FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB6147, 596 aa 1>>>pF1KB6147 596 - 596 aa - 596 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.3439+/-0.00103; mu= -2.6724+/- 0.061 mean_var=331.2856+/-71.879, 0's: 0 Z-trim(113.1): 49 B-trim: 297 in 3/52 Lambda= 0.070465 statistics sampled from 13700 (13739) to 13700 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.747), E-opt: 0.2 (0.422), width: 16 Scan time: 3.190 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS6015.1 LZTS1 gene_id:11178|Hs108|chr8 ( 596) 3894 409.9 4.6e-114 CCDS7507.1 LZTS2 gene_id:84445|Hs108|chr10 ( 669) 673 82.5 1.9e-15 >>CCDS6015.1 LZTS1 gene_id:11178|Hs108|chr8 (596 aa) initn: 3894 init1: 3894 opt: 3894 Z-score: 2161.3 bits: 409.9 E(32554): 4.6e-114 Smith-Waterman score: 3894; 100.0% identity (100.0% similar) in 596 aa overlap (1-596:1-596) 10 20 30 40 50 60 pF1KB6 MGSVSSLISGHSFHSKHCRASQYKLRKSSHLKKLNRYSDGLLRFGFSQDSGHGKSSSKMG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS60 MGSVSSLISGHSFHSKHCRASQYKLRKSSHLKKLNRYSDGLLRFGFSQDSGHGKSSSKMG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB6 KSEDFFYIKVSQKARGSHHPDYTALSSGDLGGQAGVDFDPSTPPKLMPFSNQLEMGSEKG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS60 KSEDFFYIKVSQKARGSHHPDYTALSSGDLGGQAGVDFDPSTPPKLMPFSNQLEMGSEKG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB6 AVRPTAFKPVLPRSGAILHSSPESASHQLHPAPPDKPKEQELKPGLCSGALSDSGRNSMS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS60 AVRPTAFKPVLPRSGAILHSSPESASHQLHPAPPDKPKEQELKPGLCSGALSDSGRNSMS 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB6 SLPTHSTSSSYQLDPLVTPVGPTSRFGGSAHNITQGIVLQDSNMMSLKALSFSDGGSKLG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS60 SLPTHSTSSSYQLDPLVTPVGPTSRFGGSAHNITQGIVLQDSNMMSLKALSFSDGGSKLG 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB6 HSNKADKGPSCVRSPISTDECSIQELEQKLLEREGALQKLQRSFEEKELASSLAYEERPR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS60 HSNKADKGPSCVRSPISTDECSIQELEQKLLEREGALQKLQRSFEEKELASSLAYEERPR 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB6 RCRDELEGPEPKGGNKLKQASQKSQRAQQVLHLQVLQLQQEKRQLRQELESLMKEQDLLE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS60 RCRDELEGPEPKGGNKLKQASQKSQRAQQVLHLQVLQLQQEKRQLRQELESLMKEQDLLE 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB6 TKLRSYEREKTSFGPALEETQWEVCQKSGEISLLKQQLKESQTEVNAKASEILGLKAQLK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS60 TKLRSYEREKTSFGPALEETQWEVCQKSGEISLLKQQLKESQTEVNAKASEILGLKAQLK 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB6 DTRGKLEGLELRTQDLEGALRTKGLELEVCENELQRKKNEAELLREKVNLLEQELQELRA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS60 DTRGKLEGLELRTQDLEGALRTKGLELEVCENELQRKKNEAELLREKVNLLEQELQELRA 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB6 QAALARDMGPPTFPEDVPALQRELERLRAELREERQGHDQMSSGFQHERLVWKEEKEKVI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS60 QAALARDMGPPTFPEDVPALQRELERLRAELREERQGHDQMSSGFQHERLVWKEEKEKVI 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KB6 QYQKQLQQSYVAMYQRNQRLEKALQQLARGDSAGEPLEVDLEGADIPYEDIIATEI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS60 QYQKQLQQSYVAMYQRNQRLEKALQQLARGDSAGEPLEVDLEGADIPYEDIIATEI 550 560 570 580 590 >>CCDS7507.1 LZTS2 gene_id:84445|Hs108|chr10 (669 aa) initn: 1122 init1: 541 opt: 673 Z-score: 391.0 bits: 82.5 E(32554): 1.9e-15 Smith-Waterman score: 1080; 39.3% identity (62.1% similar) in 657 aa overlap (3-596:28-669) 10 20 30 pF1KB6 MGSVSSLISGHSFHSKHCRASQYKLRKSSHL-KKL :::::::: . : .. :. . . 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