FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5463, 309 aa 1>>>pF1KE5463 309 - 309 aa - 309 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5118+/-0.000529; mu= 14.0724+/- 0.032 mean_var=66.9834+/-14.336, 0's: 0 Z-trim(106.6): 89 B-trim: 874 in 1/49 Lambda= 0.156708 statistics sampled from 14615 (14703) to 14615 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.496), E-opt: 0.2 (0.172), width: 16 Scan time: 4.960 The best scores are: opt bits E(85289) NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 mem ( 309) 2018 465.8 4.8e-131 NP_795365 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 mem ( 309) 1832 423.8 2.2e-118 NP_795366 (OMIM: 612669) taste receptor type 2 mem ( 309) 1734 401.6 1e-111 NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2 ( 319) 1726 399.8 3.7e-111 XP_006726600 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 1717 397.8 1.4e-110 XP_003961040 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 1717 397.8 1.4e-110 NP_795367 (OMIM: 613967) taste receptor type 2 mem ( 299) 1717 397.8 1.4e-110 NP_795370 (OMIM: 613962) taste receptor type 2 mem ( 309) 1421 330.8 2.1e-90 NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 mem ( 299) 1373 320.0 3.7e-87 NP_795369 (OMIM: 613961) taste receptor type 2 mem ( 299) 1366 318.4 1.1e-86 NP_076409 (OMIM: 604792) taste receptor type 2 mem ( 303) 867 205.6 1e-52 NP_076411 (OMIM: 604790) taste receptor type 2 mem ( 317) 789 188.0 2.2e-47 NP_076408 (OMIM: 604793) taste receptor type 2 mem ( 318) 690 165.6 1.2e-40 NP_076406 (OMIM: 604795) taste receptor type 2 mem ( 312) 686 164.7 2.2e-40 NP_076407 (OMIM: 604794) taste receptor type 2 mem ( 309) 630 152.0 1.4e-36 NP_852094 (OMIM: 613966) taste receptor type 2 mem ( 314) 622 150.2 5e-36 NP_076410 (OMIM: 604791) taste receptor type 2 mem ( 307) 576 139.8 6.6e-33 NP_058639 (OMIM: 604868) taste receptor type 2 mem ( 316) 572 138.9 1.3e-32 NP_795364 (OMIM: 613965) taste receptor type 2 mem ( 307) 520 127.1 4.3e-29 NP_061853 (OMIM: 605062) taste receptor type 2 mem ( 299) 442 109.5 8.5e-24 NP_062545 (OMIM: 604796) taste receptor type 2 mem ( 299) 415 103.4 5.9e-22 NP_795363 (OMIM: 613964) taste receptor type 2 mem ( 323) 406 101.4 2.6e-21 NP_803186 (OMIM: 613968) taste receptor type 2 mem ( 318) 364 91.9 1.8e-18 NP_058641 (OMIM: 103780,604867) taste receptor typ ( 291) 357 90.3 5.1e-18 NP_058640 (OMIM: 604869) taste receptor type 2 mem ( 299) 349 88.5 1.8e-17 NP_789787 (OMIM: 171200,607751) taste receptor typ ( 333) 317 81.3 3e-15 NP_005152 (OMIM: 600052) apelin receptor [Homo sap ( 380) 163 46.5 0.0001 NP_000676 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359) 149 43.3 0.00087 NP_033611 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359) 149 43.3 0.00087 NP_114438 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 388) 149 43.3 0.00093 NP_004826 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 394) 149 43.3 0.00095 NP_114038 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 394) 149 43.3 0.00095 >>NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 member (309 aa) initn: 2018 init1: 2018 opt: 2018 Z-score: 2473.6 bits: 465.8 E(85289): 4.8e-131 Smith-Waterman score: 2018; 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XP_003 VLLLNWYSTVLNPAFYSVELRTTAYNIWAVTGHFSNWPATSLSIFYLLKIANFSNLIFLR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 LKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTVT ::::::::.::.::::::::.:::::.:::::.:::::::::::::::: :::::.:::: XP_003 LKRRVKSVILVVLLGPLLFLACHLFVVNMNQIVWTKEYEGNMTWKIKLRRAMYLSDTTVT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI .::::::::.::::::::.::::::::::::::::::::: :::::.:::: ::.:: :: XP_003 MLANLVPFTVTLISFLLLVCSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKVLQTVISFFLLRAI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW ::.:.:.:::::..::::::::::.::.:: :.:::::::::::::::.:::::..:: XP_003 YFVSVIISVWSFKNLENKPVFMFCQAIGFSCSSAHPFILIWGNKKLKQTYLSVLWQMRY 250 260 270 280 290 pF1KE5 VKGEKPSSS >>NP_795367 (OMIM: 613967) taste receptor type 2 member (299 aa) initn: 1717 init1: 1717 opt: 1717 Z-score: 2106.0 bits: 397.8 E(85289): 1.4e-110 Smith-Waterman score: 1717; 85.3% identity (95.7% similar) in 299 aa overlap (1-299:1-299) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW ::::::::::::.::::::::::::::::::: :: :::::::::::.:::::::::::: NP_795 MITFLPIIFSILVVVTFVIGNFANGFIALVNSTEWVKRQKISFADQIVTALAVSRVGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH ::.::::.: ::::: :.:.: ::::.::: .::::: :::::::::::::::::::::. NP_795 VLLLNWYSTVLNPAFYSVELRTTAYNIWAVTGHFSNWPATSLSIFYLLKIANFSNLIFLR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 LKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTVT ::::::::.::.::::::::.:::::.:::::.:::::::::::::::: :::::.:::: NP_795 LKRRVKSVILVVLLGPLLFLACHLFVVNMNQIVWTKEYEGNMTWKIKLRRAMYLSDTTVT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI .::::::::.::::::::.::::::::::::::::::::: :::::.:::: ::.:: :: NP_795 MLANLVPFTVTLISFLLLVCSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKVLQTVISFFLLRAI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW ::.:.:.:::::..::::::::::.::.:: :.:::::::::::::::.:::::..:: NP_795 YFVSVIISVWSFKNLENKPVFMFCQAIGFSCSSAHPFILIWGNKKLKQTYLSVLWQMRY 250 260 270 280 290 pF1KE5 VKGEKPSSS >>NP_795370 (OMIM: 613962) taste receptor type 2 member (309 aa) initn: 1449 init1: 1410 opt: 1421 Z-score: 1744.1 bits: 330.8 E(85289): 2.1e-90 Smith-Waterman score: 1421; 69.5% identity (87.0% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW :..:: :.::::.::.:..::::::::::.: : : :::::: ::::..::::::::::: NP_795 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH :..:.::.: :::. ....: : :.::: :::: ::::::::::::::.::: ::: : NP_795 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 LKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTVT :::..:::::::.:: :.:::::: . . .::.: :::.:::::::.::.::: ::. NP_795 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI .::::.::::::::::::: :::::::::::::::::::: :.::::::::::::.: :: NP_795 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW ::: .:.: :.:. .. :.:.:.:... ::: : :::::::: ::::::::::.: : NP_795 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 VKGEKPSSS .::.. :. NP_795 AKGQNQSTP >>NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 member (299 aa) initn: 1395 init1: 1366 opt: 1373 Z-score: 1685.7 bits: 320.0 E(85289): 3.7e-87 Smith-Waterman score: 1373; 70.5% identity (87.6% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-298) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW ::::: :.:::::.: ::.:::::::::::: :.: ::.::: ::::::::::::.:::: NP_795 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH .:.:::: : ::::: :.:.:::.::.:.: :::: :::..:::::::::::::::.::: NP_795 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 LKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTVT :::::.::.:::::: :.::::::.: ::.. .:..::::::: :.:::....:: ::: NP_795 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI : ...::::.:::::.::::::::::::::::.:::: : :::::::::. :::::::: NP_795 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW .:: .:.:::: . :.: :: : .:.. : . ::::: .::::.::: .: ..: NP_795 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC 250 260 270 280 290 pF1KE5 VKGEKPSSS >>NP_795369 (OMIM: 613961) taste receptor type 2 member (299 aa) initn: 1358 init1: 1358 opt: 1366 Z-score: 1677.2 bits: 318.4 E(85289): 1.1e-86 Smith-Waterman score: 1366; 69.7% identity (88.9% similar) in 297 aa overlap (1-297:1-297) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW :. :: :: :::.: .::.:: ::::::::: :.: . .::: :.::::::.:::.:::: NP_795 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH :... :::: .: :. ..::::.: :.::: :::: :::.::::: ::::::::::: :: NP_795 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 LKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTVT ::.:.::::::::::::.::.:.: ::.:.. .::::::::.:::::::.:..::. ::: NP_795 LKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRNAIHLSSLTVT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI ::::.::::.:: :::::::::::::::.::.::::::: ::::::::::::::.: :: NP_795 TLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLMLFAI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW ::: :: :.:.... ..: :...:...:. ::: : :::: :..:::::::::::.. NP_795 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR 250 260 270 280 290 pF1KE5 VKGEKPSSS 309 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 01:00:36 2016 done: Tue Nov 8 01:00:37 2016 Total Scan time: 4.960 Total Display time: 0.000 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]