FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5463, 309 aa 1>>>pF1KE5463 309 - 309 aa - 309 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9270+/-0.00127; mu= 12.1023+/- 0.075 mean_var=71.7789+/-15.773, 0's: 0 Z-trim(100.7): 59 B-trim: 411 in 1/46 Lambda= 0.151383 statistics sampled from 6154 (6201) to 6154 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.527), E-opt: 0.2 (0.19), width: 16 Scan time: 1.680 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 ( 309) 2018 450.4 7.9e-127 CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 ( 309) 1832 409.8 1.3e-114 CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 ( 309) 1734 388.4 3.7e-108 CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 ( 319) 1726 386.7 1.3e-107 CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 ( 309) 1421 320.0 1.4e-87 CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 ( 299) 1373 309.6 2e-84 CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 ( 299) 1366 308.0 5.6e-84 CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 ( 303) 867 199.1 3.7e-51 CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 ( 317) 789 182.0 5.1e-46 CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 ( 318) 690 160.4 1.7e-39 CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 ( 312) 686 159.5 3e-39 CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 ( 309) 630 147.3 1.4e-35 CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 ( 314) 622 145.5 4.8e-35 CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 ( 307) 576 135.5 5e-32 CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 ( 316) 572 134.6 9.4e-32 CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs108|chr7 ( 307) 520 123.3 2.4e-28 CCDS5869.1 TAS2R5 gene_id:54429|Hs108|chr7 ( 299) 442 106.2 3.2e-23 CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs108|chr7 ( 338) 430 103.6 2.2e-22 CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs108|chr5 ( 299) 415 100.3 1.9e-21 CCDS43662.1 TAS2R40 gene_id:259286|Hs108|chr7 ( 323) 406 98.4 7.9e-21 CCDS5885.1 TAS2R60 gene_id:338398|Hs108|chr7 ( 318) 364 89.2 4.5e-18 CCDS5785.1 TAS2R16 gene_id:50833|Hs108|chr7 ( 291) 357 87.7 1.2e-17 CCDS5868.1 TAS2R4 gene_id:50832|Hs108|chr7 ( 299) 349 85.9 4.1e-17 CCDS34765.1 TAS2R38 gene_id:5726|Hs108|chr7 ( 333) 320 79.6 3.7e-15 >>CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 (309 aa) initn: 2018 init1: 2018 opt: 2018 Z-score: 2390.4 bits: 450.4 E(32554): 7.9e-127 Smith-Waterman score: 2018; 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CCDS86 AKGQNQSTP >>CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 (299 aa) initn: 1395 init1: 1366 opt: 1373 Z-score: 1629.4 bits: 309.6 E(32554): 2e-84 Smith-Waterman score: 1373; 70.5% identity (87.6% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-298) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW ::::: :.:::::.: ::.:::::::::::: :.: ::.::: ::::::::::::.:::: CCDS86 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH .:.:::: : ::::: :.:.:::.::.:.: :::: :::..:::::::::::::::.::: CCDS86 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 LKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTVT :::::.::.:::::: :.::::::.: ::.. .:..::::::: :.:::....:: ::: CCDS86 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI : ...::::.:::::.::::::::::::::::.:::: : :::::::::. :::::::: CCDS86 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW .:: .:.:::: . :.: :: : .:.. : . ::::: .::::.::: .: ..: CCDS86 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC 250 260 270 280 290 pF1KE5 VKGEKPSSS >>CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 (299 aa) initn: 1358 init1: 1358 opt: 1366 Z-score: 1621.1 bits: 308.0 E(32554): 5.6e-84 Smith-Waterman score: 1366; 69.7% identity (88.9% similar) in 297 aa overlap (1-297:1-297) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW :. :: :: :::.: .::.:: ::::::::: :.: . .::: :.::::::.:::.:::: CCDS86 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH :... :::: .: :. ..::::.: :.::: :::: :::.::::: ::::::::::: :: CCDS86 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 LKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTVT ::.:.::::::::::::.::.:.: ::.:.. .::::::::.:::::::.:..::. ::: CCDS86 LKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRNAIHLSSLTVT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI ::::.::::.:: :::::::::::::::.::.::::::: ::::::::::::::.: :: CCDS86 TLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLMLFAI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW ::: :: :.:.... ..: :...:...:. ::: : :::: :..:::::::::::.. CCDS86 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR 250 260 270 280 290 pF1KE5 VKGEKPSSS >>CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 (303 aa) initn: 814 init1: 266 opt: 867 Z-score: 1032.0 bits: 199.1 E(32554): 3.7e-51 Smith-Waterman score: 867; 46.9% identity (73.9% similar) in 307 aa overlap (1-302:1-302) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW : . :: ::...:.. :.:::..::::.:.: :.: .....: .:..: ::.::.::.: CCDS86 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 VLVLNWY-ATELNPAFNS-IEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIF ....:. : . : : .:: .. : : :::. :::: .:::::::::.::. : CCDS86 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFS-WIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 LHLKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNT- :.:: ::..:.:.:::: :.:: .:. :::. : .:: : ::.... . .: . 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