FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB6221, 670 aa 1>>>pF1KB6221 670 - 670 aa - 670 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0893+/-0.000432; mu= 8.2334+/- 0.027 mean_var=217.7780+/-44.570, 0's: 0 Z-trim(118.5): 96 B-trim: 693 in 2/50 Lambda= 0.086910 statistics sampled from 31420 (31545) to 31420 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.709), E-opt: 0.2 (0.37), width: 16 Scan time: 13.340 The best scores are: opt bits E(85289) NP_031374 (OMIM: 605537,616517) cyclic AMP-depende ( 670) 4367 561.0 5.2e-159 XP_006711287 (OMIM: 605537,616517) PREDICTED: cycl ( 669) 4350 558.8 2.3e-158 XP_011507612 (OMIM: 605537,616517) PREDICTED: cycl ( 595) 2846 370.2 1.2e-101 XP_011507611 (OMIM: 605537,616517) PREDICTED: cycl ( 688) 2846 370.3 1.4e-101 XP_011507610 (OMIM: 605537,616517) PREDICTED: cycl ( 689) 2846 370.3 1.4e-101 NP_001129625 (OMIM: 600984) cyclic AMP-dependent t ( 700) 755 108.1 1.2e-22 NP_004372 (OMIM: 600984) cyclic AMP-dependent tran ( 703) 755 108.1 1.2e-22 >>NP_031374 (OMIM: 605537,616517) cyclic AMP-dependent t (670 aa) initn: 4367 init1: 4367 opt: 4367 Z-score: 2975.7 bits: 561.0 E(85289): 5.2e-159 Smith-Waterman score: 4367; 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