FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7036, 397 aa 1>>>pF1KB7036 397 - 397 aa - 397 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7083+/-0.00112; mu= 14.8048+/- 0.067 mean_var=126.5991+/-42.083, 0's: 0 Z-trim(104.2): 340 B-trim: 970 in 2/47 Lambda= 0.113988 statistics sampled from 7131 (7760) to 7131 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.597), E-opt: 0.2 (0.238), width: 16 Scan time: 2.580 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 397) 2642 446.6 1.9e-125 CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 359) 2352 398.9 4e-111 CCDS5156.1 TAAR5 gene_id:9038|Hs108|chr6 ( 337) 538 100.5 2.4e-21 CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5 ( 446) 522 98.0 1.8e-20 CCDS34273.2 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 360) 520 97.6 2e-20 CCDS34271.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 378) 520 97.6 2e-20 CCDS34270.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 387) 520 97.6 2.1e-20 CCDS4291.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 388) 520 97.6 2.1e-20 CCDS75353.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 411) 520 97.6 2.1e-20 CCDS34541.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 ( 351) 519 97.4 2.2e-20 CCDS34272.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 428) 520 97.7 2.2e-20 CCDS5157.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 ( 306) 512 96.2 4.4e-20 CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 342) 511 96.1 5.3e-20 CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 429) 511 96.2 6.1e-20 CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 455) 511 96.2 6.4e-20 CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 466) 511 96.2 6.5e-20 CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 475) 511 96.2 6.6e-20 CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5 ( 520) 510 96.1 7.8e-20 CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10 ( 477) 509 95.9 8.3e-20 CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20 ( 572) 509 96.0 9.3e-20 CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5 ( 413) 494 93.4 4.2e-19 CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5 ( 422) 483 91.6 1.5e-18 CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8 ( 408) 477 90.6 2.9e-18 CCDS197.1 HTR6 gene_id:3362|Hs108|chr1 ( 440) 453 86.7 4.6e-17 CCDS5158.1 TAAR1 gene_id:134864|Hs108|chr6 ( 339) 450 86.0 5.5e-17 CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 432) 444 85.2 1.3e-16 CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 445) 444 85.2 1.3e-16 CCDS7408.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 479) 444 85.2 1.4e-16 CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10 ( 465) 441 84.7 1.9e-16 CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 440 84.5 1.9e-16 CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1 ( 377) 432 83.1 4.6e-16 CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6 ( 345) 429 82.6 6.1e-16 CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4 ( 462) 430 82.9 6.6e-16 CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 428 82.5 7.3e-16 CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6 ( 390) 427 82.3 8.3e-16 CCDS7293.1 TACR2 gene_id:6865|Hs108|chr10 ( 398) 427 82.3 8.4e-16 CCDS5006.1 HTR1E gene_id:3354|Hs108|chr6 ( 365) 422 81.5 1.4e-15 CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3 ( 366) 416 80.5 2.8e-15 CCDS3405.1 DRD5 gene_id:1816|Hs108|chr4 ( 477) 416 80.6 3.3e-15 CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 414 80.2 3.5e-15 CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2 ( 450) 412 79.9 5e-15 CCDS9405.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13 ( 471) 412 80.0 5.2e-15 CCDS14564.1 HTR2C gene_id:3358|Hs108|chrX ( 458) 410 79.6 6.4e-15 CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 408 79.2 7.2e-15 CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6 ( 348) 405 78.7 9.5e-15 CCDS839.1 ADORA3 gene_id:140|Hs108|chr1 ( 318) 404 78.4 1e-14 CCDS2604.1 HRH1 gene_id:3269|Hs108|chr3 ( 487) 405 78.8 1.2e-14 CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 399 77.7 1.9e-14 CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 399 77.7 2e-14 CCDS1958.1 TACR1 gene_id:6869|Hs108|chr2 ( 407) 399 77.7 2.1e-14 >>CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 (397 aa) initn: 2642 init1: 2642 opt: 2642 Z-score: 2365.8 bits: 446.6 E(32554): 1.9e-125 Smith-Waterman score: 2642; 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CCDS51 VFIQGAEEHPAAFCYQVNGSCPRTVHTLGIQLVIYLACAAGMLIIVLGNVFVAFAVSYFK 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KB7 RLRNLTNCFIVSLAITDLLLGLLVLPFSAIYQLSCKWSFGKVFCNIYTSLDVMLCTASIL :.. :: ...:::..:..:::::::.:.: .. : :: .: ..: ::...: .::. CCDS51 ALHTPTNFLLLSLALADMFLGLLVLPLSTIRSVESCWFFGDFLCRLHTYLDTLFCLTSIF 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KB7 NLFMISLDRYCAVMDPLRYPVLVTPVRVAISLVLI-WVISITLS--FLSIHLGWNSRNET .: .::.::.::. ::: :: : ::::. .: : . . . :: . . .. CCDS51 HLCFISIDRHCAICDPLLYPSKFT-VRVALRYILAGWGVPAAYTSLFLYTDVVETRLSQW 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KB7 SKGNHTTSKCKVQVNEVYGLVDGLVTFYLPLLIMCITYYRIFKVARDQAKRINHIS-SWK . ...:.. .:. .: .. . :..: ::: : .:: :: ::..:. .: : CCDS51 LEEMPCVGSCQLLLNKFWGWLN-FPLFFVPCLIMISLYVKIFVVATRQAQQITTLSKSLA 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KB7 AATIREHKATVTLAAVMGAFIICWFPYFTAFVYRGLRGDDAINEVLEAIVLWLGYANSAL .:. .:.::. ::. ..: ...::.:. . .: . :.. : .:..: ::: CCDS51 GAAKHERKAAKTLGIAVGIYLLCWLPFTIDTMVDSLLHFITPPLVFD-IFIWFAYFNSAC 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KB7 NPILYAALNRDFRTGYQQLFCCRLANRNSHKTSLRSNASQLSRTQSREPRQQEEKPLKLQ :::.:. . :: CCDS51 NPIIYVFSYQWFRKALKLTLSQKVFSPQTRTVDLYQE 310 320 330 >>CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5 (446 aa) initn: 448 init1: 270 opt: 522 Z-score: 481.0 bits: 98.0 E(32554): 1.8e-20 Smith-Waterman score: 689; 35.1% identity (64.7% similar) in 368 aa overlap (18-342:23-387) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MAPNGTASSFCLDSTACKITITVVLAVLILITVAGNVVVCLAVGLNRRLRN-LTN .: . :..::: :. ::..:: :: :.::. .:: CCDS43 MRTLNTSAMDGTGLVVERDFSVRILTACFLSLLILSTLLGNTLVCAAVIRFRHLRSKVTN 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 CFIVSLAITDLLLGLLVLPFSAIYQLSCKWSFGKVFCNIYTSLDVMLCTASILNLFMISL :..:::..:::...::.:..:. ... : ::. ::::....:.: ::::::: .::. CCDS43 FFVISLAVSDLLVAVLVMPWKAVAEIAGFWPFGS-FCNIWVAFDIMCSTASILNLCVISV 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 DRYCAVMDPLRYPVLVTPVRVAISLVLIWVISITLSFLSIHLGWNSRNETSK--GNHTT- ::: :. .:.:: .:: . : . . :..:. .::. ..:.:.. . :: :: :. CCDS43 DRYWAISSPFRYERKMTPKAAFILISVAWTLSVLISFIPVQLSWHKAKPTSPSDGNATSL 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 pF1KB7 ----SKCKVQVNEVYGLVDGLVTFYLPLLIMCITYYRIFKVARDQAKRINHI-------- ..: .....:.. .....::.:. :: .:: ::...:. : .:: . CCDS43 AETIDNCDSSLSRTYAISSSVISFYIPVAIMIVTYTRIYRIAQKQIRRIAALERAAVHAK 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 pF1KB7 ------------------SSWKAATIREHKATVTLAAVMGAFIICWFPYFT-----AFVY ::.: . :: :. ::...::.:. ::.:.: : CCDS43 NCQTTTGNGKPVECSQPESSFKMSFKRETKVLKTLSVIMGVFVCCWLPFFILNCILPFCG 240 250 260 270 280 290 260 270 280 290 300 310 pF1KB7 RGLRGDDAINEVLEAIVLWLGYANSALNPILYAALNRDFRTGYQQLFCC-RL--ANRNSH : :. . .:.:.:::.::::.:: .: ::: ... :. : :: :. :. CCDS43 SGETQPFCIDSNTFDVFVWFGWANSSLNPIIYA-FNADFRKAFSTLLGCYRLCPATNNAI 300 310 320 330 340 350 320 330 340 350 360 370 pF1KB7 KT-SLRSNASQLSRTQSREPRQQEEKPLKLQVWSGTEVTAPQGATDRPWLCLPECWSVEL .: :. .:.. . .. .::: . : .: CCDS43 ETVSINNNGAAMFSSH-HEPRGSISKECNLVYLIPHAVGSSEDLKKEEAAGIARPLEKLS 360 370 380 390 400 410 >>CCDS34273.2 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 (360 aa) initn: 726 init1: 245 opt: 520 Z-score: 480.3 bits: 97.6 E(32554): 2e-20 Smith-Waterman score: 699; 40.1% identity (69.6% similar) in 312 aa overlap (18-305:19-329) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MAPNGTASSFCLDSTACKITITVVLAVLILITVAGNVVVCLAVGLNRRLRNL-TNCFIV :... . :...::... ::..: .:: .:.::.. :: ::: CCDS34 MDKLDANVSSEEGFGSVEKVVLLTFLSTVILMAILGNLLVMVAVCWDRQLRKIKTNYFIV 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 SLAITDLLLGLLVLPFSAIYQLSCKWSFGKVFCNIYTSLDVMLCTASILNLFMISLDRYC :::..:::...::.::.:: .. : .:.::: . :::::.: ::::..: :::::: CCDS34 SLAFADLLVSVLVMPFGAIELVQDIWIYGEVFCLVRTSLDVLLTTASIFHLCCISLDRYY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 AVM-DPLRYPVLVTPVRVAISLVLIWVISITLSFLSIHLGWNSRN-----ETSKGNHTTS :. .:: : .::.:.:. : ::: .::: : :::. . : : :.... 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CCDS34 STYCVFMVNKPYAITCSVVAFYIPFLLMVLAYYRIYVTAKEHAHQIQMLQRAGASSESRP 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 pF1KB7 ----------IR-EHKATVTLAAVMGAFIICWFPYFTAFVYRGLRGDDAINEVLEAIVLW .: : ::. :: .:: : .:: :.:.. . . . ..: :. :: CCDS34 QSADQHSTHRMRTETKAAKTLCIIMGCFCLCWAPFFVTNIVDPFIDYTVPGQVWTAF-LW 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KB7 LGYANSALNPILYAALNRDFRTGYQQLFCCRLANRNSHKTSLRSNASQLSRTQSREPRQQ ::: ::.:::.::: ::..:: .. ..:: CCDS34 LGYINSGLNPFLYAFLNKSFRRAFLIILCCDDERYRRPSILGQTVPCSTTTINGSTHVLR 300 310 320 330 340 350 >>CCDS34271.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 (378 aa) initn: 726 init1: 245 opt: 520 Z-score: 480.1 bits: 97.6 E(32554): 2e-20 Smith-Waterman score: 699; 40.1% identity (69.6% similar) in 312 aa overlap (18-305:19-329) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MAPNGTASSFCLDSTACKITITVVLAVLILITVAGNVVVCLAVGLNRRLRNL-TNCFIV :... . :...::... ::..: .:: .:.::.. :: ::: CCDS34 MDKLDANVSSEEGFGSVEKVVLLTFLSTVILMAILGNLLVMVAVCWDRQLRKIKTNYFIV 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 SLAITDLLLGLLVLPFSAIYQLSCKWSFGKVFCNIYTSLDVMLCTASILNLFMISLDRYC :::..:::...::.::.:: .. : .:.::: . :::::.: ::::..: :::::: CCDS34 SLAFADLLVSVLVMPFGAIELVQDIWIYGEVFCLVRTSLDVLLTTASIFHLCCISLDRYY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 AVM-DPLRYPVLVTPVRVAISLVLIWVISITLSFLSIHLGWNSRN-----ETSKGNHTTS :. .:: : .::.:.:. : ::: .::: : :::. . : : :.... 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