FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5447, 328 aa 1>>>pF1KE5447 328 - 328 aa - 328 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4635+/-0.00131; mu= 14.9899+/- 0.078 mean_var=63.9587+/-13.019, 0's: 0 Z-trim(98.9): 30 B-trim: 0 in 0/47 Lambda= 0.160370 statistics sampled from 5537 (5545) to 5537 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.515), E-opt: 0.2 (0.17), width: 16 Scan time: 2.350 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS47752.1 PRKAG2 gene_id:51422|Hs108|chr7 ( 328) 2093 493.6 9.3e-140 CCDS43683.1 PRKAG2 gene_id:51422|Hs108|chr7 ( 525) 2093 493.6 1.4e-139 CCDS5928.1 PRKAG2 gene_id:51422|Hs108|chr7 ( 569) 2093 493.7 1.5e-139 CCDS8777.1 PRKAG1 gene_id:5571|Hs108|chr12 ( 331) 1555 369.1 2.8e-102 CCDS55824.1 PRKAG1 gene_id:5571|Hs108|chr12 ( 299) 1528 362.8 1.9e-100 CCDS2424.1 PRKAG3 gene_id:53632|Hs108|chr2 ( 489) 1388 330.5 1.7e-90 CCDS55825.1 PRKAG1 gene_id:5571|Hs108|chr12 ( 340) 1221 291.8 5.2e-79 >>CCDS47752.1 PRKAG2 gene_id:51422|Hs108|chr7 (328 aa) initn: 2093 init1: 2093 opt: 2093 Z-score: 2622.6 bits: 493.6 E(32554): 9.3e-140 Smith-Waterman score: 2093; 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100.0% identity (100.0% similar) in 328 aa overlap (1-328:198-525) 10 20 30 pF1KE5 MLEKLEFEDEAVEDSESGVYMRFMRSHKCY :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 PTRPPLASPTHYAPSKAAALAAALGPAEAGMLEKLEFEDEAVEDSESGVYMRFMRSHKCY 170 180 190 200 210 220 40 50 60 70 80 90 pF1KE5 DIVPTSSKLVVFDTTLQVKKAFFALVANGVRAAPLWESKKQSFVGMLTITDFINILHRYY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 DIVPTSSKLVVFDTTLQVKKAFFALVANGVRAAPLWESKKQSFVGMLTITDFINILHRYY 230 240 250 260 270 280 100 110 120 130 140 150 pF1KE5 KSPMVQIYELEEHKIETWRELYLQETFKPLVNISPDASLFDAVYSLIKNKIHRLPVIDPI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 KSPMVQIYELEEHKIETWRELYLQETFKPLVNISPDASLFDAVYSLIKNKIHRLPVIDPI 290 300 310 320 330 340 160 170 180 190 200 210 pF1KE5 SGNALYILTHKRILKFLQLFMSDMPKPAFMKQNLDELGIGTYHNIAFIHPDTPIIKALNI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 SGNALYILTHKRILKFLQLFMSDMPKPAFMKQNLDELGIGTYHNIAFIHPDTPIIKALNI 350 360 370 380 390 400 220 230 240 250 260 270 pF1KE5 FVERRISALPVVDESGKVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDITVTQALQHRSQYFEGVVKC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 FVERRISALPVVDESGKVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDITVTQALQHRSQYFEGVVKC 410 420 430 440 450 460 280 290 300 310 320 pF1KE5 NKLEILETIVDRIVRAEVHRLVVVNEADSIVGIISLSDILQALILTPAGAKQKETETE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 NKLEILETIVDRIVRAEVHRLVVVNEADSIVGIISLSDILQALILTPAGAKQKETETE 470 480 490 500 510 520 >>CCDS5928.1 PRKAG2 gene_id:51422|Hs108|chr7 (569 aa) initn: 2093 init1: 2093 opt: 2093 Z-score: 2618.8 bits: 493.7 E(32554): 1.5e-139 Smith-Waterman score: 2093; 100.0% identity (100.0% similar) in 328 aa overlap (1-328:242-569) 10 20 30 pF1KE5 MLEKLEFEDEAVEDSESGVYMRFMRSHKCY :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS59 PTRPPLASPTHYAPSKAAALAAALGPAEAGMLEKLEFEDEAVEDSESGVYMRFMRSHKCY 220 230 240 250 260 270 40 50 60 70 80 90 pF1KE5 DIVPTSSKLVVFDTTLQVKKAFFALVANGVRAAPLWESKKQSFVGMLTITDFINILHRYY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS59 DIVPTSSKLVVFDTTLQVKKAFFALVANGVRAAPLWESKKQSFVGMLTITDFINILHRYY 280 290 300 310 320 330 100 110 120 130 140 150 pF1KE5 KSPMVQIYELEEHKIETWRELYLQETFKPLVNISPDASLFDAVYSLIKNKIHRLPVIDPI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS59 KSPMVQIYELEEHKIETWRELYLQETFKPLVNISPDASLFDAVYSLIKNKIHRLPVIDPI 340 350 360 370 380 390 160 170 180 190 200 210 pF1KE5 SGNALYILTHKRILKFLQLFMSDMPKPAFMKQNLDELGIGTYHNIAFIHPDTPIIKALNI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS59 SGNALYILTHKRILKFLQLFMSDMPKPAFMKQNLDELGIGTYHNIAFIHPDTPIIKALNI 400 410 420 430 440 450 220 230 240 250 260 270 pF1KE5 FVERRISALPVVDESGKVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDITVTQALQHRSQYFEGVVKC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS59 FVERRISALPVVDESGKVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDITVTQALQHRSQYFEGVVKC 460 470 480 490 500 510 280 290 300 310 320 pF1KE5 NKLEILETIVDRIVRAEVHRLVVVNEADSIVGIISLSDILQALILTPAGAKQKETETE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS59 NKLEILETIVDRIVRAEVHRLVVVNEADSIVGIISLSDILQALILTPAGAKQKETETE 520 530 540 550 560 >>CCDS8777.1 PRKAG1 gene_id:5571|Hs108|chr12 (331 aa) initn: 1552 init1: 1552 opt: 1555 Z-score: 1949.8 bits: 369.1 E(32554): 2.8e-102 Smith-Waterman score: 1555; 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CCDS87 FFALVTNGVRAAPLWDSKKQSFVGMLTITDFINILHRYYKSALVQIYELEEHKIETWREV 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 YLQETFKPLVNISPDASLFDAVYSLIKNKIHRLPVIDPISGNALYILTHKRILKFLQLFM :::..::::: :::.::::::: :::.::::::::::: :::.:::::::::::::.::. CCDS87 YLQDSFKPLVCISPNASLFDAVSSLIRNKIHRLPVIDPESGNTLYILTHKRILKFLKLFI 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 SDMPKPAFMKQNLDELGIGTYHNIAFIHPDTPIIKALNIFVERRISALPVVDESGKVVDI ...::: ::...:.:: :::: :::... ::. ::.:::..:.::::::::.:.:::: CCDS87 TEFPKPEFMSKSLEELQIGTYANIAMVRTTTPVYVALGIFVQHRVSALPVVDEKGRVVDI 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 YSKFDVINLAAEKTYNNLDITVTQALQHRSQYFEGVVKCNKLEILETIVDRIVRAEVHRL :::::::::::::::::::..::.::::::.:::::.:: : ::::..:.:.:::::: CCDS87 YSKFDVINLAAEKTYNNLDVSVTKALQHRSHYFEGVLKCYLHETLETIINRLVEAEVHRL 250 260 270 280 290 300 300 310 320 pF1KE5 VVVNEADSIVGIISLSDILQALILTPAGAKQKETETE :::.: : . ::.:::::::::.:: .: :. CCDS87 VVVDENDVVKGIVSLSDILQALVLT-GGEKKP 310 320 330 >>CCDS55824.1 PRKAG1 gene_id:5571|Hs108|chr12 (299 aa) initn: 1525 init1: 1525 opt: 1528 Z-score: 1916.7 bits: 362.8 E(32554): 1.9e-100 Smith-Waterman score: 1528; 77.3% identity (93.3% similar) in 299 aa overlap (24-322:1-298) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MLEKLEFEDEAVEDSESGVYMRFMRSHKCYDIVPTSSKLVVFDTTLQVKKAFFALVANGV :.::.:::..:::::::::::.:::::::::::.::: CCDS55 MKSHRCYDLIPTSSKLVVFDTSLQVKKAFFALVTNGV 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 RAAPLWESKKQSFVGMLTITDFINILHRYYKSPMVQIYELEEHKIETWRELYLQETFKPL ::::::.::::::::::::::::::::::::: .::::::::::::::::.:::..:::: CCDS55 RAAPLWDSKKQSFVGMLTITDFINILHRYYKSALVQIYELEEHKIETWREVYLQDSFKPL 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 VNISPDASLFDAVYSLIKNKIHRLPVIDPISGNALYILTHKRILKFLQLFMSDMPKPAFM : :::.::::::: :::.::::::::::: :::.:::::::::::::.::....::: :: CCDS55 VCISPNASLFDAVSSLIRNKIHRLPVIDPESGNTLYILTHKRILKFLKLFITEFPKPEFM 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 KQNLDELGIGTYHNIAFIHPDTPIIKALNIFVERRISALPVVDESGKVVDIYSKFDVINL ...:.:: :::: :::... ::. ::.:::..:.::::::::.:.::::::::::::: CCDS55 SKSLEELQIGTYANIAMVRTTTPVYVALGIFVQHRVSALPVVDEKGRVVDIYSKFDVINL 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 AAEKTYNNLDITVTQALQHRSQYFEGVVKCNKLEILETIVDRIVRAEVHRLVVVNEADSI ::::::::::..::.::::::.:::::.:: : ::::..:.:.:::::::::.: : . CCDS55 AAEKTYNNLDVSVTKALQHRSHYFEGVLKCYLHETLETIINRLVEAEVHRLVVVDENDVV 220 230 240 250 260 270 310 320 pF1KE5 VGIISLSDILQALILTPAGAKQKETETE ::.:::::::::.:: .: :. CCDS55 KGIVSLSDILQALVLT-GGEKKP 280 290 >>CCDS2424.1 PRKAG3 gene_id:53632|Hs108|chr2 (489 aa) initn: 1380 init1: 1380 opt: 1388 Z-score: 1738.3 bits: 330.5 E(32554): 1.7e-90 Smith-Waterman score: 1388; 63.3% identity (88.9% similar) in 316 aa overlap (4-319:169-483) 10 20 30 pF1KE5 MLEKLEFEDEAVEDSESGVYMRFMRSHKCYDIV :: ..:: .. . .:::::. : ::: . CCDS24 FPATEAWECELEGLLEERPALCLSPQAPFPKLGWDDE-LRKPGAQIYMRFMQEHTCYDAM 140 150 160 170 180 190 40 50 60 70 80 90 pF1KE5 PTSSKLVVFDTTLQVKKAFFALVANGVRAAPLWESKKQSFVGMLTITDFINILHRYYKSP ::::::.::: :..::::::::::::::::::.:::::::::::::::: .:::::.:: CCDS24 ATSSKLVIFDTMLEIKKAFFALVANGVRAAPLWDSKKQSFVGMLTITDFILVLHRYYRSP 200 210 220 230 240 250 100 110 120 130 140 150 pF1KE5 MVQIYELEEHKIETWRELYLQETFKPLVNISPDASLFDAVYSLIKNKIHRLPVIDPISGN .:::::.:.::::::::.::: :::::.:::. :::.:::.::::.::::::.::.::: CCDS24 LVQIYEIEQHKIETWREIYLQGCFKPLVSISPNDSLFEAVYTLIKNRIHRLPVLDPVSGN 260 270 280 290 300 310 160 170 180 190 200 210 pF1KE5 ALYILTHKRILKFLQLFMSDMPKPAFMKQNLDELGIGTYHNIAFIHPDTPIIKALNIFVE .:.::::::.::::..: : .:.:.:. .....:::::....: . .::. ::.:::. CCDS24 VLHILTHKRLLKFLHIFGSLLPRPSFLYRTIQDLGIGTFRDLAVVLETAPILTALDIFVD 320 330 340 350 360 370 220 230 240 250 260 270 pF1KE5 RRISALPVVDESGKVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDITVTQALQHRSQYFEGVVKCNKL ::.::::::.: :.:: .::.::::.:::..:::.::..: .::..:. .:::..:. CCDS24 RRVSALPVVNECGQVVGLYSRFDVIHLAAQQTYNHLDMSVGEALRQRTLCLEGVLSCQPH 380 390 400 410 420 430 280 290 300 310 320 pF1KE5 EILETIVDRIVRAEVHRLVVVNEADSIVGIISLSDILQALILTPAGAKQKETETE : : ..:::.: .:::::.:.:.. ..:..:::::::::.:.::: CCDS24 ESLGEVIDRIAREQVHRLVLVDETQHLLGVVSLSDILQALVLSPAGIDALGA 440 450 460 470 480 >>CCDS55825.1 PRKAG1 gene_id:5571|Hs108|chr12 (340 aa) initn: 1218 init1: 1218 opt: 1221 Z-score: 1532.0 bits: 291.8 E(32554): 5.2e-79 Smith-Waterman score: 1527; 73.9% identity (90.3% similar) in 318 aa overlap (14-322:23-339) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MLEKLEFEDEAVEDSESGVYMRFMRSHKCYDIVPTSSKLVVFDTTLQVKKA .:...:: ::.::.:::..:::::::::::.:::::: CCDS55 METVISSDSSPAVENEHPQETPESNNSVYTSFMKSHRCYDLIPTSSKLVVFDTSLQVKKA 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 pF1KE5 FFALVANGVRAAPLWESKKQSFV---------GMLTITDFINILHRYYKSPMVQIYELEE :::::.:::::::::.::::::: :::::::::::::::::: .:::::::: CCDS55 FFALVTNGVRAAPLWDSKKQSFVVLRALSCPLGMLTITDFINILHRYYKSALVQIYELEE 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE5 HKIETWRELYLQETFKPLVNISPDASLFDAVYSLIKNKIHRLPVIDPISGNALYILTHKR ::::::::.:::..::::: :::.::::::: :::.::::::::::: :::.:::::::: CCDS55 HKIETWREVYLQDSFKPLVCISPNASLFDAVSSLIRNKIHRLPVIDPESGNTLYILTHKR 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 ILKFLQLFMSDMPKPAFMKQNLDELGIGTYHNIAFIHPDTPIIKALNIFVERRISALPVV :::::.::....::: ::...:.:: :::: :::... ::. ::.:::..:.:::::: CCDS55 ILKFLKLFITEFPKPEFMSKSLEELQIGTYANIAMVRTTTPVYVALGIFVQHRVSALPVV 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 DESGKVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDITVTQALQHRSQYFEGVVKCNKLEILETIVDR ::.:.:::::::::::::::::::::::..::.::::::.:::::.:: : ::::..: CCDS55 DEKGRVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDVSVTKALQHRSHYFEGVLKCYLHETLETIINR 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 pF1KE5 IVRAEVHRLVVVNEADSIVGIISLSDILQALILTPAGAKQKETETE .:.:::::::::.: : . ::.:::::::::.:: .: :. CCDS55 LVEAEVHRLVVVDENDVVKGIVSLSDILQALVLT-GGEKKP 310 320 330 340 328 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 00:51:07 2016 done: Tue Nov 8 00:51:07 2016 Total Scan time: 2.350 Total Display time: 0.010 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]