FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1887, 413 aa 1>>>pF1KE1887 413 - 413 aa - 413 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9751+/-0.00116; mu= 13.1970+/- 0.068 mean_var=135.3818+/-51.254, 0's: 0 Z-trim(103.6): 333 B-trim: 939 in 2/48 Lambda= 0.110229 statistics sampled from 6890 (7484) to 6890 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.587), E-opt: 0.2 (0.23), width: 16 Scan time: 2.460 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5 ( 413) 2780 454.6 7.9e-128 CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10 ( 477) 978 168.1 1.6e-41 CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8 ( 408) 733 129.1 7.7e-30 CCDS34271.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 378) 706 124.7 1.4e-28 CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 429) 706 124.8 1.6e-28 CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 455) 706 124.8 1.6e-28 CCDS4291.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 388) 705 124.6 1.6e-28 CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 466) 706 124.8 1.6e-28 CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 475) 706 124.9 1.7e-28 CCDS34273.2 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 360) 703 124.2 1.9e-28 CCDS34270.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 387) 703 124.3 2e-28 CCDS75353.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 411) 703 124.3 2.1e-28 CCDS34272.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 428) 703 124.3 2.2e-28 CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 342) 605 108.6 9.2e-24 CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5 ( 446) 586 105.7 8.9e-23 CCDS197.1 HTR6 gene_id:3362|Hs108|chr1 ( 440) 581 104.9 1.5e-22 CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20 ( 572) 524 96.0 9.7e-20 CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5 ( 520) 503 92.6 9.2e-19 CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 359) 494 91.0 1.9e-18 CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 397) 494 91.1 2.1e-18 CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 432) 467 86.8 4.3e-17 CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 445) 467 86.8 4.4e-17 CCDS7408.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 479) 467 86.8 4.6e-17 CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6 ( 390) 461 85.8 7.8e-17 CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10 ( 465) 462 86.0 7.9e-17 CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1 ( 377) 460 85.6 8.5e-17 CCDS10031.1 CHRM5 gene_id:1133|Hs108|chr15 ( 532) 451 84.4 2.9e-16 CCDS1616.1 CHRM3 gene_id:1131|Hs108|chr1 ( 590) 450 84.2 3.5e-16 CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5 ( 422) 441 82.7 7.5e-16 CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6 ( 348) 434 81.4 1.4e-15 CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2 ( 450) 423 79.8 5.7e-15 CCDS5006.1 HTR1E gene_id:3354|Hs108|chr6 ( 365) 421 79.4 6.1e-15 CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4 ( 462) 422 79.7 6.4e-15 CCDS8040.1 CHRM1 gene_id:1128|Hs108|chr11 ( 460) 418 79.0 1e-14 CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6 ( 345) 414 78.3 1.3e-14 CCDS3405.1 DRD5 gene_id:1816|Hs108|chr4 ( 477) 414 78.4 1.6e-14 CCDS5936.1 HTR5A gene_id:3361|Hs108|chr7 ( 357) 411 77.8 1.8e-14 CCDS2604.1 HRH1 gene_id:3269|Hs108|chr3 ( 487) 412 78.1 2e-14 CCDS44581.1 CHRM4 gene_id:1132|Hs108|chr11 ( 479) 404 76.8 4.8e-14 CCDS14564.1 HTR2C gene_id:3358|Hs108|chrX ( 458) 401 76.3 6.5e-14 CCDS2066.1 GPR45 gene_id:11250|Hs108|chr2 ( 372) 399 75.9 7e-14 CCDS5843.1 CHRM2 gene_id:1129|Hs108|chr7 ( 466) 399 76.0 8.2e-14 CCDS5158.1 TAAR1 gene_id:134864|Hs108|chr6 ( 339) 392 74.8 1.4e-13 CCDS33829.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3 ( 367) 380 72.9 5.7e-13 CCDS2978.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3 ( 400) 380 72.9 6e-13 CCDS1268.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1 ( 529) 379 72.9 8e-13 CCDS72978.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1 ( 546) 379 72.9 8.2e-13 CCDS58043.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1 ( 549) 379 72.9 8.2e-13 CCDS9405.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13 ( 471) 377 72.5 9.3e-13 CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3 ( 366) 371 71.5 1.5e-12 >>CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5 (413 aa) initn: 2780 init1: 2780 opt: 2780 Z-score: 2408.5 bits: 454.6 E(32554): 7.9e-128 Smith-Waterman score: 2780; 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CCDS75 VLVLGASEPGNLSSAAPLPDGAATAARLLVPASPPASLLPP-ASESPE-PLSQQ----WT 10 20 30 40 50 40 50 60 70 80 90 pF1KE1 VGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAH .:::..:.:::: :: ::::::.:::: ::::.:: :: ::: ::::::: ::::::. CCDS75 AGMGLLMALIVLLIVAGNVLVIVAIAKTPRLQTLTNLFIMSLASADLVMGLLVVPFGATI 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KE1 ILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVI .. : .:.:.::.:::.::::::::::::::::.:::.::::::.::::::. .:: . CCDS75 VVWGRWEYGSFFCELWTSVDVLCVTASIETLCVIALDRYLAITSPFRYQSLLTRARARGL 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KE1 ILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYANETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLV . :: .:.:.::::: :::.:: .:: :: . :::: ::.:::::::.::::::: CCDS75 VCTVWAISALVSFLPILMHWWRAESDEARRCYNDPKCCDFVTNRAYAIASSVVSFYVPLC 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 pF1KE1 IMVFVYSRVFQEAKRQLQKIDKSEGRF-------HVQNLSQVEQ---------------- ::.::: :::.::..:..:::. : :: . : : CCDS75 IMAFVYLRVFREAQKQVKKIDSCERRFLGGPARPPSPSPSPVPAPAPPPGPPRPAAAAAT 240 250 260 270 280 290 260 270 280 290 300 pF1KE1 ----DGRTGHGLRRSSKFC-LKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRK .::.:. :: :.. :.:.:::::::::::.:::::::::..:.:.... .:. CCDS75 APLANGRAGK--RRPSRLVALREQKALKTLGIIMGVFTLCWLPFFLANVVKAFHRELVPD 300 310 320 330 340 350 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 EVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCLRRSSLKAYGNGYSSNGNTGEQSG ......::.::.::.:::.::::::::: ::: ::: : .: ....:. . :: CCDS75 RLFVFFNWLGYANSAFNPIIYCRSPDFRKAFQGLLCCAR---RAARRRHATHGDRPRASG 360 370 380 390 400 410 370 380 390 400 410 pF1KE1 YHVEQEKENKLLCEDLPGTEDFVGHQGTVPSDNIDSQGRNCSTNDSLL CCDS75 CLARPGPPPSPGAASDDDDDDVVGATPPARLLEPWAGCNGGAAADSDSSLDEPCRPGFAS 420 430 440 450 460 470 >>CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8 (408 aa) initn: 1068 init1: 533 opt: 733 Z-score: 649.2 bits: 129.1 E(32554): 7.7e-30 Smith-Waterman score: 1049; 47.9% identity (71.7% similar) in 357 aa overlap (4-341:5-361) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MGQPGNGSAFLLAPN-GSHAPDHDVTQQRDEV-WVVGM-GIVMSLIVLAIVFGNVLVIT : ..:.. :. . ::. :. : : ... : ...: ::: : ::.:::. CCDS60 MAPWPHENSSLAPWPDLPTLAPNTANTSGLPGVPWEAALAGALLALAVLATVGGNLLVIV 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 AIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLC ::: ::::.:: :.:::: ::::::: ::: .:. : : .: ::.:::.:::: CCDS60 AIAWTPRLQTMTNVFVTSLAAADLVMGLLVVPPAATLALTGHWPLGATGCELWTSVDVLC 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 VTASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRA :::::::::..:::::.:.:.:..: .:.:: ::. ...::.::. .:: ::. .:.:. CCDS60 VTASIETLCALAVDRYLAVTNPLRYGALVTKRCARTAVVLVWVVSAAVSFAPIMSQWWRV 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 -THQEAINCYANETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLQKIDK . :: :..: :: : .:. :.. :: ::::.::..:.:::.::: : :::. . CCDS60 GADAEAQRCHSNPRCCAFASNMPYVLLSSSVSFYLPLLVMLFVYARVFVVATRQLRLLRG 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 pF1KE1 SEGRFHVQNLSQVEQ--------------DGRTGHGLRRSSKFCLKEHKALKTLGIIMGT ::: .. . . .: . : : . . :.::.:: :::.:::: CCDS60 ELGRFPPEESPPAPSRSLAPAPVGTCAPPEGVPACGRRPARLLPLREHRALCTLGLIMGT 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 FTLCWLPFFIVNIVHVIQD-NLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELL :::::::::..:..... .:. ... :::.::.::.::::::::::::: ::..:: CCDS60 FTLCWLPFFLANVLRALGGPSLVPGPAFLALNWLGYANSAFNPLIYCRSPDFRSAFRRLL 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 CLRRSSLKAYGNGYSSNGNTGEQSGYHVEQEKENKLLCEDLPGTEDFVGHQGTVPSDNID : CCDS60 CRCGRRLPPEPCAAARPALFPSGVPAARSSPAQPRLCQRLDGASWGVS 370 380 390 400 >>CCDS34271.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 (378 aa) initn: 589 init1: 254 opt: 706 Z-score: 626.4 bits: 124.7 E(32554): 1.4e-28 Smith-Waterman score: 706; 36.7% identity (65.6% similar) in 343 aa overlap (40-365:26-360) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 FLLAPNGSHAPDHDVTQQRDEVWVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTV-T .: ..: ..::.::..:. ..:. . : CCDS34 MDKLDANVSSEEGFGSVEKVVLLTFLSTVILMAILGNLLVMVAVCWDRQLRKIKT 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 NYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIETLCVIA ::::.::: :::.... :.:::: .... .: .:. .: ::.::: .:::: :: :. CCDS34 NYFIVSLAFADLLVSVLVMPFGAIELVQDIWIYGEVFCLVRTSLDVLLTTASIFHLCCIS 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 VDRYFAIT-SPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRA-----THQEAI .:::.:: .:. :.. .: . ... :.. . :::::.. : ... . CCDS34 LDRYYAICCQPLVYRNKMTPLRIALMLGGCWVIPTFISFLPIMQGWNNIGIIDLIEKRKF 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 NCYANETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLQKIDKSEGRFHV : .: : : :..:. :::. :.:.::.:...::..: :.. ::.. ..:. . : . CCDS34 NQNSNSTYCVFMVNKPYAITCSVVAFYIPFLLMVLAYYRIYVTAKEHAHQIQMLQ-RAGA 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 QNLSQVEQ-DGRTGHGLRRSSKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDN .. :. .. : .. : .: : :: ::: :::: : ::: :::..::: . : CCDS34 SSESRPQSADQHSTHRMRT-------ETKAAKTLCIIMGCFCLCWAPFFVTNIVDPFIDY 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 pF1KE1 LIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCR-SPDFRIAFQELLC-----LRRSSLKAYGNGYS . .:. . :.::.:::.::..: . .:: :: .:: :: :. . : CCDS34 TVPGQVWTAFLWLGYINSGLNPFLYAFLNKSFRRAFLIILCCDDERYRRPSILGQTVPCS 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 S---NGNTGEQSGYHVEQEKENKLLCEDLPGTEDFVGHQGTVPSDNIDSQGRNCSTNDSL . ::.: :: CCDS34 TTTINGSTHVLSGCSPVSSFLLLFCNRPVPV 350 360 370 >>CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 (429 aa) initn: 659 init1: 372 opt: 706 Z-score: 625.8 bits: 124.8 E(32554): 1.6e-28 Smith-Waterman score: 729; 34.0% identity (65.2% similar) in 376 aa overlap (15-367:5-371) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MGQPGNGSAFLLAPNGSHAPDHDVTQQRDEVWV---VGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITA .:. . . . :: : . . .:.... ..: :.::.::: . CCDS60 MVFLSGNASDSSNCTQPPAPVNISKAILLGVILGGLILFGVLGNILVILS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 IAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCV .: ..:..::.:.:..:: :::.. .:.::.: .. .:.:: .:..:...:::: CCDS60 VACHRHLHSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGYWAFGRVFCNIWAAVDVLCC 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 TASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRAT :::: ::.:..:::.... :..: ...:. .. . .: :: .: . :. :. . : . . CCDS60 TASIMGLCIISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQRRGLMALLCVWALSLVISIGPL-FGWRQPA 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 HQEAINCYANETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLQ------ .. : :: . .:.. :.. :::.::.:.. .: ::. :::. . 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CCDS60 PEDETICQINE-------EPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRESRGLKSGL 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 pF1KE1 KIDKSEG-----RFHVQNL----SQVEQDGRTGHGLRRSSKFCLKEHKALKTLGIIMGTF : :::.. :.: .: : . . : : :: .:.:: :::::..: : CCDS60 KTDKSDSEQVTLRIHRKNAPAGGSGMASAKTKTHFSVRLLKFS-REKKAAKTLGIVVGCF 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 TLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKE-VYILLNWIGYVNSGFNPLIY-CRSPDFRIAFQELL .:::::::.: . . .. .: :. .. :.::.:: .::.:: : : .:. :::..: CCDS60 VLCWLPFFLVMPIGSFFPDFKPSETVFKIVFWLGYLNSCINPIIYPCSSQEFKKAFQNVL 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE1 ---CLRRSSLKAYGNGYSSNGNTGEQSGYHVEQEKENKLLCEDLPGTEDFVGHQGTVPSD :: :.. . .. ::. . . : : CCDS60 RIQCLCRKQSSKHALGYTLHPPSQAVEGQHKDMVRIPVGSRETFYRISKTDGVCEWKFFS 350 360 370 380 390 400 >>CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 (475 aa) initn: 659 init1: 372 opt: 706 Z-score: 625.2 bits: 124.9 E(32554): 1.7e-28 Smith-Waterman score: 729; 34.0% identity (65.2% similar) in 376 aa overlap (15-367:5-371) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MGQPGNGSAFLLAPNGSHAPDHDVTQQRDEVWV---VGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITA .:. . . . :: : . . .:.... ..: :.::.::: . 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CCDS34 PEDETICQINE-------EPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRESRGLKSGL 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 pF1KE1 KIDKSEG-----RFHVQNL----SQVEQDGRTGHGLRRSSKFCLKEHKALKTLGIIMGTF : :::.. :.: .: : . . : : :: .:.:: :::::..: : CCDS34 KTDKSDSEQVTLRIHRKNAPAGGSGMASAKTKTHFSVRLLKFS-REKKAAKTLGIVVGCF 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 TLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKE-VYILLNWIGYVNSGFNPLIY-CRSPDFRIAFQELL .:::::::.: . . .. .: :. .. :.::.:: .::.:: : : .:. :::..: CCDS34 VLCWLPFFLVMPIGSFFPDFKPSETVFKIVFWLGYLNSCINPIIYPCSSQEFKKAFQNVL 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE1 ---CLRRSSLKAYGNGYSSNGNTGEQSGYHVEQEKENKLLCEDLPGTEDFVGHQGTVPSD :: :.. . .. ::. . . : : CCDS34 RIQCLCRKQSSKHALGYTLHPPSQAVEGQHKDMVRIPVGSRETFYRISKTDGVCEWKFFS 350 360 370 380 390 400 >>CCDS34273.2 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 (360 aa) initn: 589 init1: 254 opt: 703 Z-score: 624.1 bits: 124.2 E(32554): 1.9e-28 Smith-Waterman score: 703; 37.6% identity (68.2% similar) in 311 aa overlap (40-341:26-328) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 FLLAPNGSHAPDHDVTQQRDEVWVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTV-T .: ..: ..::.::..:. ..:. . : CCDS34 MDKLDANVSSEEGFGSVEKVVLLTFLSTVILMAILGNLLVMVAVCWDRQLRKIKT 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 NYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIETLCVIA ::::.::: :::.... :.:::: .... .: .:. .: ::.::: .:::: :: :. 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