FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9538, 328 aa 1>>>pF1KE9538 328 - 328 aa - 328 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2580+/-0.000982; mu= 16.0806+/- 0.059 mean_var=115.3145+/-41.271, 0's: 0 Z-trim(104.3): 219 B-trim: 1031 in 2/49 Lambda= 0.119435 statistics sampled from 7530 (7838) to 7530 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.6), E-opt: 0.2 (0.241), width: 16 Scan time: 2.560 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS3517.1 GNRHR gene_id:2798|Hs108|chr4 ( 328) 2212 392.7 2.1e-109 CCDS47064.1 GNRHR gene_id:2798|Hs108|chr4 ( 249) 1123 204.9 5.4e-53 CCDS14735.1 AVPR2 gene_id:554|Hs108|chrX ( 371) 376 76.4 3.9e-14 CCDS14656.1 BRS3 gene_id:680|Hs108|chrX ( 399) 358 73.4 3.5e-13 CCDS5444.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 ( 371) 350 72.0 8.6e-13 CCDS5443.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 ( 377) 350 72.0 8.7e-13 CCDS75579.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 ( 390) 350 72.0 8.9e-13 CCDS8965.1 AVPR1A gene_id:552|Hs108|chr12 ( 418) 348 71.7 1.2e-12 CCDS55539.1 AVPR2 gene_id:554|Hs108|chrX ( 309) 336 69.4 4.1e-12 CCDS73015.1 AVPR1B gene_id:553|Hs108|chr1 ( 424) 335 69.4 5.6e-12 CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11 ( 380) 334 69.2 5.9e-12 CCDS13089.1 PROKR2 gene_id:128674|Hs108|chr20 ( 384) 322 67.2 2.5e-11 CCDS1889.1 PROKR1 gene_id:10887|Hs108|chr2 ( 393) 317 66.3 4.6e-11 CCDS3719.1 QRFPR gene_id:84109|Hs108|chr4 ( 431) 313 65.7 7.9e-11 >>CCDS3517.1 GNRHR gene_id:2798|Hs108|chr4 (328 aa) initn: 2212 init1: 2212 opt: 2212 Z-score: 2077.6 bits: 392.7 E(32554): 2.1e-109 Smith-Waterman score: 2212; 100.0% identity (100.0% similar) in 328 aa overlap (1-328:1-328) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MANSASPEQNQNHCSAINNSIPLMQGNLPTLTLSGKIRVTVTFFLFLLSATFNASFLLKL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS35 MANSASPEQNQNHCSAINNSIPLMQGNLPTLTLSGKIRVTVTFFLFLLSATFNASFLLKL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 QKWTQKKEKGKKLSRMKLLLKHLTLANLLETLIVMPLDGMWNITVQWYAGELLCKVLSYL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS35 QKWTQKKEKGKKLSRMKLLLKHLTLANLLETLIVMPLDGMWNITVQWYAGELLCKVLSYL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 KLFSMYAPAFMMVVISLDRSLAITRPLALKSNSKVGQSMVGLAWILSSVFAGPQLYIFRM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS35 KLFSMYAPAFMMVVISLDRSLAITRPLALKSNSKVGQSMVGLAWILSSVFAGPQLYIFRM 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE9 IHLADSSGQTKVFSQCVTHCSFSQWWHQAFYNFFTFSCLFIIPLFIMLICNAKIIFTLTR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS35 IHLADSSGQTKVFSQCVTHCSFSQWWHQAFYNFFTFSCLFIIPLFIMLICNAKIIFTLTR 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE9 VLHQDPHELQLNQSKNNIPRARLKTLKMTVAFATSFTVCWTPYYVLGIWYWFDPEMLNRL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS35 VLHQDPHELQLNQSKNNIPRARLKTLKMTVAFATSFTVCWTPYYVLGIWYWFDPEMLNRL 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KE9 SDPVNHFFFLFAFLNPCFDPLIYGYFSL :::::::::::::::::::::::::::: CCDS35 SDPVNHFFFLFAFLNPCFDPLIYGYFSL 310 320 >>CCDS47064.1 GNRHR gene_id:2798|Hs108|chr4 (249 aa) initn: 1119 init1: 1119 opt: 1123 Z-score: 1064.9 bits: 204.9 E(32554): 5.4e-53 Smith-Waterman score: 1123; 95.7% identity (97.3% similar) in 186 aa overlap (1-185:1-186) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MANSASPEQNQNHCSAINNSIPLMQGNLPTLTLSGKIRVTVTFFLFLLSATFNASFLLKL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 MANSASPEQNQNHCSAINNSIPLMQGNLPTLTLSGKIRVTVTFFLFLLSATFNASFLLKL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 QKWTQKKEKGKKLSRMKLLLKHLTLANLLETLIVMPLDGMWNITVQWYAGELLCKVLSYL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 QKWTQKKEKGKKLSRMKLLLKHLTLANLLETLIVMPLDGMWNITVQWYAGELLCKVLSYL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 KLFSMYAPAFMMVVISLDRSLAITRPLALKSNSKVGQSMVGLAWILSSVFAGPQLYIFR- ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: . . 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CCDS54 FLFSIPTLIIFGKRTL--SNGEV----QCWALWPDDSYW-TPYMTIVAF-LVYFIPLTII 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KE9 LICNAKIIFTL--------TRVLHQDPHELQLNQSKNNIPRARLKTLKMTVAFATSFTVC : . .: :. : . . . .: . ... : .:..:..:... . .: : CCDS54 SIMYGIVIRTIWIKSKTYETVISNCSDGKLCSSYNRGLISKAKIKAIKYSIIIILAFICC 230 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 pF1KE9 WTPYYVLGIWYWFD--PEMLNRLSDPVNHFFFLFAFLNPCFDPLIYGYFSL :.::... : :. :. .:. : .. . :: ..:::: :: CCDS54 WSPYFLFDILDNFNLLPDTQERFYASV--IIQNLPALNSAINPLIYCVFSSSISFPCREQ 290 300 310 320 330 340 CCDS54 RSQDSRMTFRERTERHEMQILSKPEFI 350 360 370 >>CCDS5443.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 (377 aa) initn: 288 init1: 288 opt: 350 Z-score: 343.0 bits: 72.0 E(32554): 8.7e-13 Smith-Waterman score: 350; 24.9% identity (59.4% similar) in 325 aa overlap (14-327:26-334) 10 20 30 40 pF1KE9 MANSASPEQNQNHCSAINNSIPLMQGN-LPTLTLSGKIRVTVTFFLFL :. . ...:. .. : : . .:..... CCDS54 MPANFTEGSFDSSGTGQTLDSSPVACTETVTFTEVVEGKEWGSFYYSFKTEQLITLWVLF 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE9 LSATFNASFLLKLQKWTQKKEKGKKLSRMKLLLKHLTLANLLETLIVMPLDGMWNITVQW . . . : .: .. : .::. ::: ... .:.... . :. . : : .: .. CCDS54 VFTIVGNSVVL-FSTWRRKKK-----SRMTFFVTQLAITDSFTGLVNILTDINWRFTGDF 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE9 YAGELLCKVLSYLKLFSMYAPAFMMVVISLDRSLAITRPLALKSNSKVGQSMVGLAWILS : .:.:.:. ::.. .:: ....: .:.:: ::. :. . .. : .. .. .:: :: CCDS54 TAPDLVCRVVRYLQVVLLYASTYVLVSLSIDRYHAIVYPMKFLQGEKQARVLIVIAWSLS 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE9 SVFAGPQLYIFRMIHLADSSGQTKVFSQCVTHCSFSQWWHQAFYNFFTFSCLFIIPLFIM .:. : : :: : :.:.. :: . ...: .... .: ...::: :. CCDS54 FLFSIPTLIIFGKRTL--SNGEV----QCWALWPDDSYW-TPYMTIVAF-LVYFIPLTII 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KE9 LICNAKIIFTL--------TRVLHQDPHELQLNQSKNNIPRARLKTLKMTVAFATSFTVC : . .: :. : . . . .: . ... : .:..:..:... . .: : CCDS54 SIMYGIVIRTIWIKSKTYETVISNCSDGKLCSSYNRGLISKAKIKAIKYSIIIILAFICC 230 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 pF1KE9 WTPYYVLGIWYWFD--PEMLNRLSDPVNHFFFLFAFLNPCFDPLIYGYFSL :.::... : :. :. .:. : .. . :: ..:::: :: CCDS54 WSPYFLFDILDNFNLLPDTQERFYASV--IIQNLPALNSAINPLIYCVFSSSISFPCRVI 290 300 310 320 330 340 CCDS54 RLRQLQEAALMLCPQRENWKGTWPGVPSWALPR 350 360 370 >>CCDS75579.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 (390 aa) initn: 288 init1: 288 opt: 350 Z-score: 342.8 bits: 72.0 E(32554): 8.9e-13 Smith-Waterman score: 350; 24.9% identity (59.4% similar) in 325 aa overlap (14-327:26-334) 10 20 30 40 pF1KE9 MANSASPEQNQNHCSAINNSIPLMQGN-LPTLTLSGKIRVTVTFFLFL :. . ...:. .. : : . .:..... CCDS75 MPANFTEGSFDSSGTGQTLDSSPVACTETVTFTEVVEGKEWGSFYYSFKTEQLITLWVLF 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE9 LSATFNASFLLKLQKWTQKKEKGKKLSRMKLLLKHLTLANLLETLIVMPLDGMWNITVQW . . . : .: .. : .::. ::: ... .:.... . :. . : : .: .. CCDS75 VFTIVGNSVVL-FSTWRRKKK-----SRMTFFVTQLAITDSFTGLVNILTDINWRFTGDF 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE9 YAGELLCKVLSYLKLFSMYAPAFMMVVISLDRSLAITRPLALKSNSKVGQSMVGLAWILS : .:.:.:. ::.. .:: ....: .:.:: ::. :. . .. : .. .. .:: :: CCDS75 TAPDLVCRVVRYLQVVLLYASTYVLVSLSIDRYHAIVYPMKFLQGEKQARVLIVIAWSLS 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE9 SVFAGPQLYIFRMIHLADSSGQTKVFSQCVTHCSFSQWWHQAFYNFFTFSCLFIIPLFIM .:. : : :: : :.:.. :: . ...: .... .: ...::: :. CCDS75 FLFSIPTLIIFGKRTL--SNGEV----QCWALWPDDSYW-TPYMTIVAF-LVYFIPLTII 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KE9 LICNAKIIFTL--------TRVLHQDPHELQLNQSKNNIPRARLKTLKMTVAFATSFTVC : . .: :. : . . . .: . ... : .:..:..:... . .: : CCDS75 SIMYGIVIRTIWIKSKTYETVISNCSDGKLCSSYNRGLISKAKIKAIKYSIIIILAFICC 230 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 pF1KE9 WTPYYVLGIWYWFD--PEMLNRLSDPVNHFFFLFAFLNPCFDPLIYGYFSL :.::... : :. :. .:. : .. . :: ..:::: :: CCDS75 WSPYFLFDILDNFNLLPDTQERFYASV--IIQNLPALNSAINPLIYCVFSSSISFPCRAN 290 300 310 320 330 340 CCDS75 SSVYLLACDVSVLWALVLTSEKESCESWRRKGAKITGFQNDVPGEN 350 360 370 380 390 >>CCDS8965.1 AVPR1A gene_id:552|Hs108|chr12 (418 aa) initn: 453 init1: 207 opt: 348 Z-score: 340.6 bits: 71.7 E(32554): 1.2e-12 Smith-Waterman score: 483; 29.0% identity (61.9% similar) in 331 aa overlap (23-327:35-352) 10 20 30 40 pF1KE9 MANSASPEQNQNHCSAINNSIPLMQGNLPTLTLSG----KIRVTVTFFLFLL : .:: : . . :....: : . CCDS89 AGPDAGPSGNSSPWWPLATGAGNTSREAEALGEGNGPPRDVRNEELAKLEIAVLAVTFAV 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE9 SATFNASFLLKLQKWTQKKEKGKKLSRMKLLLKHLTLANLLETLI-VMPLDGMWNITVQW .. :.: :: :.. .: :::.:...::.::.: ... :.: . :.:: .. CCDS89 AVLGNSSVLLALHR------TPRKTSRMHLFIRHLSLADLAVAFFQVLP-QMCWDITYRF 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE9 YAGELLCKVLSYLKLFSMYAPAFMMVVISLDRSLAITRPL-ALKSNSKVGQSMVGLAWIL . . ::.:...:..:.:.: :.:.::.. :: .:. .:: .:.. .. .. :.. ::.: CCDS89 RGPDWLCRVVKHLQVFGMFASAYMLVVMTADRYIAVCHPLKTLQQPARRSRLMIAAAWVL 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE9 SSVFAGPQLYIFRMIHLADSSGQTKVFSQCVTHCSFSQWWHQAFYNFFTFSCLFIIPLFI : :.. :: ..: ::.. . ::. .: . .: : : . : . . .:. :. : CCDS89 SFVLSTPQYFVFSMIEVNNV---TKA-RDCWA--TFIQPWGSRAYVTWMTGGIFVAPVVI 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 pF1KE9 MLICNAKIIFTL------------TRVLHQDPHELQLN-------QSKNNIPRARLKTLK . : . : ... .. .: .: . .: ..: ::...:.: CCDS89 LGTCYGFICYNIWCNVRGKTASRQSKGAEQAGVAFQKGFLLAPCVSSVKSISRAKIRTVK 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 pF1KE9 MTVAFATSFTVCWTPYYVLGIWYWFDPEMLNRLSD-PVNHFFFLFAFLNPCFDPLIYGYF :: ...:.. :::.:.... .: .:: . :. :. . :.. :: : .: :: .: CCDS89 MTFVIVTAYIVCWAPFFIIQMWSVWDPMSVWTESENPTITITALLGSLNSCCNPWIYMFF 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 SL : CCDS89 SGHLLQDCVQSFPCCQNMKEKFNKEDTDSMSRRQTFYSNNRSPTNSTGMWKDSPKSSKSI 360 370 380 390 400 410 >>CCDS55539.1 AVPR2 gene_id:554|Hs108|chrX (309 aa) initn: 309 init1: 152 opt: 336 Z-score: 330.9 bits: 69.4 E(32554): 4.1e-12 Smith-Waterman score: 336; 27.3% identity (60.3% similar) in 267 aa overlap (45-295:41-299) 20 30 40 50 60 70 pF1KE9 SAINNSIPLMQGNLPTLTLSGKIRVTVTFFLFLLSATFNASFL---LKLQKWTQKKEKGK : ::: .: : : : : ... ..:. 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CCDS55 -WAPIHVFIGHLCLADLAVALFQVLP-QLAWKATDRFRGPDALCRAVKYLQMVGMYASSY 80 90 100 110 120 140 150 160 170 180 pF1KE9 MMVVISLDRSLAITRP-LALKSNSKVGQSM-VGLAWILSSVFAGPQLYIFRMIHLADSSG :.....::: :: :: :: . .: . . : .:: .: ... :::.:: . .. .:: CCDS55 MILAMTLDRHRAICRPMLAYRHGSGAHWNRPVLVAWAFSLLLSLPQLFIFAQRNVEGGSG 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE9 QTKVFSQCVTHCSFSQWWHQAFYNFFTFSCLFIIPLFIMLICNAKIIFTLTRVLHQDPHE : .. : :.. : . : . .:. : . . :.. :. . : : : CCDS55 VTDCWA-----C-FAEPWGRRTYVTWIALMVFVAPTLGIAACQVLIFREIHASLVPGPSE 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 LQLNQSKN----------NIPRARLKTLKMTVAFATSFTVCWTPYYVLGIWYWFDPEMLN .. .. .. : ::..::..... ...::.:.... .: .::: CCDS55 RPGGRRRGRRTGSPGEGAHVSAAVAKTVRMTLVIVVVYVLCWAPFFLVQLWAAWDPEAPL 250 260 270 280 290 300 300 310 320 pF1KE9 RLSDPVNHFFFLFAFLNPCFDPLIYGYFSL CCDS55 EGGCSRG >>CCDS73015.1 AVPR1B gene_id:553|Hs108|chr1 (424 aa) initn: 394 init1: 209 opt: 335 Z-score: 328.5 bits: 69.4 E(32554): 5.6e-12 Smith-Waterman score: 432; 28.5% identity (60.8% similar) in 344 aa overlap (15-327:18-342) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MANSASPEQNQNHCSAINNSIPLMQGNLPTLTLSGKIRVTVTFFLFLLSATFNASFL :: : . : . : :. :... : ...:.. : . : CCDS73 MDSGPLWDANPTPRGTLSAPNATTPWL-GRDEELA---KVEIGVLATVLVLATGGNLAVL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 LKLQKWTQKKEKGKKLSRMKLLLKHLTLANLLETLI-VMPLDGMWNITVQWYAGELLCKV : : . :.: :::.:.. ::.:..: .:. :.: . .:.:: .. . .:::.. CCDS73 LTLGQL------GRKRSRMHLFVLHLALTDLAVALFQVLP-QLLWDITYRFQGPDLLCRA 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 LSYLKLFSMYAPAFMMVVISLDRSLAITRPLALKSNSKVGQS---MVGLAWILSSVFAGP ..::...::.: ..:.....::: ::. .:: .: .. ::: ... :.:...:. : CCDS73 VKYLQVLSMFASTYMLLAMTLDRYLAVCHPL--RSLQQPGQSTYLLIAAPWLLAAIFSLP 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 pF1KE9 QLYIFRMIHLADSSGQTKVFSQCVTHCSFSQWWHQAFYNFFTFSCLFIIPLFIM-----L :..:: . .. ..:: .: . .: : .:. .. :.. .:..:. .. : CCDS73 QVFIFSLREVIQGSGVL----DCWADFGFP-WGPRAYLTWTTLA-IFVLPVTMLTACYSL 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 pF1KE9 IC-----NAKIIFTLTRVL--------HQDPHELQLN--------QSKNNIPRARLKTLK :: : :. :: . .: : . .: :.: ::...:.: CCDS73 ICHEICKNLKVKTQAWRVGGGGWRTWDRPSPSTLAATTRGLPSRVSSINTISRAKIRTVK 230 240 250 260 270 280 270 280 290 300 310 320 pF1KE9 MTVAFATSFTVCWTPYYVLGIWYWFDPEMLNRLSDPVNHFF-FLFAFLNPCFDPLIYGYF :: ... .. .::.:.. . .: .: . .. : : . .:.. :: : .: :: : CCDS73 MTFVIVLAYIACWAPFFSVQMWSVWDKNAPDEDSTNVAFTISMLLGNLNSCCNPWIYMGF 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 SL . CCDS73 NSHLLPRPLRHLACCGGPQPRMRRRLSDGSLSSRHTTLLTRSSCPATLSLSLSLTLSGRP 350 360 370 380 390 400 328 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 07:59:57 2016 done: Sun Nov 6 07:59:57 2016 Total Scan time: 2.560 Total Display time: 0.020 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]