Result of FASTA (ccds) for pFN21AE2110
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2110, 906 aa
  1>>>pF1KE2110     906 - 906 aa - 906 aa
Library: human.CCDS.faa
  18921897 residues in 33420 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.8785+/-0.00104; mu= -7.2094+/- 0.063
 mean_var=406.8637+/-82.615, 0's: 0 Z-trim(115.6): 19  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.063584
 statistics sampled from 16322 (16335) to 16322 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.784), E-opt: 0.2 (0.489), width:  16
 Scan time:  2.480

The best scores are:                                      opt bits E(33420)
CCDS8418.1 CBL gene_id:867|Hs109|chr11             ( 906) 6275 590.4 5.2e-168
CCDS2948.1 CBLB gene_id:868|Hs109|chr3             ( 982) 2585 251.9 4.4e-66
CCDS87116.1 CBLB gene_id:868|Hs109|chr3            (1010) 2585 251.9 4.5e-66
CCDS12643.1 CBLC gene_id:23624|Hs109|chr19         ( 474) 1367 139.9 1.1e-32
CCDS46109.1 CBLC gene_id:23624|Hs109|chr19         ( 428)  672 76.1 1.6e-13


>>CCDS8418.1 CBL gene_id:867|Hs109|chr11                  (906 aa)
 initn: 6275 init1: 6275 opt: 6275  Z-score: 3130.0  bits: 590.4 E(33420): 5.2e-168
Smith-Waterman score: 6275; 100.0% identity (100.0% similar) in 906 aa overlap (1-906:1-906)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MAGNVKKSSGAGGGSGSGGSGSGGLIGLMKDAFQPHHHHHHHLSPHPPGTVDKKMVEKCW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 MAGNVKKSSGAGGGSGSGGSGSGGLIGLMKDAFQPHHHHHHHLSPHPPGTVDKKMVEKCW
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 KLMDKVVRLCQNPKLALKNSPPYILDLLPDTYQHLRTILSRYEGKMETLGENEYFRVFME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 KLMDKVVRLCQNPKLALKNSPPYILDLLPDTYQHLRTILSRYEGKMETLGENEYFRVFME
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 NLMKKTKQTISLFKEGKERMYEENSQPRRNLTKLSLIFSHMLAELKGIFPSGLFQGDTFR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 NLMKKTKQTISLFKEGKERMYEENSQPRRNLTKLSLIFSHMLAELKGIFPSGLFQGDTFR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 ITKADAAEFWRKAFGEKTIVPWKSFRQALHEVHPISSGLEAMALKSTIDLTCNDYISVFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 ITKADAAEFWRKAFGEKTIVPWKSFRQALHEVHPISSGLEAMALKSTIDLTCNDYISVFE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 FDIFTRLFQPWSSLLRNWNSLAVTHPGYMAFLTYDEVKARLQKFIHKPGSYIFRLSCTRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 FDIFTRLFQPWSSLLRNWNSLAVTHPGYMAFLTYDEVKARLQKFIHKPGSYIFRLSCTRL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 GQWAIGYVTADGNILQTIPHNKPLFQALIDGFREGFYLFPDGRNQNPDLTGLCEPTPQDH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 GQWAIGYVTADGNILQTIPHNKPLFQALIDGFREGFYLFPDGRNQNPDLTGLCEPTPQDH
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 IKVTQEQYELYCEMGSTFQLCKICAENDKDVKIEPCGHLMCTSCLTSWQESEGQGCPFCR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 IKVTQEQYELYCEMGSTFQLCKICAENDKDVKIEPCGHLMCTSCLTSWQESEGQGCPFCR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 CEIKGTEPIVVDPFDPRGSGSLLRQGAEGAPSPNYDDDDDERADDTLFMMKELAGAKVER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 CEIKGTEPIVVDPFDPRGSGSLLRQGAEGAPSPNYDDDDDERADDTLFMMKELAGAKVER
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 PPSPFSMAPQASLPPVPPRLDLLPQRVCVPSSASALGTASKAASGSLHKDKPLPVPPTLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 PPSPFSMAPQASLPPVPPRLDLLPQRVCVPSSASALGTASKAASGSLHKDKPLPVPPTLR
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 DLPPPPPPDRPYSVGAESRPQRRPLPCTPGDCPSRDKLPPVPSSRLGDSWLPRPIPKVPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 DLPPPPPPDRPYSVGAESRPQRRPLPCTPGDCPSRDKLPPVPSSRLGDSWLPRPIPKVPV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 SAPSSSDPWTGRELTNRHSLPFSLPSQMEPRPDVPRLGSTFSLDTSMSMNSSPLVGPECD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 SAPSSSDPWTGRELTNRHSLPFSLPSQMEPRPDVPRLGSTFSLDTSMSMNSSPLVGPECD
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 HPKIKPSSSANAIYSLAARPLPVPKLPPGEQCEGEEDTEYMTPSSRPLRPLDTSQSSRAC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 HPKIKPSSSANAIYSLAARPLPVPKLPPGEQCEGEEDTEYMTPSSRPLRPLDTSQSSRAC
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 DCDQQIDSCTYEAMYNIQSQAPSITESSTFGEGNLAAAHANTGPEESENEDDGYDVPKPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 DCDQQIDSCTYEAMYNIQSQAPSITESSTFGEGNLAAAHANTGPEESENEDDGYDVPKPP
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE2 VPAVLARRTLSDISNASSSFGWLSLDGDPTTNVTEGSQVPERPPKPFPRRINSERKAGSC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 VPAVLARRTLSDISNASSSFGWLSLDGDPTTNVTEGSQVPERPPKPFPRRINSERKAGSC
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE2 QQGSGPAASAATASPQLSSEIENLMSQGYSYQDIQKALVIAQNNIEMAKNILREFVSISS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 QQGSGPAASAATASPQLSSEIENLMSQGYSYQDIQKALVIAQNNIEMAKNILREFVSISS
              850       860       870       880       890       900

             
pF1KE2 PAHVAT
       ::::::
CCDS84 PAHVAT
             

>>CCDS2948.1 CBLB gene_id:868|Hs109|chr3                  (982 aa)
 initn: 2823 init1: 2118 opt: 2585  Z-score: 1300.1  bits: 251.9 E(33420): 4.4e-66
Smith-Waterman score: 2765; 53.7% identity (69.0% similar) in 877 aa overlap (13-844:11-846)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MAGNVKKSSGAGGGSGSGGSGSGGLIGLMKDAFQPHHHHHHHLSPHPPGTVDKKMVEKCW
                   :: : :.  .: ..:.. ::.:        ..:   ...:.. ::: :
CCDS29   MANSMNGRNPGGRG-GNPRKGRILGII-DAIQDA------VGPPKQAAADRRTVEKTW
                 10         20         30              40        50

               70        80        90       100         110        
pF1KE2 KLMDKVVRLCQNPKLALKNSPPYILDLLPDTYQHLRTILSRYEG--KMETLGENEYFRVF
       ::::::::::::::: ::::::::::.::::::::: :::.:.   :.  :.:::::...
CCDS29 KLMDKVVRLCQNPKLQLKNSPPYILDILPDTYQHLRLILSKYDDNQKLAQLSENEYFKIY
               60        70        80        90       100       110

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE2 MENLMKKTKQTISLFKEGKERMYEENSQPRRNLTKLSLIFSHMLAELKGIFPSGLFQGDT
       ...::::.:..: ::::::::::::.:: :::::::::::::::::.:.:::.: ::::.
CCDS29 IDSLMKKSKRAIRLFKEGKERMYEEQSQDRRNLTKLSLIFSHMLAEIKAIFPNGQFQGDN
              120       130       140       150       160       170

      180       190       200       210       220       230        
pF1KE2 FRITKADAAEFWRKAFGEKTIVPWKSFRQALHEVHPISSGLEAMALKSTIDLTCNDYISV
       :::::::::::::: ::.::::::: ::: ::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS29 FRITKADAAEFWRKFFGDKTIVPWKVFRQCLHEVHQISSGLEAMALKSTIDLTCNDYISV
              180       190       200       210       220       230

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE2 FEFDIFTRLFQPWSSLLRNWNSLAVTHPGYMAFLTYDEVKARLQKFIHKPGSYIFRLSCT
       :::::::::::::.:.::::: :::::::::::::::::::::::.  ::::::::::::
CCDS29 FEFDIFTRLFQPWGSILRNWNFLAVTHPGYMAFLTYDEVKARLQKYSTKPGSYIFRLSCT
              240       250       260       270       280       290

      300       310       320       330       340       350        
pF1KE2 RLGQWAIGYVTADGNILQTIPHNKPLFQALIDGFREGFYLFPDGRNQNPDLTGLCEPTPQ
       :::::::::::.::::::::::::::::::::: ::::::.::::. ::::::::::::.
CCDS29 RLGQWAIGYVTGDGNILQTIPHNKPLFQALIDGSREGFYLYPDGRSYNPDLTGLCEPTPH
              300       310       320       330       340       350

      360       370       380       390       400       410        
pF1KE2 DHIKVTQEQYELYCEMGSTFQLCKICAENDKDVKIEPCGHLMCTSCLTSWQESEGQGCPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::::::
CCDS29 DHIKVTQEQYELYCEMGSTFQLCKICAENDKDVKIEPCGHLMCTSCLTAWQESDGQGCPF
              360       370       380       390       400       410

      420       430       440       450       460       470        
pF1KE2 CRCEIKGTEPIVVDPFDPRGSGSLLRQGAEGAPSPNYDDDDDERADDTLFMMKELAG---
       :::::::::::.:::::::  ::   .  .    :  : :::.  ...: ::..::.   
CCDS29 CRCEIKGTEPIIVDPFDPRDEGSRCCSIIDPFGMPMLDLDDDDDREESL-MMNRLANVRK
              420       430       440       450        460         

                          480        490       500       510       
pF1KE2 -----------------AKVERP-PSPFSMAPQASLPPVPPRLDLLPQRVCVPSSASALG
                        :. ..: :.:... :. :::::::::::. . .     .:  :
CCDS29 CTDRQNSPVTSPGSSPLAQRRKPQPDPLQI-PHLSLPPVPPRLDLIQKGIVRSPCGSPTG
     470       480       490        500       510       520        

       520       530        540       550       560       570      
pF1KE2 TASKAASGSLHKDKPLPVPPT-LRDLPPPPPPDRPYSVGAESRPQRRPLPCTPGDCPSRD
       . ...     ..:::::.::  ::: ::::::.::  .  ..: .:.       . ::::
CCDS29 SPKSSPCMVRKQDKPLPAPPPPLRD-PPPPPPERPPPIPPDNRLSRHIHHVE--SVPSRD
      530       540       550        560       570         580     

        580       590           600       610           620        
pF1KE2 KLPPVPSSRLGDSWLPRPI----PKVPVSAPSSSDPWTG----RELTNRHSLPFSLPSQM
         ::.:     ..: :: .      :     . ..:  :     ....:::   : :  :
CCDS29 --PPMPL----EAWCPRDVFGTNQLVGCRLLGEGSPKPGITASSNVNGRHSRVGSDPVLM
           590           600       610       620       630         

      630          640         650       660       670       680   
pF1KE2 EP--RPDVPRLGS-TFSLDT--SMSMNSSPLVGPECDHPKIKPSSSANAIYSLAARPLPV
       .   : :.:  :. .::     :  ..  : ..:      . :: . ..     :  :  
CCDS29 RKHRRHDLPLEGAKVFSNGHLGSEEYDVPPRLSPPPPVTTLLPSIKCTGPL---ANSLSE
     640       650       660       670       680       690         

           690       700       710       720       730        740  
pF1KE2 PKLPPGEQCEGEEDTEYMTPSSRPLRPLDTSQSSRACDCDQQIDSCTY-EAMYNIQSQAP
           : :    :.: ::  :::.:.  :. :: :.  .    . ::   . : :  ...:
CCDS29 KTRDPVE----EDDDEYKIPSSHPVS-LN-SQPSHCHNVKPPVRSCDNGHCMLN-GTHGP
        700           710        720        730       740          

            750       760       770       780       790       800  
pF1KE2 SITESSTFGEGNLAAAHANTGPEESENEDDGYDVPKPPVPAVLARRTLSDISNASSSFGW
       :  ..:.. . ..              . : .:  . :::   ::    :  . .::.. 
CCDS29 SSEKKSNIPDLSIYL------------KGDVFDSASDPVPLPPARPPTRDNPKHGSSLNR
     750       760                   770       780       790       

                810       820       830          840       850     
pF1KE2 LSLDGD----PTTNVTEGSQVPERPPKPFPRR---INSERKAGSCQQGSGPAASAATASP
          : :    :  . .  .  :  :: : : :   :.  .  :: .. :           
CCDS29 TPSDYDLLIPPLGEDAFDALPPSLPPPPPPARHSLIEHSKPPGSSSRPSSGQDLFLLPSD
       800       810       820       830       840       850       

         860       870       880       890       900               
pF1KE2 QLSSEIENLMSQGYSYQDIQKALVIAQNNIEMAKNILREFVSISSPAHVAT         
                                                                   
CCDS29 PFVDLASGQVPLPPARRLPGENVKTNRTSQDYDQLPSCSDGSQAPARPPKPRPRRTAPEI
       860       870       880       890       900       910       

>>CCDS87116.1 CBLB gene_id:868|Hs109|chr3                 (1010 aa)
 initn: 2823 init1: 2118 opt: 2585  Z-score: 1300.0  bits: 251.9 E(33420): 4.5e-66
Smith-Waterman score: 2765; 53.7% identity (69.0% similar) in 877 aa overlap (13-844:39-874)

                                 10        20        30        40  
pF1KE2                   MAGNVKKSSGAGGGSGSGGSGSGGLIGLMKDAFQPHHHHHHH
                                     :: : :.  .: ..:.. ::.:        
CCDS87 IWFLGITTHRVDLKKELKFQMANSMNGRNPGGRG-GNPRKGRILGII-DAIQDA------
       10        20        30        40         50         60      

             50        60        70        80        90       100  
pF1KE2 LSPHPPGTVDKKMVEKCWKLMDKVVRLCQNPKLALKNSPPYILDLLPDTYQHLRTILSRY
       ..:   ...:.. ::: :::::::::::::::: ::::::::::.::::::::: :::.:
CCDS87 VGPPKQAAADRRTVEKTWKLMDKVVRLCQNPKLQLKNSPPYILDILPDTYQHLRLILSKY
               70        80        90       100       110       120

              110       120       130       140       150       160
pF1KE2 EG--KMETLGENEYFRVFMENLMKKTKQTISLFKEGKERMYEENSQPRRNLTKLSLIFSH
       .   :.  :.:::::......::::.:..: ::::::::::::.:: :::::::::::::
CCDS87 DDNQKLAQLSENEYFKIYIDSLMKKSKRAIRLFKEGKERMYEEQSQDRRNLTKLSLIFSH
              130       140       150       160       170       180

              170       180       190       200       210       220
pF1KE2 MLAELKGIFPSGLFQGDTFRITKADAAEFWRKAFGEKTIVPWKSFRQALHEVHPISSGLE
       ::::.:.:::.: ::::.:::::::::::::: ::.::::::: ::: ::::: ::::::
CCDS87 MLAEIKAIFPNGQFQGDNFRITKADAAEFWRKFFGDKTIVPWKVFRQCLHEVHQISSGLE
              190       200       210       220       230       240

              230       240       250       260       270       280
pF1KE2 AMALKSTIDLTCNDYISVFEFDIFTRLFQPWSSLLRNWNSLAVTHPGYMAFLTYDEVKAR
       :::::::::::::::::::::::::::::::.:.::::: ::::::::::::::::::::
CCDS87 AMALKSTIDLTCNDYISVFEFDIFTRLFQPWGSILRNWNFLAVTHPGYMAFLTYDEVKAR
              250       260       270       280       290       300

              290       300       310       320       330       340
pF1KE2 LQKFIHKPGSYIFRLSCTRLGQWAIGYVTADGNILQTIPHNKPLFQALIDGFREGFYLFP
       :::.  :::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::: ::::::.:
CCDS87 LQKYSTKPGSYIFRLSCTRLGQWAIGYVTGDGNILQTIPHNKPLFQALIDGSREGFYLYP
              310       320       330       340       350       360

              350       360       370       380       390       400
pF1KE2 DGRNQNPDLTGLCEPTPQDHIKVTQEQYELYCEMGSTFQLCKICAENDKDVKIEPCGHLM
       :::. ::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 DGRSYNPDLTGLCEPTPHDHIKVTQEQYELYCEMGSTFQLCKICAENDKDVKIEPCGHLM
              370       380       390       400       410       420

              410       420       430       440       450       460
pF1KE2 CTSCLTSWQESEGQGCPFCRCEIKGTEPIVVDPFDPRGSGSLLRQGAEGAPSPNYDDDDD
       ::::::.::::.:::::::::::::::::.:::::::  ::   .  .    :  : :::
CCDS87 CTSCLTAWQESDGQGCPFCRCEIKGTEPIIVDPFDPRDEGSRCCSIIDPFGMPMLDLDDD
              430       440       450       460       470       480

              470                           480        490         
pF1KE2 ERADDTLFMMKELAG--------------------AKVERP-PSPFSMAPQASLPPVPPR
       .  ...: ::..::.                    :. ..: :.:... :. ::::::::
CCDS87 DDREESL-MMNRLANVRKCTDRQNSPVTSPGSSPLAQRRKPQPDPLQI-PHLSLPPVPPR
               490       500       510       520        530        

     500       510       520       530        540       550        
pF1KE2 LDLLPQRVCVPSSASALGTASKAASGSLHKDKPLPVPPT-LRDLPPPPPPDRPYSVGAES
       :::. . .     .:  :. ...     ..:::::.::  ::: ::::::.::  .  ..
CCDS87 LDLIQKGIVRSPCGSPTGSPKSSPCMVRKQDKPLPAPPPPLRD-PPPPPPERPPPIPPDN
      540       550       560       570       580        590       

      560       570       580       590           600       610    
pF1KE2 RPQRRPLPCTPGDCPSRDKLPPVPSSRLGDSWLPRPI----PKVPVSAPSSSDPWTG---
       : .:.       . ::::  ::.:     ..: :: .      :     . ..:  :   
CCDS87 RLSRHIHHVE--SVPSRD--PPMPL----EAWCPRDVFGTNQLVGCRLLGEGSPKPGITA
       600         610             620       630       640         

              620       630          640         650       660     
pF1KE2 -RELTNRHSLPFSLPSQMEP--RPDVPRLGS-TFSLDT--SMSMNSSPLVGPECDHPKIK
         ....:::   : :  :.   : :.:  :. .::     :  ..  : ..:      . 
CCDS87 SSNVNGRHSRVGSDPVLMRKHRRHDLPLEGAKVFSNGHLGSEEYDVPPRLSPPPPVTTLL
     650       660       670       680       690       700         

         670       680       690       700       710       720     
pF1KE2 PSSSANAIYSLAARPLPVPKLPPGEQCEGEEDTEYMTPSSRPLRPLDTSQSSRACDCDQQ
       :: . ..     :  :      : :    :.: ::  :::.:.  :. :: :.  .    
CCDS87 PSIKCTGPL---ANSLSEKTRDPVE----EDDDEYKIPSSHPVS-LN-SQPSHCHNVKPP
     710          720       730           740         750       760

         730        740       750       760       770       780    
pF1KE2 IDSCTY-EAMYNIQSQAPSITESSTFGEGNLAAAHANTGPEESENEDDGYDVPKPPVPAV
       . ::   . : :  ...::  ..:.. . ..              . : .:  . :::  
CCDS87 VRSCDNGHCMLN-GTHGPSSEKKSNIPDLSIYL------------KGDVFDSASDPVPLP
              770        780       790                   800       

          790       800           810       820       830          
pF1KE2 LARRTLSDISNASSSFGWLSLDGD----PTTNVTEGSQVPERPPKPFPRR---INSERKA
        ::    :  . .::..    : :    :  . .  .  :  :: : : :   :.  .  
CCDS87 PARPPTRDNPKHGSSLNRTPSDYDLLIPPLGEDAFDALPPSLPPPPPPARHSLIEHSKPP
       810       820       830       840       850       860       

       840       850       860       870       880       890       
pF1KE2 GSCQQGSGPAASAATASPQLSSEIENLMSQGYSYQDIQKALVIAQNNIEMAKNILREFVS
       :: .. :                                                     
CCDS87 GSSSRPSSGQDLFLLPSDPFVDLASGQVPLPPARRLPGENVKTNRTSQDYDQLPSCSDGS
       870       880       890       900       910       920       

>>CCDS12643.1 CBLC gene_id:23624|Hs109|chr19              (474 aa)
 initn: 1442 init1: 1307 opt: 1367  Z-score: 700.6  bits: 139.9 E(33420): 1.1e-32
Smith-Waterman score: 1449; 46.6% identity (71.3% similar) in 474 aa overlap (61-522:23-472)

               40        50        60        70        80        90
pF1KE2 DAFQPHHHHHHHLSPHPPGTVDKKMVEKCWKLMDKVVRLCQNPKLALKNSPPYILDLLPD
                                     ...... . : .:.:..  ::: . :::: 
CCDS12         MALAVAPWGRQWEEARALGRAVRMLQRLEEQCVDPRLSV--SPPSLRDLLPR
                       10        20        30          40        50

               100           110       120       130            140
pF1KE2 TYQHLRTIL-SRYE----GKMETLGENEYFRVFMENLMKKTKQTISLF-----KEGKERM
       : : :: .  ::      :     : .... ... ::  :..:. .:.     . .....
CCDS12 TAQLLREVAHSRRAAGGGGPGGPGGSGDFLLIYLANLEAKSRQVAALLPPRGRRSANDEL
               60        70        80        90       100       110

              150       160       170       180       190       200
pF1KE2 YEENSQPRRNLTKLSLIFSHMLAELKGIFPSGLFQGDTFRITKADAAEFWRKAFGEKTIV
       .. .:. ::.:.::..::::: :::...::.: . :  ...::: :  :::.. : . ..
CCDS12 FRAGSRLRRQLAKLAIIFSHMHAELHALFPGGKYCGHMYQLTKAPAHTFWRESCGARCVL
              120       130       140       150       160       170

              210       220       230       240       250       260
pF1KE2 PWKSFRQALHEVHPISSGLEAMALKSTIDLTCNDYISVFEFDIFTRLFQPWSSLLRNWNS
       ::  :.. :   ::.  :  :.::..::::::. ..:.::::.:::::::: .::.::. 
CCDS12 PWAEFESLLGTCHPVEPGCTALALRTTIDLTCSGHVSIFEFDVFTRLFQPWPTLLKNWQL
              180       190       200       210       220       230

              270       280       290       300       310       320
pF1KE2 LAVTHPGYMAFLTYDEVKARLQKFIHKPGSYIFRLSCTRLGQWAIGYVTADGNILQTIPH
       :::.:::::::::::::. :::    :::::::: :::::::::::::..::.:::::: 
CCDS12 LAVNHPGYMAFLTYDEVQERLQACRDKPGSYIFRPSCTRLGQWAIGYVSSDGSILQTIPA
              240       250       260       270       280       290

              330       340       350       360       370       380
pF1KE2 NKPLFQALIDGFREGFYLFPDGRNQNPDLTGLCEPTPQDHIKVTQEQYELYCEMGSTFQL
       :::: :.:..: ..::::.:::...::::: : .  ::..:.:..:: .::  : :::.:
CCDS12 NKPLSQVLLEGQKDGFYLYPDGKTHNPDLTELGQAEPQQRIHVSEEQLQLYWAMDSTFEL
              300       310       320       330       340       350

              390       400       410       420       430       440
pF1KE2 CKICAENDKDVKIEPCGHLMCTSCLTSWQESEGQGCPFCRCEIKGTEPIVVDPFDPRGSG
       ::::::..:::::::::::.:. ::..::.:..: :::::::::: : . .  :      
CCDS12 CKICAESNKDVKIEPCGHLLCSCCLAAWQHSDSQTCPFCRCEIKGWEAVSIYQF------
              360       370       380       390       400          

              450       460       470       480       490       500
pF1KE2 SLLRQGAEGAPSPNYDDDDDERADDTLFMMKELAGAKVERPPSPFSMAPQASLPPVPPRL
           .:   : . . ..:.. :         ::. . .  :: :    :. .:::  :: 
CCDS12 ----HGQATAEDSGNSSDQEGRE-------LELGQVPLSAPPLP----PRPDLPPRKPR-
              410       420              430           440         

               510        520       530       540       550        
pF1KE2 DLLPQ-RVCVPSSA-SALGTASKAASGSLHKDKPLPVPPTLRDLPPPPPPDRPYSVGAES
       .  :. :.   .:  .:::  . :                                    
CCDS12 NAQPKVRLLKGNSPPAALGPQDPAPA                                  
      450       460       470                                      

>>CCDS46109.1 CBLC gene_id:23624|Hs109|chr19              (428 aa)
 initn: 1201 init1: 612 opt: 672  Z-score: 356.6  bits: 76.1 E(33420): 1.6e-13
Smith-Waterman score: 1106; 39.5% identity (62.4% similar) in 474 aa overlap (61-522:23-426)

               40        50        60        70        80        90
pF1KE2 DAFQPHHHHHHHLSPHPPGTVDKKMVEKCWKLMDKVVRLCQNPKLALKNSPPYILDLLPD
                                     ...... . : .:.:..  ::: . :::: 
CCDS46         MALAVAPWGRQWEEARALGRAVRMLQRLEEQCVDPRLSV--SPPSLRDLLPR
                       10        20        30          40        50

               100           110       120       130            140
pF1KE2 TYQHLRTIL-SRYE----GKMETLGENEYFRVFMENLMKKTKQTISLF-----KEGKERM
       : : :: .  ::      :     : .... ... ::  :..:. .:.     . .....
CCDS46 TAQLLREVAHSRRAAGGGGPGGPGGSGDFLLIYLANLEAKSRQVAALLPPRGRRSANDEL
               60        70        80        90       100       110

              150       160       170       180       190       200
pF1KE2 YEENSQPRRNLTKLSLIFSHMLAELKGIFPSGLFQGDTFRITKADAAEFWRKAFGEKTIV
       .. .:. ::.:.::..::::: :::...::.: . :  ...::: :  :::.. : . ..
CCDS46 FRAGSRLRRQLAKLAIIFSHMHAELHALFPGGKYCGHMYQLTKAPAHTFWRESCGARCVL
              120       130       140       150       160       170

              210       220       230       240       250       260
pF1KE2 PWKSFRQALHEVHPISSGLEAMALKSTIDLTCNDYISVFEFDIFTRLFQPWSSLLRNWNS
       ::  :.. :   ::.  :  :.::..::::::. ..:.::::.:::::::: .::.::. 
CCDS46 PWAEFESLLGTCHPVEPGCTALALRTTIDLTCSGHVSIFEFDVFTRLFQPWPTLLKNWQL
              180       190       200       210       220       230

              270       280       290       300       310       320
pF1KE2 LAVTHPGYMAFLTYDEVKARLQKFIHKPGSYIFRLSCTRLGQWAIGYVTADGNILQTIPH
       :::.:::::::::::::. :::    :::::                             
CCDS46 LAVNHPGYMAFLTYDEVQERLQACRDKPGSY-----------------------------
              240       250       260                              

              330       340       350       360       370       380
pF1KE2 NKPLFQALIDGFREGFYLFPDGRNQNPDLTGLCEPTPQDHIKVTQEQYELYCEMGSTFQL
                        :.:::...::::: : .  ::..:.:..:: .::  : :::.:
CCDS46 -----------------LYPDGKTHNPDLTELGQAEPQQRIHVSEEQLQLYWAMDSTFEL
                              270       280       290       300    

              390       400       410       420       430       440
pF1KE2 CKICAENDKDVKIEPCGHLMCTSCLTSWQESEGQGCPFCRCEIKGTEPIVVDPFDPRGSG
       ::::::..:::::::::::.:. ::..::.:..: :::::::::: : . .  :      
CCDS46 CKICAESNKDVKIEPCGHLLCSCCLAAWQHSDSQTCPFCRCEIKGWEAVSIYQF------
          310       320       330       340       350              

              450       460       470       480       490       500
pF1KE2 SLLRQGAEGAPSPNYDDDDDERADDTLFMMKELAGAKVERPPSPFSMAPQASLPPVPPRL
           .:   : . . ..:.. :         ::. . .  :: :    :. .:::  :: 
CCDS46 ----HGQATAEDSGNSSDQEGRE-------LELGQVPLSAPPLP----PRPDLPPRKPR-
          360       370              380       390           400   

               510        520       530       540       550        
pF1KE2 DLLPQ-RVCVPSSA-SALGTASKAASGSLHKDKPLPVPPTLRDLPPPPPPDRPYSVGAES
       .  :. :.   .:  .:::  . :                                    
CCDS46 NAQPKVRLLKGNSPPAALGPQDPAPA                                  
            410       420                                          




906 residues in 1 query   sequences
18921897 residues in 33420 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Oct 24 21:34:44 2019 done: Thu Oct 24 21:34:45 2019
 Total Scan time:  2.480 Total Display time:  0.090

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com