Result of FASTA (ccds) for pFN21AE0686
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0686, 400 aa
  1>>>pF1KE0686     400 - 400 aa - 400 aa
Library: human.CCDS.faa
  18921897 residues in 33420 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.2916+/-0.00112; mu= -12.8490+/- 0.067
 mean_var=478.3398+/-99.884, 0's: 0 Z-trim(116.5): 491  B-trim: 61 in 1/51
 Lambda= 0.058642
 statistics sampled from 16861 (17408) to 16861 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.793), E-opt: 0.2 (0.521), width:  16
 Scan time:  1.560

The best scores are:                                      opt bits E(33420)
CCDS31001.1 MAPKAPK2 gene_id:9261|Hs109|chr1       ( 400) 2729 244.8 1.1e-64
CCDS1466.1 MAPKAPK2 gene_id:9261|Hs109|chr1        ( 370) 2448 221.0 1.5e-57
CCDS2832.1 MAPKAPK3 gene_id:7867|Hs109|chr3        ( 382) 1762 163.0 4.5e-40
CCDS81286.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs109|chr1        ( 719)  697 73.1 9.4e-13
CCDS284.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs109|chr1          ( 735)  697 73.1 9.5e-13
CCDS30649.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs109|chr1        ( 744)  697 73.1 9.6e-13
CCDS2582.1 CAMK1 gene_id:8536|Hs109|chr3           ( 370)  652 69.0 8.1e-12
CCDS4103.1 CAMK4 gene_id:814|Hs109|chr5            ( 473)  642 68.3 1.7e-11
CCDS1486.1 CAMK1G gene_id:57172|Hs109|chr1         ( 476)  637 67.9 2.3e-11
CCDS14197.1 RPS6KA3 gene_id:6197|Hs109|chrX        ( 740)  635 67.9 3.6e-11
CCDS7092.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs109|chr10        ( 357)  626 66.8 3.6e-11
CCDS7091.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs109|chr10        ( 385)  626 66.9 3.8e-11
CCDS83147.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs109|chr6        ( 644)  619 66.5 8.4e-11
CCDS35503.2 PNCK gene_id:139728|Hs109|chrX         ( 426)  613 65.8 8.8e-11
CCDS5294.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs109|chr6         ( 733)  619 66.5 9.2e-11
CCDS34570.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs109|chr6        ( 741)  619 66.5 9.3e-11
CCDS83148.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs109|chr6        ( 758)  619 66.5 9.4e-11


>>CCDS31001.1 MAPKAPK2 gene_id:9261|Hs109|chr1            (400 aa)
 initn: 2729 init1: 2729 opt: 2729  Z-score: 1275.1  bits: 244.8 E(33420): 1.1e-64
Smith-Waterman score: 2729; 100.0% identity (100.0% similar) in 400 aa overlap (1-400:1-400)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MLSNSQGQSPPVPFPAPAPPPQPPTPALPHPPAQPPPPPPQQFPQFHVKSGLQIKKNAII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MLSNSQGQSPPVPFPAPAPPPQPPTPALPHPPAQPPPPPPQQFPQFHVKSGLQIKKNAII
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 DDYKVTSQVLGLGINGKVLQIFNKRTQEKFALKMLQDCPKARREVELHWRASQCPHIVRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DDYKVTSQVLGLGINGKVLQIFNKRTQEKFALKMLQDCPKARREVELHWRASQCPHIVRI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 VDVYENLYAGRKCLLIVMECLDGGELFSRIQDRGDQAFTEREASEIMKSIGEAIQYLHSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VDVYENLYAGRKCLLIVMECLDGGELFSRIQDRGDQAFTEREASEIMKSIGEAIQYLHSI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 NIAHRDVKPENLLYTSKRPNAILKLTDFGFAKETTSHNSLTTPCYTPYYVAPEVLGPEKY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NIAHRDVKPENLLYTSKRPNAILKLTDFGFAKETTSHNSLTTPCYTPYYVAPEVLGPEKY
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 DKSCDMWSLGVIMYILLCGYPPFYSNHGLAISPGMKTRIRMGQYEFPNPEWSEVSEEVKM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DKSCDMWSLGVIMYILLCGYPPFYSNHGLAISPGMKTRIRMGQYEFPNPEWSEVSEEVKM
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 LIRNLLKTEPTQRMTITEFMNHPWIMQSTKVPQTPLHTSRVLKEDKERWEDVKEEMTSAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LIRNLLKTEPTQRMTITEFMNHPWIMQSTKVPQTPLHTSRVLKEDKERWEDVKEEMTSAL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400
pF1KE0 ATMRVDYEQIKIKKIEDASNPLLLKRRKKARALEAAALAH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ATMRVDYEQIKIKKIEDASNPLLLKRRKKARALEAAALAH
              370       380       390       400

>>CCDS1466.1 MAPKAPK2 gene_id:9261|Hs109|chr1             (370 aa)
 initn: 2448 init1: 2448 opt: 2448  Z-score: 1147.0  bits: 221.0 E(33420): 1.5e-57
Smith-Waterman score: 2448; 100.0% identity (100.0% similar) in 353 aa overlap (1-353:1-353)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MLSNSQGQSPPVPFPAPAPPPQPPTPALPHPPAQPPPPPPQQFPQFHVKSGLQIKKNAII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MLSNSQGQSPPVPFPAPAPPPQPPTPALPHPPAQPPPPPPQQFPQFHVKSGLQIKKNAII
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 DDYKVTSQVLGLGINGKVLQIFNKRTQEKFALKMLQDCPKARREVELHWRASQCPHIVRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DDYKVTSQVLGLGINGKVLQIFNKRTQEKFALKMLQDCPKARREVELHWRASQCPHIVRI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 VDVYENLYAGRKCLLIVMECLDGGELFSRIQDRGDQAFTEREASEIMKSIGEAIQYLHSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VDVYENLYAGRKCLLIVMECLDGGELFSRIQDRGDQAFTEREASEIMKSIGEAIQYLHSI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 NIAHRDVKPENLLYTSKRPNAILKLTDFGFAKETTSHNSLTTPCYTPYYVAPEVLGPEKY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NIAHRDVKPENLLYTSKRPNAILKLTDFGFAKETTSHNSLTTPCYTPYYVAPEVLGPEKY
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 DKSCDMWSLGVIMYILLCGYPPFYSNHGLAISPGMKTRIRMGQYEFPNPEWSEVSEEVKM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DKSCDMWSLGVIMYILLCGYPPFYSNHGLAISPGMKTRIRMGQYEFPNPEWSEVSEEVKM
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 LIRNLLKTEPTQRMTITEFMNHPWIMQSTKVPQTPLHTSRVLKEDKERWEDVKEEMTSAL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::       
CCDS14 LIRNLLKTEPTQRMTITEFMNHPWIMQSTKVPQTPLHTSRVLKEDKERWEDVKGCLHDKN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400
pF1KE0 ATMRVDYEQIKIKKIEDASNPLLLKRRKKARALEAAALAH
                                               
CCDS14 SDQATWLTRL                              
              370                              

>>CCDS2832.1 MAPKAPK3 gene_id:7867|Hs109|chr3             (382 aa)
 initn: 1017 init1: 972 opt: 1762  Z-score: 833.2  bits: 163.0 E(33420): 4.5e-40
Smith-Waterman score: 1768; 70.7% identity (86.2% similar) in 369 aa overlap (21-389:12-368)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MLSNSQGQSPPVPFPAPAPPPQPPTPALPHPPAQPPPPPPQQFPQFHVKSGLQIKKNAII
                           : :: :. :  :.    :  .. :          :: :. 
CCDS28          MDGETAEEQGGPVPP-PVAPGGPGLGGAPGGRREP----------KKYAVT
                        10         20        30                  40

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 DDYKVTSQVLGLGINGKVLQIFNKRTQEKFALKMLQDCPKARREVELHWRASQCPHIVRI
       :::....::::::.:::::. :..:: .: :::.: : ::::.::. ::.::  :::: :
CCDS28 DDYQLSKQVLGLGVNGKVLECFHRRTGQKCALKLLYDSPKARQEVDHHWQASGGPHIVCI
               50        60        70        80        90       100

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 VDVYENLYAGRKCLLIVMECLDGGELFSRIQDRGDQAFTEREASEIMKSIGEAIQYLHSI
       .:::::.. :..::::.:::..:::::::::.:::::::::::.:::..:: :::.::: 
CCDS28 LDVYENMHHGKRCLLIIMECMEGGELFSRIQERGDQAFTEREAAEIMRDIGTAIQFLHSH
              110       120       130       140       150       160

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 NIAHRDVKPENLLYTSKRPNAILKLTDFGFAKETTSHNSLTTPCYTPYYVAPEVLGPEKY
       :::::::::::::::::. .:.::::::::::::: .:.: :::::::::::::::::::
CCDS28 NIAHRDVKPENLLYTSKEKDAVLKLTDFGFAKETT-QNALQTPCYTPYYVAPEVLGPEKY
              170       180       190        200       210         

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 DKSCDMWSLGVIMYILLCGYPPFYSNHGLAISPGMKTRIRMGQYEFPNPEWSEVSEEVKM
       :::::::::::::::::::.:::::: : ::::::: :::.::: :::::::::::..:.
CCDS28 DKSCDMWSLGVIMYILLCGFPPFYSNTGQAISPGMKRRIRLGQYGFPNPEWSEVSEDAKQ
     220       230       240       250       260       270         

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 LIRNLLKTEPTQRMTITEFMNHPWIMQSTKVPQTPLHTSRVLKEDKERWEDVKEEMTSAL
       ::: ::::.::.:.:::.::::::: ::  ::::::::.:::.:::..:..:::::::::
CCDS28 LIRLLLKTDPTERLTITQFMNHPWINQSMVVPQTPLHTARVLQEDKDHWDEVKEEMTSAL
     280       290       300       310       320       330         

              370       380       390       400   
pF1KE0 ATMRVDYEQIKIKKIEDASNPLLLKRRKKARALEAAALAH   
       :::::::.:.::: .. ..: :: :::::              
CCDS28 ATMRVDYDQVKIKDLKTSNNRLLNKRRKKQAGSSSASQGCNNQ
     340       350       360       370       380  

>>CCDS81286.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs109|chr1             (719 aa)
 initn: 623 init1: 206 opt: 697  Z-score: 342.7  bits: 73.1 E(33420): 9.4e-13
Smith-Waterman score: 703; 34.2% identity (66.9% similar) in 366 aa overlap (37-398:377-719)

         10        20        30        40        50        60      
pF1KE0 GQSPPVPFPAPAPPPQPPTPALPHPPAQPPPPPPQQFPQFHVKSGLQIKKNAIIDDYKVT
                                     :  ::  :   : . :.  :: ...:  :.
CCDS81 SPGIPPSAGAHQLFRGFSFVATGLMEDDGKPRAPQA-PLHSVVQQLH-GKNLVFSDGYVV
        350       360       370       380        390        400    

         70        80        90       100        110       120     
pF1KE0 SQVLGLGINGKVLQIFNKRTQEKFALKMLQDCPK-ARREVELHWRASQCPHIVRIVDVYE
       ....:.:  ..  .  .: :. ..:.:...   .   .:.:.  : .: :.:. . :::.
CCDS81 KETIGVGSYSECKRCVHKATNMEYAVKVIDKSKRDPSEEIEILLRYGQHPNIITLKDVYD
          410       420       430       440       450       460    

         130       140       150       160       170       180     
pF1KE0 NLYAGRKCLLIVMECLDGGELFSRIQDRGDQAFTEREASEIMKSIGEAIQYLHSINIAHR
       .   :..  :.. : . ::::...:  .  . :.::::: ....::....:::: ...::
CCDS81 D---GKHVYLVT-ELMRGGELLDKILRQ--KFFSEREASFVLHTIGKTVEYLHSQGVVHR
             470        480         490       500       510        

         190       200        210       220        230       240   
pF1KE0 DVKPENLLYTSKRPNA-ILKLTDFGFAKETTSHNSLT-TPCYTPYYVAPEVLGPEKYDKS
       :.:: :.::...  :   :.. ::::::.  ..:.:  :::::  .::::::  . ::..
CCDS81 DLKPSNILYVDESGNPECLRICDFGFAKQLRAENGLLMTPCYTANFVAPEVLKRQGYDEG
      520       530       540       550       560       570        

           250       260       270        280       290       300  
pF1KE0 CDMWSLGVIMYILLCGYPPFYSNHGLAISPG-MKTRIRMGQYEFPNPEWSEVSEEVKMLI
       ::.::::...: .: :: ::   .: . .:  . :::  :.. . . .:. ::: .: :.
CCDS81 CDIWSLGILLYTMLAGYTPF--ANGPSDTPEEILTRIGSGKFTLSGGNWNTVSETAKDLV
      580       590         600       610       620       630      

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pF1KE0 RNLLKTEPTQRMTITEFMNHPWIMQSTKVPQTPLHTSRVLKEDKERWEDVKEEMTSALAT
        ..:...: ::.:  . ..:::. :. :.::. :        ...  . ::  :... ..
CCDS81 SKMLHVDPHQRLTAKQVLQHPWVTQKDKLPQSQL--------SHQDLQLVKGAMAATYSA
        640       650       660       670               680        

            370       380       390       400
pF1KE0 MRVDYEQIKIKKIEDASNPLLLKRRKKARALEAAALAH
       .  .    ..: ::..   .: .::  .: : ...:  
CCDS81 LNSSKPTPQLKPIESS---ILAQRR--VRKLPSTTL  
      690       700          710             

>>CCDS284.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs109|chr1               (735 aa)
 initn: 623 init1: 206 opt: 697  Z-score: 342.6  bits: 73.1 E(33420): 9.5e-13
Smith-Waterman score: 703; 34.2% identity (66.9% similar) in 366 aa overlap (37-398:393-735)

         10        20        30        40        50        60      
pF1KE0 GQSPPVPFPAPAPPPQPPTPALPHPPAQPPPPPPQQFPQFHVKSGLQIKKNAIIDDYKVT
                                     :  ::  :   : . :.  :: ...:  :.
CCDS28 SPGIPPSAGAHQLFRGFSFVATGLMEDDGKPRAPQA-PLHSVVQQLH-GKNLVFSDGYVV
            370       380       390        400        410       420

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pF1KE0 SQVLGLGINGKVLQIFNKRTQEKFALKMLQDCPK-ARREVELHWRASQCPHIVRIVDVYE
       ....:.:  ..  .  .: :. ..:.:...   .   .:.:.  : .: :.:. . :::.
CCDS28 KETIGVGSYSECKRCVHKATNMEYAVKVIDKSKRDPSEEIEILLRYGQHPNIITLKDVYD
              430       440       450       460       470       480

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pF1KE0 NLYAGRKCLLIVMECLDGGELFSRIQDRGDQAFTEREASEIMKSIGEAIQYLHSINIAHR
       .   :..  :.. : . ::::...:  .  . :.::::: ....::....:::: ...::
CCDS28 D---GKHVYLVT-ELMRGGELLDKILRQ--KFFSEREASFVLHTIGKTVEYLHSQGVVHR
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pF1KE0 DVKPENLLYTSKRPNA-ILKLTDFGFAKETTSHNSLT-TPCYTPYYVAPEVLGPEKYDKS
       :.:: :.::...  :   :.. ::::::.  ..:.:  :::::  .::::::  . ::..
CCDS28 DLKPSNILYVDESGNPECLRICDFGFAKQLRAENGLLMTPCYTANFVAPEVLKRQGYDEG
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pF1KE0 CDMWSLGVIMYILLCGYPPFYSNHGLAISPG-MKTRIRMGQYEFPNPEWSEVSEEVKMLI
       ::.::::...: .: :: ::   .: . .:  . :::  :.. . . .:. ::: .: :.
CCDS28 CDIWSLGILLYTMLAGYTPF--ANGPSDTPEEILTRIGSGKFTLSGGNWNTVSETAKDLV
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pF1KE0 RNLLKTEPTQRMTITEFMNHPWIMQSTKVPQTPLHTSRVLKEDKERWEDVKEEMTSALAT
        ..:...: ::.:  . ..:::. :. :.::. :        ...  . ::  :... ..
CCDS28 SKMLHVDPHQRLTAKQVLQHPWVTQKDKLPQSQL--------SHQDLQLVKGAMAATYSA
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pF1KE0 MRVDYEQIKIKKIEDASNPLLLKRRKKARALEAAALAH
       .  .    ..: ::..   .: .::  .: : ...:  
CCDS28 LNSSKPTPQLKPIESS---ILAQRR--VRKLPSTTL  
          710       720            730       

>>CCDS30649.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs109|chr1             (744 aa)
 initn: 623 init1: 206 opt: 697  Z-score: 342.5  bits: 73.1 E(33420): 9.6e-13
Smith-Waterman score: 703; 34.2% identity (66.9% similar) in 366 aa overlap (37-398:402-744)

         10        20        30        40        50        60      
pF1KE0 GQSPPVPFPAPAPPPQPPTPALPHPPAQPPPPPPQQFPQFHVKSGLQIKKNAIIDDYKVT
                                     :  ::  :   : . :.  :: ...:  :.
CCDS30 SPGIPPSAGAHQLFRGFSFVATGLMEDDGKPRAPQA-PLHSVVQQLH-GKNLVFSDGYVV
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pF1KE0 SQVLGLGINGKVLQIFNKRTQEKFALKMLQDCPK-ARREVELHWRASQCPHIVRIVDVYE
       ....:.:  ..  .  .: :. ..:.:...   .   .:.:.  : .: :.:. . :::.
CCDS30 KETIGVGSYSECKRCVHKATNMEYAVKVIDKSKRDPSEEIEILLRYGQHPNIITLKDVYD
     430       440       450       460       470       480         

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pF1KE0 NLYAGRKCLLIVMECLDGGELFSRIQDRGDQAFTEREASEIMKSIGEAIQYLHSINIAHR
       .   :..  :.. : . ::::...:  .  . :.::::: ....::....:::: ...::
CCDS30 D---GKHVYLVT-ELMRGGELLDKILRQ--KFFSEREASFVLHTIGKTVEYLHSQGVVHR
     490           500       510         520       530       540   

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pF1KE0 DVKPENLLYTSKRPNA-ILKLTDFGFAKETTSHNSLT-TPCYTPYYVAPEVLGPEKYDKS
       :.:: :.::...  :   :.. ::::::.  ..:.:  :::::  .::::::  . ::..
CCDS30 DLKPSNILYVDESGNPECLRICDFGFAKQLRAENGLLMTPCYTANFVAPEVLKRQGYDEG
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pF1KE0 CDMWSLGVIMYILLCGYPPFYSNHGLAISPG-MKTRIRMGQYEFPNPEWSEVSEEVKMLI
       ::.::::...: .: :: ::   .: . .:  . :::  :.. . . .:. ::: .: :.
CCDS30 CDIWSLGILLYTMLAGYTPF--ANGPSDTPEEILTRIGSGKFTLSGGNWNTVSETAKDLV
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pF1KE0 RNLLKTEPTQRMTITEFMNHPWIMQSTKVPQTPLHTSRVLKEDKERWEDVKEEMTSALAT
        ..:...: ::.:  . ..:::. :. :.::. :        ...  . ::  :... ..
CCDS30 SKMLHVDPHQRLTAKQVLQHPWVTQKDKLPQSQL--------SHQDLQLVKGAMAATYSA
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pF1KE0 MRVDYEQIKIKKIEDASNPLLLKRRKKARALEAAALAH
       .  .    ..: ::..   .: .::  .: : ...:  
CCDS30 LNSSKPTPQLKPIESS---ILAQRR--VRKLPSTTL  
           720          730         740      

>>CCDS2582.1 CAMK1 gene_id:8536|Hs109|chr3                (370 aa)
 initn: 623 init1: 399 opt: 652  Z-score: 325.8  bits: 69.0 E(33420): 8.1e-12
Smith-Waterman score: 652; 35.9% identity (67.2% similar) in 323 aa overlap (51-364:7-317)

               30        40        50        60        70        80
pF1KE0 PQPPTPALPHPPAQPPPPPPQQFPQFHVKSGLQIKKNAIIDDYKVTSQVLGLGINGKVLQ
                                     : . :.   : :     .::: :  ..:. 
CCDS25                         MLGAVEGPRWKQAEDIRDIYDFRDVLGTGAFSEVIL
                                       10        20        30      

               90       100       110            120       130     
pF1KE0 IFNKRTQEKFALKMLQDCPKARREVELHWRAS-----QCPHIVRIVDVYENLYAGRKCLL
         .::::.  :.: .       .:  .. . .     . :.:: . :.::.  .:.  : 
CCDS25 AEDKRTQKLVAIKCIAKEALEGKEGSMENEIAVLHKIKHPNIVALDDIYES--GGH--LY
         40        50        60        70        80          90    

         140       150       160       170       180       190     
pF1KE0 IVMECLDGGELFSRIQDRGDQAFTEREASEIMKSIGEAIQYLHSINIAHRDVKPENLLYT
       ..:. ..:::::.:: ..:   .:::.::... .. .:..:::...:.:::.::::::: 
CCDS25 LIMQLVSGGELFDRIVEKG--FYTERDASRLIFQVLDAVKYLHDLGIVHRDLKPENLLYY
            100       110         120       130       140       150

         200       210       220       230       240       250     
pF1KE0 SKRPNAILKLTDFGFAKETTSHNSLTTPCYTPYYVAPEVLGPEKYDKSCDMWSLGVIMYI
       :   .. . ..:::..:     . :.: : :: :::::::. . :.:. : ::.::: ::
CCDS25 SLDEDSKIMISDFGLSKMEDPGSVLSTACGTPGYVAPEVLAQKPYSKAVDCWSIGVIAYI
              160       170       180       190       200       210

         260       270       280       290       300       310     
pF1KE0 LLCGYPPFYSNHGLAISPGMKTRIRMGQYEFPNPEWSEVSEEVKMLIRNLLKTEPTQRMT
       :::::::::...    .  .  .:  ..::: .: :...:. .: .::.:.. .: .:.:
CCDS25 LLCGYPPFYDEN----DAKLFEQILKAEYEFDSPYWDDISDSAKDFIRHLMEKDPEKRFT
              220           230       240       250       260      

         320       330         340         350       360       370 
pF1KE0 ITEFMNHPWIMQSTKVPQTPLH--TSRVLKED--KERWEDVKEEMTSALATMRVDYEQIK
         . ..::::  .: . .. .:  .:. .:..  : .:...  . :...  ::       
CCDS25 CEQALQHPWIAGDTALDKN-IHQSVSEQIKKNFAKSKWKQA-FNATAVVRHMRKLQLGTS
        270       280        290       300        310       320    

             380       390       400                 
pF1KE0 IKKIEDASNPLLLKRRKKARALEAAALAH                 
                                                     
CCDS25 QEGQGQTASHGELLTPVAGGPAAGCCCRDCCVEPGTELSPTLPHQL
          330       340       350       360       370

>>CCDS4103.1 CAMK4 gene_id:814|Hs109|chr5                 (473 aa)
 initn: 596 init1: 385 opt: 642  Z-score: 319.9  bits: 68.3 E(33420): 1.7e-11
Smith-Waterman score: 642; 37.5% identity (66.2% similar) in 296 aa overlap (33-325:19-300)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KE0 SNSQGQSPPVPFPAPAPPPQPPTPALPHPPAQPPPPPPQQFPQFHVKSGLQIKKNAIIDD
                                     :.  :   .  :.. . ..   ...:. : 
CCDS41             MLKVTVPSCSASSCSSVTASAAPGTASLVPDYWIDGS---NRDALSDF
                           10        20        30           40     

             70        80        90          100       110         
pF1KE0 YKVTSQVLGLGINGKVLQIFNKRTQEKFALKMLQ---DCPKARREVELHWRASQCPHIVR
       ..: :. :: : .. : .  .: ::. .:::.:.   :   .: :. .  : :. :.:..
CCDS41 FEVESE-LGRGATSIVYRCKQKGTQKPYALKVLKKTVDKKIVRTEIGVLLRLSH-PNIIK
          50         60        70        80        90        100   

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE0 IVDVYENLYAGRKCLLIVMECLDGGELFSRIQDRGDQAFTEREASEIMKSIGEAIQYLHS
       . ...:.       . .:.: . :::::.:: ..:   ..::.:.. .:.: ::. ::: 
CCDS41 LKEIFET----PTEISLVLELVTGGELFDRIVEKG--YYSERDAADAVKQILEAVAYLHE
           110           120       130         140       150       

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE0 INIAHRDVKPENLLYTSKRPNAILKLTDFGFAKETTSHNSLTTPCYTPYYVAPEVLGPEK
        .:.:::.:::::::..  :.: ::..:::..: .  .  . : : :: : :::.:    
CCDS41 NGIVHRDLKPENLLYATPAPDAPLKIADFGLSKIVEHQVLMKTVCGTPGYCAPEILRGCA
       160       170       180       190       200       210       

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE0 YDKSCDMWSLGVIMYILLCGYPPFYSNHGLAISPGMKTRIRMGQYEFPNPEWSEVSEEVK
       :    ::::.:.: ::::::. :::...:  .   :  ::   .: : .: :.::: ..:
CCDS41 YGPEVDMWSVGIITYILLCGFEPFYDERGDQF---MFRRILNCEYYFISPWWDEVSLNAK
       220       230       240          250       260       270    

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE0 MLIRNLLKTEPTQRMTITEFMNHPWIMQSTKVPQTPLHTSRVLKEDKERWEDVKEEMTSA
        :.:.:.  .: .:.:  . ..:::.                                  
CCDS41 DLVRKLIVLDPKKRLTTFQALQHPWVTGKAANFVHMDTAQKKLQEFNARRKLKAAVKAVV
          280       290       300       310       320       330    

>>CCDS1486.1 CAMK1G gene_id:57172|Hs109|chr1              (476 aa)
 initn: 631 init1: 221 opt: 637  Z-score: 317.6  bits: 67.9 E(33420): 2.3e-11
Smith-Waterman score: 637; 37.0% identity (65.7% similar) in 303 aa overlap (55-348:14-305)

           30        40        50        60        70        80    
pF1KE0 TPALPHPPAQPPPPPPQQFPQFHVKSGLQIKKNAIIDDYKVTSQVLGLGINGKVLQIFNK
                                     :... :    .  .::: :  ..:. . ..
CCDS14                  MGRKEEDDCSSWKKQTTNIRKTFIFMEVLGSGAFSEVFLVKQR
                                10        20        30        40   

           90       100           110       120       130       140
pF1KE0 RTQEKFALKMLQDCPKARR---EVELH-WRASQCPHIVRIVDVYENLYAGRKCLLIVMEC
        : . :::: ..  :  :    : :.   .  .  .:: . :.::.         .::. 
CCDS14 LTGKLFALKCIKKSPAFRDSSLENEIAVLKKIKHENIVTLEDIYEST----THYYLVMQL
            50        60        70        80        90             

              150       160       170       180       190       200
pF1KE0 LDGGELFSRIQDRGDQAFTEREASEIMKSIGEAIQYLHSINIAHRDVKPENLLYTSKRPN
       ..:::::.:: .::  ..::..:: .....  :..:::  .:.:::.::::::: . . :
CCDS14 VSGGELFDRILERG--VYTEKDASLVIQQVLSAVKYLHENGIVHRDLKPENLLYLTPEEN
     100       110         120       130       140       150       

              210       220       230       240       250       260
pF1KE0 AILKLTDFGFAKETTSHNSLTTPCYTPYYVAPEVLGPEKYDKSCDMWSLGVIMYILLCGY
       . . .::::..:   ... ..: : :: :::::::. . :.:. : ::.::: :::::::
CCDS14 SKIMITDFGLSK-MEQNGIMSTACGTPGYVAPEVLAQKPYSKAVDCWSIGVITYILLCGY
       160        170       180       190       200       210      

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pF1KE0 PPFYSNHGLAISPGMKTRIRMGQYEFPNPEWSEVSEEVKMLIRNLLKTEPTQRMTITEFM
       :::: .        .  .:. : ::: .: :...:: .: .: .::. .:..:.:  . .
CCDS14 PPFYEE----TESKLFEKIKEGYYEFESPFWDDISESAKDFICHLLEKDPNERYTCEKAL
        220           230       240       250       260       270  

              330            340       350       360       370     
pF1KE0 NHPWIMQSTKV-----PQTPLHTSRVLKEDKERWEDVKEEMTSALATMRVDYEQIKIKKI
       .::::  .: .     :.. :. .. . ..: :                           
CCDS14 SHPWIDGNTALHRDIYPSVSLQIQKNFAKSKWRQAFNAAAVVHHMRKLHMNLHSPGVRPE
            280       290       300       310       320       330  

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pF1KE0 EDASNPLLLKRRKKARALEAAALAH                                   
                                                                   
CCDS14 VENRPPETQASETSRPSSPEITITEAPVLDHSVALPALTQLPCQHGRRPTAPGGRSLNCL
            340       350       360       370       380       390  

>>CCDS14197.1 RPS6KA3 gene_id:6197|Hs109|chrX             (740 aa)
 initn: 582 init1: 206 opt: 635  Z-score: 314.2  bits: 67.9 E(33420): 3.6e-11
Smith-Waterman score: 635; 37.0% identity (68.2% similar) in 292 aa overlap (53-337:410-691)

             30        40        50          60        70        80
pF1KE0 PPTPALPHPPAQPPPPPPQQFPQFHVKSGLQIKKNAI--IDDYKVTSQVLGLGINGKVLQ
                                     :...:.:   : :.:  .. :.:  .   .
CCDS14 QLFRGFSFVAITSDDESQAMQTVGVHSIVQQLHRNSIQFTDGYEVKEDI-GVGSYSVCKR
     380       390       400       410       420        430        

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pF1KE0 IFNKRTQEKFALKMLQDCPK-ARREVELHWRASQCPHIVRIVDVYENLYAGRKCLLIVME
        ..: :. .::.:...   .   .:.:.  : .: :.:. . :::..   : : . .: :
CCDS14 CIHKATNMEFAVKIIDKSKRDPTEEIEILLRYGQHPNIITLKDVYDD---G-KYVYVVTE
      440       450       460       470       480           490    

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pF1KE0 CLDGGELFSRIQDRGDQAFTEREASEIMKSIGEAIQYLHSINIAHRDVKPENLLYT--SK
        . ::::...:  .  . :.::::: .. .: ....:::. ...:::.:: :.::.  : 
CCDS14 LMKGGELLDKILRQ--KFFSEREASAVLFTITKTVEYLHAQGVVHRDLKPSNILYVDESG
          500         510       520       530       540       550  

       200       210       220        230       240       250      
pF1KE0 RPNAILKLTDFGFAKETTSHNSLT-TPCYTPYYVAPEVLGPEKYDKSCDMWSLGVIMYIL
        :..: .. ::::::.  ..:.:  :::::  .::::::  . :: .::.:::::..: .
CCDS14 NPESI-RICDFGFAKQLRAENGLLMTPCYTANFVAPEVLKRQGYDAACDIWSLGVLLYTM
             560       570       580       590       600       610 

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pF1KE0 LCGYPPFYSNHGLAISPG-MKTRIRMGQYEFPNPEWSEVSEEVKMLIRNLLKTEPTQRMT
       : :: ::   .:   .:  . .::  :.. . .  :. ::. .: :. ..:...: ::.:
CCDS14 LTGYTPF--ANGPDDTPEEILARIGSGKFSLSGGYWNSVSDTAKDLVSKMLHVDPHQRLT
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        .  . ::::..  ..::  :.                                      
CCDS14 AALVLRHPWIVHWDQLPQYQLNRQDAPHLVKGAMAATYSALNRNQSPVLEPVGRSTLAQR
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400 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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