FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5621, 1356 aa 1>>>pF1KB5621 1356 - 1356 aa - 1356 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 19.6326+/-0.000757; mu= -50.1069+/- 0.045 mean_var=1188.4447+/-265.432, 0's: 0 Z-trim(112.8): 666 B-trim: 0 in 0/57 Lambda= 0.037204 statistics sampled from 21223 (21857) to 21223 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.573), E-opt: 0.2 (0.256), width: 16 Scan time: 12.150 The best scores are: opt bits E(85289) NP_002244 (OMIM: 191306,602089) vascular endotheli (1356) 9016 502.6 7.8e-141 XP_016864757 (OMIM: 136352,153100,602089) PREDICTE (1337) 3240 192.6 1.6e-47 NP_891555 (OMIM: 136352,153100,602089) vascular en (1363) 3240 192.6 1.7e-47 XP_011532780 (OMIM: 136352,153100,602089) PREDICTE (1440) 3240 192.6 1.7e-47 NP_002011 (OMIM: 136352,153100,602089) vascular en (1298) 3236 192.4 1.9e-47 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 WLWPNNQSGSEQRVEVTECSDGLFCKTLTIPKVIGNDTGAYKCFYRETDLASVIYVYVQD 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB5 YRSPFIASVSDQHGVVYITENKNKTVVIPCLGSISNLNVSLCARYPEKRFVPDGNRISWD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 YRSPFIASVSDQHGVVYITENKNKTVVIPCLGSISNLNVSLCARYPEKRFVPDGNRISWD 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB5 SKKGFTIPSYMISYAGMVFCEAKINDESYQSIMYIVVVVGYRIYDVVLSPSHGIELSVGE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 SKKGFTIPSYMISYAGMVFCEAKINDESYQSIMYIVVVVGYRIYDVVLSPSHGIELSVGE 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB5 KLVLNCTARTELNVGIDFNWEYPSSKHQHKKLVNRDLKTQSGSEMKKFLSTLTIDGITRS ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::: NP_002 KLVLNCTARTELNVGIDFNWEYPSSKHQHKKLVNRDLKTQSGSEMKKFLSTLTIDGVTRS 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB5 DQGLYTCAASSGLMTKKNSTFVRVHEKPFVAFGSGMESLVEATVGERVRIPAKYLGYPPP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 DQGLYTCAASSGLMTKKNSTFVRVHEKPFVAFGSGMESLVEATVGERVRIPAKYLGYPPP 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB5 EIKWYKNGIPLESNHTIKAGHVLTIMEVSERDTGNYTVILTNPISKEKQSHVVSLVVYVP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 EIKWYKNGIPLESNHTIKAGHVLTIMEVSERDTGNYTVILTNPISKEKQSHVVSLVVYVP 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB5 PQIGEKSLISPVDSYQYGTTQTLTCTVYAIPPPHHIHWYWQLEEECANEPSQAVSVTNPY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 PQIGEKSLISPVDSYQYGTTQTLTCTVYAIPPPHHIHWYWQLEEECANEPSQAVSVTNPY 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB5 PCEEWRSVEDFQGGNKIEVNKNQFALIEGKNKTVSTLVIQAANVSALYKCEAVNKVGRGE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 PCEEWRSVEDFQGGNKIEVNKNQFALIEGKNKTVSTLVIQAANVSALYKCEAVNKVGRGE 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KB5 RVISFHVTRGPEITLQPDMQPTEQESVSLWCTADRSTFENLTWYKLGPQPLPIHVGELPT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 RVISFHVTRGPEITLQPDMQPTEQESVSLWCTADRSTFENLTWYKLGPQPLPIHVGELPT 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KB5 PVCKNLDTLWKLNATMFSNSTNDILIMELKNASLQDQGDYVCLAQDRKTKKRHCVVRQLT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 PVCKNLDTLWKLNATMFSNSTNDILIMELKNASLQDQGDYVCLAQDRKTKKRHCVVRQLT 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KB5 VLERVAPTITGNLENQTTSIGESIEVSCTASGNPPPQIMWFKDNETLVEDSGIVLKDGNR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 VLERVAPTITGNLENQTTSIGESIEVSCTASGNPPPQIMWFKDNETLVEDSGIVLKDGNR 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KB5 NLTIRRVRKEDEGLYTCQACSVLGCAKVEAFFIIEGAQEKTNLEIIILVGTAVIAMFFWL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 NLTIRRVRKEDEGLYTCQACSVLGCAKVEAFFIIEGAQEKTNLEIIILVGTAVIAMFFWL 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KB5 LLVIILRTVKRANGGELKTGYLSIVMDPDELPLDEHCERLPYDASKWEFPRDRLKLGKPL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 LLVIILRTVKRANGGELKTGYLSIVMDPDELPLDEHCERLPYDASKWEFPRDRLKLGKPL 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 pF1KB5 GRGAFGQVIEADAFGIDKTATCRTVAVKMLKEGATHSEHRALMSELKILIHIGHHLNVVN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 GRGAFGQVIEADAFGIDKTATCRTVAVKMLKEGATHSEHRALMSELKILIHIGHHLNVVN 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 pF1KB5 LLGACTKPGGPLMVIVEFCKFGNLSTYLRSKRNEFVPYKTKGARFRQGKDYVGAIPVDLK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 LLGACTKPGGPLMVIVEFCKFGNLSTYLRSKRNEFVPYKTKGARFRQGKDYVGAIPVDLK 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KB5 RRLDSITSSQSSASSGFVEEKSLSDVEEEEAPEDLYKDFLTLEHLICYSFQVAKGMEFLA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 RRLDSITSSQSSASSGFVEEKSLSDVEEEEAPEDLYKDFLTLEHLICYSFQVAKGMEFLA 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KB5 SRKCIHRDLAARNILLSEKNVVKICDFGLARDIYKDPDYVRKGDARLPLKWMAPETIFDR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 SRKCIHRDLAARNILLSEKNVVKICDFGLARDIYKDPDYVRKGDARLPLKWMAPETIFDR 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KB5 VYTIQSDVWSFGVLLWEIFSLGASPYPGVKIDEEFCRRLKEGTRMRAPDYTTPEMYQTML :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 VYTIQSDVWSFGVLLWEIFSLGASPYPGVKIDEEFCRRLKEGTRMRAPDYTTPEMYQTML 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KB5 DCWHGEPSQRPTFSELVEHLGNLLQANAQQDGKDYIVLPISETLSMEEDSGLSLPTSPVS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 DCWHGEPSQRPTFSELVEHLGNLLQANAQQDGKDYIVLPISETLSMEEDSGLSLPTSPVS 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KB5 CMEEEEVCDPKFHYDNTAGISQYLQNSKRKSRPVSVKTFEDIPLEEPEVKVIPDDNQTDS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 CMEEEEVCDPKFHYDNTAGISQYLQNSKRKSRPVSVKTFEDIPLEEPEVKVIPDDNQTDS 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KB5 GMVLASEELKTLEDRTKLSPSFGGMVPSKSRESVASEGSNQTSGYQSGYHSDDTDTTVYS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 GMVLASEELKTLEDRTKLSPSFGGMVPSKSRESVASEGSNQTSGYQSGYHSDDTDTTVYS 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 pF1KB5 SEEAELLKLIEIGVQTGSTAQILQPDSGTTLSSPPV :::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 SEEAELLKLIEIGVQTGSTAQILQPDSGTTLSSPPV 1330 1340 1350 >>XP_016864757 (OMIM: 136352,153100,602089) PREDICTED: v (1337 aa) initn: 3264 init1: 1239 opt: 3240 Z-score: 974.0 bits: 192.6 E(85289): 1.6e-47 Smith-Waterman score: 3562; 44.5% identity (69.7% similar) in 1344 aa overlap (32-1323:4-1321) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 QSKVLLAVALWLCVETRAASVGLPSVSLDLPRLSIQKDILTIKANTTLQITCRGQRDLDW : :.: .. .: .. .:.:.::::. :.: XP_016 MTPPTLNITEESHVIDTGDSLSISCRGQHPLEW 10 20 30 70 80 90 100 pF1KB5 LWPNNQ----SG---SEQRVEVTEC--SDGL-FCKTLTIPKVIGNDTGAYKCFYR----- ::. : .: ::. : .: .:. .::.: . .: .::::.: :.:. XP_016 AWPGAQEAPATGDKDSEDTGVVRDCEGTDARPYCKVLLLHEVHANDTGSYVCYYKYIKAR 40 50 60 70 80 90 110 120 130 140 150 160 pF1KB5 -ETDLASVIYVYVQDYRSPFIASVSDQHGVVYITENKNKTVVIPCLGSISNLNVSLCARY : :. ::.:.:...::: .. .. . :.. .. .::: :: .:::.: : XP_016 IEGTTAASSYVFVRDFEQPFI----NKPDTLLV--NRKDAMWVPCLVSIPGLNVTL--RS 100 110 120 130 140 170 180 190 200 210 220 pF1KB5 PEKRFVPDGNRISWDSKKGFTIPSYMISYAGMVFCEAKINDESYQSIMYIVVVVGYRIYD . . :::... ::...:. . . .. : .. ::. .:... : ..: ..: ..:: XP_016 QSSVLWPDGQEVVWDDRRGMLVSTPLLHDALYLQCETTWGDQDFLSNPFLVHITGNELYD 150 160 170 180 190 200 230 240 250 260 270 280 pF1KB5 VVLSPSHGIELSVGEKLVLNCTARTELNVGIDFNWEYPSSKHQHKKLVNRDLKTQSGSEM . : : ...:: ::::::::::. .:.: :. :.:.::... .. : : . . :. .:. XP_016 IQLLPRKSLELLVGEKLVLNCTVWAEFNSGVTFDWDYPGKQAERGKWVPERRSQQTHTEL 210 220 230 240 250 260 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 KKFLSTLTIDGITRSDQGLYTCAASSGLMTKKNSTFVRVHEKPFVAFGSGMESLVEATVG . : ::: .... : : :.: :..:.. ..:: : :::.::.. ..:::.: XP_016 S---SILTIHNVSQHDLGSYVCKANNGIQRFRESTEVIVHENPFISVEWLKGPILEATAG 270 280 290 300 310 320 350 360 370 380 390 400 pF1KB5 -ERVRIPAKYLGYPPPEIKWYKNGIPLESNHTIKAGHVLTIMEVSERDTGNYTVILTNPI : :..:.: .:::::..:::.: : . :. :.:.. ::.: .::.::. : : XP_016 DELVKLPVKLAAYPPPEFQWYKDGKALSGRHS---PHALVLKEVTEASTGTYTLALWNSA 330 340 350 360 370 410 420 430 440 450 460 pF1KB5 SKEKQSHVVSLVVYVPPQIGEKSLISPVDSYQYGTTQTLTCTVYAIPPPHHIHWYWQLEE . ... . ::: ::::: :: :: . :. . :.::::.:..: : :.:.:. 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XP_016 PGVQINEEFCQRLRDGTRMRAPELATPAIRRIMLNCWSGDPKARPAFSELVEILGDLLQG 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KB5 NAQQDGKDYIVLPISETLSMEEDSGLSLPTSPVSCMEEE-EVCDPKFH-------YDNTA . :. .. . : : . : :: : .. : . . . : :... : : . XP_016 RGLQEEEEVCMAPRS-SQSSEEGSFSQVSTMALHIAQADAEDSPPSLQRHSLAARYYNWV 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KB5 GISQYLQNSKRKSRPVSVKTFEDIPLEEPEVKVIPDDNQTDSGMVLASEELKTLEDRTKL .. : . . .::::..:. : . ::::::::::::::.. .:.: . XP_016 SFPGCLARGAETRGSSRMKTFEEFPMT-PTTYKGSVDNQTDSGMVLASEEFEQIESRHRQ 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KB5 SPSFGGMVPSK----SRESVASEGSNQ-----TSGYQSGYHSDDTDTTVYSSEEAELLKL .:. :.. .: :.: . . : : :.:. . . : :. 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NP_891 VSFPGCLARGAETRGSSRMKTFEEFPMT-PTTYKGSVDNQTDSGMVLASEEFEQIESRHR 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KB5 LSPSFGGMVPSK----SRESVASEGSNQ-----TSGYQSGYHSDDTDTTVYSSEEAELLK .:. :.. .: :.: . . : : :.:. . . : :. NP_891 QESGFSCKGPGQNVAVTRAHPDSQGRRRRPERGARGGQVFYNSEYGELSEPSEEDHCSPS 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1330 1340 1350 pF1KB5 LIEIGVQTGSTAQILQPDSGTTLSSPPV NP_891 ARVTFFTDNSY 1360 >>XP_011532780 (OMIM: 136352,153100,602089) PREDICTED: v (1440 aa) initn: 3264 init1: 1239 opt: 3240 Z-score: 973.6 bits: 192.6 E(85289): 1.7e-47 Smith-Waterman score: 3574; 43.9% identity (69.2% similar) in 1375 aa overlap (1-1323:79-1424) 10 20 30 pF1KB5 MQSKVLLAVALWLCVETRAASVGLPSVSLD . ..:. . : .:.. . : :. 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XP_011 TLLV--NRKDAMWVPCLVSIPGLNVTL--RSQSSVLWPDGQEVVWDDRRGMLVSTPLLHD 230 240 250 260 270 200 210 220 230 240 250 pF1KB5 AGMVFCEAKINDESYQSIMYIVVVVGYRIYDVVLSPSHGIELSVGEKLVLNCTARTELNV : .. ::. .:... : ..: ..: ..::. : : ...:: ::::::::::. .:.: XP_011 ALYLQCETTWGDQDFLSNPFLVHITGNELYDIQLLPRKSLELLVGEKLVLNCTVWAEFNS 280 290 300 310 320 330 260 270 280 290 300 310 pF1KB5 GIDFNWEYPSSKHQHKKLVNRDLKTQSGSEMKKFLSTLTIDGITRSDQGLYTCAASSGLM :. :.:.::... .. : : . . :. .:.. : ::: .... : : :.: :..:.. XP_011 GVTFDWDYPGKQAERGKWVPERRSQQTHTELS---SILTIHNVSQHDLGSYVCKANNGIQ 340 350 360 370 380 390 320 330 340 350 360 370 pF1KB5 TKKNSTFVRVHEKPFVAFGSGMESLVEATVG-ERVRIPAKYLGYPPPEIKWYKNGIPLES ..:: : :::.::.. ..:::.: : :..:.: .:::::..:::.: : . XP_011 RFRESTEVIVHENPFISVEWLKGPILEATAGDELVKLPVKLAAYPPPEFQWYKDGKALSG 400 410 420 430 440 450 380 390 400 410 420 430 pF1KB5 NHTIKAGHVLTIMEVSERDTGNYTVILTNPISKEKQSHVVSLVVYVPPQIGEKSLISPVD :. :.:.. ::.: .::.::. : : . ... . ::: ::::: :: :: . 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