FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2094, 796 aa 1>>>pF1KE2094 796 - 796 aa - 796 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.4048+/-0.00144; mu= -9.8445+/- 0.081 mean_var=514.6976+/-119.794, 0's: 0 Z-trim(108.3): 284 B-trim: 0 in 0/53 Lambda= 0.056532 statistics sampled from 9868 (10131) to 9868 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.664), E-opt: 0.2 (0.311), width: 16 Scan time: 4.320 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS1161.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 796) 5456 461.4 2.7e-129 CCDS30891.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 790) 5396 456.5 7.9e-128 CCDS30890.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 760) 4886 414.9 2.6e-115 CCDS58399.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 817) 2046 183.3 1.4e-45 CCDS10340.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 825) 1619 148.4 4.4e-35 CCDS35050.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 822) 1615 148.1 5.5e-35 CCDS6671.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 838) 1615 148.1 5.6e-35 CCDS81916.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 617) 1031 100.3 1e-20 CCDS32323.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 612) 965 94.9 4.1e-19 CCDS626.1 ROR1 gene_id:4919|Hs108|chr1 ( 937) 861 86.7 2e-16 CCDS35053.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 477) 833 84.1 6.1e-16 CCDS35052.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 537) 833 84.1 6.6e-16 CCDS35051.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 553) 833 84.1 6.8e-16 CCDS1241.1 DDR2 gene_id:4921|Hs108|chr1 ( 855) 832 84.3 9.5e-16 CCDS73785.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1366) 836 84.8 1e-15 CCDS10378.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1367) 836 84.8 1e-15 CCDS42487.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1370) 813 83.0 3.8e-15 CCDS12176.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1382) 813 83.0 3.8e-15 CCDS1160.1 INSRR gene_id:3645|Hs108|chr1 (1297) 812 82.9 3.8e-15 CCDS75419.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 767) 796 81.3 6.8e-15 CCDS4690.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 876) 796 81.3 7.4e-15 CCDS56411.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 894) 796 81.4 7.5e-15 CCDS34385.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 913) 796 81.4 7.6e-15 CCDS6691.1 ROR2 gene_id:4920|Hs108|chr9 ( 943) 795 81.3 8.2e-15 CCDS33172.1 ALK gene_id:238|Hs108|chr2 (1620) 792 81.3 1.4e-14 CCDS10078.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 ( 803) 781 80.1 1.6e-14 CCDS10077.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 ( 864) 781 80.1 1.7e-14 CCDS47396.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 919) 765 78.8 4.4e-14 CCDS4410.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 802) 755 78.0 7.1e-14 CCDS54706.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 808) 754 77.9 7.5e-14 CCDS43731.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 731) 747 77.3 1e-13 CCDS43730.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 733) 747 77.3 1e-13 CCDS43732.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 747 77.3 1.1e-13 CCDS6107.2 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 822) 747 77.3 1.1e-13 CCDS55223.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 853) 747 77.3 1.2e-13 CCDS45237.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 ( 734) 733 76.1 2.3e-13 CCDS4411.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 762) 733 76.1 2.4e-13 CCDS78096.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 734) 730 75.9 2.7e-13 CCDS4886.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 ( 940) 725 75.6 4.3e-13 CCDS4885.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1030) 725 75.6 4.5e-13 CCDS4884.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1070) 725 75.7 4.6e-13 CCDS59021.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1078) 725 75.7 4.7e-13 CCDS5116.1 ROS1 gene_id:6098|Hs108|chr6 (2347) 732 76.6 5.2e-13 CCDS4887.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1014) 717 75.0 7e-13 CCDS55221.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 812) 703 73.7 1.3e-12 CCDS55222.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 703 73.7 1.4e-12 CCDS44488.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 680) 698 73.2 1.6e-12 CCDS44489.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 769) 698 73.3 1.7e-12 CCDS7620.2 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 822) 698 73.3 1.8e-12 CCDS3353.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 806) 697 73.2 1.9e-12 >>CCDS1161.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 (796 aa) initn: 5456 init1: 5456 opt: 5456 Z-score: 2434.8 bits: 461.4 E(32554): 2.7e-129 Smith-Waterman score: 5456; 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98.8% identity (98.9% similar) in 729 aa overlap (68-796:38-760) 40 50 60 70 80 90 pF1KE2 DACCPHGSSGLRCTRDGALDSLHHLPGAENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLT :. :::::::::::::::::::::::::: CCDS30 CLAPSVPPILTVKSWDTMQLRAARSRCTNLLAASYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLT 10 20 30 40 50 60 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 IVKSGLRFVAPDAFHFTPRLSRLNLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 IVKSGLRFVAPDAFHFTPRLSRLNLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALR 70 80 90 100 110 120 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 WLQRWEEEGLGGVPEQKLQCHGQGPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 WLQRWEEEGLGGVPEQKLQCHGQGPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQV 130 140 150 160 170 180 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 EGRGLEQAGWILTELEQSATVMKSGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 EGRGLEQAGWILTELEQSATVMKSGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVS 190 200 210 220 230 240 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 VQVNVSFPASVQLHTAVEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 VQVNVSFPASVQLHTAVEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAA 250 260 270 280 290 300 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 NETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPVSFSP ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 NETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIP----- 310 320 330 340 350 360 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 VDTNSTSGDPVEKKDETPFGVSVAVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLA ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 -DTNSTSGDPVEKKDETPFGVSVAVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLA 370 380 390 400 410 420 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 PEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTEGKGSGLQGHIIENPQYFSDACVHHIKRRDIVLKWELG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 PEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTEGKGSGLQGHIIENPQYFSDACVHHIKRRDIVLKWELG 430 440 450 460 470 480 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 EGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 EGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFG 490 500 510 520 530 540 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 VCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 VCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAG 550 560 570 580 590 600 640 650 660 670 680 690 pF1KE2 MVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 MVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPE 610 620 630 640 650 660 700 710 720 730 740 750 pF1KE2 SILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 SILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVY 670 680 690 700 710 720 760 770 780 790 pF1KE2 AIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 AIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG 730 740 750 760 >>CCDS58399.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 (817 aa) initn: 2412 init1: 1020 opt: 2046 Z-score: 931.6 bits: 183.3 E(32554): 1.4e-45 Smith-Waterman score: 2555; 51.2% identity (73.0% similar) in 814 aa overlap (25-796:22-817) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MLRGGRRGQLGWHSWAAEPGSLLAWLILASAGAAPCPDACCPHGSSGLRCTR--DGAL-- :: ... : :: : : ... . : : :: : CCDS58 MDVSLCPAKCSFWRIFLLGSVWLDYVGSVLA-CP-ANCVCSKTEINCRRPDDGNLFP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 -----DSLHHLPGA--------ENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGL :: . .: .:.: ..::: . :. :. :.. :..::: .::: CCDS58 LLEGQDSGNSNGNASINITDISRNITSIHIENWRSLHTLNAVDMELYTGLQKLTIKNSGL 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 RFVAPDAFHFTPRLSRLNLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWE : . : :: .:.: .::: : : .:::. : :::.:: : : ..::: .::.: :. CCDS58 RSIQPRAFAKNPHLRYINLSSNRLTTLSWQLFQTLSLRELQLEQNFFNCSCDIRWMQLWQ 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 pF1KE2 EEGLGGVPEQKLQC----HGQGPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEG :.: . . :.: : .: :: .: ..: .: ..:. : .: ::.... :. : CCDS58 EQGEAKLNSQNLYCINADGSQLPLFRMNISQCDLPEISVSHVNLTVREGDNAVITCNGSG 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 RGLEQAGWILTELEQSATVMKSG----GLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAE : .. ::.: : :: .. ... .. ...:::.::::. : ..:: ::: :: .. CCDS58 SPLPDVDWIVTGL-QSINTHQTNLNWTNVHAINLTLVNVTSEDNGFTLTCIAENVVGMSN 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 VSVQVNVSFPASV-QLHTA-VEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFL .:: ..: .: : .:. ....: :: : : :.: :.:.:: ::. : :...: .:. CCDS58 ASVALTVYYPPRVVSLEEPELRLEH-CIEFVVRGNPPPTLHWLHNGQPLRESKIIHVEYY 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 EPAANETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPV . . . .::: .:.::: :::::::.: ::.: :. .: . :. .:: . .: : CCDS58 QEGE---ISEGCLLFNKPTHYNNGNYTLIAKNPLGTANQTINGHFLKEPFPVDEVSPTP- 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 SFSPVDTNSTSGDPVEKKDETPFGVSVAVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRP :. .. .: .: ::::.:::::.:::..: .:....:: :::.:::.. : CCDS58 ---PITVT-------HKPEEDTFGVSIAVGLAAFACVLLVVLFVMINKYGRRSKFGMKGP 410 420 430 440 450 460 470 480 490 pF1KE2 -AVLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTE-GKGSGLQGH----IIENPQYFS--------D ::.. :. : :: .. : .. : . : . . : .::::::: : CCDS58 VAVISGEEDSASPLHHINHGITTPSSLDAGPDTVVIGMTRIPVIENPQYFRQGHNCHKPD 460 470 480 490 500 510 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 ACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQR . :.:::::::::: :::::::::::::::.:: : .:::::::::::. . .::.:::: CCDS58 TYVQHIKRRDIVLKRELGEGAFGKVFLAECYNLSPTKDKMLVAVKALKDPTLAARKDFQR 520 530 540 550 560 570 560 570 580 590 600 610 pF1KE2 EAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLLAGGEDV-A :::::: :::.:::.:.::: .: ::.::::::.:::::.:::.::::: .:. :. : CCDS58 EAELLTNLQHEHIVKFYGVCGDGDPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAMILVDGQPRQA 580 590 600 610 620 630 620 630 640 650 660 670 pF1KE2 PGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYST : :::.:.: .:::.:.::::::. ::::::::::::::: .:.:::::::::::.::: CCDS58 KGELGLSQMLHIASQIASGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGANLLVKIGDFGMSRDVYST 640 650 660 670 680 690 680 690 700 710 720 730 pF1KE2 DYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAID :::::::.:::::::::::::.:::::::::::::::.::::::::::::.::::::.:. CCDS58 DYYRVGGHTMLPIRWMPPESIMYRKFTTESDVWSFGVILWEIFTYGKQPWFQLSNTEVIE 700 710 720 730 740 750 740 750 760 770 780 790 pF1KE2 CITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG :::::: :::::.:: ::: .: :::::::::: .::... :.::..: :.:::.:: CCDS58 CITQGRVLERPRVCPKEVYDVMLGCWQREPQQRLNIKEIYKILHALGKATPIYLDILG 760 770 780 790 800 810 >>CCDS10340.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 (825 aa) initn: 2450 init1: 1020 opt: 1619 Z-score: 743.3 bits: 148.4 E(32554): 4.4e-35 Smith-Waterman score: 2550; 51.2% identity (73.1% similar) in 815 aa overlap (25-796:22-825) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MLRGGRRGQLGWHSWAAEPGSLLAWLILASAGAAPCPDACCPHGSSGLRCTR--DGAL-- :: ... : :: : : ... . : : :: : CCDS10 MDVSLCPAKCSFWRIFLLGSVWLDYVGSVLA-CP-ANCVCSKTEINCRRPDDGNLFP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 -----DSLHHLPGA--------ENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGL :: . .: .:.: ..::: . :. :. :.. :..::: .::: CCDS10 LLEGQDSGNSNGNASINITDISRNITSIHIENWRSLHTLNAVDMELYTGLQKLTIKNSGL 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 RFVAPDAFHFTPRLSRLNLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWE : . : :: .:.: .::: : : .:::. : :::.:: : : ..::: .::.: :. CCDS10 RSIQPRAFAKNPHLRYINLSSNRLTTLSWQLFQTLSLRELQLEQNFFNCSCDIRWMQLWQ 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 pF1KE2 EEGLGGVPEQKLQC----HGQGPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEG :.: . . :.: : .: :: .: ..: .: ..:. : .: ::.... :. : CCDS10 EQGEAKLNSQNLYCINADGSQLPLFRMNISQCDLPEISVSHVNLTVREGDNAVITCNGSG 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 RGLEQAGWILTELEQSATVMKSG----GLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAE : .. ::.: : :: .. ... .. ...:::.::::. : ..:: ::: :: .. CCDS10 SPLPDVDWIVTGL-QSINTHQTNLNWTNVHAINLTLVNVTSEDNGFTLTCIAENVVGMSN 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 VSVQVNVSFPASV-QLHTA-VEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFL .:: ..: .: : .:. ....: :: : : :.: :.:.:: ::. : :...: .:. CCDS10 ASVALTVYYPPRVVSLEEPELRLEH-CIEFVVRGNPPPTLHWLHNGQPLRESKIIHVEYY 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 EPAANETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPV . . . .::: .:.::: :::::::.: ::.: :. .: . :. .:: . .. : CCDS10 QEG---EISEGCLLFNKPTHYNNGNYTLIAKNPLGTANQTINGHFLKEPFPESTDNFILF 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 S-FSPVDTNSTSGDPVEKKDETPFGVSVAVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINR . ::. ... : .: ::::.:::::.:::..: .:....:: :::.:::.. CCDS10 DEVSPTPPITVTHKP----EEDTFGVSIAVGLAAFACVLLVVLFVMINKYGRRSKFGMKG 420 430 440 450 460 460 470 480 490 pF1KE2 P-AVLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTE-GKGSGLQGH----IIENPQYFS-------- : ::.. :. : :: .. : .. : . : . . : .::::::: CCDS10 PVAVISGEEDSASPLHHINHGITTPSSLDAGPDTVVIGMTRIPVIENPQYFRQGHNCHKP 470 480 490 500 510 520 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 DACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQ :. :.:::::::::: :::::::::::::::.:: : .:::::::::::. . .::.::: CCDS10 DTYVQHIKRRDIVLKRELGEGAFGKVFLAECYNLSPTKDKMLVAVKALKDPTLAARKDFQ 530 540 550 560 570 580 560 570 580 590 600 610 pF1KE2 REAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLLAGGEDV- ::::::: :::.:::.:.::: .: ::.::::::.:::::.:::.::::: .:. :. CCDS10 REAELLTNLQHEHIVKFYGVCGDGDPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAMILVDGQPRQ 590 600 610 620 630 640 620 630 640 650 660 670 pF1KE2 APGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYS : : :::.:.: .:::.:.::::::. ::::::::::::::: .:.:::::::::::.:: CCDS10 AKGELGLSQMLHIASQIASGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGANLLVKIGDFGMSRDVYS 650 660 670 680 690 700 680 690 700 710 720 730 pF1KE2 TDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAI ::::::::.:::::::::::::.:::::::::::::::.::::::::::::.::::::.: CCDS10 TDYYRVGGHTMLPIRWMPPESIMYRKFTTESDVWSFGVILWEIFTYGKQPWFQLSNTEVI 710 720 730 740 750 760 740 750 760 770 780 790 pF1KE2 DCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG .:::::: :::::.:: ::: .: :::::::::: .::... :.::..: :.:::.:: CCDS10 ECITQGRVLERPRVCPKEVYDVMLGCWQREPQQRLNIKEIYKILHALGKATPIYLDILG 770 780 790 800 810 820 >>CCDS35050.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 (822 aa) initn: 2216 init1: 992 opt: 1615 Z-score: 741.6 bits: 148.1 E(32554): 5.5e-35 Smith-Waterman score: 2495; 49.2% identity (72.9% similar) in 827 aa overlap (12-796:7-822) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MLRGGRRGQLGWHSWAAEPGSLLAWLILASAGAA-PCPDAC-CPHGSSGLRCT--RDGAL ::. : . ::... :: :: .: : ..: . :. : . CCDS35 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKC--SASRIWCSDPSPGIV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 DSLHHLPGA---ENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGLRFVAPDAFHF . :.. ::.::..: ::..:. .. :... ::::::: :::.::: :: CCDS35 AFPRLEPNSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLK 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 TPRLSRLNLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWEEEGLGGVPE- . :...:.. : : ::: : . :.:.::.: :::. ::: . :.. .: . :. CCDS35 NSNLQHINFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEA--KSSPDT 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 QKLQCHGQG----PLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEGRGLEQAGWI : : : ... :::.. .::.:. .. .:: .:. : .. : :.: : . . : CCDS35 QDLYCLNESSKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWD 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 LTELEQSATVMKSGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVSVQVNVSFPASV . .: .. : :: .: :..:: . :...: ::: ::. . ::...: : .. CCDS35 VGNLVSKHMNETSHTQGSLRIT--NISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTI 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 Q-LHTAVEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCLR :.. . :::::::.: :.: :.:.:..::..:::...: :.. ..:.: ::::. CCDS35 TFLESPTSDHHWCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKI--HVTNHTEYHGCLQ 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 LNQPTHVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPF---EFNPEDPIPVSFSPVDTNSTS :..:::.:::.:::.: : .:. .: : :: : ::. : : . : ... CCDS35 LDNPTHMNNGDYTLIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYP-DVIYEDYGTAAND 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 -GDPVEKKDETP-FGVSVAVG---LAVFACLFLSTL-------LLVLNKCGRRNKFGINR :: .....: : :. .: :.:.: . .... .: : : .:..:::.. CCDS35 IGDTTNRSNEIPSTDVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFCLLVMLFLLKLARHSKFGMKG 410 420 430 440 450 460 460 470 480 490 pF1KE2 PA-VLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTEGKGSGL-----QGHIIENPQYFS-------- :: :.. .: : :: .. :... : .:: ... . .:::::::. CCDS35 PASVISNDDDSASPLHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIPVIENPQYFGITNSQLKP 470 480 490 500 510 520 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 DACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQ :. :.::::..:::: :::::::::::::::.:: :::::.:::::.::.::..::.::. CCDS35 DTFVQHIKRHNIVLKRELGEGAFGKVFLAECYNLCPEQDKILVAVKTLKDASDNARKDFH 530 540 550 560 570 580 560 570 580 590 600 610 pF1KE2 REAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLLAGGEDVA ::::::: :::.:::.:.:::.:: ::.::::::.:::::.:::.::::: :.: :. CCDS35 REAELLTNLQHEHIVKFYGVCVEGDPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAVLMAEGN--P 590 600 610 620 630 640 620 630 640 650 660 670 pF1KE2 PGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYST : : .:.: .:.:.::::::::. :::::::::::::::..:.:::::::::::.::: CCDS35 PTELTQSQMLHIAQQIAAGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGENLLVKIGDFGMSRDVYST 650 660 670 680 690 700 680 690 700 710 720 730 pF1KE2 DYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAID :::::::.:::::::::::::.::::::::::::.::::::::::::::::::::.:.:. CCDS35 DYYRVGGHTMLPIRWMPPESIMYRKFTTESDVWSLGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNNEVIE 710 720 730 740 750 760 740 750 760 770 780 790 pF1KE2 CITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG :::::: :.:::.:: ::: .: :::::::..:..:: .:. :: ::.: :::::.:: CCDS35 CITQGRVLQRPRTCPQEVYELMLGCWQREPHMRKNIKGIHTLLQNLAKASPVYLDILG 770 780 790 800 810 820 >>CCDS6671.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 (838 aa) initn: 2216 init1: 992 opt: 1615 Z-score: 741.5 bits: 148.1 E(32554): 5.6e-35 Smith-Waterman score: 2445; 48.7% identity (72.0% similar) in 830 aa overlap (25-796:20-838) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MLRGGRRGQLGWHSWAAEPGSLLAWLILASAGAA-PCPDAC-CPHGSSGLRCT--RDGAL ::... :: :: .: : ..: . :. : . CCDS66 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKC--SASRIWCSDPSPGIV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 DSLHHLPGA---ENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGLRFVAPDAFHF . :.. ::.::..: ::..:. .. :... ::::::: :::.::: :: CCDS66 AFPRLEPNSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLK 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 TPRLSRLNLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWEEEGLGGVPE- . :...:.. : : ::: : . :.:.::.: :::. ::: . :.. .: . :. CCDS66 NSNLQHINFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAK--SSPDT 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 QKLQCHGQG----PLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEGRGLEQAGWI : : : ... :::.. .::.:. .. .:: .:. : .. : :.: : . . : CCDS66 QDLYCLNESSKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWD 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 LTELEQSATVMKSGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVSVQVNVSFPASV . .: .. : :: .: :..:: . :...: ::: ::. . ::...: : .. CCDS66 VGNLVSKHMNETSHTQGSLRIT--NISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTI 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 Q-LHTAVEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCLR :.. . :::::::.: :.: :.:.:..::..:::...: :.. ..:.: ::::. CCDS66 TFLESPTSDHHWCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKI--HVTNHTEYHGCLQ 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 LNQPTHVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPF---EFNPEDPIPVSFSPVDTNSTS :..:::.:::.:::.: : .:. .: : :: : ::. : : . : ... CCDS66 LDNPTHMNNGDYTLIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYP-DVIYEDYGTAAND 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 -GDPVEKKDETP-FGVSVAVG---LAVFACLFLSTL-------LLVLNKCGRRNKFGINR :: .....: : :. .: :.:.: . .... .: : : .:..:::.. CCDS66 IGDTTNRSNEIPSTDVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFCLLVMLFLLKLARHSKFGMKD 410 420 430 440 450 460 460 470 480 490 pF1KE2 ----------------PA-VLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTEGKGSGL-----QGHI :: :.. .: : :: .. :... : .:: ... . . CCDS66 FSWFGFGKVKSRQGVGPASVISNDDDSASPLHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIPV 470 480 490 500 510 520 500 510 520 530 540 pF1KE2 IENPQYFS--------DACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVA :::::::. :. :.::::..:::: :::::::::::::::.:: :::::.::: CCDS66 IENPQYFGITNSQLKPDTFVQHIKRHNIVLKRELGEGAFGKVFLAECYNLCPEQDKILVA 530 540 550 560 570 580 550 560 570 580 590 600 pF1KE2 VKALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLR ::.::.::..::.::.::::::: :::.:::.:.:::.:: ::.::::::.:::::.::: CCDS66 VKTLKDASDNARKDFHREAELLTNLQHEHIVKFYGVCVEGDPLIMVFEYMKHGDLNKFLR 590 600 610 620 630 640 610 620 630 640 650 660 pF1KE2 SHGPDAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGL .::::: :.: :. : : .:.: .:.:.::::::::. :::::::::::::::..: CCDS66 AHGPDAVLMAEGNP--PTELTQSQMLHIAQQIAAGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGENL 650 660 670 680 690 700 670 680 690 700 710 720 pF1KE2 VVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFT .:::::::::::.::::::::::.:::::::::::::.::::::::::::.::::::::: CCDS66 LVKIGDFGMSRDVYSTDYYRVGGHTMLPIRWMPPESIMYRKFTTESDVWSLGVVLWEIFT 710 720 730 740 750 760 730 740 750 760 770 780 pF1KE2 YGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQ :::::::::::.:.:.:::::: :.:::.:: ::: .: :::::::..:..:: .:. :: CCDS66 YGKQPWYQLSNNEVIECITQGRVLQRPRTCPQEVYELMLGCWQREPHMRKNIKGIHTLLQ 770 780 790 800 810 820 790 pF1KE2 ALAQAPPVYLDVLG ::.: :::::.:: CCDS66 NLAKASPVYLDILG 830 >>CCDS81916.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 (617 aa) initn: 1745 init1: 592 opt: 1031 Z-score: 485.6 bits: 100.3 E(32554): 1e-20 Smith-Waterman score: 1839; 49.6% identity (72.9% similar) in 617 aa overlap (93-683:7-614) 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 PGAENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGLRFVAPDAFHFTPRLSRLNL :..::: .:::: . : :: .:.: .:: CCDS81 MELYTGLQKLTIKNSGLRSIQPRAFAKNPHLRYINL 10 20 30 130 140 150 160 170 pF1KE2 SFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWEEEGLGGVPEQKLQC----H : : : .:::. : :::.:: : : ..::: .::.: :.:.: . . :.: : CCDS81 SSNRLTTLSWQLFQTLSLRELQLEQNFFNCSCDIRWMQLWQEQGEAKLNSQNLYCINADG 40 50 60 70 80 90 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 GQGPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEGRGLEQAGWILTELEQSATV .: :: .: ..: .: ..:. : .: ::.... :. : : .. ::.: : :: .. CCDS81 SQLPLFRMNISQCDLPEISVSHVNLTVREGDNAVITCNGSGSPLPDVDWIVTGL-QSINT 100 110 120 130 140 150 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 MKSG----GLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVSVQVNVSFPASV-QLHTA ... .. ...:::.::::. : ..:: ::: :: ...:: ..: .: : .:. CCDS81 HQTNLNWTNVHAINLTLVNVTSEDNGFTLTCIAENVVGMSNASVALTVYYPPRVVSLEEP 160 170 180 190 200 210 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 -VEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCLRLNQPT ....: :: : : :.: :.:.:: ::. : :...: .:. . . . .::: .:.:: CCDS81 ELRLEH-CIEFVVRGNPPPTLHWLHNGQPLRESKIIHVEYYQEGE---ISEGCLLFNKPT 220 230 240 250 260 270 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 HVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPVS-FSPVDTNSTSGDPVEKK : :::::::.: ::.: :. .: . :. .:: . .. : . ::. ... : CCDS81 HYNNGNYTLIAKNPLGTANQTINGHFLKEPFPESTDNFILFDEVSPTPPITVTHKP---- 280 290 300 310 320 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 DETPFGVSVAVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRP-AVLAPEDGLAMSLHFMT .: ::::.:::::.:::..: .:....:: :::.:::.. : ::.. :. : :: .. CCDS81 EEDTFGVSIAVGLAAFACVLLVVLFVMINKYGRRSKFGMKGPVAVISGEEDSASPLHHIN 330 340 350 360 370 380 480 490 500 510 pF1KE2 LGGSSLSPTE-GKGSGLQGH----IIENPQYFS--------DACVHHIKRRDIVLKWELG : .. : . : . . : .::::::: :. :.:::::::::: ::: CCDS81 HGITTPSSLDAGPDTVVIGMTRIPVIENPQYFRQGHNCHKPDTYVQHIKRRDIVLKRELG 390 400 410 420 430 440 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 EGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFG ::::::::::::.:: : .:::::::::::. . .::.:::::::::: :::.:::.:.: CCDS81 EGAFGKVFLAECYNLSPTKDKMLVAVKALKDPTLAARKDFQREAELLTNLQHEHIVKFYG 450 460 470 480 490 500 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 VCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLLAGGEDV-APGPLGLGQLLAVASQVAA :: .: ::.::::::.:::::.:::.::::: .:. :. : : :::.:.: .:::.:. 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CCDS62 DYRGTVSVT-KSGRQCQPW--NSQYPHTHTFTALRFPELNGGHSYCRNPGNQK-EAPWCF 320 330 340 350 360 370 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 SVAVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLAPEDGLAMSLHFMTL------G .. .. : . . .. .. . . : :.: : ::..: :. . CCDS62 TLDENFKSDLCDIPACDSKDSKEKNKMEILYILVPSVAIP---LAIALLFFFICVCRNNQ 380 390 400 410 420 430 480 490 500 510 520 pF1KE2 GSSLSPTEGKGSGLQGHIIENPQ---YFSDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAEC :: .:.. . . ..:. .: . : . .... . . :::: ::::.. . CCDS62 KSSSAPVQRQPKHVRGQNVEMSMLNAYKPKSKAKELPLSAVRFMEELGECAFGKIY--KG 440 450 460 470 480 490 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 HNLLPEQDK-MLVAVKALKEASESARQ-DFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLM : :: .:. .:::.:.::. .. . .::.:: :.. :.: .:: ..:. :. .:. : CCDS62 HLYLPGMDHAQLVAIKTLKDYNNPQQWTEFQQEASLMAELHHPNIVCLLGAVTQEQPVCM 500 510 520 530 540 550 590 600 610 620 630 640 pF1KE2 VFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKL-LAGGED-VAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLH .:::. .:::..:: ..: . . .. :: .. . : :..: .: :.:::: ::.. 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CCDS62 EIPSRRPRFKDIHVRLRSWEGLSSHTSSTTPSGGNATTQTTSLSASPVSNLSNPRYPNYM 740 750 760 770 780 790 796 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 09:09:27 2016 done: Sun Nov 6 09:09:28 2016 Total Scan time: 4.320 Total Display time: 0.250 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]