FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5321, 283 aa 1>>>pF1KE5321 283 - 283 aa - 283 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3280+/-0.0011; mu= 13.8822+/- 0.066 mean_var=53.7562+/-10.850, 0's: 0 Z-trim(100.6): 29 B-trim: 0 in 0/47 Lambda= 0.174928 statistics sampled from 6168 (6175) to 6168 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.559), E-opt: 0.2 (0.19), width: 16 Scan time: 2.170 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS6131.1 VDAC3 gene_id:7419|Hs108|chr8 ( 283) 1876 481.9 2.3e-136 CCDS47850.1 VDAC3 gene_id:7419|Hs108|chr8 ( 284) 1864 478.8 1.9e-135 CCDS7348.1 VDAC2 gene_id:7417|Hs108|chr10 ( 294) 1448 373.9 7.8e-104 CCDS53544.1 VDAC2 gene_id:7417|Hs108|chr10 ( 309) 1448 373.9 8.1e-104 CCDS4168.1 VDAC1 gene_id:7416|Hs108|chr5 ( 283) 1318 341.0 5.6e-94 >>CCDS6131.1 VDAC3 gene_id:7419|Hs108|chr8 (283 aa) initn: 1876 init1: 1876 opt: 1876 Z-score: 2561.7 bits: 481.9 E(32554): 2.3e-136 Smith-Waterman score: 1876; 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CCDS41 HTNVNDGTEFGGSIYQKVNKKLETAVNLAWTAGNSNTRFGIAAKYQIDPDACFSAKVNNS 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 SLIGLGYTQTLRPGVKLTLSALIDGKNFSAGGHKVGLGFELEA :::::::::::.::.:::::::.:::: .:::::.:::.:..: CCDS41 SLIGLGYTQTLKPGIKLTLSALLDGKNVNAGGHKLGLGLEFQA 250 260 270 280 283 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 23:46:25 2016 done: Mon Nov 7 23:46:26 2016 Total Scan time: 2.170 Total Display time: -0.010 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]