Result of FASTA (ccds) for pFN21AB5621
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5621, 1356 aa
  1>>>pF1KB5621 1356 - 1356 aa - 1356 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.8857+/-0.00169; mu= -31.4507+/- 0.094
 mean_var=680.6374+/-158.009, 0's: 0 Z-trim(104.7): 363  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.049161
 statistics sampled from 7756 (8048) to 7756 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.578), E-opt: 0.2 (0.247), width:  16
 Scan time:  3.920

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS3497.1 KDR gene_id:3791|Hs108|chr4             (1356) 9016 657.2 8.6e-188
CCDS4457.1 FLT4 gene_id:2324|Hs108|chr5            (1363) 3240 247.6 1.8e-64
CCDS43412.1 FLT4 gene_id:2324|Hs108|chr5           (1298) 3236 247.3 2.1e-64
CCDS9330.1 FLT1 gene_id:2321|Hs108|chr13           (1338) 2497 194.9 1.3e-48
CCDS4302.1 CSF1R gene_id:1436|Hs108|chr5           ( 972) 1184 101.6 1.1e-20
CCDS31953.1 FLT3 gene_id:2322|Hs108|chr13          ( 993) 1137 98.3 1.1e-19
CCDS73556.1 FLT1 gene_id:2321|Hs108|chr13          ( 687) 1119 96.9   2e-19
CCDS53861.1 FLT1 gene_id:2321|Hs108|chr13          ( 541)  954 85.1 5.6e-16
CCDS55221.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 812)  767 72.0 7.6e-12
CCDS55222.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 820)  767 72.0 7.6e-12
CCDS3495.1 PDGFRA gene_id:5156|Hs108|chr4          (1089)  750 70.9 2.2e-11
CCDS47058.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4            ( 972)  747 70.6 2.3e-11
CCDS43731.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 731)  741 70.1 2.5e-11
CCDS43730.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 733)  741 70.1 2.5e-11
CCDS43732.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 820)  741 70.2 2.7e-11
CCDS6107.2 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8           ( 822)  741 70.2 2.8e-11
CCDS55223.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 853)  741 70.2 2.8e-11
CCDS81514.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 593)  735 69.6 2.9e-11
CCDS44486.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 709)  736 69.8 3.1e-11
CCDS73210.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 732)  735 69.7 3.4e-11
CCDS31298.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 821)  735 69.7 3.7e-11
CCDS3496.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4             ( 976)  735 69.8 4.2e-11
CCDS53584.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 707)  728 69.2 4.6e-11
CCDS44485.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 704)  727 69.1 4.9e-11
CCDS44487.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 705)  727 69.1 4.9e-11
CCDS81515.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 819)  727 69.2 5.5e-11
CCDS7620.2 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10          ( 822)  727 69.2 5.5e-11
CCDS3354.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4           ( 694)  723 68.8 5.8e-11
CCDS3353.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4           ( 806)  723 68.9 6.6e-11
CCDS54706.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4          ( 808)  723 68.9 6.6e-11
CCDS44488.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 680)  716 68.3 8.1e-11
CCDS44489.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 769)  716 68.4 8.9e-11


>>CCDS3497.1 KDR gene_id:3791|Hs108|chr4                  (1356 aa)
 initn: 9016 init1: 9016 opt: 9016  Z-score: 3484.9  bits: 657.2 E(32554): 8.6e-188
Smith-Waterman score: 9016; 99.9% identity (100.0% similar) in 1356 aa overlap (1-1356:1-1356)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MQSKVLLAVALWLCVETRAASVGLPSVSLDLPRLSIQKDILTIKANTTLQITCRGQRDLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MQSKVLLAVALWLCVETRAASVGLPSVSLDLPRLSIQKDILTIKANTTLQITCRGQRDLD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 WLWPNNQSGSEQRVEVTECSDGLFCKTLTIPKVIGNDTGAYKCFYRETDLASVIYVYVQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 WLWPNNQSGSEQRVEVTECSDGLFCKTLTIPKVIGNDTGAYKCFYRETDLASVIYVYVQD
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 YRSPFIASVSDQHGVVYITENKNKTVVIPCLGSISNLNVSLCARYPEKRFVPDGNRISWD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YRSPFIASVSDQHGVVYITENKNKTVVIPCLGSISNLNVSLCARYPEKRFVPDGNRISWD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 SKKGFTIPSYMISYAGMVFCEAKINDESYQSIMYIVVVVGYRIYDVVLSPSHGIELSVGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SKKGFTIPSYMISYAGMVFCEAKINDESYQSIMYIVVVVGYRIYDVVLSPSHGIELSVGE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 KLVLNCTARTELNVGIDFNWEYPSSKHQHKKLVNRDLKTQSGSEMKKFLSTLTIDGITRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS34 KLVLNCTARTELNVGIDFNWEYPSSKHQHKKLVNRDLKTQSGSEMKKFLSTLTIDGVTRS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 DQGLYTCAASSGLMTKKNSTFVRVHEKPFVAFGSGMESLVEATVGERVRIPAKYLGYPPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DQGLYTCAASSGLMTKKNSTFVRVHEKPFVAFGSGMESLVEATVGERVRIPAKYLGYPPP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 EIKWYKNGIPLESNHTIKAGHVLTIMEVSERDTGNYTVILTNPISKEKQSHVVSLVVYVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EIKWYKNGIPLESNHTIKAGHVLTIMEVSERDTGNYTVILTNPISKEKQSHVVSLVVYVP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 PQIGEKSLISPVDSYQYGTTQTLTCTVYAIPPPHHIHWYWQLEEECANEPSQAVSVTNPY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PQIGEKSLISPVDSYQYGTTQTLTCTVYAIPPPHHIHWYWQLEEECANEPSQAVSVTNPY
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 PCEEWRSVEDFQGGNKIEVNKNQFALIEGKNKTVSTLVIQAANVSALYKCEAVNKVGRGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PCEEWRSVEDFQGGNKIEVNKNQFALIEGKNKTVSTLVIQAANVSALYKCEAVNKVGRGE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 RVISFHVTRGPEITLQPDMQPTEQESVSLWCTADRSTFENLTWYKLGPQPLPIHVGELPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RVISFHVTRGPEITLQPDMQPTEQESVSLWCTADRSTFENLTWYKLGPQPLPIHVGELPT
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB5 PVCKNLDTLWKLNATMFSNSTNDILIMELKNASLQDQGDYVCLAQDRKTKKRHCVVRQLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PVCKNLDTLWKLNATMFSNSTNDILIMELKNASLQDQGDYVCLAQDRKTKKRHCVVRQLT
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB5 VLERVAPTITGNLENQTTSIGESIEVSCTASGNPPPQIMWFKDNETLVEDSGIVLKDGNR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VLERVAPTITGNLENQTTSIGESIEVSCTASGNPPPQIMWFKDNETLVEDSGIVLKDGNR
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB5 NLTIRRVRKEDEGLYTCQACSVLGCAKVEAFFIIEGAQEKTNLEIIILVGTAVIAMFFWL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NLTIRRVRKEDEGLYTCQACSVLGCAKVEAFFIIEGAQEKTNLEIIILVGTAVIAMFFWL
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB5 LLVIILRTVKRANGGELKTGYLSIVMDPDELPLDEHCERLPYDASKWEFPRDRLKLGKPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LLVIILRTVKRANGGELKTGYLSIVMDPDELPLDEHCERLPYDASKWEFPRDRLKLGKPL
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB5 GRGAFGQVIEADAFGIDKTATCRTVAVKMLKEGATHSEHRALMSELKILIHIGHHLNVVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GRGAFGQVIEADAFGIDKTATCRTVAVKMLKEGATHSEHRALMSELKILIHIGHHLNVVN
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB5 LLGACTKPGGPLMVIVEFCKFGNLSTYLRSKRNEFVPYKTKGARFRQGKDYVGAIPVDLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LLGACTKPGGPLMVIVEFCKFGNLSTYLRSKRNEFVPYKTKGARFRQGKDYVGAIPVDLK
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB5 RRLDSITSSQSSASSGFVEEKSLSDVEEEEAPEDLYKDFLTLEHLICYSFQVAKGMEFLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RRLDSITSSQSSASSGFVEEKSLSDVEEEEAPEDLYKDFLTLEHLICYSFQVAKGMEFLA
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB5 SRKCIHRDLAARNILLSEKNVVKICDFGLARDIYKDPDYVRKGDARLPLKWMAPETIFDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SRKCIHRDLAARNILLSEKNVVKICDFGLARDIYKDPDYVRKGDARLPLKWMAPETIFDR
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB5 VYTIQSDVWSFGVLLWEIFSLGASPYPGVKIDEEFCRRLKEGTRMRAPDYTTPEMYQTML
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VYTIQSDVWSFGVLLWEIFSLGASPYPGVKIDEEFCRRLKEGTRMRAPDYTTPEMYQTML
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KB5 DCWHGEPSQRPTFSELVEHLGNLLQANAQQDGKDYIVLPISETLSMEEDSGLSLPTSPVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DCWHGEPSQRPTFSELVEHLGNLLQANAQQDGKDYIVLPISETLSMEEDSGLSLPTSPVS
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KB5 CMEEEEVCDPKFHYDNTAGISQYLQNSKRKSRPVSVKTFEDIPLEEPEVKVIPDDNQTDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 CMEEEEVCDPKFHYDNTAGISQYLQNSKRKSRPVSVKTFEDIPLEEPEVKVIPDDNQTDS
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KB5 GMVLASEELKTLEDRTKLSPSFGGMVPSKSRESVASEGSNQTSGYQSGYHSDDTDTTVYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GMVLASEELKTLEDRTKLSPSFGGMVPSKSRESVASEGSNQTSGYQSGYHSDDTDTTVYS
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      
pF1KB5 SEEAELLKLIEIGVQTGSTAQILQPDSGTTLSSPPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SEEAELLKLIEIGVQTGSTAQILQPDSGTTLSSPPV
             1330      1340      1350      

>>CCDS4457.1 FLT4 gene_id:2324|Hs108|chr5                 (1363 aa)
 initn: 3264 init1: 1239 opt: 3240  Z-score: 1270.9  bits: 247.6 E(32554): 1.8e-64
Smith-Waterman score: 3594; 44.1% identity (69.3% similar) in 1375 aa overlap (1-1323:1-1347)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MQSKVLLAVALWLCVETRAASVGLPSVSLDLPRLSIQKDILTIKANTTLQITCRGQRDLD
       ::  . : . ::::.    . :.  . :.  : :.: ..  .: .. .:.:.::::. :.
CCDS44 MQRGAALCLRLWLCLGLLDGLVS--GYSMTPPTLNITEESHVIDTGDSLSISCRGQHPLE
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       : ::. :    .:   ::.   : .:  .:.  .::.: . .: .::::.: :.:.    
CCDS44 WAWPGAQEAPATGDKDSEDTGVVRDCEGTDARPYCKVLLLHEVHANDTGSYVCYYKYIKA
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pF1KB5 --ETDLASVIYVYVQDYRSPFIASVSDQHGVVYITENKNKTVVIPCLGSISNLNVSLCAR
         :   :.  ::.:.:...:::    ..  .. .  :.. .. .::: :: .:::.:  :
CCDS44 RIEGTTAASSYVFVRDFEQPFI----NKPDTLLV--NRKDAMWVPCLVSIPGLNVTL--R
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pF1KB5 YPEKRFVPDGNRISWDSKKGFTIPSYMISYAGMVFCEAKINDESYQSIMYIVVVVGYRIY
          . . :::... ::...:. . . ..  : .. ::.  .:... :  ..: ..: ..:
CCDS44 SQSSVLWPDGQEVVWDDRRGMLVSTPLLHDALYLQCETTWGDQDFLSNPFLVHITGNELY
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pF1KB5 DVVLSPSHGIELSVGEKLVLNCTARTELNVGIDFNWEYPSSKHQHKKLVNRDLKTQSGSE
       :. : : ...:: ::::::::::. .:.: :. :.:.::... .. : : .  . :. .:
CCDS44 DIQLLPRKSLELLVGEKLVLNCTVWAEFNSGVTFDWDYPGKQAERGKWVPERRSQQTHTE
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pF1KB5 MKKFLSTLTIDGITRSDQGLYTCAASSGLMTKKNSTFVRVHEKPFVAFGSGMESLVEATV
       ..   : ::: .... : : :.: :..:..  ..:: : :::.::..       ..:::.
CCDS44 LS---SILTIHNVSQHDLGSYVCKANNGIQRFRESTEVIVHENPFISVEWLKGPILEATA
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pF1KB5 G-ERVRIPAKYLGYPPPEIKWYKNGIPLESNHTIKAGHVLTIMEVSERDTGNYTVILTNP
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CCDS44 GDELVKLPVKLAAYPPPEFQWYKDGKALSGRHS---PHALVLKEVTEASTGTYTLALWNS
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        .  ...  . ::: ::::: ::   :: . :.  . :.::::.:..: :  :.:.:.  
CCDS44 AAGLRRNISLELVVNVPPQIHEKEASSP-SIYSRHSRQALTCTAYGVPLPLSIQWHWRPW
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CCDS44 TPCKMFAQRSLRRRQQQDLMPQCRDWRAVTTQDAVNPIESLDTWTEFVEGKNKTVSKLVI
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CCDS44 QNANVSAMYKCVVSNKVGQDERLIYFYVTTIPDGFTIESKPSEELLEGQPVLLSCQADSY
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        .:.: ::.:. . :    :.     :::.    .: :: .. : ...        : . 
CCDS44 KYEHLRWYRLNLSTLHDAHGNPLLLDCKNV----HLFATPLAASLEEVAPGARHATLSLS
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        :.::.:.:: : ::::.:::::.::.::. :: ::::.:.::.:::: : ..: :::::
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CCDS44 RAKRDAFSPCAEKSPEQRGRFRAMVELARLDRRRPGSSDRVLFARFSKTEGGARRAS---
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CCDS44 -PDQEA-EDLWLSPLTMEDLVCYSFQVARGMEFLASRKCIHRDLAARNILLSESDVVKIC
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CCDS44 DFGLARDIYKDPDYVRKGSARLPLKWMAPESIFDKVYTTQSDVWSFGVLLWEIFSLGASP
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CCDS44 YPGVQINEEFCQRLRDGTRMRAPELATPAIRRIMLNCWSGDPKARPAFSELVEILGDLLQ
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       . . :. ..  . : : . : :: :  .. :  .   . . :   :...       : : 
CCDS44 GRGLQEEEEVCMAPRS-SQSSEEGSFSQVSTMALHIAQADAEDSPPSLQRHSLAARYYNW
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CCDS44 VSFPGCLARGAETRGSSRMKTFEEFPMT-PTTYKGSVDNQTDSGMVLASEEFEQIESRHR
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CCDS44 QESGFSCKGPGQNVAVTRAHPDSQGRRRRPERGARGGQVFYNSEYGELSEPSEEDHCSPS
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CCDS44 ARVTFFTDNSY                 
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CCDS43 RIEGTTAASSYVFVRDFEQPFI----NKPDTLLV--NRKDAMWVPCLVSIPGLNVTL--R
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CCDS43 SQSSVLWPDGQEVVWDDRRGMLVSTPLLHDALYLQCETTWGDQDFLSNPFLVHITGNELY
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pF1KB5 DVVLSPSHGIELSVGEKLVLNCTARTELNVGIDFNWEYPSSKHQHKKLVNRDLKTQSGSE
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CCDS43 TPCKMFAQRSLRRRQQQDLMPQCRDWRAVTTQDAVNPIESLDTWTEFVEGKNKTVSKLVI
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pF1KB5 QAANVSALYKCEAVNKVGRGERVISFHVTRGPE---ITLQPDMQPTEQESVSLWCTADRS
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CCDS43 QNANVSAMYKCVVSNKVGQDERLIYFYVTTIPDGFTIESKPSEELLEGQPVLLSCQADSY
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pF1KB5 TFENLTWYKLGPQPLPIHVGELPTPVCKNLDTLWKLNATMFSNSTNDI--------LIME
        .:.: ::.:. . :    :.     :::.    .: :: .. : ...        : . 
CCDS43 KYEHLRWYRLNLSTLHDAHGNPLLLDCKNV----HLFATPLAASLEEVAPGARHATLSLS
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       .  .. . .: ::: .:::... .::  . :.:    :: .: :: .  .....:.:..:
CCDS43 IPRVAPEHEGHYVCEVQDRRSHDKHCHKKYLSVQALEAPRLTQNLTDLLVNVSDSLEMQC
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        ..:   :.:.:.::.. : : ::. : :.:..:.:.:::.:: : : :..:.. ::.. 
CCDS43 LVAGAHAPSIVWYKDERLLEEKSGVDLADSNQKLSIQRVREEDAGRYLCSVCNAKGCVNS
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        :   .::...: ..::.:::::.:::.:::.::..:. ...:   ...:::::::.:::
CCDS43 SASVAVEGSEDKGSMEIVILVGTGVIAVFFWVLLLLIFCNMRRPAHADIKTGYLSIIMDP
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        :.::.:.:: : ::::.:::::.::.::. :: ::::.:.::.:::: : ..: :::::
CCDS43 GEVPLEEQCEYLSYDASQWEFPRERLHLGRVLGYGAFGKVVEASAFGIHKGSSCDTVAVK
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pF1KB5 MLKEGATHSEHRALMSELKILIHIGHHLNVVNLLGACTKPGGPLMVIVEFCKFGNLSTYL
       ::::::: :::::::::::::::::.:::::::::::::: :::::::::::.::::..:
CCDS43 MLKEGATASEHRALMSELKILIHIGNHLNVVNLLGACTKPQGPLMVIVEFCKYGNLSNFL
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CCDS43 RAKRDAFSPCAEKSPEQRGRFRAMVELARLDRRRPGSSDRVLFARFSKTEGGARRAS---
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pF1KB5 VEEEEAPEDLYKDFLTLEHLICYSFQVAKGMEFLASRKCIHRDLAARNILLSEKNVVKIC
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CCDS43 -PDQEA-EDLWLSPLTMEDLVCYSFQVARGMEFLASRKCIHRDLAARNILLSESDVVKIC
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       ::::::::::::::::::.:::::::::::.:::.::: :::::::::::::::::::::
CCDS43 DFGLARDIYKDPDYVRKGSARLPLKWMAPESIFDKVYTTQSDVWSFGVLLWEIFSLGASP
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pF1KB5 YPGVKIDEEFCRRLKEGTRMRAPDYTTPEMYQTMLDCWHGEPSQRPTFSELVEHLGNLLQ
       ::::.:.::::.::..:::::::. .:: . . ::.:: :.:. ::.:::::: ::.:::
CCDS43 YPGVQINEEFCQRLRDGTRMRAPELATPAIRRIMLNCWSGDPKARPAFSELVEILGDLLQ
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pF1KB5 ANAQQDGKDYIVLPISETLSMEEDSGLSLPTSPVSCMEEE-EVCDPKFH-------YDNT
       . . :. ..  . : : . : :: :  .. :  .   . . :   :...       : : 
CCDS43 GRGLQEEEEVCMAPRS-SQSSEEGSFSQVSTMALHIAQADAEDSPPSLQRHSLAARYYNW
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CCDS43 VSFPGCLARGAETRGSSRMKTFEEFPMT-PTTYKGSVDNQTDSGMVLASEEFEQIESRHR
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pF1KB5 LSPSFGGMVPSKSRESVASEGSNQTSGYQSGYHSDDTDTTVYSSEEAELLKLIEIGVQTG
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CCDS43 QESGFR                                                      
                                                                   

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CCDS93 MVSYWDTGVLLCALLSCLLLTGSSSG---SKLKDPELSLKGTQHIMQAGQTLHLQCRGEA
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CCDS93 AHKWSLPEMVSKESERLSITKSACGRNGKQFCSTLTLNTAQANHTGFYSCKYLAVPTSKK
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CCDS93 KETESAIYIFISDTGRPFVEMYSEIPEIIHMTEGRE--LVIPCRVTSPNITVTL-KKFPL
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CCDS93 DTLIPDGKRIIWDSRKGFIISNATYKEIGLLTCEATVNGHLYKT-NYLTHRQTNTIIDVQ
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CCDS93 ISTPRPVKLLRGHTLVLNCTATTPLNTRVQMTWSYPDEKNK-RASVRRRID-QSNSHANI
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pF1KB5 FLSTLTIDGITRSDQGLYTCAASSGLMTKKNSTFVRVHEKPFVAFGSGMESLVEATVGER
       : :.:::: .  .:.::::: . ::   :. .: :....: :..     ....:...:.:
CCDS93 FYSVLTIDKMQNKDKGLYTCRVRSGPSFKSVNTSVHIYDKAFITVKHRKQQVLETVAGKR
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pF1KB5 -VRIPAKYLGYPPPEIKWYKNGIPL--ESNHTIKAGHVLTIMEVSERDTGNYTVILTNPI
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CCDS93 SYRLSMKVKAFPSPEVVWLKDGLPATEKSARYLTRGYSLIIKDVTEEDAGNYTILLSIKQ
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CCDS93 SNVFKNLTATLIVNVKPQIYEKAVSSFPDPALYPLGSRQILTCTAYGIPQPT-IKWFWH-
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pF1KB5 EEECANEPSQAVSVTNPYPCEEWRSVEDFQGGNKIEVNKNQFALIEGKNKTVSTLVIQAA
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CCDS93 --PCNHNHSEARCDFCSNNEESFILDADSNMGNRIESITQRMAIIEGKNKMASTLVVADS
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CCDS93 RISGIYICIASNKVGTVGRNISFYITDVPNGFHVNLEKMPTEGEDLKLSCTVNKFLYRDV
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CCDS93 TWILLRT----VNNRTMHYSISKQ-----KMAITKEHSITLNLTIM---NVSLQDSGTYA
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CCDS93 CRARNVYTGEEILQKKEITIRDQEAPYLLRNLSDHTVAISSSTTLDCHANGVPEPQITWF
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CCDS93 KNNHKIQQEPGIILGPGSSTLFIERVTEEDEGVYHCKATNQKGSVESSAYLTVQGTSDKS
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CCDS93 NLELITLTCTCVAATLFWLLLTLFIRKMKRSSS-EIKTDYLSIIMDPDEVPLDEQCERLP
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CCDS93 YDASKWEFARERLKLGKSLGRGAFGKVVQASAFGIKKSPTCRTVAVKMLKEGATASEYKA
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pF1KB5 LMSELKILIHIGHHLNVVNLLGACTKPGGPLMVIVEFCKFGNLSTYLRSKRNEFVPYKTK
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CCDS93 LMTELKILTHIGHHLNVVNLLGACTKQGGPLMVIVEYCKYGNLSNYLKSKRDLFFLNKDA
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pF1KB5 GARFRQGKDYV-GAIPVDLKRRLDSITSSQSSASSGFVEEKSLSDVEEEEAPEDLYKDFL
       . ...  :. .  ..    : ::::.:::.: ::::: :.::::::::::  . .::. .
CCDS93 ALHMEPKKEKMEPGLEQGKKPRLDSVTSSESFASSGFQEDKSLSDVEEEEDSDGFYKEPI
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pF1KB5 TLEHLICYSFQVAKGMEFLASRKCIHRDLAARNILLSEKNVVKICDFGLARDIYKDPDYV
       :.: :: ::::::.:::::.::::::::::::::::::.::::::::::::::::.::::
CCDS93 TMEDLISYSFQVARGMEFLSSRKCIHRDLAARNILLSENNVVKICDFGLARDIYKNPDYV
         1000      1010      1020      1030      1040      1050    

             1070      1080      1090      1100      1110      1120
pF1KB5 RKGDARLPLKWMAPETIFDRVYTIQSDVWSFGVLLWEIFSLGASPYPGVKIDEEFCRRLK
       ::::.::::::::::.:::..:. .:::::.:::::::::::.::::::..::.:: ::.
CCDS93 RKGDTRLPLKWMAPESIFDKIYSTKSDVWSYGVLLWEIFSLGGSPYPGVQMDEDFCSRLR
         1060      1070      1080      1090      1100      1110    

             1130      1140      1150      1160      1170      1180
pF1KB5 EGTRMRAPDYTTPEMYQTMLDCWHGEPSQRPTFSELVEHLGNLLQANAQQDGKDYIVLPI
       :: :::::.:.:::.:: :::::: .:..:: :.::::.::.:::::.::::::::  ::
CCDS93 EGMRMRAPEYSTPEIYQIMLDCWHRDPKERPRFAELVEKLGDLLQANVQQDGKDYI--PI
         1120      1130      1140      1150      1160      1170    

             1190      1200       1210      1220      1230         
pF1KB5 SETLSMEEDSGLSLPTSPVSC-MEEEEVCDPKFHYDNTAGISQYLQNSKRKSRPVSVKTF
       .  :.   .::..  :   :  . .: .  :::.  ..  . .:..  :  :    .:::
CCDS93 NAILTG--NSGFTYSTPAFSEDFFKESISAPKFNSGSSDDV-RYVNAFKFMSLE-RIKTF
             1180      1190      1200      1210       1220         

    1240      1250      1260      1270         1280      1290      
pF1KB5 EDIPLEEPEVKVIPDDNQTDSGMVLASEELKTL---EDRTKLSPSFGGMVPSKSRESVAS
       :..    :..  . :: : ::. .:::  :: .   ... : : ..   : :::.::  :
CCDS93 EEL---LPNATSMFDDYQGDSSTLLASPMLKRFTWTDSKPKASLKIDLRVTSKSKESGLS
     1230         1240      1250      1260      1270      1280     

       1300      1310      1320      1330      1340      1350      
pF1KB5 EGSNQTSGYQSGYHSDDTDTTVYSSEEAELLKLIEIGVQTGSTAQILQPDSGTTLSSPPV
       . :  .  ..:  : ..     .. ..::: . :                          
CCDS93 DVSRPSFCHSSCGHVSEGKRR-FTYDHAELERKIACCSPPPDYNSVVLYSTPPI      
        1290      1300       1310      1320      1330              

>>CCDS4302.1 CSF1R gene_id:1436|Hs108|chr5                (972 aa)
 initn: 1102 init1: 650 opt: 1184  Z-score: 484.9  bits: 101.6 E(32554): 1.1e-20
Smith-Waterman score: 1226; 35.1% identity (60.0% similar) in 733 aa overlap (528-1216:276-968)

       500       510       520       530       540       550       
pF1KB5 EVNKNQFALIEGKNKTVSTLVIQAANVSALYKCEAVNKVGRGERVISFHVTRGPEITLQP
                                     :.: : :  :.    . :.:...  ..:. 
CCDS43 IPQQSDFHNNRYQKVLTLNLDQVDFQHAGNYSCVASNVQGKHSTSMFFRVVESAYLNLSS
         250       260       270       280       290       300     

       560           570        580       590       600       610  
pF1KB5 DMQPTEQ----ESVSLWCTAD-RSTFENLTWYKLGPQPLPIHVGELPTPVCKNLDTLWKL
       ...  ..    :...:   ..    .....:  :::  .  :    : :         ::
CCDS43 EQNLIQEVTVGEGLNLKVMVEAYPGLQGFNWTYLGP--FSDH---QPEP---------KL
         310       320       330       340                     350 

            620       630       640       650       660       670  
pF1KB5 NATMFSNSTNDILIMELKNASLQDQGDYVCLAQDRKTKKRHCVVRQLTVLERVAPTITGN
         .  ...    . . :   . .. : :  ::  :.    . .. .::.  :  : ..  
CCDS43 ANATTKDTYRHTFTLSLPRLKPSEAGRYSFLA--RNPGGWRALTFELTL--RYPPEVSVI
             360       370       380         390         400       

            680       690       700        710                     
pF1KB5 LENQTTSIGESIEVSCTASGNPPPQIMWFK-DNETLVEDSGIVLK------------DGN
            : :. :  . :.::: : :.. :.. ...:   : . ::.            .  
CCDS43 W----TFINGSGTLLCAASGYPQPNVTWLQCSGHTDRCDEAQVLQVWDDPYPEVLSQEPF
           410       420       430       440       450       460   

     720           730       740       750       760          770  
pF1KB5 RNLTIRRVRK----EDEGLYTCQACSVLGCAKVEAFFIIEGAQEKTNLEII---ILVGTA
       ...:.. .      : .  : :.: . .: ..   . :  ::. .   :..   ..:.  
CCDS43 HKVTVQSLLTVETLEHNQTYECRAHNSVGSGSWAFIPISAGAHTHPPDEFLFTPVVVACM
           470       480       490       500       510       520   

            780       790              800       810       820     
pF1KB5 VIAMFFWLLLVIILRTVKRANGGELK-------TGYLSIVMDPDELPLDEHCERLPYDAS
        :  .. :::...:   :.    ...        :     .:: .:: .:          
CCDS43 SIMALLLLLLLLLLYKYKQKPKYQVRWKIIESYEGNSYTFIDPTQLPYNE----------
           530       540       550       560       570             

         830       840       850       860       870       880     
pF1KB5 KWEFPRDRLKLGKPLGRGAFGQVIEADAFGIDKTATCRTVAVKMLKEGATHSEHRALMSE
       ::::::. :..:: :: ::::.:.:: :::. :  .   :::::::  :  .:..:::::
CCDS43 KWEFPRNNLQFGKTLGAGAFGKVVEATAFGLGKEDAVLKVAVKMLKSTAHADEKEALMSE
           580       590       600       610       620       630   

         890       900       910       920       930        940    
pF1KB5 LKILIHIGHHLNVVNLLGACTKPGGPLMVIVEFCKFGNLSTYLRSKRNEFV-PYKTKGAR
       :::. :.:.: :.::::::::. :::..::.:.: .:.: ..:: : . .. :  . :  
CCDS43 LKIMSHLGQHENIVNLLGACTH-GGPVLVITEYCCYGDLLNFLRRKAEAMLGPSLSPGQD
           640       650        660       670       680       690  

          950       960        970       980       990             
pF1KB5 FRQGKDYVGAIPVDLKR-RLDSITSSQSSASSGFVEEKSLSDVEEEEAPE-DLYKD---F
        . : ::   : .. :  : ::  :::.  .  .:: . .:   ..   : :: :.    
CCDS43 PEGGVDY-KNIHLEKKYVRRDSGFSSQGVDT--YVEMRPVSTSSNDSFSEQDLDKEDGRP
             700       710       720         730       740         

    1000      1010      1020      1030      1040      1050         
pF1KB5 LTLEHLICYSFQVAKGMEFLASRKCIHRDLAARNILLSEKNVVKICDFGLARDIYKDPDY
       : :. :. .: :::.:: ::::..:::::.::::.::.. .:.:: ::::::::..: .:
CCDS43 LELRDLLHFSSQVAQGMAFLASKNCIHRDVAARNVLLTNGHVAKIGDFGLARDIMNDSNY
     750       760       770       780       790       800         

    1060      1070      1080      1090      1100      1110         
pF1KB5 VRKGDARLPLKWMAPETIFDRVYTIQSDVWSFGVLLWEIFSLGASPYPGVKIDEEFCRRL
       . ::.::::.::::::.::: :::.::::::.:.::::::::: .::::. .. .: . .
CCDS43 IVKGNARLPVKWMAPESIFDCVYTVQSDVWSYGILLWEIFSLGLNPYPGILVNSKFYKLV
     810       820       830       840       850       860         

    1120      1130      1140      1150      1160      1170         
pF1KB5 KEGTRMRAPDYTTPEMYQTMLDCWHGEPSQRPTFSELVEHLGNLLQANAQQDGK--DYIV
       :.: .:  : ..  ..:. :  ::  ::..::::...     ..:: .::.: .  ::  
CCDS43 KDGYQMAQPAFAPKNIYSIMQACWALEPTHRPTFQQIC----SFLQEQAQEDRRERDYTN
     870       880       890       900           910       920     

      1180        1190        1200      1210      1220      1230   
pF1KB5 LPISETL--SMEEDSGLSLPTSP--VSCMEEEEVCDPKFHYDNTAGISQYLQNSKRKSRP
       :: :     :   .: :   .:   ..: :. .. .: .. .:                 
CCDS43 LPSSSRSGGSGSSSSELEEESSSEHLTCCEQGDIAQPLLQPNNYQFC             
         930       940       950       960       970               

          1240      1250      1260      1270      1280      1290   
pF1KB5 VSVKTFEDIPLEEPEVKVIPDDNQTDSGMVLASEELKTLEDRTKLSPSFGGMVPSKSRES

>>CCDS31953.1 FLT3 gene_id:2322|Hs108|chr13               (993 aa)
 initn: 1128 init1: 704 opt: 1137  Z-score: 466.7  bits: 98.3 E(32554): 1.1e-19
Smith-Waterman score: 1156; 38.8% identity (64.7% similar) in 552 aa overlap (685-1199:449-990)

          660       670       680       690       700              
pF1KB5 VVRQLTVLERVAPTITGNLENQTTSIGESIEVSCTASGNPPPQIMWFK-----DNETLVE
                                     ..:: ..: : :.  : :      : :   
CCDS31 HAENDDAQFTKMFTLNIRRKPQVLAEASASQASCFSDGYPLPSWTWKKCSDKSPNCTEEI
      420       430       440       450       460       470        

     710       720       730               740       750           
pF1KB5 DSGIVLKDGNRNLTIRRVRKED-------EG-LYTCQACSVLGCAKVEAFFIIEGAQE--
         :.  . .::..  . : .         .: :  : : . :: .    ..   :     
CCDS31 TEGVWNRKANRKVFGQWVSSSTLNMSEAIKGFLVKCCAYNSLGTSCETILLNSPGPFPFI
      480       490       500       510       520       530        

     760       770       780       790       800       810         
pF1KB5 KTNLEIIILVGTAVIAMFFWLLLVIILRTVKRANGGELKTGYLSIVMDPDELPLDEHCER
       . :. .   .:  :  .:. .: ..: .  :.    : .  ..... . :.  .    ..
CCDS31 QDNISFYATIG--VCLLFIVVLTLLICHKYKKQFRYESQLQMVQVTGSSDNEYFYVDFRE
      540         550       560       570       580       590      

     820       830       840       850       860       870         
pF1KB5 LPYDASKWEFPRDRLKLGKPLGRGAFGQVIEADAFGIDKTATCRTVAVKMLKEGATHSEH
         ::  ::::::. :..:: :: ::::.:..: :.::.::..   :::::::: :  ::.
CCDS31 YEYDL-KWEFPRENLEFGKVLGSGAFGKVMNATAYGISKTGVSIQVAVKMLKEKADSSER
        600        610       620       630       640       650     

     880       890       900       910       920       930         
pF1KB5 RALMSELKILIHIGHHLNVVNLLGACTKPGGPLMVIVEFCKFGNLSTYLRSKRNEF----
       .:::::::.. ..: : :.::::::::  .::...: :.: .:.: .::::::..:    
CCDS31 EALMSELKMMTQLGSHENIVNLLGACTL-SGPIYLIFEYCCYGDLLNYLRSKREKFHRTW
         660       670       680        690       700       710    

          940             950       960       970         980      
pF1KB5 -VPYKTKGARF------RQGKDYVGAIPVDLKRRLDSITSSQSSA--SSGFVEEKSLSDV
          .: ..  :      . .... :.  :...   :.:.. ....  :   .: .. . .
CCDS31 TEIFKEHNFSFYPTFQSHPNSSMPGSREVQIHPDSDQISGLHGNSFHSEDEIEYENQKRL
          720       730       740       750       760       770    

        990      1000      1010      1020      1030      1040      
pF1KB5 EEEEAPEDLYKDFLTLEHLICYSFQVAKGMEFLASRKCIHRDLAARNILLSEKNVVKICD
       ::::   ::  . ::.: :.:...:::::::::  ..:.::::::::.:... .::::::
CCDS31 EEEE---DL--NVLTFEDLLCFAYQVAKGMEFLEFKSCVHRDLAARNVLVTHGKVVKICD
             780         790       800       810       820         

       1050      1060      1070      1080      1090      1100      
pF1KB5 FGLARDIYKDPDYVRKGDARLPLKWMAPETIFDRVYTIQSDVWSFGVLLWEIFSLGASPY
       :::::::..: .:: .:.::::.::::::..:. .:::.:::::.:.:::::::::..::
CCDS31 FGLARDIMSDSNYVVRGNARLPVKWMAPESLFEGIYTIKSDVWSYGILLWEIFSLGVNPY
     830       840       850       860       870       880         

       1110      1120      1130      1140      1150      1160      
pF1KB5 PGVKIDEEFCRRLKEGTRMRAPDYTTPEMYQTMLDCWHGEPSQRPTFSELVEHLGNLLQA
       ::. .: .: . ...: .:  : :.: :.:  : .::  .  .::.: .:.  ::  : :
CCDS31 PGIPVDANFYKLIQNGFKMDQPFYATEEIYIIMQSCWAFDSRKRPSFPNLTSFLGCQL-A
     890       900       910       920       930       940         

       1170      1180               1190      1200      1210       
pF1KB5 NAQQDGKDYIVLPISET---------LSMEEDSGLSLPTSPVSCMEEEEVCDPKFHYDNT
       .:..   . .   .::          .: : : ::  : . :                  
CCDS31 DAEEAMYQNVDGRVSECPHTYQNRRPFSREMDLGLLSPQAQVEDS               
      950       960       970       980       990                  

      1220      1230      1240      1250      1260      1270       
pF1KB5 AGISQYLQNSKRKSRPVSVKTFEDIPLEEPEVKVIPDDNQTDSGMVLASEELKTLEDRTK

>>CCDS73556.1 FLT1 gene_id:2321|Hs108|chr13               (687 aa)
 initn: 690 init1: 168 opt: 1119  Z-score: 462.1  bits: 96.9 E(32554): 2e-19
Smith-Waterman score: 1150; 32.6% identity (60.5% similar) in 709 aa overlap (6-693:9-684)

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        .  :.::....:   ::.   :.   ....::...  .::::  .  :..:.:  ..: 
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       : :.:::: .  .:.::::: . ::   :. .: :....: :..     ....:...:.:
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       :.  .. ...:.: : ::: ::.. :  :   :  :. : ::::.:.:: :  :.:.:. 
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CCDS73 --PCNHNHSEARCDFCSNNEESFILDADSNMGNRIESITQRMAIIEGKNKMASTLVVADS
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        .:..: : : ::::   : :::..:  :. . .. . .::: :...: ::...  ....
CCDS73 RISGIYICIASNKVGTVGRNISFYITDVPNGFHVNLEKMPTEGEDLKLSCTVNKFLYRDV
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       ::  :      ..   .   . :.     :.  :   . : .. ::   :.::::.: :.
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       : :..  : ..        .:..   :: :.  :. . ..     .: . .::...:   
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CCDS53 --PCNHNHSEARCDFCSNNEESFILDADSNMGNRIESITQRMAIIEGKNKLPPANSSFML
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CCDS53 PPTSFSSNYFHFLP                                              
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>>CCDS55221.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8               (812 aa)
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CCDS55 GKEFKPDHRIGGYKVRYATWSIIMDSVVPSDKGNYTCIVENEYGSINH--TYQLDVVERS
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          : . ..:  :.:...: ..:  : . ..: :.:.:.:           ::   :.  
CCDS55 PHRPILQAGLPANKTVALGSNVEFMCKVYSDPQPHIQWLKHIEVNGSKIGPDNLPYVQIL
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pF1KB5 -DSGIVLKDGNRN-LTIRRVRKEDEGLYTCQACSVLGCAKVEAFF-IIEGAQEKTN----
         .:.   : . . : .: :  :: : ::: : . .: ..  :.. ..:. .:.      
CCDS55 KTAGVNTTDKEMEVLHLRNVSFEDAGEYTCLAGNSIGLSHHSAWLTVLEALEERPAVMTS
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pF1KB5 ---LEIII----------LVGTAVIAMF--------FWLLLVI--------ILRTVKRAN
          :::::          .::....  .        :   ...        . : :.  .
CCDS55 PLYLEIIIYCTGAFLISCMVGSVIVYKMKSGTKKSDFHSQMAVHKLAKSIPLRRQVSADS
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pF1KB5 GGELKTGYLSIVMDPDEL-----PLDEHCER--LPYDASKWEFPRDRLKLGKPLGRGAFG
       .. ...: :  .. :..:     :.     .  :: :  .::.::::: ::::::.: ::
CCDS55 SASMNSGVL--LVRPSRLSSSGTPMLAGVSEYELPEDP-RWELPRDRLVLGKPLGEGCFG
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pF1KB5 QVIEADAFGIDKTATCRT--VAVKMLKEGATHSEHRALMSELKILIHIGHHLNVVNLLGA
       ::. :.:.:.::    :.  :::::::  ::...   :.::....  ::.: :..:::::
CCDS55 QVVLAEAIGLDKDKPNRVTKVAVKMLKSDATEKDLSDLISEMEMMKMIGKHKNIINLLGA
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pF1KB5 CTKPGGPLMVIVEFCKFGNLSTYLRSKRNEFVPYKTKGARFRQGKDYVGAIPVDLKRRLD
       ::. : ::.::::. . :::  ::...:    :          : .:             
CCDS55 CTQDG-PLYVIVEYASKGNLREYLQARR----P---------PGLEYC------------
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pF1KB5 SITSSQSSASSGFVEEKSLSDVEEEEAPEDLYKDFLTLEHLICYSFQVAKGMEFLASRKC
         . :..        :..::.           ::...     : ..:::.:::.:::.::
CCDS55 -YNPSHNP-------EEQLSS-----------KDLVS-----C-AYQVARGMEYLASKKC
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       :::::::::.:..: ::.:: ::::::::..   : .  ..:::.::::::..:::.:: 
CCDS55 IHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARDIHHIDYYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRIYTH
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       :::::::::::::::.::.:::::: ..: : . :::: ::  :.  : :.:. : ::::
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       . :::::::..::: :  ..  ...:.  : . .:.           : : :  ::: .:
CCDS55 AVPSQRPTFKQLVEDLDRIVALTSNQEYLD-LSMPLDQYSPSFPDTRSSTCSSGEDSVFS
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         .:.   : . . : .: :  :: : ::: : . .: ..  :.. ..:. .:.      
CCDS55 KTAGVNTTDKEMEVLHLRNVSFEDAGEYTCLAGNSIGLSHHSAWLTVLEALEERPAVMTS
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          :::::          .::....  .        :   ...        . : :.  .
CCDS55 PLYLEIIIYCTGAFLISCMVGSVIVYKMKSGTKKSDFHSQMAVHKLAKSIPLRRQVSADS
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       .. ...: :  .. :..:     :.     .  :: :  .::.::::: ::::::.: ::
CCDS55 SASMNSGVL--LVRPSRLSSSGTPMLAGVSEYELPEDP-RWELPRDRLVLGKPLGEGCFG
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       ::. :.:.:.::    :.  :::::::  ::...   :.::....  ::.: :..:::::
CCDS55 QVVLAEAIGLDKDKPNRVTKVAVKMLKSDATEKDLSDLISEMEMMKMIGKHKNIINLLGA
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CCDS55 CTQDG-PLYVIVEYASKGNLREYLQARR----P---------PGLEYC------------
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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