Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2335
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2335, 1480 aa
1>>>pF1KE2335 1480 - 1480 aa - 1480 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4402+/-0.00134; mu= 22.9968+/- 0.080
mean_var=71.8190+/-14.641, 0's: 0 Z-trim(99.4): 84 B-trim: 25 in 1/49
Lambda= 0.151340
statistics sampled from 5625 (5709) to 5625 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.49), E-opt: 0.2 (0.175), width: 16
Scan time: 4.720
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5773.1 CFTR gene_id:1080|Hs108|chr7 (1480) 9582 2102.8 0
CCDS10733.1 ABCC11 gene_id:85320|Hs108|chr16 (1344) 891 205.2 1.1e-51
CCDS10732.1 ABCC11 gene_id:85320|Hs108|chr16 (1382) 891 205.2 1.1e-51
CCDS76643.1 ABCC4 gene_id:10257|Hs108|chr13 ( 784) 664 155.5 5.7e-37
CCDS45061.1 ABCC4 gene_id:10257|Hs108|chr13 ( 859) 664 155.6 6.2e-37
CCDS9474.1 ABCC4 gene_id:10257|Hs108|chr13 (1325) 664 155.7 8.8e-37
CCDS4896.1 ABCC10 gene_id:89845|Hs108|chr6 (1464) 633 148.9 1e-34
CCDS10568.1 ABCC6 gene_id:368|Hs108|chr16 (1503) 610 143.9 3.5e-33
CCDS42122.1 ABCC1 gene_id:4363|Hs108|chr16 (1531) 604 142.6 8.7e-33
CCDS31437.1 ABCC8 gene_id:6833|Hs108|chr11 (1581) 586 138.7 1.4e-31
CCDS73264.1 ABCC8 gene_id:6833|Hs108|chr11 (1582) 586 138.7 1.4e-31
CCDS8693.1 ABCC9 gene_id:10060|Hs108|chr12 (1549) 575 136.3 7.1e-31
CCDS8694.1 ABCC9 gene_id:10060|Hs108|chr12 (1549) 568 134.7 2e-30
CCDS10730.1 ABCC12 gene_id:94160|Hs108|chr16 (1359) 559 132.7 7.2e-30
CCDS7484.1 ABCC2 gene_id:1244|Hs108|chr10 (1545) 553 131.5 2e-29
CCDS43176.1 ABCC5 gene_id:10057|Hs108|chr3 (1437) 541 128.8 1.1e-28
CCDS32681.1 ABCC3 gene_id:8714|Hs108|chr17 (1527) 520 124.3 2.9e-27
CCDS56430.1 ABCC10 gene_id:89845|Hs108|chr6 (1492) 485 116.6 5.7e-25
CCDS65290.1 ABCB7 gene_id:22|Hs108|chrX ( 712) 401 98.1 1e-19
CCDS75994.1 ABCB7 gene_id:22|Hs108|chrX ( 713) 401 98.1 1e-19
CCDS65291.1 ABCB7 gene_id:22|Hs108|chrX ( 752) 401 98.1 1.1e-19
CCDS14428.1 ABCB7 gene_id:22|Hs108|chrX ( 753) 401 98.1 1.1e-19
CCDS2436.1 ABCB6 gene_id:10058|Hs108|chr2 ( 842) 373 92.0 8.1e-18
CCDS5608.1 ABCB1 gene_id:5243|Hs108|chr7 (1280) 369 91.2 2.1e-17
CCDS5371.1 ABCB5 gene_id:340273|Hs108|chr7 ( 812) 363 89.8 3.6e-17
CCDS55090.1 ABCB5 gene_id:340273|Hs108|chr7 (1257) 363 89.9 5.1e-17
CCDS5607.1 ABCB4 gene_id:5244|Hs108|chr7 (1232) 362 89.7 5.9e-17
CCDS5605.1 ABCB4 gene_id:5244|Hs108|chr7 (1279) 362 89.7 6.1e-17
CCDS45739.1 ABCC3 gene_id:8714|Hs108|chr17 ( 572) 351 87.1 1.7e-16
CCDS1580.1 ABCB10 gene_id:23456|Hs108|chr1 ( 738) 345 85.9 5e-16
CCDS64798.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 ( 630) 339 84.5 1.1e-15
CCDS5913.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 ( 718) 339 84.5 1.2e-15
CCDS64799.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 ( 735) 339 84.6 1.2e-15
CCDS46444.1 ABCB11 gene_id:8647|Hs108|chr2 (1321) 324 81.4 2e-14
CCDS64800.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 ( 693) 297 75.4 6.8e-13
CCDS58286.1 ABCB9 gene_id:23457|Hs108|chr12 ( 703) 297 75.4 6.9e-13
CCDS5606.1 ABCB4 gene_id:5244|Hs108|chr7 (1286) 291 74.2 2.8e-12
CCDS9241.1 ABCB9 gene_id:23457|Hs108|chr12 ( 766) 285 72.8 4.6e-12
>>CCDS5773.1 CFTR gene_id:1080|Hs108|chr7 (1480 aa)
initn: 9582 init1: 9582 opt: 9582 Z-score: 11296.3 bits: 2102.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9582; 100.0% identity (100.0% similar) in 1480 aa overlap (1-1480:1-1480)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MQRSPLEKASVVSKLFFSWTRPILRKGYRQRLELSDIYQIPSVDSADNLSEKLEREWDRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 MQRSPLEKASVVSKLFFSWTRPILRKGYRQRLELSDIYQIPSVDSADNLSEKLEREWDRE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LASKKNPKLINALRRCFFWRFMFYGIFLYLGEVTKAVQPLLLGRIIASYDPDNKEERSIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LASKKNPKLINALRRCFFWRFMFYGIFLYLGEVTKAVQPLLLGRIIASYDPDNKEERSIA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 IYLGIGLCLLFIVRTLLLHPAIFGLHHIGMQMRIAMFSLIYKKTLKLSSRVLDKISIGQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 IYLGIGLCLLFIVRTLLLHPAIFGLHHIGMQMRIAMFSLIYKKTLKLSSRVLDKISIGQL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 VSLLSNNLNKFDEGLALAHFVWIAPLQVALLMGLIWELLQASAFCGLGFLIVLALFQAGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 VSLLSNNLNKFDEGLALAHFVWIAPLQVALLMGLIWELLQASAFCGLGFLIVLALFQAGL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 GRMMMKYRDQRAGKISERLVITSEMIENIQSVKAYCWEEAMEKMIENLRQTELKLTRKAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 GRMMMKYRDQRAGKISERLVITSEMIENIQSVKAYCWEEAMEKMIENLRQTELKLTRKAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 YVRYFNSSAFFFSGFFVVFLSVLPYALIKGIILRKIFTTISFCIVLRMAVTRQFPWAVQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 YVRYFNSSAFFFSGFFVVFLSVLPYALIKGIILRKIFTTISFCIVLRMAVTRQFPWAVQT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 WYDSLGAINKIQDFLQKQEYKTLEYNLTTTEVVMENVTAFWEEGFGELFEKAKQNNNNRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 WYDSLGAINKIQDFLQKQEYKTLEYNLTTTEVVMENVTAFWEEGFGELFEKAKQNNNNRK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 TSNGDDSLFFSNFSLLGTPVLKDINFKIERGQLLAVAGSTGAGKTSLLMVIMGELEPSEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 TSNGDDSLFFSNFSLLGTPVLKDINFKIERGQLLAVAGSTGAGKTSLLMVIMGELEPSEG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 KIKHSGRISFCSQFSWIMPGTIKENIIFGVSYDEYRYRSVIKACQLEEDISKFAEKDNIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 KIKHSGRISFCSQFSWIMPGTIKENIIFGVSYDEYRYRSVIKACQLEEDISKFAEKDNIV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 LGEGGITLSGGQRARISLARAVYKDADLYLLDSPFGYLDVLTEKEIFESCVCKLMANKTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LGEGGITLSGGQRARISLARAVYKDADLYLLDSPFGYLDVLTEKEIFESCVCKLMANKTR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 ILVTSKMEHLKKADKILILHEGSSYFYGTFSELQNLQPDFSSKLMGCDSFDQFSAERRNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 ILVTSKMEHLKKADKILILHEGSSYFYGTFSELQNLQPDFSSKLMGCDSFDQFSAERRNS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 ILTETLHRFSLEGDAPVSWTETKKQSFKQTGEFGEKRKNSILNPINSIRKFSIVQKTPLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 ILTETLHRFSLEGDAPVSWTETKKQSFKQTGEFGEKRKNSILNPINSIRKFSIVQKTPLQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 MNGIEEDSDEPLERRLSLVPDSEQGEAILPRISVISTGPTLQARRRQSVLNLMTHSVNQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 MNGIEEDSDEPLERRLSLVPDSEQGEAILPRISVISTGPTLQARRRQSVLNLMTHSVNQG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 QNIHRKTTASTRKVSLAPQANLTELDIYSRRLSQETGLEISEEINEEDLKECFFDDMESI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 QNIHRKTTASTRKVSLAPQANLTELDIYSRRLSQETGLEISEEINEEDLKECFFDDMESI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 PAVTTWNTYLRYITVHKSLIFVLIWCLVIFLAEVAASLVVLWLLGNTPLQDKGNSTHSRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 PAVTTWNTYLRYITVHKSLIFVLIWCLVIFLAEVAASLVVLWLLGNTPLQDKGNSTHSRN
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 NSYAVIITSTSSYYVFYIYVGVADTLLAMGFFRGLPLVHTLITVSKILHHKMLHSVLQAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 NSYAVIITSTSSYYVFYIYVGVADTLLAMGFFRGLPLVHTLITVSKILHHKMLHSVLQAP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 MSTLNTLKAGGILNRFSKDIAILDDLLPLTIFDFIQLLLIVIGAIAVVAVLQPYIFVATV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 MSTLNTLKAGGILNRFSKDIAILDDLLPLTIFDFIQLLLIVIGAIAVVAVLQPYIFVATV
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 PVIVAFIMLRAYFLQTSQQLKQLESEGRSPIFTHLVTSLKGLWTLRAFGRQPYFETLFHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 PVIVAFIMLRAYFLQTSQQLKQLESEGRSPIFTHLVTSLKGLWTLRAFGRQPYFETLFHK
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 ALNLHTANWFLYLSTLRWFQMRIEMIFVIFFIAVTFISILTTGEGEGRVGIILTLAMNIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 ALNLHTANWFLYLSTLRWFQMRIEMIFVIFFIAVTFISILTTGEGEGRVGIILTLAMNIM
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 STLQWAVNSSIDVDSLMRSVSRVFKFIDMPTEGKPTKSTKPYKNGQLSKVMIIENSHVKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 STLQWAVNSSIDVDSLMRSVSRVFKFIDMPTEGKPTKSTKPYKNGQLSKVMIIENSHVKK
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE2 DDIWPSGGQMTVKDLTAKYTEGGNAILENISFSISPGQRVGLLGRTGSGKSTLLSAFLRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 DDIWPSGGQMTVKDLTAKYTEGGNAILENISFSISPGQRVGLLGRTGSGKSTLLSAFLRL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE2 LNTEGEIQIDGVSWDSITLQQWRKAFGVIPQKVFIFSGTFRKNLDPYEQWSDQEIWKVAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LNTEGEIQIDGVSWDSITLQQWRKAFGVIPQKVFIFSGTFRKNLDPYEQWSDQEIWKVAD
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE2 EVGLRSVIEQFPGKLDFVLVDGGCVLSHGHKQLMCLARSVLSKAKILLLDEPSAHLDPVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 EVGLRSVIEQFPGKLDFVLVDGGCVLSHGHKQLMCLARSVLSKAKILLLDEPSAHLDPVT
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE2 YQIIRRTLKQAFADCTVILCEHRIEAMLECQQFLVIEENKVRQYDSIQKLLNERSLFRQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 YQIIRRTLKQAFADCTVILCEHRIEAMLECQQFLVIEENKVRQYDSIQKLLNERSLFRQA
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480
pF1KE2 ISPSDRVKLFPHRNSSKCKSKPQIAALKEETEEEVQDTRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 ISPSDRVKLFPHRNSSKCKSKPQIAALKEETEEEVQDTRL
1450 1460 1470 1480
>>CCDS10733.1 ABCC11 gene_id:85320|Hs108|chr16 (1344 aa)
initn: 1440 init1: 515 opt: 891 Z-score: 1041.6 bits: 205.2 E(32554): 1.1e-51
Smith-Waterman score: 1484; 25.8% identity (57.8% similar) in 1458 aa overlap (5-1437:85-1332)
10 20 30
pF1KE2 MQRSPLEKASVVSKLFFSWTRPILRKGYRQRLEL
::..:.. : : :: :.. .. :.::.
CCDS10 RAAVPPWGKYDAALRTMIPFRPKPRFPAPQPLDNAGLFSYLTVSWLTPLMIQSLRSRLDE
60 70 80 90 100 110
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 SDIYQIPSVDSADNLSEKLEREWDRELASKKNPK--LINALRRCFFWRFMFYGIFLYLGE
. : . :..:. ..:.: :..:.. . : .. .. : :..: ...
CCDS10 NTIPPLSVHDASDKNVQRLHRLWEEEVSRRGIEKASVLLVMLRFQRTRLIFDALLGICFC
120 130 140 150 160 170
100 110 120 130 140
pF1KE2 VTKAVQPLLLGRIIASYDPDNKEERSIAIYLGIGLCL-LFI---VRTLLLHPAIFGLHHI
..... :.:. : :. ::. . :.:::. ::. :..: . . . ..
CCDS10 IASVLGPILIIPKILEYS----EEQLGNVVHGVGLCFALFLSECVKSLSFSSSWIINQRT
180 190 200 210 220 230
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 GMQMRIAMFSLIYKKTLKLSSRVLDKISIGQLVSLLSNNLNKFDEGLALAHFVWIAPLQV
....: :. :. ..: ....: . .:. :. .:......: . ::. . .: :. ..
CCDS10 AIRFRAAVSSFAFEKLIQFKSVI--HITSGEAISFFTGDVNYLFEGVCYGPLVLITCASL
240 250 260 270 280
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 ALLMGLIWELLQASAFCG-LGFLIV--LALFQAGLGRMMMKYRDQRAGKISERLVITSEM
.. . .. .:: . : .:.: ::.: . :: .: . . . ..:. .:::.
CCDS10 VICSISSYFIIGYTAFIAILCYLLVFPLAVF---MTRMAVKAQHHTSEVSDQRIRVTSEV
290 300 310 320 330 340
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 IENIQSVKAYCWEEAMEKMIENLRQTELKLTRKAAYVRYFNSSAFFFSGFFVVFLSVLPY
. :. .: : ::. . :.::.::. : :: .: . :. ..: ..:. .. . :: .
CCDS10 LTCIKLIKMYTWEKPFAKIIEDLRRKERKLLEKCGLVQSLTSITLFIIPTVATAVWVLIH
350 360 370 380 390 400
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 ALIKGIILRKI-FTTISFCIVLRMAVTRQFPWAVQTWYDSLGAINKIQDFLQKQE--YKT
. .: . .. :. .. .::..: : ::. .: .:. ... :. .. . .
CCDS10 TSLKLKLTASMAFSMLASLNLLRLSVFF-VPIAVKGLTNSKSAVMRFKKFFLQESPVFYV
410 420 430 440 450 460
390 400 410 420 430
pF1KE2 LEYNLTTTEVVMENVTAFWEEGFGELFEKAKQNNNNRKTSNG----DDSLFFSNFSLLGT
. . .:.:..: :.. . . : . . : ..:.: :.: . .
CCDS10 QTLQDPSKALVFEEATLSWQQTCPGIVNGALELERNGHASEGMTRPRDALGPEEEGNSLG
470 480 490 500 510 520
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 PVLKDINFKIERGQLLAVAGSTGAGKTSLLMVIMGELEPSEGKIKHSGRISFCSQFSWIM
: :. ::. . .:..:.: :.::.::.::: .:. :.. ::.. .: ... : .::.
CCDS10 PELHKINLVVSKGMMLGVCGNTGSGKSSLLSAILEEMHLLEGSVGVQGSLAYVPQQAWIV
530 540 550 560 570 580
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 PGTIKENIIFGVSYDEYRYRSVIKACQLEEDISKFAEKDNIVLGEGGITLSGGQRARISL
:.:.:::..: .::. :: .:.. :.:..:. . : .:: :..:::::. ::::
CCDS10 SGNIRENILMGGAYDKARYLQVLHCCSLNRDLELLPFGDMTEIGERGLNLSGGQKQRISL
590 600 610 620 630 640
560 570 580 590 600 610
pF1KE2 ARAVYKDADLYLLDSPFGYLDVLTEKEIFESCVCKLMANKTRILVTSKMEHLKKADKILI
:::::.: ..::::.:.. .:. . :.::: :. : . .:: .::: ....:. .:..
CCDS10 ARAVYSDRQIYLLDDPLSAVDAHVGKHIFEECIKKTLRGKTVVLVTHQLQYLEFCGQIIL
650 660 670 680 690 700
620 630 640 650 660 670
pF1KE2 LHEGSSYFYGTFSELQNLQPDFSSKLMGCDSFDQFSAERRNSILTETLHRFSLEGDAPVS
:..:. :: :::..
CCDS10 LENGKICENGTHSELMQ-------------------------------------------
710 720
680 690 700 710 720 730
pF1KE2 WTETKKQSFKQTGEFGEKRKNSILNPINSIRKFSIVQKTPLQMNGIEEDSDEPLERRLSL
:: .. : ..:: :. : :: .
CCDS10 ----KKGKYAQ-----------------------LIQK----MHK-EATSD--------M
730 740
740 750 760 770 780 790
pF1KE2 VPDSEQGEAILPRISVISTGPTLQARRRQSVLNLMTHSVNQGQNIHRKTTASTRKVSLAP
. :. . :. : ... :.. . . .:.: :. . :
CCDS10 LQDTAK----------IAEKPKVES---QALATSLEESLN-GNAV--------------P
750 760 770
800 810 820 830 840 850
pF1KE2 QANLTELDIYSRRLSQETGLEISEEINEEDLKECFFDDMESIPAVTTWNTYLRYITVHKS
. ..:.:: ::..: .: .: .: .:: . .
CCDS10 E----------HQLTQE------EEMEEGSL---------------SWRVYHHYIQAAGG
780 790 800
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. . :. : :. .: . .... .: ::.:....:.. ::: ..:. : .
CCDS10 SFYQLVYGLNALLLICVGVCSSGIFTKVTRKASTALHNKLFNKVFRCPMSFFDTIPIGRL
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:: :. :. ::.:::. .:. : :.::... .:.::.:::.. . ..: .. .
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: .. .:.::. .:::.:.:...::.:: .....:. : . :.. . .. .:.
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::. ::. .:.:.. . .::. :... .. . . ....... :..: .. ..
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....: :. :. ..: ....: . .:. :. .:......: . ::. . .: :. ..
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CCDS10 FPKKLHTDVVENGGNFSVGERQLLCIARAVLRNSKIILIDEATASIDMETDTLIQRTIRE
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::.. ::.:. ..: .. :.::::.: .::::.
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:. :
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.. :: . : :.: :: : : : .... . .::: :
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. .: . . :. . . . . . . :: :.. . . .:. :.: . ..:.. :
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CCDS76 QTLHNKMFESILKAPVLFFDRNPIGRILNRFSKDIGHLDDLLPLTFLDFIQRWDLAVLSW
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CCDS76 LVSNS
780
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CCDS45 MLPVYQEVKPNPLQDANLCSRVFFWWLNPLFKIGHKRRLEEDDMYSVLPEDRSQHLGEEL
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60 70 80 90 100
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CCDS45 QGFWDKEVLRAENDAQKPSLTRAIIKCYWKSYLVLGIFTLIEESAKVIQPIFLGKIINYF
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.::: .. . : . : . .. ..: : .. .. ::..:.:: .::.:.:.
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::. .. : . ::.:.::::..::::. .. ::.: .:::. . .:.: . : . :
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.. ::.: .:. .:... . :.. : . :. .:.: .:. .: : ::... ..:
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:::. :.. ... .: .: ..:: .. ..::.. :.:. ..: ..:..... .
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.:..:: :: :.. ... .: .:: :: .: . . .: . : ... ::::.
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:: :..:.. . . : :.:. : ::::::.::..::::::.:::.::::.:.. .:. .
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...:: :.:... .: :::: ....:: :..::::..:. ::..:. . ::.:
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: :. :
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:.:..: :: . :::.
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: .. :: . : :.: :: : : : .... . .::
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: :. . : : ....:.: .: ..:... :. :.:: : :
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: . .: . . :. . . . . . . :: :.. . . .:. :.: . ..:.
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pF1KE2 TVSKILHHKMLHSVLQAPMSTLNTLKAGGILNRFSKDIAILDDLLPLTIFDFIQLLLIVI
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CCDS45 LSWLVSNS
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10 20 30 40 50
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CCDS94 L---SYWANKQSMLNVTVNGGGNVTEKLDLNWYLGIYSGLTVATVLFGIARSLLVFYVLV
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CCDS94 RKNQILIIDEATANVDPRTDELIQKKIREKFAHCTVLTIAHRLNTIIDSDKIMVLDSGRL
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10 20 30
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. . :: : :....: : .. :.: . ... : . :. ...:.. .:. .: .
CCDS48 VGV-AFVG-GLILALLLVPVNKVIATRIMASNQEMLQHK-DARVKLVTELLSGIRVIK-F
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: ::.:. .: : :: : ..:.... .. . . : .:. . :.:. .
CCDS48 CGWEQALGARVEACRARELGRLR---VIKYLDAACVYLWAALPVVISIVIFITYVLMGHQ
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. :.::.... .: . .. .:::... .. ....:: ::
CCDS48 LTATKVFTALALVRMLILPLN-NFPWVINGLLEAKVSLDRIQLFL---------------
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.. .: :.. :.: . : . .. . : . . :: .:: . :.
CCDS48 DLPNHNPQAYYSPDCGRLGAQIKWLLCSDPPAEPSTVLELHGALFSWDPVGTSLETFISH
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pF1KE2 FKIERGQLLAVAGSTGAGKTSLLMVIMGELEPSEGKIKHSGR---ISFCSQFSWIMPGTI
.....:.:....:..: ::.::: .: :::. .:.. : ... .: ::. .::
CCDS48 LEVKKGMLVGIVGKVGCGKSSLLAAIAGELHRLRGHVAVRGLSKGFGLATQEPWIQFATI
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..::.:: ..: :. :..:: :..:.: . :. .:: :.::::::::::.:::::
CCDS48 RDNILFGKTFDAQLYKEVLEACALNDDLSILPAGDQTEVGEKGVTLSGGQRARIALARAV
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CCDS48 YQEKELYLLDDPLAAVDADVANHLLHRCILGMLSYTTRLLCTHRTEYLERADAVLLMEAG
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: ::. . : .: .:.:.
CCDS48 RLIRAGPPSEI-----------------------------------LPLVQAVPKAWAEN
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CCDS48 GQESDSATAQ-------SVQNP----------EKTK---EGLEEE--QSTSGRLLQEESK
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CCDS48 KEGAVAL------------------HVYQAYWKAVGQGLAL-----AILFSLLLM-QATR
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pF1KE2 TELDIY-SRRLSQETGLEISEEINEEDLKECFFDDMESIPAVTTWNTYLRYITVHKSLIF
. : . :. .:: . . :.: . . . : : . .. :: :
CCDS48 NAADWWLSHWISQLKAENSSQEAQPSTSPASM--GLFS-PQLLLFSPGNLYIPVF-----
880 890 900 910 920
870 880 890 900 910 920
pF1KE2 VLIWCLVIFLAEVAASLVVLWLLGNTPLQDKGNSTHSRNNSYAVIITSTSSYYVFYIYVG
:: :. . : . . : . : ..
CCDS48 --------------------------PLP-KAAPNGSSDIRF---------YLTVYATIA
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930 940 950 960 970 980
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...: .. .:.. .. . .. ::...:: ::.::.. .:. .: ::::::.:.:
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990 1000 1010 1020 1030 1040
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:: ::. . .. ..: .::.. :.... :. . . .. .. .:..:.
CCDS48 CADDSLPFILNILLANAAGLLGLLAVLGSGLPWLLLLLPPLSIMYYHVQRHYRASSRELR
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1050 1060 1070 1080 1090 1100
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.: : ::...::. .: :: .::: : :: . :.:. : .:..:...
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:.... . :.. :... .: : ::. :. :... . :. :.: ......
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1130 1140 1150 1160 1170 1180
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:: :. .. :.: : . .: . : : . : . .:..
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: : :....: ..::...:..::::::::.:: ...:::. . :.. .:::. ..
CCDS48 AYRPGLPNALDGVTFCVQPGEKLGIVGRTGSGKSSLLLVLFRLLEPSSGRVLLDGVDTSQ
1230 1240 1250 1260 1270 1280
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pF1KE2 ITLQQWRKAFGVIPQKVFIFSGTFRKNLDPYEQWSDQEIWKVADEVGLRSVIEQFPGKLD
. : : :. ...:::. :.:::: :.:::: .:. .:.. . : :: .. : ::
CCDS48 LELAQLRSQLAIIPQEPFLFSGTVRENLDPQGLHKDRALWQALKQCHLSEVITSMGG-LD
1290 1300 1310 1320 1330 1340
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: .:: :: :..::.::::..:. :::: .:: .: .: : :....:. . ::. :
CCDS48 GELGEGGRSLSLGQRQLLCLARALLTDAKILCIDEATASVDQKTDQLLQQTICKRFANKT
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:. ::....:. .. ::.. ..: . :: : :. .:::.: .. :..
CCDS48 VLTIAHRLNTILNSDRVLVLQAGRVVELDSPATLRNQPHSLFQQLLQSSQQGVPASLGGP
1410 1420 1430 1440 1450 1460
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. . .. :: .::. . .. :. . :..: :. .:.:.:.: ::: ..:..
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:.:.: ..... :.. . .:. . ... . .:.:: ::. ... .. : .. .
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. . .: : :.:... ..:. ... .: :.:.. .: : . .:...
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:: .. : ... : .:.. .. ::. :: : . :..:: :. :...: : .
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. :::::: .. : .:: :..: .:. .:...:: ::
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:: .:... . ... .. .: ::..::: . : . .:.. ...: ..::: : :
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. . .. : : . ::. .:.. . .:.. ..:. .. . : ::. ..
CCDS10 AQNNARVDESQRISFPRLVADRWLAANVELLGNGLVFAAATCAVLSKAHLSAGLVGFSVS
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:... .::::.: . :... . :: :. . : :. :: ...:
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CCDS10 ------------WPQGGQIEFRDFGLRYRPELPLAVQGVSFKIHAGEKVGIVGRTGAGKS
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1260 1270 1280 1290 1300 1310
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CCDS10 SLASGLLRLQEAAEGGIWIDGVPIAHVGLHTLRSRISIIPQDPILFPGSLRMNLDLLQEH
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CCDS10 SDEAIWAALETVQLKALVASLPGQLQYKCADRGEDLSVGQKQLLCLARALLRKTQILILD
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1380 1390 1400 1410 1420 1430
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CCDS10 EATAAVDPGTELQMQAMLGSWFAQCTVLLIAHRLRSVMDCARVLVMDKGQVAESGSPAQL
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CCDS10 LAQKGLFYRLAQESGLV
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CCDS42 FSLLLIQLVLSCFSDRSPLFSETIHDPNPCPESSASFLSRITFWWITGLIVRGYRQPLEG
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CCDS42 ALIVKSPQKEWNPSLFKVLYKTFGPYFLMSFFFKAIHDLMMFSGPQILKLLIKFVNDTKA
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CCDS42 PDWQGYFYTVLLFVTACLQTLVLHQ-YFHICFVSGMRIKTAVIGAVYRKALVITNSARKS
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CCDS42 STVGEIVNLMSVDAQRFMDLATYINMIWSAPLQVILALYLLWLNLGPSVLAGVAVMVLMV
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CCDS42 PVNAVMAMKTKTYQVAHMKSKDNRIKLMNEILNGIKVLKLYAWELAFKDKVLAIRQEELK
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. .:.::. .. .. . :.:.. . :. : .. :: . :..... .::. ..
CCDS42 VLKKSAYLSAVGTFTWVCTPFLVALCTFAVYVTIDENNILDAQTAFVSLALFNILRFPLN
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CCDS42 -ILPMVISSIVQASVSLKRLRIFLSHEE---LEPDSIERRPV--------KDGGG-----
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CCDS42 ----TNSITVRNATFTWARSD-----PPTLNGITFSIPEGALVAVVGQVGCGKSSLLSAL
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CCDS42 LAEMDKVEGHVAIKGSVAYVPQQAWIQNDSLRENILFGCQLEEPYYRSVIQACALLPDLE
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CCDS42 ILPSGDRTEIGEKGVNLSGGQKQRVSLARAVYSNADIYLFDDPLSAVDAHVGKHIFENVI
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. . : :.: .:
CCDS42 -------------------------------------LARDGAFAE-----------FLR
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.. ... :.:..: .: .. .: :: .:.. ..
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CCDS42 KLMEADKAQTGQVKLSVYWD-YMKAIGLFISFLSIFLFMCNHVSALASNYWLSLWT--DD
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:. . :.. :.. . : : .. : :.: .:. : : .:.
CCDS42 PIVN-GTQEHTK--------VRLSVYGALGISQGIAVFGYSMAVSIGG------ILASRC
1010 1020 1030 1040
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:: .:::.:..::: .. .:...:::::.. .:...: .: :. :. :::: :
CCDS42 LHVDLLHSILRSPMSFFERTPSGNLVNRFSKELDTVDSMIPEVIKMFMGSLFNVIGACIV
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