Result of FASTA (omim) for pFN21AE5571
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE5571, 453 aa
  1>>>pF1KE5571 453 - 453 aa - 453 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8938+/-0.000387; mu= 15.0644+/- 0.024
 mean_var=77.1901+/-15.474, 0's: 0 Z-trim(113.0): 156  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.145980
 statistics sampled from 22035 (22205) to 22035 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.617), E-opt: 0.2 (0.26), width:  16
 Scan time:  8.690

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_000802 (OMIM: 137143) gamma-aminobutyric acid r ( 453) 2968 634.7 1.5e-181
NP_000800 (OMIM: 137141) gamma-aminobutyric acid r ( 554) 1901 410.1 7.8e-114
NP_001191195 (OMIM: 137141) gamma-aminobutyric aci ( 535) 1883 406.3  1e-112
NP_000799 (OMIM: 305660) gamma-aminobutyric acid r ( 492) 1704 368.5 2.2e-101
NP_001121120 (OMIM: 137160,611136,615744) gamma-am ( 456) 1660 359.3 1.3e-98
NP_001121115 (OMIM: 137160,611136,615744) gamma-am ( 456) 1660 359.3 1.3e-98
NP_000797 (OMIM: 137160,611136,615744) gamma-amino ( 456) 1660 359.3 1.3e-98
NP_001121116 (OMIM: 137160,611136,615744) gamma-am ( 456) 1660 359.3 1.3e-98
NP_001121117 (OMIM: 137160,611136,615744) gamma-am ( 456) 1660 359.3 1.3e-98
XP_005268315 (OMIM: 137142) PREDICTED: gamma-amino ( 462) 1575 341.4 3.1e-93
NP_001158509 (OMIM: 137142) gamma-aminobutyric aci ( 462) 1575 341.4 3.1e-93
NP_000801 (OMIM: 137142) gamma-aminobutyric acid r ( 462) 1575 341.4 3.1e-93
XP_006720522 (OMIM: 137142) PREDICTED: gamma-amino ( 462) 1575 341.4 3.1e-93
XP_016863471 (OMIM: 103780,137140) PREDICTED: gamm ( 451) 1532 332.3 1.6e-90
NP_001107647 (OMIM: 103780,137140) gamma-aminobuty ( 451) 1532 332.3 1.6e-90
XP_016863472 (OMIM: 103780,137140) PREDICTED: gamm ( 451) 1532 332.3 1.6e-90
NP_000798 (OMIM: 103780,137140) gamma-aminobutyric ( 451) 1532 332.3 1.6e-90
XP_011511977 (OMIM: 103780,137140) PREDICTED: gamm ( 511) 1532 332.3 1.8e-90
NP_001317619 (OMIM: 103780,137140) gamma-aminobuty ( 511) 1532 332.3 1.8e-90
XP_005248137 (OMIM: 103780,137140) PREDICTED: gamm ( 396) 1324 288.5 2.2e-77
NP_001273756 (OMIM: 103780,137140) gamma-aminobuty ( 456) 1324 288.5 2.5e-77
NP_944494 (OMIM: 137164,607681,611277) gamma-amino ( 475) 1312 286.0 1.5e-76
XP_006724874 (OMIM: 305660) PREDICTED: gamma-amino ( 340) 1265 276.0 1.1e-73
NP_000807 (OMIM: 137164,607681,611277) gamma-amino ( 467) 1260 275.0 2.9e-73
XP_016877545 (OMIM: 137142) PREDICTED: gamma-amino ( 306) 1256 274.1 3.6e-73
XP_016877544 (OMIM: 137142) PREDICTED: gamma-amino ( 306) 1256 274.1 3.6e-73
NP_775807 (OMIM: 137166) gamma-aminobutyric acid r ( 465) 1219 266.4 1.2e-70
NP_150092 (OMIM: 600233) gamma-aminobutyric acid r ( 467) 1186 259.4 1.4e-68
XP_011519732 (OMIM: 600233) PREDICTED: gamma-amino ( 473) 1184 259.0 1.9e-68
NP_001191196 (OMIM: 137141) gamma-aminobutyric aci ( 484) 1179 258.0 4.1e-68
NP_004952 (OMIM: 300093) gamma-aminobutyric acid r ( 506) 1039 228.5 3.2e-59
XP_016863479 (OMIM: 137166) PREDICTED: gamma-amino ( 336) 1021 224.6 3.1e-58
XP_016864119 (OMIM: 600421) PREDICTED: glycine rec ( 424)  978 215.6   2e-55
NP_006520 (OMIM: 600421) glycine receptor subunit  ( 464)  978 215.6 2.2e-55
NP_001139512 (OMIM: 138491,149400) glycine recepto ( 457)  975 215.0 3.4e-55
XP_016877548 (OMIM: 600233) PREDICTED: gamma-amino ( 355)  945 208.6 2.2e-53
XP_016877547 (OMIM: 600233) PREDICTED: gamma-amino ( 361)  943 208.2 2.9e-53
XP_016884875 (OMIM: 300093) PREDICTED: gamma-amino ( 393)  913 201.9 2.5e-51
XP_016884878 (OMIM: 300093) PREDICTED: gamma-amino ( 267)  910 201.2 2.8e-51
XP_006724550 (OMIM: 305990) PREDICTED: glycine rec ( 436)  894 197.9 4.4e-50
XP_011543797 (OMIM: 305990) PREDICTED: glycine rec ( 436)  894 197.9 4.4e-50
XP_011543798 (OMIM: 305990) PREDICTED: glycine rec ( 436)  894 197.9 4.4e-50
NP_001036008 (OMIM: 600421) glycine receptor subun ( 449)  894 197.9 4.5e-50
NP_002054 (OMIM: 305990) glycine receptor subunit  ( 452)  894 197.9 4.5e-50
NP_001112357 (OMIM: 305990) glycine receptor subun ( 452)  894 197.9 4.5e-50
NP_001112358 (OMIM: 305990) glycine receptor subun ( 452)  892 197.5 6.1e-50
XP_016884916 (OMIM: 305990) PREDICTED: glycine rec ( 452)  892 197.5 6.1e-50
NP_000162 (OMIM: 138491,149400) glycine receptor s ( 449)  872 193.3 1.1e-48
XP_016864838 (OMIM: 138491,149400) PREDICTED: glyc ( 465)  872 193.3 1.2e-48
NP_001243632 (OMIM: 137161) gamma-aminobutyric aci ( 462)  868 192.5 2.1e-48


>>NP_000802 (OMIM: 137143) gamma-aminobutyric acid recep  (453 aa)
 initn: 2968 init1: 2968 opt: 2968  Z-score: 3380.5  bits: 634.7 E(85289): 1.5e-181
Smith-Waterman score: 2968; 100.0% identity (100.0% similar) in 453 aa overlap (1-453:1-453)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MASSLPWLCIILWLENALGKLEVEGNFYSENVSRILDNLLEGYDNRLRPGFGGAVTEVKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MASSLPWLCIILWLENALGKLEVEGNFYSENVSRILDNLLEGYDNRLRPGFGGAVTEVKT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 DIYVTSFGPVSDVEMEYTMDVFFRQTWTDERLKFGGPTEILSLNNLMVSKIWTPDTFFRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DIYVTSFGPVSDVEMEYTMDVFFRQTWTDERLKFGGPTEILSLNNLMVSKIWTPDTFFRN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 GKKSIAHNMTTPNKLFRIMQNGTILYTMRLTINADCPMRLVNFPMDGHACPLKFGSYAYP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GKKSIAHNMTTPNKLFRIMQNGTILYTMRLTINADCPMRLVNFPMDGHACPLKFGSYAYP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 KSEIIYTWKKGPLYSVEVPEESSSLLQYDLIGQTVSSETIKSNTGEYVIMTVYFHLQRKM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KSEIIYTWKKGPLYSVEVPEESSSLLQYDLIGQTVSSETIKSNTGEYVIMTVYFHLQRKM
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 GYFMIQIYTPCIMTVILSQVSFWINKESVPARTVFGITTVLTMTTLSISARHSLPKVSYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GYFMIQIYTPCIMTVILSQVSFWINKESVPARTVFGITTVLTMTTLSISARHSLPKVSYA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 TAMDWFIAVCFAFVFSALIEFAAVNYFTNLQTQKAKRKAQFAAPPTVTISKATEPLEAEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TAMDWFIAVCFAFVFSALIEFAAVNYFTNLQTQKAKRKAQFAAPPTVTISKATEPLEAEI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE5 VLHPDSKYHLKKRITSLSLPIVSSSEANKVLTRAPILQSTPVTPPPLSPAFGGTSKIDQY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VLHPDSKYHLKKRITSLSLPIVSSSEANKVLTRAPILQSTPVTPPPLSPAFGGTSKIDQY
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450   
pF1KE5 SRILFPVAFAGFNLVYWVVYLSKDTMEVSSSVE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SRILFPVAFAGFNLVYWVVYLSKDTMEVSSSVE
              430       440       450   

>>NP_000800 (OMIM: 137141) gamma-aminobutyric acid recep  (554 aa)
 initn: 2112 init1: 1888 opt: 1901  Z-score: 2164.7  bits: 410.1 E(85289): 7.8e-114
Smith-Waterman score: 1901; 76.3% identity (90.2% similar) in 376 aa overlap (5-377:21-393)

                               10        20        30        40    
pF1KE5                 MASSLPWLCIILWLENALGKLEVEGNFYSENVSRILDNLLEGYD
                           : .::. . :... :. . : .. .:: .::::.::.:::
NP_000 MVSAKKVPAIALSAGVSFALLRFLCLAVCLNESPGQNQKEEKLCTENFTRILDSLLDGYD
               10        20        30        40        50        60

           50        60        70        80        90       100    
pF1KE5 NRLRPGFGGAVTEVKTDIYVTSFGPVSDVEMEYTMDVFFRQTWTDERLKFGGPTEILSLN
       ::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::: :.:::. :: ::: ::
NP_000 NRLRPGFGGPVTEVKTDIYVTSFGPVSDVEMEYTMDVFFRQTWIDKRLKYDGPIEILRLN
               70        80        90       100       110       120

          110       120       130       140       150       160    
pF1KE5 NLMVSKIWTPDTFFRNGKKSIAHNMTTPNKLFRIMQNGTILYTMRLTINADCPMRLVNFP
       :.::.:.:::::::::::::..::::.::::::::.::::::::::::.:.::::::.::
NP_000 NMMVTKVWTPDTFFRNGKKSVSHNMTAPNKLFRIMRNGTILYTMRLTISAECPMRLVDFP
              130       140       150       160       170       180

          170       180       190       200       210       220    
pF1KE5 MDGHACPLKFGSYAYPKSEIIYTWKKGPLYSVEVPEESSSLLQYDLIGQTVSSETIKSNT
       :::::::::::::::::::.:::: :::  :::::.:::::.:::::::::::::::: :
NP_000 MDGHACPLKFGSYAYPKSEMIYTWTKGPEKSVEVPKESSSLVQYDLIGQTVSSETIKSIT
              190       200       210       220       230       240

          230       240       250       260       270       280    
pF1KE5 GEYVIMTVYFHLQRKMGYFMIQIYTPCIMTVILSQVSFWINKESVPARTVFGITTVLTMT
       :::..:::::::.::::::::: : :::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GEYIVMTVYFHLRRKMGYFMIQTYIPCIMTVILSQVSFWINKESVPARTVFGITTVLTMT
              250       260       270       280       290       300

          290       300       310       320       330       340    
pF1KE5 TLSISARHSLPKVSYATAMDWFIAVCFAFVFSALIEFAAVNYFTNLQTQKAKRKAQFAAP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.: .:::::..   :
NP_000 TLSISARHSLPKVSYATAMDWFIAVCFAFVFSALIEFAAVNYFTNIQMEKAKRKTS-KPP
              310       320       330       340       350          

             350       360       370       380       390       400 
pF1KE5 ---PTVTISKATEPLEAEIVLHPDSKYHLKKRITSLSLPIVSSSEANKVLTRAPILQSTP
          :.. ...  .: :: .  . ... ...:: ..:                        
NP_000 QEVPAAPVQREKHP-EAPL-QNTNANLNMRKRTNALVHSESDVGNRTEVGNHSSKSSTVV
     360       370         380       390       400       410       

             410       420       430       440       450           
pF1KE5 VTPPPLSPAFGGTSKIDQYSRILFPVAFAGFNLVYWVVYLSKDTMEVSSSVE        
                                                                   
NP_000 QESSKGTPRSYLASSPNPFSRANAAETISAARALPSASPTSIRTGYMPRKASVGSASTRH
       420       430       440       450       460       470       

>--
 initn: 271 init1: 209 opt: 241  Z-score: 275.3  bits: 60.5 E(85289): 1.4e-08
Smith-Waterman score: 241; 37.8% identity (64.4% similar) in 135 aa overlap (331-452:419-553)

              310       320       330       340        350         
pF1KE5 TAMDWFIAVCFAFVFSALIEFAAVNYFTNLQTQKAKRKAQFAAPPT-VTISKATEPLEAE
                                     ...:.  .. .:. :.  . ..:.: . : 
NP_000 RTNALVHSESDVGNRTEVGNHSSKSSTVVQESSKGTPRSYLASSPNPFSRANAAETISAA
      390       400       410       420       430       440        

     360       370              380       390       400            
pF1KE5 IVLHPDSKYHL-------KKRITSLSLPIVSSSEANKVLTRAPILQST---PVTPPPLSP
        .:   :   .       :  . : :   : .:. ... : .  . .:    .:::: .:
NP_000 RALPSASPTSIRTGYMPRKASVGSASTRHVFGSRLQRIKTTVNTIGATGKLSATPPPSAP
      450       460       470       480       490       500        

       410       420       430       440       450   
pF1KE5 --AFGGTSKIDQYSRILFPVAFAGFNLVYWVVYLSKDTMEVSSSVE
         . .::::::.:.::::::.:..::.::::::::::::: : :. 
NP_000 PPSGSGTSKIDKYARILFPVTFGAFNMVYWVVYLSKDTMEKSESLM
      510       520       530       540       550    

>>NP_001191195 (OMIM: 137141) gamma-aminobutyric acid re  (535 aa)
 initn: 2086 init1: 1862 opt: 1883  Z-score: 2144.4  bits: 406.3 E(85289): 1e-112
Smith-Waterman score: 1883; 77.4% identity (90.7% similar) in 367 aa overlap (14-377:11-374)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MASSLPWLCIILWLENALGKLEVEGNFYSENVSRILDNLLEGYDNRLRPGFGGAVTEVKT
                    :... :. . : .. .:: .::::.::.:::::::::::: ::::::
NP_001    MLQRWFLPRSLNESPGQNQKEEKLCTENFTRILDSLLDGYDNRLRPGFGGPVTEVKT
                  10        20        30        40        50       

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 DIYVTSFGPVSDVEMEYTMDVFFRQTWTDERLKFGGPTEILSLNNLMVSKIWTPDTFFRN
       ::::::::::::::::::::::::::: :.:::. :: ::: :::.::.:.:::::::::
NP_001 DIYVTSFGPVSDVEMEYTMDVFFRQTWIDKRLKYDGPIEILRLNNMMVTKVWTPDTFFRN
        60        70        80        90       100       110       

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 GKKSIAHNMTTPNKLFRIMQNGTILYTMRLTINADCPMRLVNFPMDGHACPLKFGSYAYP
       ::::..::::.::::::::.::::::::::::.:.::::::.::::::::::::::::::
NP_001 GKKSVSHNMTAPNKLFRIMRNGTILYTMRLTISAECPMRLVDFPMDGHACPLKFGSYAYP
       120       130       140       150       160       170       

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 KSEIIYTWKKGPLYSVEVPEESSSLLQYDLIGQTVSSETIKSNTGEYVIMTVYFHLQRKM
       :::.:::: :::  :::::.:::::.:::::::::::::::: ::::..:::::::.:::
NP_001 KSEMIYTWTKGPEKSVEVPKESSSLVQYDLIGQTVSSETIKSITGEYIVMTVYFHLRRKM
       180       190       200       210       220       230       

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 GYFMIQIYTPCIMTVILSQVSFWINKESVPARTVFGITTVLTMTTLSISARHSLPKVSYA
       :::::: : :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GYFMIQTYIPCIMTVILSQVSFWINKESVPARTVFGITTVLTMTTLSISARHSLPKVSYA
       240       250       260       270       280       290       

              310       320       330       340          350       
pF1KE5 TAMDWFIAVCFAFVFSALIEFAAVNYFTNLQTQKAKRKAQFAAP---PTVTISKATEPLE
       :::::::::::::::::::::::::::::.: .:::::..   :   :.. ...  .: :
NP_001 TAMDWFIAVCFAFVFSALIEFAAVNYFTNIQMEKAKRKTS-KPPQEVPAAPVQREKHP-E
       300       310       320       330        340       350      

       360       370       380       390       400       410       
pF1KE5 AEIVLHPDSKYHLKKRITSLSLPIVSSSEANKVLTRAPILQSTPVTPPPLSPAFGGTSKI
       : .  . ... ...:: ..:                                        
NP_001 APL-QNTNANLNMRKRTNALVHSESDVGNRTEVGNHSSKSSTVVQESSKGTPRSYLASSP
          360       370       380       390       400       410    

>--
 initn: 271 init1: 209 opt: 241  Z-score: 275.5  bits: 60.4 E(85289): 1.3e-08
Smith-Waterman score: 241; 37.8% identity (64.4% similar) in 135 aa overlap (331-452:400-534)

              310       320       330       340        350         
pF1KE5 TAMDWFIAVCFAFVFSALIEFAAVNYFTNLQTQKAKRKAQFAAPPT-VTISKATEPLEAE
                                     ...:.  .. .:. :.  . ..:.: . : 
NP_001 RTNALVHSESDVGNRTEVGNHSSKSSTVVQESSKGTPRSYLASSPNPFSRANAAETISAA
     370       380       390       400       410       420         

     360       370              380       390       400            
pF1KE5 IVLHPDSKYHL-------KKRITSLSLPIVSSSEANKVLTRAPILQST---PVTPPPLSP
        .:   :   .       :  . : :   : .:. ... : .  . .:    .:::: .:
NP_001 RALPSASPTSIRTGYMPRKASVGSASTRHVFGSRLQRIKTTVNTIGATGKLSATPPPSAP
     430       440       450       460       470       480         

       410       420       430       440       450   
pF1KE5 --AFGGTSKIDQYSRILFPVAFAGFNLVYWVVYLSKDTMEVSSSVE
         . .::::::.:.::::::.:..::.::::::::::::: : :. 
NP_001 PPSGSGTSKIDKYARILFPVTFGAFNMVYWVVYLSKDTMEKSESLM
     490       500       510       520       530     

>>NP_000799 (OMIM: 305660) gamma-aminobutyric acid recep  (492 aa)
 initn: 1699 init1: 1575 opt: 1704  Z-score: 1941.3  bits: 368.5 E(85289): 2.2e-101
Smith-Waterman score: 1706; 61.2% identity (83.0% similar) in 423 aa overlap (33-445:68-483)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KE5 SSLPWLCIILWLENALGKLEVEGNFYSENVSRILDNLLEGYDNRLRPGFGGAVTEVKTDI
                                     .:::: ::.:::::::::.: :::::::::
NP_000 GDFVKQDIGGLSPKHAPDIPDDSTDNITIFTRILDRLLDGYDNRLRPGLGDAVTEVKTDI
        40        50        60        70        80        90       

             70        80        90       100       110       120  
pF1KE5 YVTSFGPVSDVEMEYTMDVFFRQTWTDERLKFGGPTEILSLNNLMVSKIWTPDTFFRNGK
       ::::::::::..::::.:::::::: :::::: :: .:: ::::..::::::::::.:::
NP_000 YVTSFGPVSDTDMEYTIDVFFRQTWHDERLKFDGPMKILPLNNLLASKIWTPDTFFHNGK
       100       110       120       130       140       150       

            130       140       150       160       170       180  
pF1KE5 KSIAHNMTTPNKLFRIMQNGTILYTMRLTINADCPMRLVNFPMDGHACPLKFGSYAYPKS
       ::.::::::::::.:...:::.::::::::.:.:::.: .:::: ::::::::::::  .
NP_000 KSVAHNMTTPNKLLRLVDNGTLLYTMRLTIHAECPMHLEDFPMDVHACPLKFGSYAYTTA
       160       170       180       190       200       210       

            190       200       210       220       230       240  
pF1KE5 EIIYTWKKGPLYSVEVPEESSSLLQYDLIGQTVSSETIKSNTGEYVIMTVYFHLQRKMGY
       :..:.:  :   :::: ...: : ::::.:..:..: :.:.:::::.::..:::.::.::
NP_000 EVVYSWTLGKNKSVEVAQDGSRLNQYDLLGHVVGTEIIRSSTGEYVVMTTHFHLKRKIGY
       220       230       240       250       260       270       

            250       260       270       280       290       300  
pF1KE5 FMIQIYTPCIMTVILSQVSFWINKESVPARTVFGITTVLTMTTLSISARHSLPKVSYATA
       :.:: : ::::::::::::::.:.::::::::::.::::::::::::::.:::::.::::
NP_000 FVIQTYLPCIMTVILSQVSFWLNRESVPARTVFGVTTVLTMTTLSISARNSLPKVAYATA
       280       290       300       310       320       330       

            310       320       330       340            350       
pF1KE5 MDWFIAVCFAFVFSALIEFAAVNYFTNLQTQKAKRKAQFA-----APPTVTISKATEPLE
       ::::::::.:::::::::::.:::::. .     .:.  :       :..  .:..  ..
NP_000 MDWFIAVCYAFVFSALIEFATVNYFTKRSWAWEGKKVPEALEMKKKTPAAPAKKTSTTFN
       340       350       360       370       380       390       

       360            370       380       390       400       410  
pF1KE5 AEIVLHP-----DSKYHLKKRITSLSLPIVSSSEANKVLTRAPILQSTPVTPPPLSPAFG
          . .:     :...   . :.. . : .::. .  .  .:  .:..:.     . ...
NP_000 IVGTTYPINLAKDTEF---STISKGAAPSASSTPTIIASPKATYVQDSPTE----TKTYN
       400       410          420       430       440           450

            420       430       440       450    
pF1KE5 GTSKIDQYSRILFPVAFAGFNLVYWVVYLSKDTMEVSSSVE 
       ..::.:. :::.::: :: ::::::..:.....         
NP_000 SVSKVDKISRIIFPVLFAIFNLVYWATYVNRESAIKGMIRKQ
              460       470       480       490  

>>NP_001121120 (OMIM: 137160,611136,615744) gamma-aminob  (456 aa)
 initn: 1692 init1: 1557 opt: 1660  Z-score: 1891.7  bits: 359.3 E(85289): 1.3e-98
Smith-Waterman score: 1664; 61.3% identity (80.8% similar) in 416 aa overlap (33-444:43-446)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KE5 SSLPWLCIILWLENALGKLEVEGNFYSENVSRILDNLLEGYDNRLRPGFGGAVTEVKTDI
                                     .:::: ::.:::::::::.:  ::::::::
NP_001 AWILLLSTLTGRSYGQPSLQDELKDNTTVFTRILDRLLDGYDNRLRPGLGERVTEVKTDI
             20        30        40        50        60        70  

             70        80        90       100       110       120  
pF1KE5 YVTSFGPVSDVEMEYTMDVFFRQTWTDERLKFGGPTEILSLNNLMVSKIWTPDTFFRNGK
       .::::::::: .::::.::::::.: :::::: ::  .: :::::.::::::::::.:::
NP_001 FVTSFGPVSDHDMEYTIDVFFRQSWKDERLKFKGPMTVLRLNNLMASKIWTPDTFFHNGK
             80        90       100       110       120       130  

            130       140       150       160       170       180  
pF1KE5 KSIAHNMTTPNKLFRIMQNGTILYTMRLTINADCPMRLVNFPMDGHACPLKFGSYAYPKS
       ::.::::: ::::.:: ..::.:::::::. :.:::.: .::::.:::::::::::: ..
NP_001 KSVAHNMTMPNKLLRITEDGTLLYTMRLTVRAECPMHLEDFPMDAHACPLKFGSYAYTRA
            140       150       160       170       180       190  

            190       200       210       220       230       240  
pF1KE5 EIIYTWKKGPLYSVEVPEESSSLLQYDLIGQTVSSETIKSNTGEYVIMTVYFHLQRKMGY
       :..: : . :  :: : :..: : ::::.::::.:  ..:.:::::.::..:::.::.::
NP_001 EVVYEWTREPARSVVVAEDGSRLNQYDLLGQTVDSGIVQSSTGEYVVMTTHFHLKRKIGY
            200       210       220       230       240       250  

            250       260       270       280       290       300  
pF1KE5 FMIQIYTPCIMTVILSQVSFWINKESVPARTVFGITTVLTMTTLSISARHSLPKVSYATA
       :.:: : ::::::::::::::.:.::::::::::.::::::::::::::.:::::.::::
NP_001 FVIQTYLPCIMTVILSQVSFWLNRESVPARTVFGVTTVLTMTTLSISARNSLPKVAYATA
            260       270       280       290       300       310  

            310       320       330       340       350       360  
pF1KE5 MDWFIAVCFAFVFSALIEFAAVNYFTNLQTQKAKRKAQFAAPPTVTISKATEPLEAEIVL
       ::::::::.:::::::::::.:::::. .      :.     :    .:. .::     .
NP_001 MDWFIAVCYAFVFSALIEFATVNYFTK-RGYAWDGKSVVPEKP----KKVKDPL-----I
            320       330        340       350           360       

            370       380       390       400           410        
pF1KE5 HPDSKYHLKKRITSLSLPIVSSSEANKVLTRAPILQSTPVTP---PPL-SPAFGGTSKID
       . .. :      :: .  .. .. .  .....  ..   : :   ::  . .:...::::
NP_001 KKNNTY--APTATSYTPNLARGDPGLATIAKSATIEPKEVKPETKPPEPKKTFNSVSKID
              370       380       390       400       410       420

      420       430       440       450    
pF1KE5 QYSRILFPVAFAGFNLVYWVVYLSKDTMEVSSSVE 
       . ::: ::. :. ::::::..::...          
NP_001 RLSRIAFPLLFGIFNLVYWATYLNREPQLKAPTPHQ
              430       440       450      

>>NP_001121115 (OMIM: 137160,611136,615744) gamma-aminob  (456 aa)
 initn: 1692 init1: 1557 opt: 1660  Z-score: 1891.7  bits: 359.3 E(85289): 1.3e-98
Smith-Waterman score: 1664; 61.3% identity (80.8% similar) in 416 aa overlap (33-444:43-446)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KE5 SSLPWLCIILWLENALGKLEVEGNFYSENVSRILDNLLEGYDNRLRPGFGGAVTEVKTDI
                                     .:::: ::.:::::::::.:  ::::::::
NP_001 AWILLLSTLTGRSYGQPSLQDELKDNTTVFTRILDRLLDGYDNRLRPGLGERVTEVKTDI
             20        30        40        50        60        70  

             70        80        90       100       110       120  
pF1KE5 YVTSFGPVSDVEMEYTMDVFFRQTWTDERLKFGGPTEILSLNNLMVSKIWTPDTFFRNGK
       .::::::::: .::::.::::::.: :::::: ::  .: :::::.::::::::::.:::
NP_001 FVTSFGPVSDHDMEYTIDVFFRQSWKDERLKFKGPMTVLRLNNLMASKIWTPDTFFHNGK
             80        90       100       110       120       130  

            130       140       150       160       170       180  
pF1KE5 KSIAHNMTTPNKLFRIMQNGTILYTMRLTINADCPMRLVNFPMDGHACPLKFGSYAYPKS
       ::.::::: ::::.:: ..::.:::::::. :.:::.: .::::.:::::::::::: ..
NP_001 KSVAHNMTMPNKLLRITEDGTLLYTMRLTVRAECPMHLEDFPMDAHACPLKFGSYAYTRA
            140       150       160       170       180       190  

            190       200       210       220       230       240  
pF1KE5 EIIYTWKKGPLYSVEVPEESSSLLQYDLIGQTVSSETIKSNTGEYVIMTVYFHLQRKMGY
       :..: : . :  :: : :..: : ::::.::::.:  ..:.:::::.::..:::.::.::
NP_001 EVVYEWTREPARSVVVAEDGSRLNQYDLLGQTVDSGIVQSSTGEYVVMTTHFHLKRKIGY
            200       210       220       230       240       250  

            250       260       270       280       290       300  
pF1KE5 FMIQIYTPCIMTVILSQVSFWINKESVPARTVFGITTVLTMTTLSISARHSLPKVSYATA
       :.:: : ::::::::::::::.:.::::::::::.::::::::::::::.:::::.::::
NP_001 FVIQTYLPCIMTVILSQVSFWLNRESVPARTVFGVTTVLTMTTLSISARNSLPKVAYATA
            260       270       280       290       300       310  

            310       320       330       340       350       360  
pF1KE5 MDWFIAVCFAFVFSALIEFAAVNYFTNLQTQKAKRKAQFAAPPTVTISKATEPLEAEIVL
       ::::::::.:::::::::::.:::::. .      :.     :    .:. .::     .
NP_001 MDWFIAVCYAFVFSALIEFATVNYFTK-RGYAWDGKSVVPEKP----KKVKDPL-----I
            320       330        340       350           360       

            370       380       390       400           410        
pF1KE5 HPDSKYHLKKRITSLSLPIVSSSEANKVLTRAPILQSTPVTP---PPL-SPAFGGTSKID
       . .. :      :: .  .. .. .  .....  ..   : :   ::  . .:...::::
NP_001 KKNNTY--APTATSYTPNLARGDPGLATIAKSATIEPKEVKPETKPPEPKKTFNSVSKID
              370       380       390       400       410       420

      420       430       440       450    
pF1KE5 QYSRILFPVAFAGFNLVYWVVYLSKDTMEVSSSVE 
       . ::: ::. :. ::::::..::...          
NP_001 RLSRIAFPLLFGIFNLVYWATYLNREPQLKAPTPHQ
              430       440       450      

>>NP_000797 (OMIM: 137160,611136,615744) gamma-aminobuty  (456 aa)
 initn: 1692 init1: 1557 opt: 1660  Z-score: 1891.7  bits: 359.3 E(85289): 1.3e-98
Smith-Waterman score: 1664; 61.3% identity (80.8% similar) in 416 aa overlap (33-444:43-446)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KE5 SSLPWLCIILWLENALGKLEVEGNFYSENVSRILDNLLEGYDNRLRPGFGGAVTEVKTDI
                                     .:::: ::.:::::::::.:  ::::::::
NP_000 AWILLLSTLTGRSYGQPSLQDELKDNTTVFTRILDRLLDGYDNRLRPGLGERVTEVKTDI
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pF1KE5 YVTSFGPVSDVEMEYTMDVFFRQTWTDERLKFGGPTEILSLNNLMVSKIWTPDTFFRNGK
       .::::::::: .::::.::::::.: :::::: ::  .: :::::.::::::::::.:::
NP_000 FVTSFGPVSDHDMEYTIDVFFRQSWKDERLKFKGPMTVLRLNNLMASKIWTPDTFFHNGK
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pF1KE5 KSIAHNMTTPNKLFRIMQNGTILYTMRLTINADCPMRLVNFPMDGHACPLKFGSYAYPKS
       ::.::::: ::::.:: ..::.:::::::. :.:::.: .::::.:::::::::::: ..
NP_000 KSVAHNMTMPNKLLRITEDGTLLYTMRLTVRAECPMHLEDFPMDAHACPLKFGSYAYTRA
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pF1KE5 EIIYTWKKGPLYSVEVPEESSSLLQYDLIGQTVSSETIKSNTGEYVIMTVYFHLQRKMGY
       :..: : . :  :: : :..: : ::::.::::.:  ..:.:::::.::..:::.::.::
NP_000 EVVYEWTREPARSVVVAEDGSRLNQYDLLGQTVDSGIVQSSTGEYVVMTTHFHLKRKIGY
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pF1KE5 FMIQIYTPCIMTVILSQVSFWINKESVPARTVFGITTVLTMTTLSISARHSLPKVSYATA
       :.:: : ::::::::::::::.:.::::::::::.::::::::::::::.:::::.::::
NP_000 FVIQTYLPCIMTVILSQVSFWLNRESVPARTVFGVTTVLTMTTLSISARNSLPKVAYATA
            260       270       280       290       300       310  

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pF1KE5 MDWFIAVCFAFVFSALIEFAAVNYFTNLQTQKAKRKAQFAAPPTVTISKATEPLEAEIVL
       ::::::::.:::::::::::.:::::. .      :.     :    .:. .::     .
NP_000 MDWFIAVCYAFVFSALIEFATVNYFTK-RGYAWDGKSVVPEKP----KKVKDPL-----I
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pF1KE5 HPDSKYHLKKRITSLSLPIVSSSEANKVLTRAPILQSTPVTP---PPL-SPAFGGTSKID
       . .. :      :: .  .. .. .  .....  ..   : :   ::  . .:...::::
NP_000 KKNNTY--APTATSYTPNLARGDPGLATIAKSATIEPKEVKPETKPPEPKKTFNSVSKID
              370       380       390       400       410       420

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pF1KE5 QYSRILFPVAFAGFNLVYWVVYLSKDTMEVSSSVE 
       . ::: ::. :. ::::::..::...          
NP_000 RLSRIAFPLLFGIFNLVYWATYLNREPQLKAPTPHQ
              430       440       450      

>>NP_001121116 (OMIM: 137160,611136,615744) gamma-aminob  (456 aa)
 initn: 1692 init1: 1557 opt: 1660  Z-score: 1891.7  bits: 359.3 E(85289): 1.3e-98
Smith-Waterman score: 1664; 61.3% identity (80.8% similar) in 416 aa overlap (33-444:43-446)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KE5 SSLPWLCIILWLENALGKLEVEGNFYSENVSRILDNLLEGYDNRLRPGFGGAVTEVKTDI
                                     .:::: ::.:::::::::.:  ::::::::
NP_001 AWILLLSTLTGRSYGQPSLQDELKDNTTVFTRILDRLLDGYDNRLRPGLGERVTEVKTDI
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pF1KE5 YVTSFGPVSDVEMEYTMDVFFRQTWTDERLKFGGPTEILSLNNLMVSKIWTPDTFFRNGK
       .::::::::: .::::.::::::.: :::::: ::  .: :::::.::::::::::.:::
NP_001 FVTSFGPVSDHDMEYTIDVFFRQSWKDERLKFKGPMTVLRLNNLMASKIWTPDTFFHNGK
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pF1KE5 KSIAHNMTTPNKLFRIMQNGTILYTMRLTINADCPMRLVNFPMDGHACPLKFGSYAYPKS
       ::.::::: ::::.:: ..::.:::::::. :.:::.: .::::.:::::::::::: ..
NP_001 KSVAHNMTMPNKLLRITEDGTLLYTMRLTVRAECPMHLEDFPMDAHACPLKFGSYAYTRA
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pF1KE5 EIIYTWKKGPLYSVEVPEESSSLLQYDLIGQTVSSETIKSNTGEYVIMTVYFHLQRKMGY
       :..: : . :  :: : :..: : ::::.::::.:  ..:.:::::.::..:::.::.::
NP_001 EVVYEWTREPARSVVVAEDGSRLNQYDLLGQTVDSGIVQSSTGEYVVMTTHFHLKRKIGY
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pF1KE5 FMIQIYTPCIMTVILSQVSFWINKESVPARTVFGITTVLTMTTLSISARHSLPKVSYATA
       :.:: : ::::::::::::::.:.::::::::::.::::::::::::::.:::::.::::
NP_001 FVIQTYLPCIMTVILSQVSFWLNRESVPARTVFGVTTVLTMTTLSISARNSLPKVAYATA
            260       270       280       290       300       310  

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pF1KE5 MDWFIAVCFAFVFSALIEFAAVNYFTNLQTQKAKRKAQFAAPPTVTISKATEPLEAEIVL
       ::::::::.:::::::::::.:::::. .      :.     :    .:. .::     .
NP_001 MDWFIAVCYAFVFSALIEFATVNYFTK-RGYAWDGKSVVPEKP----KKVKDPL-----I
            320       330        340       350           360       

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pF1KE5 HPDSKYHLKKRITSLSLPIVSSSEANKVLTRAPILQSTPVTP---PPL-SPAFGGTSKID
       . .. :      :: .  .. .. .  .....  ..   : :   ::  . .:...::::
NP_001 KKNNTY--APTATSYTPNLARGDPGLATIAKSATIEPKEVKPETKPPEPKKTFNSVSKID
              370       380       390       400       410       420

      420       430       440       450    
pF1KE5 QYSRILFPVAFAGFNLVYWVVYLSKDTMEVSSSVE 
       . ::: ::. :. ::::::..::...          
NP_001 RLSRIAFPLLFGIFNLVYWATYLNREPQLKAPTPHQ
              430       440       450      

>>NP_001121117 (OMIM: 137160,611136,615744) gamma-aminob  (456 aa)
 initn: 1692 init1: 1557 opt: 1660  Z-score: 1891.7  bits: 359.3 E(85289): 1.3e-98
Smith-Waterman score: 1664; 61.3% identity (80.8% similar) in 416 aa overlap (33-444:43-446)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KE5 SSLPWLCIILWLENALGKLEVEGNFYSENVSRILDNLLEGYDNRLRPGFGGAVTEVKTDI
                                     .:::: ::.:::::::::.:  ::::::::
NP_001 AWILLLSTLTGRSYGQPSLQDELKDNTTVFTRILDRLLDGYDNRLRPGLGERVTEVKTDI
             20        30        40        50        60        70  

             70        80        90       100       110       120  
pF1KE5 YVTSFGPVSDVEMEYTMDVFFRQTWTDERLKFGGPTEILSLNNLMVSKIWTPDTFFRNGK
       .::::::::: .::::.::::::.: :::::: ::  .: :::::.::::::::::.:::
NP_001 FVTSFGPVSDHDMEYTIDVFFRQSWKDERLKFKGPMTVLRLNNLMASKIWTPDTFFHNGK
             80        90       100       110       120       130  

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pF1KE5 KSIAHNMTTPNKLFRIMQNGTILYTMRLTINADCPMRLVNFPMDGHACPLKFGSYAYPKS
       ::.::::: ::::.:: ..::.:::::::. :.:::.: .::::.:::::::::::: ..
NP_001 KSVAHNMTMPNKLLRITEDGTLLYTMRLTVRAECPMHLEDFPMDAHACPLKFGSYAYTRA
            140       150       160       170       180       190  

            190       200       210       220       230       240  
pF1KE5 EIIYTWKKGPLYSVEVPEESSSLLQYDLIGQTVSSETIKSNTGEYVIMTVYFHLQRKMGY
       :..: : . :  :: : :..: : ::::.::::.:  ..:.:::::.::..:::.::.::
NP_001 EVVYEWTREPARSVVVAEDGSRLNQYDLLGQTVDSGIVQSSTGEYVVMTTHFHLKRKIGY
            200       210       220       230       240       250  

            250       260       270       280       290       300  
pF1KE5 FMIQIYTPCIMTVILSQVSFWINKESVPARTVFGITTVLTMTTLSISARHSLPKVSYATA
       :.:: : ::::::::::::::.:.::::::::::.::::::::::::::.:::::.::::
NP_001 FVIQTYLPCIMTVILSQVSFWLNRESVPARTVFGVTTVLTMTTLSISARNSLPKVAYATA
            260       270       280       290       300       310  

            310       320       330       340       350       360  
pF1KE5 MDWFIAVCFAFVFSALIEFAAVNYFTNLQTQKAKRKAQFAAPPTVTISKATEPLEAEIVL
       ::::::::.:::::::::::.:::::. .      :.     :    .:. .::     .
NP_001 MDWFIAVCYAFVFSALIEFATVNYFTK-RGYAWDGKSVVPEKP----KKVKDPL-----I
            320       330        340       350           360       

            370       380       390       400           410        
pF1KE5 HPDSKYHLKKRITSLSLPIVSSSEANKVLTRAPILQSTPVTP---PPL-SPAFGGTSKID
       . .. :      :: .  .. .. .  .....  ..   : :   ::  . .:...::::
NP_001 KKNNTY--APTATSYTPNLARGDPGLATIAKSATIEPKEVKPETKPPEPKKTFNSVSKID
              370       380       390       400       410       420

      420       430       440       450    
pF1KE5 QYSRILFPVAFAGFNLVYWVVYLSKDTMEVSSSVE 
       . ::: ::. :. ::::::..::...          
NP_001 RLSRIAFPLLFGIFNLVYWATYLNREPQLKAPTPHQ
              430       440       450      

>>XP_005268315 (OMIM: 137142) PREDICTED: gamma-aminobuty  (462 aa)
 initn: 1682 init1: 1558 opt: 1575  Z-score: 1794.9  bits: 341.4 E(85289): 3.1e-93
Smith-Waterman score: 1680; 57.8% identity (80.4% similar) in 455 aa overlap (1-444:11-452)

                         10        20            30           40   
pF1KE5           MASSLPWLCIILWLENALGKLEVEGNFY----SENVS---RILDNLLEGY
                 : ..:  .:: . : . .:  ..  .      ..:..   ::::.::.::
XP_005 MDNGMFSGFIMIKNLLLFCISMNLSSHFGFSQMPTSSVKDETNDNITIFTRILDGLLDGY
               10        20        30        40        50        60

            50        60        70        80        90       100   
pF1KE5 DNRLRPGFGGAVTEVKTDIYVTSFGPVSDVEMEYTMDVFFRQTWTDERLKFGGPTEILSL
       :::::::.:  .:.:.:::::::::::::.:::::.::::::.: ::::.: :: . : :
XP_005 DNRLRPGLGERITQVRTDIYVTSFGPVSDTEMEYTIDVFFRQSWKDERLRFKGPMQRLPL
               70        80        90       100       110       120

           110       120       130       140       150       160   
pF1KE5 NNLMVSKIWTPDTFFRNGKKSIAHNMTTPNKLFRIMQNGTILYTMRLTINADCPMRLVNF
       :::..::::::::::.::::::::::::::::.:. ..::.::::::::.:.:::.: .:
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