FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2558, 790 aa 1>>>pF1KE2558 790 - 790 aa - 790 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.5203+/-0.000639; mu= -9.0040+/- 0.038 mean_var=784.4043+/-180.998, 0's: 0 Z-trim(115.8): 714 B-trim: 0 in 0/57 Lambda= 0.045794 statistics sampled from 25757 (26512) to 25757 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.66), E-opt: 0.2 (0.311), width: 16 Scan time: 8.100 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001012331 (OMIM: 155240,191315,256800) high aff ( 790) 5418 375.2 5.9e-103 NP_002520 (OMIM: 155240,191315,256800) high affini ( 796) 5396 373.8 1.6e-102 NP_001007793 (OMIM: 155240,191315,256800) high aff ( 760) 4908 341.5 8e-93 NP_001230030 (OMIM: 191316) NT-3 growth factor rec ( 817) 1748 132.8 5.8e-30 XP_006720607 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 817) 1748 132.8 5.8e-30 XP_016877741 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 448) 1619 123.9 1.6e-27 XP_016877740 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 456) 1619 123.9 1.6e-27 NP_001018074 (OMIM: 600456,613886) BDNF/NT-3 growt ( 822) 1622 124.5 1.9e-27 XP_016870243 (OMIM: 600456,613886) PREDICTED: BDNF ( 822) 1622 124.5 1.9e-27 XP_016870242 (OMIM: 600456,613886) PREDICTED: BDNF ( 822) 1622 124.5 1.9e-27 XP_011517020 (OMIM: 600456,613886) PREDICTED: BDNF ( 822) 1622 124.5 1.9e-27 XP_016870241 (OMIM: 600456,613886) PREDICTED: BDNF ( 822) 1622 124.5 1.9e-27 XP_016877732 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 727) 1619 124.2 2e-27 XP_016877733 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 727) 1619 124.2 2e-27 XP_016877734 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 727) 1619 124.2 2e-27 XP_016877735 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 727) 1619 124.2 2e-27 XP_016877730 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 763) 1619 124.2 2.1e-27 NP_002521 (OMIM: 191316) NT-3 growth factor recept ( 825) 1619 124.3 2.2e-27 XP_006720606 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 825) 1619 124.3 2.2e-27 XP_016877729 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 825) 1619 124.3 2.2e-27 XP_005252060 (OMIM: 600456,613886) PREDICTED: BDNF ( 838) 1615 124.0 2.6e-27 XP_005252061 (OMIM: 600456,613886) PREDICTED: BDNF ( 838) 1615 124.0 2.6e-27 XP_005252058 (OMIM: 600456,613886) PREDICTED: BDNF ( 838) 1615 124.0 2.6e-27 XP_016870240 (OMIM: 600456,613886) PREDICTED: BDNF ( 838) 1615 124.0 2.6e-27 NP_006171 (OMIM: 600456,613886) BDNF/NT-3 growth f ( 838) 1615 124.0 2.6e-27 XP_016877737 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 559) 982 81.9 8.2e-15 XP_016877736 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 604) 980 81.8 9.3e-15 NP_001307064 (OMIM: 191316) NT-3 growth factor rec ( 617) 970 81.2 1.5e-14 XP_006720608 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 715) 970 81.3 1.6e-14 XP_016877731 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 750) 965 81.0 2.1e-14 XP_006720613 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 495) 915 77.4 1.7e-13 XP_006720611 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 528) 907 76.9 2.5e-13 XP_016877738 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 550) 907 77.0 2.5e-13 NP_001307063 (OMIM: 191316) NT-3 growth factor rec ( 567) 907 77.0 2.6e-13 NP_001007157 (OMIM: 191316) NT-3 growth factor rec ( 612) 907 77.0 2.7e-13 XP_011519939 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 612) 907 77.0 2.7e-13 XP_006720612 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 503) 904 76.7 2.8e-13 XP_011519940 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 469) 899 76.3 3.3e-13 XP_016877739 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 482) 899 76.3 3.4e-13 XP_016856866 (OMIM: 602336) PREDICTED: inactive ty ( 874) 861 74.2 2.6e-12 XP_011539828 (OMIM: 602336) PREDICTED: inactive ty ( 874) 861 74.2 2.6e-12 XP_016856865 (OMIM: 602336) PREDICTED: inactive ty ( 917) 861 74.3 2.7e-12 NP_005003 (OMIM: 602336) inactive tyrosine-protein ( 937) 861 74.3 2.7e-12 XP_011519819 (OMIM: 147370,270450) PREDICTED: insu ( 922) 836 72.6 8.5e-12 XP_011519818 (OMIM: 147370,270450) PREDICTED: insu (1064) 836 72.7 9.2e-12 NP_001014796 (OMIM: 191311,271665) discoidin domai ( 855) 832 72.3 9.9e-12 NP_006173 (OMIM: 191311,271665) discoidin domain-c ( 855) 832 72.3 9.9e-12 XP_011507888 (OMIM: 191311,271665) PREDICTED: disc ( 855) 832 72.3 9.9e-12 XP_011507889 (OMIM: 191311,271665) PREDICTED: disc ( 855) 832 72.3 9.9e-12 XP_006711407 (OMIM: 191311,271665) PREDICTED: disc ( 855) 832 72.3 9.9e-12 >>NP_001012331 (OMIM: 155240,191315,256800) high affinit (790 aa) initn: 5418 init1: 5418 opt: 5418 Z-score: 1969.4 bits: 375.2 E(85289): 5.9e-103 Smith-Waterman score: 5418; 99.9% identity (99.9% similar) in 790 aa overlap (1-790:1-790) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MLRGGRRGQLGWHSWAAEPGSLLAWLILASAGAAPCPDACCPHGSSGLRCTRDGALDSLH ::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 MLRGGRRGQLGWHSWAAGPGSLLAWLILASAGAAPCPDACCPHGSSGLRCTRDGALDSLH 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 HLPGAENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGLRFVAPDAFHFTPRLSRL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 HLPGAENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGLRFVAPDAFHFTPRLSRL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 NLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWEEEGLGGVPEQKLQCHGQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 NLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWEEEGLGGVPEQKLQCHGQ 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 GPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEGRGLEQAGWILTELEQSATVMK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 GPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEGRGLEQAGWILTELEQSATVMK 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 SGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVSVQVNVSFPASVQLHTAVEMHHWC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 SGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVSVQVNVSFPASVQLHTAVEMHHWC 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 IPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 IPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 LLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPDTNSTSGDPVEKKDETPFGVSVAVGLAV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 LLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPDTNSTSGDPVEKKDETPFGVSVAVGLAV 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE2 FACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTEGKGSGL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 FACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTEGKGSGL 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE2 QGHIIENPQYFSDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKAL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 QGHIIENPQYFSDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKAL 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE2 KEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 KEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGP 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE2 DAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 DAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKI 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KE2 GDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 GDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQ 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KE2 PWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 PWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQ 730 740 750 760 770 780 790 pF1KE2 APPVYLDVLG :::::::::: NP_001 APPVYLDVLG 790 >>NP_002520 (OMIM: 155240,191315,256800) high affinity n (796 aa) initn: 5404 init1: 2715 opt: 5396 Z-score: 1961.5 bits: 373.8 E(85289): 1.6e-102 Smith-Waterman score: 5396; 99.1% identity (99.1% similar) in 796 aa overlap (1-790:1-796) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MLRGGRRGQLGWHSWAAEPGSLLAWLILASAGAAPCPDACCPHGSSGLRCTRDGALDSLH ::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 MLRGGRRGQLGWHSWAAGPGSLLAWLILASAGAAPCPDACCPHGSSGLRCTRDGALDSLH 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 HLPGAENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGLRFVAPDAFHFTPRLSRL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 HLPGAENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGLRFVAPDAFHFTPRLSRL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 NLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWEEEGLGGVPEQKLQCHGQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 NLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWEEEGLGGVPEQKLQCHGQ 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 GPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEGRGLEQAGWILTELEQSATVMK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 GPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEGRGLEQAGWILTELEQSATVMK 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 SGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVSVQVNVSFPASVQLHTAVEMHHWC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 SGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVSVQVNVSFPASVQLHTAVEMHHWC 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 IPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 IPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 LLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIP------DTNSTSGDPVEKKDETPFGVSV :::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::: NP_002 LLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPVSFSPVDTNSTSGDPVEKKDETPFGVSV 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 AVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 AVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTE 430 440 450 460 470 480 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 GKGSGLQGHIIENPQYFSDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKML :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 GKGSGLQGHIIENPQYFSDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKML 490 500 510 520 530 540 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 VAVKALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 VAVKALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRF 550 560 570 580 590 600 600 610 620 630 640 650 pF1KE2 LRSHGPDAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 LRSHGPDAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQ 610 620 630 640 650 660 660 670 680 690 700 710 pF1KE2 GLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 GLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEI 670 680 690 700 710 720 720 730 740 750 760 770 pF1KE2 FTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHAR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 FTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHAR 730 740 750 760 770 780 780 790 pF1KE2 LQALAQAPPVYLDVLG :::::::::::::::: NP_002 LQALAQAPPVYLDVLG 790 >>NP_001007793 (OMIM: 155240,191315,256800) high affinit (760 aa) initn: 4908 init1: 4908 opt: 4908 Z-score: 1787.4 bits: 341.5 E(85289): 8e-93 Smith-Waterman score: 4908; 99.6% identity (99.7% similar) in 723 aa overlap (68-790:38-760) 40 50 60 70 80 90 pF1KE2 DACCPHGSSGLRCTRDGALDSLHHLPGAENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLT :. :::::::::::::::::::::::::: NP_001 CLAPSVPPILTVKSWDTMQLRAARSRCTNLLAASYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLT 10 20 30 40 50 60 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 IVKSGLRFVAPDAFHFTPRLSRLNLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 IVKSGLRFVAPDAFHFTPRLSRLNLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALR 70 80 90 100 110 120 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 WLQRWEEEGLGGVPEQKLQCHGQGPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 WLQRWEEEGLGGVPEQKLQCHGQGPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQV 130 140 150 160 170 180 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 EGRGLEQAGWILTELEQSATVMKSGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 EGRGLEQAGWILTELEQSATVMKSGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVS 190 200 210 220 230 240 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 VQVNVSFPASVQLHTAVEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 VQVNVSFPASVQLHTAVEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAA 250 260 270 280 290 300 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 NETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPDTNST :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 NETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPDTNST 310 320 330 340 350 360 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 SGDPVEKKDETPFGVSVAVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLAPEDGLA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 SGDPVEKKDETPFGVSVAVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLAPEDGLA 370 380 390 400 410 420 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 MSLHFMTLGGSSLSPTEGKGSGLQGHIIENPQYFSDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 MSLHFMTLGGSSLSPTEGKGSGLQGHIIENPQYFSDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGK 430 440 450 460 470 480 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 VFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 VFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGR 490 500 510 520 530 540 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 PLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 PLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAG 550 560 570 580 590 600 640 650 660 670 680 690 pF1KE2 LHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 LHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRK 610 620 630 640 650 660 700 710 720 730 740 750 pF1KE2 FTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 FTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGC 670 680 690 700 710 720 760 770 780 790 pF1KE2 WQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG ::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 WQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG 730 740 750 760 >>NP_001230030 (OMIM: 191316) NT-3 growth factor recepto (817 aa) initn: 2307 init1: 1020 opt: 1748 Z-score: 658.9 bits: 132.8 E(85289): 5.8e-30 Smith-Waterman score: 2565; 51.6% identity (73.3% similar) in 808 aa overlap (25-790:22-817) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MLRGGRRGQLGWHSWAAEPGSLLAWLILASAGAAPCPDACCPHGSSGLRCTR--DGAL-- :: ... : :: : : ... . : : :: : NP_001 MDVSLCPAKCSFWRIFLLGSVWLDYVGSVLA-CP-ANCVCSKTEINCRRPDDGNLFP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 -----DSLHHLPGA--------ENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGL :: . .: .:.: ..::: . :. :. :.. :..::: .::: NP_001 LLEGQDSGNSNGNASINITDISRNITSIHIENWRSLHTLNAVDMELYTGLQKLTIKNSGL 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 RFVAPDAFHFTPRLSRLNLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWE : . : :: .:.: .::: : : .:::. : :::.:: : : ..::: .::.: :. NP_001 RSIQPRAFAKNPHLRYINLSSNRLTTLSWQLFQTLSLRELQLEQNFFNCSCDIRWMQLWQ 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 pF1KE2 EEGLGGVPEQKLQC----HGQGPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEG :.: . . :.: : .: :: .: ..: .: ..:. : .: ::.... :. : NP_001 EQGEAKLNSQNLYCINADGSQLPLFRMNISQCDLPEISVSHVNLTVREGDNAVITCNGSG 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 RGLEQAGWILTELEQSATVMKSG----GLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAE : .. ::.: : :: .. ... .. ...:::.::::. : ..:: ::: :: .. NP_001 SPLPDVDWIVTGL-QSINTHQTNLNWTNVHAINLTLVNVTSEDNGFTLTCIAENVVGMSN 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 VSVQVNVSFPASV-QLHTA-VEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFL .:: ..: .: : .:. ....: :: : : :.: :.:.:: ::. : :...: .:. NP_001 ASVALTVYYPPRVVSLEEPELRLEH-CIEFVVRGNPPPTLHWLHNGQPLRESKIIHVEYY 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 EPAANETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPD . . . .::: .:.::: :::::::.: ::.: :. .: . :. .:: . .: : NP_001 QEGE---ISEGCLLFNKPTHYNNGNYTLIAKNPLGTANQTINGHFLKEPFPVDEVSPTPP 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 TNSTSGDPVEKKDETPFGVSVAVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRP-AVLAP . : .: .: ::::.:::::.:::..: .:....:: :::.:::.. : ::.. NP_001 ITVT-----HKPEEDTFGVSIAVGLAAFACVLLVVLFVMINKYGRRSKFGMKGPVAVISG 420 430 440 450 460 460 470 480 490 pF1KE2 EDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTE-GKGSGLQGH----IIENPQYFS--------DACVHHI :. : :: .. : .. : . : . . : .::::::: :. :.:: NP_001 EEDSASPLHHINHGITTPSSLDAGPDTVVIGMTRIPVIENPQYFRQGHNCHKPDTYVQHI 470 480 490 500 510 520 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 KRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQREAELLT :::::::: :::::::::::::::.:: : .:::::::::::. . .::.:::::::::: NP_001 KRRDIVLKRELGEGAFGKVFLAECYNLSPTKDKMLVAVKALKDPTLAARKDFQREAELLT 530 540 550 560 570 580 560 570 580 590 600 610 pF1KE2 MLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLLAGGEDV-APGPLGL :::.:::.:.::: .: ::.::::::.:::::.:::.::::: .:. :. : : ::: NP_001 NLQHEHIVKFYGVCGDGDPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAMILVDGQPRQAKGELGL 590 600 610 620 630 640 620 630 640 650 660 670 pF1KE2 GQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVG .:.: .:::.:.::::::. ::::::::::::::: .:.:::::::::::.::::::::: NP_001 SQMLHIASQIASGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGANLLVKIGDFGMSRDVYSTDYYRVG 650 660 670 680 690 700 680 690 700 710 720 730 pF1KE2 GRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGR :.:::::::::::::.:::::::::::::::.::::::::::::.::::::.:.:::::: NP_001 GHTMLPIRWMPPESIMYRKFTTESDVWSFGVILWEIFTYGKQPWFQLSNTEVIECITQGR 710 720 730 740 750 760 740 750 760 770 780 790 pF1KE2 ELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG :::::.:: ::: .: :::::::::: .::... :.::..: :.:::.:: NP_001 VLERPRVCPKEVYDVMLGCWQREPQQRLNIKEIYKILHALGKATPIYLDILG 770 780 790 800 810 >>XP_006720607 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth fac (817 aa) initn: 2307 init1: 1020 opt: 1748 Z-score: 658.9 bits: 132.8 E(85289): 5.8e-30 Smith-Waterman score: 2565; 51.6% identity (73.3% similar) in 808 aa overlap (25-790:22-817) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MLRGGRRGQLGWHSWAAEPGSLLAWLILASAGAAPCPDACCPHGSSGLRCTR--DGAL-- :: ... : :: : : ... . : : :: : XP_006 MDVSLCPAKCSFWRIFLLGSVWLDYVGSVLA-CP-ANCVCSKTEINCRRPDDGNLFP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 -----DSLHHLPGA--------ENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGL :: . .: .:.: ..::: . :. :. :.. :..::: .::: XP_006 LLEGQDSGNSNGNASINITDISRNITSIHIENWRSLHTLNAVDMELYTGLQKLTIKNSGL 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 RFVAPDAFHFTPRLSRLNLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWE : . : :: .:.: .::: : : .:::. : :::.:: : : ..::: .::.: :. XP_006 RSIQPRAFAKNPHLRYINLSSNRLTTLSWQLFQTLSLRELQLEQNFFNCSCDIRWMQLWQ 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 pF1KE2 EEGLGGVPEQKLQC----HGQGPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEG :.: . . :.: : .: :: .: ..: .: ..:. : .: ::.... :. : XP_006 EQGEAKLNSQNLYCINADGSQLPLFRMNISQCDLPEISVSHVNLTVREGDNAVITCNGSG 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 RGLEQAGWILTELEQSATVMKSG----GLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAE : .. ::.: : :: .. ... .. ...:::.::::. : ..:: ::: :: .. XP_006 SPLPDVDWIVTGL-QSINTHQTNLNWTNVHAINLTLVNVTSEDNGFTLTCIAENVVGMSN 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 VSVQVNVSFPASV-QLHTA-VEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFL .:: ..: .: : .:. ....: :: : : :.: :.:.:: ::. : :...: .:. XP_006 ASVALTVYYPPRVVSLEEPELRLEH-CIEFVVRGNPPPTLHWLHNGQPLRESKIIHVEYY 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 EPAANETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPD . . . .::: .:.::: :::::::.: ::.: :. .: . :. .:: . .: : XP_006 QEGE---ISEGCLLFNKPTHYNNGNYTLIAKNPLGTANQTINGHFLKEPFPVDEVSPTPP 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 TNSTSGDPVEKKDETPFGVSVAVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRP-AVLAP . : .: .: ::::.:::::.:::..: .:....:: :::.:::.. : ::.. XP_006 ITVT-----HKPEEDTFGVSIAVGLAAFACVLLVVLFVMINKYGRRSKFGMKGPVAVISG 420 430 440 450 460 460 470 480 490 pF1KE2 EDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTE-GKGSGLQGH----IIENPQYFS--------DACVHHI :. : :: .. : .. : . : . . : .::::::: :. :.:: XP_006 EEDSASPLHHINHGITTPSSLDAGPDTVVIGMTRIPVIENPQYFRQGHNCHKPDTYVQHI 470 480 490 500 510 520 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 KRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQREAELLT :::::::: :::::::::::::::.:: : .:::::::::::. . .::.:::::::::: XP_006 KRRDIVLKRELGEGAFGKVFLAECYNLSPTKDKMLVAVKALKDPTLAARKDFQREAELLT 530 540 550 560 570 580 560 570 580 590 600 610 pF1KE2 MLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLLAGGEDV-APGPLGL :::.:::.:.::: .: ::.::::::.:::::.:::.::::: .:. :. : : ::: XP_006 NLQHEHIVKFYGVCGDGDPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAMILVDGQPRQAKGELGL 590 600 610 620 630 640 620 630 640 650 660 670 pF1KE2 GQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVG .:.: .:::.:.::::::. ::::::::::::::: .:.:::::::::::.::::::::: XP_006 SQMLHIASQIASGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGANLLVKIGDFGMSRDVYSTDYYRVG 650 660 670 680 690 700 680 690 700 710 720 730 pF1KE2 GRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGR :.:::::::::::::.:::::::::::::::.::::::::::::.::::::.:.:::::: XP_006 GHTMLPIRWMPPESIMYRKFTTESDVWSFGVILWEIFTYGKQPWFQLSNTEVIECITQGR 710 720 730 740 750 760 740 750 760 770 780 790 pF1KE2 ELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG :::::.:: ::: .: :::::::::: .::... :.::..: :.:::.:: XP_006 VLERPRVCPKEVYDVMLGCWQREPQQRLNIKEIYKILHALGKATPIYLDILG 770 780 790 800 810 >>XP_016877741 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth fac (448 aa) initn: 1814 init1: 1020 opt: 1619 Z-score: 615.3 bits: 123.9 E(85289): 1.6e-27 Smith-Waterman score: 1819; 64.9% identity (81.8% similar) in 422 aa overlap (384-790:35-448) 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 VNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPDTNSTSGDPVEKKDETPFGVS : .: :: :. : .: :::: XP_016 FMAQPQFMSRLFLGVLDKRSSQPAGAVRVDEVSPTPPITVTH--------KPEEDTFGVS 10 20 30 40 50 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 VAVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRP-AVLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSP .:::::.:::..: .:....:: :::.:::.. : ::.. :. : :: .. : .. : XP_016 IAVGLAAFACVLLVVLFVMINKYGRRSKFGMKGPVAVISGEEDSASPLHHINHGITTPSS 60 70 80 90 100 110 480 490 500 510 pF1KE2 TE-GKGSGLQGH----IIENPQYFS--------DACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVF . : . . : .::::::: :. :.:::::::::: ::::::::::: XP_016 LDAGPDTVVIGMTRIPVIENPQYFRQGHNCHKPDTYVQHIKRRDIVLKRELGEGAFGKVF 120 130 140 150 160 170 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 LAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPL ::::.:: : .:::::::::::. . .::.:::::::::: :::.:::.:.::: .: :: XP_016 LAECYNLSPTKDKMLVAVKALKDPTLAARKDFQREAELLTNLQHEHIVKFYGVCGDGDPL 180 190 200 210 220 230 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 LMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLLAGGEDV-APGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGL .::::::.:::::.:::.::::: .:. :. : : :::.:.: .:::.:.::::::. XP_016 IMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAMILVDGQPRQAKGELGLSQMLHIASQIASGMVYLASQ 240 250 260 270 280 290 640 650 660 670 680 690 pF1KE2 HFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKF ::::::::::::::: .:.:::::::::::.::::::::::.:::::::::::::.:::: XP_016 HFVHRDLATRNCLVGANLLVKIGDFGMSRDVYSTDYYRVGGHTMLPIRWMPPESIMYRKF 300 310 320 330 340 350 700 710 720 730 740 750 pF1KE2 TTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCW :::::::::::.::::::::::::.::::::.:.:::::: :::::.:: ::: .: ::: XP_016 TTESDVWSFGVILWEIFTYGKQPWFQLSNTEVIECITQGRVLERPRVCPKEVYDVMLGCW 360 370 380 390 400 410 760 770 780 790 pF1KE2 QREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG ::::::: .::... :.::..: :.:::.:: XP_016 QREPQQRLNIKEIYKILHALGKATPIYLDILG 420 430 440 >>XP_016877740 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth fac (456 aa) initn: 1814 init1: 1020 opt: 1619 Z-score: 615.2 bits: 123.9 E(85289): 1.6e-27 Smith-Waterman score: 1829; 64.6% identity (81.9% similar) in 426 aa overlap (380-790:36-456) 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 QPTHVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPDTNSTSGDPVEKKDETP :: . :. .: : . : .: .: XP_016 MAQPQFMSRLFLGVLDKRSSQPAGAVRESTDNFILFDEVSPTPPITVT-----HKPEEDT 10 20 30 40 50 60 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 FGVSVAVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRP-AVLAPEDGLAMSLHFMTLGGS ::::.:::::.:::..: .:....:: :::.:::.. : ::.. :. : :: .. : . XP_016 FGVSIAVGLAAFACVLLVVLFVMINKYGRRSKFGMKGPVAVISGEEDSASPLHHINHGIT 70 80 90 100 110 120 470 480 490 500 510 pF1KE2 SLSPTE-GKGSGLQGH----IIENPQYFS--------DACVHHIKRRDIVLKWELGEGAF . : . : . . : .::::::: :. :.:::::::::: ::::::: XP_016 TPSSLDAGPDTVVIGMTRIPVIENPQYFRQGHNCHKPDTYVQHIKRRDIVLKRELGEGAF 130 140 150 160 170 180 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 GKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTE ::::::::.:: : .:::::::::::. . .::.:::::::::: :::.:::.:.::: . XP_016 GKVFLAECYNLSPTKDKMLVAVKALKDPTLAARKDFQREAELLTNLQHEHIVKFYGVCGD 190 200 210 220 230 240 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 GRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLLAGGEDV-APGPLGLGQLLAVASQVAAGMVY : ::.::::::.:::::.:::.::::: .:. :. : : :::.:.: .:::.:.:::: XP_016 GDPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAMILVDGQPRQAKGELGLSQMLHIASQIASGMVY 250 260 270 280 290 300 640 650 660 670 680 690 pF1KE2 LAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESIL ::. ::::::::::::::: .:.:::::::::::.::::::::::.:::::::::::::. XP_016 LASQHFVHRDLATRNCLVGANLLVKIGDFGMSRDVYSTDYYRVGGHTMLPIRWMPPESIM 310 320 330 340 350 360 700 710 720 730 740 750 pF1KE2 YRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIM :::::::::::::::.::::::::::::.::::::.:.:::::: :::::.:: ::: .: XP_016 YRKFTTESDVWSFGVILWEIFTYGKQPWFQLSNTEVIECITQGRVLERPRVCPKEVYDVM 370 380 390 400 410 420 760 770 780 790 pF1KE2 RGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG :::::::::: .::... :.::..: :.:::.:: XP_016 LGCWQREPQQRLNIKEIYKILHALGKATPIYLDILG 430 440 450 >>NP_001018074 (OMIM: 600456,613886) BDNF/NT-3 growth fa (822 aa) initn: 2216 init1: 992 opt: 1622 Z-score: 613.9 bits: 124.5 E(85289): 1.9e-27 Smith-Waterman score: 2488; 49.0% identity (72.6% similar) in 826 aa overlap (12-790:7-822) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MLRGGRRGQLGWHSWAAEPGSLLAWLILASAGAA-PCPDAC-CPHGSSGLRCT--RDGAL ::. : . ::... :: :: .: : ..: . :. : . NP_001 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKC--SASRIWCSDPSPGIV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 DSLHHLPGA---ENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGLRFVAPDAFHF . :.. ::.::..: ::..:. .. :... ::::::: :::.::: :: NP_001 AFPRLEPNSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLK 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 TPRLSRLNLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWEEEGLGGVPE- . :...:.. : : ::: : . :.:.::.: :::. ::: . :.. .: . :. NP_001 NSNLQHINFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAK--SSPDT 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 QKLQCHGQG----PLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEGRGLEQAGWI : : : ... :::.. .::.:. .. .:: .:. : .. : :.: : . . : NP_001 QDLYCLNESSKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWD 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 LTELEQSATVMKSGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVSVQVNVSFPASV . .: .. : :: .: :..:: . :...: ::: ::. . ::...: : .. NP_001 VGNLVSKHMNETSHTQGSLRIT--NISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTI 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 Q-LHTAVEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCLR :.. . :::::::.: :.: :.:.:..::..:::...: :.. ..:.: ::::. NP_001 TFLESPTSDHHWCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKI--HVTNHTEYHGCLQ 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 LNQPTHVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDP-IPDT--------NSTS :..:::.:::.:::.: : .:. .: : :: : . .: ::. . NP_001 LDNPTHMNNGDYTLIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYPDVIYEDYGTAANDI 350 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 pF1KE2 GDPVEKKDETP-FGVSVAVG---LAVFACLFLSTL-------LLVLNKCGRRNKFGINRP :: .....: : :. .: :.:.: . .... .: : : .:..:::.. : NP_001 GDTTNRSNEIPSTDVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFCLLVMLFLLKLARHSKFGMKGP 410 420 430 440 450 460 450 460 470 480 490 pF1KE2 A-VLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTEGKGSGL-----QGHIIENPQYFS--------D : :.. .: : :: .. :... : .:: ... . .:::::::. : NP_001 ASVISNDDDSASPLHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIPVIENPQYFGITNSQLKPD 470 480 490 500 510 520 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 ACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQR . :.::::..:::: :::::::::::::::.:: :::::.:::::.::.::..::.::.: NP_001 TFVQHIKRHNIVLKRELGEGAFGKVFLAECYNLCPEQDKILVAVKTLKDASDNARKDFHR 530 540 550 560 570 580 560 570 580 590 600 610 pF1KE2 EAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLLAGGEDVAP :::::: :::.:::.:.:::.:: ::.::::::.:::::.:::.::::: :.: :. : NP_001 EAELLTNLQHEHIVKFYGVCVEGDPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAVLMAEGNP--P 590 600 610 620 630 640 620 630 640 650 660 670 pF1KE2 GPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYSTD : .:.: .:.:.::::::::. :::::::::::::::..:.:::::::::::.:::: NP_001 TELTQSQMLHIAQQIAAGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGENLLVKIGDFGMSRDVYSTD 650 660 670 680 690 700 680 690 700 710 720 730 pF1KE2 YYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDC ::::::.:::::::::::::.::::::::::::.::::::::::::::::::::.:.:.: NP_001 YYRVGGHTMLPIRWMPPESIMYRKFTTESDVWSLGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNNEVIEC 710 720 730 740 750 760 740 750 760 770 780 790 pF1KE2 ITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG ::::: :.:::.:: ::: .: :::::::..:..:: .:. :: ::.: :::::.:: NP_001 ITQGRVLQRPRTCPQEVYELMLGCWQREPHMRKNIKGIHTLLQNLAKASPVYLDILG 770 780 790 800 810 820 >>XP_016870243 (OMIM: 600456,613886) PREDICTED: BDNF/NT- (822 aa) initn: 2216 init1: 992 opt: 1622 Z-score: 613.9 bits: 124.5 E(85289): 1.9e-27 Smith-Waterman score: 2488; 49.0% identity (72.6% similar) in 826 aa overlap (12-790:7-822) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MLRGGRRGQLGWHSWAAEPGSLLAWLILASAGAA-PCPDAC-CPHGSSGLRCT--RDGAL ::. : . ::... :: :: .: : ..: . :. : . XP_016 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKC--SASRIWCSDPSPGIV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 DSLHHLPGA---ENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGLRFVAPDAFHF . :.. ::.::..: ::..:. .. :... ::::::: :::.::: :: XP_016 AFPRLEPNSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLK 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 TPRLSRLNLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWEEEGLGGVPE- . :...:.. : : ::: : . :.:.::.: :::. ::: . :.. .: . :. XP_016 NSNLQHINFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAK--SSPDT 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 QKLQCHGQG----PLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEGRGLEQAGWI : : : ... :::.. .::.:. .. .:: .:. : .. : :.: : . . : XP_016 QDLYCLNESSKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWD 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 LTELEQSATVMKSGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVSVQVNVSFPASV . .: .. : :: .: :..:: . :...: ::: ::. . ::...: : .. XP_016 VGNLVSKHMNETSHTQGSLRIT--NISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTI 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 Q-LHTAVEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCLR :.. . :::::::.: :.: :.:.:..::..:::...: :.. ..:.: ::::. XP_016 TFLESPTSDHHWCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKI--HVTNHTEYHGCLQ 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 LNQPTHVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDP-IPDT--------NSTS :..:::.:::.:::.: : .:. .: : :: : . .: ::. . XP_016 LDNPTHMNNGDYTLIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYPDVIYEDYGTAANDI 350 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 pF1KE2 GDPVEKKDETP-FGVSVAVG---LAVFACLFLSTL-------LLVLNKCGRRNKFGINRP :: .....: : :. .: :.:.: . .... .: : : .:..:::.. : XP_016 GDTTNRSNEIPSTDVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFCLLVMLFLLKLARHSKFGMKGP 410 420 430 440 450 460 450 460 470 480 490 pF1KE2 A-VLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTEGKGSGL-----QGHIIENPQYFS--------D : :.. .: : :: .. :... : .:: ... . .:::::::. : XP_016 ASVISNDDDSASPLHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIPVIENPQYFGITNSQLKPD 470 480 490 500 510 520 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 ACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQR . :.::::..:::: :::::::::::::::.:: :::::.:::::.::.::..::.::.: XP_016 TFVQHIKRHNIVLKRELGEGAFGKVFLAECYNLCPEQDKILVAVKTLKDASDNARKDFHR 530 540 550 560 570 580 560 570 580 590 600 610 pF1KE2 EAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLLAGGEDVAP :::::: :::.:::.:.:::.:: ::.::::::.:::::.:::.::::: :.: :. : XP_016 EAELLTNLQHEHIVKFYGVCVEGDPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAVLMAEGNP--P 590 600 610 620 630 640 620 630 640 650 660 670 pF1KE2 GPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYSTD : .:.: .:.:.::::::::. :::::::::::::::..:.:::::::::::.:::: XP_016 TELTQSQMLHIAQQIAAGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGENLLVKIGDFGMSRDVYSTD 650 660 670 680 690 700 680 690 700 710 720 730 pF1KE2 YYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDC ::::::.:::::::::::::.::::::::::::.::::::::::::::::::::.:.:.: XP_016 YYRVGGHTMLPIRWMPPESIMYRKFTTESDVWSLGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNNEVIEC 710 720 730 740 750 760 740 750 760 770 780 790 pF1KE2 ITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG ::::: :.:::.:: ::: .: :::::::..:..:: .:. :: ::.: :::::.:: XP_016 ITQGRVLQRPRTCPQEVYELMLGCWQREPHMRKNIKGIHTLLQNLAKASPVYLDILG 770 780 790 800 810 820 >>XP_016870242 (OMIM: 600456,613886) PREDICTED: BDNF/NT- (822 aa) initn: 2216 init1: 992 opt: 1622 Z-score: 613.9 bits: 124.5 E(85289): 1.9e-27 Smith-Waterman score: 2488; 49.0% identity (72.6% similar) in 826 aa overlap (12-790:7-822) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MLRGGRRGQLGWHSWAAEPGSLLAWLILASAGAA-PCPDAC-CPHGSSGLRCT--RDGAL ::. : . ::... :: :: .: : ..: . :. : . XP_016 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKC--SASRIWCSDPSPGIV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 DSLHHLPGA---ENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGLRFVAPDAFHF . :.. ::.::..: ::..:. .. :... ::::::: :::.::: :: XP_016 AFPRLEPNSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLK 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 TPRLSRLNLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWEEEGLGGVPE- . :...:.. : : ::: : . :.:.::.: :::. ::: . :.. .: . :. XP_016 NSNLQHINFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAK--SSPDT 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 QKLQCHGQG----PLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEGRGLEQAGWI : : : ... :::.. .::.:. .. .:: .:. : .. : :.: : . . : XP_016 QDLYCLNESSKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWD 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 LTELEQSATVMKSGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVSVQVNVSFPASV . .: .. : :: .: :..:: . :...: ::: ::. . ::...: : .. XP_016 VGNLVSKHMNETSHTQGSLRIT--NISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTI 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 Q-LHTAVEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCLR :.. . :::::::.: :.: :.:.:..::..:::...: :.. ..:.: ::::. XP_016 TFLESPTSDHHWCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKI--HVTNHTEYHGCLQ 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 LNQPTHVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDP-IPDT--------NSTS :..:::.:::.:::.: : .:. .: : :: : . .: ::. . XP_016 LDNPTHMNNGDYTLIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYPDVIYEDYGTAANDI 350 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 pF1KE2 GDPVEKKDETP-FGVSVAVG---LAVFACLFLSTL-------LLVLNKCGRRNKFGINRP :: .....: : :. .: :.:.: . .... .: : : .:..:::.. : XP_016 GDTTNRSNEIPSTDVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFCLLVMLFLLKLARHSKFGMKGP 410 420 430 440 450 460 450 460 470 480 490 pF1KE2 A-VLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTEGKGSGL-----QGHIIENPQYFS--------D : :.. .: : :: .. :... : .:: ... . .:::::::. : XP_016 ASVISNDDDSASPLHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIPVIENPQYFGITNSQLKPD 470 480 490 500 510 520 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 ACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQR . :.::::..:::: :::::::::::::::.:: :::::.:::::.::.::..::.::.: XP_016 TFVQHIKRHNIVLKRELGEGAFGKVFLAECYNLCPEQDKILVAVKTLKDASDNARKDFHR 530 540 550 560 570 580 560 570 580 590 600 610 pF1KE2 EAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLLAGGEDVAP :::::: :::.:::.:.:::.:: ::.::::::.:::::.:::.::::: :.: :. : XP_016 EAELLTNLQHEHIVKFYGVCVEGDPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAVLMAEGNP--P 590 600 610 620 630 640 620 630 640 650 660 670 pF1KE2 GPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYSTD : .:.: .:.:.::::::::. :::::::::::::::..:.:::::::::::.:::: XP_016 TELTQSQMLHIAQQIAAGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGENLLVKIGDFGMSRDVYSTD 650 660 670 680 690 700 680 690 700 710 720 730 pF1KE2 YYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDC ::::::.:::::::::::::.::::::::::::.::::::::::::::::::::.:.:.: XP_016 YYRVGGHTMLPIRWMPPESIMYRKFTTESDVWSLGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNNEVIEC 710 720 730 740 750 760 740 750 760 770 780 790 pF1KE2 ITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG ::::: :.:::.:: ::: .: :::::::..:..:: .:. :: ::.: :::::.:: XP_016 ITQGRVLQRPRTCPQEVYELMLGCWQREPHMRKNIKGIHTLLQNLAKASPVYLDILG 770 780 790 800 810 820 790 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 10:50:45 2016 done: Tue Nov 8 10:50:46 2016 Total Scan time: 8.100 Total Display time: 0.140 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]