Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2558
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2558, 790 aa
1>>>pF1KE2558 790 - 790 aa - 790 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.2802+/-0.00142; mu= -9.3709+/- 0.080
mean_var=516.0974+/-120.389, 0's: 0 Z-trim(108.4): 284 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.056456
statistics sampled from 9925 (10188) to 9925 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.667), E-opt: 0.2 (0.313), width: 16
Scan time: 3.000
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS30891.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 790) 5418 457.7 3.4e-128
CCDS1161.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 796) 5396 455.9 1.2e-127
CCDS30890.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 760) 4908 416.1 1.1e-115
CCDS58399.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 817) 1748 158.8 3.3e-38
CCDS35050.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 822) 1622 148.5 4.1e-35
CCDS10340.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 825) 1619 148.3 4.9e-35
CCDS6671.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 838) 1615 148.0 6.2e-35
CCDS81916.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 617) 970 95.3 3.3e-19
CCDS32323.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 612) 907 90.1 1.2e-17
CCDS626.1 ROR1 gene_id:4919|Hs108|chr1 ( 937) 861 86.6 2e-16
CCDS1241.1 DDR2 gene_id:4921|Hs108|chr1 ( 855) 832 84.2 9.9e-16
CCDS73785.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1366) 836 84.8 1.1e-15
CCDS10378.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1367) 836 84.8 1.1e-15
CCDS35053.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 477) 816 82.6 1.7e-15
CCDS35052.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 537) 816 82.7 1.8e-15
CCDS35051.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 553) 816 82.7 1.9e-15
CCDS42487.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1370) 813 82.9 3.9e-15
CCDS12176.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1382) 813 82.9 3.9e-15
CCDS1160.1 INSRR gene_id:3645|Hs108|chr1 (1297) 812 82.8 4e-15
CCDS75419.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 767) 796 81.2 7e-15
CCDS4410.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 802) 796 81.2 7.3e-15
CCDS4690.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 876) 796 81.3 7.7e-15
CCDS56411.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 894) 796 81.3 7.8e-15
CCDS34385.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 913) 796 81.3 7.9e-15
CCDS6691.1 ROR2 gene_id:4920|Hs108|chr9 ( 943) 795 81.2 8.5e-15
CCDS33172.1 ALK gene_id:238|Hs108|chr2 (1620) 792 81.3 1.4e-14
CCDS10078.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 ( 803) 781 80.0 1.7e-14
CCDS10077.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 ( 864) 781 80.1 1.8e-14
CCDS47396.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 919) 765 78.8 4.6e-14
CCDS3353.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 806) 763 78.5 4.7e-14
CCDS54706.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 808) 753 77.7 8.3e-14
CCDS45237.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 ( 734) 733 76.1 2.4e-13
CCDS4411.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 762) 733 76.1 2.5e-13
CCDS78096.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 734) 730 75.8 2.8e-13
CCDS55221.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 812) 731 75.9 2.9e-13
CCDS55222.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 731 76.0 2.9e-13
CCDS4886.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 ( 940) 730 75.9 3.3e-13
CCDS4887.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1014) 730 76.0 3.5e-13
CCDS4885.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1030) 730 76.0 3.5e-13
CCDS43731.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 731) 726 75.5 3.6e-13
CCDS43730.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 733) 726 75.5 3.6e-13
CCDS4884.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1070) 730 76.0 3.6e-13
CCDS59021.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1078) 730 76.0 3.6e-13
CCDS43732.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 726 75.5 3.8e-13
CCDS6107.2 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 822) 726 75.5 3.8e-13
CCDS55223.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 853) 726 75.6 3.9e-13
CCDS5116.1 ROS1 gene_id:6098|Hs108|chr6 (2347) 732 76.6 5.3e-13
CCDS3354.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 694) 704 73.7 1.2e-12
CCDS44488.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 680) 703 73.6 1.2e-12
CCDS44486.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 709) 703 73.6 1.3e-12
>>CCDS30891.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 (790 aa)
initn: 5418 init1: 5418 opt: 5418 Z-score: 2415.0 bits: 457.7 E(32554): 3.4e-128
Smith-Waterman score: 5418; 99.9% identity (99.9% similar) in 790 aa overlap (1-790:1-790)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MLRGGRRGQLGWHSWAAEPGSLLAWLILASAGAAPCPDACCPHGSSGLRCTRDGALDSLH
::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MLRGGRRGQLGWHSWAAGPGSLLAWLILASAGAAPCPDACCPHGSSGLRCTRDGALDSLH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 HLPGAENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGLRFVAPDAFHFTPRLSRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 HLPGAENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGLRFVAPDAFHFTPRLSRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 NLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWEEEGLGGVPEQKLQCHGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 NLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWEEEGLGGVPEQKLQCHGQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 GPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEGRGLEQAGWILTELEQSATVMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 GPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEGRGLEQAGWILTELEQSATVMK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 SGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVSVQVNVSFPASVQLHTAVEMHHWC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVSVQVNVSFPASVQLHTAVEMHHWC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 IPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 IPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPDTNSTSGDPVEKKDETPFGVSVAVGLAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPDTNSTSGDPVEKKDETPFGVSVAVGLAV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 FACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTEGKGSGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 FACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTEGKGSGL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 QGHIIENPQYFSDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QGHIIENPQYFSDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKAL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 KEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 KEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 DAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 GDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 GDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 PWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQ
730 740 750 760 770 780
790
pF1KE2 APPVYLDVLG
::::::::::
CCDS30 APPVYLDVLG
790
>>CCDS1161.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 (796 aa)
initn: 5404 init1: 2715 opt: 5396 Z-score: 2405.2 bits: 455.9 E(32554): 1.2e-127
Smith-Waterman score: 5396; 99.1% identity (99.1% similar) in 796 aa overlap (1-790:1-796)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MLRGGRRGQLGWHSWAAEPGSLLAWLILASAGAAPCPDACCPHGSSGLRCTRDGALDSLH
::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MLRGGRRGQLGWHSWAAGPGSLLAWLILASAGAAPCPDACCPHGSSGLRCTRDGALDSLH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 HLPGAENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGLRFVAPDAFHFTPRLSRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HLPGAENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGLRFVAPDAFHFTPRLSRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 NLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWEEEGLGGVPEQKLQCHGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWEEEGLGGVPEQKLQCHGQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 GPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEGRGLEQAGWILTELEQSATVMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEGRGLEQAGWILTELEQSATVMK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 SGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVSVQVNVSFPASVQLHTAVEMHHWC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVSVQVNVSFPASVQLHTAVEMHHWC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 IPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE2 LLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIP------DTNSTSGDPVEKKDETPFGVSV
:::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS11 LLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPVSFSPVDTNSTSGDPVEKKDETPFGVSV
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 AVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTE
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 GKGSGLQGHIIENPQYFSDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GKGSGLQGHIIENPQYFSDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKML
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 VAVKALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VAVKALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRF
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 LRSHGPDAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LRSHGPDAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQ
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 GLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEI
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 FTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHAR
730 740 750 760 770 780
780 790
pF1KE2 LQALAQAPPVYLDVLG
::::::::::::::::
CCDS11 LQALAQAPPVYLDVLG
790
>>CCDS30890.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 (760 aa)
initn: 4908 init1: 4908 opt: 4908 Z-score: 2190.7 bits: 416.1 E(32554): 1.1e-115
Smith-Waterman score: 4908; 99.6% identity (99.7% similar) in 723 aa overlap (68-790:38-760)
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 DACCPHGSSGLRCTRDGALDSLHHLPGAENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLT
:. ::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 CLAPSVPPILTVKSWDTMQLRAARSRCTNLLAASYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLT
10 20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 IVKSGLRFVAPDAFHFTPRLSRLNLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 IVKSGLRFVAPDAFHFTPRLSRLNLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALR
70 80 90 100 110 120
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 WLQRWEEEGLGGVPEQKLQCHGQGPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 WLQRWEEEGLGGVPEQKLQCHGQGPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQV
130 140 150 160 170 180
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 EGRGLEQAGWILTELEQSATVMKSGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 EGRGLEQAGWILTELEQSATVMKSGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVS
190 200 210 220 230 240
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 VQVNVSFPASVQLHTAVEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VQVNVSFPASVQLHTAVEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAA
250 260 270 280 290 300
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 NETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPDTNST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 NETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPDTNST
310 320 330 340 350 360
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 SGDPVEKKDETPFGVSVAVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLAPEDGLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SGDPVEKKDETPFGVSVAVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLAPEDGLA
370 380 390 400 410 420
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 MSLHFMTLGGSSLSPTEGKGSGLQGHIIENPQYFSDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MSLHFMTLGGSSLSPTEGKGSGLQGHIIENPQYFSDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGK
430 440 450 460 470 480
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 VFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGR
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580 590 600 610 620 630
pF1KE2 PLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAG
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640 650 660 670 680 690
pF1KE2 LHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRK
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700 710 720 730 740 750
pF1KE2 FTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 FTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGC
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760 770 780 790
pF1KE2 WQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 WQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG
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10 20 30 40 50
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:: ... : :: : : ... . : : :: :
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:: . .: .:.: ..::: . :. :. :.. :..::: .:::
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: . : :: .:.: .::: : : .:::. : :::.:: : : ..::: .::.: :.
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120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
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:.: . . :.: : .: :: .: ..: .: ..:. : .: ::.... :. :
CCDS58 EQGEAKLNSQNLYCINADGSQLPLFRMNISQCDLPEISVSHVNLTVREGDNAVITCNGSG
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220 230 240 250 260 270
pF1KE2 RGLEQAGWILTELEQSATVMKSG----GLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAE
: .. ::.: : :: .. ... .. ...:::.::::. : ..:: ::: :: ..
CCDS58 SPLPDVDWIVTGL-QSINTHQTNLNWTNVHAINLTLVNVTSEDNGFTLTCIAENVVGMSN
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280 290 300 310 320 330
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.:: ..: .: : .:. ....: :: : : :.: :.:.:: ::. : :...: .:.
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340 350 360 370 380 390
pF1KE2 EPAANETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPD
. . . .::: .:.::: :::::::.: ::.: :. .: . :. .:: . .: :
CCDS58 QEGE---ISEGCLLFNKPTHYNNGNYTLIAKNPLGTANQTINGHFLKEPFPVDEVSPTPP
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 TNSTSGDPVEKKDETPFGVSVAVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRP-AVLAP
. : .: .: ::::.:::::.:::..: .:....:: :::.:::.. : ::..
CCDS58 ITVT-----HKPEEDTFGVSIAVGLAAFACVLLVVLFVMINKYGRRSKFGMKGPVAVISG
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460 470 480 490
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:. : :: .. : .. : . : . . : .::::::: :. :.::
CCDS58 EEDSASPLHHINHGITTPSSLDAGPDTVVIGMTRIPVIENPQYFRQGHNCHKPDTYVQHI
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500 510 520 530 540 550
pF1KE2 KRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQREAELLT
:::::::: :::::::::::::::.:: : .:::::::::::. . .::.::::::::::
CCDS58 KRRDIVLKRELGEGAFGKVFLAECYNLSPTKDKMLVAVKALKDPTLAARKDFQREAELLT
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560 570 580 590 600 610
pF1KE2 MLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLLAGGEDV-APGPLGL
:::.:::.:.::: .: ::.::::::.:::::.:::.::::: .:. :. : : :::
CCDS58 NLQHEHIVKFYGVCGDGDPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAMILVDGQPRQAKGELGL
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620 630 640 650 660 670
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.:.: .:::.:.::::::. ::::::::::::::: .:.:::::::::::.:::::::::
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680 690 700 710 720 730
pF1KE2 GRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGR
:.:::::::::::::.:::::::::::::::.::::::::::::.::::::.:.::::::
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740 750 760 770 780 790
pF1KE2 ELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG
:::::.:: ::: .: :::::::::: .::... :.::..: :.:::.::
CCDS58 VLERPRVCPKEVYDVMLGCWQREPQQRLNIKEIYKILHALGKATPIYLDILG
770 780 790 800 810
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pF1KE2 TPRLSRLNLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWEEEGLGGVPE-
. :...:.. : : ::: : . :.:.::.: :::. ::: . :.. .: . :.
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: : : ... :::.. .::.:. .. .:: .:. : .. : :.: : . . :
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pF1KE2 LTELEQSATVMKSGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVSVQVNVSFPASV
. .: .. : :: .: :..:: . :...: ::: ::. . ::...: : ..
CCDS35 VGNLVSKHMNETSHTQGSLRIT--NISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTI
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:.. . :::::::.: :.: :.:.:..::..:::...: :.. ..:.: ::::.
CCDS35 TFLESPTSDHHWCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKI--HVTNHTEYHGCLQ
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:..:::.:::.:::.: : .:. .: : :: : . .: ::. .
CCDS35 LDNPTHMNNGDYTLIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYPDVIYEDYGTAANDI
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pF1KE2 GDPVEKKDETP-FGVSVAVG---LAVFACLFLSTL-------LLVLNKCGRRNKFGINRP
:: .....: : :. .: :.:.: . .... .: : : .:..:::.. :
CCDS35 GDTTNRSNEIPSTDVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFCLLVMLFLLKLARHSKFGMKGP
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450 460 470 480 490
pF1KE2 A-VLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTEGKGSGL-----QGHIIENPQYFS--------D
: :.. .: : :: .. :... : .:: ... . .:::::::. :
CCDS35 ASVISNDDDSASPLHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIPVIENPQYFGITNSQLKPD
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pF1KE2 ACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQR
. :.::::..:::: :::::::::::::::.:: :::::.:::::.::.::..::.::.:
CCDS35 TFVQHIKRHNIVLKRELGEGAFGKVFLAECYNLCPEQDKILVAVKTLKDASDNARKDFHR
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560 570 580 590 600 610
pF1KE2 EAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLLAGGEDVAP
:::::: :::.:::.:.:::.:: ::.::::::.:::::.:::.::::: :.: :. :
CCDS35 EAELLTNLQHEHIVKFYGVCVEGDPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAVLMAEGNP--P
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: .:.: .:.:.::::::::. :::::::::::::::..:.:::::::::::.::::
CCDS35 TELTQSQMLHIAQQIAAGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGENLLVKIGDFGMSRDVYSTD
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680 690 700 710 720 730
pF1KE2 YYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDC
::::::.:::::::::::::.::::::::::::.::::::::::::::::::::.:.:.:
CCDS35 YYRVGGHTMLPIRWMPPESIMYRKFTTESDVWSLGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNNEVIEC
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pF1KE2 ITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG
::::: :.:::.:: ::: .: :::::::..:..:: .:. :: ::.: :::::.::
CCDS35 ITQGRVLQRPRTCPQEVYELMLGCWQREPHMRKNIKGIHTLLQNLAKASPVYLDILG
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CCDS10 MDVSLCPAKCSFWRIFLLGSVWLDYVGSVLA-CP-ANCVCSKTEINCRRPDDGNLFP
10 20 30 40 50
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pF1KE2 -----DSLHHLPGA--------ENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGL
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CCDS10 LLEGQDSGNSNGNASINITDISRNITSIHIENWRSLHTLNAVDMELYTGLQKLTIKNSGL
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pF1KE2 RFVAPDAFHFTPRLSRLNLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWE
: . : :: .:.: .::: : : .:::. : :::.:: : : ..::: .::.: :.
CCDS10 RSIQPRAFAKNPHLRYINLSSNRLTTLSWQLFQTLSLRELQLEQNFFNCSCDIRWMQLWQ
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pF1KE2 EEGLGGVPEQKLQC----HGQGPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEG
:.: . . :.: : .: :: .: ..: .: ..:. : .: ::.... :. :
CCDS10 EQGEAKLNSQNLYCINADGSQLPLFRMNISQCDLPEISVSHVNLTVREGDNAVITCNGSG
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: .. ::.: : :: .. ... .. ...:::.::::. : ..:: ::: :: ..
CCDS10 SPLPDVDWIVTGL-QSINTHQTNLNWTNVHAINLTLVNVTSEDNGFTLTCIAENVVGMSN
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pF1KE2 VSVQVNVSFPASV-QLHTA-VEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFL
.:: ..: .: : .:. ....: :: : : :.: :.:.:: ::. : :...: .:.
CCDS10 ASVALTVYYPPRVVSLEEPELRLEH-CIEFVVRGNPPPTLHWLHNGQPLRESKIIHVEYY
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pF1KE2 EPAANETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPD
. . . .::: .:.::: :::::::.: ::.: :. .: . :. .:: . .. :
CCDS10 QEGE---ISEGCLLFNKPTHYNNGNYTLIAKNPLGTANQTINGHFLKEPFPESTDNFILF
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. . :. .: .: ::::.:::::.:::..: .:....:: :::.:::.. : ::
CCDS10 DEVSPTPPITVTHKPEEDTFGVSIAVGLAAFACVLLVVLFVMINKYGRRSKFGMKGPVAV
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450 460 470 480 490
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.. :. : :: .. : .. : . : . . : .::::::: :. :
CCDS10 ISGEEDSASPLHHINHGITTPSSLDAGPDTVVIGMTRIPVIENPQYFRQGHNCHKPDTYV
480 490 500 510 520 530
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pF1KE2 HHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQREAE
.:::::::::: :::::::::::::::.:: : .:::::::::::. . .::.:::::::
CCDS10 QHIKRRDIVLKRELGEGAFGKVFLAECYNLSPTKDKMLVAVKALKDPTLAARKDFQREAE
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pF1KE2 LLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLLAGGEDV-APGP
::: :::.:::.:.::: .: ::.::::::.:::::.:::.::::: .:. :. : :
CCDS10 LLTNLQHEHIVKFYGVCGDGDPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAMILVDGQPRQAKGE
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620 630 640 650 660 670
pF1KE2 LGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYSTDYY
:::.:.: .:::.:.::::::. ::::::::::::::: .:.:::::::::::.::::::
CCDS10 LGLSQMLHIASQIASGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGANLLVKIGDFGMSRDVYSTDYY
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680 690 700 710 720 730
pF1KE2 RVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDCIT
::::.:::::::::::::.:::::::::::::::.::::::::::::.::::::.:.:::
CCDS10 RVGGHTMLPIRWMPPESIMYRKFTTESDVWSFGVILWEIFTYGKQPWFQLSNTEVIECIT
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740 750 760 770 780 790
pF1KE2 QGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG
::: :::::.:: ::: .: :::::::::: .::... :.::..: :.:::.::
CCDS10 QGRVLERPRVCPKEVYDVMLGCWQREPQQRLNIKEIYKILHALGKATPIYLDILG
780 790 800 810 820
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pF1KE2 MLRGGRRGQLGWHSWAAEPGSLLAWLILASAGAA-PCPDAC-CPHGSSGLRCT--RDGAL
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CCDS66 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKC--SASRIWCSDPSPGIV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 DSLHHLPGA---ENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGLRFVAPDAFHF
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CCDS66 AFPRLEPNSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLK
60 70 80 90 100 110
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pF1KE2 TPRLSRLNLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWEEEGLGGVPE-
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CCDS66 NSNLQHINFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEA--KSSPDT
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180 190 200 210 220
pF1KE2 QKLQCHGQG----PLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEGRGLEQAGWI
: : : ... :::.. .::.:. .. .:: .:. : .. : :.: : . . :
CCDS66 QDLYCLNESSKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWD
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230 240 250 260 270 280
pF1KE2 LTELEQSATVMKSGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVSVQVNVSFPASV
. .: .. : :: .: :..:: . :...: ::: ::. . ::...: : ..
CCDS66 VGNLVSKHMNETSHTQGSLRIT--NISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTI
240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 Q-LHTAVEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCLR
:.. . :::::::.: :.: :.:.:..::..:::...: :.. ..:.: ::::.
CCDS66 TFLESPTSDHHWCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKI--HVTNHTEYHGCLQ
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390
pF1KE2 LNQPTHVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPF---EFNPEDP--IPDTNSTS----
:..:::.:::.:::.: : .:. .: : :: : ::. : : . .:.
CCDS66 LDNPTHMNNGDYTLIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYPDVIYEDYGTAANDI
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440
pF1KE2 GDPVEKKDETP-FGVSVAVG---LAVFACLFLSTL-------LLVLNKCGRRNKFGINR-
:: .....: : :. .: :.:.: . .... .: : : .:..:::..
CCDS66 GDTTNRSNEIPSTDVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFCLLVMLFLLKLARHSKFGMKDF
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480
pF1KE2 ---------------PA-VLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTEGKGSGL-----QGHII
:: :.. .: : :: .. :... : .:: ... . .:
CCDS66 SWFGFGKVKSRQGVGPASVISNDDDSASPLHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIPVI
470 480 490 500 510 520
490 500 510 520 530
pF1KE2 ENPQYFS--------DACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAV
::::::. :. :.::::..:::: :::::::::::::::.:: :::::.::::
CCDS66 ENPQYFGITNSQLKPDTFVQHIKRHNIVLKRELGEGAFGKVFLAECYNLCPEQDKILVAV
530 540 550 560 570 580
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 KALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRS
:.::.::..::.::.::::::: :::.:::.:.:::.:: ::.::::::.:::::.:::.
CCDS66 KTLKDASDNARKDFHREAELLTNLQHEHIVKFYGVCVEGDPLIMVFEYMKHGDLNKFLRA
590 600 610 620 630 640
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 HGPDAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLV
::::: :.: :. : : .:.: .:.:.::::::::. :::::::::::::::..:.
CCDS66 HGPDAVLMAEGNP--PTELTQSQMLHIAQQIAAGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGENLL
650 660 670 680 690 700
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 VKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTY
:::::::::::.::::::::::.:::::::::::::.::::::::::::.::::::::::
CCDS66 VKIGDFGMSRDVYSTDYYRVGGHTMLPIRWMPPESIMYRKFTTESDVWSLGVVLWEIFTY
710 720 730 740 750 760
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 GKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQA
::::::::::.:.:.:::::: :.:::.:: ::: .: :::::::..:..:: .:. ::
CCDS66 GKQPWYQLSNNEVIECITQGRVLQRPRTCPQEVYELMLGCWQREPHMRKNIKGIHTLLQN
770 780 790 800 810 820
780 790
pF1KE2 LAQAPPVYLDVLG
::.: :::::.::
CCDS66 LAKASPVYLDILG
830
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:..::: .:::: . : :: .:.: .::
CCDS81 MELYTGLQKLTIKNSGLRSIQPRAFAKNPHLRYINL
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130 140 150 160 170
pF1KE2 SFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWEEEGLGGVPEQKLQC----H
: : : .:::. : :::.:: : : ..::: .::.: :.:.: . . :.: :
CCDS81 SSNRLTTLSWQLFQTLSLRELQLEQNFFNCSCDIRWMQLWQEQGEAKLNSQNLYCINADG
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.: :: .: ..: .: ..:. : .: ::.... :. : : .. ::.: : :: ..
CCDS81 SQLPLFRMNISQCDLPEISVSHVNLTVREGDNAVITCNGSGSPLPDVDWIVTGL-QSINT
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... .. ...:::.::::. : ..:: ::: :: ...:: ..: .: : .:.
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pF1KE2 -VEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCLRLNQPT
....: :: : : :.: :.:.:: ::. : :...: .:. . . . .::: .:.::
CCDS81 ELRLEH-CIEFVVRGNPPPTLHWLHNGQPLRESKIIHVEYYQEGE---ISEGCLLFNKPT
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: :::::::.: ::.: :. .: . :. .:: . .. : . . :. .: .:
CCDS81 HYNNGNYTLIAKNPLGTANQTINGHFLKEPFPESTDNFILFDEVSPTPPITVTHKPEEDT
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pF1KE2 FGVSVAVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRP-AVLAPEDGLAMSLHFMTLGGS
::::.:::::.:::..: .:....:: :::.:::.. : ::.. :. : :: .. : .
CCDS81 FGVSIAVGLAAFACVLLVVLFVMINKYGRRSKFGMKGPVAVISGEEDSASPLHHINHGIT
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. : . : . . : .::::::: :. :.:::::::::: :::::::
CCDS81 TPSSLDAGPDTVVIGMTRIPVIENPQYFRQGHNCHKPDTYVQHIKRRDIVLKRELGEGAF
400 410 420 430 440 450
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pF1KE2 GKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTE
::::::::.:: : .:::::::::::. . .::.:::::::::: :::.:::.:.::: .
CCDS81 GKVFLAECYNLSPTKDKMLVAVKALKDPTLAARKDFQREAELLTNLQHEHIVKFYGVCGD
460 470 480 490 500 510
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pF1KE2 GRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLLAGGEDV-APGPLGLGQLLAVASQVAAGMVY
: ::.::::::.:::::.:::.::::: .:. :. : : :::.:.: .:::.:.::::
CCDS81 GDPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAMILVDGQPRQAKGELGLSQMLHIASQIASGMVY
520 530 540 550 560 570
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pF1KE2 LAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESIL
::. ::::::::::::::: .:.:::::::::::.::::::::
CCDS81 LASQHFVHRDLATRNCLVGANLLVKIGDFGMSRDVYSTDYYRVVQA
580 590 600 610
700 710 720 730 740 750
pF1KE2 YRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIM
>>CCDS32323.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 (612 aa)
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pF1KE2 MLRGGRRGQLGWHSWAAEPGSLLAWLILASAGAAPCPDACCPHGSSGLRCTR--DGAL--
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CCDS32 MDVSLCPAKCSFWRIFLLGSVWLDYVGSVLA-CP-ANCVCSKTEINCRRPDDGNLFP
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pF1KE2 -----DSLHHLPGA--------ENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGL
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CCDS32 LLEGQDSGNSNGNASINITDISRNITSIHIENWRSLHTLNAVDMELYTGLQKLTIKNSGL
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pF1KE2 RFVAPDAFHFTPRLSRLNLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWE
: . : :: .:.: .::: : : .:::. : :::.:: : : ..::: .::.: :.
CCDS32 RSIQPRAFAKNPHLRYINLSSNRLTTLSWQLFQTLSLRELQLEQNFFNCSCDIRWMQLWQ
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pF1KE2 EEGLGGVPEQKLQC----HGQGPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEG
:.: . . :.: : .: :: .: ..: .: ..:. : .: ::.... :. :
CCDS32 EQGEAKLNSQNLYCINADGSQLPLFRMNISQCDLPEISVSHVNLTVREGDNAVITCNGSG
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 RGLEQAGWILTELEQSATVMKSG----GLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAE
: .. ::.: : :: .. ... .. ...:::.::::. : ..:: ::: :: ..
CCDS32 SPLPDVDWIVTGL-QSINTHQTNLNWTNVHAINLTLVNVTSEDNGFTLTCIAENVVGMSN
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280 290 300 310 320 330
pF1KE2 VSVQVNVSFPASV-QLHTA-VEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFL
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CCDS32 ASVALTVYYPPRVVSLEEPELRLEH-CIEFVVRGNPPPTLHWLHNGQPLRESKIIHVEYY
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pF1KE2 EPAANETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPD
. . . .::: .:.::: :::::::.: ::.: :. .: . :. .:: . .. :
CCDS32 QEGE---ISEGCLLFNKPTHYNNGNYTLIAKNPLGTANQTINGHFLKEPFPESTDNFILF
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440
pF1KE2 TNSTSGDPV---EKKDETPFGVSVAVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRP-AV
. . :. .: .: ::::.:::::.:::..: .:....:: :::.:::.. : ::
CCDS32 DEVSPTPPITVTHKPEEDTFGVSIAVGLAAFACVLLVVLFVMINKYGRRSKFGMKGPVAV
420 430 440 450 460 470
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pF1KE2 LAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTE-GKGSGLQGH----IIENPQYFSDACVHHIKRRDI
.. :. : :: .. : .. : . : . . : .::::::: .. :. .. :
CCDS32 ISGEEDSASPLHHINHGITTPSSLDAGPDTVVIGMTRIPVIENPQYFRQG--HNCHKPDT
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CCDS32 WVFSNIDNHGILNLKDNRDHLVPSTHYIYEEPEVQSGEVSYPRSHGFREIMLNPISLPGH
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pF1KE2 GLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLAPEDGLAMSLHFMTL------GGSSL
:.: : ::..: :. . ::
CCDS62 NFKSDLCDIPACDSKDSKEKNKMEILYILVPSVAIP---LAIALLFFFICVCRNNQKSSS
380 390 400 410 420 430
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pF1KE2 SPTEGKGSGLQGHIIENPQ---YFSDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLL
.:.. . . ..:. .: . : . .... . . :::: ::::.. . : :
CCDS62 APVQRQPKHVRGQNVEMSMLNAYKPKSKAKELPLSAVRFMEELGECAFGKIY--KGHLYL
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CCDS62 PGMDHAQLVAIKTLKDYNNPQQWTEFQQEASLMAELHHPNIVCLLGAVTQEQPVCMLFEY
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pF1KE2 MRHGDLNRFLRSHGPDAKL-LAGGED-VAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHR
. .:::..:: ..: . . .. :: .. . : :..: .: :.:::: ::.. :::.
CCDS62 INQGDLHEFLIMRSPHSDVGCSSDEDGTVKSSLDHGDFLHIAIQIAAGMEYLSSHFFVHK
560 570 580 590 600 610
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pF1KE2 DLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESD
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CCDS62 DLAARNILIGEQLHVKISDLGLSREIYSADYYRVQSKSLLPIRWMPPEAIMYGKFSSDSD
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CCDS62 IWSFGVVLWEIFSFGLQPYYGFSNQEVIEMVRKRQLLPCSEDCPPRMYSLMTECWNEIPS
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.: .::.:.::..
CCDS62 RRPRFKDIHVRLRSWEGLSSHTSSTTPSGGNATTQTTSLSASPVSNLSNPRYPNYMFPSQ
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790 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 10:50:44 2016 done: Tue Nov 8 10:50:44 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]