FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB8114, 324 aa 1>>>pF1KB8114 324 - 324 aa - 324 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1794+/-0.00073; mu= 13.4604+/- 0.044 mean_var=105.8885+/-21.326, 0's: 0 Z-trim(112.8): 50 B-trim: 238 in 1/51 Lambda= 0.124638 statistics sampled from 13435 (13485) to 13435 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.767), E-opt: 0.2 (0.414), width: 16 Scan time: 2.750 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS2439.1 DNAJB2 gene_id:3300|Hs108|chr2 ( 324) 2163 398.9 2.9e-111 CCDS46519.1 DNAJB2 gene_id:3300|Hs108|chr2 ( 277) 1816 336.4 1.5e-92 CCDS47755.1 DNAJB6 gene_id:10049|Hs108|chr7 ( 241) 573 112.9 2.7e-25 CCDS5946.1 DNAJB6 gene_id:10049|Hs108|chr7 ( 326) 573 113.0 3.4e-25 CCDS3048.1 DNAJB8 gene_id:165721|Hs108|chr3 ( 232) 494 98.7 4.9e-21 CCDS14008.1 DNAJB7 gene_id:150353|Hs108|chr22 ( 309) 476 95.5 5.8e-20 CCDS12312.1 DNAJB1 gene_id:3337|Hs108|chr19 ( 340) 395 81.0 1.5e-15 CCDS684.1 DNAJB4 gene_id:11080|Hs108|chr1 ( 337) 376 77.6 1.6e-14 CCDS35007.1 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9 ( 348) 362 75.1 9.3e-14 CCDS47959.1 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9 ( 420) 362 75.1 1.1e-13 CCDS47960.2 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9 ( 462) 362 75.2 1.2e-13 CCDS8227.1 DNAJB13 gene_id:374407|Hs108|chr11 ( 316) 339 70.9 1.5e-12 >>CCDS2439.1 DNAJB2 gene_id:3300|Hs108|chr2 (324 aa) initn: 2163 init1: 2163 opt: 2163 Z-score: 2111.1 bits: 398.9 E(32554): 2.9e-111 Smith-Waterman score: 2163; 100.0% identity (100.0% similar) in 324 aa overlap (1-324:1-324) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MASYYEILDVPRSASADDIKKAYRRKALQWHPDKNPDNKEFAEKKFKEVAEAYEVLSDKH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS24 MASYYEILDVPRSASADDIKKAYRRKALQWHPDKNPDNKEFAEKKFKEVAEAYEVLSDKH 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 KREIYDRYGREGLTGTGTGPSRAEAGSGGPGFTFTFRSPEEVFREFFGSGDPFAELFDDL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS24 KREIYDRYGREGLTGTGTGPSRAEAGSGGPGFTFTFRSPEEVFREFFGSGDPFAELFDDL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB8 GPFSELQNRGSRHSGPFFTFSSSFPGHSDFSSSSFSFSPGAGAFRSVSTSTTFVQGRRIT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS24 GPFSELQNRGSRHSGPFFTFSSSFPGHSDFSSSSFSFSPGAGAFRSVSTSTTFVQGRRIT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB8 TRRIMENGQERVEVEEDGQLKSVTINGVPDDLALGLELSRREQQPSVTSRSGGTQVQQTP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS24 TRRIMENGQERVEVEEDGQLKSVTINGVPDDLALGLELSRREQQPSVTSRSGGTQVQQTP 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB8 ASCPLDSDLSEDEDLQLAMAYSLSEMEAAGKKPAGGREAQHRRQGRPKAQHQDPGLGGTQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS24 ASCPLDSDLSEDEDLQLAMAYSLSEMEAAGKKPAGGREAQHRRQGRPKAQHQDPGLGGTQ 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KB8 EGARGEATKRSPSPEEKASRCLIL :::::::::::::::::::::::: CCDS24 EGARGEATKRSPSPEEKASRCLIL 310 320 >>CCDS46519.1 DNAJB2 gene_id:3300|Hs108|chr2 (277 aa) initn: 1816 init1: 1816 opt: 1816 Z-score: 1774.8 bits: 336.4 E(32554): 1.5e-92 Smith-Waterman score: 1816; 100.0% identity (100.0% similar) in 274 aa overlap (1-274:1-274) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MASYYEILDVPRSASADDIKKAYRRKALQWHPDKNPDNKEFAEKKFKEVAEAYEVLSDKH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 MASYYEILDVPRSASADDIKKAYRRKALQWHPDKNPDNKEFAEKKFKEVAEAYEVLSDKH 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 KREIYDRYGREGLTGTGTGPSRAEAGSGGPGFTFTFRSPEEVFREFFGSGDPFAELFDDL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 KREIYDRYGREGLTGTGTGPSRAEAGSGGPGFTFTFRSPEEVFREFFGSGDPFAELFDDL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB8 GPFSELQNRGSRHSGPFFTFSSSFPGHSDFSSSSFSFSPGAGAFRSVSTSTTFVQGRRIT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 GPFSELQNRGSRHSGPFFTFSSSFPGHSDFSSSSFSFSPGAGAFRSVSTSTTFVQGRRIT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB8 TRRIMENGQERVEVEEDGQLKSVTINGVPDDLALGLELSRREQQPSVTSRSGGTQVQQTP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 TRRIMENGQERVEVEEDGQLKSVTINGVPDDLALGLELSRREQQPSVTSRSGGTQVQQTP 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB8 ASCPLDSDLSEDEDLQLAMAYSLSEMEAAGKKPAGGREAQHRRQGRPKAQHQDPGLGGTQ :::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 ASCPLDSDLSEDEDLQLAMAYSLSEMEAAGKKPADVF 250 260 270 310 320 pF1KB8 EGARGEATKRSPSPEEKASRCLIL >>CCDS47755.1 DNAJB6 gene_id:10049|Hs108|chr7 (241 aa) initn: 666 init1: 392 opt: 573 Z-score: 567.7 bits: 112.9 E(32554): 2.7e-25 Smith-Waterman score: 760; 55.9% identity (73.9% similar) in 238 aa overlap (1-207:1-231) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MASYYEILDVPRSASADDIKKAYRRKALQWHPDKNPDNKEFAEKKFKEVAEAYEVLSDKH :..:::.: : : :: .:::::::. ::.:::::::.::: ::.:::.:::::::::: . 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CCDS14 SSLAFDNSGMDNYISVTTSDKIVNGRNINTKKIIESDQER-EAEDNGELTFFLVNSVANE 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KB8 LALGLELSRREQQPSVTSRSGGTQVQQTPASCPLDSDLSEDEDLQLAMAYSLSEMEAAGK ... : : : :. . : .. .. ... .:.: . .. . . . .:: CCDS14 EGFAKECSWRTQSFNNYSPNSHSS-KHVSQYTFVDND---EGGISWVTSNRDPPIFSAGV 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 pF1KB8 KPAGGREAQHRRQGRPKAQHQDPGLGGTQEGARGEATKRSPSPEEKASRCLIL : .: :. ..:.. . :. ... CCDS14 KEGGKRKKKKRKEVQKKSTKRNC 290 300 >>CCDS12312.1 DNAJB1 gene_id:3337|Hs108|chr19 (340 aa) initn: 382 init1: 236 opt: 395 Z-score: 392.6 bits: 81.0 E(32554): 1.5e-15 Smith-Waterman score: 404; 38.7% identity (68.6% similar) in 194 aa overlap (4-194:5-185) 10 20 30 40 50 pF1KB8 MASYYEILDVPRSASADDIKKAYRRKALQWHPDKNPDNKEFAEKKFKEVAEAYEVLSDK ::. : . :.:: ..::.::::.::..::::: . ::.::::.::::.:::: CCDS12 MGKDYYQTLGLARGASDEEIKRAYRRQALRYHPDKNKEPG--AEEKFKEIAEAYDVLSDP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB8 HKREIYDRYGREGLTGTGTGPSRAEAG-SGGPGFTFTFRS-PEEVFREFFGSGDPFAELF .::::.::::.::: :.: :: . .: ..: .:..::.. :. .: ::::. .:: .: CCDS12 RKREIFDRYGEEGLKGSG--PSGGSGGGANGTSFSYTFHGDPHAMFAEFFGGRNPFDTFF 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 DDLGPFSELQNRGSRHSGPFFTFSSSFP-GHSDFSSSSFSFSPGAGAFRSVSTSTTFVQG . . ..: . :: :.:: : . :.. .:. : .: . . .. CCDS12 GQRNG-----EEGMDIDDPF----SGFPMGMGGFTNVNFGRSRSAQEPARKKQDPPVTHD 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 RRITTRRIMENGQERVEVEEDGQLKSVTINGVPDDLALGLELSRREQQPSVTSRSGGTQV :.. ..:. . ..... CCDS12 LRVSLEEIYSGCTKKMKISHKRLNPDGKSIRNEDKILTIEVKKGWKEGTKITFPKEGDQT 170 180 190 200 210 220 >>CCDS684.1 DNAJB4 gene_id:11080|Hs108|chr1 (337 aa) initn: 354 init1: 178 opt: 376 Z-score: 374.2 bits: 77.6 E(32554): 1.6e-14 Smith-Waterman score: 385; 34.6% identity (62.6% similar) in 246 aa overlap (4-246:5-230) 10 20 30 40 50 pF1KB8 MASYYEILDVPRSASADDIKKAYRRKALQWHPDKNPDNKEFAEKKFKEVAEAYEVLSDK :: :: . ..:: .:::::::..::..::::: . . ::.:::::::::::::: CCDS68 MGKDYYCILGIEKGASDEDIKKAYRKQALKFHPDKNKSPQ--AEEKFKEVAEAYEVLSDP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB8 HKREIYDRYGREGLTGTGTGPSRAEAGSGGPGFTFTFRS-PEEVFREFFGSGDPFAELFD .::::::..:.::: : :.: . :.:: : .::.. :. .: :::...:: .: CCDS68 KKREIYDQFGEEGLKG-GAGGTD---GQGGT-FRYTFHGDPHATFAAFFGGSNPFEIFFG 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 DLGPFSELQNRGSRHSGPFFTFSSSFPGHSDFSSSSFSFSPGAGAFRSVSTSTTFVQGRR .. ... . :: .:. :. : . . : .:. .. . .. : CCDS68 RRMGGGRDSEEMEIDGDPFSAFGFSMNG---YPRDRNSVGPS-----RLKQDPPVIHELR 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 ITTRRIMENGQERVEVEEDGQLKSVTINGVPDDLALGLELSR--REQQPSVTSRSGGTQV .. ..:. . .:... . .:.. . .: : .:... .: . : : CCDS68 VSLEEIYSGCTKRMKISRK-RLNADGRSYRSEDKILTIEIKKGWKEGTKITFPREG---- 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 QQTPASCPLDSDLSEDEDLQLAMAYSLSEMEAAGKKPAGGREAQHRRQGRPKAQHQDPGL ..:: : : : CCDS68 DETPNSIPADIVFIIKDKDHPKFKRDGSNIIYTAKISLREALCGCSINVPTLDGRNIPMS 230 240 250 260 270 280 >>CCDS35007.1 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9 (348 aa) initn: 340 init1: 157 opt: 362 Z-score: 360.4 bits: 75.1 E(32554): 9.3e-14 Smith-Waterman score: 362; 51.2% identity (75.2% similar) in 125 aa overlap (4-124:5-122) 10 20 30 40 50 pF1KB8 MASYYEILDVPRSASADDIKKAYRRKALQWHPDKNPDNKEFAEKKFKEVAEAYEVLSDK ::.:: .: .:. :.::::::. ::..::::: . . ::.::::.::::.:::: CCDS35 MGKDYYKILGIPSGANEDEIKKAYRKMALKYHPDKNKEPN--AEEKFKEIAEAYDVLSDP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB8 HKREIYDRYGREGLTGTGTGPSRAEAGSGGPGFTFTFRS-PEEVFREFFGSGDPFAELFD .:: .::.::.::: :: : : .::.: .: .::.. :. .: :::...:: .: CCDS35 KKRGLYDQYGEEGLK-TGGGTS---GGSSG-SFHYTFHGDPHATFASFFGGSNPFDIFFA 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 D---LGPFSELQNRGSRHSGPFFTFSSSFPGHSDFSSSSFSFSPGAGAFRSVSTSTTFVQ . ::: CCDS35 SSRSTRPFSGFDPDDMDVDEDEDPFGAFGRFGFNGLSRGPRRAPEPLYPRRKVQDPPVVH 120 130 140 150 160 170 >>CCDS47959.1 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9 (420 aa) initn: 340 init1: 157 opt: 362 Z-score: 359.3 bits: 75.1 E(32554): 1.1e-13 Smith-Waterman score: 362; 51.2% identity (75.2% similar) in 125 aa overlap (4-124:77-194) 10 20 30 pF1KB8 MASYYEILDVPRSASADDIKKAYRRKALQWHPD ::.:: .: .:. :.::::::. ::..::: CCDS47 LKLRAWTLNGFVKFRNKETSAGPVAVMGKDYYKILGIPSGANEDEIKKAYRKMALKYHPD 50 60 70 80 90 100 40 50 60 70 80 90 pF1KB8 KNPDNKEFAEKKFKEVAEAYEVLSDKHKREIYDRYGREGLTGTGTGPSRAEAGSGGPGFT :: . . ::.::::.::::.:::: .:: .::.::.::: :: : : .::.: .: CCDS47 KNKEPN--AEEKFKEIAEAYDVLSDPKKRGLYDQYGEEGLK-TGGGTS---GGSSG-SFH 110 120 130 140 150 100 110 120 130 140 pF1KB8 FTFRS-PEEVFREFFGSGDPFAELFDD---LGPFSELQNRGSRHSGPFFTFSSSFPGHSD .::.. :. .: :::...:: .: . ::: CCDS47 YTFHGDPHATFASFFGGSNPFDIFFASSRSTRPFSGFDPDDMDVDEDEDPFGAFGRFGFN 160 170 180 190 200 210 150 160 170 180 190 200 pF1KB8 FSSSSFSFSPGAGAFRSVSTSTTFVQGRRITTRRIMENGQERVEVEEDGQLKSVTINGVP CCDS47 GLSRGPRRAPEPLYPRRKVQDPPVVHELRVSLEEIYHGSTKRMKITRRRLNPDGRTVRTE 220 230 240 250 260 270 324 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 18:01:01 2016 done: Sun Nov 6 18:01:02 2016 Total Scan time: 2.750 Total Display time: 0.020 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]