FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5468, 316 aa 1>>>pF1KE5468 316 - 316 aa - 316 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1984+/-0.000453; mu= 16.1632+/- 0.028 mean_var=68.1384+/-14.434, 0's: 0 Z-trim(109.2): 44 B-trim: 0 in 0/49 Lambda= 0.155374 statistics sampled from 17331 (17373) to 17331 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.543), E-opt: 0.2 (0.204), width: 16 Scan time: 4.470 The best scores are: opt bits E(85289) NP_058639 (OMIM: 604868) taste receptor type 2 mem ( 316) 2070 473.4 2.6e-133 NP_076408 (OMIM: 604793) taste receptor type 2 mem ( 318) 844 198.6 1.4e-50 NP_076407 (OMIM: 604794) taste receptor type 2 mem ( 309) 809 190.7 3.2e-48 NP_076406 (OMIM: 604795) taste receptor type 2 mem ( 312) 793 187.2 3.8e-47 NP_852094 (OMIM: 613966) taste receptor type 2 mem ( 314) 647 154.4 2.7e-37 NP_076410 (OMIM: 604791) taste receptor type 2 mem ( 307) 642 153.3 5.9e-37 NP_076409 (OMIM: 604792) taste receptor type 2 mem ( 303) 592 142.1 1.4e-33 NP_795365 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 mem ( 309) 585 140.5 4.1e-33 NP_795370 (OMIM: 613962) taste receptor type 2 mem ( 309) 581 139.6 7.7e-33 NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 mem ( 309) 572 137.6 3.1e-32 NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2 ( 319) 571 137.4 3.7e-32 NP_795366 (OMIM: 612669) taste receptor type 2 mem ( 309) 550 132.7 9.5e-31 NP_076411 (OMIM: 604790) taste receptor type 2 mem ( 317) 549 132.5 1.1e-30 XP_003961040 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 546 131.8 1.7e-30 NP_795367 (OMIM: 613967) taste receptor type 2 mem ( 299) 546 131.8 1.7e-30 XP_006726600 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 546 131.8 1.7e-30 NP_795369 (OMIM: 613961) taste receptor type 2 mem ( 299) 524 126.8 5.3e-29 NP_795364 (OMIM: 613965) taste receptor type 2 mem ( 307) 522 126.4 7.3e-29 NP_062545 (OMIM: 604796) taste receptor type 2 mem ( 299) 521 126.2 8.4e-29 NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 mem ( 299) 520 126.0 9.8e-29 NP_789787 (OMIM: 171200,607751) taste receptor typ ( 333) 491 119.5 9.7e-27 NP_795363 (OMIM: 613964) taste receptor type 2 mem ( 323) 471 115.0 2.1e-25 NP_803186 (OMIM: 613968) taste receptor type 2 mem ( 318) 458 112.1 1.6e-24 NP_058640 (OMIM: 604869) taste receptor type 2 mem ( 299) 444 108.9 1.3e-23 NP_058641 (OMIM: 103780,604867) taste receptor typ ( 291) 427 105.1 1.8e-22 NP_061853 (OMIM: 605062) taste receptor type 2 mem ( 299) 356 89.2 1.1e-17 >>NP_058639 (OMIM: 604868) taste receptor type 2 member (316 aa) initn: 2070 init1: 2070 opt: 2070 Z-score: 2514.3 bits: 473.4 E(85289): 2.6e-133 Smith-Waterman score: 2070; 100.0% identity (100.0% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-316) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_058 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_058 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 WLKWRVSRVMVWMLLGALLLSCGSTASLINEFKLYSVFRGIEATRNVTEHFRKKRSEYYL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_058 WLKWRVSRVMVWMLLGALLLSCGSTASLINEFKLYSVFRGIEATRNVTEHFRKKRSEYYL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 IHVLGTLWYLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRIILSFF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_058 IHVLGTLWYLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRIILSFF 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 FLFLLYFLAFLIASFGNFLPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQTFVVMLR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_058 FLFLLYFLAFLIASFGNFLPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQTFVVMLR 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 CESGHLKPGSKGPIFS :::::::::::::::: NP_058 CESGHLKPGSKGPIFS 310 >>NP_076408 (OMIM: 604793) taste receptor type 2 member (318 aa) initn: 824 init1: 476 opt: 844 Z-score: 1029.0 bits: 198.6 E(85289): 1.4e-50 Smith-Waterman score: 844; 44.6% identity (74.7% similar) in 296 aa overlap (1-293:1-294) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC : .. ..:.:. .:..::: : :: ::: .: : .... :.:.:.::. :: ::: NP_076 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLILTSLAISRICLLC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL .:: : :.. . :... .: :.::: ::.:::::::.::::.. : .::..: :: :: NP_076 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLFL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 WLKWRVSRVMVWMLLGALLLSCGSTASLINEFKLYSVFR-GIEATR--NVTEHFRKKRSE :.:::..::. :.::: ..:: :: .: . :: ..: : :.: : .... NP_076 WMKWRIDRVISWILLGCVVLSV--FISLPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVNKTQ 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 YYLIHVLGTLWYLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRIIL . ... .: : :. : : :. :::.:: :: :.: ..:. :::.:::: ::.. .. NP_076 HASTKLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKAVI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 SFFFLFLLYFLAFLIASFGNFLPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQTFVV ::..::. :.:.::::. . :.:.:..: ..:: ....::..:::::::::.::.. NP_076 SFLLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASLK 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 MLRCESGHLKPGSKGPIFS NP_076 VIWKVMSILKGRKFQQHKQI 300 310 >>NP_076407 (OMIM: 604794) taste receptor type 2 member (309 aa) initn: 864 init1: 410 opt: 809 Z-score: 986.8 bits: 190.7 E(85289): 3.2e-48 Smith-Waterman score: 809; 41.0% identity (75.1% similar) in 305 aa overlap (1-301:1-302) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC :.. ....:.:: .: :::: : .: ::: .:.: :..: :.:.:.:.. :: :. NP_076 MFSPADNIFIILITGEFILGILGNGYIALVNWIDWIKKKKISTVDYILTNLVIARICLIS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL ........: ..:... .. . .: . :::.:.:..:..:::.:.: ::::: ::: :: NP_076 VMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQQIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYFLKIASSSHPLFL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 WLKWRVSRVMVWMLLG----ALLLSCGSTASLINEFKLYSVFRGIEATRNVTEHFRKKRS ::::... :. :.::: .::.: .. : ....... . ::.:: :. .. NP_076 WLKWKIDMVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCDYRFHAIAKH---KRNITEMFHVSKI 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 EYYLIHVLGTLWYLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRII :. .: .:. . :.:::: :. ::. :: :::.:. .:.::::.::.: :::. . NP_076 PYFEPLTLFNLFAIVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGSRDPSTEVHVRAIKTM 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LSFFFLFLLYFLAFLIASFGNFLPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQTFV ::.:.:.::... .. .:. .. : :.: .::. ...:: :::.:::. :.::.:::: NP_076 TSFIFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEFGEIAAILYPLGHSLILIVLNNKLRQTFV 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 VMLRCESGHLKPGSKGPIFS :: : NP_076 RMLTCRKIACMI 300 >>NP_076406 (OMIM: 604795) taste receptor type 2 member (312 aa) initn: 783 init1: 429 opt: 793 Z-score: 967.3 bits: 187.2 E(85289): 3.8e-47 Smith-Waterman score: 793; 38.9% identity (74.9% similar) in 311 aa overlap (1-308:1-309) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC : . :....:: . ..:.:: : :: ::: .:.: . .:: :.:. .::. :: ::: NP_076 MPSAIEAIYIILIAGELTIGIWGNGFIVLVNCIDWLKRRDISLIDIILISLAISRICLLC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL .: :.:.. . :.:. ......:..: :::.:. :.:...::...: ::::..::: :. NP_076 VISLDGFFMLLFPGTYGNSVLVSIVNVVWTFANNSSLWFTSCLSIFYLLKIANISHPFFF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 WLKWRVSRVMVWMLLGALLLSCGSTASLINEFKLYSVFRGIEATRNVTEHFRKKRSEYYL ::: ....::. .:::..:.: .. :. : .:. . .:.: .:. .. . NP_076 WLKLKINKVMLAILLGSFLISLIISVPK-NDDMWYHLFK-VSHEENITWKFKVSKIPGTF 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 IHVLGTLWYLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRIILSFF .. .: . :.:. : :. ::.::: :::.:. ..:. :::.:::: :::. .. :. NP_076 KQLTLNLGVMVPFILCLISFFLLLFSLVRHTKQIRLHATGFRDPSTEAHMRAIKAVIIFL 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 FLFLLYFLAFLIASFGNFLPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQTFVVMLR .:...:. .::. . . ..:. :.. :::...:...:..::::::.:::::...:. ::: NP_076 LLLIVYYPVFLVMTSSALIPQGKLVLMIGDIVTVIFPSSHSFILIMGNSKLREAFLKMLR 240 250 260 270 280 290 310 pF1KE5 ---CESGHLKPGSKGPIFS : . :: NP_076 FVKCFLRRRKPFVP 300 310 >>NP_852094 (OMIM: 613966) taste receptor type 2 member (314 aa) initn: 606 init1: 586 opt: 647 Z-score: 790.4 bits: 154.4 E(85289): 2.7e-37 Smith-Waterman score: 647; 38.1% identity (69.0% similar) in 310 aa overlap (8-313:8-309) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC .::::. ..: ...: : :: ::: : .:.... .:::.: ::. : : NP_852 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL .:: ::::. .. . . . . . . . : .::::. ::::::...: .::: : : :: NP_852 VILFDSFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLFL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 WLKWRVSRVMVWMLLGALLLSCGSTASLINEFKLYSVFRGIEATRNVTEHFRKKRSEYYL ::.::.. ..: .:. .:.: ::. :. . .. .: :.: .. .... : NP_852 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLLI--FDSLVLEI-FIDISLNIIDKSNLTLYLDESKTLYDK 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE5 IHVLGTLWYLP---PLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRIIL . .: :: : :. . :.: .:..:: ::::.. .. .::: .::::.::..... NP_852 LSILKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMKMVM 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 SFFFLFLLYFLAFLIASFGNF-LPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQTFV ::.:::...:... .:.. : : ..: :.. ... : :. ::::::::::::.:: : NP_852 SFLFLFIVHFFSLQVANWIFFMLWNNKCIKFVMLALNAF-PSCHSFILILGNSKLQQTAV 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 VMLRCESGHLKPGSKGPIFS .: ::. .: : NP_852 RLL----WHLRNYTKTPNPLPL 300 310 >>NP_076410 (OMIM: 604791) taste receptor type 2 member (307 aa) initn: 634 init1: 316 opt: 642 Z-score: 784.5 bits: 153.3 E(85289): 5.9e-37 Smith-Waterman score: 642; 39.5% identity (70.4% similar) in 304 aa overlap (1-301:1-297) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC :. ..::.:... .. ..:.: : :: ::: . :.: .: ::.: ::. ::.:. NP_076 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCIDCAKNK-LSTIGFILTGLAISRIFLIW 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL ::.::.:. :::: . :: ... :. :.. :. :.:.:: :...: ::::.::. :: NP_076 IIITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFL 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 WLKWRVSRVMVWMLLGALLLSCGSTASLINEFKLYSVFRGIEATRNVTEHFRKKRSEYYL ::: :.. :. .:.. ::.: ::.: . ... .. ... . .:::.. NP_076 WLKSRTNMVLPFMIV-FLLIS-----SLLNFAYIAKILNDYKTKNDTVWDLNMYKSEYFI 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 IHVLGTLWYLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRIILSFF ..: .: . . .:: . .::.:: ::.::: .: :. :: .:::: .:.....::. NP_076 KQILLNLGVIFFFTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLISFI 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 pF1KE5 FLFLLYFLAFLIASFGNFLPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQ-TFVVM- .::.:::... : . ..:. :.: . : .:: ::::::::::::::: .. :. NP_076 ILFILYFIGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLRVLQ 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 -LRCESGHLKPGSKGPIFS :.: NP_076 QLKCCEKRKNLRVT 300 >>NP_076409 (OMIM: 604792) taste receptor type 2 member (303 aa) initn: 528 init1: 295 opt: 592 Z-score: 724.0 bits: 142.1 E(85289): 1.4e-33 Smith-Waterman score: 592; 35.7% identity (66.3% similar) in 300 aa overlap (1-298:1-295) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC : . ..: .. ..: .: : : :: :.: .: . ...: : .. ::. :: :. NP_076 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL ::.. :: :: ..:. :: .::...:::: ....: ::::::: :.:: NP_076 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFSWIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAFL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 WLKWRVSRVMVWMLLGALLLSCGSTASLINEFKLYSVFRGIEATRNVTEHFRKKRSEYYL .:::::..:.. .:::.:.. . .. ..: . . : ::.: .: . : . NP_076 YLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDW--LDRYE--RNTTWNFSMSDFETFS 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE5 IHV--LGTLWYLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRIILS . : :.. : :. :.. :. :::::: .: ..: : . ::: :..: :..:..: NP_076 VSVKFTMTMFSLTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIVIS 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 FFFLFLLYFLAFLIASFGNFLPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQTFVVM :.... .:: :: :. . : .. . :. :.. .: :..:::.:::::.::.:.:... NP_076 FLLFYASFFLCVLI-SWISELYQNTVIYMLCETIGVFSPSSHSFLLILGNAKLRQAFLLV 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 LRCESGHLKPGSKGPIFS NP_076 AAKVWAKR 300 >>NP_795365 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 member (309 aa) initn: 527 init1: 237 opt: 585 Z-score: 715.4 bits: 140.5 E(85289): 4.1e-33 Smith-Waterman score: 585; 36.5% identity (67.2% similar) in 299 aa overlap (1-296:1-291) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC :. . .: : . :..: ..: :: :::. ::: ...:..: :.:.::. :. :: NP_795 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL ..: . . ..: .. . .. :. ::.: :::: :...: ::::.::. :: NP_795 VLLLNWYSTVLNPAFNSVEVRTTAYNI-WAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSNFIFL 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE5 WLKWRVSRVMVWMLLGALL-LSCGSTASLINEFKLYSVFRGIEATRNVTEHFRKKRSEYY :: ::. :.. :::: :: :.: . .::. . :.: :.: ... : . :. 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