FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5767, 812 aa 1>>>pF1KB5767 812 - 812 aa - 812 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5595+/-0.000509; mu= 3.0298+/- 0.032 mean_var=522.5147+/-116.753, 0's: 0 Z-trim(119.5): 1683 B-trim: 832 in 1/57 Lambda= 0.056108 statistics sampled from 31361 (33615) to 31361 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.722), E-opt: 0.2 (0.394), width: 16 Scan time: 13.530 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001294919 (OMIM: 603166) mitogen-activated prot ( 812) 5529 463.6 1.5e-129 NP_004570 (OMIM: 603166) mitogen-activated protein ( 820) 5503 461.5 6.6e-129 XP_011543505 (OMIM: 603166) PREDICTED: mitogen-act ( 797) 4694 396.0 3.4e-109 XP_016873583 (OMIM: 603166) PREDICTED: mitogen-act ( 643) 4322 365.8 3.5e-100 XP_016873582 (OMIM: 603166) PREDICTED: mitogen-act ( 768) 4048 343.7 1.8e-93 XP_011543506 (OMIM: 603166) PREDICTED: mitogen-act ( 776) 4022 341.6 7.8e-93 XP_016873585 (OMIM: 603166) PREDICTED: mitogen-act ( 584) 3917 332.9 2.4e-90 XP_016873584 (OMIM: 603166) PREDICTED: mitogen-act ( 620) 3513 300.3 1.8e-80 NP_001257354 (OMIM: 604921) mitogen-activated prot ( 873) 1688 152.8 6.2e-36 NP_003609 (OMIM: 604921) mitogen-activated protein ( 894) 1631 148.2 1.5e-34 XP_011534679 (OMIM: 604923) PREDICTED: mitogen-act ( 845) 1561 142.5 7.6e-33 NP_942089 (OMIM: 604923) mitogen-activated protein ( 846) 1561 142.5 7.6e-33 NP_006566 (OMIM: 604923) mitogen-activated protein ( 846) 1561 142.5 7.6e-33 XP_006720076 (OMIM: 604923) PREDICTED: mitogen-act ( 846) 1561 142.5 7.6e-33 XP_011524706 (OMIM: 601983) PREDICTED: mitogen-act ( 861) 1389 128.6 1.2e-28 XP_011524705 (OMIM: 601983) PREDICTED: mitogen-act ( 873) 1389 128.6 1.2e-28 XP_011534682 (OMIM: 604923) PREDICTED: mitogen-act ( 557) 1379 127.5 1.7e-28 XP_011534681 (OMIM: 604923) PREDICTED: mitogen-act ( 710) 1379 127.6 1.9e-28 NP_001036065 (OMIM: 601983) mitogen-activated prot ( 821) 1333 124.0 2.7e-27 NP_009112 (OMIM: 601983) mitogen-activated protein ( 833) 1333 124.0 2.7e-27 XP_011534680 (OMIM: 604923) PREDICTED: mitogen-act ( 779) 1313 122.3 8.1e-27 XP_016881720 (OMIM: 601983) PREDICTED: mitogen-act ( 860) 1271 119.0 9e-26 XP_011508795 (OMIM: 602255) PREDICTED: serine/thre ( 376) 912 89.4 3.2e-17 XP_011508798 (OMIM: 602255) PREDICTED: serine/thre ( 334) 910 89.1 3.4e-17 NP_006365 (OMIM: 602255) serine/threonine-protein ( 426) 912 89.5 3.4e-17 NP_001258907 (OMIM: 602255) serine/threonine-prote ( 426) 912 89.5 3.4e-17 NP_001258906 (OMIM: 602255) serine/threonine-prote ( 426) 912 89.5 3.4e-17 XP_016858658 (OMIM: 602255) PREDICTED: serine/thre ( 365) 910 89.2 3.5e-17 XP_016858657 (OMIM: 602255) PREDICTED: serine/thre ( 365) 910 89.2 3.5e-17 XP_016876284 (OMIM: 604984) PREDICTED: serine/thre ( 474) 870 86.1 3.8e-16 NP_057626 (OMIM: 300547) serine/threonine-protein ( 416) 868 85.9 4e-16 NP_001027467 (OMIM: 604984) serine/threonine-prote ( 431) 868 85.9 4.1e-16 NP_003567 (OMIM: 604984) serine/threonine-protein ( 443) 868 85.9 4.2e-16 XP_016876283 (OMIM: 604984) PREDICTED: serine/thre ( 517) 868 86.0 4.5e-16 XP_016883522 (OMIM: 604965,614868) PREDICTED: seri ( 388) 854 84.7 8.5e-16 XP_011527322 (OMIM: 604965,614868) PREDICTED: seri ( 404) 854 84.7 8.7e-16 XP_005260590 (OMIM: 604965,614868) PREDICTED: seri ( 462) 854 84.8 9.3e-16 XP_005260588 (OMIM: 604965,614868) PREDICTED: seri ( 478) 854 84.9 9.5e-16 NP_006273 (OMIM: 604965,614868) serine/threonine-p ( 487) 854 84.9 9.6e-16 XP_005260587 (OMIM: 604965,614868) PREDICTED: seri ( 503) 854 84.9 9.7e-16 XP_016869247 (OMIM: 605030) PREDICTED: serine/thre ( 456) 837 83.4 2.4e-15 NP_006272 (OMIM: 605030) serine/threonine-protein ( 491) 837 83.5 2.5e-15 NP_001243241 (OMIM: 605030) serine/threonine-prote ( 519) 837 83.5 2.6e-15 XP_011515553 (OMIM: 605030) PREDICTED: serine/thre ( 522) 837 83.5 2.6e-15 XP_016869246 (OMIM: 605030) PREDICTED: serine/thre ( 524) 837 83.5 2.6e-15 XP_011515550 (OMIM: 605030) PREDICTED: serine/thre ( 576) 837 83.6 2.7e-15 XP_016869245 (OMIM: 605030) PREDICTED: serine/thre ( 580) 837 83.6 2.7e-15 NP_001155038 (OMIM: 610005,617028) TRAF2 and NCK-i (1268) 832 83.7 5.5e-15 NP_001155037 (OMIM: 610005,617028) TRAF2 and NCK-i (1276) 832 83.7 5.5e-15 NP_001155036 (OMIM: 610005,617028) TRAF2 and NCK-i (1297) 832 83.7 5.6e-15 >>NP_001294919 (OMIM: 603166) mitogen-activated protein (812 aa) initn: 5529 init1: 5529 opt: 5529 Z-score: 2446.7 bits: 463.6 E(85289): 1.5e-129 Smith-Waterman score: 5529; 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95.2% identity (95.2% similar) in 643 aa overlap (178-812:1-620) 150 160 170 180 190 200 pF1KB5 GDVKLADFGVSGELTASVAKRRSFIGTPYWMAPEVAAVERKGGYNELCDVWALGITAIEL :::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 MAPEVAAVERKGGYNELCDVWALGITAIEL 10 20 30 210 220 230 240 250 260 pF1KB5 GELQPPLFHLHPMRALMLMSKSSFQPPKLRDKTRWTQNFHHFLKLALTKNPKKRPTAEKL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 GELQPPLFHLHPMRALMLMSKSSFQPPKLRDKTRWTQNFHHFLKLALTKNPKKRPTAEKL 40 50 60 70 80 90 270 280 290 300 310 320 pF1KB5 LQHPFTTQQLPRALLTQLLDKASDPHLGTPSPEDCELETYDMFPDTIHSRGQHGPAERTP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 LQHPFTTQQLPRALLTQLLDKASDPHLGTPSPEDCELETYDMFPDTIHSRGQHGPAERTP 100 110 120 130 140 150 330 340 350 360 370 380 pF1KB5 SEIQFHQVKFGAPRRKETDPLNEPWEEEWTLLGKEELSGSLLQSVQEALEERSLTIRSAS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 SEIQFHQVKFGAPRRKETDPLNEPWEEEWTLLGKEELSGSLLQSVQEALEERSLTIRSAS 160 170 180 190 200 210 390 400 410 420 430 pF1KB5 EFQELDSPDDTMGTIKRAPFLGPLPTDPPAEEPLSSPPG--------PNSSPLLPTAWAT ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::: XP_016 EFQELDSPDDTMGTIKRAPFLGPLPTDPPAEEPLSSPPGTLPPPPSGPNSSPLLPTAWAT 220 230 240 250 260 270 440 450 460 470 480 490 pF1KB5 MKQREDPERSSCHGLPPTPKVHMGACFSKVFNGCPLRIHAAVTWIHPVTRDQFLVVGAEE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 MKQREDPERSSCHGLPPTPKVHMGACFSKVFNGCPLRIHAAVTWIHPVTRDQFLVVGAEE 280 290 300 310 320 330 500 510 520 530 540 550 pF1KB5 GIYTLNLHELHEDTLEKLISHRCSWLYCVNNVLLSLSGKSTHIWAHDLPGLFEQRRLQQQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 GIYTLNLHELHEDTLEKLISHRCSWLYCVNNVLLSLSGKSTHIWAHDLPGLFEQRRLQQQ 340 350 360 370 380 390 560 570 580 590 600 610 pF1KB5 VPLSIPTNRLTQRIIPRRFALSTKIPDTKGCLQCRVVRNPYTGATFLLAALPTSLLLLQW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 VPLSIPTNRLTQRIIPRRFALSTKIPDTKGCLQCRVVRNPYTGATFLLAALPTSLLLLQW 400 410 420 430 440 450 620 630 640 650 660 670 pF1KB5 YEPLQKFLLLKNFSSPLPSPAGMLEPLVLDGKELPQVCVGAEGPEGPGCRVLFHVLPLEA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 YEPLQKFLLLKNFSSPLPSPAGMLEPLVLDGKELPQVCVGAEGPEGPGCRVLFHVLPLEA 460 470 480 490 500 510 680 690 700 710 720 730 pF1KB5 GLTPDILIPPEGIPGSAQQVIQVDRDTILVSFERCVRIVNMQGEPTATLAPELTFDFPIE ::::::::: :: :::::::::::::::::::::::::: XP_016 GLTPDILIP----PG-------------------CVRIVNMQGEPTATLAPELTFDFPIE 520 530 540 740 750 760 770 780 790 pF1KB5 TVVCLQDSVLAFWSHGMQGRSLDTNEVTQEITDETRIFRVLGAHRDIILESIPTDNPEAH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 TVVCLQDSVLAFWSHGMQGRSLDTNEVTQEITDETRIFRVLGAHRDIILESIPTDNPEAH 550 560 570 580 590 600 800 810 pF1KB5 SNLYILTGHQSTY ::::::::::::: XP_016 SNLYILTGHQSTY 610 620 >>NP_001257354 (OMIM: 604921) mitogen-activated protein (873 aa) initn: 2997 init1: 1515 opt: 1688 Z-score: 766.1 bits: 152.8 E(85289): 6.2e-36 Smith-Waterman score: 2902; 53.4% identity (74.9% similar) in 843 aa overlap (6-782:6-843) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MALLRDVSLQDPRDRFELLQRVGAGTYGDVYKARDTVTSELAAVKIVKLDPGDDISSLQQ :.: ..:.. :::.::.:.::::::::::.. :.::::.:..::.::.:.. .:: NP_001 MNPGFDLSRRNPQEDFELIQRIGSGTYGDVYKARNVNTGELAAIKVIKLEPGEDFAVVQQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 EITILRECRHPNVVAYIGSYLRNDRLWICMEFCGGGSLQEIYHATGPLEERQIAYVCREA :: ....:.:::.:::.::::: :.::::::::::::::.:::.:::: : ::::: ::. NP_001 EIIMMKDCKHPNIVAYFGSYLRRDKLWICMEFCGGGSLQDIYHVTGPLSELQIAYVSRET 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB5 LKGLHHLHSQGKIHRDIKGANLLLTLQGDVKLADFGVSGELTASVAKRRSFIGTPYWMAP :.::..:::.::.::::::::.::: .: :::::::::...::..:::.::::::::::: NP_001 LQGLYYLHSKGKMHRDIKGANILLTDNGHVKLADFGVSAQITATIAKRKSFIGTPYWMAP 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB5 EVAAVERKGGYNELCDVWALGITAIELGELQPPLFHLHPMRALMLMSKSSFQPPKLRDKT ::::::::::::.:::.::.:::::::.:::::.: :::::::.::.::.::::::.:: NP_001 EVAAVERKGGYNQLCDLWAVGITAIELAELQPPMFDLHPMRALFLMTKSNFQPPKLKDKM 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 RWTQNFHHFLKLALTKNPKKRPTAEKLLQHPFTTQQLPRALLTQLLDKASDP-HLGTPSP .:...::::.:.::::::::::::::::::::.::.: :.: .::::...: : . NP_001 KWSNSFHHFVKMALTKNPKKRPTAEKLLQHPFVTQHLTRSLAIELLDKVNNPDHSTYHDF 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 EDCELETYDMFPDTIHSRGQHGPAERTPSEIQFHQVKFGAPRRKETDPLNE---PWEEEW .: . : : ::: ... :.: ::: : :::: : ::::.: .: : NP_001 DDDDPEPLVAVPHRIHSTSRNVREEKTRSEITFGQVKFDPPLRKETEPHHELDLQLEYGQ 310 320 330 340 350 360 360 370 380 pF1KB5 TLLGKEELSG--SLLQSVQEALEERS---------------------------LTIRSAS : :.. :::.::.: :..:. : . : NP_001 GHQGGYFLGANKSLLKSVEEELHQRGHVAHLEDDEGDDDESKHSTLKAKIPPPLPPKPKS 370 380 390 400 410 420 390 400 410 420 430 pF1KB5 EF--QELDSPDD-TMGTIKRAPFLGPLPTDPPAEEPLSSPPGPNSSPLLPTAWA------ : ::. : .: ..::::: :. : :. : : :: : : :.: . NP_001 IFIPQEMHSTEDENQGTIKRCPMSGS-PAKPSQVPP--RPPPPRLPPHKPVALGNGMSSF 430 440 450 460 470 440 450 460 470 pF1KB5 ----------------------TMKQREDPERSSCHGLPPTPKVHMGACFSKVFNGCPLR . :...: . .:::::::::::::::::::::::. NP_001 QLNGERDGSLCQQQNEHRGTNLSRKEKKDVPKPISNGLPPTPKVHMGACFSKVFNGCPLK 480 490 500 510 520 530 480 490 500 510 520 530 pF1KB5 IHAAVTWIHPVTRDQFLVVGAEEGIYTLNLHELHEDTLEKLISHRCSWLYCVNNVLLSLS :: : .::.: ::::.:. :::::::::::.:::: ..:.:. .::.::: .:: :::.: NP_001 IHCASSWINPDTRDQYLIFGAEEGIYTLNLNELHETSMEQLFPRRCTWLYVMNNCLLSIS 540 550 560 570 580 590 540 550 560 570 580 590 pF1KB5 GKSTHIWAHDLPGLFEQRRLQQQVPLSIPTNRLTQRIIPRRFALSTKIPDTKGCLQCRVV ::......:.:::::. : .:..:..::...: .::.::.:..:.:::.:: : .: :: NP_001 GKASQLYSHNLPGLFDYARQMQKLPVAIPAHKLPDRILPRKFSVSAKIPETKWCQKCCVV 600 610 620 630 640 650 600 610 620 630 640 650 pF1KB5 RNPYTGATFLLAALPTSLLLLQWYEPLQKFLLLKNFSSPLPSPAGMLEPLVLDGKELPQV :::::: .: .:: ::..::.: ::.:::.:.:... :.: : :.: ::. .: : : NP_001 RNPYTGHKYLCGALQTSIVLLEWVEPMQKFMLIKHIDFPIPCPLRMFEMLVVPEQEYPLV 660 670 680 690 700 710 660 670 680 690 700 710 pF1KB5 CVGAEGPEGPGCRVLFHVLPLEAGLTPDILIPPEGIPGSAQQVIQVDRDTILVSFERCVR :::. . . : :... . . : . . . .. .: :..:::::: .. :.. NP_001 CVGVSRGRDFNQVVRFETV--NPNSTSSWFTESDTPQTNVTHVTQLERDTILVCLDCCIK 720 730 740 750 760 770 720 730 740 750 760 770 pF1KB5 IVNMQG--EPTATLAPELTFDFPIETVVCLQDSVLAFWSHGMQGRSLDTNEVTQEITDET :::.:: . . :. :::::: ::..:::::::::::.:::::::. .:::::::.: : NP_001 IVNLQGRLKSSRKLSSELTFDFQIESIVCLQDSVLAFWKHGMQGRSFRSNEVTQEISDST 780 790 800 810 820 830 780 790 800 810 pF1KB5 RIFRVLGAHRDIILESIPTDNPEAHSNLYILTGHQSTY ::::.::. NP_001 RIFRLLGSDRVVVLESRPTDNPTANSNLYILAGHENSY 840 850 860 870 >>NP_003609 (OMIM: 604921) mitogen-activated protein kin (894 aa) initn: 3003 init1: 1515 opt: 1631 Z-score: 741.0 bits: 148.2 E(85289): 1.5e-34 Smith-Waterman score: 2781; 51.6% identity (73.1% similar) in 843 aa overlap (6-761:6-843) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MALLRDVSLQDPRDRFELLQRVGAGTYGDVYKARDTVTSELAAVKIVKLDPGDDISSLQQ :.: ..:.. :::.::.:.::::::::::.. :.::::.:..::.::.:.. .:: NP_003 MNPGFDLSRRNPQEDFELIQRIGSGTYGDVYKARNVNTGELAAIKVIKLEPGEDFAVVQQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 EITILRECRHPNVVAYIGSYLRNDRLWICMEFCGGGSLQEIYHATGPLEERQIAYVCREA :: ....:.:::.:::.::::: :.::::::::::::::.:::.:::: : ::::: ::. 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NP_003 KWSNSFHHFVKMALTKNPKKRPTAEKLLQHPFVTQHLTRSLAIELLDKVNNPDHSTYHDF 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 EDCELETYDMFPDTIHSRGQHGPAERTPSEIQFHQVKFGAPRRKETDPLNEPWEEEWTLL .: . : : ::: ... :.: ::: : :::: : ::::.: .: . . : NP_003 DDDDPEPLVAVPHRIHSTSRNVREEKTRSEITFGQVKFDPPLRKETEPHHELPDSDGFLD 310 320 330 340 350 360 360 370 380 pF1KB5 GKEEL--------------------------SGSLLQSVQEALEERS------------- ..::. . :::.::.: :..:. 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