Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1696
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1696, 206 aa
1>>>pF1KE1696 206 - 206 aa - 206 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7584+/-0.00102; mu= 11.5818+/- 0.062
mean_var=88.8375+/-17.428, 0's: 0 Z-trim(106.7): 202 B-trim: 215 in 1/49
Lambda= 0.136074
statistics sampled from 8907 (9127) to 8907 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.649), E-opt: 0.2 (0.28), width: 16
Scan time: 2.100
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2131.1 RALB gene_id:5899|Hs108|chr2 ( 206) 1312 267.3 4.7e-72
CCDS5460.1 RALA gene_id:5898|Hs108|chr7 ( 206) 1098 225.3 2.1e-59
CCDS8702.1 KRAS gene_id:3845|Hs108|chr12 ( 188) 631 133.6 7.7e-32
CCDS7814.1 RRAS2 gene_id:22800|Hs108|chr11 ( 204) 593 126.2 1.4e-29
CCDS877.1 NRAS gene_id:4893|Hs108|chr1 ( 189) 589 125.3 2.3e-29
CCDS7698.1 HRAS gene_id:3265|Hs108|chr11 ( 189) 589 125.3 2.3e-29
CCDS8703.1 KRAS gene_id:3845|Hs108|chr12 ( 189) 588 125.1 2.7e-29
CCDS12774.1 RRAS gene_id:6237|Hs108|chr19 ( 218) 562 120.1 1e-27
CCDS840.1 RAP1A gene_id:5906|Hs108|chr1 ( 184) 561 119.8 1e-27
CCDS8984.1 RAP1B gene_id:5908|Hs108|chr12 ( 184) 556 118.9 2e-27
CCDS14632.1 RAP2C gene_id:57826|Hs108|chrX ( 183) 549 117.5 5.3e-27
CCDS9485.1 RAP2A gene_id:5911|Hs108|chr13 ( 183) 537 115.1 2.7e-26
CCDS7699.1 HRAS gene_id:3265|Hs108|chr11 ( 170) 533 114.3 4.4e-26
CCDS1123.1 RIT1 gene_id:6016|Hs108|chr1 ( 219) 534 114.6 4.7e-26
CCDS58037.1 RIT1 gene_id:6016|Hs108|chr1 ( 236) 534 114.6 5e-26
CCDS3100.1 MRAS gene_id:22808|Hs108|chr3 ( 208) 526 113.0 1.3e-25
CCDS11921.1 RIT2 gene_id:6014|Hs108|chr18 ( 217) 526 113.0 1.4e-25
CCDS3170.1 RAP2B gene_id:5912|Hs108|chr3 ( 183) 524 112.6 1.6e-25
CCDS53603.1 RRAS2 gene_id:22800|Hs108|chr11 ( 169) 489 105.7 1.7e-23
CCDS58036.1 RIT1 gene_id:6016|Hs108|chr1 ( 183) 459 99.8 1.1e-21
CCDS8673.1 RERG gene_id:85004|Hs108|chr12 ( 199) 429 94.0 7e-20
CCDS62431.1 RIT2 gene_id:6014|Hs108|chr18 ( 153) 419 91.9 2.2e-19
CCDS12092.1 DIRAS1 gene_id:148252|Hs108|chr19 ( 198) 418 91.8 3.1e-19
CCDS6687.1 DIRAS2 gene_id:54769|Hs108|chr9 ( 199) 407 89.6 1.4e-18
CCDS10183.1 RAB8B gene_id:51762|Hs108|chr15 ( 207) 389 86.1 1.7e-17
CCDS46306.1 RAB1A gene_id:5861|Hs108|chr2 ( 205) 381 84.5 4.9e-17
CCDS31613.1 RAB1B gene_id:81876|Hs108|chr11 ( 201) 380 84.3 5.5e-17
CCDS35246.1 ERAS gene_id:3266|Hs108|chrX ( 233) 376 83.6 1.1e-16
CCDS12339.1 RAB8A gene_id:4218|Hs108|chr19 ( 207) 371 82.6 1.9e-16
CCDS10212.1 RAB11A gene_id:8766|Hs108|chr15 ( 216) 371 82.6 2e-16
CCDS6261.1 GEM gene_id:2669|Hs108|chr8 ( 296) 371 82.7 2.5e-16
CCDS6175.1 RAB2A gene_id:5862|Hs108|chr8 ( 212) 368 82.0 2.9e-16
CCDS1058.1 RAB13 gene_id:5872|Hs108|chr1 ( 203) 365 81.4 4.3e-16
CCDS9570.1 RAB2B gene_id:84932|Hs108|chr14 ( 216) 364 81.2 5.2e-16
CCDS1720.1 RAB10 gene_id:10890|Hs108|chr2 ( 200) 363 81.0 5.6e-16
CCDS41846.1 RAB35 gene_id:11021|Hs108|chr12 ( 201) 363 81.0 5.6e-16
CCDS12201.1 RAB11B gene_id:9230|Hs108|chr19 ( 218) 360 80.4 8.9e-16
CCDS5927.1 RHEB gene_id:6009|Hs108|chr7 ( 184) 358 80.0 1e-15
CCDS12257.1 RAB3D gene_id:9545|Hs108|chr19 ( 219) 357 79.8 1.4e-15
CCDS9003.1 RAB21 gene_id:23011|Hs108|chr12 ( 225) 357 79.9 1.4e-15
CCDS41413.1 RAB25 gene_id:57111|Hs108|chr1 ( 213) 354 79.2 2e-15
CCDS11703.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17 ( 216) 354 79.3 2e-15
CCDS8778.1 RHEBL1 gene_id:121268|Hs108|chr12 ( 183) 347 77.8 4.6e-15
CCDS14766.1 RAB39B gene_id:116442|Hs108|chrX ( 213) 347 77.9 5.2e-15
CCDS58253.1 RAP1B gene_id:5908|Hs108|chr12 ( 165) 345 77.4 5.5e-15
CCDS10824.1 RRAD gene_id:6236|Hs108|chr16 ( 308) 348 78.2 6e-15
CCDS560.1 RAB3B gene_id:5865|Hs108|chr1 ( 219) 346 77.7 6e-15
CCDS12372.1 RAB3A gene_id:5864|Hs108|chr19 ( 220) 346 77.7 6.1e-15
CCDS45826.1 RAB31 gene_id:11031|Hs108|chr18 ( 195) 345 77.5 6.3e-15
CCDS73011.1 RAB7B gene_id:338382|Hs108|chr1 ( 199) 345 77.5 6.4e-15
>>CCDS2131.1 RALB gene_id:5899|Hs108|chr2 (206 aa)
initn: 1312 init1: 1312 opt: 1312 Z-score: 1407.1 bits: 267.3 E(32554): 4.7e-72
Smith-Waterman score: 1312; 100.0% identity (100.0% similar) in 206 aa overlap (1-206:1-206)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAANKSKGQSSLALHKVIMVGSGGVGKSALTLQFMYDEFVEDYEPTKADSYRKKVVLDGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 MAANKSKGQSSLALHKVIMVGSGGVGKSALTLQFMYDEFVEDYEPTKADSYRKKVVLDGE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 EVQIDILDTAGQEDYAAIRDNYFRSGEGFLLVFSITEHESFTATAEFREQILRVKAEEDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 EVQIDILDTAGQEDYAAIRDNYFRSGEGFLLVFSITEHESFTATAEFREQILRVKAEEDK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 IPLLVVGNKSDLEERRQVPVEEARSKAEEWGVQYVETSAKTRANVDKVFFDLMREIRTKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 IPLLVVGNKSDLEERRQVPVEEARSKAEEWGVQYVETSAKTRANVDKVFFDLMREIRTKK
130 140 150 160 170 180
190 200
pF1KE1 MSENKDKNGKKSSKNKKSFKERCCLL
::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 MSENKDKNGKKSSKNKKSFKERCCLL
190 200
>>CCDS5460.1 RALA gene_id:5898|Hs108|chr7 (206 aa)
initn: 1038 init1: 703 opt: 1098 Z-score: 1180.0 bits: 225.3 E(32554): 2.1e-59
Smith-Waterman score: 1098; 82.1% identity (95.2% similar) in 207 aa overlap (1-206:1-206)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAANKSKGQSSLALHKVIMVGSGGVGKSALTLQFMYDEFVEDYEPTKADSYRKKVVLDGE
::::: :::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MAANKPKGQNSLALHKVIMVGSGGVGKSALTLQFMYDEFVEDYEPTKADSYRKKVVLDGE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 EVQIDILDTAGQEDYAAIRDNYFRSGEGFLLVFSITEHESFTATAEFREQILRVKAEEDK
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::: :::.:::.::::::::: :...
CCDS54 EVQIDILDTAGQEDYAAIRDNYFRSGEGFLCVFSITEMESFAATADFREQILRVK-EDEN
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 IPLLVVGNKSDLEERRQVPVEEARSKAEEWGVQYVETSAKTRANVDKVFFDLMREIRTKK
.:.:.::::::::..::: ::::...::.:.:.::::::::::::::::::::::::..:
CCDS54 VPFLLVGNKSDLEDKRQVSVEEAKNRAEQWNVNYVETSAKTRANVDKVFFDLMREIRARK
120 130 140 150 160 170
190 200
pF1KE1 MSENKDKNGKKSSKN-KKSFKERCCLL
: ..:.:::::. :. : ..::::.:
CCDS54 MEDSKEKNGKKKRKSLAKRIRERCCIL
180 190 200
>>CCDS8702.1 KRAS gene_id:3845|Hs108|chr12 (188 aa)
initn: 551 init1: 424 opt: 631 Z-score: 685.1 bits: 133.6 E(32554): 7.7e-32
Smith-Waterman score: 631; 52.6% identity (80.7% similar) in 192 aa overlap (15-206:4-188)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAANKSKGQSSLALHKVIMVGSGGVGKSALTLQFMYDEFVEDYEPTKADSYRKKVVLDGE
.:...::.:::::::::.:.. ..::..:.:: :::::.::.:::
CCDS87 MTEYKLVVVGAGGVGKSALTIQLIQNHFVDEYDPTIEDSYRKQVVIDGE
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 EVQIDILDTAGQEDYAAIRDNYFRSGEGFLLVFSITEHESFTATAEFREQILRVKAEEDK
.:::::::::.:.:.::.:.:.::::: ::.:.. .:: ..:::: ::: ::
CCDS87 TCLLDILDTAGQEEYSAMRDQYMRTGEGFLCVFAINNTKSFEDIHHYREQIKRVKDSED-
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 IPLLVVGNKSDLEERRQVPVEEARSKAEEWGVQYVETSAKTRANVDKVFFDLMREIRTKK
.:...:::: :: : : ...:.. :. .:. ..::::::: .:: .:. :.:::: :
CCDS87 VPMVLVGNKCDLPSRT-VDTKQAQDLARSYGIPFIETSAKTRQGVDDAFYTLVREIR--K
110 120 130 140 150 160
190 200
pF1KE1 MSENKDKNGKKSSKNKKSFKERCCLL
.:. .:.::: :.::: : .: ..
CCDS87 HKEKMSKDGKK--KKKKS-KTKCVIM
170 180
>>CCDS7814.1 RRAS2 gene_id:22800|Hs108|chr11 (204 aa)
initn: 406 init1: 406 opt: 593 Z-score: 644.3 bits: 126.2 E(32554): 1.4e-29
Smith-Waterman score: 593; 45.9% identity (79.2% similar) in 207 aa overlap (1-206:1-203)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAANKSKGQSSLALHKVIMVGSGGVGKSALTLQFMYDEFVEDYEPTKADSYRKKVVLDGE
::: . :. .....::.:::::::::.::. . :: ::.:: ::: :. :.: .
CCDS78 MAAAGWRDGSGQEKYRLVVVGGGGVGKSALTIQFIQSYFVTDYDPTIEDSYTKQCVIDDR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 EVQIDILDTAGQEDYAAIRDNYFRSGEGFLLVFSITEHESFTATAEFREQILRVKAEEDK
...:::::::::...:.:..:.:.:::::::::.:.. :: .:..:::::: ..:.
CCDS78 AARLDILDTAGQEEFGAMREQYMRTGEGFLLVFSVTDRGSFEEIYKFQRQILRVK-DRDE
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 IPLLVVGNKSDLEERRQVPVEEARSKAEEWGVQYVETSAKTRANVDKVFFDLMREIRTKK
.:....:::.::...::: ::... :.. : :.:.::: : :::..: .:.: :: :
CCDS78 FPMILIGNKADLDHQRQVTQEEGQQLARQLKVTYMEASAKIRMNVDQAFHELVRVIR--K
120 130 140 150 160 170
190 200
pF1KE1 MSENKDKNGKKSSKNKKSFKERC-CLL
..:.. . . ....:. :. : :..
CCDS78 FQEQECPPSPEPTRKEKD-KKGCHCVIF
180 190 200
>>CCDS877.1 NRAS gene_id:4893|Hs108|chr1 (189 aa)
initn: 529 init1: 420 opt: 589 Z-score: 640.5 bits: 125.3 E(32554): 2.3e-29
Smith-Waterman score: 589; 50.6% identity (80.9% similar) in 178 aa overlap (15-191:4-179)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAANKSKGQSSLALHKVIMVGSGGVGKSALTLQFMYDEFVEDYEPTKADSYRKKVVLDGE
.:...::.:::::::::.:.. ..::..:.:: :::::.::.:::
CCDS87 MTEYKLVVVGAGGVGKSALTIQLIQNHFVDEYDPTIEDSYRKQVVIDGE
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 EVQIDILDTAGQEDYAAIRDNYFRSGEGFLLVFSITEHESFTATAEFREQILRVKAEEDK
.:::::::::.:.:.::.:.:.::::: ::.:.. .::. .:::: ::: . :
CCDS87 TCLLDILDTAGQEEYSAMRDQYMRTGEGFLCVFAINNSKSFADINLYREQIKRVK-DSDD
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 IPLLVVGNKSDLEERRQVPVEEARSKAEEWGVQYVETSAKTRANVDKVFFDLMREIRTKK
.:...:::: :: : : ...:. :. .:. ..::::::: .:. .:. :.:::: .
CCDS87 VPMVLVGNKCDLPTRT-VDTKQAHELAKSYGIPFIETSAKTRQGVEDAFYTLVREIRQYR
110 120 130 140 150 160
190 200
pF1KE1 MSE-NKDKNGKKSSKNKKSFKERCCLL
:.. :.. .: .
CCDS87 MKKLNSSDDGTQGCMGLPCVVM
170 180
>>CCDS7698.1 HRAS gene_id:3265|Hs108|chr11 (189 aa)
initn: 531 init1: 422 opt: 589 Z-score: 640.5 bits: 125.3 E(32554): 2.3e-29
Smith-Waterman score: 589; 51.4% identity (80.2% similar) in 177 aa overlap (15-189:4-178)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAANKSKGQSSLALHKVIMVGSGGVGKSALTLQFMYDEFVEDYEPTKADSYRKKVVLDGE
.:...::.:::::::::.:.. ..::..:.:: :::::.::.:::
CCDS76 MTEYKLVVVGAGGVGKSALTIQLIQNHFVDEYDPTIEDSYRKQVVIDGE
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 EVQIDILDTAGQEDYAAIRDNYFRSGEGFLLVFSITEHESFTATAEFREQILRVKAEEDK
.:::::::::.:.:.::.:.:.::::: ::.:.. .:: ..:::: ::: . :
CCDS76 TCLLDILDTAGQEEYSAMRDQYMRTGEGFLCVFAINNTKSFEDIHQYREQIKRVK-DSDD
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 IPLLVVGNKSDLEERRQVPVEEARSKAEEWGVQYVETSAKTRANVDKVFFDLMREIRTKK
.:...:::: :: : : ..:.. :. .:. :.::::::: .:. .:. :.:::: .:
CCDS76 VPMVLVGNKCDLAART-VESRQAQDLARSYGIPYIETSAKTRQGVEDAFYTLVREIRQHK
110 120 130 140 150 160
190 200
pF1KE1 MSE--NKDKNGKKSSKNKKSFKERCCLL
. . :..:
CCDS76 LRKLNPPDESGPGCMSCKCVLS
170 180
>>CCDS8703.1 KRAS gene_id:3845|Hs108|chr12 (189 aa)
initn: 514 init1: 424 opt: 588 Z-score: 639.5 bits: 125.1 E(32554): 2.7e-29
Smith-Waterman score: 588; 50.0% identity (79.3% similar) in 184 aa overlap (15-197:4-185)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAANKSKGQSSLALHKVIMVGSGGVGKSALTLQFMYDEFVEDYEPTKADSYRKKVVLDGE
.:...::.:::::::::.:.. ..::..:.:: :::::.::.:::
CCDS87 MTEYKLVVVGAGGVGKSALTIQLIQNHFVDEYDPTIEDSYRKQVVIDGE
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 EVQIDILDTAGQEDYAAIRDNYFRSGEGFLLVFSITEHESFTATAEFREQILRVKAEEDK
.:::::::::.:.:.::.:.:.::::: ::.:.. .:: ..:::: ::: ::
CCDS87 TCLLDILDTAGQEEYSAMRDQYMRTGEGFLCVFAINNTKSFEDIHHYREQIKRVKDSED-
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 IPLLVVGNKSDLEERRQVPVEEARSKAEEWGVQYVETSAKTRANVDKVFFDLMREIRTKK
.:...:::: :: : : ...:.. :. .:. ..::::::: :. .:. :.:::: .
CCDS87 VPMVLVGNKCDLPSRT-VDTKQAQDLARSYGIPFIETSAKTRQRVEDAFYTLVREIRQYR
110 120 130 140 150 160
190 200
pF1KE1 MSE-NKDKNGKKSSKNKKSFKERCCLL
... .:... : ::
CCDS87 LKKISKEEKTPGCVKIKKCIIM
170 180
>>CCDS12774.1 RRAS gene_id:6237|Hs108|chr19 (218 aa)
initn: 534 init1: 388 opt: 562 Z-score: 611.0 bits: 120.1 E(32554): 1e-27
Smith-Waterman score: 562; 48.4% identity (76.6% similar) in 192 aa overlap (15-206:30-218)
10 20 30 40
pF1KE1 MAANKSKGQSSLALHKVIMVGSGGVGKSALTLQFMYDEFVEDYEP
::...::.:::::::::.::. . :: ::.:
CCDS12 MSSGAASGTGRGRPRGGGPGPGDPPPSETHKLVVVGGGGVGKSALTIQFIQSYFVSDYDP
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 TKADSYRKKVVLDGEEVQIDILDTAGQEDYAAIRDNYFRSGEGFLLVFSITEHESFTATA
: ::: : .:: ...:::::::::...:.:..:.:.:.::::::.:....::. ..
CCDS12 TIEDSYTKICSVDGIPARLDILDTAGQEEFGAMREQYMRAGHGFLLVFAINDRQSFNEVG
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 EFREQILRVKAEEDKIPLLVVGNKSDLEERRQVPVEEARSKAEEWGVQYVETSAKTRANV
.. :::::: ..: .:...::::.::: .:::: :: . . : : :.::: : ::
CCDS12 KLFTQILRVK-DRDDFPVVLVGNKADLESQRQVPRSEASAFGASHHVAYFEASAKLRLNV
130 140 150 160 170
170 180 190 200
pF1KE1 DKVFFDLMREIRTKKMSENKDKNGKKSSKNKKSFKERCCLL
:..: .:.: .: :..:.. . :. ::. : ::
CCDS12 DEAFEQLVRAVR--KYQEQELPPSPPSAPRKKGGGCPCVLL
180 190 200 210
>>CCDS840.1 RAP1A gene_id:5906|Hs108|chr1 (184 aa)
initn: 537 init1: 433 opt: 561 Z-score: 611.0 bits: 119.8 E(32554): 1e-27
Smith-Waterman score: 561; 49.2% identity (79.3% similar) in 179 aa overlap (15-192:4-180)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAANKSKGQSSLALHKVIMVGSGGVGKSALTLQFMYDEFVEDYEPTKADSYRKKVVLDGE
.:....:::::::::::.::. ::: :.:: :::::.: .: .
CCDS84 MREYKLVVLGSGGVGKSALTVQFVQGIFVEKYDPTIEDSYRKQVEVDCQ
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 EVQIDILDTAGQEDYAAIRDNYFRSGEGFLLVFSITEHESFTATAEFREQILRVKAEEDK
. ...:::::: :...:.:: :...:.:: ::.::: . .:. ..:::::::: ::
CCDS84 QCMLEILDTAGTEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQSTFNDLQDLREQILRVKDTED-
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE1 IPLLVVGNKSDLEERRQVPVEEARSKAEEW-GVQYVETSAKTRANVDKVFFDLMREIRTK
.:...:::: :::..: : :.... :..: . ..:.:::.. ::...:.::.:.: :
CCDS84 VPMILVGNKCDLEDERVVGKEQGQNLARQWCNCAFLESSAKSKINVNEIFYDLVRQINRK
110 120 130 140 150 160
180 190 200
pF1KE1 KMSENKDKNGKKSSKNKKSFKERCCLL
:.: : :::
CCDS84 TPVEKK-KPKKKSCLLL
170 180
>>CCDS8984.1 RAP1B gene_id:5908|Hs108|chr12 (184 aa)
initn: 491 init1: 433 opt: 556 Z-score: 605.7 bits: 118.9 E(32554): 2e-27
Smith-Waterman score: 556; 47.8% identity (79.4% similar) in 180 aa overlap (15-193:4-180)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAANKSKGQSSLALHKVIMVGSGGVGKSALTLQFMYDEFVEDYEPTKADSYRKKVVLDGE
.:....:::::::::::.::. ::: :.:: :::::.: .:..
CCDS89 MREYKLVVLGSGGVGKSALTVQFVQGIFVEKYDPTIEDSYRKQVEVDAQ
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 EVQIDILDTAGQEDYAAIRDNYFRSGEGFLLVFSITEHESFTATAEFREQILRVKAEEDK
. ...:::::: :...:.:: :...:.:: ::.::: . .:. ..:::::::: . :
CCDS89 QCMLEILDTAGTEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQSTFNDLQDLREQILRVK-DTDD
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE1 IPLLVVGNKSDLEERRQVPVEEARSKAEEWG-VQYVETSAKTRANVDKVFFDLMREIRTK
.:...:::: :::..: : :.... :..:. ..:.:::.. ::...:.::.:.: :
CCDS89 VPMILVGNKCDLEDERVVGKEQGQNLARQWNNCAFLESSAKSKINVNEIFYDLVRQINRK
110 120 130 140 150 160
180 190 200
pF1KE1 KMSENKDKNGKKSSKNKKSFKERCCLL
.: . ::::
CCDS89 TPVPGKAR--KKSSCQLL
170 180
206 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 18:17:05 2016 done: Sun Nov 6 18:17:05 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]