Result of FASTA (ccds) for pFN21AE6786
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE6786, 629 aa
  1>>>pF1KE6786 629 - 629 aa - 629 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4731+/-0.000947; mu= 10.2692+/- 0.057
 mean_var=128.7359+/-25.780, 0's: 0 Z-trim(109.6): 14  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.113038
 statistics sampled from 10984 (10992) to 10984 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.693), E-opt: 0.2 (0.338), width:  16
 Scan time:  3.970

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS55917.2 SAMD4A gene_id:23034|Hs108|chr14       ( 630) 4204 697.1 1.9e-200
CCDS32084.2 SAMD4A gene_id:23034|Hs108|chr14       ( 718) 2605 436.3 6.7e-122
CCDS55918.1 SAMD4A gene_id:23034|Hs108|chr14       ( 345) 1837 310.9 1.8e-84
CCDS77295.1 SAMD4B gene_id:55095|Hs108|chr19       ( 692)  853 150.6 6.6e-36
CCDS33020.1 SAMD4B gene_id:55095|Hs108|chr19       ( 694)  853 150.6 6.6e-36


>>CCDS55917.2 SAMD4A gene_id:23034|Hs108|chr14            (630 aa)
 initn: 4204 init1: 4204 opt: 4204  Z-score: 3712.2  bits: 697.1 E(32554): 1.9e-200
Smith-Waterman score: 4204; 100.0% identity (100.0% similar) in 629 aa overlap (1-629:2-630)

                10        20        30        40        50         
pF1KE6  MFRDQVGVLAGWFKGWNECEQTVALLSLLKRVSQTQARFLQLCLEHSLADCAELHVLER
        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MMFRDQVGVLAGWFKGWNECEQTVALLSLLKRVSQTQARFLQLCLEHSLADCAELHVLER
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE6 EANSPGIINQWQQESKDKVISLLLTHLPLLKPGNLDAKVEYMKLLPKILAHSIEHNQHIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EANSPGIINQWQQESKDKVISLLLTHLPLLKPGNLDAKVEYMKLLPKILAHSIEHNQHIE
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE6 ESRQLLSYALIHPATSLEDRSALAMWLNHLEDRTSTSFGGQNRGRSDSVDYGQTHYYHQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ESRQLLSYALIHPATSLEDRSALAMWLNHLEDRTSTSFGGQNRGRSDSVDYGQTHYYHQR
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE6 QNSDDKLNGWQNSRDSGICINASNWQDKSMGCENGHVPLYSSSSVPTTINTIGTSTSTNV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QNSDDKLNGWQNSRDSGICINASNWQDKSMGCENGHVPLYSSSSVPTTINTIGTSTSTNV
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE6 PAWLKSLRLHKYAALFSQMTYEEMMALTECQLEAQNVTKGARHKIVISIQKLKERQNLLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PAWLKSLRLHKYAALFSQMTYEEMMALTECQLEAQNVTKGARHKIVISIQKLKERQNLLK
              250       260       270       280       290       300

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE6 SLERDIIEGGSLRIPLQELHQMILTPIKAYSSPSTTPEARRREPQAPRQPSLMGPESQSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SLERDIIEGGSLRIPLQELHQMILTPIKAYSSPSTTPEARRREPQAPRQPSLMGPESQSP
              310       320       330       340       350       360

     360       370       380       390       400       410         
pF1KE6 DCKDGAAATGATATPSAGASGGLQPHQLSSCDGELAVAPLPEGDLPGQFTRVMGKVCTQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DCKDGAAATGATATPSAGASGGLQPHQLSSCDGELAVAPLPEGDLPGQFTRVMGKVCTQL
              370       380       390       400       410       420

     420       430       440       450       460       470         
pF1KE6 LVSRPDEENISSYLQLIDKCLIHEAFTETQKKRLLSWKQQVQKLFRSFPRKTLLDISGYR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LVSRPDEENISSYLQLIDKCLIHEAFTETQKKRLLSWKQQVQKLFRSFPRKTLLDISGYR
              430       440       450       460       470       480

     480       490       500       510       520       530         
pF1KE6 QQRNRGFGQSNSLPTAGSVGGGMGRRNPRQYQIPSRNVPSARLGLLGTSGFVSSNQRNTT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QQRNRGFGQSNSLPTAGSVGGGMGRRNPRQYQIPSRNVPSARLGLLGTSGFVSSNQRNTT
              490       500       510       520       530       540

     540       550       560       570       580       590         
pF1KE6 ATPTIMKQGRQNLWFANPGGSNSMPSRTHSSVQRTRSLPVHTSPQNMLMFQQPEFQLPVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ATPTIMKQGRQNLWFANPGGSNSMPSRTHSSVQRTRSLPVHTSPQNMLMFQQPEFQLPVT
              550       560       570       580       590       600

     600       610       620         
pF1KE6 EPDINNRLESLCLSMTEHALGDGVDRTSTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EPDINNRLESLCLSMTEHALGDGVDRTSTI
              610       620       630

>>CCDS32084.2 SAMD4A gene_id:23034|Hs108|chr14            (718 aa)
 initn: 2602 init1: 2602 opt: 2605  Z-score: 2302.0  bits: 436.3 E(32554): 6.7e-122
Smith-Waterman score: 3629; 86.5% identity (86.7% similar) in 661 aa overlap (57-629:58-718)

         30        40        50        60        70        80      
pF1KE6 SLLKRVSQTQARFLQLCLEHSLADCAELHVLEREANSPGIINQWQQESKDKVISLLLTHL
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SLLKRVSQTQARFLQLCLEHSLADCAELHVLEREANSPGIINQWQQESKDKVISLLLTHL
        30        40        50        60        70        80       

         90       100       110       120       130       140      
pF1KE6 PLLKPGNLDAKVEYMKLLPKILAHSIEHNQHIEESRQLLSYALIHPATSLEDRSALAMWL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PLLKPGNLDAKVEYMKLLPKILAHSIEHNQHIEESRQLLSYALIHPATSLEDRSALAMWL
        90       100       110       120       130       140       

        150       160       170       180       190       200      
pF1KE6 NHLEDRTSTSFGGQNRGRSDSVDYGQTHYYHQRQNSDDKLNGWQNSRDSGICINASNWQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NHLEDRTSTSFGGQNRGRSDSVDYGQTHYYHQRQNSDDKLNGWQNSRDSGICINASNWQD
       150       160       170       180       190       200       

        210       220       230                                    
pF1KE6 KSMGCENGHVPLYSSSSVPTTINTIGTSTST-----------------------------
       :::::::::::::::::::::::::::::::                             
CCDS32 KSMGCENGHVPLYSSSSVPTTINTIGTSTSTILSGQAHHSPLKRSVSLTPPMNVPNQPLG
       210       220       230       240       250       260       

                                                                   
pF1KE6 -----------------------------------------------------------N
                                                                  .
CCDS32 HGWMSHEDLRARGPQCLPSDHAPLSPQSSVASSGSGGSEHLEDQTTARNTFQEEGSGMKD
       270       280       290       300       310       320       

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE6 VPAWLKSLRLHKYAALFSQMTYEEMMALTECQLEAQNVTKGARHKIVISIQKLKERQNLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VPAWLKSLRLHKYAALFSQMTYEEMMALTECQLEAQNVTKGARHKIVISIQKLKERQNLL
       330       340       350       360       370       380       

      300       310       320       330       340       350        
pF1KE6 KSLERDIIEGGSLRIPLQELHQMILTPIKAYSSPSTTPEARRREPQAPRQPSLMGPESQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KSLERDIIEGGSLRIPLQELHQMILTPIKAYSSPSTTPEARRREPQAPRQPSLMGPESQS
       390       400       410       420       430       440       

      360       370       380       390       400       410        
pF1KE6 PDCKDGAAATGATATPSAGASGGLQPHQLSSCDGELAVAPLPEGDLPGQFTRVMGKVCTQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PDCKDGAAATGATATPSAGASGGLQPHQLSSCDGELAVAPLPEGDLPGQFTRVMGKVCTQ
       450       460       470       480       490       500       

      420       430       440       450       460       470        
pF1KE6 LLVSRPDEENISSYLQLIDKCLIHEAFTETQKKRLLSWKQQVQKLFRSFPRKTLLDISGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LLVSRPDEENISSYLQLIDKCLIHEAFTETQKKRLLSWKQQVQKLFRSFPRKTLLDISGY
       510       520       530       540       550       560       

      480       490       500       510       520       530        
pF1KE6 RQQRNRGFGQSNSLPTAGSVGGGMGRRNPRQYQIPSRNVPSARLGLLGTSGFVSSNQRNT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RQQRNRGFGQSNSLPTAGSVGGGMGRRNPRQYQIPSRNVPSARLGLLGTSGFVSSNQRNT
       570       580       590       600       610       620       

      540       550       560       570       580       590        
pF1KE6 TATPTIMKQGRQNLWFANPGGSNSMPSRTHSSVQRTRSLPVHTSPQNMLMFQQPEFQLPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TATPTIMKQGRQNLWFANPGGSNSMPSRTHSSVQRTRSLPVHTSPQNMLMFQQPEFQLPV
       630       640       650       660       670       680       

      600       610       620         
pF1KE6 TEPDINNRLESLCLSMTEHALGDGVDRTSTI
       :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TEPDINNRLESLCLSMTEHALGDGVDRTSTI
       690       700       710        

>--
 initn: 384 init1: 384 opt: 384  Z-score: 344.5  bits: 74.1 E(32554): 7.2e-13
Smith-Waterman score: 384; 100.0% identity (100.0% similar) in 56 aa overlap (1-56:2-57)

                10        20        30        40        50         
pF1KE6  MFRDQVGVLAGWFKGWNECEQTVALLSLLKRVSQTQARFLQLCLEHSLADCAELHVLER
        ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::   
CCDS32 MMFRDQVGVLAGWFKGWNECEQTVALLSLLKRVSQTQARFLQLCLEHSLADCAELHVLER
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE6 EANSPGIINQWQQESKDKVISLLLTHLPLLKPGNLDAKVEYMKLLPKILAHSIEHNQHIE
                                                                   
CCDS32 EANSPGIINQWQQESKDKVISLLLTHLPLLKPGNLDAKVEYMKLLPKILAHSIEHNQHIE
               70        80        90       100       110       120

>>CCDS55918.1 SAMD4A gene_id:23034|Hs108|chr14            (345 aa)
 initn: 1835 init1: 1835 opt: 1837  Z-score: 1630.0  bits: 310.9 E(32554): 1.8e-84
Smith-Waterman score: 1975; 89.4% identity (89.4% similar) in 341 aa overlap (321-625:1-341)

              300       310       320       330       340       350
pF1KE6 LKERQNLLKSLERDIIEGGSLRIPLQELHQMILTPIKAYSSPSTTPEARRREPQAPRQPS
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55                               MILTPIKAYSSPSTTPEARRREPQAPRQPS
                                             10        20        30

              360       370       380       390       400       410
pF1KE6 LMGPESQSPDCKDGAAATGATATPSAGASGGLQPHQLSSCDGELAVAPLPEGDLPGQFTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LMGPESQSPDCKDGAAATGATATPSAGASGGLQPHQLSSCDGELAVAPLPEGDLPGQFTR
               40        50        60        70        80        90

              420       430       440       450       460       470
pF1KE6 VMGKVCTQLLVSRPDEENISSYLQLIDKCLIHEAFTETQKKRLLSWKQQVQKLFRSFPRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VMGKVCTQLLVSRPDEENISSYLQLIDKCLIHEAFTETQKKRLLSWKQQVQKLFRSFPRK
              100       110       120       130       140       150

              480       490       500       510       520       530
pF1KE6 TLLDISGYRQQRNRGFGQSNSLPTAGSVGGGMGRRNPRQYQIPSRNVPSARLGLLGTSGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TLLDISGYRQQRNRGFGQSNSLPTAGSVGGGMGRRNPRQYQIPSRNVPSARLGLLGTSGF
              160       170       180       190       200       210

              540       550       560       570       580       590
pF1KE6 VSSNQRNTTATPTIMKQGRQNLWFANPGGSNSMPSRTHSSVQRTRSLPVHTSPQNMLMFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VSSNQRNTTATPTIMKQGRQNLWFANPGGSNSMPSRTHSSVQRTRSLPVHTSPQNMLMFQ
              220       230       240       250       260       270

                                                  600       610    
pF1KE6 QP------------------------------------EFQLPVTEPDINNRLESLCLSM
       ::                                    ::::::::::::::::::::::
CCDS55 QPGSQVHSGLCLTDLRGWLSLSGAPSMPALTVPKSSQGEFQLPVTEPDINNRLESLCLSM
              280       290       300       310       320       330

          620         
pF1KE6 TEHALGDGVDRTSTI
       :::::::::::    
CCDS55 TEHALGDGVDRTSTI
              340     

>>CCDS77295.1 SAMD4B gene_id:55095|Hs108|chr19            (692 aa)
 initn: 1942 init1: 850 opt: 853  Z-score: 758.1  bits: 150.6 E(32554): 6.6e-36
Smith-Waterman score: 2227; 55.0% identity (71.4% similar) in 682 aa overlap (1-597:2-662)

                10        20        30        40        50         
pF1KE6  MFRDQVGVLAGWFKGWNECEQTVALLSLLKRVSQTQARFLQLCLEHSLADCAELHVLER
        :::::::.::::::::::::::::::::::::..::::::::::::::::: ..:.:: 
CCDS77 MMFRDQVGILAGWFKGWNECEQTVALLSLLKRVTRTQARFLQLCLEHSLADCNDIHLLES
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE6 EANSPGIINQWQQESKDKVISLLLTHLPLLKPGNLDAKVEYMKLLPKILAHSIEHNQHIE
       :::: .:..:::::::.::.::::.:::::.::: .:: :::.:: :.::.::: :  ::
CCDS77 EANSAAIVSQWQQESKEKVVSLLLSHLPLLQPGNTEAKSEYMRLLQKVLAYSIESNAFIE
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE6 ESRQLLSYALIHPATSLEDRSALAMWLNHLEDRTSTSFGGQNRGRSDSVDYGQTHYYHQR
       :::::::::::::::.::::.:::.::.:::.: ...:    :.: .         ::.:
CCDS77 ESRQLLSYALIHPATTLEDRNALALWLSHLEERLASGF----RSRPEPS-------YHSR
              130       140       150           160                

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE6 QNSDDKLNGWQNSRDSGICINASNWQDKSMGCENGHVPLYSSSSVPTTINTIGTSTST--
       :.::.    : .  . :    . .::::    ::::::.. ::::: .::.::....:  
CCDS77 QGSDE----WGGPAELGPGEAGPGWQDKP-PRENGHVPFHPSSSVPPAINSIGSNANTGL
     170           180       190        200       210       220    

                                                                   
pF1KE6 ------------------------------------------------------------
                                                                   
CCDS77 PCQIHPSPLKRSMSLIPTSPQVPGEWPSPEELGARAAFTTPDHAPLSPQSSVASSGSEQT
          230       240       250       260       270       280    

                         240       250       260       270         
pF1KE6 ------------------NVPAWLKSLRLHKYAALFSQMTYEEMMALTECQLEAQNVTKG
                         .::.:::::::::::::::::.:::::.::: .::.::::::
CCDS77 EEQGSSRNTFQEDGSGMKDVPSWLKSLRLHKYAALFSQMSYEEMMTLTEQHLESQNVTKG
          290       300       310       320       330       340    

     280       290       300       310       320       330         
pF1KE6 ARHKIVISIQKLKERQNLLKSLERDIIEGGSLRIPLQELHQMILTPIKAYSSPSTTPEAR
       :::::..:::::.:::..:::::.:..:::.::  ::::.:.:.:::::::  ..:  : 
CCDS77 ARHKIALSIQKLRERQSVLKSLEKDVLEGGNLRNALQELQQIIITPIKAYSVLQATVAAA
          350       360       370       380       390       400    

     340           350       360       370       380       390     
pF1KE6 RREPQA----PRQPSLMGPESQSPDCKDGAAATGATATPSAGASGGLQPHQLSSCDG-EL
          : :    : .: : : :   :     ..  :. :    .. .   :   .  :: : 
CCDS77 TTTPTAKDGAPGEPPLPGAE---PPLAHPGTDKGTEAKDPPAVENYPPPPAPAPTDGSEP
          410       420          430       440       450       460 

          400       410       420       430       440       450    
pF1KE6 AVAPLPEGDLPGQFTRVMGKVCTQLLVSRPDEENISSYLQLIDKCLIHEAFTETQKKRLL
       : ::. .::.:.:::::::::::::::::::::::.::::::.::: :::::::::::::
CCDS77 APAPVADGDIPSQFTRVMGKVCTQLLVSRPDEENITSYLQLIEKCLTHEAFTETQKKRLL
             470       480       490       500       510       520 

          460       470       480       490       500       510    
pF1KE6 SWKQQVQKLFRSFPRKTLLDISGYRQQRNRGFGQSNSLPTAGSVGGGMGRRNPRQYQIPS
       :::::: ::.:.::::. :....::::.. .:: ::::: ::::: :..::. ::. .: 
CCDS77 SWKQQVLKLLRTFPRKAALEMQNYRQQKGWAFG-SNSLPIAGSVGMGVARRTQRQFPMPP
             530       540       550        560       570       580

          520       530       540       550       560       570    
pF1KE6 RNVPSARLGLLGTSGFVSSNQRNTTATPTIMKQGRQNLWFANPGGSNSMPSRTHSSVQRT
       : .: .:.:::. ::. . . :.. ..:..  :::::::::::::::::::...::::::
CCDS77 RALPPGRMGLLSPSGIGGVSPRHALTSPSLGGQGRQNLWFANPGGSNSMPSQSRSSVQRT
              590       600       610       620       630       640

          580       590       600       610       620         
pF1KE6 RSLPVHTSPQNMLMFQQPEFQLPVTEPDINNRLESLCLSMTEHALGDGVDRTSTI
       .:::::.::: .:::  :.  .:                                
CCDS77 HSLPVHSSPQAILMFP-PDCPVPGPDLEINPTLESLCLSMTEHALGGPSRDLC  
              650        660       670       680       690    

>>CCDS33020.1 SAMD4B gene_id:55095|Hs108|chr19            (694 aa)
 initn: 1942 init1: 850 opt: 853  Z-score: 758.1  bits: 150.6 E(32554): 6.6e-36
Smith-Waterman score: 2227; 55.0% identity (71.4% similar) in 682 aa overlap (1-597:2-662)

                10        20        30        40        50         
pF1KE6  MFRDQVGVLAGWFKGWNECEQTVALLSLLKRVSQTQARFLQLCLEHSLADCAELHVLER
        :::::::.::::::::::::::::::::::::..::::::::::::::::: ..:.:: 
CCDS33 MMFRDQVGILAGWFKGWNECEQTVALLSLLKRVTRTQARFLQLCLEHSLADCNDIHLLES
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE6 EANSPGIINQWQQESKDKVISLLLTHLPLLKPGNLDAKVEYMKLLPKILAHSIEHNQHIE
       :::: .:..:::::::.::.::::.:::::.::: .:: :::.:: :.::.::: :  ::
CCDS33 EANSAAIVSQWQQESKEKVVSLLLSHLPLLQPGNTEAKSEYMRLLQKVLAYSIESNAFIE
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE6 ESRQLLSYALIHPATSLEDRSALAMWLNHLEDRTSTSFGGQNRGRSDSVDYGQTHYYHQR
       :::::::::::::::.::::.:::.::.:::.: ...:    :.: .         ::.:
CCDS33 ESRQLLSYALIHPATTLEDRNALALWLSHLEERLASGF----RSRPEPS-------YHSR
              130       140       150           160                

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE6 QNSDDKLNGWQNSRDSGICINASNWQDKSMGCENGHVPLYSSSSVPTTINTIGTSTST--
       :.::.    : .  . :    . .::::    ::::::.. ::::: .::.::....:  
CCDS33 QGSDE----WGGPAELGPGEAGPGWQDKP-PRENGHVPFHPSSSVPPAINSIGSNANTGL
     170           180       190        200       210       220    

                                                                   
pF1KE6 ------------------------------------------------------------
                                                                   
CCDS33 PCQIHPSPLKRSMSLIPTSPQVPGEWPSPEELGARAAFTTPDHAPLSPQSSVASSGSEQT
          230       240       250       260       270       280    

                         240       250       260       270         
pF1KE6 ------------------NVPAWLKSLRLHKYAALFSQMTYEEMMALTECQLEAQNVTKG
                         .::.:::::::::::::::::.:::::.::: .::.::::::
CCDS33 EEQGSSRNTFQEDGSGMKDVPSWLKSLRLHKYAALFSQMSYEEMMTLTEQHLESQNVTKG
          290       300       310       320       330       340    

     280       290       300       310       320       330         
pF1KE6 ARHKIVISIQKLKERQNLLKSLERDIIEGGSLRIPLQELHQMILTPIKAYSSPSTTPEAR
       :::::..:::::.:::..:::::.:..:::.::  ::::.:.:.:::::::  ..:  : 
CCDS33 ARHKIALSIQKLRERQSVLKSLEKDVLEGGNLRNALQELQQIIITPIKAYSVLQATVAAA
          350       360       370       380       390       400    

     340           350       360       370       380       390     
pF1KE6 RREPQA----PRQPSLMGPESQSPDCKDGAAATGATATPSAGASGGLQPHQLSSCDG-EL
          : :    : .: : : :   :     ..  :. :    .. .   :   .  :: : 
CCDS33 TTTPTAKDGAPGEPPLPGAE---PPLAHPGTDKGTEAKDPPAVENYPPPPAPAPTDGSEP
          410       420          430       440       450       460 

          400       410       420       430       440       450    
pF1KE6 AVAPLPEGDLPGQFTRVMGKVCTQLLVSRPDEENISSYLQLIDKCLIHEAFTETQKKRLL
       : ::. .::.:.:::::::::::::::::::::::.::::::.::: :::::::::::::
CCDS33 APAPVADGDIPSQFTRVMGKVCTQLLVSRPDEENITSYLQLIEKCLTHEAFTETQKKRLL
             470       480       490       500       510       520 

          460       470       480       490       500       510    
pF1KE6 SWKQQVQKLFRSFPRKTLLDISGYRQQRNRGFGQSNSLPTAGSVGGGMGRRNPRQYQIPS
       :::::: ::.:.::::. :....::::.. .:: ::::: ::::: :..::. ::. .: 
CCDS33 SWKQQVLKLLRTFPRKAALEMQNYRQQKGWAFG-SNSLPIAGSVGMGVARRTQRQFPMPP
             530       540       550        560       570       580

          520       530       540       550       560       570    
pF1KE6 RNVPSARLGLLGTSGFVSSNQRNTTATPTIMKQGRQNLWFANPGGSNSMPSRTHSSVQRT
       : .: .:.:::. ::. . . :.. ..:..  :::::::::::::::::::...::::::
CCDS33 RALPPGRMGLLSPSGIGGVSPRHALTSPSLGGQGRQNLWFANPGGSNSMPSQSRSSVQRT
              590       600       610       620       630       640

          580       590       600       610       620         
pF1KE6 RSLPVHTSPQNMLMFQQPEFQLPVTEPDINNRLESLCLSMTEHALGDGVDRTSTI
       .:::::.::: .:::  :.  .:                                
CCDS33 HSLPVHSSPQAILMFP-PDCPVPGPDLEINPTLESLCLSMTEHALGDGTDKTSTI
              650        660       670       680       690    




629 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Tue Nov  8 16:20:34 2016 done: Tue Nov  8 16:20:35 2016
 Total Scan time:  3.970 Total Display time:  0.080

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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