FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5658, 489 aa 1>>>pF1KE5658 489 - 489 aa - 489 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9179+/-0.000971; mu= 11.3707+/- 0.059 mean_var=118.3089+/-23.897, 0's: 0 Z-trim(109.4): 19 B-trim: 169 in 1/51 Lambda= 0.117914 statistics sampled from 10860 (10868) to 10860 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.705), E-opt: 0.2 (0.334), width: 16 Scan time: 2.910 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS2424.1 PRKAG3 gene_id:53632|Hs108|chr2 ( 489) 3252 564.3 1.1e-160 CCDS47752.1 PRKAG2 gene_id:51422|Hs108|chr7 ( 328) 1380 245.7 5.6e-65 CCDS43683.1 PRKAG2 gene_id:51422|Hs108|chr7 ( 525) 1380 245.8 8.3e-65 CCDS5928.1 PRKAG2 gene_id:51422|Hs108|chr7 ( 569) 1380 245.9 8.8e-65 CCDS8777.1 PRKAG1 gene_id:5571|Hs108|chr12 ( 331) 1294 231.1 1.4e-60 CCDS55824.1 PRKAG1 gene_id:5571|Hs108|chr12 ( 299) 1275 227.8 1.2e-59 CCDS55825.1 PRKAG1 gene_id:5571|Hs108|chr12 ( 340) 1009 182.6 5.8e-46 >>CCDS2424.1 PRKAG3 gene_id:53632|Hs108|chr2 (489 aa) initn: 3252 init1: 3252 opt: 3252 Z-score: 2998.5 bits: 564.3 E(32554): 1.1e-160 Smith-Waterman score: 3252; 99.8% identity (100.0% similar) in 489 aa overlap (1-489:1-489) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MEPGLEHALRRTPSWSSLGGSEHQEMSFLEQENSSSWPSPAVTSSSERIRGKRRAKALRW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS24 MEPGLEHALRRTPSWSSLGGSEHQEMSFLEQENSSSWPSPAVTSSSERIRGKRRAKALRW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 TRQKSVEEGEPPGQGEGPRSRPAAESTGLEATFPKTTPLAQADPAGVGTPPTGWDCLPSD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS24 TRQKSVEEGEPPGQGEGPRSRPAAESTGLEATFPKTTPLAQADPAGVGTPPTGWDCLPSD 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 CTASAAGSSTDDVELATEFPATEAWECELEGLLEERPALCLSPQAPFPKLGWDDELRKPG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS24 CTASAAGSSTDDVELATEFPATEAWECELEGLLEERPALCLSPQAPFPKLGWDDELRKPG 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 AQIYMRFMQEHTCYDAMATSSKLVIFDTMLEIKKAFFALVANSVRAAPLWDSKKQSFVGM ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::: CCDS24 AQIYMRFMQEHTCYDAMATSSKLVIFDTMLEIKKAFFALVANGVRAAPLWDSKKQSFVGM 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 LTITDFILVLHRYYRSPLVQIYEIEQHKIETWREIYLQGCFKPLVSISPNDSLFEAVYTL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS24 LTITDFILVLHRYYRSPLVQIYEIEQHKIETWREIYLQGCFKPLVSISPNDSLFEAVYTL 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 IKNRIHRLPVLDPVSGNVLHILTHKRLLKFLHIFGSLLPRPSFLYRTIQDLGIGTFRDLA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS24 IKNRIHRLPVLDPVSGNVLHILTHKRLLKFLHIFGSLLPRPSFLYRTIQDLGIGTFRDLA 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 VVLETAPILTALDIFVDRRVSALPVVNECGQVVGLYSRFDVIHLAAQQTYNHLDMSVGEA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS24 VVLETAPILTALDIFVDRRVSALPVVNECGQVVGLYSRFDVIHLAAQQTYNHLDMSVGEA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 LRQRTLCLEGVLSCQPHESLGEVIDRIAREQVHRLVLVDETQHLLGVVSLSDILQALVLS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS24 LRQRTLCLEGVLSCQPHESLGEVIDRIAREQVHRLVLVDETQHLLGVVSLSDILQALVLS 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 PAGIDALGA ::::::::: CCDS24 PAGIDALGA >>CCDS47752.1 PRKAG2 gene_id:51422|Hs108|chr7 (328 aa) initn: 1372 init1: 1372 opt: 1380 Z-score: 1280.0 bits: 245.7 E(32554): 5.6e-65 Smith-Waterman score: 1380; 63.0% identity (88.9% similar) in 316 aa overlap (169-483:4-319) 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 FPATEAWECELEGLLEERPALCLSPQAPFPKLGWDDE-LRKPGAQIYMRFMQEHTCYDAM :: ..:: .. . .:::::. : ::: . 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CCDS43 RRISALPVVDESGKVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDITVTQALQHRSQYFEGVVKCNKL 420 430 440 450 460 470 440 450 460 470 480 pF1KE5 ESLGEVIDRIAREQVHRLVLVDETQHLLGVVSLSDILQALVLSPAGIDALGA : : ..:::.: .:::::.:.:.. ..:..:::::::::.:.::: CCDS43 EILETIVDRIVRAEVHRLVVVNEADSIVGIISLSDILQALILTPAGAKQKETETE 480 490 500 510 520 >>CCDS5928.1 PRKAG2 gene_id:51422|Hs108|chr7 (569 aa) initn: 1372 init1: 1372 opt: 1380 Z-score: 1276.5 bits: 245.9 E(32554): 8.8e-65 Smith-Waterman score: 1380; 63.0% identity (88.9% similar) in 316 aa overlap (169-483:245-560) 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 FPATEAWECELEGLLEERPALCLSPQAPFPKLGWDDE-LRKPGAQIYMRFMQEHTCYDAM :: ..:: .. . .:::::. : ::: . CCDS59 PPLASPTHYAPSKAAALAAALGPAEAGMLEKLEFEDEAVEDSESGVYMRFMRSHKCYDIV 220 230 240 250 260 270 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 ATSSKLVIFDTMLEIKKAFFALVANSVRAAPLWDSKKQSFVGMLTITDFILVLHRYYRSP ::::::.::: :..::::::::::.:::::::.:::::::::::::::: .:::::.:: CCDS59 PTSSKLVVFDTTLQVKKAFFALVANGVRAAPLWESKKQSFVGMLTITDFINILHRYYKSP 280 290 300 310 320 330 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 LVQIYEIEQHKIETWREIYLQGCFKPLVSISPNDSLFEAVYTLIKNRIHRLPVLDPVSGN .:::::.:.::::::::.::: :::::.:::. :::.:::.::::.::::::.::.::: CCDS59 MVQIYELEEHKIETWRELYLQETFKPLVNISPDASLFDAVYSLIKNKIHRLPVIDPISGN 340 350 360 370 380 390 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 VLHILTHKRLLKFLHIFGSLLPRPSFLYRTIQDLGIGTFRDLAVVLETAPILTALDIFVD .:.::::::.::::..: : .:.:.:. .....:::::....: . .::. ::.:::. CCDS59 ALYILTHKRILKFLQLFMSDMPKPAFMKQNLDELGIGTYHNIAFIHPDTPIIKALNIFVE 400 410 420 430 440 450 380 390 400 410 420 430 pF1KE5 RRVSALPVVNECGQVVGLYSRFDVIHLAAQQTYNHLDMSVGEALRQRTLCLEGVLSCQPH ::.::::::.: :.:: .::.::::.:::..:::.::..: .::..:. .:::..:. CCDS59 RRISALPVVDESGKVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDITVTQALQHRSQYFEGVVKCNKL 460 470 480 490 500 510 440 450 460 470 480 pF1KE5 ESLGEVIDRIAREQVHRLVLVDETQHLLGVVSLSDILQALVLSPAGIDALGA : : ..:::.: .:::::.:.:.. ..:..:::::::::.:.::: CCDS59 EILETIVDRIVRAEVHRLVVVNEADSIVGIISLSDILQALILTPAGAKQKETETE 520 530 540 550 560 >>CCDS8777.1 PRKAG1 gene_id:5571|Hs108|chr12 (331 aa) initn: 1326 init1: 1283 opt: 1294 Z-score: 1200.9 bits: 231.1 E(32554): 1.4e-60 Smith-Waterman score: 1294; 63.1% identity (86.6% similar) in 306 aa overlap (175-480:20-325) 150 160 170 180 190 200 pF1KE5 WECELEGLLEERPALCLSPQAPFPKLGWDDELRKPGAQIYMRFMQEHTCYDAMATSSKLV : . . ..: ::. : ::: . :::::: CCDS87 METVISSDSSPAVENEHPQETPESNNSVYTSFMKSHRCYDLIPTSSKLV 10 20 30 40 210 220 230 240 250 260 pF1KE5 IFDTMLEIKKAFFALVANSVRAAPLWDSKKQSFVGMLTITDFILVLHRYYRSPLVQIYEI .::: :..::::::::.:.:::::::::::::::::::::::: .:::::.: ::::::. CCDS87 VFDTSLQVKKAFFALVTNGVRAAPLWDSKKQSFVGMLTITDFINILHRYYKSALVQIYEL 50 60 70 80 90 100 270 280 290 300 310 320 pF1KE5 EQHKIETWREIYLQGCFKPLVSISPNDSLFEAVYTLIKNRIHRLPVLDPVSGNVLHILTH :.::::::::.::: ::::: :::: :::.:: .::.:.::::::.:: :::.:.:::: CCDS87 EEHKIETWREVYLQDSFKPLVCISPNASLFDAVSSLIRNKIHRLPVIDPESGNTLYILTH 110 120 130 140 150 160 330 340 350 360 370 380 pF1KE5 KRLLKFLHIFGSLLPRPSFLYRTIQDLGIGTFRDLAVVLETAPILTALDIFVDRRVSALP ::.::::..: . .:.: :. .....: :::. ..:.: :.:. .:: :::..:::::: CCDS87 KRILKFLKLFITEFPKPEFMSKSLEELQIGTYANIAMVRTTTPVYVALGIFVQHRVSALP 170 180 190 200 210 220 390 400 410 420 430 440 pF1KE5 VVNECGQVVGLYSRFDVIHLAAQQTYNHLDMSVGEALRQRTLCLEGVLSCQPHESLGEVI ::.: :.:: .::.::::.:::..:::.::.:: .::..:. .::::.: ::.: .: CCDS87 VVDEKGRVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDVSVTKALQHRSHYFEGVLKCYLHETLETII 230 240 250 260 270 280 450 460 470 480 pF1KE5 DRIAREQVHRLVLVDETQHLLGVVSLSDILQALVLSPAGIDALGA .:... .:::::.:::.. . :.::::::::::::. CCDS87 NRLVEAEVHRLVVVDENDVVKGIVSLSDILQALVLTGGEKKP 290 300 310 320 330 >>CCDS55824.1 PRKAG1 gene_id:5571|Hs108|chr12 (299 aa) initn: 1301 init1: 1258 opt: 1275 Z-score: 1184.0 bits: 227.8 E(32554): 1.2e-59 Smith-Waterman score: 1275; 64.8% identity (88.1% similar) in 293 aa overlap (188-480:1-293) 160 170 180 190 200 210 pF1KE5 ALCLSPQAPFPKLGWDDELRKPGAQIYMRFMQEHTCYDAMATSSKLVIFDTMLEIKKAFF :. : ::: . ::::::.::: :..::::: CCDS55 MKSHRCYDLIPTSSKLVVFDTSLQVKKAFF 10 20 30 220 230 240 250 260 270 pF1KE5 ALVANSVRAAPLWDSKKQSFVGMLTITDFILVLHRYYRSPLVQIYEIEQHKIETWREIYL :::.:.:::::::::::::::::::::::: .:::::.: ::::::.:.::::::::.:: CCDS55 ALVTNGVRAAPLWDSKKQSFVGMLTITDFINILHRYYKSALVQIYELEEHKIETWREVYL 40 50 60 70 80 90 280 290 300 310 320 330 pF1KE5 QGCFKPLVSISPNDSLFEAVYTLIKNRIHRLPVLDPVSGNVLHILTHKRLLKFLHIFGSL : ::::: :::: :::.:: .::.:.::::::.:: :::.:.::::::.::::..: . CCDS55 QDSFKPLVCISPNASLFDAVSSLIRNKIHRLPVIDPESGNTLYILTHKRILKFLKLFITE 100 110 120 130 140 150 340 350 360 370 380 390 pF1KE5 LPRPSFLYRTIQDLGIGTFRDLAVVLETAPILTALDIFVDRRVSALPVVNECGQVVGLYS .:.: :. .....: :::. ..:.: :.:. .:: :::..::::::::.: :.:: .:: CCDS55 FPKPEFMSKSLEELQIGTYANIAMVRTTTPVYVALGIFVQHRVSALPVVDEKGRVVDIYS 160 170 180 190 200 210 400 410 420 430 440 450 pF1KE5 RFDVIHLAAQQTYNHLDMSVGEALRQRTLCLEGVLSCQPHESLGEVIDRIAREQVHRLVL .::::.:::..:::.::.:: .::..:. .::::.: ::.: .:.:... .:::::. CCDS55 KFDVINLAAEKTYNNLDVSVTKALQHRSHYFEGVLKCYLHETLETIINRLVEAEVHRLVV 220 230 240 250 260 270 460 470 480 pF1KE5 VDETQHLLGVVSLSDILQALVLSPAGIDALGA :::.. . :.::::::::::::. CCDS55 VDENDVVKGIVSLSDILQALVLTGGEKKP 280 290 >>CCDS55825.1 PRKAG1 gene_id:5571|Hs108|chr12 (340 aa) initn: 1322 init1: 1008 opt: 1009 Z-score: 938.7 bits: 182.6 E(32554): 5.8e-46 Smith-Waterman score: 1266; 61.3% identity (84.1% similar) in 315 aa overlap (175-480:20-334) 150 160 170 180 190 200 pF1KE5 WECELEGLLEERPALCLSPQAPFPKLGWDDELRKPGAQIYMRFMQEHTCYDAMATSSKLV : . . ..: ::. : ::: . :::::: CCDS55 METVISSDSSPAVENEHPQETPESNNSVYTSFMKSHRCYDLIPTSSKLV 10 20 30 40 210 220 230 240 250 pF1KE5 IFDTMLEIKKAFFALVANSVRAAPLWDSKKQSFV---------GMLTITDFILVLHRYYR .::: :..::::::::.:.::::::::::::::: ::::::::: .:::::. CCDS55 VFDTSLQVKKAFFALVTNGVRAAPLWDSKKQSFVVLRALSCPLGMLTITDFINILHRYYK 50 60 70 80 90 100 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 SPLVQIYEIEQHKIETWREIYLQGCFKPLVSISPNDSLFEAVYTLIKNRIHRLPVLDPVS : ::::::.:.::::::::.::: ::::: :::: :::.:: .::.:.::::::.:: : CCDS55 SALVQIYELEEHKIETWREVYLQDSFKPLVCISPNASLFDAVSSLIRNKIHRLPVIDPES 110 120 130 140 150 160 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 GNVLHILTHKRLLKFLHIFGSLLPRPSFLYRTIQDLGIGTFRDLAVVLETAPILTALDIF ::.:.::::::.::::..: . .:.: :. .....: :::. ..:.: :.:. .:: :: CCDS55 GNTLYILTHKRILKFLKLFITEFPKPEFMSKSLEELQIGTYANIAMVRTTTPVYVALGIF 170 180 190 200 210 220 380 390 400 410 420 430 pF1KE5 VDRRVSALPVVNECGQVVGLYSRFDVIHLAAQQTYNHLDMSVGEALRQRTLCLEGVLSCQ :..::::::::.: :.:: .::.::::.:::..:::.::.:: .::..:. .::::.: CCDS55 VQHRVSALPVVDEKGRVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDVSVTKALQHRSHYFEGVLKCY 230 240 250 260 270 280 440 450 460 470 480 pF1KE5 PHESLGEVIDRIAREQVHRLVLVDETQHLLGVVSLSDILQALVLSPAGIDALGA ::.: .:.:... .:::::.:::.. . :.::::::::::::. CCDS55 LHETLETIINRLVEAEVHRLVVVDENDVVKGIVSLSDILQALVLTGGEKKP 290 300 310 320 330 340 489 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 05:36:20 2016 done: Tue Nov 8 05:36:20 2016 Total Scan time: 2.910 Total Display time: 0.030 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]