FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2123, 914 aa 1>>>pF1KE2123 914 - 914 aa - 914 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.8732+/-0.000508; mu= -18.6669+/- 0.032 mean_var=526.5392+/-109.095, 0's: 0 Z-trim(120.4): 118 B-trim: 0 in 0/61 Lambda= 0.055893 statistics sampled from 35415 (35546) to 35415 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.721), E-opt: 0.2 (0.417), width: 16 Scan time: 12.870 The best scores are: opt bits E(85289) NP_006257 (OMIM: 601619) ral guanine nucleotide di ( 914) 6057 504.1 1.3e-141 NP_001258704 (OMIM: 601619) ral guanine nucleotide ( 913) 5641 470.5 1.6e-131 NP_001035827 (OMIM: 601619) ral guanine nucleotide ( 859) 5624 469.1 4e-131 NP_001258703 (OMIM: 601619) ral guanine nucleotide ( 885) 4891 410.0 2.6e-113 NP_001258705 (OMIM: 601619) ral guanine nucleotide ( 902) 4891 410.0 2.6e-113 NP_001284598 (OMIM: 605667) ral guanine nucleotide ( 766) 1750 156.7 4e-37 NP_001284599 (OMIM: 605667) ral guanine nucleotide ( 766) 1750 156.7 4e-37 NP_001284600 (OMIM: 605667) ral guanine nucleotide ( 768) 1750 156.7 4e-37 NP_055964 (OMIM: 605667) ral guanine nucleotide di ( 803) 1750 156.7 4.2e-37 XP_011507641 (OMIM: 605667) PREDICTED: ral guanine ( 803) 1750 156.7 4.2e-37 XP_016856245 (OMIM: 605667) PREDICTED: ral guanine ( 683) 1252 116.5 4.5e-25 XP_011507643 (OMIM: 605667) PREDICTED: ral guanine ( 718) 1252 116.5 4.7e-25 XP_011507644 (OMIM: 605667) PREDICTED: ral guanine ( 620) 1249 116.2 4.9e-25 NP_001230667 (OMIM: 602306) ral guanine nucleotide ( 695) 1001 96.3 5.7e-19 NP_004752 (OMIM: 602306) ral guanine nucleotide di ( 777) 1001 96.3 6.2e-19 NP_001155088 (OMIM: 616743) ral guanine nucleotide ( 716) 989 95.3 1.1e-18 NP_001030300 (OMIM: 616743) ral guanine nucleotide ( 710) 985 95.0 1.4e-18 NP_705843 (OMIM: 612214) ral-GDS-related protein i ( 473) 830 82.4 5.9e-15 NP_001316353 (OMIM: 612214) ral-GDS-related protei ( 580) 830 82.4 7e-15 NP_001284601 (OMIM: 605667) ral guanine nucleotide ( 739) 753 76.3 6.2e-13 XP_011513087 (OMIM: 602306) PREDICTED: ral guanine ( 496) 704 72.2 7e-12 XP_011513083 (OMIM: 602306) PREDICTED: ral guanine ( 670) 367 45.1 0.0013 >>NP_006257 (OMIM: 601619) ral guanine nucleotide dissoc (914 aa) initn: 6057 init1: 6057 opt: 6057 Z-score: 2663.4 bits: 504.1 E(85289): 1.3e-141 Smith-Waterman score: 6057; 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