Result of FASTA (ccds) for pFN21AE1887
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE1887, 413 aa
  1>>>pF1KE1887 413 - 413 aa - 413 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9751+/-0.00116; mu= 13.1970+/- 0.068
 mean_var=135.3818+/-51.254, 0's: 0 Z-trim(103.6): 333  B-trim: 939 in 2/48
 Lambda= 0.110229
 statistics sampled from 6890 (7484) to 6890 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.587), E-opt: 0.2 (0.23), width:  16
 Scan time:  2.460

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5            ( 413) 2780 454.6 7.9e-128
CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10           ( 477)  978 168.1 1.6e-41
CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8            ( 408)  733 129.1 7.7e-30
CCDS34271.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 378)  706 124.7 1.4e-28
CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8           ( 429)  706 124.8 1.6e-28
CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8           ( 455)  706 124.8 1.6e-28
CCDS4291.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5            ( 388)  705 124.6 1.6e-28
CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8           ( 466)  706 124.8 1.6e-28
CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8          ( 475)  706 124.9 1.7e-28
CCDS34273.2 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 360)  703 124.2 1.9e-28
CCDS34270.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 387)  703 124.3   2e-28
CCDS75353.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 411)  703 124.3 2.1e-28
CCDS34272.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 428)  703 124.3 2.2e-28
CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8          ( 342)  605 108.6 9.2e-24
CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5            ( 446)  586 105.7 8.9e-23
CCDS197.1 HTR6 gene_id:3362|Hs108|chr1             ( 440)  581 104.9 1.5e-22
CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20         ( 572)  524 96.0 9.7e-20
CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5           ( 520)  503 92.6 9.2e-19
CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5            ( 359)  494 91.0 1.9e-18
CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5           ( 397)  494 91.1 2.1e-18
CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10           ( 432)  467 86.8 4.3e-17
CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10           ( 445)  467 86.8 4.4e-17
CCDS7408.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10           ( 479)  467 86.8 4.6e-17
CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6           ( 390)  461 85.8 7.8e-17
CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10          ( 465)  462 86.0 7.9e-17
CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1            ( 377)  460 85.6 8.5e-17
CCDS10031.1 CHRM5 gene_id:1133|Hs108|chr15         ( 532)  451 84.4 2.9e-16
CCDS1616.1 CHRM3 gene_id:1131|Hs108|chr1           ( 590)  450 84.2 3.5e-16
CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5          ( 422)  441 82.7 7.5e-16
CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6        ( 348)  434 81.4 1.4e-15
CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2          ( 450)  423 79.8 5.7e-15
CCDS5006.1 HTR1E gene_id:3354|Hs108|chr6           ( 365)  421 79.4 6.1e-15
CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4          ( 462)  422 79.7 6.4e-15
CCDS8040.1 CHRM1 gene_id:1128|Hs108|chr11          ( 460)  418 79.0   1e-14
CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6         ( 345)  414 78.3 1.3e-14
CCDS3405.1 DRD5 gene_id:1816|Hs108|chr4            ( 477)  414 78.4 1.6e-14
CCDS5936.1 HTR5A gene_id:3361|Hs108|chr7           ( 357)  411 77.8 1.8e-14
CCDS2604.1 HRH1 gene_id:3269|Hs108|chr3            ( 487)  412 78.1   2e-14
CCDS44581.1 CHRM4 gene_id:1132|Hs108|chr11         ( 479)  404 76.8 4.8e-14
CCDS14564.1 HTR2C gene_id:3358|Hs108|chrX          ( 458)  401 76.3 6.5e-14
CCDS2066.1 GPR45 gene_id:11250|Hs108|chr2          ( 372)  399 75.9   7e-14
CCDS5843.1 CHRM2 gene_id:1129|Hs108|chr7           ( 466)  399 76.0 8.2e-14
CCDS5158.1 TAAR1 gene_id:134864|Hs108|chr6         ( 339)  392 74.8 1.4e-13
CCDS33829.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3           ( 367)  380 72.9 5.7e-13
CCDS2978.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3            ( 400)  380 72.9   6e-13
CCDS1268.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1         ( 529)  379 72.9   8e-13
CCDS72978.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1        ( 546)  379 72.9 8.2e-13
CCDS58043.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1        ( 549)  379 72.9 8.2e-13
CCDS9405.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13          ( 471)  377 72.5 9.3e-13
CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3           ( 366)  371 71.5 1.5e-12


>>CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5                 (413 aa)
 initn: 2780 init1: 2780 opt: 2780  Z-score: 2408.5  bits: 454.6 E(32554): 7.9e-128
Smith-Waterman score: 2780; 99.8% identity (100.0% similar) in 413 aa overlap (1-413:1-413)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MGQPGNGSAFLLAPNGSHAPDHDVTQQRDEVWVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAK
       ::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MGQPGNGSAFLLAPNGSHAPDHDVTQERDEVWVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 FERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 FERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTAS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 IETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 AINCYANETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLQKIDKSEGRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AINCYANETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLQKIDKSEGRF
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 HVQNLSQVEQDGRTGHGLRRSSKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 HVQNLSQVEQDGRTGHGLRRSSKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 NLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCLRRSSLKAYGNGYSSNGNT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCLRRSSLKAYGNGYSSNGNT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410   
pF1KE1 GEQSGYHVEQEKENKLLCEDLPGTEDFVGHQGTVPSDNIDSQGRNCSTNDSLL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GEQSGYHVEQEKENKLLCEDLPGTEDFVGHQGTVPSDNIDSQGRNCSTNDSLL
              370       380       390       400       410   

>>CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10                (477 aa)
 initn: 1324 init1: 957 opt: 978  Z-score: 859.0  bits: 168.1 E(32554): 1.6e-41
Smith-Waterman score: 1311; 54.4% identity (74.9% similar) in 390 aa overlap (4-365:35-413)

                                          10        20        30   
pF1KE1                            MGQPGNGSAFLLAPNGSHAPDHDVTQQRDEVWV
                                     :..  : :: : .:..:.  ..::    :.
CCDS75 VLVLGASEPGNLSSAAPLPDGAATAARLLVPASPPASLLPP-ASESPE-PLSQQ----WT
           10        20        30        40         50             

            40        50        60        70        80        90   
pF1KE1 VGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAH
       .:::..:.:::: :: ::::::.::::  ::::.:: :: ::: ::::::: ::::::. 
CCDS75 AGMGLLMALIVLLIVAGNVLVIVAIAKTPRLQTLTNLFIMSLASADLVMGLLVVPFGATI
       60        70        80        90       100       110        

           100       110       120       130       140       150   
pF1KE1 ILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVI
       ..   : .:.:.::.:::.::::::::::::::::.:::.::::::.::::::. .:: .
CCDS75 VVWGRWEYGSFFCELWTSVDVLCVTASIETLCVIALDRYLAITSPFRYQSLLTRARARGL
      120       130       140       150       160       170        

           160       170       180       190       200       210   
pF1KE1 ILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYANETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLV
       .  :: .:.:.::::: :::.::  .::  :: .  :::: ::.:::::::.::::::: 
CCDS75 VCTVWAISALVSFLPILMHWWRAESDEARRCYNDPKCCDFVTNRAYAIASSVVSFYVPLC
      180       190       200       210       220       230        

           220       230       240              250                
pF1KE1 IMVFVYSRVFQEAKRQLQKIDKSEGRF-------HVQNLSQVEQ----------------
       ::.::: :::.::..:..:::. : ::          . : :                  
CCDS75 IMAFVYLRVFREAQKQVKKIDSCERRFLGGPARPPSPSPSPVPAPAPPPGPPRPAAAAAT
      240       250       260       270       280       290        

                  260        270       280       290       300     
pF1KE1 ----DGRTGHGLRRSSKFC-LKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRK
           .::.:.  :: :..  :.:.:::::::::::.:::::::::..:.:.... .:.  
CCDS75 APLANGRAGK--RRPSRLVALREQKALKTLGIIMGVFTLCWLPFFLANVVKAFHRELVPD
      300         310       320       330       340       350      

         310       320       330       340       350       360     
pF1KE1 EVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCLRRSSLKAYGNGYSSNGNTGEQSG
       ......::.::.::.:::.::::::::: ::: :::  :   .:    ....:.  . ::
CCDS75 RLFVFFNWLGYANSAFNPIIYCRSPDFRKAFQGLLCCAR---RAARRRHATHGDRPRASG
        360       370       380       390          400       410   

         370       380       390       400       410               
pF1KE1 YHVEQEKENKLLCEDLPGTEDFVGHQGTVPSDNIDSQGRNCSTNDSLL            
                                                                   
CCDS75 CLARPGPPPSPGAASDDDDDDVVGATPPARLLEPWAGCNGGAAADSDSSLDEPCRPGFAS
           420       430       440       450       460       470   

>>CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8                 (408 aa)
 initn: 1068 init1: 533 opt: 733  Z-score: 649.2  bits: 129.1 E(32554): 7.7e-30
Smith-Waterman score: 1049; 47.9% identity (71.7% similar) in 357 aa overlap (4-341:5-361)

                10         20        30          40        50      
pF1KE1  MGQPGNGSAFLLAPN-GSHAPDHDVTQQRDEV-WVVGM-GIVMSLIVLAIVFGNVLVIT
           : ..:..   :.  . ::.   :.    : : ... : ...: ::: : ::.:::.
CCDS60 MAPWPHENSSLAPWPDLPTLAPNTANTSGLPGVPWEAALAGALLALAVLATVGGNLLVIV
               10        20        30        40        50        60

         60        70        80        90       100       110      
pF1KE1 AIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLC
       :::   ::::.:: :.:::: ::::::: ::: .:.  :   : .:   ::.:::.::::
CCDS60 AIAWTPRLQTMTNVFVTSLAAADLVMGLLVVPPAATLALTGHWPLGATGCELWTSVDVLC
               70        80        90       100       110       120

        120       130       140       150       160       170      
pF1KE1 VTASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRA
       :::::::::..:::::.:.:.:..: .:.::  ::. ...::.::. .:: ::. .:.:.
CCDS60 VTASIETLCALAVDRYLAVTNPLRYGALVTKRCARTAVVLVWVVSAAVSFAPIMSQWWRV
              130       140       150       160       170       180

         180       190       200       210       220       230     
pF1KE1 -THQEAINCYANETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLQKIDK
        .  ::  :..:  :: : .:. :.. :: ::::.::..:.:::.:::  : :::. .  
CCDS60 GADAEAQRCHSNPRCCAFASNMPYVLLSSSVSFYLPLLVMLFVYARVFVVATRQLRLLRG
              190       200       210       220       230       240

         240       250                     260       270       280 
pF1KE1 SEGRFHVQNLSQVEQ--------------DGRTGHGLRRSSKFCLKEHKALKTLGIIMGT
         :::  ..   . .              .:  . : : .  . :.::.:: :::.::::
CCDS60 ELGRFPPEESPPAPSRSLAPAPVGTCAPPEGVPACGRRPARLLPLREHRALCTLGLIMGT
              250       260       270       280       290       300

             290       300        310       320       330       340
pF1KE1 FTLCWLPFFIVNIVHVIQD-NLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELL
       :::::::::..:.....   .:.   ... :::.::.::.::::::::::::: ::..::
CCDS60 FTLCWLPFFLANVLRALGGPSLVPGPAFLALNWLGYANSAFNPLIYCRSPDFRSAFRRLL
              310       320       330       340       350       360

              350       360       370       380       390       400
pF1KE1 CLRRSSLKAYGNGYSSNGNTGEQSGYHVEQEKENKLLCEDLPGTEDFVGHQGTVPSDNID
       :                                                           
CCDS60 CRCGRRLPPEPCAAARPALFPSGVPAARSSPAQPRLCQRLDGASWGVS            
              370       380       390       400                    

>>CCDS34271.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5                (378 aa)
 initn: 589 init1: 254 opt: 706  Z-score: 626.4  bits: 124.7 E(32554): 1.4e-28
Smith-Waterman score: 706; 36.7% identity (65.6% similar) in 343 aa overlap (40-365:26-360)

      10        20        30        40        50        60         
pF1KE1 FLLAPNGSHAPDHDVTQQRDEVWVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTV-T
                                     .: ..:  ..::.::..:.   ..:. . :
CCDS34      MDKLDANVSSEEGFGSVEKVVLLTFLSTVILMAILGNLLVMVAVCWDRQLRKIKT
                    10        20        30        40        50     

       70        80        90       100       110       120        
pF1KE1 NYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIETLCVIA
       ::::.::: :::.... :.:::: .... .: .:. .:   ::.::: .::::  :: :.
CCDS34 NYFIVSLAFADLLVSVLVMPFGAIELVQDIWIYGEVFCLVRTSLDVLLTTASIFHLCCIS
          60        70        80        90       100       110     

      130        140       150       160       170            180  
pF1KE1 VDRYFAIT-SPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRA-----THQEAI
       .:::.::  .:. :.. .:  .  ...   :..  . :::::.. :         ... .
CCDS34 LDRYYAICCQPLVYRNKMTPLRIALMLGGCWVIPTFISFLPIMQGWNNIGIIDLIEKRKF
         120       130       140       150       160       170     

            190       200       210       220       230       240  
pF1KE1 NCYANETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLQKIDKSEGRFHV
       :  .: : : :..:. :::. :.:.::.:...::..: :..  ::.. ..:.  . :  .
CCDS34 NQNSNSTYCVFMVNKPYAITCSVVAFYIPFLLMVLAYYRIYVTAKEHAHQIQMLQ-RAGA
         180       190       200       210       220       230     

            250        260       270       280       290       300 
pF1KE1 QNLSQVEQ-DGRTGHGLRRSSKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDN
       .. :. .. : .. : .:        : :: ::: :::: : ::: :::..:::  . : 
CCDS34 SSESRPQSADQHSTHRMRT-------ETKAAKTLCIIMGCFCLCWAPFFVTNIVDPFIDY
          240       250              260       270       280       

             310       320        330       340            350     
pF1KE1 LIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCR-SPDFRIAFQELLC-----LRRSSLKAYGNGYS
        .  .:.  . :.::.:::.::..:   . .:: ::  .::      :: :. .     :
CCDS34 TVPGQVWTAFLWLGYINSGLNPFLYAFLNKSFRRAFLIILCCDDERYRRPSILGQTVPCS
       290       300       310       320       330       340       

            360       370       380       390       400       410  
pF1KE1 S---NGNTGEQSGYHVEQEKENKLLCEDLPGTEDFVGHQGTVPSDNIDSQGRNCSTNDSL
       .   ::.:   ::                                               
CCDS34 TTTINGSTHVLSGCSPVSSFLLLFCNRPVPV                             
       350       360       370                                     

>>CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8                (429 aa)
 initn: 659 init1: 372 opt: 706  Z-score: 625.8  bits: 124.8 E(32554): 1.6e-28
Smith-Waterman score: 729; 34.0% identity (65.2% similar) in 376 aa overlap (15-367:5-371)

               10        20        30           40        50       
pF1KE1 MGQPGNGSAFLLAPNGSHAPDHDVTQQRDEVWV---VGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITA
                     .:. . . . ::    : .   . .:.... ..:  :.::.::: .
CCDS60           MVFLSGNASDSSNCTQPPAPVNISKAILLGVILGGLILFGVLGNILVILS
                         10        20        30        40        50

        60        70        80        90       100       110       
pF1KE1 IAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCV
       .:  ..:..::.:.:..:: :::..  .:.::.:   .. .:.::  .:..:...:::: 
CCDS60 VACHRHLHSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGYWAFGRVFCNIWAAVDVLCC
               60        70        80        90       100       110

       120       130       140       150       160       170       
pF1KE1 TASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRAT
       ::::  ::.:..:::.... :..: ...:. .. . .: :: .: . :. :. . : . .
CCDS60 TASIMGLCIISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQRRGLMALLCVWALSLVISIGPL-FGWRQPA
              120       130       140       150       160          

       180       190       200       210       220       230       
pF1KE1 HQEAINCYANETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLQ------
        ..   :  ::       . .:.. :.. :::.::.:.. .: ::.  :::. .      
CCDS60 PEDETICQINE-------EPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRESRGLKSGL
     170       180              190       200       210       220  

                  240           250       260       270       280  
pF1KE1 KIDKSEG-----RFHVQNL----SQVEQDGRTGHGLRRSSKFCLKEHKALKTLGIIMGTF
       : :::..     :.: .:     : . .     :   :  ::  .:.:: :::::..: :
CCDS60 KTDKSDSEQVTLRIHRKNAPAGGSGMASAKTKTHFSVRLLKFS-REKKAAKTLGIVVGCF
            230       240       250       260        270       280 

            290       300        310       320        330       340
pF1KE1 TLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKE-VYILLNWIGYVNSGFNPLIY-CRSPDFRIAFQELL
       .:::::::.:  .  .  ..  .: :. .. :.::.:: .::.:: : : .:. :::..:
CCDS60 VLCWLPFFLVMPIGSFFPDFKPSETVFKIVFWLGYLNSCINPIIYPCSSQEFKKAFQNVL
             290       300       310       320       330       340 

                 350       360       370       380       390       
pF1KE1 ---CLRRSSLKAYGNGYSSNGNTGEQSGYHVEQEKENKLLCEDLPGTEDFVGHQGTVPSD
          :: :.. . .. ::. .  .    : :                              
CCDS60 RIQCLCRKQSSKHALGYTLHPPSQAVEGQHKDMVRIPVGSRETFYRISKTDGVCEWKFFS
             350       360       370       380       390       400 

>>CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8                (455 aa)
 initn: 659 init1: 372 opt: 706  Z-score: 625.5  bits: 124.8 E(32554): 1.6e-28
Smith-Waterman score: 729; 34.0% identity (65.2% similar) in 376 aa overlap (15-367:5-371)

               10        20        30           40        50       
pF1KE1 MGQPGNGSAFLLAPNGSHAPDHDVTQQRDEVWV---VGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITA
                     .:. . . . ::    : .   . .:.... ..:  :.::.::: .
CCDS60           MVFLSGNASDSSNCTQPPAPVNISKAILLGVILGGLILFGVLGNILVILS
                         10        20        30        40        50

        60        70        80        90       100       110       
pF1KE1 IAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCV
       .:  ..:..::.:.:..:: :::..  .:.::.:   .. .:.::  .:..:...:::: 
CCDS60 VACHRHLHSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGYWAFGRVFCNIWAAVDVLCC
               60        70        80        90       100       110

       120       130       140       150       160       170       
pF1KE1 TASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRAT
       ::::  ::.:..:::.... :..: ...:. .. . .: :: .: . :. :. . : . .
CCDS60 TASIMGLCIISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQRRGLMALLCVWALSLVISIGPL-FGWRQPA
              120       130       140       150       160          

       180       190       200       210       220       230       
pF1KE1 HQEAINCYANETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLQ------
        ..   :  ::       . .:.. :.. :::.::.:.. .: ::.  :::. .      
CCDS60 PEDETICQINE-------EPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRESRGLKSGL
     170       180              190       200       210       220  

                  240           250       260       270       280  
pF1KE1 KIDKSEG-----RFHVQNL----SQVEQDGRTGHGLRRSSKFCLKEHKALKTLGIIMGTF
       : :::..     :.: .:     : . .     :   :  ::  .:.:: :::::..: :
CCDS60 KTDKSDSEQVTLRIHRKNAPAGGSGMASAKTKTHFSVRLLKFS-REKKAAKTLGIVVGCF
            230       240       250       260        270       280 

            290       300        310       320        330       340
pF1KE1 TLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKE-VYILLNWIGYVNSGFNPLIY-CRSPDFRIAFQELL
       .:::::::.:  .  .  ..  .: :. .. :.::.:: .::.:: : : .:. :::..:
CCDS60 VLCWLPFFLVMPIGSFFPDFKPSETVFKIVFWLGYLNSCINPIIYPCSSQEFKKAFQNVL
             290       300       310       320       330       340 

                 350       360       370       380       390       
pF1KE1 ---CLRRSSLKAYGNGYSSNGNTGEQSGYHVEQEKENKLLCEDLPGTEDFVGHQGTVPSD
          :: :.. . .. ::. .  .    : :                              
CCDS60 RIQCLCRKQSSKHALGYTLHPPSQAVEGQHKDMVRIPVGSRETFYRISKTDGVCEWKFFS
             350       360       370       380       390       400 

>>CCDS4291.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5                 (388 aa)
 initn: 589 init1: 254 opt: 705  Z-score: 625.4  bits: 124.6 E(32554): 1.6e-28
Smith-Waterman score: 705; 35.7% identity (63.7% similar) in 375 aa overlap (40-397:26-387)

      10        20        30        40        50        60         
pF1KE1 FLLAPNGSHAPDHDVTQQRDEVWVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTV-T
                                     .: ..:  ..::.::..:.   ..:. . :
CCDS42      MDKLDANVSSEEGFGSVEKVVLLTFLSTVILMAILGNLLVMVAVCWDRQLRKIKT
                    10        20        30        40        50     

       70        80        90       100       110       120        
pF1KE1 NYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIETLCVIA
       ::::.::: :::.... :.:::: .... .: .:. .:   ::.::: .::::  :: :.
CCDS42 NYFIVSLAFADLLVSVLVMPFGAIELVQDIWIYGEVFCLVRTSLDVLLTTASIFHLCCIS
          60        70        80        90       100       110     

      130        140       150       160       170            180  
pF1KE1 VDRYFAIT-SPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRA-----THQEAI
       .:::.::  .:. :.. .:  .  ...   :..  . :::::.. :         ... .
CCDS42 LDRYYAICCQPLVYRNKMTPLRIALMLGGCWVIPTFISFLPIMQGWNNIGIIDLIEKRKF
         120       130       140       150       160       170     

            190       200       210       220       230       240  
pF1KE1 NCYANETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLQKIDKSEGRFHV
       :  .: : : :..:. :::. :.:.::.:...::..: :..  ::.. ..:.  . :  .
CCDS42 NQNSNSTYCVFMVNKPYAITCSVVAFYIPFLLMVLAYYRIYVTAKEHAHQIQMLQ-RAGA
         180       190       200       210       220       230     

            250        260       270       280       290       300 
pF1KE1 QNLSQVEQ-DGRTGHGLRRSSKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDN
       .. :. .. : .. : .:        : :: ::: :::: : ::: :::..:::  . : 
CCDS42 SSESRPQSADQHSTHRMRT-------ETKAAKTLCIIMGCFCLCWAPFFVTNIVDPFIDY
          240       250              260       270       280       

             310       320        330       340            350     
pF1KE1 LIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCR-SPDFRIAFQELLC-----LRRSSLKAYGNGYS
        .  .:.  . :.::.:::.::..:   . .:: ::  .::      :: :. .     :
CCDS42 TVPGQVWTAFLWLGYINSGLNPFLYAFLNKSFRRAFLIILCCDDERYRRPSILGQTVPCS
       290       300       310       320       330       340       

            360       370       380       390       400       410  
pF1KE1 S---NGNTGEQSGYHVEQEKENKLLCEDLPGTEDFVGHQGTVPSDNIDSQGRNCSTNDSL
       .   ::.:       ::   . .  :.  :.:  .:. :   :::               
CCDS42 TTTINGSTHVLRDA-VECGGQWESQCHP-PATSPLVAAQ---PSDT              
       350       360        370        380                         

        
pF1KE1 L

>>CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8                (466 aa)
 initn: 659 init1: 372 opt: 706  Z-score: 625.3  bits: 124.8 E(32554): 1.6e-28
Smith-Waterman score: 729; 34.0% identity (65.2% similar) in 376 aa overlap (15-367:5-371)

               10        20        30           40        50       
pF1KE1 MGQPGNGSAFLLAPNGSHAPDHDVTQQRDEVWV---VGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITA
                     .:. . . . ::    : .   . .:.... ..:  :.::.::: .
CCDS60           MVFLSGNASDSSNCTQPPAPVNISKAILLGVILGGLILFGVLGNILVILS
                         10        20        30        40        50

        60        70        80        90       100       110       
pF1KE1 IAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCV
       .:  ..:..::.:.:..:: :::..  .:.::.:   .. .:.::  .:..:...:::: 
CCDS60 VACHRHLHSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGYWAFGRVFCNIWAAVDVLCC
               60        70        80        90       100       110

       120       130       140       150       160       170       
pF1KE1 TASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRAT
       ::::  ::.:..:::.... :..: ...:. .. . .: :: .: . :. :. . : . .
CCDS60 TASIMGLCIISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQRRGLMALLCVWALSLVISIGPL-FGWRQPA
              120       130       140       150       160          

       180       190       200       210       220       230       
pF1KE1 HQEAINCYANETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLQ------
        ..   :  ::       . .:.. :.. :::.::.:.. .: ::.  :::. .      
CCDS60 PEDETICQINE-------EPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRESRGLKSGL
     170       180              190       200       210       220  

                  240           250       260       270       280  
pF1KE1 KIDKSEG-----RFHVQNL----SQVEQDGRTGHGLRRSSKFCLKEHKALKTLGIIMGTF
       : :::..     :.: .:     : . .     :   :  ::  .:.:: :::::..: :
CCDS60 KTDKSDSEQVTLRIHRKNAPAGGSGMASAKTKTHFSVRLLKFS-REKKAAKTLGIVVGCF
            230       240       250       260        270       280 

            290       300        310       320        330       340
pF1KE1 TLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKE-VYILLNWIGYVNSGFNPLIY-CRSPDFRIAFQELL
       .:::::::.:  .  .  ..  .: :. .. :.::.:: .::.:: : : .:. :::..:
CCDS60 VLCWLPFFLVMPIGSFFPDFKPSETVFKIVFWLGYLNSCINPIIYPCSSQEFKKAFQNVL
             290       300       310       320       330       340 

                 350       360       370       380       390       
pF1KE1 ---CLRRSSLKAYGNGYSSNGNTGEQSGYHVEQEKENKLLCEDLPGTEDFVGHQGTVPSD
          :: :.. . .. ::. .  .    : :                              
CCDS60 RIQCLCRKQSSKHALGYTLHPPSQAVEGQHKDMVRIPVGSRETFYRISKTDGVCEWKFFS
             350       360       370       380       390       400 

>>CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8               (475 aa)
 initn: 659 init1: 372 opt: 706  Z-score: 625.2  bits: 124.9 E(32554): 1.7e-28
Smith-Waterman score: 729; 34.0% identity (65.2% similar) in 376 aa overlap (15-367:5-371)

               10        20        30           40        50       
pF1KE1 MGQPGNGSAFLLAPNGSHAPDHDVTQQRDEVWV---VGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITA
                     .:. . . . ::    : .   . .:.... ..:  :.::.::: .
CCDS34           MVFLSGNASDSSNCTQPPAPVNISKAILLGVILGGLILFGVLGNILVILS
                         10        20        30        40        50

        60        70        80        90       100       110       
pF1KE1 IAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCV
       .:  ..:..::.:.:..:: :::..  .:.::.:   .. .:.::  .:..:...:::: 
CCDS34 VACHRHLHSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGYWAFGRVFCNIWAAVDVLCC
               60        70        80        90       100       110

       120       130       140       150       160       170       
pF1KE1 TASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRAT
       ::::  ::.:..:::.... :..: ...:. .. . .: :: .: . :. :. . : . .
CCDS34 TASIMGLCIISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQRRGLMALLCVWALSLVISIGPL-FGWRQPA
              120       130       140       150       160          

       180       190       200       210       220       230       
pF1KE1 HQEAINCYANETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLQ------
        ..   :  ::       . .:.. :.. :::.::.:.. .: ::.  :::. .      
CCDS34 PEDETICQINE-------EPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRESRGLKSGL
     170       180              190       200       210       220  

                  240           250       260       270       280  
pF1KE1 KIDKSEG-----RFHVQNL----SQVEQDGRTGHGLRRSSKFCLKEHKALKTLGIIMGTF
       : :::..     :.: .:     : . .     :   :  ::  .:.:: :::::..: :
CCDS34 KTDKSDSEQVTLRIHRKNAPAGGSGMASAKTKTHFSVRLLKFS-REKKAAKTLGIVVGCF
            230       240       250       260        270       280 

            290       300        310       320        330       340
pF1KE1 TLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKE-VYILLNWIGYVNSGFNPLIY-CRSPDFRIAFQELL
       .:::::::.:  .  .  ..  .: :. .. :.::.:: .::.:: : : .:. :::..:
CCDS34 VLCWLPFFLVMPIGSFFPDFKPSETVFKIVFWLGYLNSCINPIIYPCSSQEFKKAFQNVL
             290       300       310       320       330       340 

                 350       360       370       380       390       
pF1KE1 ---CLRRSSLKAYGNGYSSNGNTGEQSGYHVEQEKENKLLCEDLPGTEDFVGHQGTVPSD
          :: :.. . .. ::. .  .    : :                              
CCDS34 RIQCLCRKQSSKHALGYTLHPPSQAVEGQHKDMVRIPVGSRETFYRISKTDGVCEWKFFS
             350       360       370       380       390       400 

>>CCDS34273.2 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5                (360 aa)
 initn: 589 init1: 254 opt: 703  Z-score: 624.1  bits: 124.2 E(32554): 1.9e-28
Smith-Waterman score: 703; 37.6% identity (68.2% similar) in 311 aa overlap (40-341:26-328)

      10        20        30        40        50        60         
pF1KE1 FLLAPNGSHAPDHDVTQQRDEVWVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTV-T
                                     .: ..:  ..::.::..:.   ..:. . :
CCDS34      MDKLDANVSSEEGFGSVEKVVLLTFLSTVILMAILGNLLVMVAVCWDRQLRKIKT
                    10        20        30        40        50     

       70        80        90       100       110       120        
pF1KE1 NYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIETLCVIA
       ::::.::: :::.... :.:::: .... .: .:. .:   ::.::: .::::  :: :.
CCDS34 NYFIVSLAFADLLVSVLVMPFGAIELVQDIWIYGEVFCLVRTSLDVLLTTASIFHLCCIS
          60        70        80        90       100       110     

      130        140       150       160       170            180  
pF1KE1 VDRYFAIT-SPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRA-----THQEAI
       .:::.::  .:. :.. .:  .  ...   :..  . :::::.. :         ... .
CCDS34 LDRYYAICCQPLVYRNKMTPLRIALMLGGCWVIPTFISFLPIMQGWNNIGIIDLIEKRKF
         120       130       140       150       160       170     

            190       200       210       220       230       240  
pF1KE1 NCYANETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLQKIDKSEGRFHV
       :  .: : : :..:. :::. :.:.::.:...::..: :..  ::.. ..:.  . :  .
CCDS34 NQNSNSTYCVFMVNKPYAITCSVVAFYIPFLLMVLAYYRIYVTAKEHAHQIQMLQ-RAGA
         180       190       200       210       220       230     

            250        260       270       280       290       300 
pF1KE1 QNLSQVEQ-DGRTGHGLRRSSKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDN
       .. :. .. : .. : .:        : :: ::: :::: : ::: :::..:::  . : 
CCDS34 SSESRPQSADQHSTHRMRT-------ETKAAKTLCIIMGCFCLCWAPFFVTNIVDPFIDY
          240       250              260       270       280       

             310       320        330       340       350       360
pF1KE1 LIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCR-SPDFRIAFQELLCLRRSSLKAYGNGYSSNGNT
        .  .:.  . :.::.:::.::..:   . .:: ::  .::                   
CCDS34 TVPGQVWTAFLWLGYINSGLNPFLYAFLNKSFRRAFLIILCCDDERYRRPSILGQTVPCS
       290       300       310       320       330       340       

              370       380       390       400       410   
pF1KE1 GEQSGYHVEQEKENKLLCEDLPGTEDFVGHQGTVPSDNIDSQGRNCSTNDSLL
                                                            
CCDS34 TTTINGSTHVLRF                                        
       350       360                                        




413 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sun Nov  6 17:05:26 2016 done: Sun Nov  6 17:05:26 2016
 Total Scan time:  2.460 Total Display time:  0.050

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com