FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6756, 812 aa 1>>>pF1KE6756 812 - 812 aa - 812 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6716+/-0.0014; mu= 18.4208+/- 0.084 mean_var=73.0340+/-14.691, 0's: 0 Z-trim(99.1): 79 B-trim: 16 in 2/48 Lambda= 0.150076 statistics sampled from 5549 (5628) to 5549 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.501), E-opt: 0.2 (0.173), width: 16 Scan time: 3.620 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS5371.1 ABCB5 gene_id:340273|Hs108|chr7 ( 812) 5161 1127.9 0 CCDS55090.1 ABCB5 gene_id:340273|Hs108|chr7 (1257) 5161 1128.0 0 CCDS5605.1 ABCB4 gene_id:5244|Hs108|chr7 (1279) 2425 535.6 1.9e-151 CCDS5606.1 ABCB4 gene_id:5244|Hs108|chr7 (1286) 2401 530.4 7.2e-150 CCDS5608.1 ABCB1 gene_id:5243|Hs108|chr7 (1280) 2372 524.1 5.6e-148 CCDS46444.1 ABCB11 gene_id:8647|Hs108|chr2 (1321) 1904 422.8 1.8e-117 CCDS5607.1 ABCB4 gene_id:5244|Hs108|chr7 (1232) 1342 301.1 7.3e-81 CCDS4758.1 TAP1 gene_id:6890|Hs108|chr6 ( 808) 847 193.9 9.3e-49 CCDS55092.1 ABCB5 gene_id:340273|Hs108|chr7 ( 126) 784 179.8 2.4e-45 CCDS55091.1 ABCB5 gene_id:340273|Hs108|chr7 ( 131) 784 179.8 2.5e-45 CCDS8693.1 ABCC9 gene_id:10060|Hs108|chr12 (1549) 722 166.9 2.3e-40 CCDS8694.1 ABCC9 gene_id:10060|Hs108|chr12 (1549) 711 164.6 1.2e-39 CCDS64798.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 ( 630) 658 152.9 1.6e-36 CCDS5913.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 ( 718) 658 152.9 1.8e-36 CCDS64799.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 ( 735) 658 152.9 1.8e-36 CCDS1580.1 ABCB10 gene_id:23456|Hs108|chr1 ( 738) 622 145.1 4e-34 CCDS2436.1 ABCB6 gene_id:10058|Hs108|chr2 ( 842) 568 133.5 1.5e-30 CCDS58286.1 ABCB9 gene_id:23457|Hs108|chr12 ( 703) 558 131.3 5.7e-30 CCDS9241.1 ABCB9 gene_id:23457|Hs108|chr12 ( 766) 558 131.3 6.1e-30 CCDS64800.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 ( 693) 512 121.3 5.6e-27 CCDS4896.1 ABCC10 gene_id:89845|Hs108|chr6 (1464) 494 117.6 1.6e-25 CCDS56430.1 ABCC10 gene_id:89845|Hs108|chr6 (1492) 494 117.6 1.6e-25 CCDS7484.1 ABCC2 gene_id:1244|Hs108|chr10 (1545) 491 116.9 2.6e-25 CCDS43176.1 ABCC5 gene_id:10057|Hs108|chr3 (1437) 473 113.0 3.6e-24 CCDS65290.1 ABCB7 gene_id:22|Hs108|chrX ( 712) 468 111.8 4.2e-24 CCDS75994.1 ABCB7 gene_id:22|Hs108|chrX ( 713) 468 111.8 4.2e-24 CCDS65291.1 ABCB7 gene_id:22|Hs108|chrX ( 752) 468 111.8 4.4e-24 CCDS14428.1 ABCB7 gene_id:22|Hs108|chrX ( 753) 468 111.8 4.4e-24 CCDS10568.1 ABCC6 gene_id:368|Hs108|chr16 (1503) 461 110.4 2.3e-23 CCDS9474.1 ABCC4 gene_id:10257|Hs108|chr13 (1325) 456 109.3 4.3e-23 CCDS31437.1 ABCC8 gene_id:6833|Hs108|chr11 (1581) 437 105.2 8.7e-22 CCDS73264.1 ABCC8 gene_id:6833|Hs108|chr11 (1582) 437 105.2 8.7e-22 CCDS78129.1 TAP2 gene_id:6891|Hs108|chr6 ( 686) 432 104.0 9.1e-22 CCDS58287.1 ABCB9 gene_id:23457|Hs108|chr12 ( 681) 397 96.4 1.7e-19 CCDS58288.1 ABCB9 gene_id:23457|Hs108|chr12 ( 683) 397 96.4 1.7e-19 CCDS42122.1 ABCC1 gene_id:4363|Hs108|chr16 (1531) 370 90.7 2e-17 CCDS5773.1 CFTR gene_id:1080|Hs108|chr7 (1480) 363 89.2 5.5e-17 CCDS10730.1 ABCC12 gene_id:94160|Hs108|chr16 (1359) 358 88.1 1.1e-16 CCDS4755.1 TAP2 gene_id:6891|Hs108|chr6 ( 653) 351 86.4 1.7e-16 CCDS10732.1 ABCC11 gene_id:85320|Hs108|chr16 (1382) 330 82.0 7.3e-15 CCDS32681.1 ABCC3 gene_id:8714|Hs108|chr17 (1527) 327 81.4 1.3e-14 CCDS10466.1 ABCA3 gene_id:21|Hs108|chr16 (1704) 315 78.8 8.3e-14 CCDS76643.1 ABCC4 gene_id:10257|Hs108|chr13 ( 784) 306 76.7 1.7e-13 CCDS45061.1 ABCC4 gene_id:10257|Hs108|chr13 ( 859) 306 76.7 1.8e-13 CCDS6762.1 ABCA1 gene_id:19|Hs108|chr9 (2261) 310 77.8 2.2e-13 CCDS12055.1 ABCA7 gene_id:10347|Hs108|chr19 (2146) 299 75.4 1.1e-12 CCDS747.1 ABCA4 gene_id:24|Hs108|chr1 (2273) 295 74.6 2.1e-12 CCDS11685.1 ABCA5 gene_id:23461|Hs108|chr17 (1642) 288 73.0 4.6e-12 CCDS43909.1 ABCA2 gene_id:20|Hs108|chr9 (2436) 286 72.6 8.8e-12 CCDS11683.1 ABCA6 gene_id:23460|Hs108|chr17 (1617) 273 69.7 4.3e-11 >>CCDS5371.1 ABCB5 gene_id:340273|Hs108|chr7 (812 aa) initn: 5161 init1: 5161 opt: 5161 Z-score: 6036.8 bits: 1127.9 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5161; 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CCDS55 MENSERAEEMQENYQRNGTAEEQPKLRKEAVGSIEIFRFA--DGLDITL 10 20 30 40 250 260 270 280 290 pF1KE6 VVLGTLASVLNGTVHPVFSIIFAKI-------------ITMFGNNDKTT--LKHDAEIYS ..:: :::..::. :.. ...... : . : .. :..: . . CCDS55 MILGILASLVNGACLPLMPLVLGEMSDNLISGCLVQTNTTNYQNCTQSQEKLNEDMTLLT 50 60 70 80 90 100 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 MIFVILGVICFVSYFMQGLFYGRAGEILTMRLRHLAFKAMLYQDIAWFDEKENSTGGLTT . .: .:: .. ..: .. .. : :.:. :...: :::.::: . : :.: CCDS55 LYYVGIGVAALIFGYIQISLWIITAARQTKRIRKQFFHSVLAQDIGWFDSCD--IGELNT 110 120 130 140 150 160 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 ILAIDIAQIQGATGSRIGVLTQNATNMGLSVIISFIYGWEMTFLILSIAPVLAVTGMIET .. :: .:. . :..:..: :: ....... .... ::..:.. :: .:.. ... . CCDS55 RMTDDIDKISDGIGDKIALLFQNMSTFSIGLAVGLVKGWKLTLVTLSTSPLIMASAAACS 170 180 190 200 210 220 420 430 440 450 460 pF1KE6 AAMTGFANKDKQELKHAGKIATEALENIRTIVSLTREKAFEQMYEEMLQTQH-----RNT . ....:. . ..:: .: :.: .:::.... .. : : . :. . :. CCDS55 RMVISLTSKELSAYSKAGAVAEEVLSSIRTVIAFRAQEKELQRYTQNLKDAKDFGIKRTI 230 240 250 260 270 280 470 480 490 500 510 520 pF1KE6 SKKAQIIGSCYAFSHAFIYFAYAAGFRFGAYLIQAGR--MTPEGMFIVFTAIAYGAMAIG ..:... :. : : .. .:. .: .:. :: :. .: .. :: .. .... :: CCDS55 ASKVSL-GAVYFFMNG----TYGLAFWYGTSLILNGEPGYTIGTVLAVFFSVIHSSYCIG 290 300 310 320 330 340 530 540 550 560 570 580 pF1KE6 ETLVLAPEYSKAKSGAAHLFALLEKKPNIDSRSQEGKKPDTCEGNLEFREVSFFYPCRPD .. .. :...: :.: ...:::.::. : : ::.. ::..::..::: :: ::. CCDS55 AAVPHFETFAIARGAAFHIFQVIDKKPSIDNFSTAGYKPESIEGTVEFKNVSFNYPSRPS 350 360 370 380 390 400 590 600 610 620 630 640 pF1KE6 VFILRGLSLSIERGKTVAFVGSSGCGKSTSVQLLQRLYDPVQGQVLFDGVDAKELNVQWL . ::.::.: :. :.:::.:: .: :::: :::::::::: .: CCDS55 IKILKGLNLRIKSGETVALVGLNGSGKSTVVQLLQRLYDPDDGFIMVDENDIRALNVRHY 410 420 430 440 450 460 650 660 670 680 690 700 pF1KE6 RSQIAIVPQEPVLFNCSIAENIAYGDNSRVVPLDEIKEAANAANIHSFIEGLPEKYNTQV CCDS55 RDHIGVVSQEPVLFGTTISNNIKYGRDDVTDEEMERAAREANAYDFIMEFPNKFNTLVGE 470 480 490 500 510 520 >>CCDS5605.1 ABCB4 gene_id:5244|Hs108|chr7 (1279 aa) initn: 3677 init1: 2392 opt: 2425 Z-score: 2832.2 bits: 535.6 E(32554): 1.9e-151 Smith-Waterman score: 3165; 58.7% identity (86.0% similar) in 820 aa overlap (2-810:455-1274) 10 20 30 pF1KE6 MVDENDIRALNVRHYRDHIGVVSQEPVLFGT .: .::: .:: . :. :::::::::::.: CCDS56 VALVGSSGCGKSTTVQLIQRLYDPDEGTINIDGQDIRNFNVNYLREIIGVVSQEPVLFST 430 440 450 460 470 480 40 50 60 70 80 90 pF1KE6 TISNNIKYGRDDVTDEEMERAAREANAYDFIMEFPNKFNTLVGEKGAQMSGGQKQRIAIA ::..:: ::: .:: .:...:..:::::.:::..:.::.:::::.:::.::::::::::: CCDS56 TIAENICYGRGNVTMDEIKKAVKEANAYEFIMKLPQKFDTLVGERGAQLSGGQKQRIAIA 490 500 510 520 530 540 100 110 120 130 140 150 pF1KE6 RALVRNPKILILDEATSALDSESKSAVQAALEKASKGRTTIVVAHRLSTIRSADLIVTLK ::::::::::.:::::::::.::.. :::::.:: .::::::.::::::.:.::.:. .. CCDS56 RALVRNPKILLLDEATSALDTESEAEVQAALDKAREGRTTIVIAHRLSTVRNADVIAGFE 550 560 570 580 590 600 160 170 180 190 200 pF1KE6 DGMLAEKGAHAELMAKRGLYYSLVMSQ----DIKKADEQMESMTYSTERKTNS----LPL ::...:.:.:.::: :.:.:..:: : .:.. . .... .:. :. : CCDS56 DGVIVEQGSHSELMKKEGVYFKLVNMQTSGSQIQSEEFELNDEKAATRMAPNGWKSRLFR 610 620 630 640 650 660 210 220 230 240 250 260 pF1KE6 HSV-KSIK-SDFIDKAEE-STQSKEISLPEVSLLKILKLNKPEWPFVVLGTLASVLNGTV ::. :..: :.. .:. . :.. : ..: ::.::.::::: :::. :.::. .. :: . CCDS56 HSTQKNLKNSQMCQKSLDVETDGLEANVPPVSFLKVLKLNKTEWPYFVVGTVCAIANGGL 670 680 690 700 710 720 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 HPVFSIIFAKIITMFGNNDKTTLKHDAEIYSMIFVILGVICFVSYFMQGLFYGRAGEILT .:.::.::..::..:: .: .. .. .:.:.::..::.: : ..:.::. .:.:::::: CCDS56 QPAFSVIFSEIIAIFGPGDDAVKQQKCNIFSLIFLFLGIISFFTFFLQGFTFGKAGEILT 730 740 750 760 770 780 330 340 350 360 370 380 pF1KE6 MRLRHLAFKAMLYQDIAWFDEKENSTGGLTTILAIDIAQIQGATGSRIGVLTQNATNMGL ::: .:::::: ::..:::...::::.:.: :: : ::.:::::.:.....:: .:.: CCDS56 RRLRSMAFKAMLRQDMSWFDDHKNSTGALSTRLATDAAQVQGATGTRLALIAQNIANLGT 790 800 810 820 830 840 390 400 410 420 430 440 pF1KE6 SVIISFIYGWEMTFLILSIAPVLAVTGMIETAAMTGFANKDKQELKHAGKIATEALENIR ..::::::::..:.:.:...:..::.:..: ..: :..::.::. ::::::::.:::: CCDS56 GIIISFIYGWQLTLLLLAVVPIIAVSGIVEMKLLAGNAKRDKKELEAAGKIATEAIENIR 850 860 870 880 890 900 450 460 470 480 490 500 pF1KE6 TIVSLTREKAFEQMYEEMLQTQHRNTSKKAQIIGSCYAFSHAFIYFAYAAGFRFGAYLIQ :.::::.:. ::.:: : : .::. .::.: : ...:.::.::.::. :::::::: CCDS56 TVVSLTQERKFESMYVEKLYGPYRNSVQKAHIYGITFSISQAFMYFSYAGCFRFGAYLIV 910 920 930 940 950 960 510 520 530 540 550 560 pF1KE6 AGRMTPEGMFIVFTAIAYGAMAIGETLVLAPEYSKAKSGAAHLFALLEKKPNIDSRSQEG :.: . ...::.::..::.:.:.. .::.:.::: .::::: :.:..: ::: :.:: CCDS56 NGHMRFRDVILVFSAIVFGAVALGHASSFAPDYAKAKLSAAHLFMLFERQPLIDSYSEEG 970 980 990 1000 1010 1020 570 580 590 600 610 620 pF1KE6 KKPDTCEGNLEFREVSFFYPCRPDVFILRGLSLSIERGKTVAFVGSSGCGKSTSVQLLQR ::: :::. : :: : :: : .: .:.:::: ...:.:.:.:::::::::: ::::.: CCDS56 LKPDKFEGNITFNEVVFNYPTRANVPVLQGLSLEVKKGQTLALVGSSGCGKSTVVQLLER 1030 1040 1050 1060 1070 1080 630 640 650 660 670 680 pF1KE6 LYDPVQGQVLFDGVDAKELNVQWLRSQIAIVPQEPVLFNCSIAENIAYGDNSRVVPLDEI .:::. : ::.:: .::.:::::::.:..:: :::.::.:::::::::::::::: ::: CCDS56 FYDPLAGTVLLDGQEAKKLNVQWLRAQLGIVSQEPILFDCSIAENIAYGDNSRVVSQDEI 1090 1100 1110 1120 1130 1140 690 700 710 720 730 740 pF1KE6 KEAANAANIHSFIEGLPEKYNTQVGLKGAQLSGGQKQRLAIARALLQKPKILLLDEATSA ::.::::: ::: ::.::.:.:: ::.:::::::::.::::::...:.:::::::::: CCDS56 VSAAKAANIHPFIETLPHKYETRVGDKGTQLSGGQKQRIAIARALIRQPQILLLDEATSA 1150 1160 1170 1180 1190 1200 750 760 770 780 790 800 pF1KE6 LDNDSEKVVQHALDKARTGRTCLVVTHRLSAIQNADLIVVLHNGKIKEQGTHQELLRNRD ::..::::::.:::::: ::::.:..::::.:::::::::..::..::.::::.:: .. CCDS56 LDTESEKVVQEALDKAREGRTCIVIAHRLSTIQNADLIVVFQNGRVKEHGTHQQLLAQKG 1210 1220 1230 1240 1250 1260 810 pF1KE6 IYFKLVNAQSVQ :::..:..:. CCDS56 IYFSMVSVQAGTQNL 1270 >-- initn: 699 init1: 599 opt: 778 Z-score: 905.0 bits: 179.0 E(32554): 4.3e-44 Smith-Waterman score: 786; 32.1% identity (67.0% similar) in 430 aa overlap (220-629:26-453) 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 MTYSTERKTNSLPLHSVKSIKSDFIDKAEESTQSKEISLPEVSLLKILKLNK-PEWP--- :...:. . :... .: : . .: CCDS56 MDLEAAKNGTAWRPTSAEGDFELGISSKQKRKKTKTVKMIGVLTLFRYSDWQDKL 10 20 30 40 50 250 260 270 280 pF1KE6 FVVLGTLASVLNGTVHPVFSIIFAKIITMF----GN------------NDKTTLKHDAEI :. :::. .. .:. :.. :.:... : :: : :... CCDS56 FMSLGTIMAIAHGSGLPLMMIVFGEMTDKFVDTAGNFSFPVNFSLSLLNPGKILEEEMTR 60 70 80 90 100 110 290 300 310 320 330 340 pF1KE6 YSMIFVILGVICFVSYFMQGLFYGRAGEILTMRLRHLAFKAMLYQDIAWFDEKENSTGGL :.. . ::. .:. ..: :. :. ..:. :.:.: :.:.::: :.: : CCDS56 YAYYYSGLGAGVLVAAYIQVSFWTLAAGRQIRKIRQKFFHAILRQEIGWFD--INDTTEL 120 130 140 150 160 170 350 360 370 380 390 400 pF1KE6 TTILAIDIAQIQGATGSRIGVLTQNATNMGLSVIISFIYGWEMTFLILSIAPVLAVTGMI .: :. ::..:. . :...:.. : .... . :..:: ::..:..:..:.:.:.... . CCDS56 NTRLTDDISKISEGIGDKVGMFFQAVATFFAGFIVGFIRGWKLTLVIMAISPILGLSAAV 180 190 200 210 220 230 410 420 430 440 450 460 pF1KE6 ETAAMTGFANKDKQELKHAGKIATEALENIRTIVSLTREKAFEQMYEEMLQTQHRNTSKK . ...:..:. .:: .: ::: :::.... .. . :.. :.. .. :: CCDS56 WAKILSAFSDKELAAYAKAGAVAEEALGAIRTVIAFGGQNKELERYQKHLENAKEIGIKK 240 250 260 270 280 290 470 480 490 500 510 520 pF1KE6 AQIIGSCYAFSHAFIYFAYAAGFRFGAYLIQAGRMTPEGMFIVFTAIAYGAMAIGETLVL : . .... .:: .:: .: .:. :. . ..: . . :: .: ::...:.. CCDS56 AISANISMGIAFLLIYASYALAFWYGSTLVISKEYTIGNAMTVFFSILIGAFSVGQAAPC 300 310 320 330 340 350 530 540 550 560 570 580 pF1KE6 APEYSKAKSGAAHLFALLEKKPNIDSRSQEGKKPDTCEGNLEFREVSFFYPCRPDVFILR ...:...: .: .....:.::: :..:.:::. .::::: .: : :: : .: ::. CCDS56 IDAFANARGAAYVIFDIIDNNPKIDSFSERGHKPDSIKGNLEFNDVHFSYPSRANVKILK 360 370 380 390 400 410 590 600 610 620 630 640 pF1KE6 GLSLSIERGKTVAFVGSSGCGKSTSVQLLQRLYDPVQGQVLFDGVDAKELNVQWLRSQIA ::.:... :.:::.::::::::::.:::.:::::: .: . CCDS56 GLNLKVQSGQTVALVGSSGCGKSTTVQLIQRLYDPDEGTINIDGQDIRNFNVNYLREIIG 420 430 440 450 460 470 650 660 670 680 690 700 pF1KE6 IVPQEPVLFNCSIAENIAYGDNSRVVPLDEIKEAANAANIHSFIEGLPEKYNTQVGLKGA CCDS56 VVSQEPVLFSTTIAENICYGRGNVTMDEIKKAVKEANAYEFIMKLPQKFDTLVGERGAQL 480 490 500 510 520 530 >>CCDS5606.1 ABCB4 gene_id:5244|Hs108|chr7 (1286 aa) initn: 3161 init1: 1552 opt: 2401 Z-score: 2804.1 bits: 530.4 E(32554): 7.2e-150 Smith-Waterman score: 3141; 58.2% identity (85.2% similar) in 827 aa overlap (2-810:455-1281) 10 20 30 pF1KE6 MVDENDIRALNVRHYRDHIGVVSQEPVLFGT .: .::: .:: . :. :::::::::::.: CCDS56 VALVGSSGCGKSTTVQLIQRLYDPDEGTINIDGQDIRNFNVNYLREIIGVVSQEPVLFST 430 440 450 460 470 480 40 50 60 70 80 90 pF1KE6 TISNNIKYGRDDVTDEEMERAAREANAYDFIMEFPNKFNTLVGEKGAQMSGGQKQRIAIA ::..:: ::: .:: .:...:..:::::.:::..:.::.:::::.:::.::::::::::: CCDS56 TIAENICYGRGNVTMDEIKKAVKEANAYEFIMKLPQKFDTLVGERGAQLSGGQKQRIAIA 490 500 510 520 530 540 100 110 120 130 140 150 pF1KE6 RALVRNPKILILDEATSALDSESKSAVQAALEKASKGRTTIVVAHRLSTIRSADLIVTLK ::::::::::.:::::::::.::.. :::::.:: .::::::.::::::.:.::.:. .. CCDS56 RALVRNPKILLLDEATSALDTESEAEVQAALDKAREGRTTIVIAHRLSTVRNADVIAGFE 550 560 570 580 590 600 160 170 180 190 200 pF1KE6 DGMLAEKGAHAELMAKRGLYYSLVMSQ----DIKKADEQMESMTYSTERKTNS----LPL ::...:.:.:.::: :.:.:..:: : .:.. . .... .:. :. : CCDS56 DGVIVEQGSHSELMKKEGVYFKLVNMQTSGSQIQSEEFELNDEKAATRMAPNGWKSRLFR 610 620 630 640 650 660 210 220 230 240 250 260 pF1KE6 HSV-KSIK-SDFIDKAEE-STQSKEISLPEVSLLKILKLNKPEWPFVVLGTLASVLNGTV ::. :..: :.. .:. . :.. : ..: ::.::.::::: :::. :.::. .. :: . CCDS56 HSTQKNLKNSQMCQKSLDVETDGLEANVPPVSFLKVLKLNKTEWPYFVVGTVCAIANGGL 670 680 690 700 710 720 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 HPVFSIIFAKIITMFGNNDKTTLKHDAEIYSMIFVILGVICFVSYFMQGLFYGRAGEILT .:.::.::..::..:: .: .. .. .:.:.::..::.: : ..:.::. .:.:::::: CCDS56 QPAFSVIFSEIIAIFGPGDDAVKQQKCNIFSLIFLFLGIISFFTFFLQGFTFGKAGEILT 730 740 750 760 770 780 330 340 350 360 370 380 pF1KE6 MRLRHLAFKAMLYQDIAWFDEKENSTGGLTTILAIDIAQIQGATGSRIGVLTQNATNMGL ::: .:::::: ::..:::...::::.:.: :: : ::.:::::.:.....:: .:.: CCDS56 RRLRSMAFKAMLRQDMSWFDDHKNSTGALSTRLATDAAQVQGATGTRLALIAQNIANLGT 790 800 810 820 830 840 390 400 410 420 430 440 pF1KE6 SVIISFIYGWEMTFLILSIAPVLAVTGMIETAAMTGFANKDKQELKHAGKIATEALENIR ..::::::::..:.:.:...:..::.:..: ..: :..::.::. ::::::::.:::: CCDS56 GIIISFIYGWQLTLLLLAVVPIIAVSGIVEMKLLAGNAKRDKKELEAAGKIATEAIENIR 850 860 870 880 890 900 450 460 470 480 490 500 pF1KE6 TIVSLTREKAFEQMYEEMLQTQHRNTSKKAQIIGSCYAFSHAFIYFAYAAGFRFGAYLIQ :.::::.:. ::.:: : : .::. .::.: : ...:.::.::.::. :::::::: CCDS56 TVVSLTQERKFESMYVEKLYGPYRNSVQKAHIYGITFSISQAFMYFSYAGCFRFGAYLIV 910 920 930 940 950 960 510 520 530 540 550 560 pF1KE6 AGRMTPEGMFIVFTAIAYGAMAIGETLVLAPEYSKAKSGAAHLFALLEKKPNIDSRSQEG :.: . ...::.::..::.:.:.. .::.:.::: .::::: :.:..: ::: :.:: CCDS56 NGHMRFRDVILVFSAIVFGAVALGHASSFAPDYAKAKLSAAHLFMLFERQPLIDSYSEEG 970 980 990 1000 1010 1020 570 580 590 600 610 620 pF1KE6 KKPDTCEGNLEFREVSFFYPCRPDVFILRGLSLSIERGKTVAFVGSSGCGKSTSVQLLQR ::: :::. : :: : :: : .: .:.:::: ...:.:.:.:::::::::: ::::.: CCDS56 LKPDKFEGNITFNEVVFNYPTRANVPVLQGLSLEVKKGQTLALVGSSGCGKSTVVQLLER 1030 1040 1050 1060 1070 1080 630 640 650 660 670 pF1KE6 LYDPVQGQV-------LFDGVDAKELNVQWLRSQIAIVPQEPVLFNCSIAENIAYGDNSR .:::. : : :.:: .::.:::::::.:..:: :::.::.:::::::::::::: CCDS56 FYDPLAGTVFVDFGFQLLDGQEAKKLNVQWLRAQLGIVSQEPILFDCSIAENIAYGDNSR 1090 1100 1110 1120 1130 1140 680 690 700 710 720 730 pF1KE6 VVPLDEIKEAANAANIHSFIEGLPEKYNTQVGLKGAQLSGGQKQRLAIARALLQKPKILL :: ::: ::.::::: ::: ::.::.:.:: ::.:::::::::.::::::...:.::: CCDS56 VVSQDEIVSAAKAANIHPFIETLPHKYETRVGDKGTQLSGGQKQRIAIARALIRQPQILL 1150 1160 1170 1180 1190 1200 740 750 760 770 780 790 pF1KE6 LDEATSALDNDSEKVVQHALDKARTGRTCLVVTHRLSAIQNADLIVVLHNGKIKEQGTHQ :::::::::..::::::.:::::: ::::.:..::::.:::::::::..::..::.:::: CCDS56 LDEATSALDTESEKVVQEALDKAREGRTCIVIAHRLSTIQNADLIVVFQNGRVKEHGTHQ 1210 1220 1230 1240 1250 1260 800 810 pF1KE6 ELLRNRDIYFKLVNAQSVQ .:: .. :::..:..:. CCDS56 QLLAQKGIYFSMVSVQAGTQNL 1270 1280 >-- initn: 699 init1: 599 opt: 778 Z-score: 905.0 bits: 179.0 E(32554): 4.4e-44 Smith-Waterman score: 786; 32.1% identity (67.0% similar) in 430 aa overlap (220-629:26-453) 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 MTYSTERKTNSLPLHSVKSIKSDFIDKAEESTQSKEISLPEVSLLKILKLNK-PEWP--- :...:. . :... .: : . .: CCDS56 MDLEAAKNGTAWRPTSAEGDFELGISSKQKRKKTKTVKMIGVLTLFRYSDWQDKL 10 20 30 40 50 250 260 270 280 pF1KE6 FVVLGTLASVLNGTVHPVFSIIFAKIITMF----GN------------NDKTTLKHDAEI :. :::. .. .:. :.. :.:... : :: : :... CCDS56 FMSLGTIMAIAHGSGLPLMMIVFGEMTDKFVDTAGNFSFPVNFSLSLLNPGKILEEEMTR 60 70 80 90 100 110 290 300 310 320 330 340 pF1KE6 YSMIFVILGVICFVSYFMQGLFYGRAGEILTMRLRHLAFKAMLYQDIAWFDEKENSTGGL :.. . ::. .:. ..: :. :. ..:. :.:.: :.:.::: :.: : CCDS56 YAYYYSGLGAGVLVAAYIQVSFWTLAAGRQIRKIRQKFFHAILRQEIGWFD--INDTTEL 120 130 140 150 160 170 350 360 370 380 390 400 pF1KE6 TTILAIDIAQIQGATGSRIGVLTQNATNMGLSVIISFIYGWEMTFLILSIAPVLAVTGMI .: :. ::..:. . :...:.. : .... . :..:: ::..:..:..:.:.:.... . CCDS56 NTRLTDDISKISEGIGDKVGMFFQAVATFFAGFIVGFIRGWKLTLVIMAISPILGLSAAV 180 190 200 210 220 230 410 420 430 440 450 460 pF1KE6 ETAAMTGFANKDKQELKHAGKIATEALENIRTIVSLTREKAFEQMYEEMLQTQHRNTSKK . ...:..:. .:: .: ::: :::.... .. . :.. :.. .. :: CCDS56 WAKILSAFSDKELAAYAKAGAVAEEALGAIRTVIAFGGQNKELERYQKHLENAKEIGIKK 240 250 260 270 280 290 470 480 490 500 510 520 pF1KE6 AQIIGSCYAFSHAFIYFAYAAGFRFGAYLIQAGRMTPEGMFIVFTAIAYGAMAIGETLVL : . .... .:: .:: .: .:. :. . ..: . . :: .: ::...:.. CCDS56 AISANISMGIAFLLIYASYALAFWYGSTLVISKEYTIGNAMTVFFSILIGAFSVGQAAPC 300 310 320 330 340 350 530 540 550 560 570 580 pF1KE6 APEYSKAKSGAAHLFALLEKKPNIDSRSQEGKKPDTCEGNLEFREVSFFYPCRPDVFILR ...:...: .: .....:.::: :..:.:::. .::::: .: : :: : .: ::. CCDS56 IDAFANARGAAYVIFDIIDNNPKIDSFSERGHKPDSIKGNLEFNDVHFSYPSRANVKILK 360 370 380 390 400 410 590 600 610 620 630 640 pF1KE6 GLSLSIERGKTVAFVGSSGCGKSTSVQLLQRLYDPVQGQVLFDGVDAKELNVQWLRSQIA ::.:... :.:::.::::::::::.:::.:::::: .: . CCDS56 GLNLKVQSGQTVALVGSSGCGKSTTVQLIQRLYDPDEGTINIDGQDIRNFNVNYLREIIG 420 430 440 450 460 470 650 660 670 680 690 700 pF1KE6 IVPQEPVLFNCSIAENIAYGDNSRVVPLDEIKEAANAANIHSFIEGLPEKYNTQVGLKGA CCDS56 VVSQEPVLFSTTIAENICYGRGNVTMDEIKKAVKEANAYEFIMKLPQKFDTLVGERGAQL 480 490 500 510 520 530 >>CCDS5608.1 ABCB1 gene_id:5243|Hs108|chr7 (1280 aa) initn: 3453 init1: 2132 opt: 2372 Z-score: 2770.2 bits: 524.1 E(32554): 5.6e-148 Smith-Waterman score: 3130; 56.7% identity (85.3% similar) in 823 aa overlap (2-810:453-1275) 10 20 30 pF1KE6 MVDENDIRALNVRHYRDHIGVVSQEPVLFGT :: .:::..::: :. :::::::::::.: CCDS56 VALVGNSGCGKSTTVQLMQRLYDPTEGMVSVDGQDIRTINVRFLREIIGVVSQEPVLFAT 430 440 450 460 470 480 40 50 60 70 80 90 pF1KE6 TISNNIKYGRDDVTDEEMERAAREANAYDFIMEFPNKFNTLVGEKGAQMSGGQKQRIAIA ::..::.:::..:: .:.:.:..:::::::::..:.::.:::::.:::.::::::::::: CCDS56 TIAENIRYGRENVTMDEIEKAVKEANAYDFIMKLPHKFDTLVGERGAQLSGGQKQRIAIA 490 500 510 520 530 540 100 110 120 130 140 150 pF1KE6 RALVRNPKILILDEATSALDSESKSAVQAALEKASKGRTTIVVAHRLSTIRSADLIVTLK ::::::::::.:::::::::.::...::.::.:: :::::::.::::::.:.::.:. . CCDS56 RALVRNPKILLLDEATSALDTESEAVVQVALDKARKGRTTIVIAHRLSTVRNADVIAGFD 550 560 570 580 590 600 160 170 180 190 200 pF1KE6 DGMLAEKGAHAELMAKRGLYYSLVMSQDI-------KKADE---QMESMTYSTERKTNSL ::...::: : ::: ..:.:..:: : . ::: ..... .:.. . .:: CCDS56 DGVIVEKGNHDELMKEKGIYFKLVTMQTAGNEVELENAADESKSEIDALEMSSNDSRSSL 610 620 630 640 650 660 210 220 230 240 250 pF1KE6 --PLHSVKSIK-SDFIDKAEESTQSKEISLPEVSLLKILKLNKPEWPFVVLGTLASVLNG . .:.. :. :. . .. . :.: ::. .:.::: :::. :.:.. ...:: CCDS56 IRKRSTRRSVRGSQAQDRKLSTKEALDESIPPVSFWRIMKLNLTEWPYFVVGVFCAIING 670 680 690 700 710 720 260 270 280 290 300 310 pF1KE6 TVHPVFSIIFAKIITMFGN-NDKTTLKHDAEIYSMIFVILGVICFVSYFMQGLFYGRAGE ..:.:.:::.::: .: .: : .......:..:. ::.: :...:.::. .:.::: CCDS56 GLQPAFAIIFSKIIGVFTRIDDPETKRQNSNLFSLLFLALGIISFITFFLQGFTFGKAGE 730 740 750 760 770 780 320 330 340 350 360 370 pF1KE6 ILTMRLRHLAFKAMLYQDIAWFDEKENSTGGLTTILAIDIAQIQGATGSRIGVLTQNATN ::: :::...:..:: ::..:::. .:.::.::: :: : ::..:: :::..:.::: .: CCDS56 ILTKRLRYMVFRSMLRQDVSWFDDPKNTTGALTTRLANDAAQVKGAIGSRLAVITQNIAN 790 800 810 820 830 840 380 390 400 410 420 430 pF1KE6 MGLSVIISFIYGWEMTFLILSIAPVLAVTGMIETAAMTGFANKDKQELKHAGKIATEALE .: ..::::::::..:.:.:.:.:..:..:..: ..: : :::.::. .:::::::.: CCDS56 LGTGIIISFIYGWQLTLLLLAIVPIIAIAGVVEMKMLSGQALKDKKELEGSGKIATEAIE 850 860 870 880 890 900 440 450 460 470 480 490 pF1KE6 NIRTIVSLTREKAFEQMYEEMLQTQHRNTSKKAQIIGSCYAFSHAFIYFAYAAGFRFGAY :.::.::::.:. ::.:: . ::. .::. .::.:.: ..:..:..::.::. :::::: CCDS56 NFRTVVSLTQEQKFEHMYAQSLQVPYRNSLRKAHIFGITFSFTQAMMYFSYAGCFRFGAY 910 920 930 940 950 960 500 510 520 530 540 550 pF1KE6 LIQAGRMTPEGMFIVFTAIAYGAMAIGETLVLAPEYSKAKSGAAHLFALLEKKPNIDSRS :. :. : ...::.:...::::.:.. .::.:.::: .:::.. ..:: : ::: : CCDS56 LVAHKLMSFEDVLLVFSAVVFGAMAVGQVSSFAPDYAKAKISAAHIIMIIEKTPLIDSYS 970 980 990 1000 1010 1020 560 570 580 590 600 610 pF1KE6 QEGKKPDTCEGNLEFREVSFFYPCRPDVFILRGLSLSIERGKTVAFVGSSGCGKSTSVQL :: :.: :::. : :: : :: :::. .:.:::: ...:.:.:.:::::::::: ::: CCDS56 TEGLMPNTLEGNVTFGEVVFNYPTRPDIPVLQGLSLEVKKGQTLALVGSSGCGKSTVVQL 1030 1040 1050 1060 1070 1080 620 630 640 650 660 670 pF1KE6 LQRLYDPVQGQVLFDGVDAKELNVQWLRSQIAIVPQEPVLFNCSIAENIAYGDNSRVVPL :.:.:::. :.::.:: . :.:::::::....:: :::.::.:::::::::::::::: CCDS56 LERFYDPLAGKVLLDGKEIKRLNVQWLRAHLGIVSQEPILFDCSIAENIAYGDNSRVVSQ 1090 1100 1110 1120 1130 1140 680 690 700 710 720 730 pF1KE6 DEIKEAANAANIHSFIEGLPEKYNTQVGLKGAQLSGGQKQRLAIARALLQKPKILLLDEA .:: .::. ::::.:::.::.::.:.:: ::.:::::::::.::::::...:.::::::: CCDS56 EEIVRAAKEANIHAFIESLPNKYSTKVGDKGTQLSGGQKQRIAIARALVRQPHILLLDEA 1150 1160 1170 1180 1190 1200 740 750 760 770 780 790 pF1KE6 TSALDNDSEKVVQHALDKARTGRTCLVVTHRLSAIQNADLIVVLHNGKIKEQGTHQELLR :::::..::::::.:::::: ::::.:..::::.:::::::::..::..::.::::.:: CCDS56 TSALDTESEKVVQEALDKAREGRTCIVIAHRLSTIQNADLIVVFQNGRVKEHGTHQQLLA 1210 1220 1230 1240 1250 1260 800 810 pF1KE6 NRDIYFKLVNAQSVQ .. :::..:..:. CCDS56 QKGIYFSMVSVQAGTKRQ 1270 1280 >-- initn: 726 init1: 646 opt: 767 Z-score: 892.1 bits: 176.6 E(32554): 2.3e-43 Smith-Waterman score: 831; 32.0% identity (68.5% similar) in 441 aa overlap (210-629:13-451) 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 IKKADEQMESMTYSTERKTNSLPLHSVKSIKSDFIDKAEESTQSKEISLPEVSLLKILKL :..:. ..: ..:. . : ::...... CCDS56 MDLEGDRNGGAKKKNFFKLNNKSEKDKKEKKPTVSVFSMFRY 10 20 30 40 240 250 260 270 280 pF1KE6 -NKPEWPFVVLGTLASVLNGTVHPVFSIIFAKIITMFGN-----------------NDK- : . ..:.::::....:. :.. ..:... .:.: :: CCDS56 SNWLDKLYMVVGTLAAIIHGAGLPLMMLVFGEMTDIFANAGNLEDLMSNITNRSDINDTG 50 60 70 80 90 100 290 300 310 320 330 pF1KE6 --TTLKHDAEIYSMIFVILGVICFVSYFMQGLFYGRAGEILTMRLRHLAFKAMLYQDIAW .:..: :.. . .:. .:. ..: :. :. ..:. :.:.. :.:.: CCDS56 FFMNLEEDMTRYAYYYSGIGAGVLVAAYIQVSFWCLAAGRQIHKIRKQFFHAIMRQEIGW 110 120 130 140 150 160 340 350 360 370 380 390 pF1KE6 FDEKENSTGGLTTILAIDIAQIQGATGSRIGVLTQNATNMGLSVIISFIYGWEMTFLILS :: .. .: :.: :. :...:. . :..::.. :. ... . :..: ::..:..::. CCDS56 FDVHD--VGELNTRLTDDVSKINEGIGDKIGMFFQSMATFFTGFIVGFTRGWKLTLVILA 170 180 190 200 210 220 400 410 420 430 440 450 pF1KE6 IAPVLAVTGMIETAAMTGFANKDKQELKHAGKIATEALENIRTIVSLTREKAFEQMYEEM :.:::.... . . ...:..:. .:: .: :.: :::.... .: . :.. CCDS56 ISPVLGLSAAVWAKILSSFTDKELLAYAKAGAVAEEVLAAIRTVIAFGGQKKELERYNKN 230 240 250 260 270 280 460 470 480 490 500 510 pF1KE6 LQTQHRNTSKKAQIIGSCYAFSHAFIYFAYAAGFRFGAYLIQAGRMTPEGMFIVFTAIAY :. .: ::: . . . .:: .:: .: .:. :. .:... .. :: .. CCDS56 LEEAKRIGIKKAITANISIGAAFLLIYASYALAFWYGTTLVLSGEYSIGQVLTVFFSVLI 290 300 310 320 330 340 520 530 540 550 560 570 pF1KE6 GAMAIGETLVLAPEYSKAKSGAAHLFALLEKKPNIDSRSQEGKKPDTCEGNLEFREVSFF ::...:.. ...:...: ..: ....::.::: :. :.:::. .::::::.: : CCDS56 GAFSVGQASPSIEAFANARGAAYEIFKIIDNKPSIDSYSKSGHKPDNIKGNLEFRNVHFS 350 360 370 380 390 400 580 590 600 610 620 630 pF1KE6 YPCRPDVFILRGLSLSIERGKTVAFVGSSGCGKSTSVQLLQRLYDPVQGQVLFDGVDAKE :: : .: ::.::.:... :.:::.::.:::::::.:::.::::::..:.: CCDS56 YPSRKEVKILKGLNLKVQSGQTVALVGNSGCGKSTTVQLMQRLYDPTEGMVSVDGQDIRT 410 420 430 440 450 460 640 650 660 670 680 690 pF1KE6 LNVQWLRSQIAIVPQEPVLFNCSIAENIAYGDNSRVVPLDEIKEAANAANIHSFIEGLPE CCDS56 INVRFLREIIGVVSQEPVLFATTIAENIRYGRENVTMDEIEKAVKEANAYDFIMKLPHKF 470 480 490 500 510 520 >>CCDS46444.1 ABCB11 gene_id:8647|Hs108|chr2 (1321 aa) initn: 2596 init1: 1889 opt: 1904 Z-score: 2222.4 bits: 422.8 E(32554): 1.8e-117 Smith-Waterman score: 2588; 47.7% identity (78.0% similar) in 838 aa overlap (2-810:481-1318) 10 20 30 pF1KE6 MVDENDIRALNVRHYRDHIGVVSQEPVLFGT :: .:::.::.. ::.::.: ::::::.: CCDS46 TALVGPSGAGKSTALQLIQRFYDPCEGMVTVDGHDIRSLNIQWLRDQIGIVEQEPVLFST 460 470 480 490 500 510 40 50 60 70 80 90 pF1KE6 TISNNIKYGRDDVTDEEMERAAREANAYDFIMEFPNKFNTLVGEKGAQMSGGQKQRIAIA ::..::.:::.:.: :.. .::.:::::.:::..:..:.::::: :.:::::::::.::: CCDS46 TIAENIRYGREDATMEDIVQAAKEANAYNFIMDLPQQFDTLVGEGGGQMSGGQKQRVAIA 520 530 540 550 560 570 100 110 120 130 140 150 pF1KE6 RALVRNPKILILDEATSALDSESKSAVQAALEKASKGRTTIVVAHRLSTIRSADLIVTLK :::.::::::.:: ::::::.::.. :: .: : ..:.: : :::::::.:.:: :. .. CCDS46 RALIRNPKILLLDMATSALDNESEAMVQEVLSKIQHGHTIISVAHRLSTVRAADTIIGFE 580 590 600 610 620 630 160 170 180 190 200 pF1KE6 DGMLAEKGAHAELMAKRGLYYSLVMSQ----------DIKKADEQ-MESMTYSTERKTNS : .:.:.: ::. ..:.:..:: : ::: : :. : . :.: .: CCDS46 HGTAVERGTHEELLERKGVYFTLVTLQSQGNQALNEEDIKDATEDDMLARTFSRGSYQDS 640 650 660 670 680 690 210 220 230 240 pF1KE6 LPLHSVKSIKSDF-----------IDKA---EESTQSKEISLPE----VSLLKILKLNKP : . ::.. .:. ::. ..:.: . : . . .:::.. : CCDS46 LRASIRQRSKSQLSYLVHEPPLAVVDHKSTYEEDRKDKDIPVQEEVEPAPVRRILKFSAP 700 710 720 730 740 750 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 EWPFVVLGTLASVLNGTVHPVFSIIFAKIITMFGNNDKTTLKHDAEIYSMIFVILGVICF :::....:......:::: :.....:..:. :. :: . . . ..:: .: . . CCDS46 EWPYMLVGSVGAAVNGTVTPLYAFLFSQILGTFSIPDKEEQRSQINGVCLLFVAMGCVSL 760 770 780 790 800 810 310 320 330 340 350 360 pF1KE6 VSYFMQGLFYGRAGEILTMRLRHLAFKAMLYQDIAWFDEKENSTGGLTTILAIDIAQIQG . :.:: ....::.:: :::...:.::: :::::::. .:: :.::: :: : .:.:: CCDS46 FTQFLQGYAFAKSGELLTKRLRKFGFRAMLGQDIAWFDDLRNSPGALTTRLATDASQVQG 820 830 840 850 860 870 370 380 390 400 410 420 pF1KE6 ATGSRIGVLTQNATNMGLSVIISFIYGWEMTFLILSIAPVLAVTGMIETAAMTGFANKDK :.::.::..... ::. ...::.: ..:.....:: . : ::..: .: .::::..:: CCDS46 AAGSQIGMIVNSFTNVTVAMIIAFSFSWKLSLVILCFFPFLALSGATQTRMLTGFASRDK 880 890 900 910 920 930 430 440 450 460 470 480 pF1KE6 QELKHAGKIATEALENIRTIVSLTREKAFEQMYEEMLQTQHRNTSKKAQIIGSCYAFSHA : :. .:.:..::: ::::.... .:. : . : :. ... .::.: : :.::.. CCDS46 QALEMVGQITNEALSNIRTVAGIGKERRFIEALETELEKPFKTAIQKANIYGFCFAFAQC 940 950 960 970 980 990 490 500 510 520 530 540 pF1KE6 FIYFAYAAGFRFGAYLIQAGRMTPEGMFIVFTAIAYGAMAIGETLVLAPEYSKAKSGAAH ....: .:..:.:.:::. . .: :..:.. .: :.:... .: :.::: .::. CCDS46 IMFIANSASYRYGGYLISNEGLHFSYVFRVISAVVLSATALGRAFSYTPSYAKAKISAAR 1000 1010 1020 1030 1040 1050 550 560 570 580 590 600 pF1KE6 LFALLEKKPNIDSRSQEGKKPDTCEGNLEFREVSFFYPCRPDVFILRGLSLSIERGKTVA .: ::...: :. . :.: :. .:...: . .: :: ::: .: :::.:: :.:.: CCDS46 FFQLLDRQPPISVYNTAGEKWDNFQGKIDFVDCKFTYPSRPDSQVLNGLSVSISPGQTLA 1060 1070 1080 1090 1100 1110 610 620 630 640 650 660 pF1KE6 FVGSSGCGKSTSVQLLQRLYDPVQGQVLFDGVDAKELNVQWLRSQIAIVPQEPVLFNCSI ::::::::::::.:::.:.::: ::.:..:: :.:..:::.:::.:.:: :::::: ::: CCDS46 FVGSSGCGKSTSIQLLERFYDPDQGKVMIDGHDSKKVNVQFLRSNIGIVSQEPVLFACSI 1120 1130 1140 1150 1160 1170 670 680 690 700 710 720 pF1KE6 AENIAYGDNSRVVPLDEIKEAANAANIHSFIEGLPEKYNTQVGLKGAQLSGGQKQRLAIA .:: ::::.. .:.... ::. :..:.:. .:::::.:.:: .:.::: :.:::.::: CCDS46 MDNIKYGDNTKEIPMERVIAAAKQAQLHDFVMSLPEKYETNVGSQGSQLSRGEKQRIAIA 1180 1190 1200 1210 1220 1230 730 740 750 760 770 780 pF1KE6 RALLQKPKILLLDEATSALDNDSEKVVQHALDKARTGRTCLVVTHRLSAIQNADLIVVLH ::... ::::::::::::::..:::.:: :::::: ::::.:..::::.:::::.:.:. CCDS46 RAIVRDPKILLLDEATSALDTESEKTVQVALDKAREGRTCIVIAHRLSTIQNADIIAVMA 1240 1250 1260 1270 1280 1290 790 800 810 pF1KE6 NGKIKEQGTHQELLRNRDIYFKLVNAQSVQ .: . :.:::.::. .. :.:::.. : CCDS46 QGVVIEKGTHEELMAQKGAYYKLVTTGSPIS 1300 1310 1320 >-- initn: 612 init1: 335 opt: 635 Z-score: 737.5 bits: 148.1 E(32554): 9.3e-35 Smith-Waterman score: 635; 29.3% identity (67.4% similar) in 341 aa overlap (290-629:141-479) 260 270 280 290 300 310 pF1KE6 VHPVFSIIFAKIITMFGNNDKTTLKHDAEIYSMIFVILGVICFVSYFMQGLFYGRAGEIL .. .. ..: ... ..: :. :. CCDS46 TIVWTNSSLNQNMTNGTRCGLLNIESEMIKFASYYAGIAVAVLITGYIQICFWVIAAARQ 120 130 140 150 160 170 320 330 340 350 360 370 pF1KE6 TMRLRHLAFKAMLYQDIAWFDEKENSTGGLTTILAIDIAQIQGATGSRIGVLTQNATNMG ...:.. :. .. ..:.::: ::.: :.: .. :: .:. : ....... : :. CCDS46 IQKMRKFYFRRIMRMEIGWFDC--NSVGELNTRFSDDINKINDAIADQMALFIQRMTSTI 180 190 200 210 220 380 390 400 410 420 430 pF1KE6 LSVIISFIYGWEMTFLILSIAPVLAVTGMIETAAMTGFANKDKQELKHAGKIATEALENI . ...:. ::..:..:.:..:.... . ... :.. . . .:: .: :.. .. CCDS46 CGFLLGFFRGWKLTLVIISVSPLIGIGAATIGLSVSKFTDYELKAYAKAGVVADEVISSM 230 240 250 260 270 280 440 450 460 470 480 490 pF1KE6 RTIVSLTREKAFEQMYEEMLQTQHRNTSKKAQIIGSCYAFSHAFIYFAYAAGFRFGAYLI ::.... :: . ::. : .: .:. ..: .: .:.. :: .: .:. :. CCDS46 RTVAAFGGEKREVERYEKNLVFAQRWGIRKGIVMGFFTGFVWCLIFLCYALAFWYGSTLV 290 300 310 320 330 340 500 510 520 530 540 550 pF1KE6 -QAGRMTPEGMFIVFTAIAYGAMAIGETLVLAPEYSKAKSGAAHLFALLEKKPNIDSRSQ . :..:: . .: .. ::. .:.. .. ....:. .: ...:: :: :. CCDS46 LDEGEYTPGTLVQIFLSVIVGALNLGNASPCLEAFATGRAAATSIFETIDRKPIIDCMSE 350 360 370 380 390 400 560 570 580 590 600 610 pF1KE6 EGKKPDTCEGNLEFREVSFFYPCRPDVFILRGLSLSIERGKTVAFVGSSGCGKSTSVQLL .: : : .:..::..:.: :: ::.: :: :.. :. :. .:.:: :: ::::..::. CCDS46 DGYKLDRIKGEIEFHNVTFHYPSRPEVKILNDLNMVIKPGEMTALVGPSGAGKSTALQLI 410 420 430 440 450 460 620 630 640 650 660 670 pF1KE6 QRLYDPVQGQVLFDGVDAKELNVQWLRSQIAIVPQEPVLFNCSIAENIAYGDNSRVVPLD ::.::: .:.: CCDS46 QRFYDPCEGMVTVDGHDIRSLNIQWLRDQIGIVEQEPVLFSTTIAENIRYGREDATMEDI 470 480 490 500 510 520 >>CCDS5607.1 ABCB4 gene_id:5244|Hs108|chr7 (1232 aa) initn: 3015 init1: 1337 opt: 1342 Z-score: 1565.2 bits: 301.1 E(32554): 7.3e-81 Smith-Waterman score: 2918; 56.1% identity (81.6% similar) in 820 aa overlap (2-810:455-1227) 10 20 30 pF1KE6 MVDENDIRALNVRHYRDHIGVVSQEPVLFGT .: .::: .:: . :. :::::::::::.: CCDS56 VALVGSSGCGKSTTVQLIQRLYDPDEGTINIDGQDIRNFNVNYLREIIGVVSQEPVLFST 430 440 450 460 470 480 40 50 60 70 80 90 pF1KE6 TISNNIKYGRDDVTDEEMERAAREANAYDFIMEFPNKFNTLVGEKGAQMSGGQKQRIAIA ::..:: ::: .:: .:...:..:::::.:::..:.::.:::::.:::.::::::::::: CCDS56 TIAENICYGRGNVTMDEIKKAVKEANAYEFIMKLPQKFDTLVGERGAQLSGGQKQRIAIA 490 500 510 520 530 540 100 110 120 130 140 150 pF1KE6 RALVRNPKILILDEATSALDSESKSAVQAALEKASKGRTTIVVAHRLSTIRSADLIVTLK ::::::::::.:::::::::.::.. :::::.:: .::::::.::::::.:.::.:. .. 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CCDS56 LDTESEKVVQEALDKAREGRTCIVIAHRLSTIQNADLIVVFQNGRVKEHGTHQQLLAQKG 1160 1170 1180 1190 1200 1210 810 pF1KE6 IYFKLVNAQSVQ :::..:..:. CCDS56 IYFSMVSVQAGTQNL 1220 1230 >-- initn: 699 init1: 599 opt: 778 Z-score: 905.3 bits: 179.0 E(32554): 4.2e-44 Smith-Waterman score: 786; 32.1% identity (67.0% similar) in 430 aa overlap (220-629:26-453) 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 MTYSTERKTNSLPLHSVKSIKSDFIDKAEESTQSKEISLPEVSLLKILKLNK-PEWP--- :...:. . :... .: : . .: CCDS56 MDLEAAKNGTAWRPTSAEGDFELGISSKQKRKKTKTVKMIGVLTLFRYSDWQDKL 10 20 30 40 50 250 260 270 280 pF1KE6 FVVLGTLASVLNGTVHPVFSIIFAKIITMF----GN------------NDKTTLKHDAEI :. :::. .. .:. :.. :.:... : :: : :... 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CCDS56 AISANISMGIAFLLIYASYALAFWYGSTLVISKEYTIGNAMTVFFSILIGAFSVGQAAPC 300 310 320 330 340 350 530 540 550 560 570 580 pF1KE6 APEYSKAKSGAAHLFALLEKKPNIDSRSQEGKKPDTCEGNLEFREVSFFYPCRPDVFILR ...:...: .: .....:.::: :..:.:::. .::::: .: : :: : .: ::. CCDS56 IDAFANARGAAYVIFDIIDNNPKIDSFSERGHKPDSIKGNLEFNDVHFSYPSRANVKILK 360 370 380 390 400 410 590 600 610 620 630 640 pF1KE6 GLSLSIERGKTVAFVGSSGCGKSTSVQLLQRLYDPVQGQVLFDGVDAKELNVQWLRSQIA ::.:... :.:::.::::::::::.:::.:::::: .: . 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CCDS47 GSAD--TFTRNLTLMSILTIASAVLEFVG---DGIYNNTMGHVHS-HLQGEVFGAVLRQE 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE6 IAWFDEKENSTGGLTTILAIDIAQIQGATGSRIGVLTQNATNMGLSVIISFIYG-WEMTF .: ..:.::.. . .. : . .. . . .... . :: .. ...: .:. CCDS47 TEFF--QQNQTGNIMSRVTEDTSTLSDSLSENLSLFLWYLVR-GLCLLGIMLWGSVSLTM 340 350 360 370 380 400 410 420 430 440 450 pF1KE6 LILSIAPVLAVTGMIETAAMTGFANKDKQELKHAGKIATEALENIRTIVSLTREKAFEQM . : :.: . . . . .. : .....: ::: . :. :.. :.. : CCDS47 VTLITLPLLFLLPKKVGKWYQLLEVQVRESLAKSSQVAIEALSAMPTVRSFANEEGEAQK 390 400 410 420 430 440 460 470 480 490 500 510 pF1KE6 YEEMLQTQHRNTSKKAQIIGSCYAFSHAFIYFAYAAGFRF-GAYLIQAGRMTPEGMFIVF ..: :: . .. ..: . . ... .. . .:. . :. :. .: .. : ...: CCDS47 FREKLQ-EIKTLNQKEAVAYAVNSWTTSISGMLLKVGILYIGGQLVTSGAVSS-GNLVTF 450 460 470 480 490 500 520 530 540 550 560 570 pF1KE6 TAIAYG-AMAIGETLVLAPEYSKAKSGAAHLFALLEKKPNIDSRSQEGKKPDTCEGNLEF . . ..:. : . :. .:: ... ..: :.. : . : :: ..: CCDS47 VLYQMQFTQAVEVLLSIYPRVQKAVGSSEKIFEYLDRTPRCPPSGLL--TPLHLEGLVQF 510 520 530 540 550 560 580 590 600 610 620 630 pF1KE6 REVSFFYPCRPDVFILRGLSLSIERGKTVAFVGSSGCGKSTSVQLLQRLYDPVQGQVLFD ..::: :: ::::..:.::..... :...:.:: .: :::: . ::: ::.:. ::.:.: CCDS47 QDVSFAYPNRPDVLVLQGLTFTLRPGEVTALVGPNGSGKSTVAALLQNLYQPTGGQLLLD 570 580 590 600 610 620 640 650 660 670 680 690 pF1KE6 GVDAKELNVQWLRSQIAIVPQEPVLFNCSIAENIAYGDNSRVVPLDEIKEAANAANIHSF : . . ..:. :.: : ::: .:. :. :::::: ... . ..:: :: .. ::: CCDS47 GKPLPQYEHRYLHRQVAAVGQEPQVFGRSLQENIAYGLTQKPT-MEEITAAAVKSGAHSF 630 640 650 660 670 680 700 710 720 730 740 750 pF1KE6 IEGLPEKYNTQVGLKGAQLSGGQKQRLAIARALLQKPKILLLDEATSALDNDSEKVVQHA : :::. :.:.: :.::::::.: .:.::::..:: .:.::.:::::: .:. :.. 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