Result of FASTA (ccds) for pFN21AE5841
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE5841, 1798 aa
  1>>>pF1KE5841     1798 - 1798 aa - 1798 aa
Library: human.CCDS.faa
  18921897 residues in 33420 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4610+/-0.00134; mu= 11.7146+/- 0.080
 mean_var=311.8905+/-61.850, 0's: 0 Z-trim(110.5): 132  B-trim: 15 in 1/52
 Lambda= 0.072623
 statistics sampled from 11681 (11811) to 11681 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.684), E-opt: 0.2 (0.353), width:  16
 Scan time:  3.340

The best scores are:                                      opt bits E(33420)
CCDS2789.1 LAMB2 gene_id:3913|Hs109|chr3           (1798) 12880 1365.6       0
CCDS5750.1 LAMB1 gene_id:3912|Hs109|chr7           (1786) 6768 725.2 5.4e-208
CCDS34732.1 LAMB4 gene_id:22798|Hs109|chr7         (1761) 4242 460.5 2.5e-128
CCDS83218.1 LAMB4 gene_id:22798|Hs109|chr7         ( 772) 2352 262.0 6.1e-69
CCDS86325.1 NTN4 gene_id:59277|Hs109|chr12         ( 605) 1256 147.1 1.9e-34
CCDS9054.1 NTN4 gene_id:59277|Hs109|chr12          ( 628) 1256 147.1   2e-34
CCDS1487.1 LAMB3 gene_id:3914|Hs109|chr1           (1172) 1258 147.7 2.5e-34
CCDS86324.1 NTN4 gene_id:59277|Hs109|chr12         ( 591) 1230 144.3 1.3e-33
CCDS6938.1 LAMC3 gene_id:10319|Hs109|chr9          (1575) 1153 136.8 6.2e-31
CCDS1351.1 LAMC1 gene_id:3915|Hs109|chr1           (1609) 1112 132.5 1.2e-29
CCDS32787.1 LAMA1 gene_id:284217|Hs109|chr18       (3075)  986 119.7 1.7e-25
CCDS5138.1 LAMA2 gene_id:3908|Hs109|chr6           (3122)  927 113.5 1.3e-23
CCDS1516.1 USH2A gene_id:7399|Hs109|chr1           (1546)  846 104.6 2.9e-21
CCDS31025.1 USH2A gene_id:7399|Hs109|chr1          (5202)  846 105.3 6.2e-21
CCDS11148.1 NTN1 gene_id:9423|Hs109|chr17          ( 604)  807 100.0 2.8e-20
CCDS48010.2 MEGF9 gene_id:1955|Hs109|chr9          ( 602)  723 91.2 1.2e-17
CCDS10469.1 NTN3 gene_id:4917|Hs109|chr16          ( 580)  621 80.5   2e-14
CCDS44285.1 LAMC2 gene_id:3918|Hs109|chr1          (1111)  605 79.2 9.6e-14
CCDS1352.1 LAMC2 gene_id:3918|Hs109|chr1           (1193)  605 79.2   1e-13
CCDS43491.1 LAMA4 gene_id:3910|Hs109|chr6          (1823)  600 79.0 1.9e-13
CCDS41237.1 MEGF6 gene_id:1953|Hs109|chr1          (1541)  580 76.8 7.2e-13
CCDS34514.1 LAMA4 gene_id:3910|Hs109|chr6          (1816)  574 76.2 1.2e-12
CCDS45564.1 SCARF1 gene_id:8578|Hs109|chr17        ( 569)  527 70.7 1.8e-11
CCDS11007.1 SCARF1 gene_id:8578|Hs109|chr17        ( 830)  527 70.9 2.3e-11
CCDS30625.1 HSPG2 gene_id:3339|Hs109|chr1          (4391)  521 71.2 9.9e-11


>>CCDS2789.1 LAMB2 gene_id:3913|Hs109|chr3                (1798 aa)
 initn: 12880 init1: 12880 opt: 12880  Z-score: 7308.7  bits: 1365.6 E(33420):    0
Smith-Waterman score: 12880; 100.0% identity (100.0% similar) in 1798 aa overlap (1-1798:1-1798)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MELTSRERGRGQPLPWELRLGLLLSVLAATLAQAPAPDVPGCSRGSCYPATGDLLVGRAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 MELTSRERGRGQPLPWELRLGLLLSVLAATLAQAPAPDVPGCSRGSCYPATGDLLVGRAD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 RLTASSTCGLNGPQPYCIVSHLQDEKKCFLCDSRRPFSARDNPHSHRIQNVVTSFAPQRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 RLTASSTCGLNGPQPYCIVSHLQDEKKCFLCDSRRPFSARDNPHSHRIQNVVTSFAPQRR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 AAWWQSENGIPAVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLVERSADFGRTWHVYRYFSY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 AAWWQSENGIPAVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLVERSADFGRTWHVYRYFSY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 DCGADFPGVPLAPPRHWDDVVCESRYSEIEPSTEGEVIYRVLDPAIPIPDPYSSRIQNLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 DCGADFPGVPLAPPRHWDDVVCESRYSEIEPSTEGEVIYRVLDPAIPIPDPYSSRIQNLL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 KITNLRVNLTRLHTLGDNLLDPRREIREKYYYALYELVVRGNCFCYGHASECAPAPGAPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 KITNLRVNLTRLHTLGDNLLDPRREIREKYYYALYELVVRGNCFCYGHASECAPAPGAPA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 HAEGMVHGACICKHNTRGLNCEQCQDFYRDLPWRPAEDGHSHACRKCECHGHTHSCHFDM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 HAEGMVHGACICKHNTRGLNCEQCQDFYRDLPWRPAEDGHSHACRKCECHGHTHSCHFDM
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE5 AVYLASGNVSGGVCDGCQHNTAGRHCELCRPFFYRDPTKDLRDPAVCRSCDCDPMGSQDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 AVYLASGNVSGGVCDGCQHNTAGRHCELCRPFFYRDPTKDLRDPAVCRSCDCDPMGSQDG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE5 GRCDSHDDPALGLVSGQCRCKEHVVGTRCQQCRDGFFGLSISDRLGCRRCQCNARGTVPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 GRCDSHDDPALGLVSGQCRCKEHVVGTRCQQCRDGFFGLSISDRLGCRRCQCNARGTVPG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE5 STPCDPNSGSCYCKRLVTGRGCDRCLPGHWGLSHDLLGCRPCDCDVGGALDPQCDEGTGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 STPCDPNSGSCYCKRLVTGRGCDRCLPGHWGLSHDLLGCRPCDCDVGGALDPQCDEGTGQ
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE5 CHCRQHMVGRRCEQVQPGYFRPFLDHLIWEAEDTRGQVLDVVERLVTPGETPSWTGSGFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 CHCRQHMVGRRCEQVQPGYFRPFLDHLIWEAEDTRGQVLDVVERLVTPGETPSWTGSGFV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE5 RLQEGQTLEFLVASVPKAMDYDLLLRLEPQVPEQWAELELIVQRPGPVPAHSLCGHLVPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 RLQEGQTLEFLVASVPKAMDYDLLLRLEPQVPEQWAELELIVQRPGPVPAHSLCGHLVPK
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE5 DDRIQGTLQPHARYLIFPNPVCLEPGISYKLHLKLVRTGGSAQPETPYSGPGLLIDSLVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 DDRIQGTLQPHARYLIFPNPVCLEPGISYKLHLKLVRTGGSAQPETPYSGPGLLIDSLVL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE5 LPRVLVLEMFSGGDAAALERQATFERYQCHEEGLVPSKTSPSEACAPLLISLSTLIYNGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 LPRVLVLEMFSGGDAAALERQATFERYQCHEEGLVPSKTSPSEACAPLLISLSTLIYNGA
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE5 LPCQCNPQGSLSSECNPHGGQCLCKPGVVGRRCDLCAPGYYGFGPTGCQACQCSHEGALS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 LPCQCNPQGSLSSECNPHGGQCLCKPGVVGRRCDLCAPGYYGFGPTGCQACQCSHEGALS
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE5 SLCEKTSGQCLCRTGAFGLRCDRCQRGQWGFPSCRPCVCNGHADECNTHTGACLGCRDHT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 SLCEKTSGQCLCRTGAFGLRCDRCQRGQWGFPSCRPCVCNGHADECNTHTGACLGCRDHT
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE5 GGEHCERCIAGFHGDPRLPYGGQCRPCPCPEGPGSQRHFATSCHQDEYSQQIVCHCRAGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 GGEHCERCIAGFHGDPRLPYGGQCRPCPCPEGPGSQRHFATSCHQDEYSQQIVCHCRAGY
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE5 TGLRCEACAPGHFGDPSRPGGRCQLCECSGNIDPMDPDACDPHTGQCLRCLHHTEGPHCA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 TGLRCEACAPGHFGDPSRPGGRCQLCECSGNIDPMDPDACDPHTGQCLRCLHHTEGPHCA
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE5 HCKPGFHGQAARQSCHRCTCNLLGTNPQQCPSPDQCHCDPSSGQCPCLPNVQGPSCDRCA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 HCKPGFHGQAARQSCHRCTCNLLGTNPQQCPSPDQCHCDPSSGQCPCLPNVQGPSCDRCA
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE5 PNFWNLTSGHGCQPCACHPSRARGPTCNEFTGQCHCRAGFGGRTCSECQELHWGDPGLQC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 PNFWNLTSGHGCQPCACHPSRARGPTCNEFTGQCHCRAGFGGRTCSECQELHWGDPGLQC
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE5 HACDCDSRGIDTPQCHRFTGHCSCRPGVSGVRCDQCARGFSGIFPACHPCHACFGDWDRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 HACDCDSRGIDTPQCHRFTGHCSCRPGVSGVRCDQCARGFSGIFPACHPCHACFGDWDRV
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE5 VQDLAARTQRLEQRAQELQQTGVLGAFESSFWHMQEKLGIVQGIVGARNTSAASTAQLVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 VQDLAARTQRLEQRAQELQQTGVLGAFESSFWHMQEKLGIVQGIVGARNTSAASTAQLVE
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE5 ATEELRREIGEATEHLTQLEADLTDVQDENFNANHALSGLERDRLALNLTLRQLDQHLDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 ATEELRREIGEATEHLTQLEADLTDVQDENFNANHALSGLERDRLALNLTLRQLDQHLDL
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE5 LKHSNFLGAYDSIRHAHSQSAEAERRANTSALAVPSPVSNSASARHRTEALMDAQKEDFN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 LKHSNFLGAYDSIRHAHSQSAEAERRANTSALAVPSPVSNSASARHRTEALMDAQKEDFN
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE5 SKHMANQRALGKLSAHTHTLSLTDINELVCGAPGDAPCATSPCGGAGCRDEDGQPRCGGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 SKHMANQRALGKLSAHTHTLSLTDINELVCGAPGDAPCATSPCGGAGCRDEDGQPRCGGL
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KE5 SCNGAAATADLALGRARHTQAELQRALAEGGSILSRVAETRRQASEAQQRAQAALDKANA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 SCNGAAATADLALGRARHTQAELQRALAEGGSILSRVAETRRQASEAQQRAQAALDKANA
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KE5 SRGQVEQANQELQELIQSVKDFLNQEGADPDSIEMVATRVLELSIPASAEQIQHLAGAIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 SRGQVEQANQELQELIQSVKDFLNQEGADPDSIEMVATRVLELSIPASAEQIQHLAGAIA
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KE5 ERVRSLADVDAILARTVGDVRRAEQLLQDARRARSWAEDEKQKAETVQAALEEAQRAQGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 ERVRSLADVDAILARTVGDVRRAEQLLQDARRARSWAEDEKQKAETVQAALEEAQRAQGI
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 AQGAIRGAVADTRDTEQTLYQVQERMAGAERALSSAGERARQLDALLEALKLKRAGNSLA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 ASTAEETAGSAQGRAQEAEQLLRGPLGDQYQTVKALAERKAQGVLAAQARAEQLRDEARD
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CCDS57 FAYDCEASFPGISTGPMKKVDDIICDSRYSDIEPSTEGEVIFRALDPAFKIEDPYSPRIQ
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pF1KE5 NLLKITNLRVNLTRLHTLGDNLLDPRREIREKYYYALYELVVRGNCFCYGHASECAPAPG
       :::::::::.....:::::::::: : :::::::::.:..:::::::::::::::::. :
CCDS57 NLLKITNLRIKFVKLHTLGDNLLDSRMEIREKYYYAVYDMVVRGNCFCYGHASECAPVDG
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CCDS57 FNEEVEGMVHGHCMCRHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRNSNACKKCNCNEHSISCH
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pF1KE5 FDMAVYLASGNVSGGVCDGCQHNTAGRHCELCRPFFYRDPTKDLRDPAVCRSCDCDPMGS
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CCDS57 FDMAVYLATGNVSGGVCDDCQHNTMGRNCEQCKPFYYQHPERDIRDPNFCERCTCDPAGS
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CCDS57 QNEGICDSYTDFSTGLIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKEGFYDLSSEDPFGCKSCACNPLGT
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CCDS57 IPGGNPCDSETGHCYCKRLVTGQHCDQCLPEHWGLSNDLDGCRPCDCDLGGALNNSCFAE
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CCDS57 SGQCSCRPHMIGRQCNEVEPGYYFATLDHYLYEAEEANLGPGVSIVERQYIQDRIPSWTG
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CCDS57 AGFVRVPEGAYLEFFIDNIPYSMEYDILIRYEPQLPDHWEKAVITVQRPGRIPTSSRCGN
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CCDS57 TIPDDDNQVVSLSPGSRYVVLPRPVCFEKGTNYTVRLELPQYTSSDSDVESPYT----LI
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       :::::.:    :..:. ::.. ..  ..   ::.::.: :..    ::  ...:  ...:
CCDS57 DSLVLMPYCKSLDIFTVGGSGDGVVTNSAWETFQRYRCLENSRSVVKTPMTDVCRNIIFS
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       .:.:... .: :.:.::::::: :.:.:::: :.:.:::: :. :::: .::::.::. :
CCDS57 ISALLHQTGLACECDPQGSLSSVCDPNGGQCQCRPNVVGRTCNRCAPGTFGFGPSGCKPC
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CCDS57 ECHLQGSVNAFCNPVTGQCHCFQGVYARQCDRCLPGHWGFPSCQPCQCNGHADDCDPVTG
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        ::.:.:.: :..::::.::..::: .  : .:::::::.:: : :.:: ::.::  . :
CCDS57 ECLNCQDYTMGHNCERCLAGYYGDPIIGSGDHCRPCPCPDGPDSGRQFARSCYQDPVTLQ
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pF1KE5 IVCHCRAGYTGLRCEACAPGHFGDPSRPGGRCQLCECSGNIDPMDPDACDPHTGQCLRCL
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CCDS57 LACVCDPGYIGSRCDDCASGYFGNPSEVGGSCQPCQCHNNIDTTDPEACDKETGRCLKCL
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pF1KE5 HHTEGPHCAHCKPGFHGQAARQSCHRCTCNLLGTNPQQCPSPDQCHCDPSSGQCPCLPNV
       .:::: ::  :. :..:.: .:.:..:.:: :::  ..: . : :.:: ..::: :::::
CCDS57 YHTEGEHCQFCRFGYYGDALQQDCRKCVCNYLGTVQEHCNGSD-CQCDKATGQCLCLPNV
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pF1KE5 QGPSCDRCAPNFWNLTSGHGCQPCACHPSRARGPTCNEFTGQCHCRAGFGGRTCSECQEL
        : .::::::: :.:.:: ::.:: :. ... ::.::::::::.:  :::::::::::::
CCDS57 IGQNCDRCAPNTWQLASGTGCDPCNCNAAHSFGPSCNEFTGQCQCMPGFGGRTCSECQEL
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CCDS57 FWGDPDVECRACDCDPRGIETPQCDQSTGQCVCVEGVEGPRCDKCTRGYSGVFPDCTPCH
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CCDS57 QCFALWDVIIAELTNRTHRFLEKAKALKISGVIGPYRETVDSVERKVSEIKDIL-AQSPA
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CCDS57 KELAEQLEFIKNSDIRGALDSITKYFQMSLEAEERVNASTTEPNSTVEQSALMRDRVEDV
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CCDS57 MMERESQFKEKQEEQARLLDELAGKLQSLDLSAAAEMTCGTPPGASCSETECGGPNCRTD
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pF1KE5 DGQPRCGGLSCNGAAATADLALGRARHTQAELQRALAEGGSILSRVAETRRQASEAQQRA
       .:. .::: .:.: ...:  :  .:   . ..  ::::  .. . :.:.. .:.::.: :
CCDS57 EGERKCGGPGCGGLVTVAHNAWQKAMDLDQDVLSALAEVEQLSKMVSEAKLRADEAKQSA
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pF1KE5 QAALDKANASRGQVEQANQELQELIQSVKDFLNQEGADPDSIEMVATRVLELSIPASAEQ
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CCDS57 EDILLKTNATKEKMDKSNEELRNLIKQIRNFLTQDSADLDSIEAVANEVLKMEMPSTPQQ
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pF1KE5 IQHLAGAIAERVRSLADVDAILARTVGDVRRAEQLLQDARRARSWAEDEKQKAETVQAAL
       .:.:.  : :::.::..:..:: ....:. :::.::..:.:: . : : :  :. :. ::
CCDS57 LQNLTEDIRERVESLSQVEVILQHSAADIARAEMLLEEAKRASKSATDVKVTADMVKEAL
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pF1KE5 EEAQRAQGIAQGAIRGAVADTRDTEQTLYQVQERMAGAERALSSAGERARQLDALLEALK
       :::..::  :. ::. :  : . :.. : ... . :..:..: .:..:  .:.  .: ::
CCDS57 EEAEKAQVAAEKAIKQADEDIQGTQNLLTSIESETAASEETLFNASQRISELERNVEELK
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pF1KE5 LKRAGNSLAASTAEETAGSAQGRAQEAEQLLRGPLGDQYQTVKALAERKAQGVLAAQARA
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CCDS57 RKAAQNSGEAEYIEKVVYTVKQSAEDVKKTLDGELDEKYKKVENLIAKKTEESADARRKA
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CCDS34 VNPPGGSE------HCIPKTLQSKPQSFALPAATRIMLLPTPICLEPDVQYSID---VYF
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CCDS34 CSTGSYDLGHHGCHPCHCHPQGSKDTVCDQVTGQCPCHGEVSGRRCDRCLAGYFGFPSCH
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CCDS34 ACLCDPVTGACPCLPNVTGLACDRCADGYWNLVPGRGCQSCDCDPRTSQSSHCDQLTGQC
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CCDS34 PCKLGYGGKRCSECQENYYGDPPGRCIPCDCNRAGTQKPICDPDTGMCRCREGVSGQRCD
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CCDS34 RCARGHSQEFPTCLQCHLCFDQWDHTISSLSKAVQGLMRLAANMEDKRETLPVCEADFKD
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CCDS34 LRGNVSEIERILKHPVFPSGKFLKVKDYHDSVRRQIMQLNEQLKAVY-EFQDLKDT----
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CCDS34 ------IERAKNEADLLLEDLQEEIDLQSSVLNASIADSSENIKKYYHISSSAEKKINET
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CCDS34 S----STINTSANTRNDLLTILDT----LTSK--------GNLSLERLKQIKIPDIQILN
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CCDS34 EKVCGDPGNVPCVPLPCGGALCTGRKGHRKCRGPGCHGSLTLSTNALQKAQEAKSIIRNL
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CCDS34 DKQVRGLKNQIESISEQAEVSKNNALQLREKLGNIRNQSDSEEENINLFIKKVKNFLLEE
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CCDS34 NVPPEDIEKVANGVLDIHLPIPSQNLTDELVKIQKHMQLCEDYRTDENRLNEEADGAQKL
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pF1KE5 LQDARRARSWAEDEKQKAETVQAALEEAQRAQGIAQGAIRGAVADTRDTEQTLYQVQERM
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CCDS34 LVKAKAAEKAANILLNLDKTLNQ-LQQAQITQGRANSTITQLTANITKIKKNVLQAENQT
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pF1KE5 AGAERALSSAGERARQLDAL-LEALKLKRAGNSLAASTAEETAGSAQGRAQEAEQLLRGP
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CCDS34 REMKSELELAKQRSGLEDGLSLLQTKLQRHQDH--AVNAKVQAESAQHQAGSLEKEFV-E
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pF1KE5 LGDQYQTVKALAERKAQ--GVLAAQ-ARAEQLRDEARDLLQAAQDKLQRLQELEGTYEEN
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CCDS34 LKKQY----AILQRKTSTTGLTKETLGKVKQLKDAAEKLAGDTEAKIRRITDLERKIQDL
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           1770      1780      1790         
pF1KE5 ERALESKAAQLDGLEARMRSVLQAINLQVQIYNTCQ 
       . . ..:: ::  :: .. .. . :  : . :  :  
CCDS34 NLSRQAKADQLRILEDQVVAIKNEIVEQEKKYARCYS
         1730      1740      1750      1760 

>>CCDS83218.1 LAMB4 gene_id:22798|Hs109|chr7              (772 aa)
 initn: 2289 init1: 977 opt: 2352  Z-score: 1351.4  bits: 262.0 E(33420): 6.1e-69
Smith-Waterman score: 2538; 48.6% identity (72.0% similar) in 726 aa overlap (14-717:1-708)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MELTSRERGRGQPLPWELRLGLLLSVLAATLAQAPAPDVPGCSRGSCYPATGDLLVGRAD
                    . ..: : : :. :. . ::        :.::.:.:.::::::::  
CCDS83              MQFQLTLFLHLGWLSYSKAQ------DDCNRGACHPTTGDLLVGRNT
                            10        20              30        40 

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 RLTASSTCGLNGPQPYCIVSHLQDEKKCFLCDSRRPFSARDNPHSHRIQNVVTSFAPQRR
       .: :::::::.  : :::.:.:. :.:::.:::: :..  :.:.:: :.::..:: :.:.
CCDS83 QLMASSTCGLSRAQKYCILSYLEGEQKCFICDSRFPYDPYDQPNSHTIENVIVSFEPDRE
              50        60        70        80        90       100 

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 AAWWQSENGIPAVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLVERSADFGRTWHVYRYFSY
         :::::::.  :.:.::::: :.:.:::.:::::::::::::::.:.:..:.:..::. 
CCDS83 KKWWQSENGLDHVSIRLDLEALFRFSHLILTFKTFRPAAMLVERSTDYGHNWKVFKYFAK
             110       120       130       140       150       160 

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 DCGADFPGVPLAPPRHWDDVVCESRYSEIEPSTEGEVIYRVLDPAIPIPDPYSSRIQNLL
       ::...::..  .  .   :.::.:.::.::::: :::. .::::.. : .:::  ::.:.
CCDS83 DCATSFPNITSGQAQGVGDIVCDSKYSDIEPSTGGEVVLKVLDPSFEIENPYSPYIQDLV
             170       180       190       200       210       220 

              250       260        270       280       290         
pF1KE5 KITNLRVNLTRLHTLGDNLLDPRR-EIREKYYYALYELVVRGNCFCYGHASECAPAP---
        .::::.:.:.:::::: ::  :. .  .::::::::..:::.::: :::::: :     
CCDS83 TLTNLRINFTKLHTLGDALLGRRQNDSLDKYYYALYEMIVRGSCFCNGHASECRPMQKMR
             230       240       250       260       270       280 

        300       310       320       330       340       350      
pF1KE5 GAPAHAEGMVHGACICKHNTRGLNCEQCQDFYRDLPWRPAEDGHSHACRKCECHGHTHSC
       :      ::::: :.:.::: : :::.:.::..: ::::: : ...:::.: :..:.  :
CCDS83 GDVFSPPGMVHGQCVCQHNTDGPNCERCKDFFQDAPWRPAADLQDNACRSCSCNSHSSRC
             290       300       310       320       330       340 

        360       370       380       390       400       410      
pF1KE5 HFDMAVYLASGNVSGGVCDGCQHNTAGRHCELCRPFFYRDPTKDLRDPAVCRSCDCDPMG
       ::::..:::::..:::::. ::::: :.::. :::.::::: : . :: .:  :.::: :
CCDS83 HFDMTTYLASGGLSGGVCEDCQHNTEGQHCDRCRPLFYRDPLKTISDPYACIPCECDPDG
             350       360       370       380       390       400 

        420       430       440       450       460       470      
pF1KE5 SQDGGRCDSHDDPALGLVSGQCRCKEHVVGTRCQQCRDGFFGLSISDRLGCRRCQCNARG
       . .:: : ::.::::: :.::: :::.: :..:.::. . .::: .: :::. :.::  :
CCDS83 TISGGICVSHSDPALGSVAGQCLCKENVEGAKCDQCKPNHYGLSATDPLGCQPCDCNPLG
             410       420       430       440       450       460 

        480       490       500       510       520       530      
pF1KE5 TVPGSTPCDPNSGSCYCKRLVTGRGCDRCLPGHWGLSHDLLGCRPCDCDVGGALDPQCDE
       ..:  : :: ..:.: :   :::  :..:  :.:::.. : :: :::::.::: .  :. 
CCDS83 SLPFLT-CDVDTGQCLCLSYVTGAHCEECTVGYWGLGNHLHGCSPCDCDIGGAYSNVCSP
              470       480       490       500       510       520

        540       550       560       570                      580 
pF1KE5 GTGQCHCRQHMVGRRCEQVQPGYFRPFLDHLIWEAED-------------TRGQ--VLDV
        .:::.:: :..:: : .  ::::   :.  ..:::.             : ::  .. :
CCDS83 KNGQCECRPHVTGRSCSEPAPGYFFAPLNFYLYEAEEATTLQGLAPLGSETFGQSPAVHV
              530       540       550       560       570       580

             590       600       610       620       630       640 
pF1KE5 VERLVTPGETPSWTGSGFVRLQEGQTLEFLVASVPKAMDYDLLLRLEPQVPEQWAELELI
       :    .::.  .::: ::.:.  :  :.: : ..:  .:. . .. : :   .:. ....
CCDS83 VLGEPVPGNPVTWTGPGFARVLPGAGLRFAVNNIPFPVDFTIAIHYETQSAADWT-VQIV
              590       600       610       620       630          

             650       660         670        680       690        
pF1KE5 VQRPGPVPAHSLCGHLVPK--DDRIQGTLQPHA-RYLIFPNPVCLEPGISYKLHLKLVRT
       :. ::         : .::  ... :.   : : : ...:.:.:::: ..:..    :  
CCDS83 VNPPGGSE------HCIPKTLQSKPQSFALPAATRIMLLPTPICLEPDVQYSID---VYF
     640             650       660       670       680          690

      700       710       720       730       740       750        
pF1KE5 GGSAQPETPYSGPGLLIDSLVLLPRVLVLEMFSGGDAAALERQATFERYQCHEEGLVPSK
       .   : :. ..   .:.::                                         
CCDS83 SQPLQGES-HAHSHVLVDSAAVQWHNLGSLQPPPPECKQFSCFSFPSSWDYRHPPPHLAN
               700       710       720       730       740         

>>CCDS86325.1 NTN4 gene_id:59277|Hs109|chr12              (605 aa)
 initn: 1428 init1: 366 opt: 1256  Z-score: 732.0  bits: 147.1 E(33420): 1.9e-34
Smith-Waterman score: 1282; 42.3% identity (64.2% similar) in 489 aa overlap (23-491:7-462)

               10        20        30        40           50       
pF1KE5 MELTSRERGRGQPLPWELRLGLLLSVLAATLAQAPAPDVPGCS---RGSCYPATGDLLVG
                             :: . . :.. :    : : :   . .: :  :.: .:
CCDS86                 MGSCARLLLLWGCTVVAAGLSGVAGVSSRCEKACNPRMGNLALG
                               10        20        30        40    

        60        70        80            90       100       110   
pF1KE5 RADRLTASSTCGLNGPQPYCIVSHLQD----EKKCFLCDSRRPFSARDNPHSHRIQNVVT
       :  .: :..::: :. . ::. :.  :    . ::  :..  :  :.  : .     . .
CCDS86 R--KLWADTTCGQNATELYCFYSENTDLTCRQPKCDKCNAAYPHLAHL-PSAM----ADS
             50        60        70        80        90            

           120       130       140       150       160       170   
pF1KE5 SFAPQRRAAWWQSENGIPAVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLVERSADFGRTWH
       ::   :  .:::: . .    :::::::::.:::::. ::. :::::...:: :::.::.
CCDS86 SFRFPR--TWWQSAEDVHREKIQLDLEAEFYFTHLIVMFKSPRPAAMVLDRSQDFGKTWK
       100         110       120       130       140       150     

           180       190       200            210       220        
pF1KE5 VYRYFSYDCGADFPGVPLAPPRHWDDVV-----CESRYSEIEPSTEGEVIYRVLDPAIPI
        :.::. .:.: : :.        ::::     : :.::   : : ::::...:.:    
CCDS86 PYKYFATNCSATF-GLE-------DDVVKKGAICTSKYSSPFPCTGGEVIFKALSPPYDT
         160        170              180       190       200       

      230       240       250       260       270       280        
pF1KE5 PDPYSSRIQNLLKITNLRVNLTRLHTLGDNLLDPRREIREKYYYALYELVVRGNCFCYGH
        .:::...:. ::::::::.: . ..   .  :  .: ..  .::.:...:.:.::: ::
CCDS86 ENPYSAKVQEQLKITNLRVQLLKRQSCPCQRNDLNEEPQHFTHYAIYDFIVKGSCFCNGH
       210       220       230       240       250       260       

      290        300          310       320       330       340    
pF1KE5 ASECAPAPG-APAHAEG---MVHGACICKHNTRGLNCEQCQDFYRDLPWRPAEDGHSHA-
       :..: :. :  :..: :   :::: :.::::: : .:..:  .: : ::. : ::.. : 
CCDS86 ADQCIPVHGFRPVKAPGTFHMVHGKCMCKHNTAGSHCQHCAPLYNDRPWE-AADGKTGAP
       270       280       290       300       310        320      

             350       360       370       380       390       400 
pF1KE5 --CRKCECHGHTHSCHFDMAVYLASGNVSGGVCDGCQHNTAGRHCELCRPFFYRDPTKDL
         :: :.:.::. .::::. :. :::: :::::: ::::: :..:. :.: ::::  . .
CCDS86 NECRTCKCNGHADTCHFDVNVWEASGNRSGGVCDDCQHNTEGQYCQRCKPGFYRDLRRPF
        330       340       350       360       370       380      

             410        420       430       440       450       460
pF1KE5 RDPAVCRSCDCDPMGSQD-GGRCDSHDDPALGLVSGQCRCKEHVVGTRCQQCRDGFFGLS
         : .:. :.: :.::    .   .  ::.    .:.: ::  :.: ::..:  :..:..
CCDS86 SAPDACKPCSCHPVGSAVLPANSVTFCDPS----NGDCPCKPGVAGRRCDRCMVGYWGFG
        390       400       410           420       430       440  

              470       480       490       500       510       520
pF1KE5 ISDRLGCRRCQCNARGTVPGSTPCDPNSGSCYCKRLVTGRGCDRCLPGHWGLSHDLLGCR
         :  ::: :.:       ::  ::: .:.:                             
CCDS86 --DY-GCRPCDCA------GS--CDPITGDCISSHTDIDWYHEVPDFRPVHNKSEPAWEW
               450               460       470       480       490 

              530       540       550       560       570       580
pF1KE5 PCDCDVGGALDPQCDEGTGQCHCRQHMVGRRCEQVQPGYFRPFLDHLIWEAEDTRGQVLD
                                                                   
CCDS86 EDAQGFSALLHSVLKIKILSAHDKGTHVEVNVKIKKVLKSTKLKIFRGKRTLYPESWTDR
             500       510       520       530       540       550 

>>CCDS9054.1 NTN4 gene_id:59277|Hs109|chr12               (628 aa)
 initn: 1428 init1: 366 opt: 1256  Z-score: 731.8  bits: 147.1 E(33420): 2e-34
Smith-Waterman score: 1293; 39.4% identity (61.3% similar) in 553 aa overlap (23-549:7-514)

               10        20        30        40           50       
pF1KE5 MELTSRERGRGQPLPWELRLGLLLSVLAATLAQAPAPDVPGCS---RGSCYPATGDLLVG
                             :: . . :.. :    : : :   . .: :  :.: .:
CCDS90                 MGSCARLLLLWGCTVVAAGLSGVAGVSSRCEKACNPRMGNLALG
                               10        20        30        40    

        60        70        80            90       100       110   
pF1KE5 RADRLTASSTCGLNGPQPYCIVSHLQD----EKKCFLCDSRRPFSARDNPHSHRIQNVVT
       :  .: :..::: :. . ::. :.  :    . ::  :..  :  :.  : .     . .
CCDS90 R--KLWADTTCGQNATELYCFYSENTDLTCRQPKCDKCNAAYPHLAHL-PSAM----ADS
             50        60        70        80        90            

           120       130       140       150       160       170   
pF1KE5 SFAPQRRAAWWQSENGIPAVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLVERSADFGRTWH
       ::   :  .:::: . .    :::::::::.:::::. ::. :::::...:: :::.::.
CCDS90 SFRFPR--TWWQSAEDVHREKIQLDLEAEFYFTHLIVMFKSPRPAAMVLDRSQDFGKTWK
       100         110       120       130       140       150     

           180       190       200            210       220        
pF1KE5 VYRYFSYDCGADFPGVPLAPPRHWDDVV-----CESRYSEIEPSTEGEVIYRVLDPAIPI
        :.::. .:.: : :.        ::::     : :.::   : : ::::...:.:    
CCDS90 PYKYFATNCSATF-GLE-------DDVVKKGAICTSKYSSPFPCTGGEVIFKALSPPYDT
         160        170              180       190       200       

      230       240       250       260       270       280        
pF1KE5 PDPYSSRIQNLLKITNLRVNLTRLHTLGDNLLDPRREIREKYYYALYELVVRGNCFCYGH
        .:::...:. ::::::::.: . ..   .  :  .: ..  .::.:...:.:.::: ::
CCDS90 ENPYSAKVQEQLKITNLRVQLLKRQSCPCQRNDLNEEPQHFTHYAIYDFIVKGSCFCNGH
       210       220       230       240       250       260       

      290        300          310       320       330       340    
pF1KE5 ASECAPAPG-APAHAEG---MVHGACICKHNTRGLNCEQCQDFYRDLPWRPAEDGHSHA-
       :..: :. :  :..: :   :::: :.::::: : .:..:  .: : ::. : ::.. : 
CCDS90 ADQCIPVHGFRPVKAPGTFHMVHGKCMCKHNTAGSHCQHCAPLYNDRPWEAA-DGKTGAP
       270       280       290       300       310        320      

             350       360       370       380       390       400 
pF1KE5 --CRKCECHGHTHSCHFDMAVYLASGNVSGGVCDGCQHNTAGRHCELCRPFFYRDPTKDL
         :: :.:.::. .::::. :. :::: :::::: ::::: :..:. :.: ::::  . .
CCDS90 NECRTCKCNGHADTCHFDVNVWEASGNRSGGVCDDCQHNTEGQYCQRCKPGFYRDLRRPF
        330       340       350       360       370       380      

             410        420       430       440       450       460
pF1KE5 RDPAVCRSCDCDPMGSQD-GGRCDSHDDPALGLVSGQCRCKEHVVGTRCQQCRDGFFGLS
         : .:. :.: :.::    .   .  ::.    .:.: ::  :.: ::..:  :..:..
CCDS90 SAPDACKPCSCHPVGSAVLPANSVTFCDPS----NGDCPCKPGVAGRRCDRCMVGYWGFG
        390       400       410           420       430       440  

              470       480       490       500       510       520
pF1KE5 ISDRLGCRRCQCNARGTVPGSTPCDPNSGSCYCKRLVTGRGCDRCLPGHWGLSHDLLGCR
         :  ::: :.:       ::  ::: .:.:    . .    :      :   :..   :
CCDS90 --DY-GCRPCDCA------GS--CDPITGDC----ISSHTDID------W--YHEVPDFR
               450               460           470                 

              530             540       550       560       570    
pF1KE5 PCDCDVGGALDPQCDEG------TGQCHCRQHMVGRRCEQVQPGYFRPFLDHLIWEAEDT
       :       : . .  .:      .:.:.:... .:                         
CCDS90 PVHNKSEPAWEWEDAQGFSALLHSGKCECKEQTLGNAKAFCGMKYSYVLKIKILSAHDKG
     480       490       500       510       520       530         

          580       590       600       610       620       630    
pF1KE5 RGQVLDVVERLVTPGETPSWTGSGFVRLQEGQTLEFLVASVPKAMDYDLLLRLEPQVPEQ
                                                                   
CCDS90 THVEVNVKIKKVLKSTKLKIFRGKRTLYPESWTDRGCTCPILNPGLEYLVAGHEDIRTGK
     540       550       560       570       580       590         

>>CCDS1487.1 LAMB3 gene_id:3914|Hs109|chr1                (1172 aa)
 initn: 1824 init1: 489 opt: 1258  Z-score: 729.9  bits: 147.7 E(33420): 2.5e-34
Smith-Waterman score: 1669; 45.1% identity (68.5% similar) in 514 aa overlap (42-552:21-511)

              20        30        40        50        60        70 
pF1KE5 QPLPWELRLGLLLSVLAATLAQAPAPDVPGCSRGSCYPATGDLLVGRADRLTASSTCGLN
                                     ::::.::: .:::::::.  : :::::::.
CCDS14           MRPFFLLCFALPGLLHAQQACSRGACYPPVGDLLVGRTRFLRASSTCGLT
                         10        20        30        40        50

              80        90       100       110       120       130 
pF1KE5 GPQPYCIVSHLQDEKKCFLCDSRRPFSARDNPHSHRIQNVVTSFAPQRRAAWWQSENGIP
        :. :: ... . . ::  ::::.:     : .:::..::..: .:.:   ::::.: . 
CCDS14 KPETYC-TQYGEWQMKCCKCDSRQP----HNYYSHRVENVASSSGPMR---WWQSQNDVN
                60        70            80        90          100  

             140       150       160       170       180       190 
pF1KE5 AVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLVERSADFGRTWHVYRYFSYDCGADFPGVPL
        :..::::. .:.. ...: :.   ::.::.:::.:::.::.::.:.. :: . :: :  
CCDS14 PVSLQLDLDRRFQLQEVMMEFQGPMPAGMLIERSSDFGKTWRVYQYLAADCTSTFPRVRQ
            110       120       130       140       150       160  

             200       210        220       230       240       250
pF1KE5 APPRHWDDVVCESRYSEIEPSTEG-EVIYRVLDPAIPIPDPYSSRIQNLLKITNLRVNLT
       . :. :.:: :.:  .. .   .: .:   ..: .  ::   :..::.. .:::::::.:
CCDS14 GRPQSWQDVRCQSLPQRPNARLNGGKVQLNLMDLVSGIPATQSQKIQEVGEITNLRVNFT
            170       180       190       200       210       220  

              260       270       280       290       300          
pF1KE5 RLHTLGDNLLDPRREIREKYYYALYELVVRGNCFCYGHASECAPAPGAPAHAEG--MVHG
       ::  . .    :      . :::. .: ..:.:::.:::..::: ::: :      .:: 
CCDS14 RLAPVPQRGYHP-----PSAYYAVSQLRLQGSCFCHGHADRCAPKPGASAGPSTAVQVHD
            230            240       250       260       270       

      310       320       330       340       350       360        
pF1KE5 ACICKHNTRGLNCEQCQDFYRDLPWRPAEDGHSHACRKCECHGHTHSCHFDMAVYLASGN
       .:.:.::: : :::.:  :: . ::::::   .: :..:.:.::...:::: ::. :: .
CCDS14 VCVCQHNTAGPNCERCAPFYNNRPWRPAEGQDAHECQRCDCNGHSETCHFDPAVFAASQG
       280       290       300       310       320       330       

      370       380       390       400       410       420        
pF1KE5 VSGGVCDGCQHNTAGRHCELCRPFFYRDPTKDLRDPAVCRSCDCDPMGSQDGGRCDSHDD
       . :::::.:. .: :..:: :.  ..:.         .: ::.::: :.  :. ::    
CCDS14 AYGGVCDNCRDHTEGKNCERCQLHYFRNRRPGASIQETCISCECDPDGAVPGAPCD----
       340       350       360       370       380       390       

      430       440       450       460       470       480        
pF1KE5 PALGLVSGQCRCKEHVVGTRCQQCRDGFFGLSISDRLGCRRCQCNARGTVPGSTPCDPNS
       :    :.::: ::::: : ::. :. :: ::. ..  ::.::.::  :.   . ::: .:
CCDS14 P----VTGQCVCKEHVQGERCDLCKPGFTGLTYANPQGCHRCDCNILGSRR-DMPCDEES
               400       410       420       430       440         

      490       500       510       520       530       540        
pF1KE5 GSCYCKRLVTGRGCDRCLPGHWGLSHDLLGCRPCDCDVGGALDPQCDEGTGQCHCRQHMV
       : : :   :.:  ::.: : :: :.    ::.:: ::  ..:.:::.. :::: ::. . 
CCDS14 GRCLCLPNVVGPKCDQCAPYHWKLASGQ-GCEPCACDPHNSLSPQCNQFTGQCPCREGFG
      450       460       470        480       490       500       

      550       560       570       580       590       600        
pF1KE5 GRRCEQVQPGYFRPFLDHLIWEAEDTRGQVLDVVERLVTPGETPSWTGSGFVRLQEGQTL
       :  :                                                        
CCDS14 GLMCSAAAIRQCPDRTYGDVATGCRACDCDFRGTEGPGCDKASGRCLCRPGLTGPRCDQC
       510       520       530       540       550       560       

>--
 initn: 579 init1: 317 opt: 723  Z-score: 427.0  bits: 91.6 E(33420): 1.9e-17
Smith-Waterman score: 802; 27.2% identity (59.1% similar) in 680 aa overlap (1127-1798:518-1172)

       1100      1110      1120      1130      1140      1150      
pF1KE5 CHPSRARGPTCNEFTGQCHCRAGFGGRTCSECQELHWGDPGLQCHACDCDSRGIDTPQCH
                                     .: .  .:: .  :.::::: :: . : : 
CCDS14 SLSPQCNQFTGQCPCREGFGGLMCSAAAIRQCPDRTYGDVATGCRACDCDFRGTEGPGCD
       490       500       510       520       530       540       

       1160      1170      1180      1190      1200      1210      
pF1KE5 RFTGHCSCRPGVSGVRCDQCARGFSGIFPACHPCHACFGDWDRVVQDLAARTQRLEQRAQ
       . .:.: ::::..: ::::: ::. . .:.:  :: ::  .:  ... : :  ::.. . 
CCDS14 KASGRCLCRPGLTGPRCDQCQRGYCNRYPVCVACHPCFQTYDADLREQALRFGRLRNATA
       550       560       570       580       590       600       

       1220        1230      1240      1250      1260      1270    
pF1KE5 ELQQTGVLG--AFESSFWHMQEKLGIVQGIVGARNTSAASTAQLVEATEELRREIGEATE
        : .   :   .. : .   . :.  .......  ..   .::.. :   :::       
CCDS14 SLWSGPGLEDRGLASRILDAKSKIEQIRAVLSSPAVTEQEVAQVASAILSLRRT------
       610       620       630       640       650       660       

         1280      1290      1300      1310       1320      1330   
pF1KE5 HLTQLEADLTDVQDENFNANHALSGLERDRLALNLTLRQLD-QHLDLLKHSNFLGAYDSI
        :  :. ::  ...:...  . : .:.:.  .: ::. :   .... .. ..  ::.  .
CCDS14 -LQGLQLDLP-LEEETLSLPRDLESLDRSFNGL-LTMYQRKREQFEKISSADPSGAFRML
              670        680       690        700       710        

          1340      1350      1360      1370      1380      1390   
pF1KE5 RHAHSQSAEAERRANTSALAVPSPVSNSASARHRTEALMDAQKEDFNSKHMANQRALGKL
         :. :::.: .... :.  . . . .:    .:      .     . : .: .  ...:
CCDS14 STAYEQSAQAAQQVSDSSRLL-DQLRDSRREAERLVRQAGGGGGTGSPKLVALRLEMSSL
      720       730        740       750       760       770       

          1400      1410      1420      1430      1440      1450   
pF1KE5 SAHTHTLSLTDINELVCGAPGDAPCATSPCGGAGCRDEDGQPRCGGLSCNGAAATADLAL
          : :.     :.: ::   .  :.   : :  : ...:   ::.  : :.   :  :.
CCDS14 PDLTPTF-----NKL-CGNSRQMACTPISCPGELCPQDNGTA-CGS-RCRGVLPRAGGAF
       780             790       800       810         820         

          1460      1470      1480      1490      1500      1510   
pF1KE5 GRARHTQAELQRALAEGGSILSRVAETRRQASEAQQRAQAALDKANASRGQVEQANQELQ
         : ..  .:.   :.     . .  ....::. :. ::    ...:::.:.:.  .. .
CCDS14 LMAGQVAEQLRGFNAQLQRTRQMIRAAEESASQIQSSAQRLETQVSASRSQMEEDVRRTR
     830       840       850       860       870       880         

          1520      1530      1540       1550        1560      1570
pF1KE5 ELIQSVKDFLNQEGADPDSIEMVATRVLELSIPA-SAEQIQHLA--GAIAERVRSLADVD
        :::.:.:::..  .:  .:. :.  :: : .:. ::  .:..    ::: :   : .::
CCDS14 LLIQQVRDFLTDPDTDAATIQEVSEAVLALWLPTDSATVLQKMNEIQAIAAR---LPNVD
     890       900       910       920       930       940         

             1580      1590      1600      1610      1620      1630
pF1KE5 AILARTVGDVRRAEQLLQDARRARSWAEDEKQKAETVQAALEEAQRAQGIAQGAIRGAVA
        .:..:  :. ::..:  .:..::: :.  . ..: : . :...  :   :: ...:.  
CCDS14 LVLSQTKQDIARARRLQAEAEEARSRAHAVEGQVEDVVGNLRQGTVALQEAQDTMQGTSR
        950       960       970       980       990      1000      

             1640      1650      1660      1670      1680      1690
pF1KE5 DTRDTEQTLYQVQERMAGAERALSSAGERARQLDALLEALKLKRAGNSLAASTAEETAGS
       . :  .. . .::. .  ::. ..:  ..  .. . .: :. .   ..  :  :.. : .
CCDS14 SLRLIQDRVAEVQQVLRPAEKLVTSMTKQLGDFWTRMEELRHQARQQGAEAVQAQQLAEG
       1010      1020      1030      1040      1050      1060      

             1700      1710      1720        1730      1740        
pF1KE5 AQGRAQEAEQLLRGPLGDQYQTVKALAERKAQG-VLAAQ-ARAEQLRDEARDLLQAAQDK
       :. .:  :.. ..  . ..:  .:   .: .:. .:. : :: .... ::..:.  ... 
CCDS14 ASEQALSAQEGFER-IKQKYAELK---DRLGQSSMLGEQGARIQSVKTEAEELFGETMEM
       1070      1080          1090      1100      1110      1120  

     1750      1760      1770      1780      1790        
pF1KE5 LQRLQELEGTYEENERALESKAAQLDGLEARMRSVLQAINLQVQIYNTCQ
       ..:....:    .. .:.  ..:.: ::: :.... . :: .:  : ::.
CCDS14 MDRMKDMELELLRGSQAIMLRSADLTGLEKRVEQIRDHINGRVLYYATCK
           1130      1140      1150      1160      1170  

>>CCDS86324.1 NTN4 gene_id:59277|Hs109|chr12              (591 aa)
 initn: 1428 init1: 366 opt: 1230  Z-score: 717.4  bits: 144.3 E(33420): 1.3e-33
Smith-Waterman score: 1267; 40.1% identity (62.2% similar) in 521 aa overlap (52-549:2-477)

              30        40        50        60        70        80 
pF1KE5 LLLSVLAATLAQAPAPDVPGCSRGSCYPATGDLLVGRADRLTASSTCGLNGPQPYCIVSH
                                     :.: .::  .: :..::: :. . ::. :.
CCDS86                              MGNLALGR--KLWADTTCGQNATELYCFYSE
                                              10        20         

                  90       100       110       120       130       
pF1KE5 LQD----EKKCFLCDSRRPFSARDNPHSHRIQNVVTSFAPQRRAAWWQSENGIPAVTIQL
         :    . ::  :..  :  :.  : .     . .::   :  .:::: . .    :::
CCDS86 NTDLTCRQPKCDKCNAAYPHLAHL-PSAM----ADSSFRFPR--TWWQSAEDVHREKIQL
      30        40        50             60          70        80  

       140       150       160       170       180       190       
pF1KE5 DLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLVERSADFGRTWHVYRYFSYDCGADFPGVPLAPPRHW
       ::::::.:::::. ::. :::::...:: :::.::. :.::. .:.: : :.        
CCDS86 DLEAEFYFTHLIVMFKSPRPAAMVLDRSQDFGKTWKPYKYFATNCSATF-GLE-------
             90       100       110       120       130            

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       ..   .  :  .: ..  .::.:...:.:.::: :::..: :. :  :..: :   ::::
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        :.::::: : .:..:  .: : ::. : ::.. :   :: :.:.::. .::::. :. :
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       ::: :::::: ::::: :..:. :.: ::::  . .  : .:. :.: :.::    .   
CCDS86 SGNRSGGVCDDCQHNTEGQYCQRCKPGFYRDLRRPFSAPDACKPCSCHPVGSAVLPANSV
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       .  ::.    .:.: ::  :.: ::..:  :..:..  :  ::: :.:       ::  :
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       :: .:.:    . .    :      :   :..   ::       : . .  .:      .
CCDS86 DPITGDC----ISSHTDID------W--YHEVPDFRPVHNKSEPAWEWEDAQGFSALLHS
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       :.:.:... .:                                                 
CCDS86 GKCECKEQTLGNAKAFCGMKYSYVLKIKILSAHDKGTHVEVNVKIKKVLKSTKLKIFRGK
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CCDS69 CKCNGHASECGP------DVAGQL--ACRCQHNTTGTDCERCLPFFQDRPWARGTAEAAH
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        .   : :  :.    :: .   :  ::      : :                      :
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       ::::    : :                           : ..              :: :
CCDS69 APGYKREMPQG---------------------------GPYA--------------SCVP
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       :.:: :.  :. .:: :. :  :: :  ::::. ::.:.:    . .:.:::::   :. 
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           ..:     :...:: ::  :  : :::.:  : ::::    :.   :. :.::::.
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       ::     ::: .:.::::::.: : :: ::. ::.:.:      ..:  :.:.  :.  .
CCDS69 DPNAVGNCDPLSGHCLRCLHNTTGDHCEHCQEGFYGSALAPRPADKCMPCSCHPQGSVSE
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       : :      ::: .::: :::.: . .:.:: :.:..:  :.::. : :::  ..   :.
CCDS69 QMP------CDPVTGQCSCLPHVTARDCSRCYPGFFDLQPGRGCRSCKCHPLGSQEDQCH
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pF1KE5 EFTGQCHCRAGFGGRTCSECQELHWGDPGLQCHACDCDSRGIDTPQCHRFTGHCSCRPGV
         :::: :: :  :..:..::   .:     :.:: :.  :  . :::. .: : :::: 
CCDS69 PKTGQCTCRPGVTGQACDRCQLGFFGFSIKGCRACRCSPLGAASAQCHE-NGTCVCRPGF
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pF1KE5 SGVRCDQCARGF--SGIFPACHPCHACFGDWDRVVQDLAARTQ-RLEQRAQELQQTGVLG
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CCDS69 EGYKCDRCHDNFFLTADGTHCQQCPSCYA----LVKEEAAKLKARLTLTEGWLQ-----G
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CCDS69 SDCGSPWGPLDILLGEAPRGDVYQGHHLLPGAREAFLEQMMSLEGAVKAAREQLQRLNKG
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pF1KE5 ----EIG--EATEHLTQLEADLTDVQDENFNANHALSGLERDRLALNLTLRQLDQHLDLL
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CCDS69 ARCAQAGSQKTCTQLADLEAVLESSEEEILHAAAILASLEIPQEGPSQPTKW--SHLATE
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pF1KE5 KHSNFLGAYDSIRHAHSQSAEAERRANTS-ALAVPSPVSNSASARHRTEALMDAQKEDFN
        ..   .  :.  .  . . .:   .::: ::     . :   .:   :.  :   ::  
CCDS69 ARALARSHRDTATKIAATAWRALLASNTSYAL-----LWNLLEGRVALETQRDL--EDRY
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       .. .: :.::            : . :..       : : :  . .     :  :  . :
CCDS69 QEVQAAQKALR-----------TAVAEVL-------PEAESVLATVQQVGADTAPYLALL
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       .  ::    . :   . ...: :....:    . ...:.: . :..:  :    : : . 
CCDS69 ASPGALPQKSRAEDLGLKAKA-LEKTVASWQHMATEAARTLQTAAQATLRQTEPLTKLHQ
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pF1KE5 -SRGQVEQANQELQELIQSVKDFLNQEGADPDSIEMVATRVLELSIPASAEQIQHLAGAI
        .:. . ::.. .:    .:       ::     .. . . :..  : .   .:. : ..
CCDS69 EARAALTQASSSVQAATVTV------MGARTLLADLEGMK-LQFPRPKDQAALQRKADSV
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pF1KE5 AERVRSLADVDAILARTVGDVRRAEQLLQDARRARSWAEDEKQKAETVQAALEEAQRAQG
       ..:         .:: :   ...::..: .:    : :. . ..::..  : . :. :..
CCDS69 SDR---------LLADTRKKTKQAERMLGNAAPLSSSAKKKGREAEVL--AKDSAKLAKA
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pF1KE5 IAQGAIRGAVADTRDTEQTLYQVQERMAGAERALSSAGERARQLDALLEALKLKRAGNSL
       . .   ..    .: : ::   .:.   .....:.:  :  ::   : :: ..  :: : 
CCDS69 LLRERKQAHRRASRLTSQTQATLQQ---ASQQVLAS--EARRQ--ELEEAERVG-AGLSE
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pF1KE5 AASTAEETAGSAQGRAQEAEQLLRGPLG--DQYQTVKALAERKAQGVLAAQARAEQLRDE
         .  .:.  : .   .   .:: . ::  : .:.        ::..  .:   :.::  
CCDS69 MEQQIRESRISLEKDIETLSELL-ARLGSLDTHQA-------PAQALNETQWALERLR--
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pF1KE5 ARDLLQAAQDKLQR-LQELEGTYEENE---RALESKAAQLDGLEARMRSVLQAINLQVQI
          :  ..  .::: :. ::   ...:   ...::  :.. . .  ....:...      
CCDS69 ---LQLGSPGSLQRKLSLLEQESQQQELQIQGFESDLAEIRADKQNLEAILHSLPENCAS
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CCDS69 WQ   
            

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                  : :::  :.     :..: .. ::  :::   .    :     :.:   
CCDS13 MRGSHRAAPALRPRGRLWPV-----LAVLAAAAAAGCAQAAMDECTDEGGRPQRCMPE--
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         .:. :  .:  :..::: . :. ::. . .    :.: :::.        .:: ..  
CCDS13 --FVNAAFNVTVVATNTCG-TPPEEYCVQTGVTGVTKSCHLCDA-------GQPHLQHGA
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         .:..  :  ..::::..   :.  :. ... : :   : .:.. . :.: :: .. . 
CCDS13 AFLTDYNNQADTTWWQSQTMLAGVQYPSSINLTLHLGKAFDITYVRLKFHTSRPESFAIY
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CCDS13 KRTREDGPWIPYQYYSGSCENTYSKANRGFIRTGGDEQQALCTDEFSDISPLTGGNVAFS
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       .:.  :.    :  :  .:. .  :..::.:.::.:.::... ::.  . ..::::. ..
CCDS13 TLEGRPSAYNFDN-SPVLQEWVTATDIRVTLNRLNTFGDEVFNDPK--VLKSYYYAISDF
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pF1KE5 VVRGNCFCYGHASECAPAPGAPAHAEGMVHGACICKHNTRGLNCEQCQDFYRDLPWRPAE
       .: : : : ::::::        . . .:   : ::::: :..::.:  :. : ::: : 
CCDS13 AVGGRCKCNGHASECMKN-----EFDKLV---CNCKHNTYGVDCEKCLPFFNDRPWRRAT
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          .  :  :.:.:... :.::  .: ..:.  :: : .:: :: : ::: ::  :.:  
CCDS13 AESASECLPCDCNGRSQECYFDPELYRSTGH--GGHCTNCQDNTDGAHCERCRENFFR--
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          : .  .: :: :.:.:: .  .:::.         :.: ::  :.: .:..:. :: 
CCDS13 ---LGNNEACSSCHCSPVGSLST-QCDSY---------GRCSCKPGVMGDKCDRCQPGFH
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       .:.   . ::: :.:.  :..     :. ..: : ::  : : .:.:: :: ..: : . 
CCDS13 SLT---EAGCRPCSCDPSGSI---DECNIETGRCVCKDNVEGFNCERCKPGFFNLESSNP
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        :: :: :              :.     . ::    ... . :.  .:.  :.::.  :
CCDS13 RGCTPCFC-------------FGHSSVCTNAVGYSVYSIS-STFQ--IDEDGWRAEQRDG
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       .  ..            :..       : :               :. .  .   :. . 
CCDS13 SEASL-----------EWSS-------ERQ---------------DIAVISDSYFPRYFI
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                  .::. :  ...   . .. ...   :   .     .  : . .. . :.
CCDS13 -----------APAKFLGKQVLSYGQNLSFSFRVDRRDTRLSAEDLVLEGAGLRVSVPLI
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         :.:   ::  .                :...  . :       . :: .:   ..:. 
CCDS13 AQGNSYPSETTVK---------------YVFRLHEATDYPWRPALTPFE-FQKLLNNLTS
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pF1KE5 SKT--SPSEACAPLLISLSTLIYNGALPCQCNPQGSLSSECNPHGGQCLCKPGVVGRRCD
        :   . ::  :     :. .   .: :    :   . :        : :  :  :. :.
CCDS13 IKIRGTYSERSAGY---LDDVTLASARPGPGVPATWVES--------CTCPVGYGGQFCE
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pF1KE5 LCAPGYYGFGPTGCQACQCSHEGALSSLCEKTSGQCLCRTGAFGLRCDRCQRGQWGFPSC
       .:  ::    :.                            : ..             : :
CCDS13 MCLSGYRRETPN---------------------------LGPYS-------------P-C
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pF1KE5 RPCVCNGHADECNTHTGACLGCRDHTGGEHCERCIAGFHGDPRLPYGGQCRPCPCPEGPG
         :.::::.. :. .::.: .:::.:.: :::.:  :..::     ...:.::::: :  
CCDS13 VLCACNGHSETCDPETGVC-NCRDNTAGPHCEKCSDGYYGDSTAGTSSDCQPCPCPGG--
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pF1KE5 SQRHFATSCHQDEYSQQIVC-HCRAGYTGLRCEACAPGHFGDP-SRPGGR--CQLCECSG
             .::     ....:: .: .: :: ::: :  :.:::: .: :    :.::.:: 
CCDS13 ------SSCAVVPKTKEVVCTNCPTGTTGKRCELCDDGYFGDPLGRNGPVRLCRLCQCSD
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pF1KE5 NIDPMDPDACDPHTGQCLRCLHHTEGPHCAHCKPGFHGQA----ARQSCHRCTCNLLGTN
       ::::     :.  ::.::.:...: : .: .:: :: :.       ..:. :.::: :: 
CCDS13 NIDPNAVGNCNRLTGECLKCIYNTAGFYCDRCKDGFFGNPLAPNPADKCKACNCNLYGTM
            840       850       860       870       880       890  

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pF1KE5 PQQCPSPDQCHCDPSSGQCPCLPNVQGPSCDRCAPNFWNLTSGHGCQPCACHPSRARGPT
        :      :  :.: .::: :::.: : .:  : :.:.:: ::.::. : ::   . .  
CCDS13 KQ------QSSCNPVTGQCECLPHVTGQDCGACDPGFYNLQSGQGCERCDCHALGSTNGQ
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pF1KE5 CNEFTGQCHCRAGFGGRTCSECQELHWGDPGLQCHACDCDSRGIDTPQCHRFTGHCSCRP
       :.  ::::.:. :. :. : .:.  :.:     :. :::  .:  . ::.   :.: :: 
CCDS13 CDIRTGQCECQPGITGQHCERCEVNHFGFGPEGCKPCDCHPEGSLSLQCKD-DGRCECRE
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       :  : ::::: ...  .  .:.:. : ::.    :.:.: .:  .:.  . :::..    
CCDS13 GFVGNRCDQCEENYFYNRSWPGCQECPACY----RLVKDKVA-DHRV--KLQELES----
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                .  .::  . .:    :. :   .: :: .:.   . :: . . ... .: 
CCDS13 ---------LIANLGTGDEMV----TDQAFEDRLKEAEREVMDLLREAQD-VKDVDQNLM
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pF1KE5 D-VQDENFNANHALSGLERDRLALNLTLRQLDQHLDLLKHSNFLGAYDSIRHAHSQSAEA
       : .:  : . .  .: :.  : ... :    .:    .....        :  .  : : 
CCDS13 DRLQRVNNTLSSQISRLQNIRNTIEETGNLAEQARAHVENTE--------RLIEIASREL
             1110      1120      1130      1140              1150  

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pF1KE5 ER-RANTSALAVPSPVSNSASARHRTEALMDAQKEDFNSKHMANQRALGKLSAHTHTLSL
       :. .. .. ..: .: :   ..   . .:.  . . .  .:  .   . ...  ..  : 
CCDS13 EKAKVAAANVSVTQPES---TGDPNNMTLLAEEARKLAERHKQEADDIVRVAKTANDTST
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