FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5571, 453 aa 1>>>pF1KE5571 453 - 453 aa - 453 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1070+/-0.000958; mu= 13.7772+/- 0.058 mean_var=75.4092+/-14.984, 0's: 0 Z-trim(105.8): 71 B-trim: 46 in 1/49 Lambda= 0.147694 statistics sampled from 8525 (8596) to 8525 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.625), E-opt: 0.2 (0.264), width: 16 Scan time: 2.360 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS4356.1 GABRA6 gene_id:2559|Hs108|chr5 ( 453) 2968 641.9 3.9e-184 CCDS3473.1 GABRA4 gene_id:2557|Hs108|chr4 ( 554) 1901 414.6 1.3e-115 CCDS14706.1 GABRA3 gene_id:2556|Hs108|chrX ( 492) 1704 372.6 5e-103 CCDS4357.1 GABRA1 gene_id:2554|Hs108|chr5 ( 456) 1660 363.2 3.1e-100 CCDS45194.1 GABRA5 gene_id:2558|Hs108|chr15 ( 462) 1575 345.1 8.8e-95 CCDS3471.1 GABRA2 gene_id:2555|Hs108|chr4 ( 451) 1532 335.9 5e-92 CCDS82921.1 GABRA2 gene_id:2555|Hs108|chr4 ( 511) 1532 336.0 5.5e-92 CCDS4359.1 GABRG2 gene_id:2566|Hs108|chr5 ( 475) 1312 289.1 6.7e-78 CCDS4358.1 GABRG2 gene_id:2566|Hs108|chr5 ( 467) 1260 278.0 1.4e-74 CCDS3470.1 GABRG1 gene_id:2565|Hs108|chr4 ( 465) 1219 269.3 6.1e-72 CCDS45195.1 GABRG3 gene_id:2567|Hs108|chr15 ( 467) 1186 262.2 8e-70 CCDS14703.1 GABRE gene_id:2564|Hs108|chrX ( 506) 1039 230.9 2.3e-60 CCDS3822.1 GLRA3 gene_id:8001|Hs108|chr4 ( 464) 978 217.9 1.7e-56 CCDS54942.1 GLRA1 gene_id:2741|Hs108|chr5 ( 457) 975 217.3 2.7e-56 CCDS43283.1 GLRA3 gene_id:8001|Hs108|chr4 ( 449) 894 200.0 4.1e-51 CCDS14160.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX ( 452) 894 200.0 4.2e-51 CCDS48085.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX ( 452) 892 199.6 5.6e-51 CCDS4320.1 GLRA1 gene_id:2741|Hs108|chr5 ( 449) 872 195.3 1.1e-49 CCDS59029.1 GABRR1 gene_id:2569|Hs108|chr6 ( 462) 868 194.5 2e-49 CCDS5019.2 GABRR1 gene_id:2569|Hs108|chr6 ( 479) 868 194.5 2e-49 CCDS43980.2 GLRA4 gene_id:441509|Hs108|chrX ( 417) 864 193.6 3.2e-49 CCDS5020.3 GABRR2 gene_id:2570|Hs108|chr6 ( 465) 861 193.0 5.6e-49 CCDS59028.1 GABRR1 gene_id:2569|Hs108|chr6 ( 392) 858 192.3 7.4e-49 CCDS10018.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 473) 858 192.3 8.8e-49 CCDS36.1 GABRD gene_id:2563|Hs108|chr1 ( 452) 851 190.8 2.4e-48 CCDS10019.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 473) 844 189.3 7e-48 CCDS3474.1 GABRB1 gene_id:2560|Hs108|chr4 ( 474) 837 187.9 2e-47 CCDS4354.1 GABRB2 gene_id:2561|Hs108|chr5 ( 474) 828 185.9 7.4e-47 CCDS4355.1 GABRB2 gene_id:2561|Hs108|chr5 ( 512) 828 186.0 8e-47 CCDS54617.1 GABRR3 gene_id:200959|Hs108|chr3 ( 467) 825 185.3 1.1e-46 CCDS4375.1 GABRP gene_id:2568|Hs108|chr5 ( 440) 821 184.4 2e-46 CCDS14707.1 GABRQ gene_id:55879|Hs108|chrX ( 632) 790 177.9 2.6e-44 CCDS55371.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX ( 363) 782 176.1 5.2e-44 CCDS53921.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 402) 723 163.5 3.5e-40 CCDS3796.1 GLRB gene_id:2743|Hs108|chr4 ( 497) 724 163.8 3.6e-40 CCDS53920.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 388) 702 159.1 7.5e-39 CCDS59251.1 GABRG3 gene_id:2567|Hs108|chr15 ( 253) 693 157.1 1.9e-38 CCDS47333.1 GABRG2 gene_id:2566|Hs108|chr5 ( 515) 622 142.1 1.3e-33 CCDS75368.1 GABRP gene_id:2568|Hs108|chr5 ( 289) 592 135.6 6.5e-32 CCDS54813.1 GLRB gene_id:2743|Hs108|chr4 ( 303) 589 135.0 1.1e-31 CCDS6135.1 CHRNA6 gene_id:8973|Hs108|chr8 ( 494) 313 76.2 8.3e-14 CCDS10306.1 CHRNB4 gene_id:1143|Hs108|chr15 ( 498) 305 74.5 2.7e-13 CCDS8365.2 HTR3A gene_id:3359|Hs108|chr11 ( 484) 287 70.7 3.8e-12 CCDS53710.1 HTR3A gene_id:3359|Hs108|chr11 ( 463) 285 70.2 4.9e-12 CCDS2261.1 CHRNA1 gene_id:1134|Hs108|chr2 ( 457) 280 69.2 1e-11 CCDS6059.1 CHRNA2 gene_id:1135|Hs108|chr8 ( 529) 277 68.6 1.8e-11 CCDS13517.1 CHRNA4 gene_id:1137|Hs108|chr20 ( 627) 273 67.7 3.8e-11 CCDS8366.2 HTR3A gene_id:3359|Hs108|chr11 ( 516) 267 66.4 7.7e-11 >>CCDS4356.1 GABRA6 gene_id:2559|Hs108|chr5 (453 aa) initn: 2968 init1: 2968 opt: 2968 Z-score: 3419.3 bits: 641.9 E(32554): 3.9e-184 Smith-Waterman score: 2968; 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61.2% identity (83.0% similar) in 423 aa overlap (33-445:68-483) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 SSLPWLCIILWLENALGKLEVEGNFYSENVSRILDNLLEGYDNRLRPGFGGAVTEVKTDI .:::: ::.:::::::::.: ::::::::: CCDS14 GDFVKQDIGGLSPKHAPDIPDDSTDNITIFTRILDRLLDGYDNRLRPGLGDAVTEVKTDI 40 50 60 70 80 90 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 YVTSFGPVSDVEMEYTMDVFFRQTWTDERLKFGGPTEILSLNNLMVSKIWTPDTFFRNGK ::::::::::..::::.:::::::: :::::: :: .:: ::::..::::::::::.::: CCDS14 YVTSFGPVSDTDMEYTIDVFFRQTWHDERLKFDGPMKILPLNNLLASKIWTPDTFFHNGK 100 110 120 130 140 150 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 KSIAHNMTTPNKLFRIMQNGTILYTMRLTINADCPMRLVNFPMDGHACPLKFGSYAYPKS ::.::::::::::.:...:::.::::::::.:.:::.: .:::: :::::::::::: . CCDS14 KSVAHNMTTPNKLLRLVDNGTLLYTMRLTIHAECPMHLEDFPMDVHACPLKFGSYAYTTA 160 170 180 190 200 210 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 EIIYTWKKGPLYSVEVPEESSSLLQYDLIGQTVSSETIKSNTGEYVIMTVYFHLQRKMGY :..:.: : :::: ...: : ::::.:..:..: :.:.:::::.::..:::.::.:: CCDS14 EVVYSWTLGKNKSVEVAQDGSRLNQYDLLGHVVGTEIIRSSTGEYVVMTTHFHLKRKIGY 220 230 240 250 260 270 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 FMIQIYTPCIMTVILSQVSFWINKESVPARTVFGITTVLTMTTLSISARHSLPKVSYATA :.:: : ::::::::::::::.:.::::::::::.::::::::::::::.:::::.:::: CCDS14 FVIQTYLPCIMTVILSQVSFWLNRESVPARTVFGVTTVLTMTTLSISARNSLPKVAYATA 280 290 300 310 320 330 310 320 330 340 350 pF1KE5 MDWFIAVCFAFVFSALIEFAAVNYFTNLQTQKAKRKAQFA-----APPTVTISKATEPLE ::::::::.:::::::::::.:::::. . .:. : :.. .:.. .. CCDS14 MDWFIAVCYAFVFSALIEFATVNYFTKRSWAWEGKKVPEALEMKKKTPAAPAKKTSTTFN 340 350 360 370 380 390 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 AEIVLHP-----DSKYHLKKRITSLSLPIVSSSEANKVLTRAPILQSTPVTPPPLSPAFG . .: :... . :.. . : .::. . . .: .:..:. . ... CCDS14 IVGTTYPINLAKDTEF---STISKGAAPSASSTPTIIASPKATYVQDSPTE----TKTYN 400 410 420 430 440 450 420 430 440 450 pF1KE5 GTSKIDQYSRILFPVAFAGFNLVYWVVYLSKDTMEVSSSVE ..::.:. :::.::: :: ::::::..:..... CCDS14 SVSKVDKISRIIFPVLFAIFNLVYWATYVNRESAIKGMIRKQ 460 470 480 490 >>CCDS4357.1 GABRA1 gene_id:2554|Hs108|chr5 (456 aa) initn: 1692 init1: 1557 opt: 1660 Z-score: 1913.1 bits: 363.2 E(32554): 3.1e-100 Smith-Waterman score: 1664; 61.3% identity (80.8% similar) in 416 aa overlap (33-444:43-446) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 SSLPWLCIILWLENALGKLEVEGNFYSENVSRILDNLLEGYDNRLRPGFGGAVTEVKTDI .:::: ::.:::::::::.: :::::::: CCDS43 AWILLLSTLTGRSYGQPSLQDELKDNTTVFTRILDRLLDGYDNRLRPGLGERVTEVKTDI 20 30 40 50 60 70 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 YVTSFGPVSDVEMEYTMDVFFRQTWTDERLKFGGPTEILSLNNLMVSKIWTPDTFFRNGK .::::::::: .::::.::::::.: :::::: :: .: :::::.::::::::::.::: CCDS43 FVTSFGPVSDHDMEYTIDVFFRQSWKDERLKFKGPMTVLRLNNLMASKIWTPDTFFHNGK 80 90 100 110 120 130 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 KSIAHNMTTPNKLFRIMQNGTILYTMRLTINADCPMRLVNFPMDGHACPLKFGSYAYPKS ::.::::: ::::.:: ..::.:::::::. :.:::.: .::::.:::::::::::: .. CCDS43 KSVAHNMTMPNKLLRITEDGTLLYTMRLTVRAECPMHLEDFPMDAHACPLKFGSYAYTRA 140 150 160 170 180 190 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 EIIYTWKKGPLYSVEVPEESSSLLQYDLIGQTVSSETIKSNTGEYVIMTVYFHLQRKMGY :..: : . : :: : :..: : ::::.::::.: ..:.:::::.::..:::.::.:: CCDS43 EVVYEWTREPARSVVVAEDGSRLNQYDLLGQTVDSGIVQSSTGEYVVMTTHFHLKRKIGY 200 210 220 230 240 250 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 FMIQIYTPCIMTVILSQVSFWINKESVPARTVFGITTVLTMTTLSISARHSLPKVSYATA :.:: : ::::::::::::::.:.::::::::::.::::::::::::::.:::::.:::: CCDS43 FVIQTYLPCIMTVILSQVSFWLNRESVPARTVFGVTTVLTMTTLSISARNSLPKVAYATA 260 270 280 290 300 310 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 MDWFIAVCFAFVFSALIEFAAVNYFTNLQTQKAKRKAQFAAPPTVTISKATEPLEAEIVL ::::::::.:::::::::::.:::::. . :. : .:. .:: . CCDS43 MDWFIAVCYAFVFSALIEFATVNYFTK-RGYAWDGKSVVPEKP----KKVKDPL-----I 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 HPDSKYHLKKRITSLSLPIVSSSEANKVLTRAPILQSTPVTP---PPL-SPAFGGTSKID . .. : :: . .. .. . ..... .. : : :: . .:...:::: CCDS43 KKNNTY--APTATSYTPNLARGDPGLATIAKSATIEPKEVKPETKPPEPKKTFNSVSKID 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 pF1KE5 QYSRILFPVAFAGFNLVYWVVYLSKDTMEVSSSVE . ::: ::. :. ::::::..::... CCDS43 RLSRIAFPLLFGIFNLVYWATYLNREPQLKAPTPHQ 430 440 450 >>CCDS45194.1 GABRA5 gene_id:2558|Hs108|chr15 (462 aa) initn: 1682 init1: 1558 opt: 1575 Z-score: 1815.1 bits: 345.1 E(32554): 8.8e-95 Smith-Waterman score: 1680; 57.8% identity (80.4% similar) in 455 aa overlap (1-444:11-452) 10 20 30 40 pF1KE5 MASSLPWLCIILWLENALGKLEVEGNFY----SENVS---RILDNLLEGY : ..: .:: . : . .: .. . ..:.. ::::.::.:: CCDS45 MDNGMFSGFIMIKNLLLFCISMNLSSHFGFSQMPTSSVKDETNDNITIFTRILDGLLDGY 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE5 DNRLRPGFGGAVTEVKTDIYVTSFGPVSDVEMEYTMDVFFRQTWTDERLKFGGPTEILSL :::::::.: .:.:.:::::::::::::.:::::.::::::.: ::::.: :: . : : CCDS45 DNRLRPGLGERITQVRTDIYVTSFGPVSDTEMEYTIDVFFRQSWKDERLRFKGPMQRLPL 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE5 NNLMVSKIWTPDTFFRNGKKSIAHNMTTPNKLFRIMQNGTILYTMRLTINADCPMRLVNF :::..::::::::::.::::::::::::::::.:. ..::.::::::::.:.:::.: .: CCDS45 NNLLASKIWTPDTFFHNGKKSIAHNMTTPNKLLRLEDDGTLLYTMRLTISAECPMQLEDF 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 PMDGHACPLKFGSYAYPKSEIIYTWKKGPLYSVEVPEESSSLLQYDLIGQTVSSETIKSN :::.:::::::::::::.::..:.: .: :: : :..: : :: :.::::..:.:... CCDS45 PMDAHACPLKFGSYAYPNSEVVYVWTNGSTKSVVVAEDGSRLNQYHLMGQTVGTENISTS 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 TGEYVIMTVYFHLQRKMGYFMIQIYTPCIMTVILSQVSFWINKESVPARTVFGITTVLTM ::::.:::..:::.::.:::.:: : ::::::::::::::.:.::::::::::.:::::: CCDS45 TGEYTIMTAHFHLKRKIGYFVIQTYLPCIMTVILSQVSFWLNRESVPARTVFGVTTVLTM 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 pF1KE5 TTLSISARHSLPKVSYATAMDWFIAVCFAFVFSALIEFAAVNYFTN----LQTQKAKRKA ::::::::.:::::.::::::::::::.:::::::::::.:::::. . .:: . : CCDS45 TTLSISARNSLPKVAYATAMDWFIAVCYAFVFSALIEFATVNYFTKRGWAWDGKKALEAA 310 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 390 pF1KE5 QFAAPPTVTISKATEPLEAEIVLHPDSKYHLKKRITSLSLPIVSSSEANKVLTRAPILQS .. : ..:.:. . . . :: . : . . : .:. .. .. : .. CCDS45 KIKKKREVILNKSTNAFTTGKMSHPPN-------IPKEQTPAGTSNTTS--VSVKPSEEK 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 pF1KE5 TPVTPPPLSPAFGGTSKIDQYSRILFPVAFAGFNLVYWVVYLSKDTMEVSSSVE : . . .... ::::..:::.::: :. ::::::..::... CCDS45 TSES----KKTYNSISKIDKMSRIVFPVLFGTFNLVYWATYLNREPVIKGAASPK 420 430 440 450 460 >>CCDS3471.1 GABRA2 gene_id:2555|Hs108|chr4 (451 aa) initn: 1680 init1: 1531 opt: 1532 Z-score: 1765.7 bits: 335.9 E(32554): 5e-92 Smith-Waterman score: 1647; 58.4% identity (80.1% similar) in 438 aa overlap (11-444:18-444) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MASSLPWLCIILWLENALGKLEVEGNFYSENVS---RILDNLLEGYDNRLRPG ..: : ... . ..:.. :::: ::.::::::::: CCDS34 MKTKLNIYNMQFLLFVFLVWDPARLVLANIQEDEAKNNITIFTRILDRLLDGYDNRLRPG 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 FGGAVTEVKTDIYVTSFGPVSDVEMEYTMDVFFRQTWTDERLKFGGPTEILSLNNLMVSK .: ..::: :.:::::::::::..::::.:::::: : :::::: :: .:: :::::.:: CCDS34 LGDSITEVFTNIYVTSFGPVSDTDMEYTIDVFFRQKWKDERLKFKGPMNILRLNNLMASK 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 IWTPDTFFRNGKKSIAHNMTTPNKLFRIMQNGTILYTMRLTINADCPMRLVNFPMDGHAC ::::::::.:::::.::::: ::::.::...::.:::::::..:.:::.: .::::.:.: CCDS34 IWTPDTFFHNGKKSVAHNMTMPNKLLRIQDDGTLLYTMRLTVQAECPMHLEDFPMDAHSC 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 PLKFGSYAYPKSEIIYTWKKGPLYSVEVPEESSSLLQYDLIGQTVSSETIKSNTGEYVIM ::::::::: ::. : : . ::.: ..: : ::::.::....:::::.::::..: CCDS34 PLKFGSYAYTTSEVTYIWTYNASDSVQVAPDGSRLNQYDLLGQSIGKETIKSSTGEYTVM 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 TVYFHLQRKMGYFMIQIYTPCIMTVILSQVSFWINKESVPARTVFGITTVLTMTTLSISA :..:::.::.:::.:: : ::::::::::::::.:.::::::::::.::::::::::::: CCDS34 TAHFHLKRKIGYFVIQTYLPCIMTVILSQVSFWLNRESVPARTVFGVTTVLTMTTLSISA 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 RHSLPKVSYATAMDWFIAVCFAFVFSALIEFAAVNYFTNLQTQKAKRKAQFAAPPTVTIS :.:::::.::::::::::::.:::::::::::.::::: :: . . .:. . CCDS34 RNSLPKVAYATAMDWFIAVCYAFVFSALIEFATVNYFT-------KRGWAWDGKSVVNDK 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE5 KATEPLEAEIVLHPDS-KYHLKKRITSLSLPIVSSSEANKVLTRAPILQSTPVTPPPLSP : . : .... .. . . .:: : :. .... : : .. : . CCDS34 KKEK---ASVMIQNNAYAVAVANYAPNLSKDPVLSTISKSATTPEPN-KKPENKPAEAKK 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE5 AFGGTSKIDQYSRILFPVAFAGFNLVYWVVYLSKDTMEVSSSVE .:...::::..:::.::: :. ::::::..::... CCDS34 TFNSVSKIDRMSRIVFPVLFGTFNLVYWATYLNREPVLGVSP 410 420 430 440 450 >>CCDS82921.1 GABRA2 gene_id:2555|Hs108|chr4 (511 aa) initn: 1680 init1: 1531 opt: 1532 Z-score: 1764.9 bits: 336.0 E(32554): 5.5e-92 Smith-Waterman score: 1573; 54.8% identity (73.6% similar) in 478 aa overlap (11-435:18-495) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MASSLPWLCIILWLENALGKLEVEGNFYSENVS---RILDNLLEGYDNRLRPG ..: : ... . ..:.. :::: ::.::::::::: CCDS82 MKTKLNIYNMQFLLFVFLVWDPARLVLANIQEDEAKNNITIFTRILDRLLDGYDNRLRPG 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 FGGAVTEVKTDIYVTSFGPVSDVEMEYTMDVFFRQTWTDERLKFGGPTEILSLNNLMVSK .: ..::: :.:::::::::::..::::.:::::: : :::::: :: .:: :::::.:: CCDS82 LGDSITEVFTNIYVTSFGPVSDTDMEYTIDVFFRQKWKDERLKFKGPMNILRLNNLMASK 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 IWTPDTFFRNGKKSIAHNMTTPNKLFRIMQNGTILYTMRLTINADCPMRLVNFPMDGHAC ::::::::.:::::.::::: ::::.::...::.:::::::..:.:::.: .::::.:.: CCDS82 IWTPDTFFHNGKKSVAHNMTMPNKLLRIQDDGTLLYTMRLTVQAECPMHLEDFPMDAHSC 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 PLKFGSYAYPKSEIIYTWKKGPLYSVEVPEESSSLLQYDLIGQTVSSETIKSNTGEYVIM ::::::::: ::. : : . ::.: ..: : ::::.::....:::::.::::..: CCDS82 PLKFGSYAYTTSEVTYIWTYNASDSVQVAPDGSRLNQYDLLGQSIGKETIKSSTGEYTVM 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 TVYFHLQRKMGYFMIQIYTPCIMTVILSQVSFWINKESVPARTVFGITTVLTMTTLSISA :..:::.::.:::.:: : ::::::::::::::.:.::::::::::.::::::::::::: CCDS82 TAHFHLKRKIGYFVIQTYLPCIMTVILSQVSFWLNRESVPARTVFGVTTVLTMTTLSISA 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 RHSLPKVSYATAMDWFIAVCFAFVFSALIEFAAVNYFTNLQTQKAKRKAQFAAPPTVTIS :.:::::.::::::::::::.:::::::::::.:::::. ... :.. CCDS82 RNSLPKVAYATAMDWFIAVCYAFVFSALIEFATVNYFTKRGWAWDGKSVVNDKSPSIKAE 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 pF1KE5 KATEPLEA-EIVLHPD----SKY---------------HLKKRITSLSLPIVSSSEANKV : .. . .:. ::: .:.: . :.. :..: .: CCDS82 GITLTYNSVKAILQGAKLIWSKYIAFSWPSLFQEKTLEYLEKWMDCLTFKQSSKKEKASV 370 380 390 400 410 420 400 410 420 pF1KE5 LTR-----------APILQSTPV---------TPPPLS-----PA-----FGGTSKIDQY . . :: :.. :: :: : . :: :...::::.. CCDS82 MIQNNAYAVAVANYAPNLSKDPVLSTISKSATTPEPNKKPENKPAEAKKTFNSVSKIDRM 430 440 450 460 470 480 430 440 450 pF1KE5 SRILFPVAFAGFNLVYWVVYLSKDTMEVSSSVE :::.::: :. :::: CCDS82 SRIVFPVLFGTFNLVYWATYLNREPVLGVSP 490 500 510 >>CCDS4359.1 GABRG2 gene_id:2566|Hs108|chr5 (475 aa) initn: 1227 init1: 693 opt: 1312 Z-score: 1512.0 bits: 289.1 E(32554): 6.7e-78 Smith-Waterman score: 1312; 49.3% identity (74.4% similar) in 422 aa overlap (31-441:65-473) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MASSLPWLCIILWLENALGKLEVEGNFYSENVSRILDNLLEGYDNRLRPGFGGAVTEVKT .:. ::.::::::::.::: .: : ..: CCDS43 PGFTSQKSDDDYEDYASNKTWVLTPKVPEGDVTVILNNLLEGYDNKLRPDIGVKPTLIHT 40 50 60 70 80 90 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 DIYVTSFGPVSDVEMEYTMDVFFRQTWTDERLKFGGPTEILSLNNLMVSKIWTPDTFFRN :.::.:.:::. ..::::.:.:: ::: :.::::.. ..: ::. ::.::: ::::::: CCDS43 DMYVNSIGPVNAINMEYTIDIFFAQTWYDRRLKFNSTIKVLRLNSNMVGKIWIPDTFFRN 100 110 120 130 140 150 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 GKKSIAHNMTTPNKLFRIMQNGTILYTMRLTINADCPMRLVNFPMDGHACPLKFGSYAYP .::. :: .::::...:: ..: .:::.::::.:.: ..: ::::: :.:::.:.::.:: CCDS43 SKKADAHWITTPNRMLRIWNDGRVLYTLRLTIDAECQLQLHNFPMDEHSCPLEFSSYGYP 160 170 180 190 200 210 190 200 210 220 230 pF1KE5 KSEIIYTWKKGPLYSVEVPEESS-SLLQYDLIGQTVSSETIKSNTGEYVIMTVYFHLQRK . ::.: ::.. :::: . : : :....: ..:..:...:.::.:.::: :.:. CCDS43 REEIVYQWKRS---SVEVGDTRSWRLYQFSFVGLRNTTEVVKTTSGDYVVMSVYFDLSRR 220 230 240 250 260 270 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 MGYFMIQIYTPCIMTVILSQVSFWINKESVPARTVFGITTVLTMTTLSISARHSLPKVSY :::: :: : :: . :.:: :::::::..::::: .:::::::::::: ::.::::::: CCDS43 MGYFTIQTYIPCTLIVVLSWVSFWINKDAVPARTSLGITTVLTMTTLSTIARKSLPKVSY 280 290 300 310 320 330 300 310 320 330 340 pF1KE5 ATAMDWFIAVCFAFVFSALIEFAAVNYF-TNLQTQKAKRKAQ---------FAAPPTVTI .:::: :..::: ::::::.:.....:: .: . .: : : . : :: :. : CCDS43 VTAMDLFVSVCFIFVFSALVEYGTLHYFVSNRKPSKDKDKKKKNPLLRMFSFKAP-TIDI 340 350 360 370 380 390 350 360 370 380 390 400 pF1KE5 SKATEPLEAEIVLHPDSKYHLKKRITSLSLPIVSSSEANKVLTRAPILQSTPVTPPPLSP .: : : . .. ::..: . ..... . . ... . . CCDS43 ----RPRSATIQM--NNATHLQERDEEYGYECLDGKDCASFFC---CFEDCRTGAWRHGR 400 410 420 430 440 410 420 430 440 450 pF1KE5 AFGGTSKIDQYSRILFPVAFAGFNLVYWVVYLSKDTMEVSSSVE .:.:.:.::.::.:: ::::::: :: CCDS43 IHIRIAKMDSYARIFFPTAFCLFNLVYWVSYLYL 450 460 470 >>CCDS4358.1 GABRG2 gene_id:2566|Hs108|chr5 (467 aa) initn: 1277 init1: 693 opt: 1260 Z-score: 1452.3 bits: 278.0 E(32554): 1.4e-74 Smith-Waterman score: 1333; 49.9% identity (75.5% similar) in 413 aa overlap (31-441:65-465) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MASSLPWLCIILWLENALGKLEVEGNFYSENVSRILDNLLEGYDNRLRPGFGGAVTEVKT .:. ::.::::::::.::: .: : ..: CCDS43 PGFTSQKSDDDYEDYASNKTWVLTPKVPEGDVTVILNNLLEGYDNKLRPDIGVKPTLIHT 40 50 60 70 80 90 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 DIYVTSFGPVSDVEMEYTMDVFFRQTWTDERLKFGGPTEILSLNNLMVSKIWTPDTFFRN :.::.:.:::. ..::::.:.:: ::: :.::::.. ..: ::. ::.::: ::::::: CCDS43 DMYVNSIGPVNAINMEYTIDIFFAQTWYDRRLKFNSTIKVLRLNSNMVGKIWIPDTFFRN 100 110 120 130 140 150 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 GKKSIAHNMTTPNKLFRIMQNGTILYTMRLTINADCPMRLVNFPMDGHACPLKFGSYAYP .::. :: .::::...:: ..: .:::.::::.:.: ..: ::::: :.:::.:.::.:: CCDS43 SKKADAHWITTPNRMLRIWNDGRVLYTLRLTIDAECQLQLHNFPMDEHSCPLEFSSYGYP 160 170 180 190 200 210 190 200 210 220 230 pF1KE5 KSEIIYTWKKGPLYSVEVPEESS-SLLQYDLIGQTVSSETIKSNTGEYVIMTVYFHLQRK . ::.: ::.. :::: . : : :....: ..:..:...:.::.:.::: :.:. CCDS43 REEIVYQWKRS---SVEVGDTRSWRLYQFSFVGLRNTTEVVKTTSGDYVVMSVYFDLSRR 220 230 240 250 260 270 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 MGYFMIQIYTPCIMTVILSQVSFWINKESVPARTVFGITTVLTMTTLSISARHSLPKVSY :::: :: : :: . :.:: :::::::..::::: .:::::::::::: ::.::::::: CCDS43 MGYFTIQTYIPCTLIVVLSWVSFWINKDAVPARTSLGITTVLTMTTLSTIARKSLPKVSY 280 290 300 310 320 330 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 ATAMDWFIAVCFAFVFSALIEFAAVNYF-TNLQTQKAKRKAQFAAPPTVTISKATEPLEA .:::: :..::: ::::::.:.....:: .: . .: : : . ::. : .: : CCDS43 VTAMDLFVSVCFIFVFSALVEYGTLHYFVSNRKPSKDKDKKKKNPAPTIDI----RPRSA 340 350 360 370 380 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 EIVLHPDSKYHLKKRITSLSLPIVSSSEANKVLTRAPILQSTPVTPPPLSPAFGGTSKID : . .. ::..: . ..... . . ... . . .:.: CCDS43 TIQM--NNATHLQERDEEYGYECLDGKDCASFFC---CFEDCRTGAWRHGRIHIRIAKMD 390 400 410 420 430 440 420 430 440 450 pF1KE5 QYSRILFPVAFAGFNLVYWVVYLSKDTMEVSSSVE .:.::.::.:: ::::::: :: CCDS43 SYARIFFPTAFCLFNLVYWVSYLYL 450 460 >>CCDS3470.1 GABRG1 gene_id:2565|Hs108|chr4 (465 aa) initn: 1299 init1: 684 opt: 1219 Z-score: 1405.1 bits: 269.3 E(32554): 6.1e-72 Smith-Waterman score: 1282; 50.0% identity (73.7% similar) in 418 aa overlap (31-441:63-463) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MASSLPWLCIILWLENALGKLEVEGNFYSENVSRILDNLLEGYDNRLRPGFGGAVTEVKT ....::..::.::::.::: .: : ..: CCDS34 GNCVDKADDEDDEDLTVNKTWVLAPKIHEGDITQILNSLLQGYDNKLRPDIGVRPTVIET 40 50 60 70 80 90 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 DIYVTSFGPVSDVEMEYTMDVFFRQTWTDERLKFGGPTEILSLNNLMVSKIWTPDTFFRN :.::.:.:::. ..::::.:..: ::: : ::::.. ..: ::. ::.::: ::::::: CCDS34 DVYVNSIGPVDPINMEYTIDIIFAQTWFDSRLKFNSTMKVLMLNSNMVGKIWIPDTFFRN 100 110 120 130 140 150 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 GKKSIAHNMTTPNKLFRIMQNGTILYTMRLTINADCPMRLVNFPMDGHACPLKFGSYAYP ..:: :: .::::.:.:: ..: .:::.::::::.: ..: ::::: :.:::.:.::.:: CCDS34 SRKSDAHWITTPNRLLRIWNDGRVLYTLRLTINAECYLQLHNFPMDEHSCPLEFSSYGYP 160 170 180 190 200 210 190 200 210 220 230 pF1KE5 KSEIIYTWKKGPLYSVEVPEESS-SLLQYDLIGQTVSSETIKSNTGEYVIMTVYFHLQRK :.:: : ::: : :::: . . : :. ..: :.: .. .:.:::::..: :.:. CCDS34 KNEIEYKWKK-P--SVEVADPKYWRLYQFAFVGLRNSTEITHTISGDYVIMTIFFDLSRR 220 230 240 250 260 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 MGYFMIQIYTPCIMTVILSQVSFWINKESVPARTVFGITTVLTMTTLSISARHSLPKVSY :::: :: : :::.::.:: :::::::..::::: .:::::::::::: ::.::::::: CCDS34 MGYFTIQTYIPCILTVVLSWVSFWINKDAVPARTSLGITTVLTMTTLSTIARKSLPKVSY 270 280 290 300 310 320 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 ATAMDWFIAVCFAFVFSALIEFAAVNYFTNLQTQK-AKRKAQFAAPPTVTISKATEPLEA .:::: :..::: :::.::.:.....:::. : : : . .. ..: . CCDS34 VTAMDLFVSVCFIFVFAALMEYGTLHYFTSNQKGKTATKDRKLKNKASMTPG-------- 330 340 350 360 370 380 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 EIVLHPDSKYHLKKRITSLSLPIVSSS-----EANKVLTRAPILQSTPVTPPPLSPAFGG ::: : ....:.: .. :.. . ... . . CCDS34 ---LHPGSTL---IPMNNISVPQEDDYGYQCLEGKDCASFFCCFEDCRTGSWREGRIHIR 390 400 410 420 430 420 430 440 450 pF1KE5 TSKIDQYSRILFPVAFAGFNLVYWVVYLSKDTMEVSSSVE .:::.::::.::.::: ::::::: :: CCDS34 IAKIDSYSRIFFPTAFALFNLVYWVGYLYL 440 450 460 453 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 01:57:14 2016 done: Tue Nov 8 01:57:15 2016 Total Scan time: 2.360 Total Display time: 0.080 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]