Result of FASTA (omim) for pFN21AB6221
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6221, 670 aa
  1>>>pF1KB6221 670 - 670 aa - 670 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0893+/-0.000432; mu= 8.2334+/- 0.027
 mean_var=217.7780+/-44.570, 0's: 0 Z-trim(118.5): 96  B-trim: 693 in 2/50
 Lambda= 0.086910
 statistics sampled from 31420 (31545) to 31420 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.709), E-opt: 0.2 (0.37), width:  16
 Scan time: 13.340

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_031374 (OMIM: 605537,616517) cyclic AMP-depende ( 670) 4367 561.0 5.2e-159
XP_006711287 (OMIM: 605537,616517) PREDICTED: cycl ( 669) 4350 558.8 2.3e-158
XP_011507612 (OMIM: 605537,616517) PREDICTED: cycl ( 595) 2846 370.2 1.2e-101
XP_011507611 (OMIM: 605537,616517) PREDICTED: cycl ( 688) 2846 370.3 1.4e-101
XP_011507610 (OMIM: 605537,616517) PREDICTED: cycl ( 689) 2846 370.3 1.4e-101
NP_001129625 (OMIM: 600984) cyclic AMP-dependent t ( 700)  755 108.1 1.2e-22
NP_004372 (OMIM: 600984) cyclic AMP-dependent tran ( 703)  755 108.1 1.2e-22


>>NP_031374 (OMIM: 605537,616517) cyclic AMP-dependent t  (670 aa)
 initn: 4367 init1: 4367 opt: 4367  Z-score: 2975.7  bits: 561.0 E(85289): 5.2e-159
Smith-Waterman score: 4367; 99.9% identity (100.0% similar) in 670 aa overlap (1-670:1-670)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MGEPAGVAGTMESPFSPGLFHRLDEDWDSALFAELGYFTDTDELQLEAANETYENNFDNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 MGEPAGVAGTMESPFSPGLFHRLDEDWDSALFAELGYFTDTDELQLEAANETYENNFDNL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 DFDLDLVPWESDIWDINNQICTVKDIKAEPQPLSPASSSYSVSSPRSVDSYSSTQHVPEE
       ::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 DFDLDLMPWESDIWDINNQICTVKDIKAEPQPLSPASSSYSVSSPRSVDSYSSTQHVPEE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 LDLSSSSQMSPLSLYGENSNSLSSAEPLKEDKPVTGPRNKTENGLTPKKKIQVNSKPSIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 LDLSSSSQMSPLSLYGENSNSLSSAEPLKEDKPVTGPRNKTENGLTPKKKIQVNSKPSIQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 PKPLLLPAAPKTQTNSSVPAKTIIIQTVPTLMPLAKQQPIISLQPAPTKGQTVLLSQPTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 PKPLLLPAAPKTQTNSSVPAKTIIIQTVPTLMPLAKQQPIISLQPAPTKGQTVLLSQPTV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 VQLQAPGVLPSAQPVLAVAGGVTQLPNHVVNVVPAPSANSPVNGKLSVTKPVLQSTMRNV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 VQLQAPGVLPSAQPVLAVAGGVTQLPNHVVNVVPAPSANSPVNGKLSVTKPVLQSTMRNV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 GSDIAVLRRQQRMIKNRESACQSRKKKKEYMLGLEARLKAALSENEQLKKENGTLKRQLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 GSDIAVLRRQQRMIKNRESACQSRKKKKEYMLGLEARLKAALSENEQLKKENGTLKRQLD
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 EVVSENQRLKVPSPKRRVVCVMIVLAFIILNYGPMSMLEQDSRRMNPSVSPANQRRHLLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 EVVSENQRLKVPSPKRRVVCVMIVLAFIILNYGPMSMLEQDSRRMNPSVSPANQRRHLLG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 FSAKEAQDTSDGIIQKNSYRYDHSVSNDKALMVLTEEPLLYIPPPPCQPLINTTESLRLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 FSAKEAQDTSDGIIQKNSYRYDHSVSNDKALMVLTEEPLLYIPPPPCQPLINTTESLRLN
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB6 HELRGWVHRHEVERTKSRRMTNNQQKTRILQGALEQGSNSQLMAVQYTETTSSISRNSGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 HELRGWVHRHEVERTKSRRMTNNQQKTRILQGALEQGSNSQLMAVQYTETTSSISRNSGS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB6 ELQVYYASPRSYQDFFEAIRRRGDTFYVVSFRRDHLLLPATTHNKTTRPKMSIVLPAINI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 ELQVYYASPRSYQDFFEAIRRRGDTFYVVSFRRDHLLLPATTHNKTTRPKMSIVLPAINI
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB6 NENVINGQDYEVMMQIDCQVMDTRILHIKSSSVPPYLRDQQRNQTNTFFGSPPAATEATH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 NENVINGQDYEVMMQIDCQVMDTRILHIKSSSVPPYLRDQQRNQTNTFFGSPPAATEATH
              610       620       630       640       650       660

              670
pF1KB6 VVSTIPESLQ
       ::::::::::
NP_031 VVSTIPESLQ
              670

>>XP_006711287 (OMIM: 605537,616517) PREDICTED: cyclic A  (669 aa)
 initn: 3475 init1: 3475 opt: 4350  Z-score: 2964.2  bits: 558.8 E(85289): 2.3e-158
Smith-Waterman score: 4350; 99.7% identity (99.9% similar) in 670 aa overlap (1-670:1-669)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MGEPAGVAGTMESPFSPGLFHRLDEDWDSALFAELGYFTDTDELQLEAANETYENNFDNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MGEPAGVAGTMESPFSPGLFHRLDEDWDSALFAELGYFTDTDELQLEAANETYENNFDNL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 DFDLDLVPWESDIWDINNQICTVKDIKAEPQPLSPASSSYSVSSPRSVDSYSSTQHVPEE
       ::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 DFDLDLMPWESDIWDINNQICTVKDIKAEPQPLSPASSSYSVSSPRSVDSYSSTQHVPEE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 LDLSSSSQMSPLSLYGENSNSLSSAEPLKEDKPVTGPRNKTENGLTPKKKIQVNSKPSIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LDLSSSSQMSPLSLYGENSNSLSSAEPLKEDKPVTGPRNKTENGLTPKKKIQVNSKPSIQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 PKPLLLPAAPKTQTNSSVPAKTIIIQTVPTLMPLAKQQPIISLQPAPTKGQTVLLSQPTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PKPLLLPAAPKTQTNSSVPAKTIIIQTVPTLMPLAKQQPIISLQPAPTKGQTVLLSQPTV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 VQLQAPGVLPSAQPVLAVAGGVTQLPNHVVNVVPAPSANSPVNGKLSVTKPVLQSTMRNV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VQLQAPGVLPSAQPVLAVAGGVTQLPNHVVNVVPAPSANSPVNGKLSVTKPVLQSTMRNV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 GSDIAVLRRQQRMIKNRESACQSRKKKKEYMLGLEARLKAALSENEQLKKENGTLKRQLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GSDIAVLRRQQRMIKNRESACQSRKKKKEYMLGLEARLKAALSENEQLKKENGTLKRQLD
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 EVVSENQRLKVPSPKRRVVCVMIVLAFIILNYGPMSMLEQDSRRMNPSVSPANQRRHLLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 EVVSENQRLKVPSPKRRVVCVMIVLAFIILNYGPMSMLEQDSRRMNPSVSPANQRRHLLG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 FSAKEAQDTSDGIIQKNSYRYDHSVSNDKALMVLTEEPLLYIPPPPCQPLINTTESLRLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 FSAKEAQDTSDGIIQKNSYRYDHSVSNDKALMVLTEEPLLYIPPPPCQPLINTTESLRLN
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB6 HELRGWVHRHEVERTKSRRMTNNQQKTRILQGALEQGSNSQLMAVQYTETTSSISRNSGS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
XP_006 HELRGWVHRHEVERTKSRRMTNNQQKTRILQGALEQGSNSQLMAVQYTETTSSI-RNSGS
              490       500       510       520       530          

              550       560       570       580       590       600
pF1KB6 ELQVYYASPRSYQDFFEAIRRRGDTFYVVSFRRDHLLLPATTHNKTTRPKMSIVLPAINI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ELQVYYASPRSYQDFFEAIRRRGDTFYVVSFRRDHLLLPATTHNKTTRPKMSIVLPAINI
     540       550       560       570       580       590         

              610       620       630       640       650       660
pF1KB6 NENVINGQDYEVMMQIDCQVMDTRILHIKSSSVPPYLRDQQRNQTNTFFGSPPAATEATH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 NENVINGQDYEVMMQIDCQVMDTRILHIKSSSVPPYLRDQQRNQTNTFFGSPPAATEATH
     600       610       620       630       640       650         

              670
pF1KB6 VVSTIPESLQ
       ::::::::::
XP_006 VVSTIPESLQ
     660         

>>XP_011507612 (OMIM: 605537,616517) PREDICTED: cyclic A  (595 aa)
 initn: 2846 init1: 2846 opt: 2846  Z-score: 1945.7  bits: 370.2 E(85289): 1.2e-101
Smith-Waterman score: 3682; 96.6% identity (96.8% similar) in 592 aa overlap (1-573:1-592)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MGEPAGVAGTMESPFSPGLFHRLDEDWDSALFAELGYFTDTDELQLEAANETYENNFDNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MGEPAGVAGTMESPFSPGLFHRLDEDWDSALFAELGYFTDTDELQLEAANETYENNFDNL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 DFDLDLVPWESDIWDINNQICTVKDIKAEPQPLSPASSSYSVSSPRSVDSYSSTQHVPEE
       ::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DFDLDLMPWESDIWDINNQICTVKDIKAEPQPLSPASSSYSVSSPRSVDSYSSTQHVPEE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 LDLSSSSQMSPLSLYGENSNSLSSAEPLKEDKPVTGPRNKTENGLTPKKKIQVNSKPSIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LDLSSSSQMSPLSLYGENSNSLSSAEPLKEDKPVTGPRNKTENGLTPKKKIQVNSKPSIQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 PKPLLLPAAPKTQTNSSVPAKTIIIQTVPTLMPLAKQQPIISLQPAPTKGQTVLLSQPTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PKPLLLPAAPKTQTNSSVPAKTIIIQTVPTLMPLAKQQPIISLQPAPTKGQTVLLSQPTV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 VQLQAPGVLPSAQPVLAVAGGVTQLPNHVVNVVPAPSANSPVNGKLSVTKPVLQSTMRNV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VQLQAPGVLPSAQPVLAVAGGVTQLPNHVVNVVPAPSANSPVNGKLSVTKPVLQSTMRNV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 GSDIAVLRRQQRMIKNRESACQSRKKKKEYMLGLEARLKAALSENEQLKKENGTLKRQLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSDIAVLRRQQRMIKNRESACQSRKKKKEYMLGLEARLKAALSENEQLKKENGTLKRQLD
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 EVVSENQRLKVPSPKRRVVCVMIVLAFIILNYGPMSMLEQDSRRMNPSVSPANQRRHLLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EVVSENQRLKVPSPKRRVVCVMIVLAFIILNYGPMSMLEQDSRRMNPSVSPANQRRHLLG
              370       380       390       400       410       420

              430                          440       450       460 
pF1KB6 FSAKEAQDTSDGIIQKNSY-------------------RYDHSVSNDKALMVLTEEPLLY
       :::::::::::::::::::                   ::::::::::::::::::::::
XP_011 FSAKEAQDTSDGIIQKNSYSKLLRNLRYKETNFVHPCFRYDHSVSNDKALMVLTEEPLLY
              430       440       450       460       470       480

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IPPPPCQPLINTTESLRLNHELRGWVHRHEVERTKSRRMTNNQQKTRILQGALEQGSNSQ
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pF1KB6 LMAVQYTETTSSISRNSGSELQVYYASPRSYQDFFEAIRRRGDTFYVVSFRRDHLLLPAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::        
XP_011 LMAVQYTETTSSISRNSGSELQVYYASPRSYQDFFEAIRRRGDTFYVVSFRRLSG     
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pF1KB6 THNKTTRPKMSIVLPAININENVINGQDYEVMMQIDCQVMDTRILHIKSSSVPPYLRDQQ

>>XP_011507611 (OMIM: 605537,616517) PREDICTED: cyclic A  (688 aa)
 initn: 3722 init1: 2846 opt: 2846  Z-score: 1944.9  bits: 370.3 E(85289): 1.4e-101
Smith-Waterman score: 4302; 97.0% identity (97.1% similar) in 689 aa overlap (1-670:1-688)

               10        20        30        40        50        60
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VQLQAPGVLPSAQPVLAVAGGVTQLPNHVVNVVPAPSANSPVNGKLSVTKPVLQSTMRNV
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSDIAVLRRQQRMIKNRESACQSRKKKKEYMLGLEARLKAALSENEQLKKENGTLKRQLD
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EVVSENQRLKVPSPKRRVVCVMIVLAFIILNYGPMSMLEQDSRRMNPSVSPANQRRHLLG
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pF1KB6 FSAKEAQDTSDGIIQKNSY-------------------RYDHSVSNDKALMVLTEEPLLY
       :::::::::::::::::::                   ::::::::::::::::::::::
XP_011 FSAKEAQDTSDGIIQKNSYSKLLRNLRYKETNFVHPCFRYDHSVSNDKALMVLTEEPLLY
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pF1KB6 IPPPPCQPLINTTESLRLNHELRGWVHRHEVERTKSRRMTNNQQKTRILQGALEQGSNSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IPPPPCQPLINTTESLRLNHELRGWVHRHEVERTKSRRMTNNQQKTRILQGALEQGSNSQ
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pF1KB6 LMAVQYTETTSSISRNSGSELQVYYASPRSYQDFFEAIRRRGDTFYVVSFRRDHLLLPAT
       ::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LMAVQYTETTSSI-RNSGSELQVYYASPRSYQDFFEAIRRRGDTFYVVSFRRDHLLLPAT
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pF1KB6 THNKTTRPKMSIVLPAININENVINGQDYEVMMQIDCQVMDTRILHIKSSSVPPYLRDQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 THNKTTRPKMSIVLPAININENVINGQDYEVMMQIDCQVMDTRILHIKSSSVPPYLRDQQ
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             650       660       670
pF1KB6 RNQTNTFFGSPPAATEATHVVSTIPESLQ
       :::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RNQTNTFFGSPPAATEATHVVSTIPESLQ
     660       670       680        

>>XP_011507610 (OMIM: 605537,616517) PREDICTED: cyclic A  (689 aa)
 initn: 2846 init1: 2846 opt: 2846  Z-score: 1944.9  bits: 370.3 E(85289): 1.4e-101
Smith-Waterman score: 4319; 97.1% identity (97.2% similar) in 689 aa overlap (1-670:1-689)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MGEPAGVAGTMESPFSPGLFHRLDEDWDSALFAELGYFTDTDELQLEAANETYENNFDNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MGEPAGVAGTMESPFSPGLFHRLDEDWDSALFAELGYFTDTDELQLEAANETYENNFDNL
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               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 DFDLDLVPWESDIWDINNQICTVKDIKAEPQPLSPASSSYSVSSPRSVDSYSSTQHVPEE
       ::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DFDLDLMPWESDIWDINNQICTVKDIKAEPQPLSPASSSYSVSSPRSVDSYSSTQHVPEE
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              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 LDLSSSSQMSPLSLYGENSNSLSSAEPLKEDKPVTGPRNKTENGLTPKKKIQVNSKPSIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LDLSSSSQMSPLSLYGENSNSLSSAEPLKEDKPVTGPRNKTENGLTPKKKIQVNSKPSIQ
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pF1KB6 PKPLLLPAAPKTQTNSSVPAKTIIIQTVPTLMPLAKQQPIISLQPAPTKGQTVLLSQPTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PKPLLLPAAPKTQTNSSVPAKTIIIQTVPTLMPLAKQQPIISLQPAPTKGQTVLLSQPTV
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VQLQAPGVLPSAQPVLAVAGGVTQLPNHVVNVVPAPSANSPVNGKLSVTKPVLQSTMRNV
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSDIAVLRRQQRMIKNRESACQSRKKKKEYMLGLEARLKAALSENEQLKKENGTLKRQLD
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pF1KB6 EVVSENQRLKVPSPKRRVVCVMIVLAFIILNYGPMSMLEQDSRRMNPSVSPANQRRHLLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EVVSENQRLKVPSPKRRVVCVMIVLAFIILNYGPMSMLEQDSRRMNPSVSPANQRRHLLG
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pF1KB6 FSAKEAQDTSDGIIQKNSY-------------------RYDHSVSNDKALMVLTEEPLLY
       :::::::::::::::::::                   ::::::::::::::::::::::
XP_011 FSAKEAQDTSDGIIQKNSYSKLLRNLRYKETNFVHPCFRYDHSVSNDKALMVLTEEPLLY
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pF1KB6 IPPPPCQPLINTTESLRLNHELRGWVHRHEVERTKSRRMTNNQQKTRILQGALEQGSNSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IPPPPCQPLINTTESLRLNHELRGWVHRHEVERTKSRRMTNNQQKTRILQGALEQGSNSQ
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             530       540       550       560       570       580 
pF1KB6 LMAVQYTETTSSISRNSGSELQVYYASPRSYQDFFEAIRRRGDTFYVVSFRRDHLLLPAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LMAVQYTETTSSISRNSGSELQVYYASPRSYQDFFEAIRRRGDTFYVVSFRRDHLLLPAT
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             590       600       610       620       630       640 
pF1KB6 THNKTTRPKMSIVLPAININENVINGQDYEVMMQIDCQVMDTRILHIKSSSVPPYLRDQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 THNKTTRPKMSIVLPAININENVINGQDYEVMMQIDCQVMDTRILHIKSSSVPPYLRDQQ
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             650       660       670
pF1KB6 RNQTNTFFGSPPAATEATHVVSTIPESLQ
       :::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RNQTNTFFGSPPAATEATHVVSTIPESLQ
              670       680         

>>NP_001129625 (OMIM: 600984) cyclic AMP-dependent trans  (700 aa)
 initn: 1079 init1: 416 opt: 755  Z-score: 527.9  bits: 108.1 E(85289): 1.2e-22
Smith-Waterman score: 1121; 36.4% identity (60.6% similar) in 698 aa overlap (25-666:25-694)

               10        20        30        40        50          
pF1KB6 MGEPAGVAGTMESPFSPGLFHRLDEDWDSALFAELGYFTDTDELQLEAANETYENNFD--
                               :::::.:.. :   .. .. ::    :  .  ::  
NP_001 MAELMLLSEIADPTRFFTDNLLSPEDWDSTLYSGLDEVAE-EQTQLFRCPEQ-DVPFDGS
               10        20        30        40         50         

       60        70        80        90        100        110      
pF1KB6 NLDFDLDLVPWESDIWDINNQICTVKDIKAEPQPLSP-ASSSYSVSSPR-SVDSYSSTQH
       .::  .:. : :   :..   .    :.... .: :: .::: :  : : :..  : .  
NP_001 SLDVGMDVSPSEPP-WEL---LPIFPDLQVKSEPSSPCSSSSLSSESSRLSTEPSSEALG
       60        70            80        90       100       110    

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pF1KB6 VPEELDLSSSSQMSPLSLYGENSNSLSSAEPLKEDK-PVTGPRNKTENGLTPKKKIQ-VN
       : : : ... :   :: : :.. .:  : : .. .  :..   . ... . : .  . ::
NP_001 VGEVLHVKTESLAPPLCLLGDDPTS--SFETVQINVIPTSDDSSDVQTKIEPVSPCSSVN
          120       130         140       150       160       170  

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pF1KB6 SKPSI-----QPKPLLLPAAPKTQTNS---------SVPAKT---IIIQTVPTL-----M
       :. :.     . . ..   . ...:.:         .::: .   . :.  :.:      
NP_001 SEASLLSADSSSQAFIGEEVLEVKTESLSPSGCLLWDVPAPSLGAVQISMGPSLDGSSGK
            180       190       200       210       220       230  

            220       230            240       250       260       
pF1KB6 PLAKQQPIISLQPAPTKGQTVLLSQ---P--TVVQLQAPGVLPSAQPVLAVAGGVTQLPN
        :  ..:   ::: :.   :: . .   :  :.: ::.    : ..::. . :..   :.
NP_001 ALPTRKP--PLQPKPVVLTTVPMPSRAVPPSTTVLLQSLVQPPPVSPVVLIQGAIRVQPE
              240       250       260       270       280       290

       270       280       290       300       310       320       
pF1KB6 HVVNVVPAPSANSPVNGKLSVTKPVLQSTMRNVGSDIAVLRRQQRMIKNRESACQSRKKK
             ::::   :   . :..   . ..      :  .:.::::::::::::::::.::
NP_001 G-----PAPSLPRPE--RKSIVPAPMPGNSCPPEVDAKLLKRQQRMIKNRESACQSRRKK
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NP_004 QPEG-----PAPSLPRPE--RKSIVPAPMPGNSCPPEVDAKLLKRQQRMIKNRESACQSR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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