Result of FASTA (ccds) for pFN21AE2132
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2132, 863 aa
  1>>>pF1KE2132 863 - 863 aa - 863 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9165+/-0.00114; mu= 9.0427+/- 0.069
 mean_var=140.6135+/-28.617, 0's: 0 Z-trim(106.9): 27  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.108159
 statistics sampled from 9213 (9228) to 9213 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.632), E-opt: 0.2 (0.283), width:  16
 Scan time:  3.390

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS6143.1 MCM4 gene_id:4173|Hs108|chr8            ( 863) 5601 886.4       0
CCDS13915.1 MCM5 gene_id:4174|Hs108|chr22          ( 734) 1087 182.0 3.4e-45
CCDS5683.1 MCM7 gene_id:4176|Hs108|chr7            ( 719) 1040 174.6 5.4e-43
CCDS5684.1 MCM7 gene_id:4176|Hs108|chr7            ( 543)  967 163.2 1.1e-39
CCDS13094.1 MCM8 gene_id:84515|Hs108|chr20         ( 840)  873 148.6 4.3e-35
CCDS2179.1 MCM6 gene_id:4175|Hs108|chr2            ( 821)  843 143.9 1.1e-33
CCDS75468.1 MCM3 gene_id:4172|Hs108|chr6           ( 818)  756 130.4 1.3e-29
CCDS4940.2 MCM3 gene_id:4172|Hs108|chr6            ( 853)  756 130.4 1.4e-29
CCDS56447.1 MCM9 gene_id:254394|Hs108|chr6         (1143)  755 130.3   2e-29
CCDS3043.1 MCM2 gene_id:4171|Hs108|chr3            ( 904)  752 129.7 2.2e-29
CCDS13095.1 MCM8 gene_id:84515|Hs108|chr20         ( 824)  727 125.8 3.1e-28
CCDS63227.1 MCM8 gene_id:84515|Hs108|chr20         ( 880)  609 107.4 1.1e-22
CCDS63226.1 MCM8 gene_id:84515|Hs108|chr20         ( 793)  478 87.0 1.5e-16


>>CCDS6143.1 MCM4 gene_id:4173|Hs108|chr8                 (863 aa)
 initn: 5601 init1: 5601 opt: 5601  Z-score: 4730.4  bits: 886.4 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5601; 99.9% identity (100.0% similar) in 863 aa overlap (1-863:1-863)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MSSPASTPSRRGSRRGRATPAQTPRSEDARSSPSQRRRGEDSTSTGELQPMPTSPGVDLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 MSSPASTPSRRGSRRGRATPAQTPRSEDARSSPSQRRRGEDSTSTGELQPMPTSPGVDLQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 SPAAQDVLFSSPPQMHSSAIPLDFDVSSPLTYGTPSSRVEGTPRSGVRGTPVRQRPDLGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 SPAAQDVLFSSPPQMHSSAIPLDFDVSSPLTYGTPSSRVEGTPRSGVRGTPVRQRPDLGS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 AQKGLQVDLQSDGAAAEDIVASEQSLGQKLVIWGTDVNVAACKENFQRFLQRFIDPLAKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 AQKGLQVDLQSDGAAAEDIVASEQSLGQKLVIWGTDVNVAACKENFQRFLQRFIDPLAKE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 EENVGIDITEPLYMQRLGEINVIGEPFLNVNCEHIKSFDKNLYRQLISYPQEVIPTFDMA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 EENVGIDITEPLYMQRLGEINVIGEPFLNVNCEHIKSFDKNLYRQLISYPQEVIPTFDMA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 VNEIFFDRYPDSILEHQIQVRPFNALKTKNMRNLNPEDIDQLITISGMVIRTSQLIPEMQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 VNEIFFDRYPDSILEHQIQVRPFNALKTKNMRNLNPEDIDQLITISGMVIRTSQLIPEMQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 EAFFQCQVCAHTTRVEMDRGRIAEPSVCGRCHTTHSMALIHNRSLFSDKQMIKLQESPED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 EAFFQCQVCAHTTRVEMDRGRIAEPSVCGRCHTTHSMALIHNRSLFSDKQMIKLQESPED
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 MPAGQTPHTVILFAHNDLVDKVQPGDRVNVTGIYRAVPIRVNPRVSNVKSVYKTHIDVIH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 MPAGQTPHTVILFAHNDLVDKVQPGDRVNVTGIYRAVPIRVNPRVSNVKSVYKTHIDVIH
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 YRKTDAKRLHGLDEEAEQKLFSEKRVELLKELSRKPDIYERLASALAPSIYEHEDIKKGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 YRKTDAKRLHGLDEEAEQKLFSEKRVELLKELSRKPDIYERLASALAPSIYEHEDIKKGI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 LLQLFGGTRKDFSHTGRGKFRAEINILLCGDPGTSKSQLLQYVYNLVPRGQYTSGKGSSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 LLQLFGGTRKDFSHTGRGKFRAEINILLCGDPGTSKSQLLQYVYNLVPRGQYTSGKGSSA
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 VGLTAYVMKDPETRQLVLQTGALVLSDNGICCIDEFDKMNESTRSVLHEVMEQQTLSIAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 VGLTAYVMKDPETRQLVLQTGALVLSDNGICCIDEFDKMNESTRSVLHEVMEQQTLSIAK
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 AGIICQLNARTSVLAAANPIESQWNPKKTTIENIQLPHTLLSRFDLIFLMLDPQDEAYDR
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS61 AGIICQLNARTSVLAAANPIESQWNPKKTTIENIQLPHTLLSRFDLIFLLLDPQDEAYDR
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 RLAHHLVALYYQSEEQAEEELLDMAVLKDYIAYAHSTIMPRLSEEASQALIEAYVDMRKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 RLAHHLVALYYQSEEQAEEELLDMAVLKDYIAYAHSTIMPRLSEEASQALIEAYVDMRKI
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 GSSRGMVSAYPRQLESLIRLAEAHAKVRLSNKVEAIDVEEAKRLHREALKQSATDPRTGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 GSSRGMVSAYPRQLESLIRLAEAHAKVRLSNKVEAIDVEEAKRLHREALKQSATDPRTGI
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE2 VDISILTTGMSATSRKRKEELAEALKKLILSKGKTPALKYQQLFEDIRGQSDIAITKDMF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 VDISILTTGMSATSRKRKEELAEALKKLILSKGKTPALKYQQLFEDIRGQSDIAITKDMF
              790       800       810       820       830       840

              850       860   
pF1KE2 EEALRALADDDFLTVTGKTVRLL
       :::::::::::::::::::::::
CCDS61 EEALRALADDDFLTVTGKTVRLL
              850       860   

>>CCDS13915.1 MCM5 gene_id:4174|Hs108|chr22               (734 aa)
 initn: 951 init1: 520 opt: 1087  Z-score: 924.8  bits: 182.0 E(32554): 3.4e-45
Smith-Waterman score: 1134; 34.7% identity (61.9% similar) in 680 aa overlap (161-808:26-679)

              140       150       160       170       180       190
pF1KE2 SDGAAAEDIVASEQSLGQKLVIWGTDVNVAACKENFQRFLQRFIDPLAKEEENVGIDITE
                                     : : ..:: ...:.     ..  :: : : 
CCDS13      MSGFDDPGIFYSDSFGGDAQADEGQARKSQLQRRFKEFL-----RQYRVGTDRTG
                    10        20        30             40        50

                200       210       220       230       240        
pF1KE2 PLYMQR--LGEINVIGEPFLNVNCEHIKSFDKNLYRQLISYPQEVIPTFDMAV----NEI
         .  :  : .   .:: ...:. : . :::..:   : . : : .  .. :.    .:.
CCDS13 FTFKYRDELKRHYNLGEYWIEVEMEDLASFDEDLADYLYKQPAEHLQLLEEAAKEVADEV
               60        70        80        90       100       110

          250       260       270       280       290       300    
pF1KE2 FFDRYPDSILEHQIQVRPFNALKTKNMRNLNPEDIDQLITISGMVIRTSQLIPEMQEAFF
          :     . ..:::   .  . ...:.:. . ...:. : :..: .: .  .  .  .
CCDS13 TRPRPSGEEVLQDIQVMLKSDASPSSIRSLKSDMMSHLVKIPGIIIAASAVRAKATRISI
              120       130       140       150       160       170

          310        320              330         340       350    
pF1KE2 QCQVCAHT-TRVEMDRGR--IAEPSVC-----GR--CHTTHSMALIHNRSLFSDKQMIKL
       ::. : .: : . :  :    : :  :     ::  :     . .. ..    : : .::
CCDS13 QCRSCRNTLTNIAMRPGLEGYALPRKCNTDQAGRPKC-PLDPYFIMPDKCKCVDFQTLKL
              180       190       200        210       220         

          360       370       380       390       400       410    
pF1KE2 QESPEDMPAGQTPHTVILFAHNDLVDKVQPGDRVNVTGIYRAVPIRVNPRVSNVKSVYKT
       :: :. .: :. :. . :.    : ::: ::.::.. :::    .     ... ..  ..
CCDS13 QELPDAVPHGEMPRHMQLYCDRYLCDKVVPGNRVTIMGIYSIKKF----GLTTSRGRDRV
     230       240       250       260       270           280     

          420       430         440           450       460        
pF1KE2 HIDVIHYRKTDAKRLHGL--DEEAEQKLF----SEKRVELLKELSRKPDIYERLASALAP
        . .    ...  :. :.  : ..  . :    : .. : ...:.  :..:: .....::
CCDS13 GVGI----RSSYIRVLGIQVDTDGSGRSFAGAVSPQEEEEFRRLAALPNVYEVISKSIAP
             290       300       310       320       330       340 

      470       480       490       500       510       520        
pF1KE2 SIYEHEDIKKGILLQLFGGTRKDFSHTGRGKFRAEINILLCGDPGTSKSQLLQYVYNLVP
       ::.   :.::.:   ::::.:: .   :  . :..::.:. :::::.:::::..: .  :
CCDS13 SIFGGTDMKKAIACLLFGGSRKRLPD-GLTR-RGDINLLMLGDPGTAKSQLLKFVEKCSP
             350       360        370        380       390         

      530       540       550       560       570       580        
pF1KE2 RGQYTSGKGSSAVGLTAYVMKDPETRQLVLQTGALVLSDNGICCIDEFDKMNESTRSVLH
        : :::::::::.:::: ::.:: .:..... ::.::.:.:. :::::::: :. : ..:
CCDS13 IGVYTSGKGSSAAGLTASVMRDPSSRNFIMEGGAMVLADGGVVCIDEFDKMREDDRVAIH
     400       410       420       430       440       450         

      590       600       610       620       630       640        
pF1KE2 EVMEQQTLSIAKAGIICQLNARTSVLAAANPIESQWNPKKTTIENIQLPHTLLSRFDLIF
       :.:::::.:::::::   ::.: ::::::: . ..:.  :   .::..  :.:::::.::
CCDS13 EAMEQQTISIAKAGITTTLNSRCSVLAAANSVFGRWDETKGE-DNIDFMPTILSRFDMIF
     460       470       480       490       500        510        

      650       660       670         680       690       700      
pF1KE2 LMLDPQDEAYDRRLAHHLVALYYQ--SEEQAEEELLDMAVLKDYIAYAHSTIMPRLSEEA
       .. : ..:  :  ::.:...:. .  .. :: :  .:.: :: .::: .    :::: ::
CCDS13 IVKDEHNEERDVMLAKHVITLHVSALTQTQAVEGEIDLAKLKKFIAYCRVKCGPRLSAEA
      520       530       540       550       560       570        

        710              720       730       740       750         
pF1KE2 SQALIEAYVDMR-------KIGSSRGMVSAYPRQLESLIRLAEAHAKVRLSNKVEAIDVE
       .. : . :. ::       . .. :. .    ::::...:.::: .:..:.  .   :::
CCDS13 AEKLKNRYIIMRSGARQHERDSDRRSSIPITVRQLEAIVRIAEALSKMKLQPFATEADVE
      580       590       600       610       620       630        

     760       770       780       790        800       810        
pF1KE2 EAKRLHREALKQSATDPRTGIVDISILTTGMSA-TSRKRKEELAEALKKLILSKGKTPAL
       :: :: . .  ..:         .:   .:. . ::.. .: :..  :.:          
CCDS13 EALRLFQVSTLDAA---------LSGTLSGVEGFTSQEDQEMLSRIEKQLKRRFAIGSQV
      640       650                660       670       680         

      820       830       840       850       860   
pF1KE2 KYQQLFEDIRGQSDIAITKDMFEEALRALADDDFLTVTGKTVRLL
                                                    
CCDS13 SEHSIIKDFTKQKYPEHAIHKVLQLMLRRGEIQHRMQRKVLYRLK
     690       700       710       720       730    

>>CCDS5683.1 MCM7 gene_id:4176|Hs108|chr7                 (719 aa)
 initn: 908 init1: 696 opt: 1040  Z-score: 885.3  bits: 174.6 E(32554): 5.4e-43
Smith-Waterman score: 1175; 34.2% identity (64.7% similar) in 720 aa overlap (158-826:5-700)

       130       140       150       160       170         180     
pF1KE2 DLQSDGAAAEDIVASEQSLGQKLVIWGTDVNVAACKENFQRFLQRFI--DPLAKEEENVG
                                     . :  ::. ..:::.:   : :.:.. . :
CCDS56                           MALKDYALEKEKVKKFLQEFYQDDELGKKQFKYG
                                         10        20        30    

         190          200          210       220       230         
pF1KE2 IDITEPLYMQRLG---EINVIGE--PFL-NVNCEHIKSFDKNLYRQLISYPQEVIPTFDM
        ....  . ....   ... ..:  : : .  ::. . . : :. . .   ::..: .  
CCDS56 NQLVRLAHREQVALYVDLDDVAEDDPELVDSICENARRYAK-LFADAV---QELLPQYKE
           40        50        60        70         80           90

       240                    250            260              270  
pF1KE2 --AVNEIFFDRY-------------PDSILEHQIQ-----VRPF-------NALKTKNMR
         .::.  .: :             :  .   : :     .: :       .. : . .:
CCDS56 REVVNKDVLDVYIEHRLMMEQRSRDPGMVRSPQNQYPAELMRRFELYFQGPSSNKPRVIR
              100       110       120       130       140       150

            280       290       300       310       320         330
pF1KE2 NLNPEDIDQLITISGMVIRTSQLIPEMQEAFFQCQVCAHTTRVEMDRGRIAEPSVCG--R
       ..  ... .:.:. :.: :.:.. :.:  : . :. :.  :   ..   .    .:   .
CCDS56 EVRADSVGKLVTVRGIVTRVSEVKPKMVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMCPSQE
              160       170       180       190       200       210

                 340       350       360       370       380       
pF1KE2 CHTTHS---MALIHNRSLFSDKQMIKLQESPEDMPAGQTPHTVILFAHNDLVDKVQPGDR
       :.:..:   . :    : :   : .:.::  ...:.:. :... ...... .  .::::.
CCDS56 CQTNRSGGRLYLQTRGSRFIKFQEMKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQPGDH
              220       230       240       250       260       270

       390       400       410        420       430        440     
pF1KE2 VNVTGIYRAVPIRVNPRVSNVKSVYKTHID-VIHYRKTDAKRLHGLDE-EAEQKLFSEKR
       :.::::.  .::        ... ..  .. ..     .:.:.  ... : ...  .:  
CCDS56 VSVTGIF--LPI--------LRTGFRQVVQGLLSETYLEAHRIVKMNKSEDDESGAGELT
                280               290       300       310       320

         450       460       470       480       490       500     
pF1KE2 VELLKELSRKPDIYERLASALAPSIYEHEDIKKGILLQLFGGTRKDFSHTGRGKFRAEIN
        : :...... :.::.::...:: :: :::.::..:: : ::.  : :  :  :.:..::
CCDS56 REELRQIAEE-DFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGV--DQSPRGM-KIRGNIN
              330        340       350       360          370      

         510       520       530       540       550       560     
pF1KE2 ILLCGDPGTSKSQLLQYVYNLVPRGQYTSGKGSSAVGLTAYVMKDPETRQLVLQTGALVL
       : : ::::..:::::.:.  :.::.:::.:.:::.::::: :..:  . .:.:. :::::
CCDS56 ICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVSGELTLEGGALVL
        380       390       400       410       420       430      

         570       580       590       600       610       620     
pF1KE2 SDNGICCIDEFDKMNESTRSVLHEVMEQQTLSIAKAGIICQLNARTSVLAAANPIESQWN
       .:.:.::::::::: :. :...::::::::.:::::::.  :::: :.::::::  ...:
CCDS56 ADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYN
        440       450       460       470       480       490      

         630       640       650       660       670        680    
pF1KE2 PKKTTIENIQLPHTLLSRFDLIFLMLDPQDEAYDRRLAHHLVALYYQSEEQAEE-ELLDM
       :...  .::::: .:::::::..:. :  :.  : :::.:.. .. .:..   . : :::
CCDS56 PRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPSQFEPLDM
        500       510       520       530       540       550      

          690       700       710       720        730       740   
pF1KE2 AVLKDYIAYAHSTIMPRLSEEASQALIEAYVDMRKIG-SSRGMVSAYPRQLESLIRLAEA
        ... :::. .   .: . :  .. .  :::.::. . .:.  . .  : : ...::. :
CCDS56 KLMRRYIAMCREK-QPMVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATYTSARTLLAILRLSTA
        560        570       580       590       600       610     

           750       760              770       780       790      
pF1KE2 HAKVRLSNKVEAIDVEEAKRLH---REAL----KQSATDPRTGIVDISILTTGMSATSRK
        :..:. . ::  ::.:: ::    ...:     :.:   : .  :. :..:    .:  
CCDS56 LARLRMVDVVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPA--DV-IFATVRELVSGG
         620       630       640       650         660        670  

        800       810       820       830       840       850      
pF1KE2 RKEELAEALKKLILSKGKTPALKYQQLFEDIRGQSDIAITKDMFEEALRALADDDFLTVT
       :. ...:: .. . :.: ::: ..:  ...                              
CCDS56 RSVRFSEAEQRCV-SRGFTPA-QFQAALDEYEELNVWQVNASRTRITFV           
            680        690        700       710                    

>>CCDS5684.1 MCM7 gene_id:4176|Hs108|chr7                 (543 aa)
 initn: 934 init1: 696 opt: 967  Z-score: 825.6  bits: 163.2 E(32554): 1.1e-39
Smith-Waterman score: 1079; 37.8% identity (68.6% similar) in 545 aa overlap (299-826:1-524)

      270       280       290       300       310       320        
pF1KE2 KNMRNLNPEDIDQLITISGMVIRTSQLIPEMQEAFFQCQVCAHTTRVEMDRGRIAEPSVC
                                     :  : . :. :.  :   ..   .    .:
CCDS56                               MVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMC
                                             10        20        30

        330          340       350       360       370       380   
pF1KE2 G--RCHTTHS---MALIHNRSLFSDKQMIKLQESPEDMPAGQTPHTVILFAHNDLVDKVQ
          .:.:..:   . :    : :   : .:.::  ...:.:. :... ...... .  .:
CCDS56 PSQECQTNRSGGRLYLQTRGSRFIKFQEMKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQ
               40        50        60        70        80        90

           390       400       410        420       430        440 
pF1KE2 PGDRVNVTGIYRAVPIRVNPRVSNVKSVYKTHID-VIHYRKTDAKRLHGLDE-EAEQKLF
       :::.:.::::.  .::        ... ..  .. ..     .:.:.  ... : ...  
CCDS56 PGDHVSVTGIF--LPI--------LRTGFRQVVQGLLSETYLEAHRIVKMNKSEDDESGA
              100                 110       120       130       140

             450       460       470       480       490        500
pF1KE2 SEKRVELLKELSRKPDIYERLASALAPSIYEHEDIKKGILLQLFGGTRKDFSHTGRG-KF
       .:   : :...... :.::.::...:: :: :::.::..:: : ::.    ... :: :.
CCDS56 GELTREELRQIAEE-DFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGV----DQSPRGMKI
              150        160       170       180           190     

              510       520       530       540       550       560
pF1KE2 RAEINILLCGDPGTSKSQLLQYVYNLVPRGQYTSGKGSSAVGLTAYVMKDPETRQLVLQT
       :..::: : ::::..:::::.:.  :.::.:::.:.:::.::::: :..:  . .:.:. 
CCDS56 RGNINICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVSGELTLEG
         200       210       220       230       240       250     

              570       580       590       600       610       620
pF1KE2 GALVLSDNGICCIDEFDKMNESTRSVLHEVMEQQTLSIAKAGIICQLNARTSVLAAANPI
       :::::.:.:.::::::::: :. :...::::::::.:::::::.  :::: :.:::::: 
CCDS56 GALVLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPA
         260       270       280       290       300       310     

              630       640       650       660       670          
pF1KE2 ESQWNPKKTTIENIQLPHTLLSRFDLIFLMLDPQDEAYDRRLAHHLVALYYQSEEQAEE-
        ...::...  .::::: .:::::::..:. :  :.  : :::.:.. .. .:..   . 
CCDS56 YGRYNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPSQF
         320       330       340       350       360       370     

     680       690       700       710       720        730        
pF1KE2 ELLDMAVLKDYIAYAHSTIMPRLSEEASQALIEAYVDMRKIG-SSRGMVSAYPRQLESLI
       : ::: ... :::. .   .: . :  .. .  :::.::. . .:.  . .  : : ...
CCDS56 EPLDMKLMRRYIAMCREK-QPMVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATYTSARTLLAIL
         380       390        400       410       420       430    

      740       750       760              770       780       790 
pF1KE2 RLAEAHAKVRLSNKVEAIDVEEAKRLH---REAL----KQSATDPRTGIVDISILTTGMS
       ::. : :..:. . ::  ::.:: ::    ...:     :.:   :   .:. :..:   
CCDS56 RLSTALARLRMVDVVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRP--ADV-IFATVRE
          440       450       460       470       480          490 

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pF1KE2 ATSRKRKEELAEALKKLILSKGKTPALKYQQLFEDIRGQSDIAITKDMFEEALRALADDD
        .:  :. ...:: .. . :.: ::: ..:  ...                         
CCDS56 LVSGGRSVRFSEAEQRCV-SRGFTPA-QFQAALDEYEELNVWQVNASRTRITFV      
             500        510        520       530       540         

             860   
pF1KE2 FLTVTGKTVRLL

>>CCDS13094.1 MCM8 gene_id:84515|Hs108|chr20              (840 aa)
 initn: 883 init1: 380 opt: 873  Z-score: 743.5  bits: 148.6 E(32554): 4.3e-35
Smith-Waterman score: 1026; 29.0% identity (60.5% similar) in 751 aa overlap (164-863:97-837)

           140       150       160       170       180        190  
pF1KE2 AAAEDIVASEQSLGQKLVIWGTDVNVAACKENFQRFLQRFIDPLAKEE-ENVGIDITEPL
                                     . :..:. : ::   :.: :  :  ...  
CCDS13 STLDRFIPYKGWKLYFSEVYSDSSPLIEKIQAFEKFFTRHIDLYDKDEIERKGSILVDFK
         70        80        90       100       110       120      

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pF1KE2 YMQRLGEI-NVIGEPFLNVNCEHIKSFDKNLYRQLISYPQEVIPTFD-----MAVNEIFF
        . . ::. :.:  :  ..  :   . .:.:  . ..  : .   ..     . ..: . 
CCDS13 ELTEGGEVTNLI--P--DIATELRDAPEKTLACMGLAIHQVLTKDLERHAAELQAQEGLS
        130           140       150       160       170       180  

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pF1KE2 DRYPDSILEHQIQVRPFNALKTKNMRNLNPEDIDQLITISGMVIRTSQLIPEMQEAFFQC
       .     .   .:..: .:     ...:.  .   . :.. : :.:.:.. :   .  : :
CCDS13 NDGETMVNVPHIHARVYNYEPLTQLKNVRANYYGKYIALRGTVVRVSNIKPLCTKMAFLC
            190       200       210       220       230       240  

        310       320       330         340        350         360 
pF1KE2 QVCAHTTRVEMDRGRIAEPSVCGR--CHTTHSMALIHNR-SLFSDKQMIKLQE--SPEDM
        .:..     .  :. . :. :    :.     ::  .  ..  : : ::.::  : .. 
CCDS13 AACGEIQSFPLPDGKYSLPTKCPVPVCRGRSFTALRSSPLTVTMDWQSIKIQELMSDDQR
            250       260       270       280       290       300  

             370       380       390       400       410       420 
pF1KE2 PAGQTPHTVILFAHNDLVDKVQPGDRVNVTGIYRAVPIRVNPRVSNVKSVYKTHIDVIHY
        ::. :.:.     .::::.  ::: :..::: ..   . . : .: : ..  .:..   
CCDS13 EAGRIPRTIECELVHDLVDSCVPGDTVTITGIVKVSNAEEGSRNKNDKCMFLLYIEANSI
            310       320       330       340       350       360  

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pF1KE2 RKTDAKRLHGLDEEAEQKL---FSEKRVELLKELSRKPDIYERLASALAPSIYEHEDIKK
        .. ... .. ..  .. .   :: : .  ..:.. . .... ....: : :. :: .: 
CCDS13 SNSKGQKTKSSEDGCKHGMLMEFSLKDLYAIQEIQAEENLFKLIVNSLCPVIFGHELVKA
            370       380       390       400       410       420  

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pF1KE2 GILLQLFGGTRKDFSHTGRGKFRAEINILLCGDPGTSKSQLLQYVYNLVPRGQYTSGKGS
       :. : ::::..:  .  .:  .:.. .::. :::: .:::.:: . :..::: :. :. .
CCDS13 GLALALFGGSQKYADDKNRIPIRGDPHILVVGDPGLGKSQMLQAACNVAPRGVYVCGNTT
            430       440       450       460       470       480  

      540       550       560       570       580       590        
pF1KE2 SAVGLTAYVMKDPETRQLVLQTGALVLSDNGICCIDEFDKMNESTRSVLHEVMEQQTLSI
       .. :::. . ::  . ...:..:::::.:.::: :::::::... ...: :.::::..:.
CCDS13 TTSGLTVTLSKDSSSGDFALEAGALVLGDQGICGIDEFDKMGNQHQALL-EAMEQQSISL
            490       500       510       520       530        540 

      600       610       620       630       640       650        
pF1KE2 AKAGIICQLNARTSVLAAANPIESQWNPKKTTIENIQLPHTLLSRFDLIFLMLDPQDEAY
       ::::..:.: ::::..:::::. ...:  ::. ::...  .:::::::.:..::  .: .
CCDS13 AKAGVVCSLPARTSIIAAANPVGGHYNKAKTVSENLKMGSALLSRFDLVFILLDTPNEHH
             550       560       570       580       590       600 

      660                                 670       680            
pF1KE2 DRRLAHHLVA--------------------------LYYQSEEQAEEEL----------L
       :. :..:..:                          :   ::.   :.:          .
CCDS13 DHLLSEHVIAIRAGKQRTISSATVARMNSQDSNTSVLEVVSEKPLSERLKVVPGETIDPI
             610       620       630       640       650       660 

            690       700       710       720       730       740  
pF1KE2 DMAVLKDYIAYAHSTIMPRLSEEASQALIEAYVDMRKIGSSRGMVSAYPRQLESLIRLAE
          .:. ::.::.. ..:::: ::...: . :...:: ..  .      :::::::::.:
CCDS13 PHQLLRKYIGYARQYVYPRLSTEAARVLQDFYLELRKQSQRLNSSPITTRQLESLIRLTE
             670       680       690       700       710       720 

            750       760       770       780       790       800  
pF1KE2 AHAKVRLSNKVEAIDVEEAKRLHREALKQSATDPRTGIVDISILTTGMSATSRKRKEELA
       :.:...: ...   :.:.  .. . ..  . .: . : .:.     : . ..:.  ... 
CCDS13 ARARLELREEATKEDAEDIVEIMKYSMLGTYSD-EFGNLDFERSQHGSGMSNRSTAKRFI
             730       740       750        760       770       780

            810       820       830       840       850       860  
pF1KE2 EALKKLILSKGKTPALKYQQLFEDIRGQSDIAITKDMFEEALRALADDDFLTVTGKTVRL
        ::.. .  .  .  ....:: ..:  . .: ..   ::. . .: :. .:   :  :  
CCDS13 SALNN-VAERTYNNIFQFHQL-RQIAKELNIQVAD--FENFIGSLNDQGYLLKKGPKVYQ
               790       800        810         820       830      

           
pF1KE2 L   
       :   
CCDS13 LQTM
        840

>>CCDS2179.1 MCM6 gene_id:4175|Hs108|chr2                 (821 aa)
 initn: 782 init1: 592 opt: 843  Z-score: 718.3  bits: 143.9 E(32554): 1.1e-33
Smith-Waterman score: 1042; 32.5% identity (63.3% similar) in 667 aa overlap (141-764:6-651)

              120       130       140        150       160         
pF1KE2 PVRQRPDLGSAQKGLQVDLQSDGAAAEDIVASEQSLG-QKLVIWGTDVNVAACKENFQRF
                                     :.: . : :.: .   :  .  :.. :  :
CCDS21                          MDLAAAAEPGAGSQHLEV--RDEVAEKCQKLFLDF
                                        10          20        30   

     170       180       190       200       210       220         
pF1KE2 LQRFIDPLAKEEENVGIDITEPLYMQRLGEINVIGEPFLNVNCEHIKSFDKNLYRQLISY
       :..:       . . :    :  :.:   :.    .  : :.   ...:...:   .   
CCDS21 LEEF-------QSSDG----EIKYLQLAEELIRPERNTLVVSFVDLEQFNQQLSTTIQEE
                   40            50        60        70        80  

     230       240       250       260       270        280        
pF1KE2 PQEVIPTFDMAVNEIFFDRYPDSILEHQIQVRPFNALKTKN-MRNLNPEDIDQLITISGM
         .: : .  :.. .  ::  .  : ... :  :. : :.. .:.:.   :  :  :::.
CCDS21 FYRVYPYLCRALKTFVKDR-KEIPLAKDFYV-AFQDLPTRHKIRELTSSRIGLLTRISGQ
             90       100        110        120       130       140

      290       300       310       320       330         340      
pF1KE2 VIRTSQLIPEMQEAFFQCQVCAHTTRVEMDRGRIAEPSVCGR--CHTTHSMALIHNRSLF
       :.::  . ::.  . : :  :  . :   .. . ..:..:    : . . . :  :.: :
CCDS21 VVRTHPVHPELVSGTFLCLDCQTVIRDVEQQFKYTQPNICRNPVCANRRRFLLDTNKSRF
              150       160       170       180       190       200

        350       360       370       380       390                
pF1KE2 SDKQMIKLQESPEDMPAGQTPHTVILFAHNDLVDKVQPGDRVNVTGIYRAVP--------
        : : ...::.  ..: :. :... .. . . :...: ::. . ::   .::        
CCDS21 VDFQKVRIQETQAELPRGSIPRSLEVILRAEAVESAQAGDKCDFTGTLIVVPDVSKLSTP
              210       220       230       240       250       260

         400       410                420                    430   
pF1KE2 ---IRVNPRVSNVKSVYKTH---------IDVIHYR-------------KTDAKRLHGLD
           ..: :::.: . :.:.         .  . ::             .  .:.:.  .
CCDS21 GARAETNSRVSGVDG-YETEGIRGLRALGVRDLSYRLVFLACCVAPTNPRFGGKELRDEE
              270        280       290       300       310         

             440       450       460       470       480       490 
pF1KE2 EEAE--QKLFSEKRVELLKELSRKPDIYERLASALAPSIYEHEDIKKGILLQLFGGTRKD
       . ::  .. .. :. : . :.:.  ..:. : ..: :.:. ....:.:.::.::::. : 
CCDS21 QTAESIKNQMTVKEWEKVFEMSQDKNLYHNLCTSLFPTIHGNDEVKRGVLLMLFGGVPKT
     320       330       340       350       360       370         

              500       510       520       530       540       550
pF1KE2 FSHTGRG-KFRAEINILLCGDPGTSKSQLLQYVYNLVPRGQYTSGKGSSAVGLTAYVMKD
          ::.: ..:..::. . :::.:.:::.:..: .. ::. :::::.:::.:::: :..:
CCDS21 ---TGEGTSLRGDINVCIVGDPSTAKSQFLKHVEEFSPRAVYTSGKASSAAGLTAAVVRD
        380       390       400       410       420       430      

              560       570       580       590       600       610
pF1KE2 PETRQLVLQTGALVLSDNGICCIDEFDKMNESTRSVLHEVMEQQTLSIAKAGIICQLNAR
        :....:...:::.:.:::.:::::::::.   . ..::.:::::.::.:::.   ::::
CCDS21 EESHEFVIEAGALMLADNGVCCIDEFDKMDVRDQVAIHEAMEQQTISITKAGVKATLNAR
        440       450       460       470       480       490      

              620       630       640       650       660       670
pF1KE2 TSVLAAANPIESQWNPKKTTIENIQLPHTLLSRFDLIFLMLDPQDEAYDRRLAHHLVALY
       ::.::::::: .... .:.  .::.:   ..:::::.:...:  .:. :  .:...: :.
CCDS21 TSILAAANPISGHYDRSKSLKQNINLSAPIMSRFDLFFILVDECNEVTDYAIARRIVDLH
        500       510       520       530       540       550      

              680       690       700       710          720       
pF1KE2 YQSEEQAEEELLDMAVLKDYIAYAHSTIMPRLSEEASQALIEAYVDMRK---IGSSRGMV
        . ::. .. . ..  .. :. .:.. . :..:.:. . ..: :  .:.    : ...  
CCDS21 SRIEESIDR-VYSLDDIRRYLLFARQ-FKPKISKESEDFIVEQYKHLRQRDGSGVTKSSW
        560        570       580        590       600       610    

       730       740       750       760       770       780       
pF1KE2 SAYPRQLESLIRLAEAHAKVRLSNKVEAIDVEEAKRLHREALKQSATDPRTGIVDISILT
           :::::.:::.:: :...  ..:.   :.:: ::                       
CCDS21 RITVRQLESMIRLSEAMARMHCCDEVQPKHVKEAFRLLNKSIIRVETPDVNLDQEEEIQM
          620       630       640       650       660       670    

       790       800       810       820       830       840       
pF1KE2 TGMSATSRKRKEELAEALKKLILSKGKTPALKYQQLFEDIRGQSDIAITKDMFEEALRAL
                                                                   
CCDS21 EVDEGAGGINGHADSPAPVNGINGYNEDINQESAPKASLRLGFSEYCRISNLIVLHLRKV
          680       690       700       710       720       730    

>>CCDS75468.1 MCM3 gene_id:4172|Hs108|chr6                (818 aa)
 initn: 998 init1: 599 opt: 756  Z-score: 645.0  bits: 130.4 E(32554): 1.3e-29
Smith-Waterman score: 1004; 34.7% identity (61.8% similar) in 599 aa overlap (221-764:78-658)

              200       210       220       230       240       250
pF1KE2 PLYMQRLGEINVIGEPFLNVNCEHIKSFDKNLYRQLISYPQEVIPTFDMAVNEIFFDRYP
                                     : ...:... :...  :  ...  .  .: 
CCDS75 AWRVPWCWTMWSCGRLREITWTSWTTRLLNNAFEELVAF-QRALKDFVASIDATYAKQYE
        50        60        70        80         90       100      

              260       270       280       290       300       310
pF1KE2 DSILEHQIQVRPFNALKTKNMRNLNPEDIDQLITISGMVIRTSQLIPEMQEAFFQCQVCA
           :  . ..   . :  . :.:.   .. .. . :.: . : . :.. ..   : .  
CCDS75 ----EFYVGLEGSFGSKHVSPRTLTSCFLSCVVCVEGIVTKCSLVRPKVVRSVHYCPATK
            110       120       130       140       150       160  

               320           330       340       350       360     
pF1KE2 HTT-RVEMDRGR-IAEPSVC---GRCHTTHSMALIHNRSLFSDKQMIKLQESPEDMPAGQ
       .:  :   :    .: ::      . . .. .   .. :...:.: : .:: ::  ::::
CCDS75 KTIERRYSDLTTLVAFPSSSVYPTKDEENNPLETEYGLSVYKDHQTITIQEMPEKAPAGQ
            170       180       190       200       210       220  

         370       380       390       400       410       420     
pF1KE2 TPHTVILFAHNDLVDKVQPGDRVNVTGIYRAVPIRVNPRVSNVKSVYKTHIDVIHYRKTD
        :..: ..  .:::::..:::::.:.: :: .: . .  .:..  .     .: .. : :
CCDS75 LPRSVDVILDDDLVDKAKPGDRVQVVGTYRCLPGKKGGYTSGTFRTVLIACNVKQMSK-D
            230       240       250       260       270       280  

         430       440       450       460       470       480     
pF1KE2 AKRLHGLDEEAEQKLFSEKRVELLKELSRKPDIYERLASALAPSIYEHEDIKKGILLQLF
       :.   . .. :. : ::.         .:. ::...::..:::::. :. .::.::  :.
CCDS75 AQPSFSAEDIAKIKKFSK---------TRSKDIFDQLAKSLAPSIHGHDYVKKAILCLLL
             290                300       310       320       330  

         490       500       510       520       530       540     
pF1KE2 GGTRKDFSHTGRGKFRAEINILLCGDPGTSKSQLLQYVYNLVPRGQYTSGKGSSAVGLTA
       ::...:. . .  ..:..::::: :::...:::::.::   .::.  :.:.:::.:::::
CCDS75 GGVERDLENGS--HIRGDINILLIGDPSVAKSQLLRYVLCTAPRAIPTTGRGSSGVGLTA
            340         350       360       370       380       390

         550       560       570       580       590       600     
pF1KE2 YVMKDPETRQLVLQTGALVLSDNGICCIDEFDKMNESTRSVLHEVMEQQTLSIAKAGIIC
        :  : :: .  :..::.::.: :. ::::::::..  :...::::::  ..::::::  
CCDS75 AVTTDQETGERRLEAGAMVLADRGVVCIDEFDKMSDMDRTAIHEVMEQGRVTIAKAGIHA
              400       410       420       430       440       450

         610       620       630       640       650       660     
pF1KE2 QLNARTSVLAAANPIESQWNPKKTTIENIQLPHTLLSRFDLIFLMLDPQDEAYDRRLAHH
       .:::: ::::::::. ....  :: .::: :  .:::::::.:.::: .:   ::... :
CCDS75 RLNARCSVLAAANPVYGRYDQYKTPMENIGLQDSLLSRFDLLFIMLDQMDPEQDREISDH
              460       470       480       490       500       510

         670                                                       
pF1KE2 LVALY----------------------------YQSEEQAE------------------E
       .. ..                            ...:.: .                  :
CCDS75 VLRMHRYRAPGEQDGDAMPLGSAVDILATDDPNFSQEDQQDTQIYEKHDNLLHGTKKKKE
              520       530       540       550       560       570

     680       690       700       710       720        730        
pF1KE2 ELLDMAVLKDYIAYAHSTIMPRLSEEASQALIEAYVDMRKIGS-SRGMVSAYP---RQLE
       .... : .: ::  :.  : : :..:..  . : :  .:.  : :   . . :   : ::
CCDS75 KMVSAAFMKKYIHVAK-IIKPVLTQESATYIAEEYSRLRSQDSMSSDTARTSPVTARTLE
              580        590       600       610       620         

         740       750       760       770       780       790     
pF1KE2 SLIRLAEAHAKVRLSNKVEAIDVEEAKRLHREALKQSATDPRTGIVDISILTTGMSATSR
       .::::: ::::.:.:. :.  :.::: .:                               
CCDS75 TLIRLATAHAKARMSKTVDLQDAEEAVELVQYAYFKKVLEKEKKRKKRSEDESETEDEEE
     630       640       650       660       670       680         

>>CCDS4940.2 MCM3 gene_id:4172|Hs108|chr6                 (853 aa)
 initn: 998 init1: 599 opt: 756  Z-score: 644.7  bits: 130.4 E(32554): 1.4e-29
Smith-Waterman score: 1010; 32.5% identity (59.8% similar) in 723 aa overlap (103-764:3-693)

             80        90       100         110       120       130
pF1KE2 PQMHSSAIPLDFDVSSPLTYGTPSSRVEGTPRSGV--RGTPVRQRPDLGSAQKGLQVDLQ
                                     :::    ::. .  : ..:: . :..    
CCDS49                             MLPRSPPLPRGN-LWWREEFGSFRAGVE----
                                           10         20           

              140        150       160       170       180         
pF1KE2 SDGAAAEDIVA-SEQSLGQKLVIWGTDVNVAACKENFQRFLQRFIDPLAKEEENVGIDIT
       :.    .:. . :  . :.  ..   ::..   ....  ::.        .::. ::   
CCDS49 SSWEPPRDFGGGSSLAAGMAGTVVLDDVELREAQRDYLDFLD--------DEEDQGI---
        30        40        50        60                70         

     190       200       210       220       230       240         
pF1KE2 EPLYMQRLGEINVIGEPFLNVNCEHIKSFDKNLYRQLISYPQEVIPTFDMAVNEIF--FD
          :.... :.   ..  : :: . ..  ...   .:..   : . .:. :....   .:
CCDS49 ---YQSKVRELISDNQYRLIVNVNDLRRKNEKRANRLLNNAFEELVAFQRALKDFVASID
            80        90       100       110       120       130   

        250       260       270       280       290       300      
pF1KE2 -RYPDSILEHQIQVRPFNALKTKNMRNLNPEDIDQLITISGMVIRTSQLIPEMQEAFFQC
         :  .  :  . ..   . :  . :.:.   .. .. . :.: . : . :.. ..   :
CCDS49 ATYAKQYEEFYVGLEGSFGSKHVSPRTLTSCFLSCVVCVEGIVTKCSLVRPKVVRSVHYC
           140       150       160       170       180       190   

        310        320           330       340       350       360 
pF1KE2 QVCAHTT-RVEMDRGR-IAEPSVC---GRCHTTHSMALIHNRSLFSDKQMIKLQESPEDM
        .  .:  :   :    .: ::      . . .. .   .. :...:.: : .:: ::  
CCDS49 PATKKTIERRYSDLTTLVAFPSSSVYPTKDEENNPLETEYGLSVYKDHQTITIQEMPEKA
           200       210       220       230       240       250   

             370       380       390       400       410       420 
pF1KE2 PAGQTPHTVILFAHNDLVDKVQPGDRVNVTGIYRAVPIRVNPRVSNVKSVYKTHIDVIHY
       :::: :..: ..  .:::::..:::::.:.: :: .: . .  .:..  .     .: ..
CCDS49 PAGQLPRSVDVILDDDLVDKAKPGDRVQVVGTYRCLPGKKGGYTSGTFRTVLIACNVKQM
           260       270       280       290       300       310   

             430       440       450       460       470       480 
pF1KE2 RKTDAKRLHGLDEEAEQKLFSEKRVELLKELSRKPDIYERLASALAPSIYEHEDIKKGIL
        : ::.   . .. :. : ::.         .:. ::...::..:::::. :. .::.::
CCDS49 SK-DAQPSFSAEDIAKIKKFSK---------TRSKDIFDQLAKSLAPSIHGHDYVKKAIL
            320       330                340       350       360   

             490       500       510       520       530       540 
pF1KE2 LQLFGGTRKDFSHTGRGKFRAEINILLCGDPGTSKSQLLQYVYNLVPRGQYTSGKGSSAV
         :.::...:. . ..  .:..::::: :::...:::::.::   .::.  :.:.:::.:
CCDS49 CLLLGGVERDLENGSH--IRGDINILLIGDPSVAKSQLLRYVLCTAPRAIPTTGRGSSGV
           370         380       390       400       410       420 

             550       560       570       580       590       600 
pF1KE2 GLTAYVMKDPETRQLVLQTGALVLSDNGICCIDEFDKMNESTRSVLHEVMEQQTLSIAKA
       :::: :  : :: .  :..::.::.: :. ::::::::..  :...::::::  ..::::
CCDS49 GLTAAVTTDQETGERRLEAGAMVLADRGVVCIDEFDKMSDMDRTAIHEVMEQGRVTIAKA
             430       440       450       460       470       480 

             610       620       630       640       650       660 
pF1KE2 GIICQLNARTSVLAAANPIESQWNPKKTTIENIQLPHTLLSRFDLIFLMLDPQDEAYDRR
       ::  .:::: ::::::::. ....  :: .::: :  .:::::::.:.::: .:   ::.
CCDS49 GIHARLNARCSVLAAANPVYGRYDQYKTPMENIGLQDSLLSRFDLLFIMLDQMDPEQDRE
             490       500       510       520       530       540 

             670                                                   
pF1KE2 LAHHLVALY----------------------------YQSEEQAE---------------
       .. :.. ..                            ...:.: .               
CCDS49 ISDHVLRMHRYRAPGEQDGDAMPLGSAVDILATDDPNFSQEDQQDTQIYEKHDNLLHGTK
             550       560       570       580       590       600 

         680       690       700       710       720        730    
pF1KE2 ---EELLDMAVLKDYIAYAHSTIMPRLSEEASQALIEAYVDMRKIGS-SRGMVSAYP---
          :.... : .: ::  :.  : : :..:..  . : :  .:.  : :   . . :   
CCDS49 KKKEKMVSAAFMKKYIHVAK-IIKPVLTQESATYIAEEYSRLRSQDSMSSDTARTSPVTA
             610       620        630       640       650       660

             740       750       760       770       780       790 
pF1KE2 RQLESLIRLAEAHAKVRLSNKVEAIDVEEAKRLHREALKQSATDPRTGIVDISILTTGMS
       : ::.::::: ::::.:.:. :.  :.::: .:                           
CCDS49 RTLETLIRLATAHAKARMSKTVDLQDAEEAVELVQYAYFKKVLEKEKKRKKRSEDESETE
              670       680       690       700       710       720

             800       810       820       830       840       850 
pF1KE2 ATSRKRKEELAEALKKLILSKGKTPALKYQQLFEDIRGQSDIAITKDMFEEALRALADDD
                                                                   
CCDS49 DEEEKSQEDQEQKRKRRKTRQPDAKDGDSYDPYDFSDTEEEMPQVHTPKTADSQETKESQ
              730       740       750       760       770       780

>>CCDS56447.1 MCM9 gene_id:254394|Hs108|chr6              (1143 aa)
 initn: 610 init1: 290 opt: 755  Z-score: 641.9  bits: 130.3 E(32554): 2e-29
Smith-Waterman score: 866; 30.7% identity (63.4% similar) in 632 aa overlap (229-831:61-659)

      200       210       220       230       240            250   
pF1KE2 EINVIGEPFLNVNCEHIKSFDKNLYRQLISYPQEVIPTFDMAVNEIFFD-----RYPDSI
                                     .:.::.  :: :. .  .        :...
CCDS56 ERDEDAHYPVVVNAMTLFETNMEIGEYFNMFPSEVLTIFDSALRRSALTILQSLSQPEAV
               40        50        60        70        80        90

            260         270         280       290       300        
pF1KE2 -LEHQIQVRPFNALKT--KNMRNLNPE--DIDQLITISGMVIRTSQLIPEMQ-EAFFQCQ
        .......: ...: .  . .:.  :.  :. ......: ::::: :.  .. :  ..:.
CCDS56 SMKQNLHAR-ISGLPVCPELVREHIPKTKDVGHFLSVTGTVIRTS-LVKVLEFERDYMCN
               100       110       120       130        140        

       310       320          330       340             350        
pF1KE2 VCAHTTRVEMDRGR---IAEPSVCGRCHTTHSMALIHNRSLFS------DKQMIKLQESP
        : :.  .. :  .   . .:: :   ..  :  .    .: :      : : ::.::. 
CCDS56 KCKHVFVIKADFEQYYTFCRPSSCPSLESCDSSKFTCLSGLSSSPTRCRDYQEIKIQEQV
      150       160       170       180       190       200        

      360       370       380       390       400       410        
pF1KE2 EDMPAGQTPHTVILFAHNDLVDKVQPGDRVNVTGIYRAVPIRVNPRVSNVKSVYKTHIDV
       . . .:. :... .. ..::::. . :: ... ::   :  : .:  ..:.   .  . .
CCDS56 QRLSVGSIPRSMKVILEDDLVDSCKSGDDLTIYGI---VMQRWKPFQQDVRCEVEIVLKA
      210       220       230       240          250       260     

      420       430         440       450       460         470    
pF1KE2 IHYRKTDAKRLHG--LDEEAEQKLFSEKRVELLKELSRKPDIYER--LASALAPSIYEHE
        .: ... ..  :  .:::. :: :     : . :  ..  .  :  . ..: :...   
CCDS56 -NYIQVNNEQSSGIIMDEEV-QKEF-----EDFWEYYKSDPFAGRNVILASLCPQVFGMY
          270       280             290       300       310        

          480       490       500       510       520       530    
pF1KE2 DIKKGILLQLFGGTRKDFSHTGRGKFRAEINILLCGDPGTSKSQLLQYVYNLVPRGQYTS
        .: .. . : :: ..  . ::  . :.: ..:: :::::.:::.:.:. ...::.  :.
CCDS56 LVKLAVAMVLAGGIQRT-DATGT-RVRGESHLLLVGDPGTGKSQFLKYAAKITPRSVLTT
      320       330        340        350       360       370      

          540       550       560       570       580       590    
pF1KE2 GKGSSAVGLTAYVMKDPETRQLVLQTGALVLSDNGICCIDEFDKMNESTRSVLHEVMEQQ
       : ::...:::. ..::  . .  :..:::::.: :.::::::....:  :. .::.::::
CCDS56 GIGSTSAGLTVTAVKD--SGEWNLEAGALVLADAGLCCIDEFNSLKEHDRTSIHEAMEQQ
        380       390         400       410       420       430    

          600       610       620       630       640       650    
pF1KE2 TLSIAKAGIICQLNARTSVLAAANPIESQWNPKKTTIENIQLPHTLLSRFDLIFLMLDPQ
       :.:.::::..:.::.::..:::.:: ..:..:....  :: :   ::::::::...:: .
CCDS56 TISVAKAGLVCKLNTRTTILAATNP-KGQYDPQESVSVNIALGSPLLSRFDLILVLLDTK
          440       450        460       470       480       490   

          660       670       680       690       700       710    
pF1KE2 DEAYDRRLAHHLVALYYQSEEQAEEELLDMAVLKDYIAYAHSTIMPRLSEEASQALIEAY
       .: .:: ..  .  :  ..  .  :.: .:  .: :.   .. ..: ::. ..:.:.. :
CCDS56 NEDWDRIISSFI--LENKGYPSKSEKLWSMEKMKTYFCLIRN-LQPTLSDVGNQVLLR-Y
           500         510       520       530        540          

          720       730       740       750       760       770    
pF1KE2 VDMRKIGSSRGMVSAYPRQLESLIRLAEAHAKVRLSNKVEAIDVEEAKRLHREALKQSAT
        .:.. .. :. . .  : ::::::::::::.. . . :   :.  .  . . ... .: 
CCDS56 YQMQRQSDCRNAARTTIRLLESLIRLAEAHARLMFRDTVTLEDAITVVSVMESSMQGGA-
     550       560       570       580       590       600         

          780       790       800          810       820           
pF1KE2 DPRTGIVDISILTTGMSATSRKRKEELAEALKK---LILSKGKTPALKYQQL--FEDIRG
                  :  :..:   .  :. .:  ..   ::: : .  .:  ..:  .: ...
CCDS56 -----------LLGGVNALHTSFPENPGEQYQRQCELILEKLELQSLLSEELRRLERLQN
                 610       620       630       640       650       

     830       840       850       860                             
pF1KE2 QSDIAITKDMFEEALRALADDDFLTVTGKTVRLL                          
       ::                                                          
CCDS56 QSVHQSQPRVLEVETTPGSLRNGPGEESNFRTSSQQEINYSTHIFSPGGSPEGSPVLDPP
       660       670       680       690       700       710       

>>CCDS3043.1 MCM2 gene_id:4171|Hs108|chr3                 (904 aa)
 initn: 923 init1: 619 opt: 752  Z-score: 640.9  bits: 129.7 E(32554): 2.2e-29
Smith-Waterman score: 1197; 31.5% identity (60.4% similar) in 826 aa overlap (21-769:2-802)

               10        20        30        40              50    
pF1KE2 MSSPASTPSRRGSRRGRATPAQTPRSEDARSSPSQRRRGED--STSTGE----LQPMPTS
                           :.. .:    :::.:::::.:  ..: :.     . . .:
CCDS30                    MAESSESFTMASSPAQRRRGNDPLTSSPGRSSRRTDALTSS
                                  10        20        30        40 

                        60            70        80        90       
pF1KE2 PGVDL-------------QSPAAQDV----LFSSPPQMHSSAIPLDFDVSSPLTYGTPSS
       :: ::             ..:  ..     :...  .    ::: ..:.      .  . 
CCDS30 PGRDLPPFEDESEGLLGTEGPLEEEEDGEELIGDGMERDYRAIP-ELDAYEAEGLALDDE
              50        60        70        80         90       100

       100       110              120                        130   
pF1KE2 RVEGTPRSGVRGTP--VRQRP-----DLGSAQKGL-----------------QVDLQS-D
        ::    :  ...   .:::       ::  ..::                 ::.  . :
CCDS30 DVEELTASQREAAERAMRQRDREAGRGLGRMRRGLLYDSDEEDEERPARKRRQVERATED
              110       120       130       140       150       160

            140           150       160       170       180        
pF1KE2 GAAAEDIVASEQSL----GQKLVIWGTDVNVAACKENFQRFLQRFIDPLAKEEENVGIDI
       :   :... : ..:    :...  :   :..:. . ...   .:: . :  . .. : ..
CCDS30 GEEDEEMIESIENLEDLKGHSVREW---VSMAGPRLEIH---HRFKNFLRTHVDSHGHNV
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pF1KE2 TEPLYMQRLGEINVIGEPFLNVNCEHIKSFDKNLYRQLISYPQEVIPTFDMAVNEIFFDR
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CCDS30 ----FKERISDMCKENRESLVVNYEDLAAREHVLAYFLPEAPAELLQIFDEAALEVVLAM
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pF1KE2 YP--DSILEHQIQVRPFNALKTKNMRNLNPEDIDQLITISGMVIRTSQLIPEMQEAFFQC
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CCDS30 YPKYDRITNH-IHVRISHLPLVEELRSLRQLHLNQLIRTSGVVTSCTGVLPQLSMVKYNC
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CCDS30 NKCNFVLGPFCQSQNQEVKPGSCPECQSAGPFEVNMEETIYQNYQRIRIQESPGKVAAGR
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CCDS30 LPRSKDAILLA--DLVDSCKPGDEIELTGIYHN-NYDGSLNTANGFPVFATVILANHVAK
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CCDS30 KDNKVAVGE--------LTDEDVKMITSLSKDQQIGEKIFASIAPSIYGHEDIKRGLALA
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       ::::  :. .  :. : :..::.::::::::.:::.:.:. ..  :. .:.:.:.:::::
CCDS30 LFGGEPKNPG--GKHKVRGDINVLLCGDPGTAKSQFLKYIEKVSSRAIFTTGQGASAVGL
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CCDS30 TAYVQRHPVSREWTLEAGALVLADRGVCLIDEFDKMNDQDRTSIHEAMEQQSISISKAGI
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CCDS30 VTSLQARCTVIAAANPIGGRYDPSLTFSENVDLTEPIISRFDILCVVRDTVDPVQDEMLA
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CCDS30 RFVVGSHVRHHPSNKEEEGLANGSAAEPAMPNTYGVEPLPQEVLKKYIIYAKERVHPKLN
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CCDS30 QMDQDKVAKMYSDLRKESMATGSIPITVRHIESMIRMAEAHARIHLRDYVIEDDVNMAIR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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