FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1973, 541 aa 1>>>pF1KE1973 541 - 541 aa - 541 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4195+/-0.00123; mu= 17.8448+/- 0.074 mean_var=67.3653+/-13.346, 0's: 0 Z-trim(101.0): 54 B-trim: 76 in 1/49 Lambda= 0.156263 statistics sampled from 6287 (6332) to 6287 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.548), E-opt: 0.2 (0.195), width: 16 Scan time: 3.080 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS2060.1 IL18R1 gene_id:8809|Hs108|chr2 ( 541) 3587 818.3 0 CCDS14517.1 IL1RAPL2 gene_id:26280|Hs108|chrX ( 686) 655 157.4 5.2e-38 CCDS14218.1 IL1RAPL1 gene_id:11141|Hs108|chrX ( 696) 625 150.6 5.7e-36 CCDS2055.1 IL1R1 gene_id:3554|Hs108|chr2 ( 569) 597 144.2 3.8e-34 CCDS3298.1 IL1RAP gene_id:3556|Hs108|chr3 ( 570) 578 140.0 7.4e-33 CCDS2061.1 IL18RAP gene_id:8807|Hs108|chr2 ( 599) 561 136.1 1.1e-31 CCDS54696.1 IL1RAP gene_id:3556|Hs108|chr3 ( 687) 544 132.3 1.8e-30 CCDS2056.1 IL1RL2 gene_id:8808|Hs108|chr2 ( 575) 542 131.8 2.1e-30 CCDS2057.1 IL1RL1 gene_id:9173|Hs108|chr2 ( 556) 458 112.9 1e-24 CCDS74547.1 IL1R1 gene_id:3554|Hs108|chr2 ( 538) 307 78.9 1.7e-14 CCDS31325.1 SIGIRR gene_id:59307|Hs108|chr11 ( 410) 264 69.1 1.1e-11 >>CCDS2060.1 IL18R1 gene_id:8809|Hs108|chr2 (541 aa) initn: 3587 init1: 3587 opt: 3587 Z-score: 4369.8 bits: 818.3 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 3587; 100.0% identity (100.0% similar) in 541 aa overlap (1-541:1-541) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MNCRELPLTLWVLISVSTAESCTSRPHITVVEGEPFYLKHCSCSLAHEIETTTKSWYKSS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS20 MNCRELPLTLWVLISVSTAESCTSRPHITVVEGEPFYLKHCSCSLAHEIETTTKSWYKSS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 GSQEHVELNPRSSSRIALHDCVLEFWPVELNDTGSYFFQMKNYTQKWKLNVIRRNKHSCF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS20 GSQEHVELNPRSSSRIALHDCVLEFWPVELNDTGSYFFQMKNYTQKWKLNVIRRNKHSCF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 TERQVTSKIVEVKKFFQITCENSYYQTLVNSTSLYKNCKKLLLENNKNPTIKKNAEFEDQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS20 TERQVTSKIVEVKKFFQITCENSYYQTLVNSTSLYKNCKKLLLENNKNPTIKKNAEFEDQ 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 GYYSCVHFLHHNGKLFNITKTFNITIVEDRSNIVPVLLGPKLNHVAVELGKNVRLNCSAL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS20 GYYSCVHFLHHNGKLFNITKTFNITIVEDRSNIVPVLLGPKLNHVAVELGKNVRLNCSAL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 LNEEDVIYWMFGEENGSDPNIHEEKEMRIMTPEGKWHASKVLRIENIGESNLNVLYNCTV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS20 LNEEDVIYWMFGEENGSDPNIHEEKEMRIMTPEGKWHASKVLRIENIGESNLNVLYNCTV 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 ASTGGTDTKSFILVRKADMADIPGHVFTRGMIIAVLILVAVVCLVTVCVIYRVDLVLFYR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS20 ASTGGTDTKSFILVRKADMADIPGHVFTRGMIIAVLILVAVVCLVTVCVIYRVDLVLFYR 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 HLTRRDETLTDGKTYDAFVSYLKECRPENGEEHTFAVEILPRVLEKHFGYKLCIFERDVV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS20 HLTRRDETLTDGKTYDAFVSYLKECRPENGEEHTFAVEILPRVLEKHFGYKLCIFERDVV 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 PGGAVVDEIHSLIEKSRRLIIVLSKSYMSNEVRYELESGLHEALVERKIKIILIEFTPVT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS20 PGGAVVDEIHSLIEKSRRLIIVLSKSYMSNEVRYELESGLHEALVERKIKIILIEFTPVT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE1 DFTFLPQSLKLLKSHRVLKWKADKSLSYNSRFWKNLLYLMPAKTVKPGRDEPEVLPVLSE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS20 DFTFLPQSLKLLKSHRVLKWKADKSLSYNSRFWKNLLYLMPAKTVKPGRDEPEVLPVLSE 490 500 510 520 530 540 pF1KE1 S : CCDS20 S >>CCDS14517.1 IL1RAPL2 gene_id:26280|Hs108|chrX (686 aa) initn: 557 init1: 223 opt: 655 Z-score: 795.9 bits: 157.4 E(32554): 5.2e-38 Smith-Waterman score: 720; 32.4% identity (59.7% similar) in 534 aa overlap (33-523:46-559) 10 20 30 40 50 pF1KE1 CRELPLTLWVLISVSTAESCTSRPHITVVEGEPFYLKHCSC--SLAHEIETTTKS----- ::: .: :. : . .:..: CCDS14 STNLKMVSKRNSVDGCIDWSVDLKTYMALAGEPVRVK-CALFYSYIRTNYSTAQSTGLRL 20 30 40 50 60 70 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 -WYKSSGSQEHVELNPRSSSRIALHDCVLEFWPVELNDTGSYFFQMKNYTQKWK----LN :::..:. : : : :.. .. . : .: .:.: : ..: : : :. CCDS14 MWYKNKGDLE--EPIIFSEVRMSKEEDSIWFHSAEAQDSGFYTCVLRNSTYCMKVSMSLT 80 90 100 110 120 130 120 130 140 150 160 pF1KE1 VIRRNKHSCFTERQVTSKIVEVKKFFQITCEN--SYYQTLVNSTSL-YKNCK----KLLL : . .. :.. : . :: : .:.: . .. .. . . ::.:: . .. CCDS14 VAENESGLCYNSRIRYLEKSEVTKRKEISCPDMDDFKKSDQEPDVVWYKECKPKMWRSII 140 150 160 170 180 190 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 ENNKNPTIKKNAEFEDQGYYSCVHFLHHNGKLFNITKTFNIT-IVEDRSNIVPVLLGPKL .. : . .... :: : :.: :...::: : ...: .. :. : : : CCDS14 IQKGNALLIQEVQEEDGGNYTC--ELKYEGKLVRRTTELKVTALLTDKP---PKPLFPME 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 pF1KE1 NH---VAVELGKNVRLNCSALLNEED----VIYWMFGEENGSDPNIH-EEKEMRIMTPE- :. . :.::: . . :.:... .:::: ::. . : .: :.:.. . CCDS14 NQPSVIDVQLGKPLNIPCKAFFGFSGESGPMIYWMKGEKFIEELAGHIREGEIRLLKEHL 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 GKWHASKVLRIENIGESNLNVLYNCTVASTGGTDTKSFILVRKADMADIPGHVFTRGMII :. .. .: .... :..: . :.: : . .: : .:.:: :. .. : . CCDS14 GEKEVELALIFDSVVEADL-ANYTCHVENRNGRKHAS-VLLRKKDLIY---KIELAGGLG 310 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 pF1KE1 AVLILVAVVCLVTVCVIYRVDLVLFYRHLTRRDETLTDGKTYDAFVSYLK------ECRP :...:.... .. : : ..:.::::. ::: :.: :::..:: : .: CCDS14 AIFLLLVLLVVIYKC--YNIELMLFYRQHFGADETNDDNKEYDAYLSYTKVDQDTLDC-- 370 380 390 400 410 390 400 410 420 430 440 pF1KE1 ENGEEHTFAVEILPRVLEKHFGYKLCIFERDVVPGGAVVDEIHSLIEKSRRLIIVLSKSY .: ::. ::.:.:: :::::.:::: : :::..:.:. .... .:.::::::::. .: CCDS14 DNPEEEQFALEVLPDVLEKHYGYKLFIPERDLIPSGTYMEDLTRYVEQSRRLIIVLTPDY 420 430 440 450 460 470 450 460 470 480 490 pF1KE1 MSNE--VRYELESGLHEALVERKIKIILIEFTPVT------DFTFLPQSLKLLKSHRVLK . . .:::: ::. :: .::.:::: : . . : .:.:::. ..: CCDS14 ILRRGWSIFELESRLHNMLVSGEIKVILIECTELKGKVNCQEVESLKRSIKLLS---LIK 480 490 500 510 520 530 500 510 520 530 540 pF1KE1 WKADKSLSYNSRFWKNLLYLMPAKTVKPGRDEPEVLPVLSES ::..:: . ::.:::.:.: :: : CCDS14 WKGSKSSKLNSKFWKHLVYEMPIKKKEMLPRCHVLDSAEQGLFGELQPIPSIAMTSTSAT 540 550 560 570 580 590 >>CCDS14218.1 IL1RAPL1 gene_id:11141|Hs108|chrX (696 aa) initn: 558 init1: 222 opt: 625 Z-score: 759.3 bits: 150.6 E(32554): 5.7e-36 Smith-Waterman score: 726; 30.4% identity (58.3% similar) in 566 aa overlap (9-527:18-566) 10 20 30 40 pF1KE1 MNCRELPLTLWVLISVSTAESCTSRP----HITVVEGEPFYLKHCSCSLAH .: :. . ..:..::. . :. ::: .: :.: . CCDS14 MKAPIPHLILLYATFTQSLKVVTKRGSADGCTDWSIDIKKYQVLVGEPVRIK---CALFY 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 pF1KE1 EIETTTKS----------WYKSSGSQEHVELNPRSSSRIALHDCVLEFWPVELNDTGSYF :. : :::::: . : ..::.. .. . : :. :.:.: : CCDS14 GYIRTNYSLAQSAGLSLMWYKSSGPGDFEEPIAFDGSRMSKEEDSIWFRPTLLQDSGLYA 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KE1 FQMKNYTQKWKLNV---IRRNKHS-CFTERQVTSKIVEVKKFFQITC---ENSYYQTLVN ..: : :... . .: . :.. .. . .:..: .:.: :. : CCDS14 CVIRNSTYCMKVSISLTVGENDTGLCYNSKMKYFEKAELSKSKEISCRDIEDFLLPTREP 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 pF1KE1 STSLYKNCKKLLLENN----KNPTIKKNAEFEDQGYYSCVHFLHHNGKLFNITKTFNITI ::.:. . . .. . .... .: : :.: :...: : . .: ..:. CCDS14 EILWYKECRTKTWRPSIVFKRDTLLIREVREDDIGNYTC--ELKYGG--FVVRRTTELTV 180 190 200 210 220 230 210 220 230 240 250 pF1KE1 VEDRSNIVPVLLGP---KLNHVAVELGKNVRLNCSALLNEE-DV---IYWMFGEE--NGS . .. : :: : ::. ..:: .. :.: :... :: :::: ::. . CCDS14 TAPLTDKPPKLLYPMESKLTIQETQLGDSANLTCRAFFGYSGDVSPLIYWMKGEKFIEDL 240 250 260 270 280 290 260 270 280 290 300 310 pF1KE1 DPNIHEEKEMRIMTPE-GKWHASKVLRIENIGESNLNVLYNCTVASTGGTDTKSFILVRK : : :...::. . :. ..: : .... :..:. :.: : . .: : .: .. CCDS14 DENRVWESDIRILKEHLGEQEVSISLIVDSVEEGDLGN-YSCYVENGNGRRHASVLLHKR 300 310 320 330 340 350 320 330 340 350 360 370 pF1KE1 ADMADIPGHVFTRGMIIAVLILVAVVCLVTVCVIYRVDLVLFYRHLTRRDETLTDGKTYD : . : . :.:.: .:::::. :.....::::. .: :.: :: CCDS14 ELMYTVE----LAGGLGAILLL--LVCLVTIYKCYKIEIMLFYRNHFGAEELDGDNKDYD 360 370 380 390 400 380 390 400 410 420 430 pF1KE1 AFVSYLK----ECRPENGEEHTFAVEILPRVLEKHFGYKLCIFERDVVPGGAVVDEIHSL :..:: : . :.:::. ::.:::: .::::.:::: : .::..: :. .... CCDS14 AYLSYTKVDPDQWNQETGEEERFALEILPDMLEKHYGYKLFIPDRDLIPTGTYIEDVARC 410 420 430 440 450 460 440 450 460 470 480 pF1KE1 IEKSRRLIIVLSKSYMSNE--VRYELESGLHEALVERKIKIILIEFTPVT------DFTF ...:.:::::.. .:. . .:::. :.. :: .::.:::: . . . CCDS14 VDQSKRLIIVMTPNYVVRRGWSIFELETRLRNMLVTGEIKVILIECSELRGIMNYQEVEA 470 480 490 500 510 520 490 500 510 520 530 540 pF1KE1 LPQSLKLLKSHRVLKWKADKSLSYNSRFWKNLLYLMPAKTVKPGRDEPEVLPVLSES : ...::: :.::.. : . ::.::: : : :: : ..: CCDS14 LKHTIKLLT---VIKWHGPKCNKLNSKFWKRLQYEMPFKRIEPITHEQALDVSEQGPFGE 530 540 550 560 570 580 CCDS14 LQTVSAISMAAATSTALATAHPDLRSTFHNTYHSQMRQKHYYRSYEYDVPPTGTLPLTSI 590 600 610 620 630 640 >>CCDS2055.1 IL1R1 gene_id:3554|Hs108|chr2 (569 aa) initn: 487 init1: 141 opt: 597 Z-score: 726.5 bits: 144.2 E(32554): 3.8e-34 Smith-Waterman score: 693; 27.0% identity (58.0% similar) in 559 aa overlap (12-540:13-558) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MNCRELPLTLWVLISVSTAESCTSRPHITVVEGEPFYLKHCSCSLAHEIETTTKSWYKS .::: :..: : . .. . . : : . . : .:::. CCDS20 MKVLLRLICFIALLISSLEADKCKEREEKIILVSSANEIDVRPCPLNPNEHKGTITWYKD 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 SGSQEHVELNPRSSSRIALHDCVLEFWPVELNDTGSYFFQMKN--YTQKWKLNV--IRRN .. .. .. ...::: : : : :....:.: :. ..: : . :... .. . CCDS20 DS---KTPVSTEQASRIHQHKEKLWFVPAKVEDSGHYYCVVRNSSYCLRIKISAKFVENE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 KHSCFTERQVTSKIVEVKKFFQITCEN-SYYQTLVN---STSLYKNCKKLLLENN----- . :.. . . .. . : ..: .... : . . ::.:: :::.: CCDS20 PNLCYNAQAIFKQKLPVAGDGGLVCPYMEFFKNENNELPKLQWYKDCKPLLLDNIHFSGV 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 KNPTIKKNAEFEDQGYYSCVHFLHHNGKLFNITKTFNITIVEDRSNIVPVLLGPKLNHVA :. : :. . .: :.: . :: . ::..... .:. . ::...: . . CCDS20 KDRLIVMNVAEKHRGNYTCHASYTYLGKQYPITRVIEFITLEENKPTRPVIVSPANETME 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 VELGKNVRLNCSALLNEEDVIYWMF-GEENGSDPNIHEEKEMRIMTPEGKWHASKVLRIE :.::....: :.. . :. :: . : : . : . . .: .: . : .. . CCDS20 VDLGSQIQLICNVTGQLSDIAYWKWNGSVIDEDDPVLGEDYYSVENPANK-RRSTLITVL 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 NIGESNLNVL---YNCTVASTGGTDTKSFILVRKADMADIPGHVFTRGMI-IAVLILVAV ::.: . ..: . .: : :. . :. : : . :: : : . : . CCDS20 NISEIESRFYKHPFTCFAKNTHGIDAAYIQLIY-------PVTNFQKHMIGICVTLTVII 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE1 VCLVTVCVIYRVDLVLFYRHLTRRDETL--TDGKTYDAFVSYLKEC-RPENGEEHTFAVE :: : . :...:.::.:: . .:::::::.. : : . ... :. . CCDS20 VCSVFIYKIFKIDIVLWYRDSCYDFLPIKASDGKTYDAYILYPKTVGEGSTSDCDIFVFK 350 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 450 pF1KE1 ILPRVLEKHFGYKLCIFERDVVPGGAVVDEIHSLIEKSRRLIIVLSK-----SYMSNEVR .::.::::. :::: :. :: : .:. :. ..:::::::.: . :.... . CCDS20 VLPEVLEKQCGYKLFIYGRDDYVGEDIVEVINENVKKSRRLIIILVRETSGFSWLGGSSE 410 420 430 440 450 460 460 470 480 490 500 pF1KE1 YELESGLHEALVERKIKIILIEFTPVTDFTFLPQSLKLLKS-HRVLKWKADKSL---SYN .. ....:::. ::..:.:. . :. .:.:.:..:. : ...:..: . : . CCDS20 EQI--AMYNALVQDGIKVVLLELEKIQDYEKMPESIKFIKQKHGAIRWSGDFTQGPQSAK 470 480 490 500 510 520 510 520 530 540 pF1KE1 SRFWKNLLYLMPAKTVKPGRDEPEVLPVLSES .:::::. : ::.. .:. . . :. .: CCDS20 TRFWKNVRYHMPVQRRSPSSKHQLLSPATKEKLQREAHVPLG 530 540 550 560 >>CCDS3298.1 IL1RAP gene_id:3556|Hs108|chr3 (570 aa) initn: 504 init1: 229 opt: 578 Z-score: 703.3 bits: 140.0 E(32554): 7.4e-33 Smith-Waterman score: 693; 31.3% identity (59.6% similar) in 540 aa overlap (27-529:34-554) 10 20 30 40 pF1KE1 MNCRELPLTLWVLISVSTAESCTSRPHITVVEGEPFYLKHC---------SCSLAH .: : : :: .: : . : :: CCDS32 LWCVVSLYFYGILQSDASERCDDWGLDTMRQIQVFEDEPARIK-CPLFEHFLKFNYSTAH 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 EIETTTKSWYKSSGSQEHVE-LNPR-SSSRIALHDCVLEFWPVELNDTGSYFFQMKN--Y : :: . ... : .: : .::. . :: : :. :::::.: ...: : CCDS32 SAGLTLI-WYWTRQDRDLEEPINFRLPENRISKEKDVLWFRPTLLNDTGNYTCMLRNTTY 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 pF1KE1 TQK--WKLNVIRRNKHSCF-TERQVTSKIVEVKKFFQ-ITCEN--SYYQTLVNST-SLYK .: . :.:.... ::: . .. . . .. .: ::: : .:. . :. : . : CCDS32 CSKVAFPLEVVQKD--SCFNSPMKLPVHKLYIEYGIQRITCPNVDGYFPSSVKPTITWYM 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KE1 NCKKLLLENNKNPTIKKNAEF-----EDQGYYSCVHFLHHNGKLFNITKTFNITIVEDRS .: :. :: : : : ..: :.:: .::. :..:.:... .: . . CCDS32 GCYKIQNFNNVIPE-GMNLSFLIALISNNGNYTCVVTYPENGRTFHLTRTLTVKVVGSPK 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 pF1KE1 NIVPVLLGPKLNHVAVEL--GKNVRLNCSA----LLNEEDVIYWMFGEENGSDPNIHEEK : :: .. .::. : :... . :.. :.. .. ..: . .. .: .: CCDS32 NAVPPVIHSPNDHVVYEKEPGEELLIPCTVYFSFLMDSRNEVWWTIDGKKPDDITIDVTI 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 pF1KE1 EMRIMTPEGKWHA-SKVLRIENIGESNLNVLYNCTVASTGGTDTKSFILVRKADMADIPG . : . . .. ...: :... .:. : : . :. : .:. . .: .:. CCDS32 NESISHSRTEDETRTQILSIKKVTSEDLKRSYVCHARSAKGEVAKAAKVKQK-----VPA 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 370 380 pF1KE1 HVFTRGMI--IAVLILVAVVCLVTVCVIYRVDLVLFYRHLTRRDETLTDGKTYDAFVSYL .: . ... .:..:. :..: .: ...::::: :::. ::: :: .::: CCDS32 PRYTVELACGFGATVLLVVI-LIVVYHVYWLEMVLFYRAHFGTDETILDGKEYDIYVSYA 360 370 380 390 400 410 390 400 410 420 430 440 pF1KE1 KECRPENGEEHTFAVEILPRVLEKHFGYKLCIFERDVVPGGAVVDEIHSLIEKSRRLIIV . :.::. :.. : :::..::::::::.:: .::: :.:: :.:.:::::..: CCDS32 R-----NAEEEEFVLLTLRGVLENEFGYKLCIFDRDSLPGGIVTDETLSFIQKSRRLLVV 420 430 440 450 460 450 460 470 480 490 pF1KE1 LSKSYM--SNEVRYELESGLHEALVERKIKIILIEFTPVTDFTFLPQSLKLLKS-HRVLK :: .:. .... ::..::.. . .:..::... : . . :: :. :.: CCDS32 LSPNYVLQGTQALLELKAGLENMASRGNINVILVQYKAVKETKV--KELKRAKTVLTVIK 470 480 490 500 510 520 500 510 520 530 540 pF1KE1 WKADKSLSYNSRFWKNLLYLMPAKTVKPGRDEPEVLPVLSES ::..:: ..::::.: ::.: .: : CCDS32 WKGEKSKYPQGRFWKQLQVAMPVKK-SPRRSSSDEQGLSYSSLKNV 530 540 550 560 570 >>CCDS2061.1 IL18RAP gene_id:8807|Hs108|chr2 (599 aa) initn: 399 init1: 233 opt: 561 Z-score: 682.3 bits: 136.1 E(32554): 1.1e-31 Smith-Waterman score: 605; 28.9% identity (59.2% similar) in 495 aa overlap (56-523:84-562) 30 40 50 60 70 80 pF1KE1 PHITVVEGEPFYLKHCSCSLAHEIETTTKSWYKSSGSQEHVELNPRSSSRIALHDCVLEF ::.. .. . .: .: .: :.:.: CCDS20 SHFCHRNRLSPKQVPEHLPFMGSNDLSDVQWYQQPSNGDPLEDIRKSYPHIIQDKCTLHF 60 70 80 90 100 110 90 100 110 120 130 pF1KE1 WPVELNDTGSYFFQMKNYTQ--------KWKLNVIRRNKHSCFTERQVTSKI-VEVKKFF .:..:::. . : . : :.: ... :: : ... : . . . CCDS20 LTPGVNNSGSYICRPKMIKSPYDVACCVKMILEVKPQTNASC--EYSASHKQDLLLGSTG 120 130 140 150 160 170 140 150 160 170 180 190 pF1KE1 QITCENSYYQTLVNSTSL--YKNCKKLLLENNKNPTIKKNAEFEDQGYYSCVHFLHHNGK .:.: . :. ..: .. ::: : : .: .. .. . ... :: : : . . . CCDS20 SISCPSLSCQSDAQSPAVTWYKNGKLLSVERSNRIVVDEVYDYH-QGTYVCDYTQSDTVS 180 190 200 210 220 230 200 210 220 230 240 250 pF1KE1 LFNITKTFNITIVEDRSNIVPVLLGPKLNHVAVELGKNVRLNCSALLNEE----DVIYWM ... . .. . ... : .: : . . ::::: . ..:.: .. : :: :. CCDS20 SWTVRAVVQVRTIVGDTKLKPDILDPVEDTLEVELGKPLTISCKARFGFERVFNPVIKWY 240 250 260 270 280 290 260 270 280 290 300 pF1KE1 FGEENGS-DPNIHEEKEMRIMTPEGKWHASKVLRIENIGESNLNVLYNCTVASTGGTDTK . . . . .. : : .. . . . .: :.. . .: . : : .. :. :. CCDS20 IKDSDLEWEVSVPEAKSIKSTLKDEIIERNIIL--EKVTQRDLRRKFVCFVQNSIGNTTQ 300 310 320 330 340 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 SFILVRKADMADIPGHVFTRGMIIAVLILVAVVCLVTVCVIYR--VDLVLFYRHLTRRDE : : .: : :. .. .. :::: :.. ..:: ...::.:: .:. CCDS20 SVQLKEKR------GVVLLYILLGTIGTLVAV--LAASALLYRHWIEIVLLYRTYQSKDQ 350 360 370 380 390 400 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 TLTDGKTYDAFVSYLK------ECRPENGEEHTFAVEILPRVLEKHFGYKLCIFERDVVP :: : : .:::::: : : .::: .:. ..: :::...::.::..::::.: CCDS20 TLGDKKDFDAFVSYAKWSSFPSEATSSLSEEH-LALSLFPDVLENKYGYSLCLLERDVAP 410 420 430 440 450 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 GGAVVDEIHSLIEKSRRLIIVLSKSYMSNEVRYELESGLHEALVERKIKIILIEFTPVTD ::. ...: :.:..::: :..:: .:... .::..... :: .. .:.:::.: . CCDS20 GGVYAEDIVSIIKRSRRGIFILSPNYVNGPSIFELQAAVNLALDDQTLKLILIKFCYFQE 460 470 480 490 500 510 490 500 510 520 530 pF1KE1 FTFLPQSLKLLKSHRVLK---WKADKSLSYNSRFWKNLLYLMPAKTVKPGRDEPEVLPVL ::. .: :. ::: :.. ::. ::::: .. : ::.: CCDS20 PESLPHLVK--KALRVLPTVTWRGLKSVPPNSRFWAKMRYHMPVKNSQGFTWNQLRITSR 520 530 540 550 560 570 540 pF1KE1 SES CCDS20 IFQWKGLSRTETTGRSSQPKEW 580 590 >>CCDS54696.1 IL1RAP gene_id:3556|Hs108|chr3 (687 aa) initn: 434 init1: 218 opt: 544 Z-score: 660.7 bits: 132.3 E(32554): 1.8e-30 Smith-Waterman score: 659; 29.9% identity (58.9% similar) in 535 aa overlap (27-525:34-549) 10 20 30 40 pF1KE1 MNCRELPLTLWVLISVSTAESCTSRPHITVVEGEPFYLKHC---------SCSLAH .: : : :: .: : . : :: CCDS54 LWCVVSLYFYGILQSDASERCDDWGLDTMRQIQVFEDEPARIK-CPLFEHFLKFNYSTAH 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 EIETTTKSWYKSSGSQEHVE-LNPR-SSSRIALHDCVLEFWPVELNDTGSYFFQMKN--Y : :: . ... : .: : .::. . :: : :. :::::.: ...: : CCDS54 SAGLTLI-WYWTRQDRDLEEPINFRLPENRISKEKDVLWFRPTLLNDTGNYTCMLRNTTY 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 pF1KE1 TQK--WKLNVIRRNKHSCF-TERQVTSKIVEVKKFFQ-ITCEN--SYYQTLVNST-SLYK .: . :.:.... ::: . .. . . .. .: ::: : .:. . :. : . : CCDS54 CSKVAFPLEVVQKD--SCFNSPMKLPVHKLYIEYGIQRITCPNVDGYFPSSVKPTITWYM 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KE1 NCKKLLLENNKNPTIKKNAEF-----EDQGYYSCVHFLHHNGKLFNITKTFNITIVEDRS .: :. :: : : : ..: :.:: .::. :..:.:... .: . . CCDS54 GCYKIQNFNNVIPE-GMNLSFLIALISNNGNYTCVVTYPENGRTFHLTRTLTVKVVGSPK 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 pF1KE1 NIVPVLLGPKLNHVAVEL--GKNVRLNCSA----LLNEEDVIYWMFGEENGSDPNIHEEK : :: .. .::. : :... . :.. :.. .. ..: . .. .: .: CCDS54 NAVPPVIHSPNDHVVYEKEPGEELLIPCTVYFSFLMDSRNEVWWTIDGKKPDDITIDVTI 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 pF1KE1 EMRIMTPEGKWHA-SKVLRIENIGESNLNVLYNCTVASTGGTDTKSFILVRKADMADIPG . : . . .. ...: :... .:. : : . :. : .:. . .: .:. CCDS54 NESISHSRTEDETRTQILSIKKVTSEDLKRSYVCHARSAKGEVAKAAKVKQK-----VPA 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 370 380 pF1KE1 HVFTRGMI--IAVLILVAVVCLVTVCVIYRVDLVLFYRHLTRRDETLTDGKTYDAFVSYL .: . ... .:..:. :..: .: ...::::: :::. ::: :: .::: CCDS54 PRYTVELACGFGATVLLVVI-LIVVYHVYWLEMVLFYRAHFGTDETILDGKEYDIYVSYA 360 370 380 390 400 410 390 400 410 420 430 440 pF1KE1 KECRPENGEEHTFAVEILPRVLEKHFGYKLCIFERDVVPGGAVVDEIHSLIEKSRRLIIV . :.::. :.. : :::..::::::::.:: .::: .:. . ..:..:::.:.: CCDS54 R-----NAEEEEFVLLTLRGVLENEFGYKLCIFDRDSLPGGNTVEAVFDFIQRSRRMIVV 420 430 440 450 460 450 460 470 480 490 500 pF1KE1 LSKSYMSNEVRYELESGLHEALVERKI--KIILIEFTPVTDFTFLPQSLKLLKSHRVLKW :: .:.... :: : .. . .: :.:..:. :. : :.: .: ..: CCDS54 LSPDYVTEKSISMLEFKLG-VMCQNSIATKLIVVEYRPLEHPH--PGILQLKESVSFVSW 470 480 490 500 510 520 510 520 530 540 pF1KE1 KADKSLSYNSRFWKNLLYLMPAKTVKPGRDEPEVLPVLSES :..:: .:.::: : .: ... CCDS54 KGEKSKHSGSKFWKALRLALPLRSLSASSGWNESCSSQSDISLDHVQRRRSRLKEPPELQ 530 540 550 560 570 580 >>CCDS2056.1 IL1RL2 gene_id:8808|Hs108|chr2 (575 aa) initn: 339 init1: 142 opt: 542 Z-score: 659.4 bits: 131.8 E(32554): 2.1e-30 Smith-Waterman score: 605; 27.3% identity (59.9% similar) in 556 aa overlap (8-527:9-543) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MNCRELPLTLWVLISVSTAESCTS--RPHITVVEGEPFYLKHCSCSLAHEIETTTKSWY :.. . .:: ::..: . . . ..:: . .:. :... .:: CCDS20 MWSLLLCGLSIALPLSV-TADGCKDIFMKNEILSASQPFAF-NCTFPPITSGEVSV-TWY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 KSSGSQEHVELNPRSSSRIALHDCVLEFWPVELNDTGSY--FFQMKNYTQKWKLNVIRRN :.:.. . .. .::: . . : :.: .:.: : .. .. .. ..:. . CCDS20 KNSSK---IPVSKIIQSRIHQDETWILFLPMEWGDSGVYQCVIKGRDSCHRIHVNLTVFE 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 KHSCFTE-------RQVTSKIVEVKKFFQITCENSYYQTLV-NSTSLYKNCKKLLLENN- :: : : . ..:... : ..::. . .. : . . ::.:... : CCDS20 KHWCDTSIGGLPNLSDEYKQILHLGKDDSLTCHLHFPKSCVLGPIKWYKDCNEIKGERFT 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 --KNPTIKKNAEFEDQGYYSCVHFLHHNGKLFNITKTFNITIVE--DRSNIVPVLLGPKL .. . .:. ::.: :.: .: :.:: ... . ....:.: .. :: .. :: CCDS20 VLETRLLVSNVSAEDRGNYACQAILTHSGKQYEVLNGITVSITERAGYGGSVPKIIYPKN 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 NHVAVELGKNVRLNCSALLNEEDVIYWMFGEENG-SDPNIHEEKEMRIMTPEG-KWHASK . . :.:: .. ..:.. ..... . .: : : :..: :: . :.: CCDS20 HSIEVQLGTTLIVDCNVTDTKDNTNLRCWRVNNTLVDDYYDESKRIR----EGVETHVS- 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 VLRIENIGESNLNVL------YNCTVASTGGTDTKSFILVRKADMADIPGHVFTRGMIIA .: .:. :.. : :. .:..: .:: ..:. : .: . CCDS20 -FREHNLYTVNITFLEVKMEDYGLPFMCHAGVSTAYIIL-------QLPAPDFRAYLIGG 290 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 390 pF1KE1 VLILVAV-VCLVTVCVIYRVDLVLFYRHLTRRDETLTDGKTYDAFVSYLKECRPENGEEH .. :::: : .: . :...:.::.:: . ::..::: :::.: : : . ....: CCDS20 LIALVAVAVSVVYIYNIFKIDIVLWYRSAFHSTETIVDGKLYDAYVLYPKPHK--ESQRH 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KE1 T---FAVEILPRVLEKHFGYKLCIFERDVVPGGAVVDEIHSLIEKSRRLI-IVLSKSYMS . ....:::.:::.. :::: :: :: :: ::.. : .. :::: ::. .: CCDS20 AVDALVLNILPEVLERQCGYKLFIFGRDEFPGQAVANVIDENVKLCRRLIVIVVPESLGF 400 410 420 430 440 450 450 460 470 480 490 500 pF1KE1 NEVRY--ELESGLHEALVERKIKIILIEFTPVTDFTFLPQSLKLLKS-HRVLKWKAD--- . .. : . ... ::.. .:.::::. . :.: .:.:.. .:. : ...:..: CCDS20 GLLKNLSEEQIAVYSALIQDGMKVILIELEKIEDYTVMPESIQYIKQKHGAIRWHGDFTE 460 470 480 490 500 510 510 520 530 540 pF1KE1 KSLSYNSRFWKNLLYLMPAKTVKPGRDEPEVLPVLSES .: ....:::.. : :: . .: CCDS20 QSQCMKTKFWKTVRYHMPPRRCRPFPPVQLLQHTPCYRTAGPELGSRRKKCTLTTG 520 530 540 550 560 570 >>CCDS2057.1 IL1RL1 gene_id:9173|Hs108|chr2 (556 aa) initn: 367 init1: 158 opt: 458 Z-score: 557.3 bits: 112.9 E(32554): 1e-24 Smith-Waterman score: 645; 28.3% identity (57.6% similar) in 519 aa overlap (53-540:45-554) 30 40 50 60 70 80 pF1KE1 TSRPHITVVEGEPFYLKHCSCSLAHEIETTTKSWYKSSGSQEHVELNPRSSSRIALHDCV : .:: : : . . . .:. . CCDS20 STAAKFSKQSWGLENEALIVRCPRQGKPSYTVDWYYS---QTNKSIPTQERNRVFASGQL 20 30 40 50 60 70 90 100 110 120 130 pF1KE1 LEFWPVELNDTGSYFFQMKN--YTQKWKLNV-IRRNKHSC-FTERQVTSKIVEVKKFFQI :.: :. . :.: : ... ... :: : ... .: . . : . .: .: CCDS20 LKFLPAAVADSGIYTCIVRSPTFNRTGYANVTIYKKQSDCNVPDYLMYSTVSGSEKNSKI 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 pF1KE1 TCENSYYQTLVNSTSLYKNCKKLL---LENNKNPTIKKNAEFEDQGYYSCVHFLHH-NGK : . . . .:::. : . .:. . :. :: : :.: .:.:. :: CCDS20 YCPTIDLYNWTAPLEWFKNCQALQGSRYRAHKSFLVIDNVMTEDAGDYTC-KFIHNENGA 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 LFNITKTFNITIVEDRS-NIVPVLLGPKLNHVA-VELGKNVRLNCSALLNEED----VIY ...: : ..:. .... .. ::. .: :.. ::.:::. :.::: ... .. CCDS20 NYSVTATRSFTVKDEQGFSLFPVIGAPAQNEIKEVEIGKNANLTCSACFGKGTQFLAAVL 200 210 220 230 240 250 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 WMFGEENGSD---PNIHEEKEMRIMTPEGKWHASKVLRIENIGESNLNVLYNCTVASTGG :... . .: : :..:. . .: . :::: .. : .: . :.: . . : CCDS20 WQLNGTKITDFGEPRIQQEEGQNQSFSNGLACLDMVLRIADVKEEDLLLQYDCLALNLHG 260 270 280 290 300 310 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 TDTKSFILVRKADMADIPGHVFTRGMIIAVLILVAVVCLVTVCVIYRVDLVLFYRHLTRR .. : :: : : . . . ..:. . :: . .. .. .:..: ... CCDS20 LRRHTVRLSRKNP---IDHHSIYCIIAVCSVFLMLINVLVIILKMFWIEATLLWRDIAKP 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 DETLTDGKTYDAFVSYLKECRPE-NGE---EHTFAVEILPRVLEKHFGYKLCIFERDVVP .: .::: :::.: : .. . .: :: :. .::: :::.. :: :::. ::..: CCDS20 YKTRNDGKLYDAYVVYPRNYKSSTDGASRVEH-FVHQILPDVLENKCGYTLCIYGRDMLP 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 GGAVVDEIHSLIEKSRRLIIVLSKSYMSN-EVRYELESGLHEALVERKIKIILIEFTPVT : :: ... :.:::: :..:. . : : :: : .:: ::.. :.::::. .. 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