FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5658, 489 aa 1>>>pF1KE5658 489 - 489 aa - 489 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9698+/-0.000379; mu= 11.0917+/- 0.024 mean_var=125.7116+/-25.841, 0's: 0 Z-trim(116.5): 42 B-trim: 286 in 1/56 Lambda= 0.114390 statistics sampled from 27643 (27685) to 27643 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.697), E-opt: 0.2 (0.325), width: 16 Scan time: 7.950 The best scores are: opt bits E(85289) NP_059127 (OMIM: 604976) 5'-AMP-activated protein ( 489) 3252 548.0 2.1e-155 XP_016859832 (OMIM: 604976) PREDICTED: 5'-AMP-acti ( 489) 3252 548.0 2.1e-155 XP_016867765 (OMIM: 194200,261740,600858,602743) P ( 327) 1392 241.0 3.9e-63 XP_016867763 (OMIM: 194200,261740,600858,602743) P ( 377) 1392 241.0 4.4e-63 NP_001291456 (OMIM: 194200,261740,600858,602743) 5 ( 444) 1392 241.1 5e-63 XP_016867761 (OMIM: 194200,261740,600858,602743) P ( 524) 1392 241.1 5.7e-63 XP_016867760 (OMIM: 194200,261740,600858,602743) P ( 524) 1392 241.1 5.7e-63 XP_011514586 (OMIM: 194200,261740,600858,602743) P ( 564) 1392 241.1 6.1e-63 XP_016867758 (OMIM: 194200,261740,600858,602743) P ( 568) 1392 241.1 6.1e-63 XP_016867757 (OMIM: 194200,261740,600858,602743) P ( 574) 1392 241.1 6.2e-63 XP_011514584 (OMIM: 194200,261740,600858,602743) P ( 614) 1392 241.2 6.5e-63 NP_001291460 (OMIM: 194200,261740,600858,602743) 5 ( 328) 1380 239.0 1.6e-62 NP_077747 (OMIM: 194200,261740,600858,602743) 5'-A ( 328) 1380 239.0 1.6e-62 XP_011514587 (OMIM: 194200,261740,600858,602743) P ( 378) 1380 239.0 1.7e-62 XP_016867762 (OMIM: 194200,261740,600858,602743) P ( 445) 1380 239.1 2e-62 XP_005250063 (OMIM: 194200,261740,600858,602743) P ( 495) 1380 239.1 2.2e-62 NP_001035723 (OMIM: 194200,261740,600858,602743) 5 ( 525) 1380 239.1 2.3e-62 XP_016867759 (OMIM: 194200,261740,600858,602743) P ( 525) 1380 239.1 2.3e-62 XP_011514585 (OMIM: 194200,261740,600858,602743) P ( 565) 1380 239.2 2.4e-62 NP_057287 (OMIM: 194200,261740,600858,602743) 5'-A ( 569) 1380 239.2 2.4e-62 XP_005250061 (OMIM: 194200,261740,600858,602743) P ( 575) 1380 239.2 2.4e-62 XP_006716084 (OMIM: 194200,261740,600858,602743) P ( 615) 1380 239.2 2.6e-62 XP_005250059 (OMIM: 194200,261740,600858,602743) P ( 619) 1380 239.2 2.6e-62 XP_016867766 (OMIM: 194200,261740,600858,602743) P ( 320) 1372 237.7 3.8e-62 XP_011514588 (OMIM: 194200,261740,600858,602743) P ( 370) 1372 237.7 4.3e-62 XP_016867767 (OMIM: 194200,261740,600858,602743) P ( 308) 1360 235.7 1.5e-61 XP_016867769 (OMIM: 194200,261740,600858,602743) P ( 308) 1360 235.7 1.5e-61 XP_016867768 (OMIM: 194200,261740,600858,602743) P ( 308) 1360 235.7 1.5e-61 XP_016867771 (OMIM: 194200,261740,600858,602743) P ( 308) 1360 235.7 1.5e-61 XP_016867770 (OMIM: 194200,261740,600858,602743) P ( 308) 1360 235.7 1.5e-61 XP_011514589 (OMIM: 194200,261740,600858,602743) P ( 358) 1360 235.7 1.6e-61 XP_016867764 (OMIM: 194200,261740,600858,602743) P ( 358) 1360 235.7 1.6e-61 NP_002724 (OMIM: 602742) 5'-AMP-activated protein ( 331) 1294 224.8 2.9e-58 XP_011536864 (OMIM: 602742) PREDICTED: 5'-AMP-acti ( 299) 1275 221.6 2.4e-57 NP_001193639 (OMIM: 602742) 5'-AMP-activated prote ( 299) 1275 221.6 2.4e-57 XP_006719562 (OMIM: 602742) PREDICTED: 5'-AMP-acti ( 299) 1275 221.6 2.4e-57 XP_005269076 (OMIM: 602742) PREDICTED: 5'-AMP-acti ( 368) 1179 205.9 1.6e-52 NP_001193638 (OMIM: 602742) 5'-AMP-activated prote ( 340) 1009 177.8 4.3e-44 XP_016875111 (OMIM: 602742) PREDICTED: 5'-AMP-acti ( 247) 1000 176.2 9.4e-44 XP_016875112 (OMIM: 602742) PREDICTED: 5'-AMP-acti ( 247) 1000 176.2 9.4e-44 XP_005269077 (OMIM: 602742) PREDICTED: 5'-AMP-acti ( 247) 1000 176.2 9.4e-44 >>NP_059127 (OMIM: 604976) 5'-AMP-activated protein kina (489 aa) initn: 3252 init1: 3252 opt: 3252 Z-score: 2910.8 bits: 548.0 E(85289): 2.1e-155 Smith-Waterman score: 3252; 99.8% identity (100.0% similar) in 489 aa overlap (1-489:1-489) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MEPGLEHALRRTPSWSSLGGSEHQEMSFLEQENSSSWPSPAVTSSSERIRGKRRAKALRW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_059 MEPGLEHALRRTPSWSSLGGSEHQEMSFLEQENSSSWPSPAVTSSSERIRGKRRAKALRW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 TRQKSVEEGEPPGQGEGPRSRPAAESTGLEATFPKTTPLAQADPAGVGTPPTGWDCLPSD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_059 TRQKSVEEGEPPGQGEGPRSRPAAESTGLEATFPKTTPLAQADPAGVGTPPTGWDCLPSD 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 CTASAAGSSTDDVELATEFPATEAWECELEGLLEERPALCLSPQAPFPKLGWDDELRKPG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_059 CTASAAGSSTDDVELATEFPATEAWECELEGLLEERPALCLSPQAPFPKLGWDDELRKPG 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 AQIYMRFMQEHTCYDAMATSSKLVIFDTMLEIKKAFFALVANSVRAAPLWDSKKQSFVGM ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::: NP_059 AQIYMRFMQEHTCYDAMATSSKLVIFDTMLEIKKAFFALVANGVRAAPLWDSKKQSFVGM 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 LTITDFILVLHRYYRSPLVQIYEIEQHKIETWREIYLQGCFKPLVSISPNDSLFEAVYTL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_059 LTITDFILVLHRYYRSPLVQIYEIEQHKIETWREIYLQGCFKPLVSISPNDSLFEAVYTL 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 IKNRIHRLPVLDPVSGNVLHILTHKRLLKFLHIFGSLLPRPSFLYRTIQDLGIGTFRDLA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_059 IKNRIHRLPVLDPVSGNVLHILTHKRLLKFLHIFGSLLPRPSFLYRTIQDLGIGTFRDLA 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 VVLETAPILTALDIFVDRRVSALPVVNECGQVVGLYSRFDVIHLAAQQTYNHLDMSVGEA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_059 VVLETAPILTALDIFVDRRVSALPVVNECGQVVGLYSRFDVIHLAAQQTYNHLDMSVGEA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 LRQRTLCLEGVLSCQPHESLGEVIDRIAREQVHRLVLVDETQHLLGVVSLSDILQALVLS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_059 LRQRTLCLEGVLSCQPHESLGEVIDRIAREQVHRLVLVDETQHLLGVVSLSDILQALVLS 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 PAGIDALGA ::::::::: NP_059 PAGIDALGA >>XP_016859832 (OMIM: 604976) PREDICTED: 5'-AMP-activate (489 aa) initn: 3252 init1: 3252 opt: 3252 Z-score: 2910.8 bits: 548.0 E(85289): 2.1e-155 Smith-Waterman score: 3252; 99.8% identity (100.0% similar) in 489 aa overlap (1-489:1-489) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MEPGLEHALRRTPSWSSLGGSEHQEMSFLEQENSSSWPSPAVTSSSERIRGKRRAKALRW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 MEPGLEHALRRTPSWSSLGGSEHQEMSFLEQENSSSWPSPAVTSSSERIRGKRRAKALRW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 TRQKSVEEGEPPGQGEGPRSRPAAESTGLEATFPKTTPLAQADPAGVGTPPTGWDCLPSD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 TRQKSVEEGEPPGQGEGPRSRPAAESTGLEATFPKTTPLAQADPAGVGTPPTGWDCLPSD 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 CTASAAGSSTDDVELATEFPATEAWECELEGLLEERPALCLSPQAPFPKLGWDDELRKPG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 CTASAAGSSTDDVELATEFPATEAWECELEGLLEERPALCLSPQAPFPKLGWDDELRKPG 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 AQIYMRFMQEHTCYDAMATSSKLVIFDTMLEIKKAFFALVANSVRAAPLWDSKKQSFVGM ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::: XP_016 AQIYMRFMQEHTCYDAMATSSKLVIFDTMLEIKKAFFALVANGVRAAPLWDSKKQSFVGM 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 LTITDFILVLHRYYRSPLVQIYEIEQHKIETWREIYLQGCFKPLVSISPNDSLFEAVYTL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 LTITDFILVLHRYYRSPLVQIYEIEQHKIETWREIYLQGCFKPLVSISPNDSLFEAVYTL 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 IKNRIHRLPVLDPVSGNVLHILTHKRLLKFLHIFGSLLPRPSFLYRTIQDLGIGTFRDLA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 IKNRIHRLPVLDPVSGNVLHILTHKRLLKFLHIFGSLLPRPSFLYRTIQDLGIGTFRDLA 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 VVLETAPILTALDIFVDRRVSALPVVNECGQVVGLYSRFDVIHLAAQQTYNHLDMSVGEA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 VVLETAPILTALDIFVDRRVSALPVVNECGQVVGLYSRFDVIHLAAQQTYNHLDMSVGEA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 LRQRTLCLEGVLSCQPHESLGEVIDRIAREQVHRLVLVDETQHLLGVVSLSDILQALVLS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 LRQRTLCLEGVLSCQPHESLGEVIDRIAREQVHRLVLVDETQHLLGVVSLSDILQALVLS 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 PAGIDALGA ::::::::: XP_016 PAGIDALGA >>XP_016867765 (OMIM: 194200,261740,600858,602743) PREDI (327 aa) initn: 1392 init1: 1392 opt: 1392 Z-score: 1254.4 bits: 241.0 E(85289): 3.9e-63 Smith-Waterman score: 1392; 63.2% identity (89.2% similar) in 315 aa overlap (169-483:4-318) 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 FPATEAWECELEGLLEERPALCLSPQAPFPKLGWDDELRKPGAQIYMRFMQEHTCYDAMA :: ..::.. . .:::::. : ::: . XP_016 MLEKLEFEDEVEDSESGVYMRFMRSHKCYDIVP 10 20 30 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 TSSKLVIFDTMLEIKKAFFALVANSVRAAPLWDSKKQSFVGMLTITDFILVLHRYYRSPL ::::::.::: :..::::::::::.:::::::.:::::::::::::::: .:::::.::. XP_016 TSSKLVVFDTTLQVKKAFFALVANGVRAAPLWESKKQSFVGMLTITDFINILHRYYKSPM 40 50 60 70 80 90 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 VQIYEIEQHKIETWREIYLQGCFKPLVSISPNDSLFEAVYTLIKNRIHRLPVLDPVSGNV :::::.:.::::::::.::: :::::.:::. :::.:::.::::.::::::.::.:::. XP_016 VQIYELEEHKIETWRELYLQETFKPLVNISPDASLFDAVYSLIKNKIHRLPVIDPISGNA 100 110 120 130 140 150 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 LHILTHKRLLKFLHIFGSLLPRPSFLYRTIQDLGIGTFRDLAVVLETAPILTALDIFVDR :.::::::.::::..: : .:.:.:. .....:::::....: . .::. ::.:::.: XP_016 LYILTHKRILKFLQLFMSDMPKPAFMKQNLDELGIGTYHNIAFIHPDTPIIKALNIFVER 160 170 180 190 200 210 380 390 400 410 420 430 pF1KE5 RVSALPVVNECGQVVGLYSRFDVIHLAAQQTYNHLDMSVGEALRQRTLCLEGVLSCQPHE :.::::::.: :.:: .::.::::.:::..:::.::..: .::..:. .:::..:. : XP_016 RISALPVVDESGKVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDITVTQALQHRSQYFEGVVKCNKLE 220 230 240 250 260 270 440 450 460 470 480 pF1KE5 SLGEVIDRIAREQVHRLVLVDETQHLLGVVSLSDILQALVLSPAGIDALGA : ..:::.: .:::::.:.:.. ..:..:::::::::.:.::: XP_016 ILETIVDRIVRAEVHRLVVVNEADSIVGIISLSDILQALILTPAGAKQKETETE 280 290 300 310 320 >>XP_016867763 (OMIM: 194200,261740,600858,602743) PREDI (377 aa) initn: 1392 init1: 1392 opt: 1392 Z-score: 1253.5 bits: 241.0 E(85289): 4.4e-63 Smith-Waterman score: 1392; 63.2% identity (89.2% similar) in 315 aa overlap (169-483:4-318) 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 FPATEAWECELEGLLEERPALCLSPQAPFPKLGWDDELRKPGAQIYMRFMQEHTCYDAMA :: ..::.. . .:::::. : ::: . XP_016 MLEKLEFEDEVEDSESGVYMRFMRSHKCYDIVP 10 20 30 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 TSSKLVIFDTMLEIKKAFFALVANSVRAAPLWDSKKQSFVGMLTITDFILVLHRYYRSPL ::::::.::: :..::::::::::.:::::::.:::::::::::::::: .:::::.::. XP_016 TSSKLVVFDTTLQVKKAFFALVANGVRAAPLWESKKQSFVGMLTITDFINILHRYYKSPM 40 50 60 70 80 90 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 VQIYEIEQHKIETWREIYLQGCFKPLVSISPNDSLFEAVYTLIKNRIHRLPVLDPVSGNV :::::.:.::::::::.::: :::::.:::. :::.:::.::::.::::::.::.:::. XP_016 VQIYELEEHKIETWRELYLQETFKPLVNISPDASLFDAVYSLIKNKIHRLPVIDPISGNA 100 110 120 130 140 150 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 LHILTHKRLLKFLHIFGSLLPRPSFLYRTIQDLGIGTFRDLAVVLETAPILTALDIFVDR :.::::::.::::..: : .:.:.:. .....:::::....: . .::. ::.:::.: XP_016 LYILTHKRILKFLQLFMSDMPKPAFMKQNLDELGIGTYHNIAFIHPDTPIIKALNIFVER 160 170 180 190 200 210 380 390 400 410 420 430 pF1KE5 RVSALPVVNECGQVVGLYSRFDVIHLAAQQTYNHLDMSVGEALRQRTLCLEGVLSCQPHE :.::::::.: :.:: .::.::::.:::..:::.::..: .::..:. .:::..:. : XP_016 RISALPVVDESGKVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDITVTQALQHRSQYFEGVVKCNKLE 220 230 240 250 260 270 440 450 460 470 480 pF1KE5 SLGEVIDRIAREQVHRLVLVDETQHLLGVVSLSDILQALVLSPAGIDALGA : ..:::.: .:::::.:.:.. ..:..:::::::::.:.::: XP_016 ILETIVDRIVRAEVHRLVVVNEADSIVGIISLSDILQALILTPAGKMLVSDLCHRRLGRV 280 290 300 310 320 330 XP_016 GGRTGSAAFKPSFLHPPTDQGFEYITLKPFSFSLQLGSLSVLRE 340 350 360 370 >>NP_001291456 (OMIM: 194200,261740,600858,602743) 5'-AM (444 aa) initn: 1392 init1: 1392 opt: 1392 Z-score: 1252.5 bits: 241.1 E(85289): 5e-63 Smith-Waterman score: 1398; 51.5% identity (76.5% similar) in 443 aa overlap (51-483:5-435) 30 40 50 60 70 pF1KE5 SEHQEMSFLEQENSSSWPSPAVTSSSERIRGKRRAKALRWTRQKSVE--EGEPPGQ-GEG :. :.. . ...:.: ..:: : . : NP_001 MKRFGSLRSNKKHKDQNRSTERRQSEPHGLFASG 10 20 30 80 90 100 110 120 130 pF1KE5 PRSRPAAES-TGLEATFP----KTTP--LAQADPAGVGTPPTGWDCLPSDCTASAAGSST : :.. . . . ::: : : : . :. . : :: :: : . . 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NP_001 IDPISGNALYILTHKRILKFLQLFMSDMPKPAFMKQNLDELGIGTYHNIAFIHPDTPIIK 270 280 290 300 310 320 380 390 400 410 420 430 pF1KE5 ALDIFVDRRVSALPVVNECGQVVGLYSRFDVIHLAAQQTYNHLDMSVGEALRQRTLCLEG ::.:::.::.::::::.: :.:: .::.::::.:::..:::.::..: .::..:. .:: NP_001 ALNIFVERRISALPVVDESGKVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDITVTQALQHRSQYFEG 330 340 350 360 370 380 440 450 460 470 480 pF1KE5 VLSCQPHESLGEVIDRIAREQVHRLVLVDETQHLLGVVSLSDILQALVLSPAGIDALGA :..:. : : ..:::.: .:::::.:.:.. ..:..:::::::::.:.::: NP_001 VVKCNKLEILETIVDRIVRAEVHRLVVVNEADSIVGIISLSDILQALILTPAGAKQKETE 390 400 410 420 430 440 NP_001 TE >>XP_016867761 (OMIM: 194200,261740,600858,602743) PREDI (524 aa) initn: 1392 init1: 1392 opt: 1392 Z-score: 1251.5 bits: 241.1 E(85289): 5.7e-63 Smith-Waterman score: 1392; 63.2% identity (89.2% similar) in 315 aa overlap (169-483:201-515) 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 FPATEAWECELEGLLEERPALCLSPQAPFPKLGWDDELRKPGAQIYMRFMQEHTCYDAMA :: ..::.. . .:::::. : ::: . 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XP_016 PPLASPTHYAPSKAAALAAALGPAEAGMLEKLEFEDEVEDSESGVYMRFMRSHKCYDIVP 180 190 200 210 220 230 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 TSSKLVIFDTMLEIKKAFFALVANSVRAAPLWDSKKQSFVGMLTITDFILVLHRYYRSPL ::::::.::: :..::::::::::.:::::::.:::::::::::::::: .:::::.::. XP_016 TSSKLVVFDTTLQVKKAFFALVANGVRAAPLWESKKQSFVGMLTITDFINILHRYYKSPM 240 250 260 270 280 290 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 VQIYEIEQHKIETWREIYLQGCFKPLVSISPNDSLFEAVYTLIKNRIHRLPVLDPVSGNV :::::.:.::::::::.::: :::::.:::. :::.:::.::::.::::::.::.:::. 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