDINILLIGDPSVAKSQLLRYVLCTAPRAIPTTGRGSSGV 370 380 390 400 410 420 550 560 570 580 590 600 pF1KE2 GLTAYVMKDPETRQLVLQTGALVLSDNGICCIDEFDKMNESTRSVLHEVMEQQTLSIAKA :::: : : :: . :..::.::.: :. ::::::::.. :...:::::: ..:::: CCDS49 GLTAAVTTDQETGERRLEAGAMVLADRGVVCIDEFDKMSDMDRTAIHEVMEQGRVTIAKA 430 440 450 460 470 480 610 620 630 640 650 660 pF1KE2 GIICQLNARTSVLAAANPIESQWNPKKTTIENIQLPHTLLSRFDLIFLMLDPQDEAYDRR :: .:::: ::::::::. .... :: .::: : .:::::::.:.::: .: ::. CCDS49 GIHARLNARCSVLAAANPVYGRYDQYKTPMENIGLQDSLLSRFDLLFIMLDQMDPEQDRE 490 500 510 520 530 540 670 pF1KE2 LAHHLVALY----------------------------YQSEEQAE--------------- .. :.. .. ...:.: . CCDS49 ISDHVLRMHRYRAPGEQDGDAMPLGSAVDILATDDPNFSQEDQQDTQIYEKHDNLLHGTK 550 560 570 580 590 600 680 690 700 710 720 730 pF1KE2 ---EELLDMAVLKDYIAYAHSTIMPRLSEEASQALIEAYVDMRKIGS-SRGMVSAYP--- :.... : .: :: :. : : :..:.. . : : .:. : : . . : CCDS49 KKKEKMVSAAFMKKYIHVAK-IIKPVLTQESATYIAEEYSRLRSQDSMSSDTARTSPVTA 610 620 630 640 650 660 740 750 760 770 780 790 pF1KE2 RQLESLIRLAEAHAKVRLSNKVEAIDVEEAKRLHREALKQSATDPRTGIVDISILTTGMS : ::.::::: ::::.:.:. :. :.::: .: CCDS49 RTLETLIRLATAHAKARMSKTVDLQDAEEAVELVQYAYFKKVLEKEKKRKKRSEDESETE 670 680 690 700 710 720 800 810 820 830 840 850 pF1KE2 ATSRKRKEELAEALKKLILSKGKTPALKYQQLFEDIRGQSDIAITKDMFEEALRALADDD CCDS49 DEEEKSQEDQEQKRKRRKTRQPDAKDGDSYDPYDFSDTEEEMPQVHTPKTADSQETKESQ 730 740 750 760 770 780 >>CCDS56447.1 MCM9 gene_id:254394|Hs108|chr6 (1143 aa) initn: 610 init1: 290 opt: 755 Z-score: 641.9 bits: 130.3 E(32554): 2e-29 Smith-Waterman score: 866; 30.7% identity (63.4% similar) in 632 aa overlap (229-831:61-659) 200 210 220 230 240 250 pF1KE2 EINVIGEPFLNVNCEHIKSFDKNLYRQLISYPQEVIPTFDMAVNEIFFD-----RYPDSI .:.::. :: :. . . :... 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