FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2528, 449 aa 1>>>pF1KE2528 449 - 449 aa - 449 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0583+/-0.000738; mu= 19.6481+/- 0.045 mean_var=68.9713+/-14.006, 0's: 0 Z-trim(108.6): 75 B-trim: 5 in 1/50 Lambda= 0.154433 statistics sampled from 10274 (10350) to 10274 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.673), E-opt: 0.2 (0.318), width: 16 Scan time: 2.120 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS4320.1 GLRA1 gene_id:2741|Hs108|chr5 ( 449) 3026 683.0 1.6e-196 CCDS54942.1 GLRA1 gene_id:2741|Hs108|chr5 ( 457) 3000 677.3 8.9e-195 CCDS43283.1 GLRA3 gene_id:8001|Hs108|chr4 ( 449) 2523 571.0 8.7e-163 CCDS3822.1 GLRA3 gene_id:8001|Hs108|chr4 ( 464) 2387 540.7 1.2e-153 CCDS48085.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX ( 452) 2337 529.5 2.6e-150 CCDS14160.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX ( 452) 2331 528.2 6.6e-150 CCDS43980.2 GLRA4 gene_id:441509|Hs108|chrX ( 417) 2070 470.0 2e-132 CCDS55371.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX ( 363) 2008 456.2 2.5e-128 CCDS3796.1 GLRB gene_id:2743|Hs108|chr4 ( 497) 1170 269.6 5.2e-72 CCDS54813.1 GLRB gene_id:2743|Hs108|chr4 ( 303) 987 228.6 6.7e-60 CCDS3471.1 GABRA2 gene_id:2555|Hs108|chr4 ( 451) 983 227.9 1.7e-59 CCDS4357.1 GABRA1 gene_id:2554|Hs108|chr5 ( 456) 954 221.4 1.5e-57 CCDS4354.1 GABRB2 gene_id:2561|Hs108|chr5 ( 474) 943 219.0 8.4e-57 CCDS4355.1 GABRB2 gene_id:2561|Hs108|chr5 ( 512) 940 218.3 1.4e-56 CCDS10018.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 473) 938 217.8 1.8e-56 CCDS45194.1 GABRA5 gene_id:2558|Hs108|chr15 ( 462) 936 217.4 2.4e-56 CCDS10019.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 473) 935 217.2 2.9e-56 CCDS3474.1 GABRB1 gene_id:2560|Hs108|chr4 ( 474) 935 217.2 2.9e-56 CCDS4375.1 GABRP gene_id:2568|Hs108|chr5 ( 440) 927 215.4 9.4e-56 CCDS36.1 GABRD gene_id:2563|Hs108|chr1 ( 452) 927 215.4 9.6e-56 CCDS59029.1 GABRR1 gene_id:2569|Hs108|chr6 ( 462) 920 213.8 2.9e-55 CCDS5019.2 GABRR1 gene_id:2569|Hs108|chr6 ( 479) 920 213.8 3e-55 CCDS3470.1 GABRG1 gene_id:2565|Hs108|chr4 ( 465) 910 211.6 1.4e-54 CCDS4358.1 GABRG2 gene_id:2566|Hs108|chr5 ( 467) 905 210.5 2.9e-54 CCDS59028.1 GABRR1 gene_id:2569|Hs108|chr6 ( 392) 901 209.5 4.8e-54 CCDS14707.1 GABRQ gene_id:55879|Hs108|chrX ( 632) 902 209.9 5.9e-54 CCDS3473.1 GABRA4 gene_id:2557|Hs108|chr4 ( 554) 876 204.1 3e-52 CCDS5020.3 GABRR2 gene_id:2570|Hs108|chr6 ( 465) 873 203.4 4.1e-52 CCDS4356.1 GABRA6 gene_id:2559|Hs108|chr5 ( 453) 872 203.1 4.7e-52 CCDS82921.1 GABRA2 gene_id:2555|Hs108|chr4 ( 511) 866 201.8 1.3e-51 CCDS14706.1 GABRA3 gene_id:2556|Hs108|chrX ( 492) 855 199.4 6.9e-51 CCDS4359.1 GABRG2 gene_id:2566|Hs108|chr5 ( 475) 854 199.1 7.9e-51 CCDS45195.1 GABRG3 gene_id:2567|Hs108|chr15 ( 467) 845 197.1 3.1e-50 CCDS53921.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 402) 807 188.6 9.8e-48 CCDS54617.1 GABRR3 gene_id:200959|Hs108|chr3 ( 467) 806 188.4 1.3e-47 CCDS53920.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 388) 787 184.1 2.1e-46 CCDS14703.1 GABRE gene_id:2564|Hs108|chrX ( 506) 787 184.2 2.6e-46 CCDS75368.1 GABRP gene_id:2568|Hs108|chr5 ( 289) 680 160.2 2.5e-39 CCDS47333.1 GABRG2 gene_id:2566|Hs108|chr5 ( 515) 465 112.5 1e-24 CCDS59251.1 GABRG3 gene_id:2567|Hs108|chr15 ( 253) 438 106.3 3.8e-23 CCDS6135.1 CHRNA6 gene_id:8973|Hs108|chr8 ( 494) 305 76.8 5.4e-14 CCDS8365.2 HTR3A gene_id:3359|Hs108|chr11 ( 484) 303 76.4 7.2e-14 CCDS53710.1 HTR3A gene_id:3359|Hs108|chr11 ( 463) 289 73.2 6e-13 CCDS53924.1 CHRNA7 gene_id:1139|Hs108|chr15 ( 531) 281 71.5 2.3e-12 CCDS8366.2 HTR3A gene_id:3359|Hs108|chr11 ( 516) 280 71.3 2.6e-12 CCDS3459.1 CHRNA9 gene_id:55584|Hs108|chr4 ( 479) 279 71.0 2.9e-12 CCDS2261.1 CHRNA1 gene_id:1134|Hs108|chr2 ( 457) 269 68.8 1.3e-11 CCDS53964.1 CHRNA3 gene_id:1136|Hs108|chr15 ( 489) 263 67.5 3.5e-11 CCDS10305.1 CHRNA3 gene_id:1136|Hs108|chr15 ( 505) 263 67.5 3.6e-11 CCDS10306.1 CHRNB4 gene_id:1143|Hs108|chr15 ( 498) 262 67.3 4.1e-11 >>CCDS4320.1 GLRA1 gene_id:2741|Hs108|chr5 (449 aa) initn: 3026 init1: 3026 opt: 3026 Z-score: 3641.7 bits: 683.0 E(32554): 1.6e-196 Smith-Waterman score: 3026; 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83.9% identity (94.8% similar) in 441 aa overlap (9-449:14-447) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MYSFNTLRLYLWETIVFFSLAASKEAEAARSAPKPMSPSDFLDKLMGRTSGYDAR .:.::. ...::.:.::...::: ::::::::::::::::::::: CCDS43 MAHVRHFRTLVSGFYFWEAALLLSLVATKETDSARSRSAPMSPSDFLDKLMGRTSGYDAR 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 IRPNFKGPPVNVSCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQQWNDPRLAYNEYPDDSLDLDP ::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::::::.::::::::::: CCDS43 IRPNFKGPPVNVTCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQKWNDPRLAYSEYPDDSLDLDP 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 SMLDSIWKPDLFFANEKGAHFHEITTDNKLLRISRNGNVLYSIRITLTLACPMDLKNFPM :::::::::::::::::::.:::.::::::::: .:::::::::.::::.:::::::::: CCDS43 SMLDSIWKPDLFFANEKGANFHEVTTDNKLLRIFKNGNVLYSIRLTLTLSCPMDLKNFPM 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 DVQTCIMQLESFGYTMNDLIFEWQEQGAVQVADGLTLPQFILKEEKDLRYCTKHYNTGKF ::::::::::::::::::::::::... ::::.:::::::.::::::::::::::::::: CCDS43 DVQTCIMQLESFGYTMNDLIFEWQDEAPVQVAEGLTLPQFLLKEEKDLRYCTKHYNTGKF 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 TCIEARFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWISFWINMDAAPARVGLGITTVLTMTTQS ::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.::::::::::::: CCDS43 TCIEVRFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWVSFWINMDAAPARVALGITTVLTMTTQS 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 SGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFSALLEYAAVNFVSRQHKELLRFRRKRRHHKED ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.. :.: CCDS43 SGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFSALLEYAAVNFVSRQHKELLRFRRKRKN-KDD 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 EAGEGRFNFSAYGMGPACLQAKDGISVKGANNSNTTNPPPAPSKSPEEMRKLFIQRAKKI :. :.::.:.:::::: :::::::.. :: :. . : :::.::::.::.::::: CCDS43 EVRESRFSFTAYGMGP-CLQAKDGMTPKGPNHPVQVMP-----KSPDEMRKVFIDRAKKI 360 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 DKISRIGFPMAFLIFNMFYWIIYKIVRREDVHNQ : ::: ::.::::::.:::.::::.:.::.:.: CCDS43 DTISRACFPLAFLIFNIFYWVIYKILRHEDIHQQQD 420 430 440 >>CCDS3822.1 GLRA3 gene_id:8001|Hs108|chr4 (464 aa) initn: 2457 init1: 2136 opt: 2387 Z-score: 2872.1 bits: 540.7 E(32554): 1.2e-153 Smith-Waterman score: 2494; 81.3% identity (91.9% similar) in 455 aa overlap (9-449:14-462) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MYSFNTLRLYLWETIVFFSLAASKEAEAARSAPKPMSPSDFLDKLMGRTSGYDAR .:.::. ...::.:.::...::: ::::::::::::::::::::: CCDS38 MAHVRHFRTLVSGFYFWEAALLLSLVATKETDSARSRSAPMSPSDFLDKLMGRTSGYDAR 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 IRPNFKGPPVNVSCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQQWNDPRLAYNEYPDDSLDLDP ::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::::::.::::::::::: CCDS38 IRPNFKGPPVNVTCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQKWNDPRLAYSEYPDDSLDLDP 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 SMLDSIWKPDLFFANEKGAHFHEITTDNKLLRISRNGNVLYSIRITLTLACPMDLKNFPM :::::::::::::::::::.:::.::::::::: .:::::::::.::::.:::::::::: CCDS38 SMLDSIWKPDLFFANEKGANFHEVTTDNKLLRIFKNGNVLYSIRLTLTLSCPMDLKNFPM 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 DVQTCIMQLESFGYTMNDLIFEWQEQGAVQVADGLTLPQFILKEEKDLRYCTKHYNTGKF ::::::::::::::::::::::::... ::::.:::::::.::::::::::::::::::: CCDS38 DVQTCIMQLESFGYTMNDLIFEWQDEAPVQVAEGLTLPQFLLKEEKDLRYCTKHYNTGKF 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 TCIEARFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWISFWINMDAAPARVGLGITTVLTMTTQS ::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.::::::::::::: CCDS38 TCIEVRFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWVSFWINMDAAPARVALGITTVLTMTTQS 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 SGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFSALLEYAAVNFVSRQHKELLRFRRKRRHHKE- ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::... : CCDS38 SGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFSALLEYAAVNFVSRQHKELLRFRRKRKNKTEA 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 pF1KE2 -------------DEAGEGRFNFSAYGMGPACLQAKDGISVKGANNSNTTNPPPAPSKSP ::. :.::.:.:::::: :::::::.. :: :. . : ::: CCDS38 FALEKFYRFSDMDDEVRESRFSFTAYGMGP-CLQAKDGMTPKGPNHPVQVMP-----KSP 370 380 390 400 410 410 420 430 440 pF1KE2 EEMRKLFIQRAKKIDKISRIGFPMAFLIFNMFYWIIYKIVRREDVHNQ .::::.::.:::::: ::: ::.::::::.:::.::::.:.::.:.: CCDS38 DEMRKVFIDRAKKIDTISRACFPLAFLIFNIFYWVIYKILRHEDIHQQQD 420 430 440 450 460 >>CCDS48085.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX (452 aa) initn: 2236 init1: 1988 opt: 2337 Z-score: 2812.0 bits: 529.5 E(32554): 2.6e-150 Smith-Waterman score: 2337; 79.9% identity (91.5% similar) in 437 aa overlap (18-449:22-452) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MYSFNTLRLYLWETIVFFSLAASKEAEAARSAPKP---MSPSDFLDKLMGRTSGYD : : :. .. ::. .: .::::::::::::::::: CCDS48 MNRQLVNILTALFAFFLETNHFRTAFCKDHDS-RSGKQPSQTLSPSDFLDKLMGRTSGYD 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 ARIRPNFKGPPVNVSCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQQWNDPRLAYNEYPDDSLDL ::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::: ::::.::::::::: CCDS48 ARIRPNFKGPPVNVTCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQQWNDSRLAYSEYPDDSLDL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 DPSMLDSIWKPDLFFANEKGAHFHEITTDNKLLRISRNGNVLYSIRITLTLACPMDLKNF :::::::::::::::::::::.::..::::::::::.::.::::::.::::.:::::::: CCDS48 DPSMLDSIWKPDLFFANEKGANFHDVTTDNKLLRISKNGKVLYSIRLTLTLSCPMDLKNF 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 PMDVQTCIMQLESFGYTMNDLIFEWQEQGAVQVADGLTLPQFILKEEKDLRYCTKHYNTG ::::::: ::::::::::::::::: .: ::::.:::::::::::::.: ::::::::: CCDS48 PMDVQTCTMQLESFGYTMNDLIFEWLSDGPVQVAEGLTLPQFILKEEKELGYCTKHYNTG 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 KFTCIEARFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWISFWINMDAAPARVGLGITTVLTMTT ::::::..::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.::::::::::: CCDS48 KFTCIEVKFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWVSFWINMDAAPARVALGITTVLTMTT 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 QSSGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFSALLEYAAVNFVSRQHKELLRFRR--KRRH ::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::.:: ::.. CCDS48 QSSGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFAALLEYAAVNFVSRQHKEFLRLRRRQKRQN 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 HKEDEAGEGRFNFSAYGMGPACLQAKDGISVKGANNSNTTNPPPAPSKSPEEMRKLFIQR ..:: . :.:::::.:::: :::.::: .:: .. .:: : : :. . ..: :..: CCDS48 KEEDVTRESRFNFSGYGMGH-CLQVKDGTAVK----ATPANPLPQPPKDGDAIKKKFVDR 360 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 AKKIDKISRIGFPMAFLIFNMFYWIIYKIVRREDVHNQ ::.:: ::: .::.::::::.:::: :::.:.::::.. CCDS48 AKRIDTISRAAFPLAFLIFNIFYWITYKIIRHEDVHKK 420 430 440 450 >>CCDS14160.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX (452 aa) initn: 2230 init1: 1982 opt: 2331 Z-score: 2804.8 bits: 528.2 E(32554): 6.6e-150 Smith-Waterman score: 2331; 79.4% identity (91.5% similar) in 437 aa overlap (18-449:22-452) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MYSFNTLRLYLWETIVFFSLAASKEAEAARSAPKP---MSPSDFLDKLMGRTSGYD : : :. .. ::. .: .::::::::::::::::: CCDS14 MNRQLVNILTALFAFFLETNHFRTAFCKDHDS-RSGKQPSQTLSPSDFLDKLMGRTSGYD 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 ARIRPNFKGPPVNVSCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQQWNDPRLAYNEYPDDSLDL ::::::::::::::.::::::::::..:::::::::::::::::: ::::.::::::::: CCDS14 ARIRPNFKGPPVNVTCNIFINSFGSVTETTMDYRVNIFLRQQWNDSRLAYSEYPDDSLDL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 DPSMLDSIWKPDLFFANEKGAHFHEITTDNKLLRISRNGNVLYSIRITLTLACPMDLKNF :::::::::::::::::::::.::..::::::::::.::.::::::.::::.:::::::: CCDS14 DPSMLDSIWKPDLFFANEKGANFHDVTTDNKLLRISKNGKVLYSIRLTLTLSCPMDLKNF 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 PMDVQTCIMQLESFGYTMNDLIFEWQEQGAVQVADGLTLPQFILKEEKDLRYCTKHYNTG ::::::: ::::::::::::::::: .: ::::.:::::::::::::.: ::::::::: CCDS14 PMDVQTCTMQLESFGYTMNDLIFEWLSDGPVQVAEGLTLPQFILKEEKELGYCTKHYNTG 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 KFTCIEARFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWISFWINMDAAPARVGLGITTVLTMTT ::::::..::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.::::::::::: CCDS14 KFTCIEVKFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWVSFWINMDAAPARVALGITTVLTMTT 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 QSSGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFSALLEYAAVNFVSRQHKELLRFRR--KRRH ::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::.:: ::.. CCDS14 QSSGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFAALLEYAAVNFVSRQHKEFLRLRRRQKRQN 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 HKEDEAGEGRFNFSAYGMGPACLQAKDGISVKGANNSNTTNPPPAPSKSPEEMRKLFIQR ..:: . :.:::::.:::: :::.::: .:: .. .:: : : :. . ..: :..: CCDS14 KEEDVTRESRFNFSGYGMGH-CLQVKDGTAVK----ATPANPLPQPPKDGDAIKKKFVDR 360 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 AKKIDKISRIGFPMAFLIFNMFYWIIYKIVRREDVHNQ ::.:: ::: .::.::::::.:::: :::.:.::::.. CCDS14 AKRIDTISRAAFPLAFLIFNIFYWITYKIIRHEDVHKK 420 430 440 450 >>CCDS43980.2 GLRA4 gene_id:441509|Hs108|chrX (417 aa) initn: 2031 init1: 1056 opt: 2070 Z-score: 2491.0 bits: 470.0 E(32554): 2e-132 Smith-Waterman score: 2070; 76.3% identity (89.7% similar) in 409 aa overlap (9-409:12-416) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MYSFNTLRLYLWETI--VFFSLA-ASKEAEAARSAPKPMSPSDFLDKLMGRTSGYDA : :: :.. .: :..:.... .. .:::::::::::::::::::: CCDS43 MTTLVPATLSFLLLWTLPGQVLLRVALAKEEVKSGTKGSQPMSPSDFLDKLMGRTSGYDA 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 RIRPNFKGPPVNVSCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQQWNDPRLAYNEYPDDSLDLD :::::::::::::.::::::::.::..::::::::.:::::::::::.: :::::::::: CCDS43 RIRPNFKGPPVNVTCNIFINSFSSITKTTMDYRVNVFLRQQWNDPRLSYREYPDDSLDLD 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 PSMLDSIWKPDLFFANEKGAHFHEITTDNKLLRISRNGNVLYSIRITLTLACPMDLKNFP ::::::::::::::::::::.:::.::::::::: .:::::::::.:: :.: ::::::: CCDS43 PSMLDSIWKPDLFFANEKGANFHEVTTDNKLLRIFKNGNVLYSIRLTLILSCLMDLKNFP 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 MDVQTCIMQLESFGYTMNDLIFEWQEQG-AVQVADGLTLPQFILKEEKDLRYCTKHYNTG ::.::: ::::::::::.::.::: :.. :::::.:::::::::..:::: :::::::: CCDS43 MDIQTCTMQLESFGYTMKDLVFEWLEDAPAVQVAEGLTLPQFILRDEKDLGCCTKHYNTG 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 KFTCIEARFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWISFWINMDAAPARVGLGITTVLTMTT ::::::..::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::: CCDS43 KFTCIEVKFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWVSFWINMDAAPARVGLGITTVLTMTT 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 QSSGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFSALLEYAAVNFVSRQHKELLRFRRKRRHHK ::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::::::..:.::..:... CCDS43 QSSGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFAALLEYAAINFVSRQHKEFIRLRRRQRRQR 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 pF1KE2 --EDEAGEGRFNFSAYGMGPACLQAKDGISVKGANNSNTTNP-PPAPS-KSPEEMRKLFI :: :.:: : .::.: ::::.:: ..: :. .: :::: . : :::.. CCDS43 LEEDIIQESRFYFRGYGLGH-CLQARDGGPMEG---SGIYSPQPPAPLLREGETTRKLYV 370 380 390 400 410 410 420 430 440 pF1KE2 QRAKKIDKISRIGFPMAFLIFNMFYWIIYKIVRREDVHNQ CCDS43 D >>CCDS55371.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX (363 aa) initn: 1912 init1: 1664 opt: 2008 Z-score: 2417.2 bits: 456.2 E(32554): 2.5e-128 Smith-Waterman score: 2008; 80.7% identity (92.7% similar) in 368 aa overlap (84-449:1-363) 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 ARIRPNFKGPPVNVSCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQQWNDPRLAYNEYPDDSLDL ::::::::::::::: ::::.::::::::: CCDS55 MDYRVNIFLRQQWNDSRLAYSEYPDDSLDL 10 20 30 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 DPSMLDSIWKPDLFFANEKGAHFHEITTDNKLLRISRNGNVLYSIRITLTLACPMDLKNF :::::::::::::::::::::.::..::::::::::.::.::::::.::::.:::::::: CCDS55 DPSMLDSIWKPDLFFANEKGANFHDVTTDNKLLRISKNGKVLYSIRLTLTLSCPMDLKNF 40 50 60 70 80 90 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 PMDVQTCIMQLESFGYTMNDLIFEWQEQGAVQVADGLTLPQFILKEEKDLRYCTKHYNTG ::::::: ::::::::::::::::: .: ::::.:::::::::::::.: ::::::::: CCDS55 PMDVQTCTMQLESFGYTMNDLIFEWLSDGPVQVAEGLTLPQFILKEEKELGYCTKHYNTG 100 110 120 130 140 150 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 KFTCIEARFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWISFWINMDAAPARVGLGITTVLTMTT ::::::..::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.::::::::::: CCDS55 KFTCIEVKFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWVSFWINMDAAPARVALGITTVLTMTT 160 170 180 190 200 210 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 QSSGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFSALLEYAAVNFVSRQHKELLRFRR--KRRH ::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::.:: ::.. CCDS55 QSSGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFAALLEYAAVNFVSRQHKEFLRLRRRQKRQN 220 230 240 250 260 270 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 HKEDEAGEGRFNFSAYGMGPACLQAKDGISVKGANNSNTTNPPPAPSKSPEEMRKLFIQR ..:: . :.:::::.:::: :::.::: .:: .. .:: : : :. . ..: :..: CCDS55 KEEDVTRESRFNFSGYGMGH-CLQVKDGTAVK----ATPANPLPQPPKDGDAIKKKFVDR 280 290 300 310 320 420 430 440 pF1KE2 AKKIDKISRIGFPMAFLIFNMFYWIIYKIVRREDVHNQ ::.:: ::: .::.::::::.:::: :::.:.::::.. CCDS55 AKRIDTISRAAFPLAFLIFNIFYWITYKIIRHEDVHKK 330 340 350 360 >>CCDS3796.1 GLRB gene_id:2743|Hs108|chr4 (497 aa) initn: 1235 init1: 438 opt: 1170 Z-score: 1406.3 bits: 269.6 E(32554): 5.2e-72 Smith-Waterman score: 1206; 44.8% identity (67.5% similar) in 462 aa overlap (22-438:41-496) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MYSFNTLRLYLWETIVFFSLAASKEAEAARSAPKPMSPSDFLDKLMGRTSG ... :: .: : :..:..:. . CCDS37 ILISLWVEEAYSKEKSSKKGKGKKKQYLCPSQQSAEDLARVPAN-STSNILNRLL---VS 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 pF1KE2 YDARIRPNFKGPPVNVSCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQQWNDPRLAY--NEYPDD :: :::::::: ::.: :::::::::: ::::::::::::::.:::::: . .: CCDS37 YDPRIRPNFKGIPVDVVVNIFINSFGSIQETTMDYRVNIFLRQKWNDPRLKLPSDFRGSD 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 SLDLDPSMLDSIWKPDLFFANEKGAHFHEITTDNKLLRISRNGNVLYSIRITLTLACPMD .: .::.: .:::::::::::.:.::..: .: :: : :.:.:: :.:...::.::.: CCDS37 ALTVDPTMYKCLWKPDLFFANEKSANFHDVTQENILLFIFRDGDVLVSMRLSITLSCPLD 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 LKNFPMDVQTCIMQLESFGYTMNDLIFEWQEQGAVQVADGLTLPQFILKEEKDLRY--CT : ::::.: : ::::::::: .:: : :: ::. . ..:::: .:.: :..: :: CCDS37 LTLFPMDTQRCKMQLESFGYTTDDLRFIWQSGDPVQL-EKIALPQFDIKKE-DIEYGNCT 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 KHYN-TGKFTCIEARFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWISFWINMDAAPARVGLGIT :.:. :: .::.:. : :.::.:.:.. .: :.::::.:::.::::: ::. ::: ::: CCDS37 KYYKGTGYYTCVEVIFTLRRQVGFYMMGVYAPTLLIVVLSWLSFWINPDASAARVPLGIF 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 TVLTMTTQSSGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFSALLEYAAVNFVSRQHK--ELLR .::..... . : :::::::::.:.:. .:::: :..:.:::.:. . . : : . CCDS37 SVLSLASECTTLAAELPKVSYVKALDVWLIACLLFGFASLVEYAVVQVMLNNPKRVEAEK 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 pF1KE2 FRRKRRHHKEDEAGEGRFNFSAYGMG-PA---------------CLQAKD----GISVKG : . .. . ..:. . .. : : :. : . .: .:. : CCDS37 ARIAKAEQADGKGGNVAKKNTVNGTGTPVHISTLQVGETRCKKVCTSKSDLRSNDFSIVG 370 380 390 400 410 420 390 400 410 420 pF1KE2 A-------NNSNTTNPP-----------PAPSKSPEEMRKLFIQRAKKIDKISRIGFPMA . .: . . : .:.: . .. ::.:: .: ::. CCDS37 SLPRDFELSNYDCYGKPIEVNNGLGKSQAKNNKKPPPAKPVIPTAAKRIDLYARALFPFC 430 440 450 460 470 480 430 440 pF1KE2 FLIFNMFYWIIYKIVRREDVHNQ ::.::..:: :: CCDS37 FLFFNVIYWSIYL 490 >>CCDS54813.1 GLRB gene_id:2743|Hs108|chr4 (303 aa) initn: 955 init1: 424 opt: 987 Z-score: 1188.9 bits: 228.6 E(32554): 6.7e-60 Smith-Waterman score: 987; 56.7% identity (77.6% similar) in 268 aa overlap (22-284:41-302) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MYSFNTLRLYLWETIVFFSLAASKEAEAARSAPKPMSPSDFLDKLMGRTSG ... :: .: : :..:..:. . CCDS54 ILISLWVEEAYSKEKSSKKGKGKKKQYLCPSQQSAEDLARVPAN-STSNILNRLL---VS 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 pF1KE2 YDARIRPNFKGPPVNVSCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQQWNDPRLAY--NEYPDD :: :::::::: ::.: :::::::::: ::::::::::::::.:::::: . .: CCDS54 YDPRIRPNFKGIPVDVVVNIFINSFGSIQETTMDYRVNIFLRQKWNDPRLKLPSDFRGSD 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 SLDLDPSMLDSIWKPDLFFANEKGAHFHEITTDNKLLRISRNGNVLYSIRITLTLACPMD .: .::.: .:::::::::::.:.::..: .: :: : :.:.:: :.:...::.::.: CCDS54 ALTVDPTMYKCLWKPDLFFANEKSANFHDVTQENILLFIFRDGDVLVSMRLSITLSCPLD 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 LKNFPMDVQTCIMQLESFGYTMNDLIFEWQEQGAVQVADGLTLPQFILKEEKDLRY--CT : ::::.: : ::::::::: .:: : :: ::. . ..:::: .:.: :..: :: CCDS54 LTLFPMDTQRCKMQLESFGYTTDDLRFIWQSGDPVQL-EKIALPQFDIKKE-DIEYGNCT 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 KHYN-TGKFTCIEARFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWISFWINMDAAPARVGLGIT :.:. :: .::.:. : :.::.:.:.. .: :.::::.:::.::::: ::. ::: :: CCDS54 KYYKGTGYYTCVEVIFTLRRQVGFYMMGVYAPTLLIVVLSWLSFWINPDASAARVPLGW 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 TVLTMTTQSSGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFSALLEYAAVNFVSRQHKELLRFR 449 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 03:28:01 2016 done: Tue Nov 8 03:28:01 2016 Total Scan time: 2.120 Total Display time: 0.040 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]