Result of FASTA (omim) for pFN21AE5321
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE5321, 283 aa
  1>>>pF1KE5321 283 - 283 aa - 283 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1312+/-0.000478; mu= 15.3346+/- 0.030
 mean_var=56.1824+/-11.813, 0's: 0 Z-trim(107.2): 40  B-trim: 104 in 1/48
 Lambda= 0.171109
 statistics sampled from 15268 (15298) to 15268 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.535), E-opt: 0.2 (0.179), width:  16
 Scan time:  5.850

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_005653 (OMIM: 610029) voltage-dependent anion-s ( 283) 1876 471.8 6.6e-133
NP_001129166 (OMIM: 610029) voltage-dependent anio ( 284) 1864 468.8 5.1e-132
XP_006716457 (OMIM: 610029) PREDICTED: voltage-dep ( 251) 1606 405.1 6.8e-113
NP_001311017 (OMIM: 193245) voltage-dependent anio ( 294) 1448 366.1 4.3e-101
NP_001171752 (OMIM: 193245) voltage-dependent anio ( 294) 1448 366.1 4.3e-101
NP_003366 (OMIM: 193245) voltage-dependent anion-s ( 294) 1448 366.1 4.3e-101
NP_001171712 (OMIM: 193245) voltage-dependent anio ( 309) 1448 366.1 4.5e-101
XP_016865311 (OMIM: 604492) PREDICTED: voltage-dep ( 283) 1318 334.0 1.9e-91
XP_005272132 (OMIM: 604492) PREDICTED: voltage-dep ( 283) 1318 334.0 1.9e-91
NP_003365 (OMIM: 604492) voltage-dependent anion-s ( 283) 1318 334.0 1.9e-91
XP_016865310 (OMIM: 604492) PREDICTED: voltage-dep ( 283) 1318 334.0 1.9e-91
XP_016865312 (OMIM: 604492) PREDICTED: voltage-dep ( 283) 1318 334.0 1.9e-91
NP_001311018 (OMIM: 193245) voltage-dependent anio ( 255) 1226 311.3 1.2e-84
NP_001311016 (OMIM: 193245) voltage-dependent anio ( 255) 1226 311.3 1.2e-84
NP_001311019 (OMIM: 193245) voltage-dependent anio ( 255) 1226 311.3 1.2e-84


>>NP_005653 (OMIM: 610029) voltage-dependent anion-selec  (283 aa)
 initn: 1876 init1: 1876 opt: 1876  Z-score: 2507.1  bits: 471.8 E(85289): 6.6e-133
Smith-Waterman score: 1876; 100.0% identity (100.0% similar) in 283 aa overlap (1-283:1-283)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MCNTPTYCDLGKAAKDVFNKGYGFGMVKIDLKTKSCSGVEFSTSGHAYTDTGKASGNLET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MCNTPTYCDLGKAAKDVFNKGYGFGMVKIDLKTKSCSGVEFSTSGHAYTDTGKASGNLET
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 KYKVCNYGLTFTQKWNTDNTLGTEISWENKLAEGLKLTLDTIFVPNTGKKSGKLKASYKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KYKVCNYGLTFTQKWNTDNTLGTEISWENKLAEGLKLTLDTIFVPNTGKKSGKLKASYKR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 DCFSVGSNVDIDFSGPTIYGWAVLAFEGWLAGYQMSFDTAKSKLSQNNFALGYKAADFQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DCFSVGSNVDIDFSGPTIYGWAVLAFEGWLAGYQMSFDTAKSKLSQNNFALGYKAADFQL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 HTHVNDGTEFGGSIYQKVNEKIETSINLAWTAGSNNTRFGIAAKYMLDCRTSLSAKVNNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 HTHVNDGTEFGGSIYQKVNEKIETSINLAWTAGSNNTRFGIAAKYMLDCRTSLSAKVNNA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280   
pF1KE5 SLIGLGYTQTLRPGVKLTLSALIDGKNFSAGGHKVGLGFELEA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SLIGLGYTQTLRPGVKLTLSALIDGKNFSAGGHKVGLGFELEA
              250       260       270       280   

>>NP_001129166 (OMIM: 610029) voltage-dependent anion-se  (284 aa)
 initn: 1603 init1: 1603 opt: 1864  Z-score: 2491.1  bits: 468.8 E(85289): 5.1e-132
Smith-Waterman score: 1864; 99.6% identity (99.6% similar) in 284 aa overlap (1-283:1-284)

               10        20        30         40        50         
pF1KE5 MCNTPTYCDLGKAAKDVFNKGYGFGMVKIDLKTKSCSGV-EFSTSGHAYTDTGKASGNLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
NP_001 MCNTPTYCDLGKAAKDVFNKGYGFGMVKIDLKTKSCSGVMEFSTSGHAYTDTGKASGNLE
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE5 TKYKVCNYGLTFTQKWNTDNTLGTEISWENKLAEGLKLTLDTIFVPNTGKKSGKLKASYK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TKYKVCNYGLTFTQKWNTDNTLGTEISWENKLAEGLKLTLDTIFVPNTGKKSGKLKASYK
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE5 RDCFSVGSNVDIDFSGPTIYGWAVLAFEGWLAGYQMSFDTAKSKLSQNNFALGYKAADFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RDCFSVGSNVDIDFSGPTIYGWAVLAFEGWLAGYQMSFDTAKSKLSQNNFALGYKAADFQ
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE5 LHTHVNDGTEFGGSIYQKVNEKIETSINLAWTAGSNNTRFGIAAKYMLDCRTSLSAKVNN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LHTHVNDGTEFGGSIYQKVNEKIETSINLAWTAGSNNTRFGIAAKYMLDCRTSLSAKVNN
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280   
pF1KE5 ASLIGLGYTQTLRPGVKLTLSALIDGKNFSAGGHKVGLGFELEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASLIGLGYTQTLRPGVKLTLSALIDGKNFSAGGHKVGLGFELEA
              250       260       270       280    

>>XP_006716457 (OMIM: 610029) PREDICTED: voltage-depende  (251 aa)
 initn: 1606 init1: 1606 opt: 1606  Z-score: 2147.7  bits: 405.1 E(85289): 6.8e-113
Smith-Waterman score: 1606; 98.4% identity (99.2% similar) in 249 aa overlap (35-283:3-251)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KE5 PTYCDLGKAAKDVFNKGYGFGMVKIDLKTKSCSGVEFSTSGHAYTDTGKASGNLETKYKV
                                     : . .:::::::::::::::::::::::::
XP_006                             MSSTKDMEFSTSGHAYTDTGKASGNLETKYKV
                                           10        20        30  

           70        80        90       100       110       120    
pF1KE5 CNYGLTFTQKWNTDNTLGTEISWENKLAEGLKLTLDTIFVPNTGKKSGKLKASYKRDCFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 CNYGLTFTQKWNTDNTLGTEISWENKLAEGLKLTLDTIFVPNTGKKSGKLKASYKRDCFS
             40        50        60        70        80        90  

          130       140       150       160       170       180    
pF1KE5 VGSNVDIDFSGPTIYGWAVLAFEGWLAGYQMSFDTAKSKLSQNNFALGYKAADFQLHTHV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VGSNVDIDFSGPTIYGWAVLAFEGWLAGYQMSFDTAKSKLSQNNFALGYKAADFQLHTHV
            100       110       120       130       140       150  

          190       200       210       220       230       240    
pF1KE5 NDGTEFGGSIYQKVNEKIETSINLAWTAGSNNTRFGIAAKYMLDCRTSLSAKVNNASLIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 NDGTEFGGSIYQKVNEKIETSINLAWTAGSNNTRFGIAAKYMLDCRTSLSAKVNNASLIG
            160       170       180       190       200       210  

          250       260       270       280   
pF1KE5 LGYTQTLRPGVKLTLSALIDGKNFSAGGHKVGLGFELEA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LGYTQTLRPGVKLTLSALIDGKNFSAGGHKVGLGFELEA
            220       230       240       250 

>>NP_001311017 (OMIM: 193245) voltage-dependent anion-se  (294 aa)
 initn: 1448 init1: 1448 opt: 1448  Z-score: 1935.9  bits: 366.1 E(85289): 4.3e-101
Smith-Waterman score: 1448; 73.5% identity (94.0% similar) in 283 aa overlap (1-283:12-294)

                          10        20        30        40         
pF1KE5            MCNTPTYCDLGKAAKDVFNKGYGFGMVKIDLKTKSCSGVEFSTSGHAYT
                  ::  :.: ::::::.:.::::.:::.::.:.:::::::::::::: . :
NP_001 MATHGQTCARPMCIPPSYADLGKAARDIFNKGFGFGLVKLDVKTKSCSGVEFSTSGSSNT
               10        20        30        40        50        60

      50        60        70        80        90       100         
pF1KE5 DTGKASGNLETKYKVCNYGLTFTQKWNTDNTLGTEISWENKLAEGLKLTLDTIFVPNTGK
       ::::..:.:::::: :.::::::.::::::::::::. :... .:::::.:: : :::::
NP_001 DTGKVTGTLETKYKWCEYGLTFTEKWNTDNTLGTEIAIEDQICQGLKLTFDTTFSPNTGK
               70        80        90       100       110       120

     110       120       130       140       150       160         
pF1KE5 KSGKLKASYKRDCFSVGSNVDIDFSGPTIYGWAVLAFEGWLAGYQMSFDTAKSKLSQNNF
       ::::.:.::::.:...: .::.::.::.:.: ::...:::::::::.::.:::::..:::
NP_001 KSGKIKSSYKRECINLGCDVDFDFAGPAIHGSAVFGYEGWLAGYQMTFDSAKSKLTRNNF
              130       140       150       160       170       180

     170       180       190       200       210       220         
pF1KE5 ALGYKAADFQLHTHVNDGTEFGGSIYQKVNEKIETSINLAWTAGSNNTRFGIAAKYMLDC
       :.::...::::::.::::::::::::::: : ..::.:::::.:.: :::::::::.:: 
NP_001 AVGYRTGDFQLHTNVNDGTEFGGSIYQKVCEDLDTSVNLAWTSGTNCTRFGIAAKYQLDP
              190       200       210       220       230       240

     230       240       250       260       270       280   
pF1KE5 RTSLSAKVNNASLIGLGYTQTLRPGVKLTLSALIDGKNFSAGGHKVGLGFELEA
        .:.::::::.::::.:::::::::::::::::.:::...::::::::..::::
NP_001 TASISAKVNNSSLIGVGYTQTLRPGVKLTLSALVDGKSINAGGHKVGLALELEA
              250       260       270       280       290    

>>NP_001171752 (OMIM: 193245) voltage-dependent anion-se  (294 aa)
 initn: 1448 init1: 1448 opt: 1448  Z-score: 1935.9  bits: 366.1 E(85289): 4.3e-101
Smith-Waterman score: 1448; 73.5% identity (94.0% similar) in 283 aa overlap (1-283:12-294)

                          10        20        30        40         
pF1KE5            MCNTPTYCDLGKAAKDVFNKGYGFGMVKIDLKTKSCSGVEFSTSGHAYT
                  ::  :.: ::::::.:.::::.:::.::.:.:::::::::::::: . :
NP_001 MATHGQTCARPMCIPPSYADLGKAARDIFNKGFGFGLVKLDVKTKSCSGVEFSTSGSSNT
               10        20        30        40        50        60

      50        60        70        80        90       100         
pF1KE5 DTGKASGNLETKYKVCNYGLTFTQKWNTDNTLGTEISWENKLAEGLKLTLDTIFVPNTGK
       ::::..:.:::::: :.::::::.::::::::::::. :... .:::::.:: : :::::
NP_001 DTGKVTGTLETKYKWCEYGLTFTEKWNTDNTLGTEIAIEDQICQGLKLTFDTTFSPNTGK
               70        80        90       100       110       120

     110       120       130       140       150       160         
pF1KE5 KSGKLKASYKRDCFSVGSNVDIDFSGPTIYGWAVLAFEGWLAGYQMSFDTAKSKLSQNNF
       ::::.:.::::.:...: .::.::.::.:.: ::...:::::::::.::.:::::..:::
NP_001 KSGKIKSSYKRECINLGCDVDFDFAGPAIHGSAVFGYEGWLAGYQMTFDSAKSKLTRNNF
              130       140       150       160       170       180

     170       180       190       200       210       220         
pF1KE5 ALGYKAADFQLHTHVNDGTEFGGSIYQKVNEKIETSINLAWTAGSNNTRFGIAAKYMLDC
       :.::...::::::.::::::::::::::: : ..::.:::::.:.: :::::::::.:: 
NP_001 AVGYRTGDFQLHTNVNDGTEFGGSIYQKVCEDLDTSVNLAWTSGTNCTRFGIAAKYQLDP
              190       200       210       220       230       240

     230       240       250       260       270       280   
pF1KE5 RTSLSAKVNNASLIGLGYTQTLRPGVKLTLSALIDGKNFSAGGHKVGLGFELEA
        .:.::::::.::::.:::::::::::::::::.:::...::::::::..::::
NP_001 TASISAKVNNSSLIGVGYTQTLRPGVKLTLSALVDGKSINAGGHKVGLALELEA
              250       260       270       280       290    

>>NP_003366 (OMIM: 193245) voltage-dependent anion-selec  (294 aa)
 initn: 1448 init1: 1448 opt: 1448  Z-score: 1935.9  bits: 366.1 E(85289): 4.3e-101
Smith-Waterman score: 1448; 73.5% identity (94.0% similar) in 283 aa overlap (1-283:12-294)

                          10        20        30        40         
pF1KE5            MCNTPTYCDLGKAAKDVFNKGYGFGMVKIDLKTKSCSGVEFSTSGHAYT
                  ::  :.: ::::::.:.::::.:::.::.:.:::::::::::::: . :
NP_003 MATHGQTCARPMCIPPSYADLGKAARDIFNKGFGFGLVKLDVKTKSCSGVEFSTSGSSNT
               10        20        30        40        50        60

      50        60        70        80        90       100         
pF1KE5 DTGKASGNLETKYKVCNYGLTFTQKWNTDNTLGTEISWENKLAEGLKLTLDTIFVPNTGK
       ::::..:.:::::: :.::::::.::::::::::::. :... .:::::.:: : :::::
NP_003 DTGKVTGTLETKYKWCEYGLTFTEKWNTDNTLGTEIAIEDQICQGLKLTFDTTFSPNTGK
               70        80        90       100       110       120

     110       120       130       140       150       160         
pF1KE5 KSGKLKASYKRDCFSVGSNVDIDFSGPTIYGWAVLAFEGWLAGYQMSFDTAKSKLSQNNF
       ::::.:.::::.:...: .::.::.::.:.: ::...:::::::::.::.:::::..:::
NP_003 KSGKIKSSYKRECINLGCDVDFDFAGPAIHGSAVFGYEGWLAGYQMTFDSAKSKLTRNNF
              130       140       150       160       170       180

     170       180       190       200       210       220         
pF1KE5 ALGYKAADFQLHTHVNDGTEFGGSIYQKVNEKIETSINLAWTAGSNNTRFGIAAKYMLDC
       :.::...::::::.::::::::::::::: : ..::.:::::.:.: :::::::::.:: 
NP_003 AVGYRTGDFQLHTNVNDGTEFGGSIYQKVCEDLDTSVNLAWTSGTNCTRFGIAAKYQLDP
              190       200       210       220       230       240

     230       240       250       260       270       280   
pF1KE5 RTSLSAKVNNASLIGLGYTQTLRPGVKLTLSALIDGKNFSAGGHKVGLGFELEA
        .:.::::::.::::.:::::::::::::::::.:::...::::::::..::::
NP_003 TASISAKVNNSSLIGVGYTQTLRPGVKLTLSALVDGKSINAGGHKVGLALELEA
              250       260       270       280       290    

>>NP_001171712 (OMIM: 193245) voltage-dependent anion-se  (309 aa)
 initn: 1448 init1: 1448 opt: 1448  Z-score: 1935.5  bits: 366.1 E(85289): 4.5e-101
Smith-Waterman score: 1448; 73.5% identity (94.0% similar) in 283 aa overlap (1-283:27-309)

                                         10        20        30    
pF1KE5                           MCNTPTYCDLGKAAKDVFNKGYGFGMVKIDLKTK
                                 ::  :.: ::::::.:.::::.:::.::.:.:::
NP_001 MSWCNELRLPALKQHSIGRGLESHITMCIPPSYADLGKAARDIFNKGFGFGLVKLDVKTK
               10        20        30        40        50        60

           40        50        60        70        80        90    
pF1KE5 SCSGVEFSTSGHAYTDTGKASGNLETKYKVCNYGLTFTQKWNTDNTLGTEISWENKLAEG
       ::::::::::: . :::::..:.:::::: :.::::::.::::::::::::. :... .:
NP_001 SCSGVEFSTSGSSNTDTGKVTGTLETKYKWCEYGLTFTEKWNTDNTLGTEIAIEDQICQG
               70        80        90       100       110       120

          100       110       120       130       140       150    
pF1KE5 LKLTLDTIFVPNTGKKSGKLKASYKRDCFSVGSNVDIDFSGPTIYGWAVLAFEGWLAGYQ
       ::::.:: : :::::::::.:.::::.:...: .::.::.::.:.: ::...::::::::
NP_001 LKLTFDTTFSPNTGKKSGKIKSSYKRECINLGCDVDFDFAGPAIHGSAVFGYEGWLAGYQ
              130       140       150       160       170       180

          160       170       180       190       200       210    
pF1KE5 MSFDTAKSKLSQNNFALGYKAADFQLHTHVNDGTEFGGSIYQKVNEKIETSINLAWTAGS
       :.::.:::::..::::.::...::::::.::::::::::::::: : ..::.:::::.:.
NP_001 MTFDSAKSKLTRNNFAVGYRTGDFQLHTNVNDGTEFGGSIYQKVCEDLDTSVNLAWTSGT
              190       200       210       220       230       240

          220       230       240       250       260       270    
pF1KE5 NNTRFGIAAKYMLDCRTSLSAKVNNASLIGLGYTQTLRPGVKLTLSALIDGKNFSAGGHK
       : :::::::::.::  .:.::::::.::::.:::::::::::::::::.:::...:::::
NP_001 NCTRFGIAAKYQLDPTASISAKVNNSSLIGVGYTQTLRPGVKLTLSALVDGKSINAGGHK
              250       260       270       280       290       300

          280   
pF1KE5 VGLGFELEA
       :::..::::
NP_001 VGLALELEA
                

>>XP_016865311 (OMIM: 604492) PREDICTED: voltage-depende  (283 aa)
 initn: 1343 init1: 1316 opt: 1318  Z-score: 1762.7  bits: 334.0 E(85289): 1.9e-91
Smith-Waterman score: 1318; 67.5% identity (91.9% similar) in 283 aa overlap (1-283:1-283)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MCNTPTYCDLGKAAKDVFNKGYGFGMVKIDLKTKSCSGVEFSTSGHAYTDTGKASGNLET
       :   ::: ::::.:.:::.::::::..:.:::::: .:.::..:: : :.: :..:.:::
XP_016 MAVPPTYADLGKSARDVFTKGYGFGLIKLDLKTKSENGLEFTSSGSANTETTKVTGSLET
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 KYKVCNYGLTFTQKWNTDNTLGTEISWENKLAEGLKLTLDTIFVPNTGKKSGKLKASYKR
       ::.  .::::::.::::::::::::. :..::.:::::.:. : ::::::..:.:..:::
XP_016 KYRWTEYGLTFTEKWNTDNTLGTEITVEDQLARGLKLTFDSSFSPNTGKKNAKIKTGYKR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 DCFSVGSNVDIDFSGPTIYGWAVLAFEGWLAGYQMSFDTAKSKLSQNNFALGYKAADFQL
       . ...: ..:.:..::.: :  ::..:::::::::.:.::::...:.:::.:::. .:::
XP_016 EHINLGCDMDFDIAGPSIRGALVLGYEGWLAGYQMNFETAKSRVTQSNFAVGYKTDEFQL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 HTHVNDGTEFGGSIYQKVNEKIETSINLAWTAGSNNTRFGIAAKYMLDCRTSLSAKVNNA
       ::.::::::::::::::::.:.::..:::::::..::::::::::..:  . .::::::.
XP_016 HTNVNDGTEFGGSIYQKVNKKLETAVNLAWTAGNSNTRFGIAAKYQIDPDACFSAKVNNS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280   
pF1KE5 SLIGLGYTQTLRPGVKLTLSALIDGKNFSAGGHKVGLGFELEA
       :::::::::::.::.:::::::.:::: .:::::.:::.:..:
XP_016 SLIGLGYTQTLKPGIKLTLSALLDGKNVNAGGHKLGLGLEFQA
              250       260       270       280   

>>XP_005272132 (OMIM: 604492) PREDICTED: voltage-depende  (283 aa)
 initn: 1343 init1: 1316 opt: 1318  Z-score: 1762.7  bits: 334.0 E(85289): 1.9e-91
Smith-Waterman score: 1318; 67.5% identity (91.9% similar) in 283 aa overlap (1-283:1-283)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MCNTPTYCDLGKAAKDVFNKGYGFGMVKIDLKTKSCSGVEFSTSGHAYTDTGKASGNLET
       :   ::: ::::.:.:::.::::::..:.:::::: .:.::..:: : :.: :..:.:::
XP_005 MAVPPTYADLGKSARDVFTKGYGFGLIKLDLKTKSENGLEFTSSGSANTETTKVTGSLET
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 KYKVCNYGLTFTQKWNTDNTLGTEISWENKLAEGLKLTLDTIFVPNTGKKSGKLKASYKR
       ::.  .::::::.::::::::::::. :..::.:::::.:. : ::::::..:.:..:::
XP_005 KYRWTEYGLTFTEKWNTDNTLGTEITVEDQLARGLKLTFDSSFSPNTGKKNAKIKTGYKR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 DCFSVGSNVDIDFSGPTIYGWAVLAFEGWLAGYQMSFDTAKSKLSQNNFALGYKAADFQL
       . ...: ..:.:..::.: :  ::..:::::::::.:.::::...:.:::.:::. .:::
XP_005 EHINLGCDMDFDIAGPSIRGALVLGYEGWLAGYQMNFETAKSRVTQSNFAVGYKTDEFQL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 HTHVNDGTEFGGSIYQKVNEKIETSINLAWTAGSNNTRFGIAAKYMLDCRTSLSAKVNNA
       ::.::::::::::::::::.:.::..:::::::..::::::::::..:  . .::::::.
XP_005 HTNVNDGTEFGGSIYQKVNKKLETAVNLAWTAGNSNTRFGIAAKYQIDPDACFSAKVNNS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280   
pF1KE5 SLIGLGYTQTLRPGVKLTLSALIDGKNFSAGGHKVGLGFELEA
       :::::::::::.::.:::::::.:::: .:::::.:::.:..:
XP_005 SLIGLGYTQTLKPGIKLTLSALLDGKNVNAGGHKLGLGLEFQA
              250       260       270       280   

>>NP_003365 (OMIM: 604492) voltage-dependent anion-selec  (283 aa)
 initn: 1343 init1: 1316 opt: 1318  Z-score: 1762.7  bits: 334.0 E(85289): 1.9e-91
Smith-Waterman score: 1318; 67.5% identity (91.9% similar) in 283 aa overlap (1-283:1-283)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MCNTPTYCDLGKAAKDVFNKGYGFGMVKIDLKTKSCSGVEFSTSGHAYTDTGKASGNLET
       :   ::: ::::.:.:::.::::::..:.:::::: .:.::..:: : :.: :..:.:::
NP_003 MAVPPTYADLGKSARDVFTKGYGFGLIKLDLKTKSENGLEFTSSGSANTETTKVTGSLET
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 KYKVCNYGLTFTQKWNTDNTLGTEISWENKLAEGLKLTLDTIFVPNTGKKSGKLKASYKR
       ::.  .::::::.::::::::::::. :..::.:::::.:. : ::::::..:.:..:::
NP_003 KYRWTEYGLTFTEKWNTDNTLGTEITVEDQLARGLKLTFDSSFSPNTGKKNAKIKTGYKR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 DCFSVGSNVDIDFSGPTIYGWAVLAFEGWLAGYQMSFDTAKSKLSQNNFALGYKAADFQL
       . ...: ..:.:..::.: :  ::..:::::::::.:.::::...:.:::.:::. .:::
NP_003 EHINLGCDMDFDIAGPSIRGALVLGYEGWLAGYQMNFETAKSRVTQSNFAVGYKTDEFQL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 HTHVNDGTEFGGSIYQKVNEKIETSINLAWTAGSNNTRFGIAAKYMLDCRTSLSAKVNNA
       ::.::::::::::::::::.:.::..:::::::..::::::::::..:  . .::::::.
NP_003 HTNVNDGTEFGGSIYQKVNKKLETAVNLAWTAGNSNTRFGIAAKYQIDPDACFSAKVNNS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280   
pF1KE5 SLIGLGYTQTLRPGVKLTLSALIDGKNFSAGGHKVGLGFELEA
       :::::::::::.::.:::::::.:::: .:::::.:::.:..:
NP_003 SLIGLGYTQTLKPGIKLTLSALLDGKNVNAGGHKLGLGLEFQA
              250       260       270       280   




283 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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