FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9535, 699 aa 1>>>pF1KE9535 699 - 699 aa - 699 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9780+/-0.00127; mu= 11.8233+/- 0.075 mean_var=219.6467+/-71.494, 0's: 0 Z-trim(104.7): 165 B-trim: 898 in 2/49 Lambda= 0.086539 statistics sampled from 7835 (8056) to 7835 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.592), E-opt: 0.2 (0.247), width: 16 Scan time: 3.400 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS1842.1 LHCGR gene_id:3973|Hs108|chr2 ( 699) 4608 589.9 4.3e-168 CCDS1843.1 FSHR gene_id:2492|Hs108|chr2 ( 695) 2284 299.7 9.5e-81 CCDS1844.2 FSHR gene_id:2492|Hs108|chr2 ( 669) 2023 267.1 6e-71 CCDS9872.1 TSHR gene_id:7253|Hs108|chr14 ( 764) 1586 212.6 1.7e-54 CCDS61195.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 ( 835) 690 100.8 8.5e-21 CCDS61194.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 ( 883) 690 100.8 8.8e-21 CCDS9000.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 ( 907) 690 100.9 9e-21 CCDS30972.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 ( 828) 577 86.7 1.5e-16 CCDS1424.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 ( 915) 565 85.3 4.5e-16 CCDS30971.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 ( 967) 565 85.3 4.7e-16 CCDS32131.1 TSHR gene_id:7253|Hs108|chr14 ( 253) 541 81.5 1.7e-15 CCDS55935.1 TSHR gene_id:7253|Hs108|chr14 ( 274) 541 81.6 1.7e-15 CCDS31449.1 LGR4 gene_id:55366|Hs108|chr11 ( 951) 531 81.0 8.7e-15 CCDS75205.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 ( 626) 462 72.2 2.7e-12 CCDS58930.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 ( 724) 462 72.3 2.9e-12 CCDS43276.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 ( 757) 462 72.3 3e-12 CCDS75204.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 ( 784) 462 72.3 3e-12 CCDS58929.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 ( 709) 447 70.4 1.1e-11 CCDS9342.1 RXFP2 gene_id:122042|Hs108|chr13 ( 754) 428 68.0 5.6e-11 >>CCDS1842.1 LHCGR gene_id:3973|Hs108|chr2 (699 aa) initn: 4608 init1: 4608 opt: 4608 Z-score: 3131.3 bits: 589.9 E(32554): 4.3e-168 Smith-Waterman score: 4608; 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CCDS18 MALLLVSLLAFLS--LGSGCHHRICH--CSNRVFLCQESKVTEIPSDLPRNAI-E 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 LSLAYLPVKVIPSQAFRGLNEVIKIEISQIDSLERIEANAFDNLLNLSEILIQNTKNLRY : .. ..:: . :: :.... :::::: : :: :::..:.:: .: :: :....:: : CCDS18 LRFVLTKLRVIQKGAFSGFGDLEKIEISQNDVLEVIEADVFSNLPKLHEIRIEKANNLLY 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 IEPGAFINLPRLKYLSICNTGIRKFPDVTKVFSSESNFILEICDNLHITTIPGNAFQGMN :.: :: ::: :.:: : ::::...::: :. : .. CCDS18 INPEAFQNLPNLQYLLISNTGIKHLPDVHKIHSLQK------------------------ 120 130 140 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 NESVTLKLYGNGFEEVQSHAFNGTTLTSLELKENVHLEKMHNGAFRGATGPKTLDISSTK : : : ::..:... ::::: : :.:..: .::.. : .:.::.:: :::: :. CCDS18 ---VLLWLNKNGIQEIHNCAFNGTQLDELNLSDNNNLEELPNDVFHGASGPVILDISRTR 150 160 170 180 190 200 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 LQALPSYGLESIQRLIATSSYSLKKLPSRETFVNLLEATLTYPSHCCAFRNLPTKEQNFS ...:::::::....: : :.:.:::::. : .: :.::.:::::::::: : . ... CCDS18 IHSLPSYGLENLKKLRARSTYNLKKLPTLEKLVALMEASLTYPSHCCAFANWRRQISELH 210 220 230 240 250 260 300 310 320 330 340 pF1KE9 HSISENFSKQCESTVRKVNNKTLYSSMLAESELS---GWD-----YEYGFCLPKTP-RCA .... .: . . .. .. ::. ..: : :.: ..: .: . :. CCDS18 PICNKSILRQEVDYMTQARGQR--SSLAEDNESSYSRGFDMTYTEFDYDLCNEVVDVTCS 270 280 290 300 310 320 350 360 370 380 390 400 pF1KE9 PEPDAFNPCEDIMGYDFLRVLIWLINILAIMGNMTVLFVLLTSRYKLTVPRFLMCNLSFA :.:::::::::::::..::::::.:.:::: ::. :: .: ::.:::::::::::::.:: CCDS18 PKPDAFNPCEDIMGYNILRVLIWFISILAITGNIIVLVILTTSQYKLTVPRFLMCNLAFA 330 340 350 360 370 380 410 420 430 440 450 460 pF1KE9 DFCMGLYLLLIASVDSQTKGQYYNHAIDWQTGSGCSTAGFFTVFASELSVYTLTVITLER :.:.:.::::::::: .::.::.:.:::::::.::..:::::::::::::::::.::::: CCDS18 DLCIGIYLLLIASVDIHTKSQYHNYAIDWQTGAGCDAAGFFTVFASELSVYTLTAITLER 390 400 410 420 430 440 470 480 490 500 510 520 pF1KE9 WHTITYAIHLDQKLRLRHAILIMLGGWLFSSLIAMLPLVGVSNYMKVSICFPMDVETTLS :::::.:..:: :..:::: .:. ::.:. :..:. :.:.:::::::.:::... :: CCDS18 WHTITHAMQLDCKVQLRHAASVMVMGWIFAFAAALFPIFGISSYMKVSICLPMDIDSPLS 450 460 470 480 490 500 530 540 550 560 570 580 pF1KE9 QVYILTILILNVVAFFIICACYIKIYFAVRNPELMATNKDTKIAKKMAILIFTDFTCMAP :.:....:.:::.:: .::.:::.::..::::.......::.:::.::.:::::: :::: CCDS18 QLYVMSLLVLNVLAFVVICGCYIHIYLTVRNPNIVSSSSDTRIAKRMAMLIFTDFLCMAP 510 520 530 540 550 560 590 600 610 620 630 640 pF1KE9 ISFFAISAAFKVPLITVTNSKVLLVLFYPINSCANPFLYAIFTKTFQRDFFLLLSKFGCC ::::::::..:::::::...:.:::::.::::::::::::::::.:.::::.:::: :: CCDS18 ISFFAISASLKVPLITVSKAKILLVLFHPINSCANPFLYAIFTKNFRRDFFILLSKCGCY 570 580 590 600 610 620 650 660 670 680 690 pF1KE9 KRRAELYRRKDFSA-YTSNCKNGFTGSNKPSQSTLKLSTLHCQGTALLDKTRYTEC . .:..:: . :. .... .:: .: CCDS18 EMQAQIYRTETSSTVHNTHPRNGHCSSAPRVTSGSTYILVPLSHLAQN 630 640 650 660 >>CCDS9872.1 TSHR gene_id:7253|Hs108|chr14 (764 aa) initn: 2057 init1: 1574 opt: 1586 Z-score: 1091.8 bits: 212.6 E(32554): 1.7e-54 Smith-Waterman score: 2238; 52.3% identity (75.8% similar) in 681 aa overlap (33-652:28-707) 10 20 30 40 50 pF1KE9 QRFSALQLLKLLLLLQPPLPRALREALCPEPCNCVPDGALR--C------PGPTAGLTRL ::.: . .: : :. . : CCDS98 MRPADLLQLVLLLDLPRDLGGMGCSSPPCECHQEEDFRVTCKDIQRIPSLPPSTQTL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 SLAYLPVKVIPSQAFRGLNEVIKIEISQID-SLERIEANAFDNLLNLSEILIQNTKNLRY .: ...:::.:: .: .. .: .: :: .:...:...: :: ....: :.::.:: : CCDS98 KLIETHLRTIPSHAFSNLPNISRIYVS-IDVTLQQLESHSFYNLSKVTHIEIRNTRNLTY 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 IEPGAFINLPRLKYLSICNTGIRKFPDVTKVFSSESNFILEICDNLHITTIPGNAFQGMN :.: :. .:: ::.:.: :::.. :::.:::.:.. ::::: :: ..:.:: :::::. CCDS98 IDPDALKELPLLKFLGIFNTGLKMFPDLTKVYSTDIFFILEITDNPYMTSIPVNAFQGLC 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 NESVTLKLYGNGFEEVQSHAFNGTTLTSLELKENVHLEKMHNGAFRGA-TGPKTLDISST ::..:::::.::: ::..::::: : .. :..: .: . . :: :. .::. ::.:.: CCDS98 NETLTLKLYNNGFTSVQGYAFNGTKLDAVYLNKNKYLTVIDKDAFGGVYSGPSLLDVSQT 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 KLQALPSYGLESIQRLIATSSYSLKKLPSRETFVNLLEATLTYPSHCCAFRN-------- .. :::: ::: ...::: ....::::: .:..: .: :.::::::::.: CCDS98 SVTALPSKGLEHLKELIARNTWTLKKLPLSLSFLHLTRADLSYPSHCCAFKNQKKIRGIL 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 pF1KE9 --LPTKE--------------------QNFSHSISENFSKQCE-STVRKVNNKTLYSSML : .: :.. ....... : : . ..:.. : .. CCDS98 ESLMCNESSMQSLRQRKSVNALNSPLHQEYEENLGDSIVGYKEKSKFQDTHNNAHYYVFF 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 pF1KE9 AESE-----------------LSGWD--YEYGFCLPKTPR-CAPEPDAFNPCEDIMGYDF :.: :...: :.: .: . :.:. : :::::::::: : CCDS98 EEQEDEIIGFGQELKNPQEETLQAFDSHYDYTICGDSEDMVCTPKSDEFNPCEDIMGYKF 360 370 380 390 400 410 370 380 390 400 410 420 pF1KE9 LRVLIWLINILAIMGNMTVLFVLLTSRYKLTVPRFLMCNLSFADFCMGLYLLLIASVDSQ ::...:....::..::. ::..::::.:::.:::::::::.:::::::.::::::::: CCDS98 LRIVVWFVSLLALLGNVFVLLILLTSHYKLNVPRFLMCNLAFADFCMGMYLLLIASVDLY 420 430 440 450 460 470 430 440 450 460 470 480 pF1KE9 TKGQYYNHAIDWQTGSGCSTAGFFTVFASELSVYTLTVITLERWHTITYAIHLDQKLRLR :...::::::::::: ::.:::::::::::::::::::::::::..::.:..::.:.::: CCDS98 THSEYYNHAIDWQTGPGCNTAGFFTVFASELSVYTLTVITLERWYAITFAMRLDRKIRLR 480 490 500 510 520 530 490 500 510 520 530 540 pF1KE9 HAILIMLGGWLFSSLIAMLPLVGVSNYMKVSICFPMDVETTLSQVYILTILILNVVAFFI :: ::.:::. :.:.:::::.:.: :::::.:::.:: :. .::. .: ::.::: : CCDS98 HACAIMVGGWVCCFLLALLPLVGISSYAKVSICLPMDTETPLALAYIVFVLTLNIVAFVI 540 550 560 570 580 590 550 560 570 580 590 600 pF1KE9 ICACYIKIYFAVRNPELMATNKDTKIAKKMAILIFTDFTCMAPISFFAISAAFKVPLITV .: ::.:::..::::. .:::::::.::.:::::: :::::::.:.:: .. ::::: CCDS98 VCCCYVKIYITVRNPQYNPGDKDTKIAKRMAVLIFTDFICMAPISFYALSAILNKPLITV 600 610 620 630 640 650 610 620 630 640 650 660 pF1KE9 TNSKVLLVLFYPINSCANPFLYAIFTKTFQRDFFLLLSKFGCCKRRAELYRRKDFSAYTS .:::.:::::::.::::::::::::::.:::: :.:::::: :::.:. :: CCDS98 SNSKILLVLFYPLNSCANPFLYAIFTKAFQRDVFILLSKFGICKRQAQAYRGQRVPPKNS 660 670 680 690 700 710 670 680 690 pF1KE9 NCKNGFTGSNKPSQSTLKLSTLHCQGTALLDKTRYTEC CCDS98 TDIQVQKVTHEMRQGLHNMEDVYELIENSHLTPKKQGQISEEYMQTVL 720 730 740 750 760 >>CCDS61195.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 (835 aa) initn: 654 init1: 400 opt: 690 Z-score: 486.8 bits: 100.8 E(32554): 8.5e-21 Smith-Waterman score: 755; 26.2% identity (59.3% similar) in 668 aa overlap (2-637:107-762) 10 20 pF1KE9 MKQRFSALQLLKLLLLLQPPLPRALREAL-- : :..: ::.:.: . : .. ::: CCDS61 NISQLLPNPLPSLRFLEELRLAGNALTYIPKGAFTGLYSLKVLMLQNNQLRHVPTEALQN 80 90 100 110 120 130 30 40 50 60 70 80 pF1KE9 ------CPEPCNCVPDGALRCPGPTAGLTRLSLAYLPVKVIPSQAFRGLNEVIKIEISQI : . . . .: .: :.: : . .:. :.: :... .. . . CCDS61 LRSLQSLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETLDLNYNNLDEFPT-AIRTLSNLKELGFHS- 140 150 160 170 180 190 90 100 110 120 130 140 pF1KE9 DSLERIEANAFDNLLNLSEILIQNTKN-LRYIEPGAFINLPRLKYLSICNTG-IRKFPDV .... : .:: . : : : :. : .... .:: .::.:. :.. ... : .:::. CCDS61 NNIRSIPEKAF--VGNPSLITIHFYDNPIQFVGRSAFQHLPELRTLTLNGASQITEFPDL 200 210 220 230 240 250 150 160 170 180 pF1KE9 TKVFSSES---------NFILEICD---NLHITTIPGNAFQGMNNESVTLKLYG-----N : . . :: .. .:. ::.. . : .. . . :: :: : CCDS61 TGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLSYNLLEDLPSFSVCQKLQKIDLRHN 260 270 280 290 300 310 190 200 210 220 230 240 pF1KE9 GFEEVQSHAFNGT-TLTSLELKENVHLEKMHNGAFRGATGPKTLDISSTKLQALPSYGLE . :.. .:. .: ::.: : .. .: .:: . ::.::. :...: ::. CCDS61 EIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWN-KIAIIHPNAFSTLPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLH 320 330 340 350 360 370 250 260 270 280 290 300 pF1KE9 SIQRLIATSSYSLKKLPSRETFVNLLEATLTYPSHCCAFRNLPTKEQNFSHSISENFSKQ .. .: :....:..: : :.: .: . : .:::: .: ...::....: CCDS61 GLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCCAFGVC----EN-AYKISNQWNKG 380 390 400 410 420 310 320 330 340 350 pF1KE9 CESTVRKVNNKT--LYSSMLAESELSGW--DYEYGFCLPKTPRCAPEPDAFNPCEDIMGY .:.. ...: ..... : .: . :.: . .. .:.: : :.::: .. CCDS61 DNSSMDDLHKKDAGMFQAQ-DERDLEDFLLDFEEDLKALHSVQCSPSPGPFKPCEHLLDG 430 440 450 460 470 480 360 370 380 390 400 410 pF1KE9 DFLRVLIWLINILAIMGNMTVLFVLLTSRYKLTVPRFLMCNLSFADFCMGLYLLLIASVD ..:. .: : .::. : : ... : .. ..:. .. ... :. ..:.:: CCDS61 WLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRSPLYISPIKLLIGVIAAVNMLTGVSSAVLAGVD 490 500 510 520 530 540 420 430 440 450 460 470 pF1KE9 SQTKGQYYNHAIDWQTGSGCSTAGFFTVFASELSVYTLTVITLERWHTITYAIHLDQKLR . : :.. :. :..: :: . ::...:::: ::. ::. .::: .. :. ... : CCDS61 AFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSVFLLTLAALERGFSVKYSAKFETKAP 550 560 570 580 590 600 480 490 500 510 520 530 pF1KE9 LRHAILIMLGGWLFSSLIAMLPLVGVSNYMKVSICFPMDVETTLSQVYILTILILNVVAF . .:.: :.. .: .::.: :.: .:.:. .. :......:: . : CCDS61 FSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLCLPLPFGEPSTMGYMVALILLNSLCF 610 620 630 640 650 660 540 550 560 570 580 590 pF1KE9 FIICACYIKIYFAVRNPELMATNKDTKIAKKMAILIFTDFTCMAPISFFAISAAFKVPLI ... : :.: . . .: . : ...:..:.:.::. :..:...:. ... .: CCDS61 LMMTIAYTKLYCNLDKGDL-ENIWDCSMVKHIALLLFTNCILNCPVAFLSFSSLINLTFI 670 680 690 700 710 720 600 610 620 630 640 650 pF1KE9 TVTNSKVLLVLFYPINSCANPFLYAIFTKTFQRDFFLLLSKFGCCKRRAELYRRKDFSAY . : .:.. :. .: ::.:: .:. :..:. : CCDS61 SPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLVSLRKQTYVWTRSKHPSLMSINSDD 730 740 750 760 770 780 660 670 680 690 pF1KE9 TSNCKNGFTGSNKPSQSTLKLSTLHCQGTALLDKTRYTEC CCDS61 VEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSSVAFVPCL 790 800 810 820 830 >>CCDS61194.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 (883 aa) initn: 654 init1: 400 opt: 690 Z-score: 486.5 bits: 100.8 E(32554): 8.8e-21 Smith-Waterman score: 758; 26.0% identity (60.9% similar) in 624 aa overlap (37-637:201-810) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 ALQLLKLLLLLQPPLPRALREALCPEPCNCVPDGALRCPGPTAGLTRLSLAYLPVKVIPS .:: :. : ..:. : : .. . . CCDS61 DNALTEIPVQAFRSLSALQAMTLALNKIHHIPDYAF---GNLSSLVVLHLHNNRIHSLGK 180 190 200 210 220 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 QAFRGLNEVIKIEISQIDSLERIEANAFDNLLNLSEILIQNTKNLRYIEPGAFINLPRLK . : ::. . .... ..:... . :. .: ::.:. . .. .... .:: .::.:. CCDS61 KCFDGLHSLETLDLNY-NNLDEFPT-AIRTLSNLKELHFYDNP-IQFVGRSAFQHLPELR 230 240 250 260 270 280 130 140 150 160 170 pF1KE9 YLSICNTG-IRKFPDVTKVFSSES---------NFILEICD---NLHITTIPGNAFQGMN :.. ... : .:::.: . . :: .. .:. ::.. . : .. . CCDS61 TLTLNGASQITEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLSYNLLEDLP 290 300 310 320 330 340 180 190 200 210 220 pF1KE9 NESVTLKLYG-----NGFEEVQSHAFNGT-TLTSLELKENVHLEKMHNGAFRGATGPKTL . :: :: : . :.. .:. .: ::.: : .. .: .:: . : CCDS61 SFSVCQKLQKIDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWN-KIAIIHPNAFSTLPSLIKL 350 360 370 380 390 400 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 DISSTKLQALPSYGLESIQRLIATSSYSLKKLPSRETFVNLLEATLTYPSHCCAFRNLPT :.::. :...: ::... .: :....:..: : :.: .: . : .:::: CCDS61 DLSSNLLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCCAF----G 410 420 430 440 450 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 KEQNFSHSISENFSKQCESTVRKVNNKT--LYSSMLAESELSGW--DYEYGFCLPKTPRC .: ...::....: .:.. ...: ..... : .: . :.: . .. .: CCDS61 VCEN-AYKISNQWNKGDNSSMDDLHKKDAGMFQAQ-DERDLEDFLLDFEEDLKALHSVQC 460 470 480 490 500 510 350 360 370 380 390 400 pF1KE9 APEPDAFNPCEDIMGYDFLRVLIWLINILAIMGNMTVLFVLLTSRYKLTVPRFLMCNLSF .: : :.::: .. ..:. .: : .::. : : ... : .. ..:. .. CCDS61 SPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRSPLYISPIKLLIGVIAA 520 530 540 550 560 570 410 420 430 440 450 460 pF1KE9 ADFCMGLYLLLIASVDSQTKGQYYNHAIDWQTGSGCSTAGFFTVFASELSVYTLTVITLE ... :. ..:.::. : :.. :. :..: :: . ::...:::: ::. ::. .:: CCDS61 VNMLTGVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSVFLLTLAALE 580 590 600 610 620 630 470 480 490 500 510 520 pF1KE9 RWHTITYAIHLDQKLRLRHAILIMLGGWLFSSLIAMLPLVGVSNYMKVSICFPMDVETTL : .. :. ... : . .:.: :.. .: .::.: :.: .:.:. CCDS61 RGFSVKYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLCLPLPFGEPS 640 650 660 670 680 690 530 540 550 560 570 580 pF1KE9 SQVYILTILILNVVAFFIICACYIKIYFAVRNPELMATNKDTKIAKKMAILIFTDFTCMA .. :......:: . :... : :.: . . .: : ...:..:.:.::. CCDS61 TMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDLENI-WDCSMVKHIALLLFTNCILNC 700 710 720 730 740 750 590 600 610 620 630 640 pF1KE9 PISFFAISAAFKVPLITVTNSKVLLVLFYPINSCANPFLYAIFTKTFQRDFFLLLSKFGC :..:...:. ... .:. : .:.. :. .: ::.:: .:. :..:. : CCDS61 PVAFLSFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLVSLRKQTYV 760 770 780 790 800 810 650 660 670 680 690 pF1KE9 CKRRAELYRRKDFSAYTSNCKNGFTGSNKPSQSTLKLSTLHCQGTALLDKTRYTEC CCDS61 WTRSKHPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSS 820 830 840 850 860 870 >>CCDS9000.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 (907 aa) initn: 654 init1: 400 opt: 690 Z-score: 486.4 bits: 100.9 E(32554): 9e-21 Smith-Waterman score: 748; 26.3% identity (60.4% similar) in 619 aa overlap (43-637:228-834) 20 30 40 50 60 70 pF1KE9 LLLLLQPPLPRALREALCPEPCNCVPDGALRCPGPTAGLTRLSLAYLPVKVIPSQAFRGL .: .: :.: : . .:. :.: : CCDS90 IHHIPDYAFGNLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETLDLNYNNLDEFPT-AIRTL 200 210 220 230 240 250 80 90 100 110 120 130 pF1KE9 NEVIKIEISQIDSLERIEANAFDNLLNLSEILIQNTKN-LRYIEPGAFINLPRLKYLSIC ... .. . . .... : .:: . : : : :. : .... .:: .::.:. :.. CCDS90 SNLKELGFHS-NNIRSIPEKAF--VGNPSLITIHFYDNPIQFVGRSAFQHLPELRTLTLN 260 270 280 290 300 310 140 150 160 170 pF1KE9 NTG-IRKFPDVTKVFSSES---------NFILEICD---NLHITTIPGNAFQGMNNESVT ... : .:::.: . . :: .. .:. ::.. . : .. . . :: CCDS90 GASQITEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLSYNLLEDLPSFSVC 320 330 340 350 360 370 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 LKLYG-----NGFEEVQSHAFNGT-TLTSLELKENVHLEKMHNGAFRGATGPKTLDISST :: : . :.. .:. .: ::.: : .. .: .:: . ::.::. CCDS90 QKLQKIDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWN-KIAIIHPNAFSTLPSLIKLDLSSN 380 390 400 410 420 430 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 KLQALPSYGLESIQRLIATSSYSLKKLPSRETFVNLLEATLTYPSHCCAFRNLPTKEQNF :...: ::... .: :....:..: : :.: .: . : .:::: .: CCDS90 LLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCCAF----GVCEN- 440 450 460 470 480 300 310 320 330 340 pF1KE9 SHSISENFSKQCESTVRKVNNKT--LYSSMLAESELSGW--DYEYGFCLPKTPRCAPEPD ...::....: .:.. ...: ..... : .: . :.: . .. .:.: : CCDS90 AYKISNQWNKGDNSSMDDLHKKDAGMFQAQ-DERDLEDFLLDFEEDLKALHSVQCSPSPG 490 500 510 520 530 540 350 360 370 380 390 400 pF1KE9 AFNPCEDIMGYDFLRVLIWLINILAIMGNMTVLFVLLTSRYKLTVPRFLMCNLSFADFCM :.::: .. ..:. .: : .::. : : ... : .. ..:. .. ... CCDS90 PFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRSPLYISPIKLLIGVIAAVNMLT 550 560 570 580 590 600 410 420 430 440 450 460 pF1KE9 GLYLLLIASVDSQTKGQYYNHAIDWQTGSGCSTAGFFTVFASELSVYTLTVITLERWHTI :. ..:.::. : :.. :. :..: :: . ::...:::: ::. ::. .::: .. CCDS90 GVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSVFLLTLAALERGFSV 610 620 630 640 650 660 470 480 490 500 510 520 pF1KE9 TYAIHLDQKLRLRHAILIMLGGWLFSSLIAMLPLVGVSNYMKVSICFPMDVETTLSQVYI :. ... : . .:.: :.. .: .::.: :.: .:.:. .. :. CCDS90 KYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLCLPLPFGEPSTMGYM 670 680 690 700 710 720 530 540 550 560 570 580 pF1KE9 LTILILNVVAFFIICACYIKIYFAVRNPELMATNKDTKIAKKMAILIFTDFTCMAPISFF .....:: . :... : :.: . . .: . : ...:..:.:.::. :..:. CCDS90 VALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDL-ENIWDCSMVKHIALLLFTNCILNCPVAFL 730 740 750 760 770 780 590 600 610 620 630 640 pF1KE9 AISAAFKVPLITVTNSKVLLVLFYPINSCANPFLYAIFTKTFQRDFFLLLSKFGCCKRRA ..:. ... .:. : .:.. :. .: ::.:: .:. :..:. : CCDS90 SFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLVSLRKQTYVWTRSK 790 800 810 820 830 840 650 660 670 680 690 pF1KE9 ELYRRKDFSAYTSNCKNGFTGSNKPSQSTLKLSTLHCQGTALLDKTRYTEC CCDS90 HPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSSVAFVP 850 860 870 880 890 900 >>CCDS30972.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 (828 aa) initn: 373 init1: 188 opt: 577 Z-score: 410.6 bits: 86.7 E(32554): 1.5e-16 Smith-Waterman score: 577; 24.9% identity (57.1% similar) in 662 aa overlap (3-642:65-707) 10 20 30 pF1KE9 MKQRFSALQLLKLLLLLQPPLPRALREALCPE : ::.: ::.:.: . : ::: CCDS30 LTELQPGLFHHLRFLEELRLSGNHLSHIPGQAFSGLYSLKILMLQNNQLGGIPAEALWEL 40 50 60 70 80 90 40 50 60 70 80 pF1KE9 PCNCVPD---GALR-CPGPTAGLTRLS-LAYLP--VKVIPSQAFRGLNEVIKIEISQIDS : : . :. : : ::. :.. .:.:: .:: : : ... . CCDS30 PSLQSLDLNYNKLQEFPVAIRTLGRLQELGFHNNNIKAIPEKAFMG-NPLLQTIHFYDNP 100 110 120 130 140 150 90 100 110 120 130 140 pF1KE9 LERIEANAFDNLLNLSEILIQNTKNLRYIEPGAFINLPRLKYLSICNTGIRKFPDVTKVF .. . .::. : .: . .... ... : . . :. :.. .::: .: . . CCDS30 IQFVGRSAFQYLPKLHTLSLNGAMDIQ--EFPDLKGTTSLEILTLTRAGIRLLP--SGMC 160 170 180 190 200 150 160 170 180 190 200 pF1KE9 SSESNF-ILEICDNLHITTIPGNAFQGMNNESVTLKLYGNGFEEVQSHAFNG-TTLTSLE .. . .::. : .: .: . . .. : . :. : . :. . .:. ..: .:. CCDS30 QQLPRLRVLELSHN-QIEELP-SLHRCQKLEEIGLQ--HNRIWEIGADTFSQLSSLQALD 210 220 230 240 250 260 210 220 230 240 250 260 pF1KE9 LKENVHLEKMHNGAFRGATGPKTLDISSTKLQALPSYGLESIQRLIATSSYSLKKLPSRE :. :. ....: :: . ::.....: .:: :: ....: .. .:.. :.. CCDS30 LSWNA-IRSIHPEAFSTLHSLVKLDLTDNQLTTLPLAGLGGLMHLKLKGNLALSQAFSKD 270 280 290 300 310 320 270 280 290 300 310 pF1KE9 TFVNLLEATLTYPSHCCA-------FRNLPTKEQNFSHSISENFSKQCESTV-RKVNNKT .: .: . : .:: :. : . : .:. ::. . . :...:. 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CCDS30 CDLPRGDFEAV-WDCAMVRHVAWLIFADGLLYCPVAFLSFASMLGLFPVTPEAVKSVLLV 620 630 640 650 660 670 620 630 640 650 660 670 pF1KE9 FYPINSCANPFLYAIFTKTFQRDFFLLLSKFGCCKRRAELYRRKDFSAYTSNCKNGFTGS :. .: ::.:: .:. :. :. : . : CCDS30 VLPLPACLNPLLYLLFNPHFRDDLRRLRPRAGDSGPLAYAAAGELEKSSCDSTQALVAFS 680 690 700 710 720 730 680 690 pF1KE9 NKPSQSTLKLSTLHCQGTALLDKTRYTEC CCDS30 DVDLILEASEAGRPPGLETYGFPSVTLISCQQPGAPRLEGSHCVEPEGNHFGNPQPSMDG 740 750 760 770 780 790 >>CCDS1424.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 (915 aa) initn: 314 init1: 188 opt: 565 Z-score: 402.0 bits: 85.3 E(32554): 4.5e-16 Smith-Waterman score: 565; 24.3% identity (58.6% similar) in 596 aa overlap (61-642:217-794) 40 50 60 70 80 90 pF1KE9 PEPCNCVPDGALRCPGPTAGLTRLSLAYLPVKVIPSQAFRGLNEVIKIEISQIDSLERIE .:.:: .:: : : ... . .. . 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