FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2486, 2223 aa 1>>>pF1KE2486 2223 - 2223 aa - 2223 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.2524+/-0.000382; mu= 3.7242+/- 0.024 mean_var=272.4159+/-55.497, 0's: 0 Z-trim(122.1): 293 B-trim: 0 in 0/59 Lambda= 0.077707 statistics sampled from 39349 (39654) to 39349 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.744), E-opt: 0.2 (0.465), width: 16 Scan time: 18.660 The best scores are: opt bits E(85289) NP_066919 (OMIM: 608230) voltage-dependent T-type (2223) 15174 1716.0 0 NP_001003406 (OMIM: 608230) voltage-dependent T-ty (2188) 11521 1306.5 0 XP_016884525 (OMIM: 608230) PREDICTED: voltage-dep (1605) 10552 1197.8 0 XP_016884524 (OMIM: 608230) PREDICTED: voltage-dep (1606) 10540 1196.4 0 XP_016884526 (OMIM: 608230) PREDICTED: voltage-dep (1593) 7674 875.1 0 NP_001243253 (OMIM: 604065,616795) 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NP_938 LECDETHPCEGLGRHATFRNFGMAFLTLFRVSTGDNWNGIMKDTLRDCDQ-ESTCYNTV- 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1710 1720 1730 1740 1750 1760 pF1KE2 FVSPLYFVSFVLTAQFVLINVVVAVLMKHLDDSNKEAQEDAEMDAELELEMAHGLGPGPR .::.:::::::::::::.:::.:::::::..:::::.:.::..::::::: . :.: :. NP_938 -ISPIYFVSFVLTAQFVLVNVVIAVLMKHLEESNKEAKEEAELEAELELEM-KTLSPQPH 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1770 1780 1790 1800 1810 1820 pF1KE2 LPTGSPGA-PG-RGPGGAGGGGDTEGGLCRRCYSPAQENLWLDSVSLIIKDS-LEGELTI : ::: :: .:: . . :.: .. . .. :. .. . . : : . NP_938 SPLGSPFLWPGVEGPDSPDS--PKPGALHPAAHARSASHFSLEHPTMQPHPTELPGPDLL 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1830 1840 1850 1860 1870 1880 pF1KE2 IDNLSGSIFHHYSSPAGCKKCHHDKQEVQLAETEAFSLNSDRSSSILLGDDLSLEDPTAC :: . . .: : :.: . ....: . .:.:.: . : . NP_938 TVRKSG-VSRTHSLPNDSYMCRHGSTAEGPLGHRGWGLPKAQSGSVLSVHSQP-ADTSYI 1930 1940 1950 1960 1970 1980 1890 1900 1910 1920 1930 1940 pF1KE2 PPGRKDSKGELDPPEPMRVGDLGECFFPLSSTAVSPDPENFLCEMEEIPFNPVRSWLKHD ::. :.: : . . : . :: . : .. : . . .. NP_938 LQLPKDAPHLLQPHSAPTWGTIPK----LPPPGRSPLAQRPLRRQAAIRTDSLD--VQGL 1990 2000 2010 2020 2030 1950 1960 1970 1980 1990 2000 pF1KE2 SSQAPPSPFSPDASSPLLPMPAEFFHPAVSASQKGPEKGTGTGTLPKIALQGSWASLRSP .:. . ..:.: :. . . :..: .. . . ::. . .: NP_938 GSRE---DLLAEVSGPSPPLARAYSFWGQSSTQAQQHSRSHS----KISKH------MTP 2040 2050 2060 2070 2080 2010 2020 2030 2040 2050 pF1KE2 RVNCTLLRQATGSDTSLDASPSSSAGSLQTTLEDSLTLSDSPRRALGPPA---PAPGPRA . : : . . .: . .::. : : .: : ::. :.:: NP_938 PAPC------PGPEPNWGKGPPETRSSLELDTELSWISGD-----LLPPGGQEEPPSPRD 2090 2100 2110 2120 2130 2060 2070 2080 2090 2100 2110 pF1KE2 GLSPAARRRLSLRGRGLFSLRGLRAHQRSHSSGGST-SPGCTHHDSMDPSDEEGRGGAGG . . . : . : : .:: :: . : . : : . :::. :: NP_938 LKKCYSVEAQSCQRRPTSWLD----EQRRHSIAVSCLDSGSQPHLGTDPSNL---GGQPL 2140 2150 2160 2170 2180 2120 2130 2140 2150 2160 2170 pF1KE2 GGAGSEHSETLSSLSLTSLFCPPP---P--PPAPGLTPARKFSSTSSLAAPGRPHAAALA :: ::. .. :: :.: . :: : ::.::. :. :..: : :.. 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NP_001 TCYNTV--ISPIYFVSFVLTAQFVLVNVVIAVLMKHLEESNKEAKEEAELEAELELEM-K 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1760 1770 1780 1790 1800 1810 pF1KE2 GLGPGPRLPTGSPGA-PG-RGPGGAGGGGDTEGGLCRRCYSPAQENLWLDSVSLIIKDSL :.: :. : ::: :: .:: :: NP_001 TLSPQPHSPLGSPFLWPGVEGPD-----------------SP------------------ 1870 1880 1890 1820 1830 1840 1850 1860 1870 pF1KE2 EGELTIIDNLSGSIFHHYSSPAGCKKCHHDKQEVQLAETEAFSLNSDRSSSILLGDDLSL :. . . .: ::. : ::.: .:: NP_001 -------DSPKPGALH----PAA-----H-----------------ARSAS-----HFSL 1900 1910 1880 1890 1900 1910 1920 1930 pF1KE2 EDPTACPPGRKDSKGELDPPEPMRVGDLGECFFPLSSTAVSPDPENFLCEMEEIPFNPV- : :: : :: :. . : : .: : :. ....:. .:. NP_001 EHPTMQP-----HPTELPGPDLLTVRKSG-----VSRTHSLPN-DSYMCRHGSTAEGPLG 1920 1930 1940 1950 1960 1940 1950 1960 1970 1980 1990 pF1KE2 -RSW-LKHDSSQAPPSPFS-PDASSPLLPMPAEFFHPAVSASQKGPEKGTGTGTLPKIAL :.: : . .: . : : : .: .: .: . : :... ::.::. 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NP_938 FGIVGVQLWAGLLRNRCFLPENFSLPLSVDLERYYQTENEDESPFICSQPRENGMRSCRS 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 IPPLKEQGR---ECCLSKDDVYDFGAGRQDLNASGLCVNWNRYYNVCRTGSANPHKGAIN .: :. .: : : :. : .. :.. :::::.::. : .: :: ::::: NP_938 VPTLRGDGGGGPPCGL------DYEAYNSSSNTT--CVNWNQYYTNCSAGEHNPFKGAIN 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 FDNIGYAWIVIFQVITLEGWVEIMYYVMDAHSFYNFIYFILLIIVGSFFMINLCLVVIAT :::::::::.:::::::::::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_938 FDNIGYAWIAIFQVITLEGWVDIMYFVMDAHSFYNFIYFILLIIVGSFFMINLCLVVIAT 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 QFSETKQREHRLMLEQRQRYLSS-STVASYAEPGDCYEEIFQYVCHILRKAKRR------ ::::::::: .:: ::: :.::. ::.::..:::.::::...:. .::::: :: NP_938 QFSETKQRESQLMREQRVRFLSNASTLASFSEPGSCYEELLKYLVYILRKAARRLAQVSR 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 pF1KE2 ALGLYQALQSRRQALGPEAPAPAKPGPHAKE-----------PRHYHGKTKGQGD----- : :. .: : :: . :.. .... .:.: :.: NP_938 AAGVRVGLLSSPAPLGGQETQPSSSCSRSHRRLSVHHLVHHHHHHHHHYHLGNGTLRAPR 460 470 480 490 500 510 500 510 520 pF1KE2 -----EGRHL-GSRHCQTLHGPASP---GNDHSGREL--------C----------PQHS . : :::. . : :..: : .: : : : .: NP_938 ASPEIQDRDANGSRRLM-LPPPSTPALSGAPPGGAESVHSFYHADCHLEPVRCQAPPPRS 520 530 540 550 560 570 530 540 550 pF1KE2 PLDAT----------PHTLVQPIPATL----------ASDPA------------------ : .:. : . ..: : :: .: : NP_938 PSEASGRTVGSGKVYPTVHTSPPPETLKEKALVEVAASSGPPTLTSLNIPPGPYSSMHKL 580 590 600 610 620 630 560 570 580 590 pF1KE2 ----SCPCCQHEDGRRPSGLGSTDSGQEGSGSG---SSAG-GEDE-ADGDGARS------ : :: . . : ..::: : : . :: :: : :: . : NP_938 LETQSTGACQS-SCKISSPCLKADSGACGPDSCPYCARAGAGEVELADREMPDSDSEAVY 640 650 660 670 680 690 600 610 620 630 640 650 pF1KE2 --SEDGASSELGKEEEEEEQADGAVWLCGDV---WRETRAKLRGIVDSKYFNRGIMMAIL ..:. :.: . ..... : ..: :: .: :::::::.::::.::: NP_938 EFTQDAQHSDLRDPHSRRQRSLGPDAEPSSVLAFWRLICDTFRKIVDSKYFGRGIMIAIL 700 710 720 730 740 750 660 670 680 690 700 710 pF1KE2 VNTVSMGIEHHEQPEELTNILEICNVVFTSMFALEMILKLAAFGLFDYLRNPYNIFDSII :::.:::::.::::::::: ::: :.::::.:::::.::: ..: : :..:::::::..: NP_938 VNTLSMGIEYHEQPEELTNALEISNIVFTSLFALEMLLKLLVYGPFGYIKNPYNIFDGVI 760 770 780 790 800 810 720 730 740 750 760 770 pF1KE2 VIISIWEIVGQADGGLSVLRTFRLLRVLKLVRFMPALRRQLVVLMKTMDNVATFCMLLML :.::.:::::: :::::::::::.::::::::.:::.:::::::::::::::::::::: NP_938 VVISVWEIVGQQGGGLSVLRTFRLMRVLKLVRFLPALQRQLVVLMKTMDNVATFCMLLML 820 830 840 850 860 870 780 790 800 810 820 830 pF1KE2 FIFIFSILGMHIFGCKFSLRTDTGDTVPDRKNFDSLLWAIVTVFQILTQEDWNVVLYNGM :::::::::::.:::::. . : :::.:::::::::::::::::::::::::: :::::: NP_938 FIFIFSILGMHLFGCKFASERD-GDTLPDRKNFDSLLWAIVTVFQILTQEDWNKVLYNGM 880 890 900 910 920 930 840 850 860 870 880 pF1KE2 ASTSPWASLYFVALMTFGNYVLFNLLVAILVEGFQAEG-----DANRSYS------DEDQ :::: ::.:::.::::::::::::::::::::::::: ::. . : : . NP_938 ASTSSWAALYFIALMTFGNYVLFNLLVAILVEGFQAEEISKREDASGQLSCIQLPVDSQG 940 950 960 970 980 990 890 900 910 920 930 pF1KE2 SSSNIEEF--DKLQEGLDSSGDPKLCP--IPMTPNGHLDPSL--PLGGHLGPAGAAGPAP ...: : : .. .::..:: : : . . . .: :: :: : :: : NP_938 GDANKSESEPDFFSPSLDGDGDRKKCLALVSLGEHPELRKSLLPPLIIHT----AATPMS 1000 1010 1020 1030 1040 940 950 960 970 980 990 pF1KE2 RLSLQPDPMLVALG--SRKSSVMSLGR--MSYDQRSLSSSRSSYYGPWGRSAAWASRRSS . . ::: ::..: . .. .....: :.::: ..::. ...:.::::: NP_938 LPKSTSTGLGEALGPASRRTSSSGSAEPGAAHEMKSPPSARSSPHSPWSAASSWTSRRSS 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE2 WNSL------KHKPPSAEHESLLSAERGGGARVCEVAADEGPPRAAPLHTPHAHHVHHGP ::: :.. ::.:..::::.: : .. : ...: ::.: . : NP_938 RNSLGRAPSLKRRSPSGERRSLLSGE-GQESQDEEESSEE--ERASPAGSDH-------- 1110 1120 1130 1140 1150 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KE2 HLAHRHRHHRRTLSLDNRDSVDLAELVPAVGAHPRAAWRAAGPAPGHEDCNGRMPSIAKD .:: .: . ..: :: . . . : : :. : : : :.::::. : NP_938 -------RHRGSLEREAKSSFDLPDTLQVPGLHRTASGR--GSASEHQDCNGKSASGRLA 1160 1170 1180 1190 1200 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KE2 VFTKMGDRGDRGED-EEEIDYTLCFRVRKMIDVYKPDWCEVREDWSVYLFSPENRFRVLC . : :.: ..: . . ::: : . : : :..::.:.: :..:::.:: NP_938 RALRPDDPPLDGDDADDEGNLSKGERVRAWIRARLPACCLERDSWSAYIFPPQSRFRLLC 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KE2 QTIIAHKLFDYVVLAFIFLNCITIALERPQIEAGSTERIFLTVSNYIFTAIFVGEMTLKV . ::.::.::.:::..:::::::::.:::.:. :.::::::.:::::::.:..:::.:: NP_938 HRIITHKMFDHVVLVIIFLNCITIAMERPKIDPHSAERIFLTLSNYIFTAVFLAEMTVKV 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1230 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KE2 VSLGLYFGEQAYLRSSWNVLDGFLVFVSIIDIVVSLASAGGAKILGVLRVLRLLRTLRPL :.:: ::::::::::::::::.::..:.:::.::..: .:.::::.::::::::::::: NP_938 VALGWCFGEQAYLRSSWNVLDGLLVLISVIDILVSMVSDSGTKILGMLRVLRLLRTLRPL 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1290 1300 1310 1320 1330 1340 pF1KE2 RVISRAPGLKLVVETLISSLKPIGNIVLICCAFFIIFGILGVQLFKGKFYHCLGVDTRNI :::::: :::::::::.::::::::::.:::::::::::::::::::::. : : ::::: NP_938 RVISRAQGLKLVVETLMSSLKPIGNIVVICCAFFIIFGILGVQLFKGKFFVCQGEDTRNI 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1350 1360 1370 1380 1390 1400 pF1KE2 TNRSDCMAANYRWVHHKYNFDNLGQALMSLFVLASKDGWVNIMYNGLDAVAVDQQPVTNH ::.::: :.::::.:::::::::::::::::::::::::.:::.:::::.:::::. :: NP_938 TNKSDCAEASYRWVRHKYNFDNLGQALMSLFVLASKDGWVDIMYDGLDAVGVDQQPIMNH 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1410 1420 1430 1440 1450 1460 pF1KE2 NPWMLLYFISFLLIVSFFVLNMFVGVVVENFHKCRQHQEAEEARRREEKRLRRLEKKRR- :::::::::::::::.::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::: NP_938 NPWMLLYFISFLLIVAFFVLNMFVGVVVENFHKCRQHQEEEEARRREEKRLRRLEKKRRS 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1470 1480 1490 1500 1510 pF1KE2 ------KAQRLPYYATYCHTRLLIHSMCTSHYLDIFITFIICLNVVTMSLEHYNQPTSLE .:: :::. : . :::.: .:::::::.::: .: ::::::..:::.:: :. NP_938 KEKQMAEAQCKPYYSDYSRFRLLVHHLCTSHYLDLFITGVIGLNVVTMAMEHYQQPQILD 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1520 1530 1540 1550 1560 1570 pF1KE2 TALKYCNYMFTTVFVLEAVLKLVAFGLRRFFKDRWNQLDLAIVLLSVMGITLEEIEINAA ::: :::.::..::::.:.::::::.::::.::::::::::::::.:::::::::.::. NP_938 EALKICNYIFTVIFVLESVFKLVAFGFRRFFQDRWNQLDLAIVLLSIMGITLEEIEVNAS 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1580 1590 1600 1610 1620 1630 pF1KE2 LPINPTIIRIMRVLRIARVLKLLKMATGMRALLDTVVQALPQVGNLGLLFMLLFFIYAAL ::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::::::::::::.::: NP_938 LPINPTIIRIMRVLRIARVLKLLKMAVGMRALLDTVMQALPQVGNLGLLFMLLFFIFAAL 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1640 1650 1660 1670 1680 1690 pF1KE2 GVELFGKLVCNDENPCEGMSRHATFENFGMAFLTLFQVSTGDNWNGIMKDTLRDCTHDER :::::: : :.. .::::..:::::.::::::::::.:::::::::::::::::: . : NP_938 GVELFGDLECDETHPCEGLGRHATFRNFGMAFLTLFRVSTGDNWNGIMKDTLRDCDQ-ES 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1700 1710 1720 1730 1740 1750 pF1KE2 SCLSSLQFVSPLYFVSFVLTAQFVLINVVVAVLMKHLDDSNKEAQEDAEMDAELELEMAH .: ... .::.:::::::::::::.:::.:::::::..:::::.:.::..::::::: . NP_938 TCYNTV--ISPIYFVSFVLTAQFVLVNVVIAVLMKHLEESNKEAKEEAELEAELELEM-K 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1760 1770 1780 1790 1800 1810 pF1KE2 GLGPGPRLPTGSPGA-PG-RGPGGAGGGGDTEGGLCRRCYSPAQENLWLDSVSLIIKDS- :.: :. : ::: :: .:: . . :.: .. . .. :. .. . . NP_938 TLSPQPHSPLGSPFLWPGVEGPDSPDS--PKPGALHPAAHARSASHFSLEHPTMQPHPTE 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1820 1830 1840 1850 1860 1870 pF1KE2 LEGELTIIDNLSGSIFHHYSSPAGCKKCHHDKQEVQLAETEAFSLNSDRSSSILLGDDLS : : . :: . . .: : :.: . ....: . .:.:.: . NP_938 LPGPDLLTVRKSG-VSRTHSLPNDSYMCRHGSTAEGPLGHRGWGLPKAQSGSVLSVHSQP 1930 1940 1950 1960 1970 1980 1880 1890 1900 1910 1920 1930 pF1KE2 LEDPTACPPGRKDSKGELDPPEPMRVGDLGECFFPLSSTAVSPDPENFLCEMEEIPFNPV : . ::. :.: : . . : . :: . : .. : . . NP_938 -ADTSYILQLPKDAPHLLQPHSAPTWGTIPK----LPPPGRSPLAQRPLRRQAAIRTDSL 1990 2000 2010 2020 2030 1940 1950 1960 1970 1980 1990 pF1KE2 RSWLKHDSSQAPPSPFSPDASSPLLPMPAEFFHPAVSASQKGPEKGTGTGTLPKIALQGS .. .:. . ..:.: :. . . :..: .. . . ::. . NP_938 D--VQGLGSRE---DLLAEVSGPSPPLARAYSFWGQSSTQAQQHSRSHS----KISKH-- 2040 2050 2060 2070 2080 2000 2010 2020 2030 2040 2050 pF1KE2 WASLRSPRVNCTLLRQATGSDTSLDASPSSSAGSLQTTLEDSLTLSDSPRRALGPPA--- .: . : : . . .: . .::. : : .: : ::. NP_938 ----MTPPAPC------PGPEPNWGKGPPETRSSLELDTELSWISGD-----LLPPGGQE 2090 2100 2110 2120 2130 2060 2070 2080 2090 2100 pF1KE2 PAPGPRAGLSPAARRRLSLRGRGLFSLRGLRAHQRSHSSGGST-SPGCTHHDSMDPSDEE :.:: . . . : . : : .:: :: . : . : : . :::. 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